BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg921752 Length=2174 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G24340.1 | Symbols: EMB260, EMB2421 | FAD/NAD(P)-binding oxi... 3506 0.0 > AT1G24340.1 | Symbols: EMB260, EMB2421 | FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein | chr1:8635209-8638986 FORWARD LENGTH=2457 Length=2457 Score = 3506 bits (1898), Expect = 0.0 Identities = 2086/2178 (96%), Gaps = 8/2178 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGTTT-AGGATTTAGATTCTCGACCATGGCGATTCTAGGGCTGATCACGAGGGTAACACG 59 ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| Sbjct 184 GGTTTAAGG-TTTAGCTTCTCGACTATGGCGATTCTAGGGCTTATCAAGAGGGTTACACG 242 Query 60 AATAAGCATAAACAATTCGAGGGTCAGAGTGTACCCAGTGAGGCACTTCCAAAGCAAGGA 119 ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct 243 AATAACCGTAAACAATTCGAGGGTCAGAGTGTACCCAGTGAGGTACTTCCAAAGGAAGGA 302 Query 120 CCTTTCAAGTACAAATTC-ATTCAATGGCCAAGATGCTGCTAAGCTTCCTGTTCTGATCG 178 ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 CCTTTCAAGCACAAA-TCTATTCAATGGTGAAGATGCTGCTAAGCTTCCTGTTCTGATCG 361 Query 179 TCGGCGCTGGACCGGTGGGCCTCGTTTTATCCATTCTTCTCACCAAACTAGGAGTGAAAT 238 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 362 TCGGCGCTGGACCGGTGGGACTCGTTTTATCCATCCTTCTCACCAAACTAGGAGTGAAAT 421 Query 239 GTGCTGTTGTTGACAAAGCCACAAGCTTCTCCAAACATCCACAAGCACATTTTATCAACA 298 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 422 GTGCTGTTGTTGACAAAGCCACAAGCTTCTCGAAACATCCACAAGCACACTTTATCAACA 481 Query 299 ACCGATCAATGGAGATCTTCCGTGCATTGGATGGATTAGCTGAGGAGATTGAAAGATCAC 358 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 482 ACCGATCAATGGAGATCTTCCGTGAATTGGATGGATTAGCTGAGGAGATTGAAAGATCAC 541 Query 359 AGCCTCCTGTAGATTTGTGGAGAAATTTTATTTACTGTACATCTCTCTCCGGCTCAACTC 418 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 542 AGCCTCCTGTAGATTTGTGGAGAAAATTTATTTACTGTACATCTCTCTCCGGCTCAACAC 601 Query 419 TAGGCACAGTGGATCACATGCAGCCTCAAGATTTTGAGAAAGTTGTCAGCCCAGCTTCTG 478 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 602 TAGGCACAGTTGATCACATGCAGCCTCAAGATTTTGAGAAAGTTGTCAGCCCGGCTTCTG 661 Query 479 TTGCTCACTTCTCCCAGTACAAATTGACAAATTTATTGCTTAAGCGGTTGGAAGACCTCG 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 662 TTGCTCACTTCTCCCAGTACAAATTGACAAATTTATTGCTTAAGCGGTTGGAAGACCTCG 721 Query 539 GCTTTCATGTTCGAGGTTCCAAGGATTCAGATGGTATTGA-GCTTGACTCTGTGGTTGCG 597 ||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||||| Sbjct 722 GCTTTCATGTTCGTGGTTCCAAAGAGTCGGATGGTCTTGAGGC-TGACTCTGTGGTTGCG 780 Query 598 AGGCAAATTCTTATGGGTCATGAGTGTGTGGCGATTGATGCTAACAAGGACAGTATTACT 657 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AGGCAAATTCTTATGGGTCATGAGTGTGTGGGGATTGATGCTAACAAGGACAGTATTACT 840 Query 658 GCAACTGTTTCTTATCTCAAAGGAGGCAAGCATATGAAAAGAAACATTCAATGTAGTCTA 717 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GCAACTGTTTCTTTTCTCAAAGGAGGCAAGCATATGAAAAGAAACATTCAATGTAGTCTA 900 Query 718 CTGGTTGGTGCTGATGGTGCTGGGAGTGCTGTAAGAAAGCTCACAGAAATAGAAATGCGA 777 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 901 CTGGTTGGTGCTGATGGTGCTGGGAGTGCAGTAAGAAAGCTCACAGTAATAGAAATGCGA 960 Query 778 GGGGAAAAAGATCTACAAAAGCTTGTTAGTGTCCATTTTATGAGTAGAGAGCTCGGTGAG 837 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GGGGAAAGAGATCTACAGAAGCTTGTTAGTGTCCATTTCATGAGTAGAGAGCTCGGTGAG 1020 Query 838 TACCTGATCAGTAGCAGACCAGGGATGTTAttttttatttttAACACCGACGGTATAGGA 897 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1021 TACCTGATCAGTAACAGACCAGGGATGCTATTTTTTATTTTTAACACCGATGGTATAGGA 1080 Query 898 GTTCTTGTTGCCCATGATCTTCTACAAGGAGAATTTGTTTTGCAGATTCCATACTATCCA 957 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GTTCTTGTTGCCCATGATCTTCTACAAGGAGAATTTGTTTTGCAGATTCCATACTATCCA 1140 Query 958 CCTCAACAGAGTCTATCTGATTTCAGTCTTGAGATGTGCAAGATGCTGATATTCAATTTG 1017 ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 CCTCAACAGAGTCTATCTGATTTTAGTCCTGAGATGTGCAAGATGCTGATATTCAATTTG 1200 Query 1018 GTGGGACATCAGCTTTCAGACTTGGATGTAGCTGACATTAAGCCATGGGTCATGCATGCT 1077 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 GTGGGACATGAGCTTTCAGACTTGGATGTAGCTGATATTAAGCCATGGGTCATGCATGCT 1260 Query 1078 GAAGTCGCCGAGAAATTCATGTGCTT-TGAGAACAGAGTGATACTTGCTGGTGATGCTGC 1136 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 GAAGTCGCCGAGAAATTCATGTG-TTGTGAGAACAGAGTGATACTTGCTGGTGATGCTGC 1319 Query 1137 TCACCGGTTCCCGCCTGCTGGAGGTTTTGGAATGAACACTGGAATTCAGGATGCTCATAA 1196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 TCACCGGTTCCCGCCTGCTGGAGGTTTTGGAATGAACACTGGAATTCAGGATGCTCATAA 1379 Query 1197 TCTTGCATGGAAAATAGCAGCTCTTGTTCAGGGCTCTGCAAAATCTTCGATTCTTAACAC 1256 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || Sbjct 1380 TCTTGCATGGAAAATAGCAGCTCTTGTTCAGGGTTCTGCAAACTCTTCAATTCTTAAAAC 1439 Query 1257 TTATGAAACAGAACGTAGGCCGATTGCCCTCTCCAATACTTCACTCAGTGTTCAGAACTT 1316 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1440 TTATGAAACAGAACGTAGGCCGATTGCCCTTTCCAATACTTCACTCAGTGTTCAAAACTT 1499 Query 1317 CAAAGCAGCTATGTCGGTTCCTTCAGCGCTAGGCCTTGACCCAACAGTTGCAAACTCAGT 1376 || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1500 CAGAGCAGCTATGTCAGTTCCTTCAGCGCTAGGCCTTGACCCAACAGTTGCAAACTCAGT 1559 Query 1377 GCATAGGTTTATAAACAAAACAGTTGGTTCCATCCTTCCAACTGGGCTACAAAAGGCAAT 1436 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1560 GCATAGGTTTATAAACAAAACAGTTGGTTCGATCCTTCCAACTGGGCTGCAAAAGGCAAT 1619 Query 1437 CTTGGATAATGTCTTTGCACTAGGACGTGCACAGCTTTCAGAATCTATATTGAATGAGAG 1496 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct 1620 CTTGGATAATGTCTTTGCACTAGGTCGTGCACAGCTTTCAGAATCTCTGTTGAATGAGAG 1679 Query 1497 CAATCCGCTGGGAAATCAGAGACTTAGCAGATTAAAGAGTATCTTCGAAGGAGGAAAAAG 1556 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 CAATCCACTGGGAAATCAGAGACTTAGCAGACTAAAGAGTATCTTCGAAGGAGGAAAAAG 1739 Query 1557 CCTACAGCTACAGTTTCCTGCAGAAGATCTTGGTTTCAGGTATTTAGAGGGAGCCATTGT 1616 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1740 CCTTCAACTACAGTTTCCTGCAGAAGATCTTGGTTTCAGGTATTTAGAGGGAGCCATTGT 1799 Query 1617 TCCTGATAGCAAGTCTGAAGCTGGTGATCCCGAAGTACCGAGTGGTCGTAGAAGAGACTA 1676 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1800 TCCTGATAACGAGTCTGAAGCTGGTGATCCCGAAGTACCGAGTGGTCGTAGAAGAGACTA 1859 Query 1677 TGTGCCTTGTGCTGAACCAGGTTCAAGACTGCCTCATATGTATATGAAAATACTGTCAGA 1736 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1860 TGTCCCTTGTGCTGAACCAGGTTCAAGACTGCCTCATATGTATGTGAAAATACTGTCAGA 1919 Query 1737 TTCCAAAAGAGATGTTATTGTTTCTACACTGGATCTTGTTTCGACAGAGAAAGTGGAGTT 1796 ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1920 TTCCACAAGAGAGGTTATTGTTTCTACACTGGATCTTGTTTCGACAGAGAAAGTGGAGTT 1979 Query 1797 TCTACTTATAATATCGCCATTACAAGAGTCTTATGAGCTAGCTCGTGCTACATTCAAAGT 1856 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1980 TCTACTTATAATATCGCCATTACAAGAGTCCTATGAGCTAGCTCATGCTACATTCAAAGT 2039 Query 1857 CGGAAAAGAGTTAATGGCTAATGTAAAAGTATGTGTGGTCTGGCCTAGTAGTGATGAAGG 1916 || ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2040 CGCAAAAGAGTTTATGGCTAGTGTAAAAGTATGCGTGGTCTGGCCTAGTAGTGATGATGG 2099 Query 1917 TCTTGAAAGGGAGAGCAATTCAGCAGTAGCTCCATGGGAAAATTATGTCGATGTTATGGA 1976 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2100 TCTTGAAAGGAAGAGCAATTCAGCATTAGCTCCATGGGAAAATTATGTCGATGTTATGGA 2159 Query 1977 AGTTATAAGACAAAATGGTGAAGGAACTTCTTGGTGGAGTATATGTAAAATGTCAGACAG 2036 ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 2160 AGTTAAAAAACAAAATGGTGAAGGAACTTCGTGGTGGAGTATTTGTAAAATGTCAGAGAG 2219 Query 2037 AGGATCTATTTTAGTCCGTCCTGACCAACACATTGCTTGGCGAGCAAAGTCTGGTATTAC 2096 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2220 AGGATCTATTTTAGTCCGTCCCGACCAACACATTGCTTGGCGAGCAAAGTCTGGTATTAC 2279 Query 2097 TTTGGATCCTACTCTGCACATGAGAGATGCCTTCTCCATCATACTTGGTAAACAATGATG 2156 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| Sbjct 2280 TTTGGATCCTACTCTGCACATGAGAGATGTCTTCACCATCATACTAGGGAAACAATGATG 2339 Query 2157 AACAACGCAATTTTATTC 2174 |||| | ||||||||||| Sbjct 2340 AACATCACAATTTTATTC 2357 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 107830770660 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5