BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg923482
Length=2173
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G50380.1 | Symbols: | Prolyl oligopeptidase family protein ... 3587 0.0
> AT1G50380.1 | Symbols: | Prolyl oligopeptidase family protein
| chr1:18662309-18666478 FORWARD LENGTH=2597
Length=2597
Score = 3587 bits (1942), Expect = 0.0
Identities = 2094/2169 (97%), Gaps = 4/2169 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTGACATCACCGGGAGACATGGCGGAATCGAAATCCCCTCCTGTAGCGAAGAAGGTGG 60
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152 GGTTGACATCACCGAGAGACATGGCGGAATCGAGATCCCCTCCTGTAGCGAAGAAGGTGG 211
Query 61 AGCATGTGATGGAGATGTTCGGTGACGTTAGGGTTGACAATTACTACTGGCTCCGTGACG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 AGCATGTGATGGAGATGTTCGGTGACGTTAGGGTTGACAATTACTACTGGCTCCGTGACG 271
Query 121 ATTCTCGTTCCAATCCCGACATGCTTTCTTATCTCCGTGAAGAAAATCACTACACTGATT 180
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 ATTCTCGCACCAATCCCGACATGCTTTCTTATCTTCGTGAAGAAAATCACTACACTGATT 331
Query 181 TCGTCATGTCTGGGACCAAGCAATTTGAGAATCAGCTGTTTGCTGAAATAAGAGGGAGGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 TCGTCATGTCTGGGACCAAGCAATTTGAGAATCAGCTGTTTGCTGAAATAAGAGGGAGGA 391
Query 241 TCAAAGAAGATGATATATCTGCACCTCTACGCAAGGGTCCTTACTACTATTATGAGAAAA 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 392 TCAAAGAAGATGATATATCTGCACCTCTACGCAAGGGTCCTTACTATTATTATGAGAAAA 451
Query 301 ATCTTCAAGGAAAGGAATATGTTCAACATTGTAGGCGTTTAATCCCTGACAACAAAGCTG 360
|||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 452 ATCTTCAAGGAAAGGAATATATTCAGCACTGTAGACGTTTGATCACTGACAACAAAGCTG 511
Query 361 AGCCTTCTGTCTATGATACTATGCTAACTGGTCCAGATGCTCCTCCTGAGCATGT-ACTA 419
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 512 AGCCTTCTGTCTATGATACTATGCCAACTGGTCCAGATGCTCCTCCTGAGCATGTGA-TA 570
Query 420 TTGGATGAGAATATCAAAGCTCAAGAGCATGACTACTACAGAATTGGTGCCTTCAAGGCG 479
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 571 TTGGATGAGAATACCAAGGCTCAAGAGCATGACTACTACAGAATTGGGGCCTTCAAGGCG 630
Query 480 AGTCCCGATCATAAGTTGGTTGCATATGCAGAGGACACAAAAGGTGATGAGATATATACA 539
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AGTCCCGATCATAAATTGGTGGCATATGCAGAGGACACAAAAGGTGATGAGATATATACA 690
Query 540 GTGAATGTTATCGACTCTGAAGCTCTAAAACCAGTGGGGGAACAGCTAAAAGGA-TTGAC 598
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||
Sbjct 691 GTGAATGTCATCGACTCTGAAGCCCTAAAACCAGTGGGGCAACAGCTTAAAGGACTT-AC 749
Query 599 TTCTTATCTTGAATGGGCTGGTAATGATGCTTTGGTCTACATTACAATGGACGAAATCCT 658
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 750 TTCTTATCTTGAATGGGCTGGTAATGATGCTTTGCTCTACATAACAATGGACGAAATCCT 809
Query 659 GCGACCTGACAAGGTTTGGTTACATAAGTTAGGGACAGAGCAGGGCAGTGACATATGCCT 718
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 810 GCGACCTGATAAGGTTTGGTTACATAAATTAGGGACAGAGCAGAGCAGTGATGTATGCCT 869
Query 719 TTACCATGAGAAGGATGATATGTTTTCTCTTGAACTCCACGCTTCTGAGAGCCATAAGTA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 TTACCATGAGAAGGATGATATGTTTTCTCTTGAACTCCACGCTTCTGAGAGCCATAAGTA 929
Query 779 TTTATTTGTTGCATCGGAAAGCAAAACTACAAGATTTGTCTTCTCGCTTGATGTGTCCAA 838
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 TTTATTTGTTGCATCTGAAAGCAAAACTACAAGATTTGTCTTCTCGCTTGATGTGTCCAA 989
Query 839 GCCTCAGGATGGACTCAGGGTGTTGACACCTCGTGTAGATGGCATTGATTCATCTGTCTG 898
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 990 GACTCAGGATGGACTCAGGGTGTTGACACCTCGTGTAGATGGAATTGATTCATCTGTCAG 1049
Query 899 TCATCGTGGGAACCACTTTTTCATCCAGAGAAGGAGCACTGAATTTTACAACTCAGAACT 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 TCATCGTGGGAACCACTTTTTCATCCAGAGAAGGAGCACTGAATTTTACAACTCAGAACT 1109
Query 959 GGTCGCCTGTCCAGTTGATGACACATCGAAGACAACTGTTCTGCTTCCACATAGAGAAAG 1018
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GATCGCCTGTCCAGTTGATGACACATCAAAGACAACTGTTCTGCTTCCACATAGAGAAAG 1169
Query 1019 TGTAAAGATTCAGGAAATTCAGCTTTTCCGAGATCATCTCGCAGTATTCGAGCGTGAACA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
Sbjct 1170 TGTAAAGATTCAGGAAATTCAGCTTTTCCGAGATCATCTTGCAGTCTTCGAGCGTGAAAA 1229
Query 1079 GGGACTGCAGAAGATAACAGTTCATAGGCTTCCTGCTGAGGGACAGCCACTGGAAGGGCT 1138
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1230 CGGACTGCAGAAGATCACAGTTCATAGGCTTCCTGCTGAGGGACAGCCACTGGAAGGTCT 1289
Query 1139 CCAAGGTGGTCGTAGTGTGAGCTTTGCTGATCCGGTCTATTCAGTTGACTCAACCGAGTC 1198
|||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 CCAAGGTGGTCGTAATGTGAGCTTTGTTGACCCGGTCTATTCAGTTGACTCAACCGAGTC 1349
Query 1199 TGAATTTTTGTCCAGAGTTTTAAGGTTTAAATACAGCTCAATGAAAACACCTCCTTCTGT 1258
||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 CGAATTTTCGTCCAGGGTTTTAAGGTTTAAATACTGCTCAATGAAAACACCTCCTTCTGT 1409
Query 1259 GTATGACTATGACATGGACAGTGGCACTTCCGTTGTCAAGAAGATTGACACAGTATTGAG 1318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1410 GTATGACTATGACATGGACAGTGGCACTTCCGTTGTCAAGAAGATTGACACAGTATTGGG 1469
Query 1319 AGGTTTTGATGCATCAAATTATGTTACAGAAAGAAAATGGGTCACTGCATCAGACGGAAC 1378
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1470 AGGTTTTGATGCATCAAATTATGTTACAGAAAGAAAGTGGGTCGCTGCATCAGACGGAAC 1529
Query 1379 TCAAATTCCAATGTCTATTGTGTATAACAAAAAACTTGCAAAGCTCGATGGATCTGATCC 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1530 TCAAATTCCAATGTCTATTGTGTATAACAAAAAACTTGCAAAGCTTGATGGATCTGATCC 1589
Query 1439 ATTACTCCTTTATGGATATGGATCATATGAGATTTCTGTGGATCCATATTTCAAGACATC 1498
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1590 ATTACTCCTTTATGGATATGGTTCATATGAGATTTCTGTGGATCCTTATTTCAAGGCATC 1649
Query 1499 AAGGTTGTCCCTGTTAGATCGTGGGTTTATCTTTGTAATTGCTCATGTTCGTGGGGGTGG 1558
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1650 AAGGTTGTCCCTGTTAGATCGTGGGTTTACCTTTGTAATTGCTCATGTTCGTGGGGGCGG 1709
Query 1559 TGAAATGGGGAGACAGTGGTATGAGAATGGGAAGCTGTTGAAGAAGAAAAACACATTCAC 1618
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1710 TGAGATGGGGAGACAGTGGTATGAGAATGGGAAGCTGTTGAAGAAGAAAAACACATTCAC 1769
Query 1619 TGATTTTATTGCTTGTGCTGAGCGTTTAATAGAACTAAAGTATTGCTCGAAAGAAAAACT 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 TGATTTTATTGCTTGTGCTGAGCGTTTAATAGAACTAAAATATTGCTCGAAAGAAAAACT 1829
Query 1679 GTGCATGGAAGGAAGAAGTGCTGGTGGATTGCTGATGGGTGCTGTTGTTAATATGAGGCC 1738
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1830 GTGCATGGAAGGGAGAAGTGCTGGTGGATTGCTGATGGGTGCTGTTGTTAATATGAGGCC 1889
Query 1739 TGACTTGTTCAAGGTGGTTGTCGCTGGAGTTCCTTTTGTAGATGTTTTGACAACAATGCT 1798
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1890 TGACTTGTTCAAGGTGGTTATCGCTGGAGTTCCTTTTGTAGATGTCTTGACAACAATGCT 1949
Query 1799 GGACCCAACAATTCCGCTTACGACATCAGAATGGGAGGAGTGGGGTGACCCCAGAAAGGA 1858
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950 GGACCCAACAATTCCGCTTACGACATCAGAGTGGGAGGAGTGGGGTGACCCCAGAAAGGA 2009
Query 1859 AGAATTTTACTTCTATATGAAGTCATATTCCCCTGTCGACAATGTAGCAGCGCAGAATTA 1918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||
Sbjct 2010 AGAATTTTACTTCTATATGAAGTCATATTCCCCTGTAGACAATGTAACGGCGCAGAATTA 2069
Query 1919 TCCAAATATGCTTGTAACTGCTGGGTTAAATGATCCAAGAGTTATGTACTCTGAACCTGG 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 TCCAAATATGCTTGTAACTGCTGGGTTAAATGATCCAAGAGTTATGTACTCTGAACCTGG 2129
Query 1979 CAAGTGGGTGGCAAAACTGAGAGAAATGAAGACTGACAACAACGTACTTCTGTTCAAATG 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130 CAAGTGGGTGGCAAAACTGAGAGAAATGAAGACCGACAACAACGTACTTCTGTTCAAATG 2189
Query 2039 TGAGCTTGGCGCAGGGCATTTCTCAAAATCTGGGAGATTCGAGAAGCTTCAAGAGGATGC 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2190 CGAGCTTGGCGCAGGGCATTTCTCAAAATCTGGGAGATTCGAGAAGCTTCAAGAAGATGC 2249
Query 2099 ATTTATGTTTGCATTCATGATGAAAGTTTTAGACATGATTCCTGCTTCTGGGTGAGTCCT 2158
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 ATTTACGTTTGCATTCATGATGAAAGTTTTGGACATGATTCCTGCTTCTGGGTGAGTCCT 2309
Query 2159 CAAATTTAG 2167
|||||||||
Sbjct 2310 CAAATTTAG 2318
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 107780570115
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5