BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg924045
Length=6499
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G55350.5 | Symbols: DEK1 | calpain-type cysteine protease fa... 7094 0.0
> AT1G55350.5 | Symbols: DEK1 | calpain-type cysteine protease
family | chr1:20654061-20665095 REVERSE LENGTH=7308
Length=7308
Score = 7094 bits (3841), Expect = 0.0
Identities = 4076/4192 (97%), Gaps = 6/4192 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTAGGTGGGAGAAGAAGCCATGGAAGGGGATGAGCGAGGAGTCTTACTTGCTTGTGTAAT 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 GTAGGTGGGAGAAGAAGCCATGGAAGGGGATGAGCGAGGAGTCTTACTTGCTTGTGTAAT 473
Query 64 TTCGGGTACCCTTTTCACGGTTTTCGGTTTGGGTTCGTTTTGGATACTTTGGGCTGTTAA 123
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 TTCGGGTACCCTTTTCACGGTTTTCGGTTCGGGTTCGTTTTGGATACTTTGGGCTGTTAA 533
Query 124 TTGGCGGCCATGGCGGCTCTATAGCTGGATCTTTGCTAGAAAATGGCCAAAAGTATTGCA 183
||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 TTGGCGGCCATGGCGTCTCTACAGTTGGATCTTTGCTAGAAAATGGCCAAAAGTATTGCA 593
Query 184 AGGTCCCCAGCTTGATGCACTATGTGGTGTTCTATCTCTTTTTGCTTGGATTGTGGTAGT 243
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 AGGTCCTCAGCTTGATATACTATGTGGTGTTCTATCTCTTTTTGCTTGGATTGTGGTAGT 653
Query 244 ATCTCCTATTGCAATCTTGATAGGGTGGGGTTCCTGGCTGATT-TCGATATTGGATCGAG 302
||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 654 ATCCCCTATTGCAATCTTGATAGGATGGGGTTCTTGGCTGATTGT-GATATTGGATCGAC 712
Query 303 ATATCATTGGGCTTGCGATAATAATGGCTGGAACAGCCCTTTTACTGGCATTCTACTCAA 362
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 ATATCATTGGGCTGGCGATAATAATGGCTGGAACAGCCCTTTTACTGGCATTCTACTCAA 772
Query 363 TCATGCTTTGGTGGAGGACCCAGTGGCAAAGCTCAAGAGCTGTCGCTTTACTTCTCCTTC 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 TCATGCTTTGGTGGAGGACCCAGTGGCAAAGCTCAAGAGCTGTCGCTTTACTTCTCCTTC 832
Query 423 TTGGTGTTGCCTTACTCTGTGCGTATGAACTTTGTGCTGTCTATGTTACGGCTGGTGCGC 482
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 TTGGTGTTGCCTTACTATGTGCGTATGAACTCTGTGCTGTCTATGTTACGGCTGGTGCGC 892
Query 483 ATGCATCTCAGCAATATTCTCCTTCTGGTTTCTTTTTCGGTGTATCAGCAATCGCGTTGG 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 ATGCATCTCAGCAATATTCTCCTTCTGGTTTCTTTTTCGGTGTATCAGCAATCGCGTTGG 952
Query 543 CAATTAACATGCTATTTATCTGCCGCATGGTCTTTAATGGAAATGGGTTAGATGTGGATG 602
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 953 CAATTAACATGCTATTTATCTGCCGCATGGTCTTTAATGGAAATGGTTTAGATGTGGACG 1012
Query 603 AATATGTAAGGAAGGCATATAAATTTGCTTATTCAGATTGTATAGAAGTGGGTCCTGTGG 662
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 AATATGTAAGGAGGGCATATAAATTTGCTTATTCAGATTGTATAGAAGTGGGTCCTGTGG 1072
Query 663 CTTGTTTGCCAGAACCTCCTGATCCCAATGAATTATATCCCCGGCAAACCAGCAGGGCTT 722
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 CTTGTTTGCCTGAACCTCCTGATCCTAATGAATTATATCCCCGGCAAACCAGCAGGGCTT 1132
Query 723 CACATCTTGGCCTCCTGTACCTGGGCTCACTCGTAGTTCTCCTTGCCTACTCAGTCCTAT 782
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 CACATCTTGGCCTTCTGTACCTGGGCTCACTCGTAGTTCTCCTTGCCTACTCAGTCCTAT 1192
Query 783 ATGGCCTCACAGCTAGGGAATCACGTTGGCTTGGAGGAATTACATCAGCTGCAGTTATTG 842
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1193 ATGGTCTCACAGCTAGGGAATCACGTTGGCTTGGAGGAATCACATCAGCTGCAGTTATTG 1252
Query 843 TTCTTGACTGGAATATTGGGGCATGCTTGTATGGGTTTAAGCTTCTTCAGAATCGTGTTC 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 TTCTTGACTGGAATATTGGGGCATGCTTGTATGGGTTTAAGCTTCTTCAGAATCGTGTTC 1312
Query 903 TGGCACTTTTTGTTGCTGGCACATCCCGTCTTTTCCTAATATGTTTTGGCATACACTACT 962
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TGGCACTTTTTGTTGCTGGCATATCCCGTCTTTTCCTAATATGTTTTGGCATACACTACT 1372
Query 963 GGTACCTAGGGCATTGTATTAGTTACATTTTCGTAGCATCAGTTCTATCAGGTGCTGCTG 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 GGTACCTAGGGCATTGTATTAGTTACATTTTCGTAGCATCAGTTCTATCAGGTGCTGCTG 1432
Query 1023 TTTCCCGGCATCTATC-AGTAACAGACCCATCAGCTGCAAGAAGAGATGCCTTACAGAGC 1081
|||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 TTTCTCGGCATCTATCTA-TAACAGACCCATCAGCTGCAAGAAGAGATGCCTTACAGAGC 1491
Query 1082 ACAGTGATCCGCTTGAGAGAAGGTTTTCGGAGAAAGGAGCAGAATAGTTCATCAAGTTCT 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1492 ACAGTGATCCGCTTGAGAGAAGGTTTTCGGAGAAAAGAGCAGAATAGTTCTTCAAGTTCT 1551
Query 1142 TCAGATGGTTGTGGCTCAAGTATGAAAAGAAGTAGTAGTATCGATGCTGGCCATGCTGGT 1201
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1552 TCAGATGGTTGTGGCTCAAGTATAAAAAGAAGTAGTAGTATCGATGCTGGCCATACTGGT 1611
Query 1202 TGTACTAATGAAGCTAATCGTACCGCAGAATCTTGCACGGCTGACAATCTAACTCGAACA 1261
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 TGTACTAATGAAGCAAATCGTACGGCAGAATCTTGCACGGCTGACAATCTAACTCGAACA 1671
Query 1262 GGCAGCTCCCAGGAGGGTATCAATAGCGAGAAAAGCGTAGAAAGTGGAAGACCAAGCTTA 1321
|||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 GGCAGCTCTCAGGAGGGAATCAATAGCGACAAAAGCGAAGAAAGTGGAAGACCAAGCTTA 1731
Query 1322 GGTTTACGTAGTAATTCATGTCGTTCTGTGGTCCAAGAGCCCGAAGCAGGAACGTCTTAT 1381
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732 GGTTTACGTAGTAGTTCATGTCGTTCTGTGGTCCAAGAGCCCGAAGCAGGAACGTCTTAT 1791
Query 1382 TTTCTGGACAAAGTTTCTGATCAGAATAACACTCCTGTTGTTTGTTCTAGCAGTGGTCTA 1441
||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1792 TTTATGGACAAAGTTTCTGATCAAAATAACACTCTTGTTGTTTGTTCGAGCAGTGGTCTA 1851
Query 1442 GATAGCCAAGGTTACGAGTCTAGCACATCGAATTCTGCAAACCAGCAGCTTTTGGATTTG 1501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1852 GATAGCCAAGGTTACGAGTCTAGCACATCGAATTCTGCAAACCAGCAGCTTTTGGATATG 1911
Query 1502 AATTTGGCTCTTGCTTTCCAGGACCAGTTAAACGATCCTAGGATAGCCTCGATACTTAAA 1561
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 AATTTGGCTCTTGCTTTCCAGGACCAGTTAAACAATCCTAGGATAGCCTCGATACTTAAG 1971
Query 1562 AAGAAAGCAAAAGAAGGTGATCTTGAACTCACTAGTTTGCTGCAAGACAAGGGGTTGGAC 1621
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 AAGAAAGCAAAAGAAGGTGATCTTGAACTGACTAATTTGCTGCAAGACAAGGGGTTGGAC 2031
Query 1622 CCTAACTTTGCTGTAATGCTGAAGGaaaaaaaCTTGGATCCAACTATATTGGCACTACTT 1681
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2032 CCTAACTTTGCTGTAATGTTGAAGGAAAAAAACTTGGATCCTACTATATTGGCACTACTT 2091
Query 1682 CAGAGGAGTAGTTTGGATGCAGATAGAGATCACCGCGACAACACTGATATTACAATCATT 1741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2092 CAGAGGAGTAGTTTGGATGCAGATAGAGATCACCGCGACAATACTGATATTACAATCATT 2151
Query 1742 GACTCAAACAGTGTTGACAATACTTTGCCAAATCAGATTTCTTTATCCGAAGAATTGAGA 1801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 GACTCAAACAGTGTTGACAATACTTTGCCAAATCAGATTTCTTTATCCGAAGAATTGAGA 2211
Query 1802 CTCCGTGGACTAGAGAAGTGGCTTAAGCTGTCCAGACTTCTTCTGCACCATGTAGCGGGC 1861
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 CTCCGTGGACTAGAGAAGTGGCTTAAGTTGTCTAGACTTCTTCTGCACCATGTAGCGGGG 2271
Query 1862 ACACCAGAGAGAGCATGGGGCCTCTTTAGTCTTGTCTTTATCCTTGAAACAATCATTGTG 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 ACACCAGAGAGAGCATGGGGCCTCTTTAGTCTTGTCTTTATCCTTGAAACAATCATTGTG 2331
Query 1922 GCCATTTTTCGCCCGAAGACCATCACGATTATAAATTCTAGTCATCAACAGTTCGAATTT 1981
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 GCCATTTTTCGCCCAAAGACCATCACGATTATAAATTCTAGTCATCAACAGTTCGAATTT 2391
Query 1982 GGTTTCTCTGTGCTGCTATTGTCACCTGTTGTCTGTTCAATAATGGCTTTTCTTCGGTCT 2041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 GGTTTCTCTGTGCTGCTATTGTCACCTGTTGTCTGTTCAATAATGGCTTTTCTTCGGTCT 2451
Query 2042 CTTCAAGTTGAGGAAATGGCCTTGACATCAAAATCTCGCAAGTATGGCTTTGTTGCCTGG 2101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 CTTCAAGTTGAGGAAATGGCCTTGACATCAAAATCTCGCAAGTATGGCTTTGTTGCCTGG 2511
Query 2102 CTTCTGAGCACTTCAGTTGGATTGTCACTCTCGTTCTTGAGTAAATCGTCAGTACTTCTG 2161
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 CTTCTGAGCACATCAGTTGGATTGTCACTCTCGTTCTTGAGTAAATCGTCAGTACTTCTG 2571
Query 2162 GGAATATCCTTGACTGTGCCCCTCATGGCAGCATGCCTGTCTATTGCTGTTCCCATATGG 2221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 GGAATATCCTTGACTGTGCCCCTCATGGCAGCATGCCTGTCTATTGCTGTTCCCATATGG 2631
Query 2222 ATTCATAATGGGTACCAATTTTGGGTACCACAGTTATCATGTGGTGACCAGGCAAGAGAT 2281
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 ATGCATAATGGGTACCAATTTTGGGTTCCACAGTTATCATGTGGTGACCAGGCAAGAGAT 2691
Query 2282 TTACGATCTCCCAGGATAAAGGGGTTTATTCTTTGGATTTGTGTTGTGTTGTTTGCGGGA 2341
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 TTACGATCTCCCAGGATAAAGGGGTTTATTCTTTGGATTTGTGTTGTGTTGTTTGCGGGT 2751
Query 2342 TCTGTAATTGCTCTTGGTGCAATTATATCTGCTAAACCTTTGGATGATTTAAAGTATAAG 2401
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2752 TCTGTAATTTCTCTTGGTGCGATTATATCTGCTAAACCTTTGGATGATTTAAAGTATAAG 2811
Query 2402 CTGTTTAGTGCCAGAGAAAACAACGTCATGTCACCATATACATCTTCTGTATACCTTGGT 2461
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 CTGTTTAGTGCCAGAGAAAACAACGTCACGTCACCATATACATCTTCTGTATACCTTGGT 2871
Query 2462 TGGGCAATGGCATCTGGAATTGCTTTAGTAGTTACCGCCATTCTGCCAATAGTTTCATGG 2521
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2872 TGGGCAATGTCATCTGGAATTGCTTTAGTAGTTACCGCCATTCTACCAATAGTTTCATGG 2931
Query 2522 TTTGCAACTTATAGGTTTTCCCACTCTTCTGCTGTCTGTCTCATGATATTCTCAGTTGTT 2581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 TTTGCAACTTATAGGTTTTCCCACTCTTCTGCTGTCTGTCTCATGATATTCTCAGTTGTT 2991
Query 2582 CTCGTGGCATTTTGTGGAACATCATATTTGGAAGTTGTGAAATCTAGAGATGATCAGTTG 2641
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2992 CTCGTGGCATTTTGTGGAACTTCATATTTGGAAGTTGTAAAATCTAGAGATGATCAGTTG 3051
Query 2642 CCCACAAAGGGTGATTTCCTTGCGGCCTTGCTTCCACTTGCATGCATTCCGGCGCTACTT 2701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3052 CCCACAAAGGGTGATTTCCTTGCGGCCTTGCTTCCACTTGCATGCATTCCGGCGCTGCTT 3111
Query 2702 TCACTATGCTGTGGGATGGTTAAATGGAAGGACGATTGTTGGATACTATCTCGAGGTGTA 2761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3112 TCACTATGCTGTGGGATGGTTAAATGGAAGGACGATTGTTGGATACTCTCTCGAGGTGTA 3171
Query 2762 TATGTTTT-TGTTTCAATAGGTCTTCTTCTTCTTTTTGGTGCAATAGCAGCTGTTATTGC 2820
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 3172 TATGTTTTCT-TTTCAATAGGTCTTCTTCTTCTTTTTGGTGCGATAGCAGCTGTCATTGC 3230
Query 2821 AGTCAAACCATGGACGATAGGCGTGTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCATTATGGTGGTAGC 2880
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3231 AGTCAAACCATGGACGATAGGCGTATCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCCTTATGGTGGTAAC 3290
Query 2881 AATTGGTGTAATCTATCTTTGGGCGTCAAACAATTTCTATTTGACCAGGAAACAGACATC 2940
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3291 AATTGGTGTAATCCATCTTTGGGCGTCAAACAATTTCTATTTAACCAGGAAACAGACATC 3350
Query 2941 CTCTGTCTGCTTTCTTGCCCTTCTTTTGGGTTTGGCCGCATTCCTTGTCGGATGGCATCA 3000
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3351 CTTTGTCTGCTTTCTTGCTCTTCTTTTGGGTTTGGCCGCATTCCTTCTCGGATGGCATCA 3410
Query 3001 AGATAAACCATTTGCTGGAGCATCTGTTGGTTATTTTACATTCCTGTCTCTGTTGGCTGG 3060
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 AGATAAAGCATTTGCTGGAGCATCTGTTGGTTACTTTACATTCCTGTCTCTGTTGGCTGG 3470
Query 3061 AAGAGCATTAGCTGTTCTTCTATCCCCACCAATTGTGGTATATTCTCCAAGAGTACTACC 3120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct 3471 AAGAGCATTAGCTGTTCTTCTATCCCCACCAATTGTAGTATATTCTCCAAGGGTGCTACC 3530
Query 3121 AGTATATGTCTACGATGCTCATGCGGATTGTGGAAAGAATGTCAGTGCTGCATTTCTTCT 3180
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3531 AGTATATGTCTACGATGCTCATGCTGATTGCGGAAAGAATGTCAGTGCTGCATTTCTTGT 3590
Query 3181 TCTGTATGGAATTGCTTTGGCAACAGAAGGCTGGGGTGTTGTTGCTAGTCTGATAATATA 3240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3591 CCTGTATGGAATTGCTTTGGCAACAGAAGGCTGGGGTGTTGTTGCTAGTCTGATAATTTA 3650
Query 3241 TCCTCCGTTCGCTGGTGCTGCTGTATCAGCTATCACCCTTGTAGTAGCCTTTGGGTTTGC 3300
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3651 TCCTCCGTTTGCGGGTGCTGCTGTATCAGCTATCACCCTTGTAGTAGCCTTTGGGTTTGC 3710
Query 3301 TGTTTCTCGCCCGTGTTTGACTCTTGAGATGATGGAGGTTGCTGTACGTTTTCTTAGCAA 3360
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3711 TGTTTCTCGCCCATGTTTGACTCTTGAGATGATGGAGGTTGCTGTACGCTTTCTTAGCAA 3770
Query 3361 GGATACTATAGTGCAAGCTATCTCTCGATCTGCAACGAAAACAAGAAATGCTCTATCCGG 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3771 GGATACTATAGTGCAAGCTATCTCTCGATCTGCCACGAAAACAAGAAATGCTCTATCCGG 3830
Query 3421 CACGTATTCAGCTCCCCAAAGGTCTGCCAGCTCTGCAGCTCTTCTGGTTGGAGACCCCTC 3480
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3831 CACGTATTCAGCTCCCCAAAGGTCCGCCAGCTCTGCAGCTCTTCTGGTTGGGGATCCCTC 3890
Query 3481 TGCAATGCGTGATAAAGCAGGGAACTTTGTGCTTCCTAGAGATGATGTCATGAAATTAAG 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3891 TGCAATGCGTGATAAAGCAGGGAACTTTGTGCTTCCTAGAGATGATGTCATGAAATTAAG 3950
Query 3541 GGATCGTCTCAGGAACGAAGAAAGAGTTGCTGGATCAATCTTCTACAAAATGCAATGCAG 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3951 GGATCGTCTCAGGAACGAAGAAAGAGTTGCTGGATCAATCTTCTACAAAATGCAATGCAG 4010
Query 3601 GAAAGGATTCCGTCTTGAACCACCTTCAAATGTAGATTACAGAAGAGACATGTGTGCCCA 3660
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4011 GAAAGGATTCCGTCATGAACCACCTACAAATGTAGATTATAGAAGAGACATGTGTGCCCA 4070
Query 3661 TGCAAGAGTTTTGGCGCTGGAAGAGGCAATTGATACAGAATGGGTGTATATGTGGGACAA 3720
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4071 TGCAAGAGTTTTGGCACTGGAAGAGGCAATTGATACAGAATGGGTGTATATGTGGGACAA 4130
Query 3721 GTTTGGTGGTTATTTACTCCTATTGTTAGGTTTGACAGCTAAGGCGGAGATAGTTCAGGA 3780
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4131 ATTTGGTGGTTATTTACTACTATTGTTAGGTTTGACAGCTAAGGCGGAGAGAGTTCAGGA 4190
Query 3781 TGAGGTACGGTTGCGGCTCTTCTTAGATAGCATTGGGTTCTCGGACTTAAGTGCCAGAAA 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4191 TGAGGTACGGTTGCGGCTCTTCTTAGATAGCATTGGGTTCTCGGATTTAAGTGCCAGAAA 4250
Query 3841 AATCAGTAAATGGAAGCCGGAGGATAGAAGACAATTTGAAATTATTCAAGAGAGTTATCT 3900
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4251 AATCAGTAAATGGAAGCCAGAGGATAGAAGACAATTCGAAATTATTCAAGAGAGTTATCT 4310
Query 3901 gagagagaaagagatggaagaggaaacccttatgcagagacgtgaagaagaagggagagg 3960
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4311 GAGAGAGAAAGAGATGGAAGAGGAAAGCCTTATGCAGAGACGTGAAGAAGAAGGGAGAGG 4370
Query 3961 taaagaaagaaggaaagctcttttggagaaggaagaaCGCAAATGGAAGGAAATTGAAGC 4020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4371 TAAAGAAAGAAGGAAAGCTCTTTTGGAGAAGGAAGAGCGCAAATGGAAGGAAATTGAAGC 4430
Query 4021 TTCCCTTATTCCATCTATTCCTAATGCTGGTAGCAGGGAGGCAGCAGCCATGGCAGCTGC 4080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4431 GTCCCTTATTCCATCTATTCCTAATGCTGGTAGCAGGGAGGCAGCAGCCATGGCAGCTGC 4490
Query 4081 AATACGTGCTGTTGGGGGTGATTCTGTCCTTGAGGATTCCTTTGCAAGAGAGAGAGTCTC 4140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 4491 AATACGTGCTGTTGGGGGTGATTCTGTCCTTGAGGATTCCTTCGCAAGAGAGAGGGTCTC 4550
Query 4141 GGGTATTGCGCGTAGGATACGCACTGCTCAACTAGACCGACGCGCACAACAG 4192
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 4551 GGGTATTGCACGTAGGATACGCACTGCTCAACTAGAACGACGTGCACAACAG 4602
Score = 4019 bits (2176), Expect = 0.0
Identities = 2264/2308 (98%), Gaps = 0/2308 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4190 CAGACTGGAATATCTGGGGCAGTTTGTGTTCTTGATGATGAACCTATGATAAGTGGTAAA 4249
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4684 CAGACTGGAATATCTGGGGCAGTTTGTGTTCTTGATGATGAACCAATGATAAGTGGTAAA 4743
Query 4250 CATTGCGGCCAAATGGACTCAAGTGTCTGTCAAAGTCAGAAGATTAGCTTTTCCGTTACA 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4744 CATTGCGGCCAAATGGACTCAAGTGTCTGTCAAAGTCAGAAGATTAGCTTTTCCGTTACA 4803
Query 4310 GCAATGATCCAATCCGATTCTGGACCTGTATGTCTTTTTGGCACTGAATTTCAAAAGAAA 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4804 GCAATGATCCAATCCGATTCTGGACCTGTATGTCTTTTTGGCACTGAATTTCAAAAGAAA 4863
Query 4370 GTCTGTTGGGAGATTCTGGTTGCTGGTTCTGAACAAGGAATTGAGGCTGGCCAAGTTGGG 4429
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4864 GTATGTTGGGAGATTCTGGTTGCTGGTTCTGAGCAAGGAATTGAGGCTGGCCAAGTTGGG 4923
Query 4430 CTTAGGTTGATAACAAAAGGTGAGAGGCAGACAACCGTGGCTAGAGAGTGGTATATTGGT 4489
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4924 CTTAGGTTGATAACAAAAGGTGAGAGGCAGACAACCGTTGCTAGAGAGTGGTATATTGGT 4983
Query 4490 GCAACCAGCGTAACTGATGGAAGGTGGCATACAGTGACAATCACAATTGATGCTGATGCG 4549
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4984 GCAACCAGCATAACTGATGGAAGGTGGCATACAGTGACAATCACAATTGATGCTGATGCG 5043
Query 4550 GGGGAAGCTACTTGTTACATAGATGGTGGGTTTGATGGCTATCAGACTGGGTTACCTCTA 4609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 5044 GGGGAAGCTACTTGTTACATAGATGGTGGGTTTGATGGCTACCAGAATGGGTTACCTCTA 5103
Query 4610 AGTACTGGTAGTGCCATTTGGGAACAAGGAGCTGAAGTTTGGTTGGGTGTTAGGCCACCT 4669
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5104 AGTATTGGCAGTGCCATTTGGGAACAAGGAGCTGAAGTTTGGTTGGGTGTTAGGCCACCT 5163
Query 4670 ATAGATGTTGATGCATTCGGGAGATCAGATAGTGATGGAGTCGAGTCAAAGATGCATATT 4729
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 5164 ATAGATGTTGATGCATTCGGGAGATCAGATAGTGATGGCGTCGAATCAAAGATGCATATT 5223
Query 4730 ATGGATGTTTTCCTTTGGGGGAAATGTTTAAGTGAAGACGAGGCCGCTTCTTTGCATGCA 4789
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5224 ATGGATGTTTTCCTTTGGGGGAAATGCTTAAGTGAAGAAGAGGCCGCTTCTTTGCATGCA 5283
Query 4790 GTCATTGGCATGGCTGACTTAGACATGATTGATTTGTCTGATGACAATTGGCAATGGACG 4849
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5284 GCCATTGGCATGGCTGACTTAGACATGATTGATTTGTCTGATGACAATTGGCAATGGACG 5343
Query 4850 GATTCACCCCCCAGAGTCGATGGTTGGGATAGTGATCCTGCCGATGTTGATCTCTATGAT 4909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5344 GATTCACCCCCCAGAGTCGATGGTTGGGATAGTGATCCTGCCGATGTTGATCTCTATGAT 5403
Query 4910 AGGGATGACGTAGATTGGGATGGACAATATTCCAGTGGGAGGAAAAGAAGATCAGGTCGG 4969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5404 AGGGATGACGTAGATTGGGATGGACAATATTCCAGTGGGAGGAAAAGAAGATCAGGTCGG 5463
Query 4970 GATTTTGTAATGAGTGTCGATTCCTTTGCCAGGAGACACAGGAAACCCAGGATGGAGACA 5029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5464 GATTTTGTAATGAGTGTCGATTCCTTTGCCAGGAGACACAGGAAACCCAGGATGGAGACA 5523
Query 5030 CAAGAAGATATAAATCAAAGAATGCGTTCAGTTGAGTTGGCTGTCAAAGAAGCTCTATCT 5089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5524 CAAGAAGATATAAATCAAAGAATGCGTTCAGTTGAGTTGGCTGTCAAAGAAGCTCTCTCT 5583
Query 5090 GCACGAGGTGATAAGCAATTTACTGACCAGGAATTTCCTCCAAATGATCGCTCTTTATTT 5149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5584 GCACGAGGTGATAAGCAATTTACTGACCAGGAATTTCCTCCAAATGATCGCTCTTTATTT 5643
Query 5150 GTGGATACACAAAATCCCCCTTCAAAATTGCAGGTTGTTTCTGAATGGATGAGACCTGAC 5209
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5644 GTGGATACACAAAATCCCCCATCAAAATTGCAGGTTGTTTCTGAATGGATGAGACCTGAC 5703
Query 5210 TCCATTGTGAAAGAGAACGGTAGTGATTCCCGTCCCTGCCTGTTCTCTGGGGAAGCAAAT 5269
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5704 TCCATTGTGAAAGAAAACGGTAGTGATTCCCGTCCCTGCCTGTTCTCTGGGGATGCAAAT 5763
Query 5270 CCTTCAGATGTTTGCCAGGGGCGTTTGGGGGATTGTTGGTTCTTAAGCGCCGTTGCAGTT 5329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5764 CCTTCAGATGTTTGCCAGGGGCGTTTGGGGGATTGTTGGTTCTTAAGCGCCGTTGCAGTT 5823
Query 5330 TTGACAGAAGTATCACGAATATCTGAAGTGATCATTACTCCTGAATACAACGAGGAAGGG 5389
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5824 TTGACAGAGGTTTCACGAATATCTGAAGTGATCATTACTCCTGAATACAACGAGGAAGGG 5883
Query 5390 ATCTACACTGTTCGTTTTTGTATTCAGGGTGAGTGGGTTCCTGTTGTGATCGATGACTGG 5449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5884 ATCTACACTGTTCGTTTTTGTATTCAGGGTGAGTGGGTTCCTGTTGTTATCGATGACTGG 5943
Query 5450 ATTCCATGTGAATCGCCTGGTAAACCAGCTTTTGCTACTAGCAAAAAGCTCAATGAACTC 5509
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5944 ATTCCATGTGAATCACCTGGTAAACCAGCTTTTGCTACTAGCAGAAAGCTCAATGAACTC 6003
Query 5510 TGGGTCTCCATGGTGGAGAAAGCATATGCCAAGCTCCATGGTTCTTATGAGGCACTGGAG 5569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6004 TGGGTCTCCATGGTGGAGAAAGCATATGCCAAGCTCCATGGTTCTTATGAGGCACTGGAG 6063
Query 5570 GGGGGACTGGTTCAGGATGCACTTGTTGACCTAACTGGAGGAGCTGGTGAGGAGATTGAC 5629
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6064 GGGGGACTGGTTCAGGATGCTCTTGTCGACCTAACTGGAGGAGCTGGTGAGGAGATTGAC 6123
Query 5630 TTGCGGAGTGCTCAAGCACAAATAGATCTTGCAAGTGGCAGATTATGGTCTCAATTGTTA 5689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6124 TTGCGGAGTGCTCAAGCACAAATAGATCTTGCAAGTGGCAGATTGTGGTCTCAATTGTTA 6183
Query 5690 CGCTTTAAACAAGAGGGGTTCTTACTTGGAGCTGGAAGTCCATCAGGATCTGATGTTCAT 5749
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6184 CGTTTTAAACAAGAGGGGTTCTTACTTGGTGCTGGAAGTCCATCAGGATCTGATGTTCAT 6243
Query 5750 GTATCTTCCAGTGGCATTGTGCAAGGGCATGCTTACTCCGTCTTACAGGTGAGAGAGGTC 5809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6244 GTATCTTCCAGTGGCATTGTGCAAGGGCATGCTTACTCCGTCTTACAGGTGAGAGAGGTT 6303
Query 5810 GATGGGCACAGACTTGTTCAGATCCGGAATCCATGGGCTAATGAAGTTGAGTGGAATGGT 5869
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6304 GATGGGCACAGACTTGTTCAGATTCGAAATCCATGGGCTAATGAAGTTGAGTGGAATGGT 6363
Query 5870 CCATGGTCAGACTCATCCCCAGAGTGGACTGATAGGATGAAGCACAAGCTGAAGCATGTT 5929
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6364 CCCTGGTCAGACTCATCCCCAGAGTGGACTGATAGGATGAAGCACAAGCTGAAGCATGTT 6423
Query 5930 CCACAGTCAAAAGAAGGTATATTCTGGATGTCTTGGCAAGATTTCCAGATTCATTTCAGA 5989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6424 CCACAGTCAAAAGAAGGTATATTCTGGATGTCTTGGCAAGATTTCCAGATTCATTTCAGA 6483
Query 5990 TCAATATATGTTTGTCGGGTTTACCCCCGTGAGATGCGCTACTCTGTACATGGCCAATGG 6049
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6484 TCAATATATGTGTGTCGGGTTTACCCCCGTGAGATGCGCTACTCTGTAAATGGCCAATGG 6543
Query 6050 CGAGGTTATAGTGCCGGTGGCTGCCAAGATTATAGCTCATGGCATCAAAATCCACAATTC 6109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6544 CGAGGTTATAGTGCCGGTGGCTGCCAAGATTATAGCTCATGGCATCAAAATCCACAATTC 6603
Query 6110 AGGCTGAGGGCAACTGGTTCTGATGCATCTTTGCCAATTCATGTGTTCATCACCTTAACT 6169
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6604 AGGCTGAGGGCAACTGGTTCTGATGCATCTTTACCAATTCATGTGTTCATCACCTTAACT 6663
Query 6170 CAGGGCGTAGGTTTCTCAAGAACAACTCCTGGATTTCGTAACTACCAATCAAGCCATGAT 6229
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6664 CAGGGCGTAGGTTTCTCGAGAACAACTCCTGGATTTCGTAACTACCAATCAAGCCATGAT 6723
Query 6230 TCACAGTTGTTCTATATCGGAATGAGGATTCTTAAAACTCGTGGACGTCGTGCTGCTTAT 6289
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6724 TCACAGTTGTTCTATATCGGATTGAGGATTCTTAAAACTCGTGGACGTCGTGCTGCTTAC 6783
Query 6290 AACATATTTCTTCATGAATCTGTTGGTGGAACAGACTATGTGAATTCCCGGGAGATATCA 6349
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 6784 AACATATTTCTTCATGAATCTGTTGGTGGAACAGACTATGTGAATTCCCGTGAGATTTCA 6843
Query 6350 TGCGAAATGGTTCTTGACCCTGATCCTAAGGGTTATACTATTGTCCCAACCACTATACAC 6409
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 6844 TGTGAAATGGTTCTTGACCCTGATCCTAAGGGTTATACTATTGTCCCAACCACGATACAC 6903
Query 6410 CCTGGGGAAGAAGCACCTTTTGTCCTTTCAGTCTTCACAAAAGCATCCATTGTTCTTGAA 6469
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6904 CCAGGGGAAGAAGCACCTTTTGTCCTTTCAGTCTTCACAAAAGCATCCATTGTTCTTGAA 6963
Query 6470 GCTTTGTAGTGCCCGTATAGTCAGATGG 6497
|||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6964 GCTTTGTAGTGCCCGTATTGTCAGATGG 6991
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 324412849611
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5