BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg924574
Length=2975
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G63770.5 | Symbols: | Peptidase M1 family protein | chr1:23... 2495 0.0
> AT1G63770.5 | Symbols: | Peptidase M1 family protein | chr1:23657506-23664677
REVERSE LENGTH=3420
Length=3420
Score = 2495 bits (1351), Expect = 0.0
Identities = 1451/1501 (97%), Gaps = 0/1501 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1468 CTGAGGTCGTCAGGATGTACAAAACTCTACTAGGAACTCAGGGGTTCCGAAAGGGAATTG 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1649 CTGAGGTCGTCAGGATGTACAAAACTCTACTAGGAACTCAGGGGTTCCGAAAGGGAATTG 1708
Query 1528 ATCTCTATTTTGAAAGACATGATGAGCAAGCAGTGACTTGTGAAGACTTCTTTGCTGCTA 1587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 ATCTCTATTTTGAAAGACATGATGAGCAAGCAGTGACTTGTGAAGACTTCTTTGCTGCTA 1768
Query 1588 TGCGTGATGCAAACAATGCAGATTTTGCTAATTTCTTGCAATGGTACTCTCAAGCTGGAA 1647
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 TGCGTGATGCAAATAATGCAGACTTTGCTAATTTCTTGCAATGGTACTCTCAAGCTGGAA 1828
Query 1648 CGCCAGTTGTCAAAGTGGTTTCCTCTTACGATGCTGAAGCTCGTACTTTCTCTTTAAAAT 1707
|||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 CGCCCGTTGTCAAAGTGGTATCCTCTTACAATGCTGACGCTCGTACTTTCTCTTTAAAAT 1888
Query 1708 TCAGTCAGGAGATACCTCCGACTCCAGGCCAGCCAACAAAAGAACCTACATTTATACCAG 1767
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1889 TCAGTCAGGAGATACCTCCAACTCCAGGCCAGCCAACAAAAGAACCTACATTTATTCCAG 1948
Query 1768 TGGTTGTTGGTCTTCTGGACTCGAGTGGTAAAGACATTACACTCTCCTCTGTTCATCATG 1827
|||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1949 TGGTTGTTGGTCTTTTGGACTCAAGTGGGAAAGACATTACTCTTTCCTCTGTTCATCATG 2008
Query 1828 ATGGTACAGTGCAGACCATTTCAAGCAGCAGCACAATACTTCGAGTGACTAAGAAAGAAG 1887
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 ATGGTACAGTGCAGACCATTTCAGGCAGCAGCACAATACTTCGAGTGACTAAGAAAGAAG 2068
Query 1888 AAGAATTTGTGTTTTCTGATATATCAGAAAGACCTGTTCCGTCCCTATTTAGGGGATTCA 1947
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2069 AAGAGTTTGTGTTTTCTGATATACCAGAAAGACCTGTTCCATCCCTATTTAGGGGATTCA 2128
Query 1948 GTGCCCCAGTTCGTGTTGAGACTGATCTCTCTAATGATGACTTGTTCTTCCTCCTAGCTC 2007
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2129 GTGCCCCAGTTCGTGTTGAAACTGATCTCTCTAATGATGACTTATTCTTCCTCCTAGCAC 2188
Query 2008 ATGATTCAGATGAATTCAATCGGTGGGAGGCCGGTCAAGTTCTGGCGAGGAAGCTGATGT 2067
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2189 ATGATTCAGATGAATTCAATAGGTGGGAGGCCGGTCAAGTTCTGGCAAGAAAGCTGATGC 2248
Query 2068 TGAACTTAGTTTCTGATTTCCAGCAAAATAAACCATTGGTTCTGAACCCAAAATTTGTGC 2127
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2249 TGAACTTAGTTTCTGATTTCCAGCAAAATAAACCGTTGGCTCTAAACCCAAAATTTGTGC 2308
Query 2128 AAGGTCTCGGCAGTGTTCTTTCTGACTCAAGCTTGGACAAGGAATTTATAGCCAAAGCAA 2187
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309 AAGGTCTCGGCAGTGTGCTTTCTGACTCAAGCTTGGACAAGGAATTTATAGCCAAAGCAA 2368
Query 2188 TAACACTGCCTGGGGAGGGAGAGATAATGGACATGATGGCTGTGGCGGATCCTGATGCCG 2247
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2369 TAACACTACCTGGGGAGGGAGAGATAATGGACATGATGGCCGTGGCGGATCCTGATGCTG 2428
Query 2248 TTCATGCTGTTAGAAAGTTTGTAAGAAAGCAGCTTGCATCTGAACTTAAAGCTGAGCTTC 2307
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 2429 TTCATGCTGTTAGAAAGTTTGTACGAAAGCAGCTTGCATCTGAACTTAAGGAGGAGCTTC 2488
Query 2308 TAAAGATAGTCGAGAACAATAGGAGCACAGAAGCTTATGTCTTTGACCACCCAAACATGG 2367
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2489 TAAAGATAGTCGAGAACAATAGGAGCACAGAAGCTTATGTCTTTGACCACTCAAACATGG 2548
Query 2368 CGAGGCGTGCTTTGAAGAACACAGCTCTAGCTTATCTTGCATCTCTTGAGGATCCAGCAT 2427
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2549 CGAGGCGTGCTTTGAAGAATACAGCTCTAGCTTATCTTGCATCTCTCGAAGATCCAGCAT 2608
Query 2428 ATATGGAACTTGCACTGAATGAATACAAGATGGCCACCAATTTGACCGACCAATTTGCTG 2487
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2609 ATATGGAACTTGCACTGAACGAATACAAGATGGCCACCAATTTGACCGACCAATTTGCTG 2668
Query 2488 CTTTGGCAGCTCTTTCCCAGAACCCTGGTAAAACCCGTGACGACATTCTTGCCGACTTCT 2547
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2669 CTTTGGCAGCTCTATCCCAGAACCCTGGTAAAACCCGTGACGACATTCTTGCCGACTTCT 2728
Query 2548 ATAACAAGTGGCAGGACGATTACTTGGTTGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAATCAACAT 2607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729 ATAACAAGTGGCAGGACGATTACTTGGTTGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAATCAACAT 2788
Query 2608 CCGACATTCCTGGCAATGTAGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTCGATC 2667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2789 CCGACATTCCTGGCAATGTAGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTCGATC 2848
Query 2668 TGCGCAACCCTAACAAGGTTTACTCGCTTATTGGAGGGTTCTGCGGTTCCCCAGTGAATT 2727
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2849 TGCGCAACCCAAACAAGGTTTATTCGCTTATTGGAGGGTTCTGCGGTTCCCCAGTGAATT 2908
Query 2728 TCCATGCCAAGGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTCGTCCAGTTAGACA 2787
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2909 TCCATGCCAAGGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACA 2968
Query 2788 AATTGAACCCTCAGGTTGCTTCTCGTATGGTGTCTGCCTTTTCGAGGTGGAAGCGGTACG 2847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2969 AATTGAACCCTCAGGTTGCTTCTCGTATGGTGTCTGCCTTTTCGAGGTGGAAGCGGTACG 3028
Query 2848 ATGAAACCCGTCAAGGTCTAGCCAAGGCACAACTGGAGATGATAATGTCTGCAAATGGGC 2907
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3029 ATGAAACCCGTCAAGGTCTAGCCAAGGCACAATTGGAAATGATAATGTCTGCTAATGGGC 3088
Query 2908 TGTCTGAGAATGTCTTTGAGATTGCCTCCAAGAGTTTGGCTGCTTGAGGGAAACTTTAAG 2967
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 3089 TGTCTGAGAATGTCTTTGAGATTGCCTCCAAGAGTTTGGCTGCTTGAGAGACACGTTAAG 3148
Query 2968 A 2968
|
Sbjct 3149 A 3149
Score = 2435 bits (1318), Expect = 0.0
Identities = 1387/1421 (98%), Gaps = 2/1421 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GAA-TTGGGTATT-TTTTAAATGGCTCGGTTGATAATTCCTTGTCGAAGTTCGTCTCTGG 60
||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 GAATTTGGGTGTTCTTTTAAATGGCTCGGTTGATAATTCCTTGTCGAAGTTCGTCTCTGG 133
Query 61 CGAGAGTCAATCTTCTGGGTTTGCTCTCTCGTGCTCCTGTTCCTGTTAGAAGCAGTTGTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134 CGAGAGTCAATCTTCTGGGTTTGCTCTCTCGTGCTCCTGTTCCTGTTAGAAGCAGTTGTC 193
Query 121 TTCGTAGTTCGGCAAAGAGACTTACTCAATACAGACCGTTTCTTACTTCCGAGGCCATTT 180
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 TTCGTAGTTCGGCAAACAGACTTACTCAACACAGACCGTTTCTTACTTCCGAGGCCATTT 253
Query 181 GTTTGAGGAAGAATCGGTTTCTACCCCATTCTGTTGATAGACAGAAGCAAAACAGCAGGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 254 GTTTGAGGAAGAATCGGTTTCTACCCCATTCTGTTGATACACATAAGCAAAACAGCAGGA 313
Query 241 GGCTCATTTGTTCTGTTGCCACAGAATCAGTTCCGGATAAAGCTGAAGAATCCAAAATGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 314 GGCTCATTTGTTCTGTTGCCACAGAATCAGTTCCGGATAAAGCTGAAGATTCCAAAATGG 373
Query 301 ATGCACCAAAAGAAATATTTCTCAAGGACTACACAAAGCCTGATTACTACTTTGAAACTG 360
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 ATGCACCTAAAGAAATATTTCTCAAGAACTACACAAAGCCTGATTACTACTTTGAAACTG 433
Query 361 TGGATCTGAGCTTCTCTCTAGGTGAAGAGAAAACAATTGTTAGCTCTAAAATCAAGGTTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 TGGATCTGAGCTTCTCTCTAGGTGAAGAGAAAACAATTGTTAGCTCTAAAATCAAGGTTT 493
Query 421 CCCCTCGAGTTAAAGGATCTTCCGCTGCATTGGTCTTGGATGGACATGACTTGAAGCTAC 480
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 CTCCTCGAGTTAAAGGATCTTCTGCTGCATTGGTCTTGGATGGACATGACTTGAAGCTAC 553
Query 481 TTTCAGTTAAGGTTGAGGGGAAGCTTCTAAAGGAAGGGGATTACCAGTTGGACTCTCGTC 540
|||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 554 TTTCTGTCAAGGTTGAGGGGAAGCTTCTTAAGGAAGGGGATTACCAGTTGGACTCTCGCC 613
Query 541 ATCTTACTATTCCTTCGCTTCCAGCTGAGGAGTCCTTTGTTTTGGAAATTGATACTGAGA 600
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 614 ATCTAACTCTTCCTTCGCTTCCAGCTGAGGAGTCCTTTGTTTTGGAGATTGATACTGAGA 673
Query 601 TATACCCCCACAAGAATACTTCACTTGAGGGGCTTTACAAGTCTTCTGGGAATTTTTGCA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 674 TATACCCCCACAAGAATACTTCACTTGAGGGGCTTTACAAGTCTTCTGGGAATTTCTGCA 733
Query 661 CACAGTGCGAAGCAGAAGGTTTCCGCAAAATTACATTTTACCAGGATCGTCCTGACATAA 720
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 734 CACAGTGTGAAGCAGAAGGTTTCCGCAAAATTACATTTTACCAGGATCGTCCTGATATAA 793
Query 721 TGGCAAAGTACACGTGTCGTGTGGAAGCTGACAAGACACTTTATCCTGTGTTATTGTCCA 780
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 TGGCTAAGTACACGTGTCGTGTGGAAGGTGACAAGACACTTTATCCTGTGTTATTGTCCA 853
Query 781 ATGGAAACCTCATTTCTCAAGGAGATGTAGAGGGTGGTCGGCACTATGCCTTATGGGAGG 840
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 854 ATGGAAACCTCATTTCTCAAGGAGATATAGAGGGTGGTCGACACTATGCCTTATGGGAGG 913
Query 841 ATCCATTCAAGAAACCGTGCTATCTATTTGCTCTGGTGGCTGGACAGCTAGTGAGCAGAG 900
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 ATCCATTCAAGAAACCGTGCTATCTATTTGCTTTGGTGGCTGGACAGCTAGTGAGCAGAG 973
Query 901 ATGATACATTTACCACACGCTCTGGTAGGCAGGTTTCCCTGAAAATCTGGACTCCTGCAG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 ATGATACATTTACCACACGCTCTGGTAGGCAGGTTTCCCTGAAAATCTGGACTCCTGCAG 1033
Query 961 AAGATCTACCAAAGACTGCCCATGCCATGTATTCCTTAAAAGCGGCCATGAAGTGGGATG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 AAGATCTACCAAAGACTGCCCATGCCATGTATTCCCTAAAAGCGGCCATGAAGTGGGATG 1093
Query 1021 AGGATGTGTTTGGGCTTGAGTATGACCTGGATCTCTTCAACATTGTTGCTGTTCCAGATT 1080
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 AGGATGTGTTCGGGCTTGAGTATGACCTGGATCTCTTCAACATTGTTGCTGTTCCAGATT 1153
Query 1081 TTAACATGGGAGCCATGGAAAACAAGAGTTTGAATATTTTTAATTCCAAGCTTGTCCTAG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 TTAACATGGGAGCCATGGAAAACAAGAGTTTGAATATTTTTAATTCCAAGCTTGTCCTAG 1213
Query 1141 CATCTCCAGAAACTGCAACAGATGCGGATTACGCTGCAATTTTGGGTGTTATTGGTCATG 1200
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 CATCTCCAGAAACAGCAACAGATGCAGATTACGCTGCAATTTTGGGTGTTATTGGTCATG 1273
Query 1201 AGTACTTTCACAATTGGACAGGGAACAGGGTGACATGCCGTGACTGGTTCCAACTCAGTC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274 AGTACTTTCACAATTGGACAGGGAACAGGGTGACATGCCGTGACTGGTTCCAACTCAGTC 1333
Query 1261 TAAAGGAAGGACTTACTGTCTTCCGTGACCAGGAGTTTTCATCTGACATGGGAAGCCGAA 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 TAAAGGAAGGACTTACTGTCTTCCGTGACCAGGAATTTTCATCTGACATGGGAAGCCGAA 1393
Query 1321 CTGTAAAGCGCATTGCTGATGTTTCAAAGCTTCGGATCTATCAATTTCCGCAGGATGCTG 1380
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 CTGTAAAGCGAATTGCTGATGTTTCAAAGCTTCGGATCTATCAATTTCCGCAGGATGCTG 1453
Query 1381 GTCCTATGGCACATCCTGTTCGCCCACATTCTTACATCAAG 1421
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1454 GTCCTATGGCACATCCTGTTCGCCCACATTCATACATCAAG 1494
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 147892147964
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5