BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg925208
Length=4012
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G58230.1 | Symbols: | binding | chr1:21566148-21579123 FORW... 6577 0.0
> AT1G58230.1 | Symbols: | binding | chr1:21566148-21579123 FORWARD
LENGTH=8256
Length=8256
Score = 6577 bits (3561), Expect = 0.0
Identities = 3822/3951 (97%), Gaps = 6/3951 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAACTCCGATTGAGCTAATGGAATCTGTCTCTGTCGCAGAATCGCCTGCTAGTTCTG 60
|||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||
Sbjct 166 ACGAAA--CCTATTGAGCTAATGGAATCTGACTCTGTCGCAGGATCGGCTTCAAGTTCTG 223
Query 61 ATGCAACTGCGTCTCATTTGCCGAGTGTGTCTGTACTTTTAGACGCTCTTGAGCAGTCTG 120
||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 224 ATGCAGCTGCGTCTCATTTGCCAAGTGTGTCTGTCCTTTTAGATGCTCTTGAGCAGTCTG 283
Query 121 CATCTACACCTAGGATCACAAATGGTCTTTCGCAGCGGCTGTTACGTTCGTTACAGCTT- 179
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 284 CATCTACACCTAGGATCGCAAATGGTCTTTCACAGAGGCTGTTACGTTCGTTACAG-TTC 342
Query 180 TCAAATGAAAATAAGCTTTCGTTTAAGGTGTTGAATGGAGCTTGTCGTGTGCTCAGATTG 239
|||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 TCAAATGAAAATAAACTTTCTTTTAAGGCGTTGAATGGAGCTTGTCGTGTGCTCAGATTG 402
Query 240 GCTTGTATTCAAGCTAAGGAAAGTAGGAAGTCCGGGTGTGTTAGTCCTTTAGTTGAAAGT 299
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 403 GCTTGTATTCAAGCTAAAGAAAGTAGGAAGTCCGGGTGTGTTAGCCCTTTAGTAGAAAGT 462
Query 300 AGTGACAGTGGAGTTATAGTTGATTCAACTCTTAAGAAGTCTGATTCAAGTCGTGCAGAG 359
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||
Sbjct 463 AGTGACTGTGGAGTTATAGTTGATTCACCTCATAAGAAGTCTGATTCGAGTCATACAGAG 522
Query 360 GATTTTTGGTTTGAGTGCGTGGAATCATGCGTGGGGATATTCACTGAGTTTTTCTCATCA 419
|||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 523 GATTGTTGGTTTGAGTGCGTGGAATCTTGTGTGGGGATTTTCACTGAGTTTTTCTCGTCC 582
Query 420 ACAG-ATGAAGCGAAAGTATATGTTTTGCGAAGCTCTGTTTGTGTTGATTGTCTTTTTGA 478
|| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 AC-GAATGATGCCAAAGTATATGTTTTGCGAAGCTCCGTTTGTGTTGATTGTCTTTTTGA 641
Query 479 GCTGTTTTGGGAAAAAGCTGTAAGAAACAATGTGATGAAACTCATTATTGATCTCATGAA 538
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 GCTGTTTTGGGAAAAAGCCGTTAGAAACAATGTGATGAAACTCATTATTGATCTCATGAA 701
Query 539 GATCAGGCCTTTGTGTGAGGAAGACAAAAGCGCAAAATTGCAAGTGTGTTCCAAATATCT 598
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GATTAGGCCTTTGTGTGAGGAAGACAAAAGCGCAAAATTGCAAGTGTGTTCCAAATATCT 761
Query 599 AGAAACTTTCACTCAAGTGAAGGAAAGAGAAAACGATTTTGTTGACTTATCTGTTGATCT 658
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 762 AGAAACTTTCACTCAAGTGAAAGAAAGAGAAAATGATTCTGTTGACTTATCTGTTGATCT 821
Query 659 ATTGGCGGGTATGAGGGATTTGATCAAGACTAATTCGAGGTATTACCAAGCCCTATTCCG 718
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 ATTGGCGGGTATGAGGGATTTGATCAAGTCTGATTCGAGGTATTACCAAGCCCTATTCCG 881
Query 719 GGAGGGGGAGTGTTTCTTACACATTGTCTCTCTCTTAAATGGTAATCTCGATGAAGCAAA 778
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 TGAGGGAGAGTGTTTCTTACACATTGTCTCTCTCTTAAATGGTAATCTCGATGAAGCAAA 941
Query 779 TGGAGAGAAGTTGGTTTTGAATGTCCTTCAAACTTTAACTTCCCTGCTTGCAAATAATGA 838
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 TGGAGAGAAGTTGGTTTTAAATGTCCTTCAAACTCTAACTTCCCTGCTTGCAAATAATGA 1001
Query 839 TACGTCAAAGTTTGCATTTAAAGCCCTTGCTGGCAAGGGTTATCAGACACTTCAAAGCTT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 TACGTCAAAGTTTGCATTTAAAGCCCTTGCTGGCAAGGGTTATCAGACACTTCAAAGCTT 1061
Query 899 ATTGTTGGATTTCTTCCAATGGAAACCTACTCAAAGGCTCTTAGACGCACTACTTGATAT 958
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 1062 ATTGTTGGATTTCTTCCAATGGAAACCTACCCAAAGGCTATTAGACGCATTACTTGATAT 1121
Query 959 GCTTGTTGATGGAAAATTTGATGATAAAGGCAGTGCCCTTATAAAGAATGAAGATGTTAT 1018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1122 GCTTGTTGATGGAAAATTTGATGATAAAGGCAGTGCCCTTATCAAGAATGAAGATGTTAT 1181
Query 1019 CATACTTTACTTAAATGTACTTCAGAAGAGCAGCGAGTCTTTGCAGTGTTATGGGCTAAA 1078
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CATACTTTACTTAAATGTACTTCAGAAGAGCAGCGAATCTTTGCAGTGTTATGGGCTAAA 1241
Query 1079 TTTGTTTCAGCAACTCCTTAGGGATTCCATATCGAATCGTGCTTCATGTGTTCGGGCGGG 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1242 TTTGTTTCAGCAACTCCTTAGGGATTCCATATCGAATCGTGCTTCATGTGTTCGGGCAGG 1301
Query 1139 AATGCTTCACCTTCTTCTTGATTGGTTTTCTCTCGAAAATGATGATAGTGTTATCTTGAA 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 AATGCTTCACCTTCTTCTTGATTGGTTTTCTCTGGAAAATGATGATAGTGTTATCTTGAA 1361
Query 1199 AATAACACAGCTAACTCAGACAATTGGTGGCCACAGTATTTCTGGGAAGGATATACGTAA 1258
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 AATAACACAGCTAACTCAGACAATTGGTGGTCACAGTATTTCTGGGAAGGATATACGTAA 1421
Query 1259 GATCTTTGCCCTTCTTCGGAGTGAAAGAGTTGGCAATCAACAAAGATACCGCTCACTGTT 1318
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1422 GATCTTTGCTCTTCTTCGGAGTGAAAGAGTGGGCAATCAACAGAGATACCGCTCACTGTT 1481
Query 1319 ATTGGCTTGTTTGTTGTCAATGCTGAATGAGAAAGGACCAACAGGCTTTTTTGACATGAA 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 ATTGGCTTGTTTGTTGTCAATGCTGAATGAGAAAGGACCAACAGGCTTTTTTGACATGAA 1541
Query 1379 TGGGGTTGAATCTGGGATTGTAATCAGAACACCTGTTCGGTGGCCTGCAAATAAGGGGTT 1438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1542 TGGGGTTGAATCTGGGATTGTAATCAGAACACCTGTTCAGTGGCCTGCAAACAAGGGGTT 1601
Query 1439 TTCCTTTTGCTGTTGGCTTAGGGTAGAAAGCTTTCCTGGAGATGGCAAAATGGGTATCTT 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 TTCCTTTTGCTGTTGGCTTAGGGTAGAAAGCTTTCCTGGAGATGGCAAAATGGGTATCTT 1661
Query 1499 CAGTTTTATGTCAAAAAATGGAAAGGGTTGCTTTGCTGCTATTGGGAAGGATGAACTATC 1558
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1662 CAGTTTTATGTCAAAAAATGGAAAGGGTTGCTTTGCTGCTCTTGGGAAGGATGGACTATC 1721
Query 1559 TTATGTTTCTCTGAATCTGAAACGGCAATGTGTAAATGTGCATGCCAATTTGGTCTGTAA 1618
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1722 TTATGTGTCTCTGAATCTGAAACGGCAATGTGTAAATGTGCATACCAATTTGGTCTGTAA 1781
Query 1619 AAAATGGCATTTTATTTGTATATCTCATAGTATTGGAAGAGCATTCTGGGGTGGAAGCCT 1678
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 AAAATGGCATTTTATTTGTGTATCTCATAGTATTGGTAGAGCATTCTGGGGTGGAAGCCT 1841
Query 1679 CTTGAGGTGTTATGTTGATGGGGATCTTGTGTCATCCGAAAGATGCAGCTATCCCAAAGT 1738
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 CTTGAGGTGTTATGTTAATGGGGATCTTGTGTCATCCGAAAGATGCAGCTATCCCAAAGT 1901
Query 1739 TACTGATGTACTTACCAGCTGCTTAATTGGTACAAGAATCACGTTGCCACATATCCAAGA 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 TACTGATGTACTTACCAGCTGCTTAATTGGTACAAGAATCACGTTGCCACATATCCAAGA 1961
Query 1799 TAACGATGGCCTGGAATCGATCCGAGATGTGTTCCCATTTTTTGGCCAGATTGGCCCTGT 1858
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1962 TAATGATGGCCTGGAATCGATCCGAGATGTGTTCCCATTTTTTGGTCAGATTGGCCCTGT 2021
Query 1859 TTACTTGTTCAATGATTCCTTGTCTTCAGAGCAAGTTCAGGCCATTTATTCGCTAGGACC 1918
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 TTACTTGTTCAATGATTCCTTGTCTTCCGAGCAAGTTCAGGCCATTTATTCGCTAGGACC 2081
Query 1919 AAGCTATATGTATGCATTCTTGGAGAATGAGATGACAGGTCCCTTTTCTGATAGTCCATT 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2082 AAGCTATATGTATGCATTCTTGGAGAATGAGATGACATGTCCCTTTTCTGATAATCCATT 2141
Query 1979 TCCTAGTGGTATTCTTGATGGAAAAGATGGGCTTGCATCTAAGGTTTCCTTTGGACTGAA 2038
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 TCCTAGTGGCATTCTTGATGGAAAAGATGGGCTTGCATCTAAGGTTTCCTTTGGACTGAA 2201
Query 2039 TGCACAGGCGAGCGATGGTAGGAGATTGTTTAATGTGTCTCGGGTTTCAGATCATCTACA 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2202 TGCACAGGCGAGCGATGGTAGGAGATTGTTTAATGTGTCTCGGGTGTCAGATCATCTACA 2261
Query 2099 AGAAAGGCTCGCATTTGAGGCCGATATTATGGTTGGTACTCAGCTATGCTCGCGGCGCTT 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 AGAAAGGCTCGCATTTGAGGCCGATATTATGGTTGGTACTCAGCTATGCTCGCGGCGCTT 2321
Query 2159 GCTCCAGCAGATAATTTACTGTGTCGGAGGGATATCTGTTTTCTTTCCTTTGATTACACA 2218
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2322 GCTTCAGCAGATAATTTACTGTGTCGGAGGGATATCTGTTTTCTTTCCTTTGATAACACA 2381
Query 2219 ATCTGATAGATGTGAAAGTGAAGCACTTAAAGAGGAAACTTCACCTATGCCTTTAAAAGA 2278
|||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2382 ATCTGATAGATGTGAAAGTGAAACACTGAACGAGGAAACTTCAGCTATGCCTACAAAAGA 2441
Query 2279 GCGTATGACAGCAGAAGTTATTGAATTGATTGCTTCTGTCTTGGATGAAAATCCAGCAAA 2338
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 GCGTATGACAGCAGAAGTTATTGAACTGATTGCTTCTGTCTTGGATGAAAATCCAGCAAA 2501
Query 2339 TCAGCAACAGATGCATCTTCTCTCTGGATTCCCCATACTTGGATTTTTATTACAGTCTAT 2398
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 TCAGCAACAGATGCATCTTCTCGCTGGATTCCCCATACTAGGATTTTTATTACAGTCTAT 2561
Query 2399 TCAACCGAAGCAACTCAATCTAGAGACACTTTCATCCTTGAAACACCTATTCAACGTTAT 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2562 TCAACCGAAGCAACTCAATCTAGAGACACTTTCGTCTTTGAAACACCTCTTCAACGTTAT 2621
Query 2459 TTCAAGCTCTGGGTTTGCTGAGCAGCTTGTGGAGGATGCTATATCTAGCATATTCCTTAA 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2622 TTCAAGCTCTGGGTTTGCTGAGCAGCTTGTGGAGGATGCTATATCTAGCATTTTCCTTAA 2681
Query 2519 TCCTCACATTTGGCTCCATGCGGCCTATAATGTGCAGCGTGAACTTTACATGTTTCTCAT 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 TCCTCACATTTGGCTCCATGCGGCCTATAATGTACAGCGTGAACTTTACATGTTTCTCAT 2741
Query 2579 CCAACAGCTAGATAACGATCCACGACTTCTGGGAAGCCTTTGTCGACTCCCCAGAGTTAT 2638
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 CCAACAGCTAGATAATGATCCACGACTTCTCGGAAGCCTTTGTCGACTCCCCAGAGTTAT 2801
Query 2639 TGACATAGTATGGAACTTTTACTGGGAATCTGAAAGATACTGTAAAGGAAGCAAGCCTCT 2698
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802 TGACATTGTATGGAACTTTTATTGGGAATCTGAAAGATACTGTAAAGGAAGCAAGCCTCT 2861
Query 2699 TATGCATCCAGCAAGGACTATAGAAGAAAGACCAAGTAGAGATGAAATTCATAAAATTCG 2758
|||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2862 TATGCATCCAACAAGGACTATTGCAGAAAGACCAAGTAGAGATGAAATTCACAAAATTCG 2921
Query 2759 TCTCCTTTTGCTGAGCCTAGGTGAAATGAGTCTGAGGCAAAATATCTCATCAGGGGACGT 2818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2922 TCTCCTTTTGCTGAGCCTAGGTGAAATGAGTCTGAGGCATAATATCTCATCAGGGGACGT 2981
Query 2819 AAAAGCTTTGACAGCATTTTTTGAGACATGCCAGGATGTAGCATGTATCGAAGATGTTCT 2878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 AAAAGCTTTGACAGCATTTTTTGAGACATGCCAGGATGTAGCATGTATCGAAGATGTTCT 3041
Query 2879 GCATATGGTTATCCGTGCAATTTCTCAAACATCGGTCCTTGTTTCTTTTCTTGAACAAGT 2938
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3042 GCATATGGTTATCCGTGCCATTTCTCAAACATCGGTCCTTGTTTCGTTTCTTGAACAAGT 3101
Query 2939 CAATCTTATCGGTGGATGTCACACTTTCGTCGATCTTCTTCAGAGGGATTACGAGCCTAT 2998
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3102 CAATCTTATCGGTGGATGTCACATTTTCGTCGATCTTCTCCAGAGGGATTACGAGCCTAT 3161
Query 2999 AAGGTTACTCAGCTTGCAGTTCCTTGGAAGGCTTCTTTATGATGTACCTTCTGAGAGAAA 3058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3162 AAGGTTACTCAGCTTGCAGTTCCTTGGAAGGCTTCTTTATGATGTACCTTCTGAGAGAAA 3221
Query 3059 AGGACCTAAGTTTTTCAATCTTGCTGTTGGAAGAACTAAGTCTCTATCACAAGGGCATAA 3118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3222 AGGACCTAAGTTTTTCAATCTTGCTGTTGGAAGAACTAAGTCTCTATCACAAGGGCATAA 3281
Query 3119 GAAGATTGGTGCTAGAACGCAACCAAtttttttGGCCATGTCTGATAGATTGTTCCAATA 3178
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3282 GAAAATTGGTGCTAGAACGCAACCAATTTTTTTGGCCATGTCTGATAGATTGTTCCAGTA 3341
Query 3179 TCCTCAGACAGATAACTTGCGTGCAACCTTGTTTGATGTTCTTCTTGGTGGGGCCAGCCC 3238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3342 TCCTCAGACAGATAACTTGCGTGCAACCTTGTTTGACGTTCTTCTTGGTGGGGCCAGCCC 3401
Query 3239 CAAACAGGTTTTACAAAAACACAACCAGGTTGATAAGCACAGAAGCAAACCAAGCAACTC 3298
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3402 CAAACAGGTTTTGCAGAAACACAACCAGGTTGATAAGCACAGAAGCAAACCAAGCAACTC 3461
Query 3299 TCACttttttcttccacaaatttttgtttttatttttGAATTCCTGTCCGGCTGCAAGGA 3358
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 3462 TCACTTTTTCCTTCCACAAATTTTTGTTTTTATTTTCGAATTCCTCTCGGGCTGCAAGGA 3521
Query 3359 TGGATTAACACGAATGAAGATCATCAGTGACATACTCGATCTTCTTGATTCAAATCCTAT 3418
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3522 TGGATTAGCACGAATGAAGATCATCAGTGACATACTCGATCTTCTTGATTCAAATCCTAT 3581
Query 3419 GAATGTTGAAGCTTTGATGGAATTTGGATGGAGTGCATGGTTAACAGCGTCAATGAAACT 3478
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3582 GAATGTTGAAGCTTTGATGGAATTTGGATGGAGTGCGTGGTTAACAGCATCAATGAAACT 3641
Query 3479 TGATGTGATAAAAGACTACAGATCTGAATTGCTTAATCATGATGACTTGGCATTAAATGA 3538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3642 TGATGTGATAAAAGACTACAGATCTGAATTGCTTAATCATGATGACTTGGCATTAAATGA 3701
Query 3539 GCAACATTTTGTCAGGGGTCTCTTTTGTGTTGTTCTCTGCCACTATATTTTATCTGTGAA 3598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3702 GCAACATTTTGTCAGGGGTCTCTTTTGTGTTGTTCTCTGCCACTATATTTTATCTGTGAA 3761
Query 3599 GGGAGGTTGGCAGCAGCTAGAGGAAACTGTGAATTTCATACTCTTGCAGAGTGAGCATAA 3658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3762 GGGAGGTTGGCAGCAGCTAGAGGAAACTGTGAATTTCATACTCTTGCAGAGTGAGCATAA 3821
Query 3659 TGATGTCCCATACCGGTCTTTTCTCCGTGATCTCTATGAGGACTTGATTCAGCGTTTGGT 3718
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3822 TGATGTCCCGTACCGGTCTTTTCTCCGTGATCTCTATGAAGACTTGATTCAGCGTTTGGT 3881
Query 3719 GGAGCTCTCATCTGAAGATAATATATTCCTTTTGCACCCATGTCGCGACAATGTGCTGTA 3778
||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3882 GGAACTCTCATCTGAAGATAATATTTTCCTTTCGCACCCATGTCGCGACAATGTGCTGTA 3941
Query 3779 TCTCTTGCGGCTCGTTGATGAGATGCTTGTCCGTGAATTTGGCAGTAGGCTCCTGTTTCC 3838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3942 TCTCTTGCGGCTCGTTGATGAGATGCTTGTCCGTGAATTTGGCAGTAGGCTCCTGTTTCC 4001
Query 3839 AGCAATTAGCACTGATTTTTCAGAGGATTTATTACAACTTGGGAACCGTGAGGACCACAG 3898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 4002 AGCAATTAGCACTGATTTTTCAGAGGATTTATTACAACTTGGAAACCGTGAGGACCCCAC 4061
Query 3899 TTTGGGATTAGACGAGAGTTTCCAACGATTTTTGACTGAAGAAATCTCTAG 3949
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4062 TTTGGGATTAGATGAGAGTTTCCAACGATTTTTGACTGAAGAAATCTCTAG 4112
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 199915267855
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5