BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg926002
Length=5741
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G67500.2 | Symbols: REV3 | recovery protein 3 | chr1:2528770... 7249 0.0
> AT1G67500.2 | Symbols: REV3 | recovery protein 3 | chr1:25287707-25296937
REVERSE LENGTH=5883
Length=5883
Score = 7249 bits (3925), Expect = 0.0
Identities = 4569/4869 (94%), Gaps = 87/4869 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 886 GATATTCTCAATCAACAGTTTAAAATGTACAACTCCCTTTCACAAGCCCAGTCTGATACT 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GATATTCTCAATCAACAGTTTAAAATGTACAACTCCCTTTCACAAGCCCAGTCTGATACT 1128
Query 946 AACATGGTTCAGTCGCTTGTGACAATTTGGGAGGAGGAATATGAAAGGACTGGCGTGCAT 1005
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1129 AACATGGTTCAGTCGCTTGTGGCAATTTGGGAGGAGGAGTATGAAAGGACTGGTGTGCAT 1188
Query 1006 GATGCACCTATACCTCCTGATCCTGGCAAACCATCTGCAGCAGATGTGTTGAAGACTATG 1065
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 1189 GATGCACCTATACCTCCTGATCCTGGTAAACCCTCTGCAGCTGATGTGTTGCAGACTATG 1248
Query 1066 TCAGATTATGTTGGGTTTGAGAATATGCTTAAAGAAATGCAT-AACGAAGTTGACTTGTC 1124
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||
Sbjct 1249 TCAGATTATGTTGGGTTTGGGAATATGCTTAAAGAAATGC-TAAACAAAGTTGAATTGTC 1307
Query 1125 TCAGTCTGATATGAAGCCTACTGCAGTATCTTCAGCCGGTCCAGATAGGCATGCCAAACC 1184
|| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1308 TCCGCCTGGTATGAAGCCTACTGCAGTATCTTCAGCTGGTCCAGATATGCATGCCAAACC 1367
Query 1185 TGAAATTAGTGATCTGCAGGTTTTGAATCATATGGTTGGTACAAGCAGTAAGTTTCCTGC 1244
|||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1368 TGAAATTACTGATCTACAGGCTTTGAATCATATGGTTGGTACATGCAGTGAGTTTCCTGC 1427
Query 1245 ATCAGAACAGCTTTCTCCACTTGGTGAGAGGAGTGGAGAAGCATCAATGGAAAATGATGA 1304
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 ATCAGAACAGCTTTCTCCACTTGGCGAGAAGAGTGAAGAAGCATCAATGGAAAATGATGA 1487
Query 1305 ATATATGAAAACACCCACGGACAGAGATACACCTGCTGAAATACAAGATGCTGAAGCCTT 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 ATATATGAAAACACCCACGGACAGAGATACACCTGCTCAAATACAAGATGCTGAAGCCTT 1547
Query 1365 GGGTCTCTTTAAGTGGTTTGCCTCATCCCAGGCTGCAGAGGACATAAACTCTGATGATGA 1424
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1548 GGGTCTCTTTAAGTGGTTTGCCTCATCTCAGGCTGCAGAGGACATAAACTCAGATGATGA 1607
Query 1425 AATTCTCCGGGAAACTATCCTTAGTCCTCTTTTGCCTTTAGCTTCCATTAACAAGGTTCT 1484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1608 GATTCTCCGGGAAACTATCCTTAGTCCTCTTTTGCCTTTAGCGTCTATTAACAAGGTTCT 1667
Query 1485 TGAAATGGCTAGTACAGATTATGTGAGCCAATCCCAAAAGGAATGTCAAGACATTCTTGA 1544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 TGAAATGGCTAGTACAGATTATGTGAGCCAATCCCAAAAGGAATGTCAAGACATTCTTGA 1727
Query 1545 TTCTCAGGAAGATCTACCAGACTTCGGGAGTTCGACAAAGAGAGCTTTACCTAGTAATCC 1604
|||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 TTCTCAGGAAAATCTTCCAGACTTTGGGAGTTCGACTAAGAGAGCTTTACCTAGTAATCC 1787
Query 1605 TGATAGCCAGAATCTTATAACTTCATCGGACAAACAATCTCTTGAAACAGAAGTCGCTAG 1664
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1788 TGATAGCCAGAATCTTAGAACTTCATCCGACAAACAATCTCTTGAAATAGAAGTCGCTAG 1847
Query 1665 TGATGTTCCAGATATCTCCACTTCAAATGGCGCAAGCGAAAATTCATTCCAGAGATAC-- 1722
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1848 TGATGTTCCAGATAGCTCCACTTCAAATGGAGCAAGCGAAAATTCATTCCGGAGATACAG 1907
Query 1723 ----A--G----A-A-A-GAGTGAAGTAATGGAGAATAAGAACAGGAGCTACTCTAAGAG 1769
| | | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1908 AAAGAGTGATTTACATACGAGTGAAGTAATGGAGTATAAGAACAGGAGCTTCTCTAAGAG 1967
Query 1770 CAACAAGCCTAGCAACTCAGTATGGGGACCTTTACTTTTTACACTGACCAAAAATCTTCA 1829
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 CAACAAGCCTAGCAACTCAGTATGGGGACCTTTACCTTTTACACTGACCAAAAATCTTCA 2027
Query 1830 GAATGACTTTGACAGTACAAATACTAGTGATAAACTTGGTTTAACAAAGATTAATTCAGA 1889
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2028 GAAGGACTTTGACAGTACAAATGCTAGTGATAAACTTGGTTTAACAAAGATTAGTTC--- 2084
Query 1890 CCACCCCATGAATGAGACGACAGACAAATATAATGTTCCAGTCAAAGAACATCAAGCAGA 1949
||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2085 TTACCCCATGAATGAGATGACAGACAATTATATTGTTCCAGTCAAAGAACATCAAGCAGA 2144
Query 1950 TGTTTGTAATTCGATTGACAGAAACGTTTTGGCTGGATTTTCTCTGCGGGACTTGATGAG 2009
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 TGTTTGTAATACAATTGACAGAAACGTTTTGGCTGGATGTTCTCTGCGGGACTTGATGAG 2204
Query 2010 GAAAAAACGGTTATGCCATGGAGACTCGCCTGTTTCACAACATATGAAATTTAGAAAGGT 2069
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||
Sbjct 2205 AAAAAAACGGTTATGCCATGGAGAATCGCCTGTTTCACAGCATATGAAGTCT----AGG- 2259
Query 2070 CCTACCACAGTCTAGAGATTCACC-ACACGGGGaaaaaaa-GCAGTGCACCTTGAGATCT 2127
| | || ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
Sbjct 2260 ---A--A-GGT-TAGAGATTC-CCGACACGGGGAAAAAAATG-AGTGCACCTTGAGATGT 2310
Query 2128 GAGGCCGAAAAACAAGGTCCTGCTCTTTCTGCAGAATTTAGTGAAGTTGATTATGGTGAT 2187
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||
Sbjct 2311 GAGGCCAAAAAACAAGGTCCTGCTCTTTCTGCAGAATTTAGCGAATTTGTTTGTGGCGAT 2370
Query 2188 GCTCCTTCAACTTTATCTCCTATAGATGATGGAACTTGTGAGTGTAATATATCCACTCAG 2247
|| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2371 ACT-C--CAAATTTATCTCCTATAGATTCTGGAAATTGCGAGTGTAATATATCCACTGAG 2427
Query 2248 ATGA-CTGAACTTCATTCTGTTGGTAGATGTTCGGCTAAAGAGACAGCATTTCAAAACAG 2306
| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2428 -TCATCTGAACTTCATTCTGTTGATAGATGTTCAGCTAAAGAGACAGCAAGTCAAAACAG 2486
Query 2307 TGATGAAGTTGTAAGGAATTTTTCATTTACCACTGTTTCACTTGGTAAGGATCCACAAAC 2366
|||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2487 TGATGAAGTTTTAAGGAATTTGTCATCTACCACTGTTCCATTTGGTAAGGATCCACAAAC 2546
Query 2367 TGTGGAATCAGGAACATTAGTGTCTAGCAATAAACTTCTTGGGATTGAAATAGATGA-TG 2425
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2547 TGTGGAATCAGGAACACTAGTGTCTAGCAATATACATGTTGGGATTGAAATAGAT-AGTG 2605
Query 2426 TCCAAAAATCGGGGAGGGAGCAAGAGTCAACTGCCAATGAAATTGTTGAGACAGGAAGAT 2485
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||
Sbjct 2606 TCCAAAAATCGGGGAGGGAGCAAGAGTCAACTGCCAATGAAACTGATGAGACGGGAAGAT 2665
Query 2486 TAATATGCCTAACCTTAAGCAAGAAGCCTCCTTCTGTGGATTGCCTAAGTTCTGGACTGC 2545
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||
Sbjct 2666 TAATATGCCTAACCTTAAGCAAGAAGCCTCCTTCTCTCGATTGCCTAAGTGCTGGACTGC 2725
Query 2546 ACGATTCTGCACATTCTCACGATATTCTTGCCCAATTTCATCATGCCAGGGAAAAACAGC 2605
| ||||||||||||||| | | || || | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2726 AGGATTCTGCACATTCT--C---A----TG---AA-AT--TCATGCCAGGGAAAAACAGC 2770
Query 2606 ATGATGGATGTGAGGGGAATTCCAAGGACATCCCATTTTTTCCCTTGGAGGACACCGAAA 2665
|||||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | | |
Sbjct 2771 ATGATGAATATGAGGGAAATTCCAACGACATCCCGTTTTTTCCCTTGGA-G-----G--A 2822
Query 2666 TCAACAAGGATGG-AAAGAAACACTTATTCCAAGGAGCTTCCCTTGGTATTCCCTTGCAT 2724
||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2823 -CAACAAGGA-GGAAAAGAAACACTTTTTCCAAGGAACTTCCCTTGGTATTCCCTTGCAT 2880
Query 2725 CATCTCAATGACGGCTCAAATCTTTACCTACTGGCCCCTGCCTTGTCACCCCCTTCTGTG 2784
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2881 CATCTCAATGACGGCTCCAATCTTTACCTACTGACCCCTGCCTTTTCACCCCCTTCTGTG 2940
Query 2785 GATTCTGTTTTACAATGGATAGCAGAA-GACAAAGGAGACTATAATATTGATTCAGAAAA 2843
||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2941 GATTCTGTTTTACAATGGATATC-GAATGACAAAGGAGACTCTAATATTGATTCAGAAAA 2999
Query 2844 ACAACCATTA-GAAGATGATCATATTGATCGTGGGGCAAGTTTCACTGATCTTGCTTCTG 2902
|||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 ACAACCATTACG-AGATAATCATAATGATCGTGGAGCAAGTTTCACTGATCTTGCTTCTG 3058
Query 2903 CATCTAATGTGGTGTCTGTGTCTGAGCACGTGCAGCATCATAATAACGTTTTTGTGAATT 2962
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3059 CATCTAATGTGGTGTCTGTGTCTGAGCACGTGGAGCAGCATAATAACCTTTTTGTGAATT 3118
Query 2963 CAGAATCAAATACTTATACAGAGTCTGAGATAGATCTGAAACGTAGAGGAACGTTTCTTA 3022
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3119 CAGAATCAAATGCTTATACAGAGTCGGAGATAGATCTGAAACCCAAAGGAACGTTTCTTA 3178
Query 3023 ATCTTAAC-T-C---TCAG-ATTTCCCAAGAGATGTCTCAGATTTCAGGTCCTGATGGGA 3076
|||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3179 ATCTTAACTTGCAGGCCAGTGTTTCCCAAGAGCTGTCTCAGATTTCAGGCCCTGATGGGA 3238
Query 3077 AATCAGGGCCCACTCCCTTAAGTCAAATGGGATTCCGAGATCCTGCGAGCATGGGGGCTG 3136
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3239 AATCTGGGCCCACTCCCTTAAGTCAAATGGGATTCCGAGATCCTGCGAGCATGGGTGCGG 3298
Query 3137 GGCAACAACTTACAGTGCTGAGTATAGAGGTTCATGCAGAGTCTAGAGGGGACCTGCGAC 3196
||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 GGCAACAGCTTACAATTCTGAGTATAGAGGTTCATGCAGAGTCTAGAGGGGACCTGCGAC 3358
Query 3197 CTGATCCACGATTTGATTCTGTCAATGTCATAGCTCTCGTCGTGCAGAATGACGATAGTT 3256
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3359 CTGATCCACGATTTGATTCTGTCAATGTTATAGCTCTCGTCGTGCAGAATGACGATAGTT 3418
Query 3257 TTGTAGCTGAAGTATTTGTGCTTTTATTTAGTCCAGATAGCATTGATCAGAGAAATGTTG 3316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3419 TTGTAGCTGAAGTATTTGTGCTTTTATTTAGTCCAGATAGCATTGATCAGAGAAATGTTG 3478
Query 3317 ATGGCCTATCTGGATGCAAGTTTTCTGTATTCCTTAAAGAGAGGCAACTATTCAGTTATT 3376
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3479 ATGGCCTATCTGGATGCAAGTTGTCTGTATTCCTTGAAGAGAGGCAACTATTCAGATATT 3538
Query 3377 TTATTGAGACTTTATGTAAATGGGATCCAGATATTCTTCTGGGATGGGATATACAGGGTG 3436
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3539 TTATTGAGACTTTATGTAAATGGGATCCAGATGTTCTTCTGGGCTGGGATATACAGGGCG 3598
Query 3437 GATCCATTGGTTTTCTAGCTGAAAGGGCTGCCCAGCTTGGCATAAGATTTCTCAATAATA 3496
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3599 GATCCATTGGTTTTCTAGCTGAAAGAGCTGCACAGCTTGGTATAAGATTTCTCAATAATA 3658
Query 3497 TATCTAGGACGCCATCTCCGACCACGAGAAACGATTCAGATAATAAGAGAAAGCTTGGTA 3556
||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3659 TATCTAGGACGCCATCTCCGACCACAACAAACAATTCAGATAATAAGAGAAAACTTGGTA 3718
Query 3557 AAAATCTGCTGCCAGATCCTTTGGTAGCTGATCCTGCTCAAGTAGAAGAAGTGGTAATTG 3616
| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 ATAATCTGCTGCCAGATCCGTTGGTAGCTAATCCTGCTCAAGTAGAAGAAGTGGTAATTG 3778
Query 3617 AGGACGAGTGGGGCCGCACACATGCTAGTGGTGTTCATGTTGGAGGTAGAATTGTTCTCA 3676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3779 AGGACGAGTGGGGCCGCACACATGCTAGTGGTGTTCATGTTGGAGGTAGAATTGTTCTCA 3838
Query 3677 ATGCATGGCGTTTGATTCGCGGGGAAGTTAAACTCAACATGTACACAATTGAAGCTGTGT 3736
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3839 ATGCATGGCGTTTGATTCGCGGGGAAGTTAAACTCAACATGTACACGATTGAAGCTGTGT 3898
Query 3737 CGGAGGCTGTTTTGAGGCAGAAGATTCCATCCATCCCCTATAAAGTATTGACAGAATGGT 3796
| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3899 CAGAGGCTGTTTTGAGGCAGAAGGTTCCATCAATCCCCTATAAGGTATTGACAGAATGGT 3958
Query 3797 TTTCAAGTGGTCCTGCGGGGGCAAGATATCGATGCATAGAATATGTGGTTCGCCGAGCAA 3856
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 3959 TTTCAAGTGGTCCTGCGGGTGCAAGATATAGATGCATAGAATATGTGATTCGGCGAGCAA 4018
Query 3857 ATTTGAACCTTGAGATAATGAGTCAACTTGACATGATAAATCGTACGTCAGAACTTGCTC 3916
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4019 ATTTGAACCTTGAGATAATGAGCCAACTTGACATGATAAATCGTACGTCAGAACTTGCTC 4078
Query 3917 GTGTTTTTGGCATAGACTTTTTCTCAGTTCTCTCCCGAGGTTCCCAATACAGAGTGGAAT 3976
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 4079 GTGTTTTTGGTATAGACTTTTTCTCAGTTCTCTCCCGAGGTTCACAGTACAGAGTGGAAT 4138
Query 3977 CTATGCTTTTGAGATTAGCACACACACAAAATTATCTTGCTATATCTCCAGGAAACCAAC 4036
| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4139 CCATGCTTCTGAGATTAGCACATACACAAAATTATCTTGCTATTTCTCCAGGAAACCAAC 4198
Query 4037 AGGTTGCTTCTCAGCCAGCTATGGAATGTGTACCTCTTGTGATGGAACCGGAATCTGCCT 4096
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4199 AGGTTGCCTCTCAGCCAGCTATGGAATGTGTACCTCTTGTGATGGAACCAGAATCTGCCT 4258
Query 4097 TCTACGATGATCCTGTTATTGTGTTGGATTTTCAATCTCTTTACCCTTCAATGATTATAG 4156
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 TTTACGATGATCCTGTTATTGTGTTGGATTTTCAATCTCTTTACCCTTCAATGATTATAG 4318
Query 4157 CATATAATCTGTGCTTTTCTACGTGTCTTGGAAAACTTGCACATTTGAAGATGAACACCC 4216
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4319 CATATAATCTGTGCTTTTCTACATGTCTCGGAAAACTTGCACATTTGAAGATGAACACCC 4378
Query 4217 TTGGGGTCAGCTCATACTCTCTAGACCTTGGTGTTCTTCAGGATTTAAATCAAATCCTGC 4276
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4379 TTGGGGTCAGCTCATACTCTCTAGACCTCGATGTTCTTCAGGATTTAAATCAGATCCTAC 4438
Query 4277 AGACCCCAAACAGTGTGATGTATGTGCCACCAGAGGTGCGCAGAGGAATTTTACCAAGGC 4336
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 4439 AGACCCCAAACAGTGTGATGTACGTGCCACCAGAGGTGCGTAGAGGAATTTTACCTAGGC 4498
Query 4337 TGCTAGAGGAAATTCTATCTACAAGAATAATGGTGAAAAAAGCAATGAAAAAGTTGACTC 4396
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4499 TGCTAGAGGAGATTCTGTCTACAAGAATAATGGTGAAAAAAGCAATGAAAAAGTTGACTC 4558
Query 4397 CTTCAGAAGCAGTTCTTCACCGGATATTTAATGCAAGGCAGCTTGCTTTAAAGCTGATAG 4456
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4559 CTTCAGAAGCAGTTCTTCACCGGATATTTAATGCGAGGCAGCTTGCTTTAAAGCTGATAG 4618
Query 4457 CAAATGTTACTTATGGCTATACTGCTGCTGGCTTCAGTGGTCGAATGCCTTGTGCAGAGC 4516
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4619 CAAATGTGACTTATGGTTATACTGCTGCTGGCTTCAGTGGTCGAATGCCTTGTGCAGAGC 4678
Query 4517 TGGCAGATAGTATTGTCCAGTGTGGTCGTAGCACACTTGAGAAGGCTATTTCGTTTGTCA 4576
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 4679 TGGCAGATAGTATTGTCCAGTGTGGTCGTAGCACACTTGAGAAGGCTATTTCATTCGTCA 4738
Query 4577 ATGCCAATGATAGTTGGAACGCTAGAGTTGTATATGGTGACACTGATAGTATGTTTGTCC 4636
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4739 ATGCCAATGATAATTGGAACGCTAGAGTTGTATATGGTGACACTGATAGTATGTTTGTCC 4798
Query 4637 TCCTCAAAGGACGAACTGTAAAAGAAGCTTTTGTAGTCGGACAAGAGATTGCATCTGCAA 4696
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4799 TCCTAAAAGGACGAACTGTAAAAGAAGCTTTTGTAGTCGGACAAGAGATTGCATCTGCAA 4858
Query 4697 TAACTGAAATGAATCCACACCCAGTCACTTTAAAGATGGAGAAAGTCTATCACCCTTGTT 4756
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4859 TAACTGAAATGAACCCACACCCAGTCACTTTAAAGATGGAGAAAGTCTATCACCCTTGTT 4918
Query 4757 TCCTTCTTACGAAGAAGCGCTATGTTGGGTACAGTTATGAAAGTCCCGATCAGA-ACGAG 4815
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||
Sbjct 4919 TCCTTCTTACGAAGAAGCGTTATGTTGGGTACAGTTATGAAAGTCCCAATCAGAGA-GAG 4977
Query 4816 CCTATATTTGATGCAAAAGGTATTGAAACTGTTCGAAGAGACACTTGTGAAGCTGTTTCA 4875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4978 CCTATATTTGATGCAAAAGGTATTGAAACTGTTCGAAGAGACACTTGTGAAGCTGTTGCG 5037
Query 4876 AAAACTATGGAGCAATCGTTGAGACTCTTTTTTGAGA-AGAAGAGCATCTCTAAGGTTAA 4934
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||
Sbjct 5038 AAAACTATGGAGCAATCGTTGAGACTCTTTTTTGA-ACAGAAGAACATCTCTAAGGTTAA 5096
Query 4935 GTCGTACTTGTATAGACAGTGGAAGCGGATACTATCAGGGAGAGTGTCTCTACAAGATTT 4994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5097 GTCGTACTTGTATAGACAGTGGAAGCGGATACTATCAGGGAGAGTGTCTCTTCAAGATTT 5156
Query 4995 TGTCTTTGCAAAAGAAGTTCGGTTGGGGACTTATAGCACAAGAGACTCTTCACTCCTTCC 5054
| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5157 TATCTTTGCAAAAGAAGTTCGGTTGGGTACTTACAGCACAAGAGACTCTTCACTCCTTCC 5216
Query 5055 TCCAGCTGCTATTGTGGCAACCAAATCAATGAGAA-CAGACCCTCGGACAGAGCCACGCT 5113
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5217 TCCAGCAGCTATTGTGGCAACCAAATCAATGA-AAGCAGACCCTCGGACAGAGCCACGCT 5275
Query 5114 ATGCGGAACGAGTGCCTTATGTTGTGATCCATGGGGAGCCAGGAGCTCGACTTGTTGATA 5173
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5276 ATGCTGAACGAGTGCCTTATGTTGTGATTCATGGGGAGCCAGGAGCTCGACTTGTTGATA 5335
Query 5174 TGGTGGTGGACCCACTGGTTCTTTTGGACATTGATACACCCTACCGATTGAATGACTTAT 5233
|||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5336 TGGTTGTTGATCCACTGGTTCTTTTGGACGTCGATACACCCTACCGACTGAATGACTTAT 5395
Query 5234 ACTACATCAACAAACAAATTATACCGGCTTTGCAAAGGGTATTTGGACTCCTGGGTGCAG 5293
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5396 ACTACATCAACAAACAAATTATACCAGCTTTGCAAAGGGTATTTGGACTCGTGGGTGCAG 5455
Query 5294 ACTTAAACCAGTGGTTTTTGGAGATGCCCCGTCTCACCAGAAGCTCCCTTGGTCAACGTC 5353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5456 ACTTAAACCAGTGGTTTTTGGAGATGCCCCGTCTCACCAGAAGCTCCCTTGGTCAACGTC 5515
Query 5354 CCTTAAGCTCTAAAAACTCACACAAAACGAGAATTGATTATTTTTATCTCTCGAAACATT 5413
|||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5516 CCTTAAACTCTAAAAACTCACACAAAACAAGGATTGATTATTTTTATCTATCGAAACATT 5575
Query 5414 GCATCTTGTGTGGGGAAGTTGTTCAAGAATCTGCTCAGCTATGCAACCGGTGCCT-CAAA 5472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5576 GCATCTTGTGTGGGGAAGTTGTTCAAGAATCTGCTCAACTATGCAACCGGTGCCTTCAAA 5635
Query 5473 AATAAAAGTGCTGCTGATGCAACCATTGTTTGGAAGACTTCAAAATTGGAGAGAGAGATG 5532
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5636 A-TAAAAGTGCTGCTGCTGCAACCATTGTTTGGAAGACTTCAAAGTTGGAGAGAGAGATG 5694
Query 5533 CAACACCTAGCCACGATATGCAGACACTGTGGTGGGGGAGACTGGGTGGTGCAATGCGGA 5592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5695 CAACACCTAGCCACGATATGCAGACACTGTGGTGGGGGAGACTGGGTGGTGCAAAGCGGA 5754
Query 5593 GTGAAATGCAATTCCCTTGCTTGCTCAGTCTTTTACGAGAGACGGAAAGTTCAGAAAGAG 5652
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5755 GTGAAATGCAATTCCCTTGCGTGCTCAGTCTTTTACGAGAGACGGAAAGTTCAGAAAGAG 5814
Query 5653 CTTCGTGGCCTCTCCTCCATTGCTACTGAGAGTGAGCTTTACCCTAAATGCATGGCTGAG 5712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5815 CTTCGTGGCCTCTCCTCCATTGCTACTGAGAGTGAGCTTTACCCTAAATGCATGGCTGAG 5874
Query 5713 TGGTTCTAA 5721
|||||||||
Sbjct 5875 TGGTTCTAA 5883
Score = 1338 bits (724), Expect = 0.0
Identities = 836/887 (94%), Gaps = 20/887 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGTCCCGGCGAAGCAGCCATGGCTGATTCTCAGTCCGGTTCCAATGTTTTCAGTTTA 60
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 CAAAGTCACGGCGAAACAGCCATGGCTGATTCTCAATCCGGTTCCAATGTTTTCAGTTTA 171
Query 61 CGGATTGTTTCAATAGATTATTACATGGCTTCTCCTATCCCTGGTTATGATATTTGCTAC 120
||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 172 CGGATAGTTTCAATCGATTATTACATGGCTTCTCCAATCCCTGGTTATAATATTTGCTAC 231
Query 121 AGTAGCTTCCAAGGTGGTGAGGTAAACGAAGTCCCTGTTATAAGGATATATGGCTCTACA 180
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 232 AGTAGCTTCCAAGGTAGTGAGGTAAATGAAGTCCCTGTTATAAGGATATACGGCTCTACA 291
Query 181 CCTGCTGGTCAGAAGACTTGCCTGCACATTCATCGTGCTTTACCATATCTCTATATTCCA 240
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 CCTGCTGGTCAGAAGACTTGCTTGCACATTCATCGTGCTTTACCATATCTCTATATTCCG 351
Query 241 TGCTCGGAGATTCCACCTGAGCATCATAAAGGAGCT-GATGGAAGTACACTTGCTTTATC 299
||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 TGCTCAGAAATTCCACTTGAGCATCATAAAGGAG-TGGATGGAAGTACACTTGCTTTATC 410
Query 300 CCTTGAGTTAGAGAAGGCTCTAAAGCTTAAGGGCAATGCTGCTTCAAAAAGGCAACATGT 359
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 411 CCTTGAGTTAGAGAAGGCTCTAAAGCTTAAGGGAAATGCTGCTTCAAAAAGGCAACATAT 470
Query 360 CCATGATTGTGAGATTGTTAGAGCAAAGAAGTTTTATGGGTACCACTCAACTGAGGAGGC 419
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 471 CCATGATTGTGAGATTGTAAGAGCAAAGAAGTTTTATGGGTACCACTCAACAGAGGAGGC 530
Query 420 TTTTGTGAAGATTTATCTGTATCCTTGTAATAGCTACCATCCACCCGATGTGGCTCGTGC 479
|||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 TTTTGTGAAGATTTATCT-TA-----G------CTACCATCCACCCGATGTGGCTCGTGC 578
Query 480 TGCCAGTCTTCTTCTGGCAGGTGCTGTTCTTGGTAAAAGTTTGCAGCCTTACGAGTCTCA 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579 TGCCAGTCTTCTTCTGGCAGGTGCTGTTCTTGGTAAAAGTTTGCAGCCTTACGAGTCTCA 638
Query 540 TATTCCTTTTATTCTCCAGTTTCTGGTTGATTATAATTTGTATGGAATGTGTCATGTGCA 599
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 639 TATTCCCTTTATTCTCCAGTTTCTGGTTGATTATAATTTGTATGGAATGGGTCATGTGCA 698
Query 600 TATATCAAAGATGAAGTTCCGTAGCCCAGTTCCTCACCATTTCCTTCCAAGGAGATTTGA 659
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 699 TATATCAAAGATGAAGTTCCGTAGCCCAGTGCCTCACCATTTCCGGCCAAGGAGATTTGA 758
Query 660 TTTGGAAGATTGTGCGGGACAAAGGATTGACGAAGTGGCTATAACAAAGGCAAATTCAAG 719
|||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 759 TTTGGATGATTGTCCGGGACAAAGGATTGACGAAGTGGCTATTACAAAGGCAAATTCAAG 818
Query 720 TGCTGCTGCAAGCGTCAGTTTTCCTGTTTGGAGCTTGTCAACAATCCCAGGTCAATGGAT 779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 819 TGCTGCTGCAAGCGTCAGTTTTCCTGTTTGGAGCTTGTCAACAATCCCAGGTCAGTGGAT 878
Query 780 GTGGAATATCTCAGAAGAATCTGATACACCGTTGAGCCAGAGCCAGCATAGGCACTA--- 836
||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 879 GTGGAATCTCTCTGAAGAATCTGATACACCGTTGAGCCAGAGCCAGCATAGGCACCAACA 938
Query 837 ---TTACAGACGTCAGAGTCTCTGTGAACTTGAGGGAGATGCTACTA 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 939 CCATTACAGACGTCAGAGTCTCTGTGAACTTGAGGGAGATGCTACTA 985
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 286411777133
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5