BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg926183
Length=5191
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G68890.1 | Symbols: | magnesium ion binding;thiamin pyropho... 8442 0.0
> AT1G68890.1 | Symbols: | magnesium ion binding;thiamin pyrophosphate
binding;hydro-lyases;catalytics;2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid
synthases |
chr1:25896945-25906714 FORWARD LENGTH=5352
Length=5352
Score = 8442 bits (4571), Expect = 0.0
Identities = 4998/5204 (96%), Gaps = 29/5204 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATTCATCACAGCGAAGAAGATGCGATCTTCGTTTCTAGTTTCGAATCCTCCGTTTCTAC 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 24 AATTCATCACAGCGAAGAAGATGCGATCTTCGTTTCTAGTCTCGAATCCTCCATTTCTAC 83
Query 61 CTTCTCTAATCCCTCGTCACAGTTCTAGAAACTCCTTCAGACGTAGCAGAGAACGCTTCT 120
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 CTTCTCTAATCCCTCGTTACAGTTCTAGAAAATCCATCAGACGTAGCAGAGAACGCTTCT 143
Query 121 CCTTCGCTGAGTCTCTTCGTGT-T-TC-TCTTCATGGAATCGGAAGAAACATTGAGGTCG 177
||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 144 CCTTCCCTGAGTCTCTTCGTGTCTCTCTTCTTCATGGAATCCGAAGAAACATTGAGGTCG 203
Query 178 CTCATGGAGTTCAATTTGATGGTCCGATTATGGATAGAGATGCTTTGGAGGTGAATTTAG 237
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
Sbjct 204 CTCAAGGAGTTCAATTCGATGGTCCGATTATGGATAGAGA--C-------GTGAATTT-G 253
Query 238 G-TGATGATTTGA-TGGTTCAAGTGTGTGTGACTCGTACATTGCCTCCAGCTTTGACTCT 295
| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254 GATGATGATTT-AGTGGTTCAAGTGTGTGTGACTCGTACATTGCCTCCAGCTTTGACTCT 312
Query 296 TGAGCTTGGCCTTGAGAGCCTCAAGGAAGCTGTTAACGAATTGAAGACTAATCCTCCTAA 355
||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 TGAGCTTGGTCTCGAGAGTCTCAAGGAAGCTATTGACGAATTGAAGACTAATCCTCCTAA 372
Query 356 GTCATCTACTGGCGTCTTGCGATTTCAAGTGGCTGTGCCTCCAAGGGCAAAAGCTTTGTT 415
|||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 373 GTCATCTAGTGGAGTCTTACGATTTCAAGTGGCTGTGCCTCCAAGGGCTAAAGCTTTGTT 432
Query 416 TTTGTTTTGCTCTCAGCCGAC-ATCTTCTGATGTGTTTCCTGTGTTTTTCCTCTCCAAGG 474
| |||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 CTGGTTTTGCTCTCAACCAACGA-CTTCCGATGTGTTTCCTGTGTTTTTCCTCTCCAAGG 491
Query 475 AAACTGTGGAGCCTTCTTATAAATCACTCTATGTAAAGGAACCTCATGGGGTTTTTGGGA 534
| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 ATACTGTTGAGCCTTCTTATAAATCACTTTATGTAAAGGAACCTCATGGGGTTTTTGGGA 551
Query 535 TTGGGAATGCACTCTCTTTCGTTCATCCGTCTTCCA-TCGACTCCAAGGGACATAGCATG 593
||||||||||| || |||| |||||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||
Sbjct 552 TTGGGAATGCATTCGCTTTTGTTCATTCATCTT-CAGTTGACTCCAATGGACATAGCATG 610
Query 594 ATGAAAACATTCCTCTCAGATGAATCAGCTATGGTGACGGCCTATGGTTTTCCAGATATT 653
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 ATCAAAACATTCCTCTCAGATGAATCAGCTATGGTGACGGCCTATGGTTTTCCAGATATT 670
Query 654 GAATTCAACAAATACTCTACTGTCAATAGCAAGGGTGGCTCTTCTTACTTTTTCGTTCCT 713
||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 GAATTCAACAAATACTCTACTGTAAATAGCAAAGATGGCTCTTCTTACTTTTTCGTTCCT 730
Query 714 CAGATTGAGTTAGATGAGCACGAGGAGGTCTCTATATTAGCAGTTACACTGGCATGGAAT 773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 731 CAGATTGAGTTAGATGAGCACGAGGAGGTCTCTATATTAGCAGTTACATTGGCATGGAAT 790
Query 774 GAATCTCTCTCTTACAGATTTGAGCAAACAATTAGTTCATATGAGAAATCAATTTTTCAG 833
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 GAATCTCTCTCTTACACAGTTGAGCAAACAATTAGTTCATATGAGAAATCAATTTTTCAG 850
Query 834 GTTTCTTCTCATTTCTGCCCAAATTTAGAGGATCACTGGTTCAAACATCTAAAAAGTTCT 893
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 GTTTCTTCTCATTTCTGCCCAAATGTAGAGGATCACTGGTTCAAACATCTAAAAAGTTCT 910
Query 894 CTAGCAAAGTTTAGTGTAGAAGAGATACATCCAATTGAGATGGAGCATATGGGCTTTTTC 953
|||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 TTAGCGAAGCTTAGTGTTGAAGAGATACATCCACTTGAGATGGAGCATATGGGCTTTTTC 970
Query 954 ACTTTTTCTGGGAGAGATCAGGCTGACGTCAAGGAACTGAAAAGTATACAATCATCATGT 1013
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 ACCTTTTCTGGGAGAGATCAGGCTGACGTCAAGGAACTGAAAAGTATACAATCATCATGT 1030
Query 1014 CAGTTCCATTGCAAGCTTTCACCTGACGTTGATTTCTCAAACAATATGCTGAATCGAGAG 1073
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1031 CAGTTCCATTGCAAGCTTTCACCTGACGTTGTTTTCTCAAACAACATGCTGAATCGAGAG 1090
Query 1074 ACTGAAGTGAGCAACTTCTTGAAAGATGAGGCTAACATCAATGCTGTATGGGCATCAGCT 1133
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 ACTGAAGTGAGCAACTTCTTGAGAGATGAAGCTAACATCAATGCTGTATGGGCATCAGCT 1150
Query 1134 ATAATTGAAGAATGCACTCGTCTTGGTTTGACGTACTTTTGTGTAGCTCCTGGATCAAGG 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1151 ATAATTGAAGAATGCACTCGTCTTGGTTTGACGTACTTTTGTGTAGCCCCTGGATCAAGG 1210
Query 1194 TCTTCCCATCTTGCAATTGCTGCTGCCAACCATCCCCTTACAACGTGTCTTGCATGCTTT 1253
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 TCTTCCCATCTTGCTATCGCTGCTGCCAACCATCCCCTTACAACGTGTCTTGCATGCTTT 1270
Query 1254 GATGAACGATCTCTTGCGTTTCATGCTATTGGTTATGCTAAAGGATCCCTCAAACCAGCA 1313
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 GATGAACGATCTCTTGCGTTTCACGCTATTGGTTATGCTAAAGGATCCCTCAAACCAGCA 1330
Query 1314 GTCATTATAACATCATCAGGAACTGCCGTTTCAAATCTTCTTCCAGCGGTTGTTGAAGCC 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 GTCATTATAACATCATCAGGAACTGCCGTTTCAAATCTTCTTCCAGCGGTTGTTGAAGCC 1390
Query 1374 AGTGAGGATTTCTTACCACTGCTACTACTTACCGCAGATCGTCCTCCTGAACTTCAGGGA 1433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 AGTGAGGATTTCTTACCACTGCTACTACTTACCGCAGATCGTCCTCCTGAACTTCAGGGA 1450
Query 1434 GTTGGCGCAAATCAATCAATAAATCAAATAAACCACTTCGGTTCGTTTGTCAGATTCTTC 1493
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1451 GTTGGCGCAAATCAAGCAATAAATCAAATAAACCACTTCGGTTCGTTCGTCAGATTCTTC 1510
Query 1494 TTCAATCTTCCTCCTCCAACTGATCTTATTCCAGTCCGAATGGTCCTTACCACTGTAGAC 1553
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1511 TTCAATCTTCCTCCTCCAACCGATCTTATTCCAGTCCGAATGGTCCTTACGACTGTAGAC 1570
Query 1554 TCTGCTCTACATTGGGCAACAGGTTCTGCTTGTGGACCAGTACATCTCAATTGTCCTTTT 1613
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 TCCGCTCTACATTGGGCAACAGGATCTGCTTGTGGACCAGTACATCTCAATTGTCCTTTT 1630
Query 1614 AGAGACCCACTTGACGGTAGTCCAACAAATTGGTCATCCAACTGCTTAAAAGGATTAGAC 1673
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1631 AGAGACCCACTTGACGGTAGTCCAACAAATTGGTCATCTAACTGCTTAAATGGATTAGAC 1690
Query 1674 ATGTGGATGTCGAATGCTGAACCATTCACAAAATATTTTCAAGTACAAAGCCATAAAAGC 1733
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 ATGTGGATGTCTAATGCTGAGCCATTCACAAAATATTTTCAAGTACAAAGCCATAAAAGC 1750
Query 1734 -AGTGGTGTAACAACTGGCCAAATTACTGAGGTCTTACAAGTAATCAAAGAGGCTAAGAA 1792
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751 GA-TGGTGTAACAACTGGCCAAATTACTGAGATCTTACAAGTAATCAAAGAGGCTAAGAA 1809
Query 1793 GGGTCTTCTTCTTATTGGTGCAATCCATACAGAGGATGAAATTTGGGCTTCGCTTCTGTT 1852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 GGGTCTTCTTCTTATTGGTGCAATCCATACAGAGGATGAAATTTGGGCTTCGCTTCTGTT 1869
Query 1853 GGCGAAAGAGCTGATGTGGCCTGTAGTTGCAGATGTCTTGTCGGGTGTACGGCTGCGCAA 1912
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1870 GGCGAAAGAGCTGATGTGGCCTGTAGTTGCAGATGTCTTGTCTGGTGTACGGCTGCGCAA 1929
Query 1913 GCTTTTTAAACCTTTTCTTGAGAAGTTGACGCCTGTTTTTGTTGATCATCTTGATCATGC 1972
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1930 GCTTTTTAAACCTTTTGTTGAGAAGTTGACGCATGTTTTTGTTGATCATCTTGATCATGC 1989
Query 1973 CTTGCTTTCAGACTCTGTCAGGAATTTGATAGAGTTTGATGTTGTTATCCAGGTTGGAAG 2032
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 CTTATTTTCAGACTCTGTCAGGAATTTGATAGAGTTTGATGTTGTTATCCAGGTTGGAAG 2049
Query 2033 TCGGATAACAAGTAAAAGAGTTTCTCAGGTGCTAGAGAAATGCTTTCCATTTGCATACAT 2092
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2050 TCGGATAACAAGTAAAAGAGTTTCTCAGATGCTAGAGAAATGCTTTCCATTTGCATACAT 2109
Query 2093 TTTGGTTGATAAGCATCCATGCCGACATGACCCATCACACCTGGTCACTCACAGGGTCCA 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110 TTTGGTTGATAAGCATCCATGCCGACATGACCCATCACACCTGGTCACTCACAGGGTCCA 2169
Query 2153 AAGCAACATTGTTCAGTTTGCTGATTGTGTGCTTAACTCTCAATTTCCAAGGAGGAGAAG 2212
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 2170 AAGCAACATTGTTCAGTTTGCTAATTGTGTGCTTAAATCTCGATTTCCATGGAGGAGAAG 2229
Query 2213 CAAGTTGCATGGTCATCTACAAGCATTGGATGGTGCTATTGCCCGGGAAATTTCATTTCA 2272
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2230 CAAGTTGCATGGTCATCTACAGGCATTGGATGGCGCTATTGCCCGGGAAATGTCATTTCA 2289
Query 2273 AATATCTGCTGAAAGCTCCCTGACCGAACCTTACGTTGCACACATGCTTTTTAAAGCACT 2332
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 2290 AATATCTGCTGAAAGCTCCCTGACTGAACCTTACGTTGCACATATGCTTTCTAAAGCACT 2349
Query 2333 AACATCTAAATCTGCTCTTTTCATCGGGAATAGTATGCCAATAAGGGATGTGGATATGTA 2392
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2350 AACTTCTAAATCTGCTCTTTTCATCGGGAATAGTATGCCAATAAGGGATGTGGATATGTA 2409
Query 2393 TGGATGTAGTTCAGAAAATTCTTCTCATGTGGTAGATAAGATGTTGAGTGCAGAACTACC 2452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2410 TGGATGTAGTTCAGAAAATTCTTCTCATGTGGTAGATATGATGTTGAGTGCAGAACTACC 2469
Query 2453 ATGTCAATGGATACAAGTAACTGGAAATAGAGGAGCTAGTGGCATTGATGGGTTGCTCAG 2512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2470 ATGTCAATGGATACAAGTAACTGGAAATAGAGGAGCTAGTGGCATTGATGGGTTGCTCAG 2529
Query 2513 CTCGGCCACTGGCTTTGCTGTAGGATGCAAGAAGAGAGTGGTCTGTGTGGTGGGGGACAT 2572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2530 CTCGGCCACTGGCTTTGCTGTAGGATGCAAGAAGAGAGTGGTCTGTGTGGTTGGGGACAT 2589
Query 2573 CTCTTTCCTTCATGATACAAATGGATTGGCGATTTTGAAGCAGAGGATTGCAAGGAAACC 2632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 CTCTTTCCTTCATGATACAAATGGATTGGCGATTTTGAAGCAGAGGATTGCAAGGAAACC 2649
Query 2633 AATGACAATTCTTGTGATAAACAACCGTGGAGGTGGAATCTTCCGACTTCTTCCTATTGC 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 AATGACAATTCTTGTGATAAACAACCGTGGAGGTGGAATCTTCCGACTTCTTCCTATTGC 2709
Query 2693 AAAGAGAACAGAGCCTAGCGTGTTAAATCAATATTTCTATACATCACATGACATTTCCAT 2752
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2710 AAAGAAAACAGAGCCTAGCGTGTTAAATCAATATTTCTATACAGCACATGACATTTCCAT 2769
Query 2753 TGAAAACTTGTGTTTGGCACATGGTGTGAGGTATGTACACGTTGGGACGAAAAGTGAACT 2812
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2770 TGAAAACTTGTGTTTGGCACATGGTGTGAGGTATGTTCACGTTGGGACGAAAAGTGAACT 2829
Query 2813 TGAGGATGCTCTATTTGTACCCAGCGTGGAAGAGATGGATTGCATTGTGGAGGTTGAAAG 2872
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2830 TGAGGATGCTCTATTTGTACCAAGCGTGGAGGAGATGGATTGCATTGTGGAGGTTGAAAG 2889
Query 2873 CTCTATAAACGCTAACGCAATCGTTCATAGCACTTTGGAGAGGTTTGCACGCCAAGCTGC 2932
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2890 CTCTATAAACGCTAACGCGATTGTTCATAGCACTTTGGAGAGGTTTGCACGCCAAGCCGC 2949
Query 2933 AGAAAATTCCCTAGGCATTATCTCGGCCAGTTCTCTTCTTCATCCGATGATCGGAAATGT 2992
|||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2950 AGAAAATTCCCTGGGCATTGTTTCTGCCAGTTCTTTTCTTCATCCGATGATCAAAAATGT 3009
Query 2993 ACTTCTTTGCCAAGTCTCTGGAATACAATATTCGCAGTACAGAGTCAAACTGTGTGACAG 3052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010 ACTTCTTTGCCAAGTCTCTGGAATACAATATTCGCAGTACAGAGTCAAACTGTGTGACAG 3069
Query 3053 ACCTACCATATGTTCTGATGAATTCTCTCAATTCCATCGAGAAGGATTTATACTCTCCCT 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 3070 ACCTACCATATGTTCTGATGAATTCTCTCAATTCCATCGAGAAGGGTTCATACTCTCCCT 3129
Query 3113 CACTTTGGAGGATGGAAGCATTGGCTATGGAGAGGTTGCACCTCTGGACAGTAATGTAGA 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3130 GACTTTGGAGGATGGAAGCATTGGCTATGGAGAGGTTGCACCTCTGAACAGTAATGTAGA 3189
Query 3173 GAACTTAATGGATGTTGAGGGGCAGCTTCAGTTAGTTCTTCACCTCGTGAATGGAGCTAA 3232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 3190 GAACTTAATGGATGTTGAGGGGCAGCTTCAGTTAGTTCTTCACCTCATGAATGAAGCTAA 3249
Query 3233 ATTTAGTTACATGCTTCCTTTGTTAAATGGCTCTATTTCTTCCTGGATTTGGAGTGAACT 3292
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3250 ATTTAGTTACATGCTTCCTTTGTTAAATGGCTCGATTTCTTCCTGGATTTGGAGTGAACT 3309
Query 3293 TGGAATTACTGCATCATCGATTTTCCCTAGTGTCAGATGTGGTCTGGAAATGGCTCTTCT 3352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3310 TGGAATTACTGCATCATCGATTTTCCCTAGTGTCAGATGTGGTCTGGAAATGGCTCTTCT 3369
Query 3353 AAATGCTATGGCAGTAAGACATGATTCTAGTTTGTTGGGGATACTTCATTATCAGAAAGA 3412
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3370 AAACGCAATGGCAGTAAGACATGATTCTAGTTTGTTGGGGATACTTCATTATCAGAAAGA 3429
Query 3413 CGAAAATGGTTCTGCTCAGCCACATTCTGTTCAAATATGTGCCCTTCTTGATTCTGAAGG 3472
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3430 AGAAAATGGTTCTGCTCAGCCACACTCTGTTCAAATATGTGCCCTTCTTGATTCTGAAGG 3489
Query 3473 TAC-CGCATTGGAGGTCGCATACGTTGCTAGAAAACTTGTTGAAGAAGGGTTCAGTGCTA 3531
||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3490 TACTC-CACTGGAGGTCGCATACGTTGCTAGAAAACTTGTTCAAGAAGGGTTCAGTGCTA 3548
Query 3532 TTAAACTTAAAGTTGGTCGTCGAGTGAACTCTGTTCAAGATGCTTTAGTTATGCAAGAAG 3591
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3549 TTAAACTTAAAGTTGGTCGTCGAGTGAGCTCTGTTCAAGATGCTTTAGTTATGCAAGAAG 3608
Query 3592 TAAGGAGAGCCGTTGGCGATCAAATTGAACTCCGTGCAGATGCAAATTGTCGTTGGACTT 3651
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3609 TAAGGAGAGCCGTTGGCGTTCAAATTGAACTCCGTGCAGATGCAAATTGTCGTTGGACTT 3668
Query 3652 TTGAAGAGGCTACAGAGTTTGGTTTGTTGGTGAAAAGCTGTAATTTAAAATATATTGAGG 3711
|||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3669 TTGAAGAGGCTAGAGAGTTTGGTTTATTGGTGAACAGCTGTAATTTAAAATATATTGAGG 3728
Query 3712 AACCTGTCCAGAATAAAGATGACCTTATAAGGTTTCATGAAGAAACTGGATTACCAGTGG 3771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3729 AACCTGTCCAGAATAAAGATGACCTTATAAGGTTTCATGAAGAAACTGGATTACCAGTGG 3788
Query 3772 CACTTGATGAGACTCTTGATGATTTTGAGGAATGTCCTCTACTTATGCTTACCAAATATA 3831
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 3789 CACTTGATGAGACTCTTGATGATTTTGAGGAATGTCCTCTGCGTATGCTTACCAAATATA 3848
Query 3832 CCCATCCTGGAATAGTTGCTGTTGTTATTAAACCAAGTGTTGTGGGAGGGTTTGAGAATG 3891
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 CGCACCCTGGAATAGTTGCTGTTGTTATTAAACCAAGTGTTGTGGGAGGGTTTGAGAATG 3908
Query 3892 CAGCCCTGATTGCTCGGTGGGCACAGAAGCATGGAAAAATGGCTGTTATTAGTGCTGCAT 3951
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3909 CAGCACTGATTGCTCGGTGGGCACAGCAGCATGGAAAGATGGCTGTTATAAGTGCTGCAT 3968
Query 3952 ACGAAAGTGGCCTAGGTTTATCAGCATATATTTTATTTGCATCATATTTGGAGTTGGTA- 4010
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 3969 ATGAAAGTGGCCTAGGTTTATCAGCATATATTTTATTTGCATCATATTTGGAGATGG-AG 4027
Query 4011 AACGTCAAAGCATCCACAGAGCAGAAGCAAGGAACATCGCCTTCTGTAGCCCATGGTCTT 4070
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 4028 AACGTGAAAGCATCCACAGAGCAGAAGCAAGGAACGCCCCCTTCTGTAGCCCATGGTCTT 4087
Query 4071 GGAACTTATCGTTGGCTTAGTGAAGACGTAATGATGAATACATTAGGGATATTTCGTAGC 4130
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4088 GGAACTTACCGGTGGCTTAGTGAAGACGTAATGATGAATACATTAGGGATATTTCGTAGC 4147
Query 4131 CCTTATAGTGGATTTGTTGAAGGATTTGTTGCTGATTCTAGTAGAAATCTAAAGGATGTT 4190
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4148 CCTTACAGTGGATTTGTTGAAGGATTTATTGCTGATGCTAGTAGAAATCTAAAGGATGTT 4207
Query 4191 AAGATAAACAACGATGTTATTGTTAGAACCAGTAAAGGAATTCCTGTCCGGAGGTATGAA 4250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4208 AAGATAAACAACGATGTTATTGTTAGAACCAGTAAAGGAATTCCTGTTCGGAGGTATGAA 4267
Query 4251 CTGAGGGTGGATGTAGATGGGTTCTCTCATTTCATTAGAGTCCACGACATTGGGCAGAAT 4310
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||
Sbjct 4268 CTGAGGGTGGATGTAGATGGTTTCTCTCATTTCATAAGAGTCCATGACGTTGGGGAGAAT 4327
Query 4311 GCAGAAGGAAGTGTAGCTTTGTTTCTTCATGGATTTCTTGGAACTGGTGAAGAATGGATC 4370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4328 GCAGAAGGAAGTGTAGCTTTGTTTCTTCATGGATTTCTTGGAACTGGTGAAGAATGGATC 4387
Query 4371 CCCATCATGAAGGGTATCTTGGGATCTGCGAGATGCATTTCAGTCGATATTCCTGGTCAC 4430
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4388 CCCATCATGACGGGTATCTCAGGATCTGCGAGATGCATTTCAGTCGATATTCCTGGTCAC 4447
Query 4431 GGAAGGTCAAGGGTACAAAGTCATGCTAGTGAGACCCAGACGGCCCCAACTTTCTCAATG 4490
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4448 GGAAGGTCAAGGGTACAAAGTCATGCTAGTGAGACCCAGACGTCCCCAACTTTCTCAATG 4507
Query 4491 GAGATGATAGCGAAGGCATTGTATAAGTTGATTGAGCAAATTACTCCTGGGAAAGTAACT 4550
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4508 GAGATGATAGCGGAGGCATTGTATAAGTTGATTGAGCAAATTACTCCTGGGAAAGTAACC 4567
Query 4551 ATAGTTGGATATTCCATGGGAGCAAGAATAGCCCTGTACATGGCTTTGAGGTTTAGCAAC 4610
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4568 ATAGTTGGATATTCCATGGGAGCAAGGATAGCACTGTACATGGCTTTGAGGTTTAGCAAC 4627
Query 4611 AAGATCGAAGGAGCTGTCGTGGTATCAGGGAGCCCGGGACTCAAGGATCCAGTGGCAAGG 4670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 4628 AAGATCGAAGGAGCTGTCGTGGTATCAGGGAGCCCGGGACTCAAGGATCCAGTAGCACGG 4687
Query 4671 AAAGTTCGAAGTGCAACAGATGATTCCAAAGCACGAATGATGGTTGACAATGGACTCGAA 4730
||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4688 AAAATTCGAAGTGCTACAGATGATTCCAAAGCACGAATGATGGTTGACAATGGACTATAT 4747
Query 4731 ATCTTTCTAGAGAACTGGTACAATGGAGGCTTGTGGAAGAGCTTGAGAAATCATCCCCAT 4790
|||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4748 ATCTTTATCGAGAATTGGTACAATGGAGGCTTGTGGAAGAGCTTGAGAAATCATCCCCAT 4807
Query 4791 TTTAGTAAAATAGTTGCAAGCCGCTTGCTACATGATGATGTTCCTAGTGTTGCAAAGCTC 4850
||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4808 TTTAGTAAAATTGCTGCAAGCCGCTTGCTACATGGTGATGTTCCTAGTGTTGCAAAGCTC 4867
Query 4851 CTGTCTGATCTAAGCAGTGGGAGACAACCGTCATTGTGGGAAGAGTTGGAGGATTGTGAT 4910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4868 CTGTCTGATCTAAGCAGTGGGAGACAACCGTCATTGTGGGAAGAGTTGGAGGATTGTGAT 4927
Query 4911 ACAAATATCTCGCTCGTATTCGGAGAGAAAGATGTCAAATTCAAGCAAATCGCTACTAGA 4970
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4928 ACAAATATCTCGCTCGTATTCGGGGAGAAAGATGTCAAATACAAGCAAATCGCTACTAGA 4987
Query 4971 ATGTACCGCGAGATGAGTAAAAGCAAGAATAGCGTAAACAATATCATCGAGATGGTTGAA 5030
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4988 ATGTACCGCGAGATGAGTAAAAGCAAGAAGAGCGTAAACAATATCATCGAGATAGTTGAA 5047
Query 5031 ATCCCAGAGGCTGGTCACGCTGTCCATCTCGAGAACCCTCTTCACATGATTCTCGCCCTT 5090
|| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||
Sbjct 5048 ATTCCAGAGGCTGGTCACGCTGTACATCTCGAGAGCCCTCTTCGCGTGATTCTCGCCCTC 5107
Query 5091 AGAAAATTCTTAACAAGAGTGCACAAAAGTTC-ACAGAGACAG--CTTTCTCAGAAGCTC 5147
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5108 AGAAAATTCTTAACAAGAGTTCACAACAGTTCTACAGAGACAGAGCTTTCTCAGAAGCTC 5167
Query 5148 TTGTTAGCACTAAAAGAAATGTAAAACAGATTTGAAACATGAAG 5191
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5168 TTGTTAGCACTAAAAGAAATGTAAAACAGATTTGGAACATGAAG 5211
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 259062093652
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5