BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg926473
Length=4895
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G71220.2 | Symbols: EBS1 | UDP-glucose:glycoprotein glucosyl... 8226 0.0
> AT1G71220.2 | Symbols: EBS1 | UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferases;transferases,
transferring hexosyl groups;transferases,
transferring glycosyl groups | chr1:26841630-26851919
FORWARD LENGTH=5068
Length=5068
Score = 8226 bits (4454), Expect = 0.0
Identities = 4746/4886 (97%), Gaps = 24/4886 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTCTTCTCCGTCGCGGAAAAGATGGGG---ACCACCAATCTGAGATCTTGGCTCTAT 57
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 11 TTCTTCTTCTCCGTCGCGGAAAAGATGGGGACCACCACCAATCTGAGATCTTGGCTGTAT 70
Query 58 CTCATTCTTCTCTTCTTCGTCGTCGTCGGCGTCAACGCTCAGAATCGGAGACCTAAGAAT 117
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 CTCATTCTTCTCTTCATCGTCGTCGTCGGCGTCAACGCTCAGAATCGGAGACCTAAGAAT 130
Query 118 GTTCAGGTGGCGGTTAAGGCCAAGTGGCAGGGTACTCCTCTTCTCCTTGAGGCTGGTGAG 177
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GTTCAGGTGGCTGTTAAGGCTAAGTGGCAGGGTACTCCTCTTCTCCTTGAGGCTGGTGAG 190
Query 178 TTGATTTCCAAAGAATCGAAGCAGTTGTTCTGGGAGTTCACTGATGCTTGGCTTGGTTCT 237
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 191 TTGATTTCCAAAGAATCGAAGCAGTTGTTCTGGGAGTTTACTGATGCTTGGCTTGGTTCC 250
Query 238 GATGGAGATGATACTGGTGATTCCGATTGCAAATCAGCTAGAGATTGTCTTCTTAAGATA 297
||| | || | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 251 GAT-G-GA-G--A----TGATTCCGATTGTAAATCAGCTAGAGATTGTCTTCTTAAGATA 301
Query 298 TCTAAACAGGCGTCGACTCTGTTAGCTCAACCAGTGGCTTCTCTCTTCCATTTCTCACTT 357
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 TCTAAACAGGCTTCGACTCTGTTAGCTCAACCAGTGGCTTCTCTCTTCCATTTCTCACTT 361
Query 358 ACTTTGAGATCTGCCTCGCCTAGGCTTGTGCTTTATCGCCAATTGGCCGATGAGTCTCTA 417
||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 362 ACTCTGAGATCTGCTTCGCCTAGGCTTGTGCTTTACCGTCAATTGGCTGATGAGTCTCTA 421
Query 418 TCTTCTTTCCCTCACGGCGATGATCCCTCTGCGACTGACTGCTGTTGGGTTGATACTGGC 477
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 TCTTCTTTCCCTCATGGTGATGATCCCTCTGCGACTGGCTGCTGTTGGGTTGATACTGGC 481
Query 478 TCCTCTCTCTTTTACGATGTTGCAGATCTTCAATCCTGGCTCGCTTCTGCTCCTGCTGCT 537
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
Sbjct 482 TCCTCTCTGTTTTACGATGTTGCAGATCTTCAATCCTGGCTTGCCTCTGCTCCTGCTGTT 541
Query 538 GGAGATGCTGTTCAGGGGCCTGAGCTCTTCGAGTTCGATCACGTTCATTTTGATTCAAGA 597
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 542 GGAGATGCTGTTCAGGGGCCTGAGCTATTCGACTTCGATCATGTTCATTTTGATTCAAGA 601
Query 598 GCTGGAAGCCCAGTTGCTGTTCTCTATGGGGCTGTTGGGACTGATTGCTTTAGGAAGTTT 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 GCTGGAAGCCCAGTTGCTGTTCTCTATGGGGCTGTTGGGACTGATTGCTTTAGGAAGTTT 661
Query 658 CACCTCTCGCTTGCTAAAGCAGCCAAGGAGGGAAAAGTTACATATGTTGTTAGACCAGTA 717
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 CACCTGTCGCTTGCTAAAGCAGCCAAGGAGGGAAAAGTTACATATGTTGTTAGACCAGTA 721
Query 718 TTACCTTTGGGTTGTGAAGGCAAAACTAGACCCTGCGGTGCCATTGGAGCAAGGGAGAAT 777
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 722 TTACCTTTGGGTTGTGAAGGGAAAACTAGACCCTGCGGTGCCATTGGAGCAAGGGATAAT 781
Query 778 GTTAGCTTAGCTGGTTATGGTGTGGAGCTTGCTTTGAAGAACATGGAGTACAAGGCAATG 837
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 782 GTTAGCTTAGCTGGTTATGGTGTGGAGCTTGCTTTGAAGAACATGGAGTACAAGGCTATG 841
Query 838 GATGATAGTGCTATAAAGAAAGGTATCACTCTTGAAGATCCTAGGACTGAAGATCTTAGT 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 GATGATAGTGCTATAAAGAAAGGTATCACTCTTGAAGATCCTAGGACTGAAGATCTTAGT 901
Query 898 CAAGATGTTAGGGGCTTTATATTCTCAAAAATCCTGGACAGGAAACCCGAGCTAAGATCA 957
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 CAAGATGTTAGGGGCTTTATATTCTCAAAAATCTTGGACAGGAAACCCGAGCTAAGATCA 961
Query 958 GAAGTCATGGCTTTTAGGGATTATCTTCTATCATCAACAGTATCAGACACGCTTGATGTT 1017
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GAAGTCATGGCTTTTAGGGATTATCTCCTATCATCAACAGTATCAGACACGCTTGATGTT 1021
Query 1018 TGGGAGCTCAAAGATTTAGGACACCAAACAGCGCAGAGAATAGTCCATGCCTCTGATCCT 1077
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 TGGGAGCTGAAAGATTTAGGACACCAAACAGCGCAGAGAATAGTCCATGCCTCTGATCCT 1081
Query 1078 CTGCAGTCTATGCAAGAAATTAATCAAAACTTTCCTAGTGTAGTTTCTTCATTATCTCGC 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 CTGCAGTCTATGCAAGAAATTAATCAAAACTTTCCTAGTGTAGTTTCTTCATTATCTCGC 1141
Query 1138 ATGAAGCTCAATGAATCAATCAAAGAAGAGATACTTTCAAACCAGAGAATGGTTCCCCCT 1197
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 ATGAAGCTCAATGAATCAATCAAAGACGAGATACTTTCAAACCAGAGAATGGTTCCCCCT 1201
Query 1198 GGCAAGGCTTTGTTGGCTCTGAATGGTGCCCTGTTGAACATCGAAGATATGGATCTATAC 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1202 GGCAAGGCTTTGTTGGCTCTGAATGGTGCCCTGTTGAACATCGAAGATATTGATCTATAC 1261
Query 1258 ATGTTGATGGATTTGGCTCATCAGGAATTGTCCCTGGCCAACCATTTTTCGAAGCTTAAG 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 ATGTTGATGGATTTGGCTCATCAGGAATTGTCCCTGGCCAACCATTTTTCGAAGCTTAAG 1321
Query 1318 ATACCTGATGGAGCCATACGGAAACTTCTACTAACTACCCCTCTCCCTGAACCGGATTCA 1377
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 ATACCTGATGGAGCCATAAGGAAACTTCTACTAACTACCCCTCTCCCTGAACCGGATTCA 1381
Query 1378 TATCGGGTTGATTTCCGTTCCGTGCATGTTACCTATCTCAACAATCTGGAAGAGGATGAT 1437
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382 TATCGGGTTGATTTCCGATCCGTGCATGTTACCTATCTCAACAATCTGGAAGAGGATGAT 1441
Query 1438 ATGTACAAGCGTTGGCGGAGTAATATTAACGAGATTTTGATGCCTGCCTTCCCTGGACAA 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 ATGTACAAGCGTTGGCGGAGTAATATTAACGAGATTTTGATGCCTGCCTTCCCTGGACAA 1501
Query 1498 CTACGTTACATCCGAAAGAACCTATTCCATGCAGTTTACGTCATTGATCCAGCGACTCCC 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1502 CTACGTTACATCCGAAAGAACCTATTCCATGCAGTTTACGTCATTGATCCAGCGACTGCC 1561
Query 1558 TGCGGTCTTGAGTCCATTGATACTCTCAGATCTTTATACGAAAATCAACTCCCTGTGAGA 1617
|| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 TGTGGTCTTGAGTCTATTGAAACTCTCAGATCTTTATATGAAAATCAACTCCCTGTGAGA 1621
Query 1618 TTTGGGGTGATATTATATTCCACTCAATTAATCAAGA-ATATCGAGCAGAATGGTGGTCA 1676
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||
Sbjct 1622 TTTGGGGTGATATTATATTCAACTCAACTAATCAAGACA-ATCGAGAATAATGGTGGTCA 1680
Query 1677 AATTCCATCTTCTGATGCAGCGACTAATGCCCAAGTTAAAGAGGACATATCCACTATGGT 1736
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1681 AATCCCATCTTCTGATGCAGTGACTAATGCCCAAGTTAAAGAGGACTTATCGACTATGGT 1740
Query 1737 CATACGTCTTTTTCTGTACATCAAGGAGCACCATGGGATTCAAACAGCTTTTCAGTTCTT 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 CATACGTCTTTTTCTGTACATCAAGGAGCACCATGGGATTCAAACAGCTTTTCAGTTCTT 1800
Query 1797 GGGCAATGTAAACACACTAAGGACTGAATCTGCTGATTCTTCCGAAG-AGGACATTGAAC 1855
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1801 GGGCAATTTAAACACACTAAGGACTGAATCTGCTGATTCTTCCGAAGCAG-ACATTGAAC 1859
Query 1856 AGGAACACGTTGATGGAGCATTTGTTGAGACAATTTTACCAAAGGTTAAAACACCCCCTC 1915
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1860 AGGAGCACGTTGATGGTGCATTTGTTGAGACAATTTTACCAAAGGTTAAAACACTCCCTC 1919
Query 1916 AGGATATATTGCTGAAACTGCAACAAGAGCACACTTTGAAGGAAGCATCTGAAGCGAGCT 1975
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1920 AGGATATATTGCTGAAACTGCGACAAGAGCACACTTTGAAGGAAGCATCTGAAGCAAGCT 1979
Query 1976 CCATGTTTGTATTTAAGTTGGGTCTGGCGAAATTGAAGTGTTCCTTTTTGATGAATGGCC 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CCATGTTTGTATTTAAGTTGGGTCTGGCGAAATTGAAGTGTTCCTTTTTGATGAATGGCC 2039
Query 2036 TTGTCTTTGATTCCATTGAGGAAGAAACTCTTTTAAATGCCATGAATGATGAGCTTCCCA 2095
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2040 TTGTCTTTGATTCTGTTGAGGAAGAAACTCTTTTAAATGCCATGAATGAAGAGCTTCCCA 2099
Query 2096 AGATACAAGAACAAGTTTATTACGGCCAGATAGAATCCCGTACTAATGTTTTGGACAAAT 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
Sbjct 2100 AGATACAAGAACAAGTTTATTACGGCCAGATAGAATCCCATACTAAGGTTTTGGACAAGT 2159
Query 2156 TGCTTTCGGAAAGTGGTCTTAGCCGTTATAATCCACAGATTATTAGTGGAGGAAAGAACA 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 TGCTTTCGGAAAGTGGTCTTAGCCGTTATAATCCACAGATTATTAGTGGAGGAAAGAACA 2219
Query 2216 AACCAAGGTTTGTGTCTCTAGCTTCATCTACCAGGAAAGGGGAATCTATGTTGAATGATG 2275
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 AACCAAGGTTTGTGTCGCTAGCTTCATCTACCAGGAAAGGGGAATCTATGTTGAATGATG 2279
Query 2276 TTAACTACTTGCATTCTCCTGAAACTTCAGAGGATGTTAAGTATGTGACTCATCTCCTTG 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TTAACTACTTGCATTCTCCTGAAACTTCAGAGGATGTGAAGTATGTGACTCATCTCCTTG 2339
Query 2336 CTGCTGATGTCGCAACGAAGAAAGGAATGAAATTGTTACATGAAGGAATCCGTTACCTGA 2395
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2340 CTGCTGATGTTGCAACGAAGAAAGGAATGAAATTGTTACATGAAGGAGTCCGTTACCTGA 2399
Query 2396 TTGGAGGTTCCAAAAGTGCTCGTCTTGGAGTCTTATTTAG---CAGCCAGAATGCTGACC 2452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2400 TTGGAGGTTCCAAAAGTGCTCGTCTTGGAGTCTTATTTAGTAGCAGCCAGAATGCTGACC 2459
Query 2453 CATATAGCCTTCTATTTATAAAGTTTTTCGAAAAAACTGCTTCATCATTTAGTCATAAGG 2512
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2460 CACATAGCCTTCTATTTATAAAGTTTTTCGAAAAAACTGCTTCATCGTTTAGTCATAAGG 2519
Query 2513 AAAAGGTGCTATACTTCTTGGATAAACTATGCTTGTTTTACGAGCGTGAATATCTGTTAA 2572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 AAAAGGTGCTATACTTCTTGGATAAACTATGCTTGTTTTACGAGCGTGAATATCTGTTAA 2579
Query 2573 AAACAGCAGTGGAATCAGCTAGCTCTCAAATGTTTATTGATAAAGTCCTTGAGCTTGCTG 2632
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 AAACATCAGTGGAATCAGCTAGCTCTCAAATGTTTATTGATAAAGTCCTTGAGCTTGCTG 2639
Query 2633 AGGAATATGGGCTATCTTCTAAGGCATACCGATCTTGTCTCGTTGAATCATTGGATGAAG 2692
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2640 ATGAGTATGGGCTATCTTCTAAGGCATACCGATCTTGTCTCGTTGAATCAGTGGATGAAG 2699
Query 2693 AATTACTTAAGCGTTTGACAAAGGTCGCCCAATTCTTGTCTTGGGAACTTGGACTTGAAT 2752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 AATTACTTAAGCGTTTGACAAAGGTCGCCCAATTCTTGTCTTGGGAACTTGGACTTGAAT 2759
Query 2753 CTGATGCAAATGCTATTATTTCAAATGGAAGGGTGATATTTCCTGTGGATGAGAGGACAT 2812
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2760 CTGATGCAAATGCAATAATTTCAAATGGAAGGGTGATATTTCCTGTGGATGAGAGGACAT 2819
Query 2813 TTTTGGGCCAAGATTTACATCTTCTTGAGTCAATGGAGTTCAATCAAAGAGTAAAGCCTG 2872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 TTTTGGGCCAAGATTTACATCTTCTTGAGTCAATGGAGTTCAATCAAAGAGTAAAGCCTG 2879
Query 2873 TTCAAGAAATTATTGAAGGCATTGAATGGCAAGATGTGGATCCTGATCTGCTCACAAGTA 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2880 TTCAAGAAATTATTGAAGGCATTGAATGGCAAGATGTGGATCCCGATCTGCTGACAAGTA 2939
Query 2933 AATATTTTAGCGATGTCTTCATGTTTGTGTCATCTGCAATGGCAACACGGGATCGTAGTT 2992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 AATATTTTAGCGATGTCTTCATGTTTGTGTCATCTGCAATGGCAACACGGGATCGTAGTT 2999
Query 2993 CTGAAAGTGCACGCTTTGAGGTGTTGAATTCAGAGTACAGTGCGGTTTTGCTGGGAAATG 3052
|||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 CTGAAAGTGCGCGGTTTGAGGTGTTGAATTCAGAATACAGTGCGGTTTTGCTGGGAAATG 3059
Query 3053 AAAATGCAACGATACACATTGATGCTGTTATCGATCCTTTAAGTCCTACTGGTCAAAAAC 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3060 AAAATGCAACGATACACATTGATGCTGTTATCGATCCTTTAAGCCCTACTGGTCAAAAAC 3119
Query 3113 TAGCATCACTTCTTCAAGTTCTACAGAAACATGTTCAGACGAGCATGAGGATTGTTCTGA 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 TAGCATCACTTCTTCAAGTTCTACAGAAACATGTTCAGACGAGCATGAGGATTGTTCTGA 3179
Query 3173 ATCCGATGAGTTCCCTTGTGGACATTCCTCTGAAGAATTACTACAGATATGTCTTACCTA 3232
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 ATCCCATGAGTTCCCTTGTGGACATTCCTCTGAAAAATTACTACAGATATGTCTTACCTA 3239
Query 3233 ATACGGACGATTACAGCAGTACAGGCTTTGACGTAGATGGGCCTAAGGCATTTTTCGCAA 3292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 ATACGGACGATTACAGCAGTACAGGCTTTGACGTAGATGGGCCTAAGGCATTTTTCGCAA 3299
Query 3293 ATATGCCATTGTCTAAGACACTTACCATGAATCTTGACGTTCCAGAGCCATGGCTTGTTG 3352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3300 ATATGCCATTGTCTAAGACACTTACCATGAATCTTGACGTTCCAGAGCCATGGCTGGTTG 3359
Query 3353 AACCAGTAATTGCCATTCATGATCTTGATAATATATTGCTTGAGAACCTGGGAGATACCA 3412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3360 AACCAGTAATTGCCATTCATGATCTTGATAATATATTGCTTGAGAATCTAGGAGATACCA 3419
Query 3413 CTACACTGCAGGCAGTTTTTGAGGTTGAATCTCTTGTTCTTACAGGTCATTGCGCAGAAA 3472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3420 CTACACTGCAGGCAGTTTTTGAGGTTGAATCTCTTGTTCTTACAGGTCATTGCGCGGAAA 3479
Query 3473 AAGATCATGAGGCTCCTCGTGGCCTTCAGCTGATTCTGGGAACCAAAAATAGACCGCATT 3532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 AAGATCATGAGGCTCCTCGTGGCCTTCAGCTGATTCTGGGAACCAAAAATAGACCGCATT 3539
Query 3533 TGGTTGATACCCTTGTAATGGCCAATTTGGGTTATTGGCAGATGAAAGTATCCCCAGGGG 3592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 TGGTTGATACCCTTGTAATGGCCAATTTGGGTTATTGGCAGATGAAAGTATCCCCAGGGG 3599
Query 3593 TTTGGTATTTGCAACTTGCTCCGGGTAGAAGTTCTGAGCTATACGCTTTGAAAGGAGGAA 3652
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 TTTGGTATTTGCAACTTGCTCCGGGTAGAAGTTCGGAGCTATACGCTTTGAAAGGAGGAA 3659
Query 3653 ATGATGGGAGTCAAGATCAATCCTCACTGAAACGTATTACTATCGATGATCTGCGTGGTA 3712
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 ATGATGGGAGTCAAGATCAATCCTCGCTGAAACGTATAACTATCGATGATCTGCGTGGTA 3719
Query 3713 AAGTTGTTCATCTAGAAGTAGTTAAGAGAAAGGGTAAGGAGCATGAAAAGTTGCTAGTTC 3772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 AAGTTGTTCATCTAGAAGTAGTTAAGAGAAAGGGTAAGGAGCATGAAAAGTTGCTAGTTC 3779
Query 3773 CTTCAGACGGTGATGATGGTGTGCAGCAAAACAACAAACGAGG-AAGCTGGAACTCAAAT 3831
|||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 3780 CTTCAGACGGTGATGATGCTGTGCAACAAAACAAGGAAC-AGGGAAGCTGGAACTCAAAT 3838
Query 3832 TTCTTGAAATGGGCGTCTGGTTTTGTTGGTGGTCGTCAACAATCAATGAAGGGAGGTCCC 3891
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3839 TTCTTGAAATGGGCGTCTGGTTTTGTTGGTGGTCGTCAACAATCAATGAAGGGAGGTCCT 3898
Query 3892 GAAAAAGAGCATGAGAAGGGTGGGCGACAAGGGAAAACGATAAATATATTCTCCATCGCT 3951
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3899 GACAAAGAGCATGAGAAGGGTGGGCGACAAGGGAAAACGATAAATATATTCTCCATTGCT 3958
Query 3952 TCAGGGCATTTATACGAGCGTTTCCTTAAGATCATGATTCTCAGTGTCCTGAAGAACACC 4011
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 TCAGGGCATTTATACGAGCGTTTCCTTAAGATTATGATTCTCAGTGTCCTGAAGAACACC 4018
Query 4012 AATCGTCCTGTAAAATTCTGGTTTATTAAGAATTATCTCTCTCCTCAATTTAAGGATGTG 4071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4019 AATCGTCCTGTAAAATTCTGGTTTATTAAGAATTATCTCTCTCCTCAATTTAAGGATGTG 4078
Query 4072 ATTCCACATATGGCACAAGAATACAACTTTGAGTATGAGCTGATTACATATAAATGGCCT 4131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4079 ATTCCACATATGGCACAAGAATACAACTTTGAGTATGAGCTGATTACATACAAATGGCCG 4138
Query 4132 TCCTGGTTGCATAAACAGAAAGAAAAGCAACGAATTATTTGGGCCTACAAAATTCTTTTC 4191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4139 TCCTGGTTGCATAAACAGAAAGAAAAGCAACGAATTATTTGGGCCTACAAAATTCTTTTC 4198
Query 4192 CTTGATGTTATATTTCCTCTCTCATTGGAAAAGGTTATATTTGTCGACGCAGATCAAATT 4251
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4199 CTTGATGTCATATTTCCTCTCTCATTGGAAAAGGTTATATTTGTCGACGCAGATCAAATT 4258
Query 4252 ATAAGGACAGACATGGGAGAACTGTATGATATGGATATCAAAGGAAGACCTCTCGCGTAT 4311
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 ATAAGGACAGACATGGGAGAACTGTATGATATGGATATTAAAGGAAGACCTCTCGCGTAT 4318
Query 4312 ACTCCTTTTTGTGACAACAACAGGGAAATGGATGGCTATCGATTTTGGAGACAGGGTTTC 4371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 4319 ACTCCTTTTTGTGACAACAACAGGGAAATGGATGGCTATAAATTTTGGAAACAGGGTTTC 4378
Query 4372 TGGAAAGAACATTTACGTGGTAGGCCATACCATATCAGTGCTCTGTACGTTGTTGACTTG 4431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4379 TGGAAAGAACATTTACGTGGTAGGCCATACCATATCAGTGCTCTATACGTTGTTGACTTG 4438
Query 4432 GTTAAGTTCCGAGAGACAGCGGCAGGAGATAATCTAAGAGTATTTTATGAGACGCTTAGC 4491
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4439 GTTAAGTTCCGAGAGACAGCGGCAGGAGATAATCTAAGAGTATTCTATGAGACGCTTAGC 4498
Query 4492 AAGGATCCAAATAGTTTGTCCAACCTAGATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCATACT 4551
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4499 AAGGATCCAAACAGTTTGTCCAACCTAGATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCATACT 4558
Query 4552 GTTCCTATATTTTCACTTCCCCAAGAGTGGTTGTGGTGTGAATCTTGGTGTGGAAACGCC 4611
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4559 GTTCCTATATTTTCACTTCCCCAAGAGTGGTTGTGGTGTGAATCCTGGTGTGGAAACGCC 4618
Query 4612 ACAAAAGCCAAGGCCAGAACAATTGACCTTTGCAATAATCCCATGACAAAGGAACCAAAG 4671
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4619 ACAAAAGCCAAGGCCAGAACAATCGATCTTTGCAATAATCCCATGACAAAGGAACCAAAG 4678
Query 4672 CTTCAGGGTGCCAGAAGAATCGTAACTGAATGGCCCGATCTTGATCTCGAAGCACGGAAA 4731
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4679 CTTCAGGGTGCCCGAAGAATCGTAACCGAATGGCCCGATCTTGATCTCGAAGCACGAAAA 4738
Query 4732 TTCACAGCAAAAATCTTGGGTGAAGATGTGGAACTCGTCAACGAGCCAGTAGCTGCTCCT 4791
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4739 TTCACAGCAAAAATCTTGGGTGAAGATGTGGAACTC---AACGAGCCAGTAGCTGCTCCT 4795
Query 4792 GCTACAGAGAAGCCTAACCCTCCTCCATCAAGTGACATCTCTAAAGATACAGAAGAAGAC 4851
|||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 4796 GCTACAGACAAGCCTAATCCTCTTCCATCAAATGACATCTCTGAAGATACAGAACAAGAC 4855
Query 4852 TTGGAATCTAAAGCAGAACTGTAAAT 4877
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4856 TTGGAATCTAAAGCAGAACTGTAAAT 4881
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 244212678524
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5