BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg926858 Length=2053 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G74800.1 | Symbols: | Galactosyltransferase family protein ... 3384 0.0 > AT1G74800.1 | Symbols: | Galactosyltransferase family protein | chr1:28101968-28105112 REVERSE LENGTH=2391 Length=2391 Score = 3384 bits (1832), Expect = 0.0 Identities = 1983/2055 (96%), Gaps = 13/2055 (1%) Strand=Plus/Plus Query 9 aaaaaaacagaaatgaaaaaacccaaattgtcgaaagttgaaaaaCTCGACAAGCTTGAT 68 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| Sbjct 108 AAAAAAACAGAAATGAAAAAACCCAAATTGTCGAAAGTGGAAAAAATCGACAAGATTGAT 167 Query 69 CTGTTCTCTTCACTATGGAAGCAGAGATCGGTTCGTGTAATAATGGCAATAGGGTTTCTC 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 168 CTGTTCTCTTCACTATGGAAGCAGAGATCGGTTCGTGTAATAATGGCAATAGGGTTTCTC 227 Query 129 TATC-TGATAATTGTCTCAGTAGAGATACCTCTCGTATTCAAATCCTGGTCCAGCAGCTC 187 |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 228 TATCTTG-TAATTGTCTCAGTAGAGATACCTCTCGTTTTCAAATCCTGGTCCAGCAGCTC 286 Query 188 CGTGCCTCTTGATTCTCTTTCCCGACTCGAGAAGCTCAATAGCGAGCAAGAGCCCCAAGT 247 ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 287 CGTGCCTCTTGATGCTCTTTCTCGACTCGAGAAGCTCAATAACGAGCAAGAGCCCCAAGT 346 Query 248 CGAGAAAATCCCTGATCCTCCATTGAAGCCAGTTTCGTACCCGGTTTCTG-ACCCGACCA 306 ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 347 CGAGATTATCCCTAATCCTCCATTGGAGCCAGTTTCGTACCCGGTTTC-GAACCCGACCA 405 Query 307 TTGTTAACCGGACGGA-C-----CAGAACAAGGTCCGTGAACATCATCGGGGTCTCCTCT 360 |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 406 TTGTTACCCGGACGGACCTTGTTCAGAACAAGGTCCGTGAACATCATCGGGGTGTTCTCT 465 Query 361 CAAGTTTGAGATTTGATTCGGAAACTTTCGACCCGAGTAGTAAAGACGGGTCAGTGGAGC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 466 CAAGTTTGAGATTTGATTCGGAAACTTTCGACCCGAGTAGTAAAGACGGGTCAGTGGAGC 525 Query 421 TTCACAAGTCGGCTAAGGAAGCTTGGCAGCTAGGTCGCAAGCTATGGAAGGAGCTTGAAT 480 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 526 TTCACAAGTCAGCTAAGGAAGCTTGGCAGCTAGGTCGCAAGCTATGGAAGGAGCTTGAAT 585 Query 481 CAGGAAGGCTTGAGAAACTAGTGGAGAAGCCAGAGAAGAACAAATCAGATTCGTGTCCAC 540 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| Sbjct 586 CTGGAAGGCTTGAGAAACTAGTGGAGAAGCCAGAGAAGAACAAACCGGATTCATGTCCAC 645 Query 541 ATTCTGTTTCGTTAACCGGGTCGGAATTTATGAACCGGGAGAACAAACTGATGGAGCTGC 600 ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 646 ATTCTGTTTCGCTAACCGGGTCTGAGTTTATGAACCGGGAGAACAAATTGATGGAGCTGC 705 Query 601 CGTGTGGTTTGACATTGGGTTCACACATAACTCTGGTGGGGAGGCCGAGGAAAGCTCATC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 706 CGTGTGGTTTGACATTGGGTTCACACATAACTTTGGTGGGGAGGCCGAGGAAAGCTCATC 765 Query 661 CCAAGGAAGGAGATTGGTCTAAGTTAGTGTCTCAGTTTGTGATAGAGCTTCAAGGTTTGA 720 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 766 CCAAGGAAGGAGATTGGTCTAAGTTGGTGTCTCAGTTTGTGATAGAGCTTCAAGGTTTGA 825 Query 721 AGACTGTTGAAGGAGAGGATCCTCCTAGGATTCTGCATTTCAATCCGAGGCTTAAGGGAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 826 AGACTGTTGAAGGAGAGGATCCTCCTAGGATTCTGCATTTCAATCCGAGGCTTAAGGGAG 885 Query 781 ATTGGAGCAAAAAACCGGTGATTGAGCAGAACAGTTGCTATAGGATGCAATGGGGACCTG 840 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 886 ATTGGAGCAAAAAACCGGTGATTGAGCAGAATAGTTGCTATAGGATGCAATGGGGACCTG 945 Query 841 CACAACGTTGCGAAGGATGGAAGTCAAGAGCCGAGGAAGAGACTGTTGATAGTCATGTGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 946 CACAACGTTGCGAAGGATGGAAGTCAAGAGATGATGAAGAGACTGTTGATAGTCATGTGA 1005 Query 901 AGTGTGAGAAGTGGATTCGTGATGATGATAACTACTCAGAAGGGTCGAGGGCAAGATGGT 960 ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1006 AGTGTGAAAAATGGATTCGTGATGATGACAATTACTCAGAAGGGTCGAGGGCAAGATGGT 1065 Query 961 GGTTGAATAGACTCATAGGAAGGAGAAAAAGGGTCAAAGTGGAATGGCCGTTTCCTTTTG 1020 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1066 GGTTGAATAGACTTATAGGAAGGAGGAAAAGGGTCAAAGTAGAATGGCCGTTTCCTTTTG 1125 Query 1021 TGGAAGAGAAGCTGTTTGTTCTAACTCTTAGCGCCGGTTTAGAGGGCTACCATATCAATG 1080 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1126 TGGAAGAGAAGCTGTTCGTTCTAACTCTTAGCGCCGGTTTAGAGGGTTACCATATCAATG 1185 Query 1081 TTGATGGAAAGCATGTGACATCTTTCCCTTATCGCACTGGTTTCACGCTCGAGGATGCAA 1140 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 1186 TTGATGGAAAGCATGTTACTTCTTTCCCTTATCGCACTGGTTTCACCCTTGAGGATGCAA 1245 Query 1141 CAGGGCTAACCGTAAATGGAGACATTGATGTCCATTCTGTTTTTGTTGCCTCTCTGCCAA 1200 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1246 CAGGGCTAACAGTAAACGGAGACATTGATGTCCATTCTGTTTTTGTTGCCTCTCTGCCAA 1305 Query 1201 CATCACATCCTAGCTTTGCTCCCCAAAGGCATCTCGAGTTGTCAAAGAGATGGCAGGCCC 1260 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 1306 CATCACATCCTAGTTTTGCTCCCCAAAGGCATCTCGAATTGTCAAAGAGATGGCAGGCTC 1365 Query 1261 CTGTAGTTCCTGATGGGCCTGTGGAGATCTTTATAGGCATTCTTTCTGCAGGCAATCATT 1320 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1366 CTGTAGTTCCCGATGGGCCTGTGGAGATCTTTATAGGCATTCTTTCCGCAGGCAATCATT 1425 Query 1321 TCTCTGAGCGGATGGCTGTGAGGAAATCCTGGATGCAGCATGTTCTTATCACATCTGCAA 1380 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1426 TCTCTGAGCGGATGGCTGTGAGGAAATCCTGGATGCAGCATGTTCTTATTACATCTGCAA 1485 Query 1381 AAGTTGTTGCTCGTTTCTTTGTAGCGCTGCATGGGAGGAAGGAGGTGAATGTGGAATTGA 1440 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1486 AAGTTGTTGCTCGTTTCTTTGTGGCGCTGCATGGGAGGAAGGAGGTGAATGTGGAATTGA 1545 Query 1441 AGAAAGAAGCAGAGTATTTTGGAGACATTGTACTTGTTCCATACATGGATAGCTATGATC 1500 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1546 AGAAAGAAGCGGAGTATTTTGGGGACATTGTACTTGTTCCTTACATGGATAGCTATGATC 1605 Query 1501 TTGTCGTGCTGAAAACTGTTGCCATATGTGAACACGGAGCTCTTGCATTCTCTGCAAAGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1606 TTGTCGTGCTGAAAACTGTTGCCATATGTGAACACGGAGCTCTTGCATTCTCTGCAAAGT 1665 Query 1561 ACATAATGAAATGTGACGATGATACATTTGTAAAACTTGGTGCGGTGATCAATGAAGTGA 1620 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1666 ACATAATGAAGTGTGACGATGATACATTTGTAAAACTTGGCGCGGTGATCAATGAAGTGA 1725 Query 1621 AAAAAGTACCCGAAGGTAGAAGCCTGTACATTGGTAACATGAATTATTACCACAAACCTC 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1726 AAAAAGTACCCGAAGGTAGAAGCCTGTACATTGGTAACATGAATTATTACCACAAACCTC 1785 Query 1681 TCCGTGGGGGTAAATGGGCAGTCACATATGAGGAATGGCCAGAGGAGGACTATCCGCCCT 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1786 TCCGTGGGGGTAAATGGGCAGTCACATATGAGGAATGGCCAGAGGAGGACTATCCGCCCT 1845 Query 1741 ACGCAAATGGACCCGGATATGTTCTATCTTCTGACATTGCGCGCTTCATCGTAGACAAGT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1846 ACGCAAATGGACCCGGATATGTTCTATCTTCTGACATTGCGCGCTTCATCGTGGACAAGT 1905 Query 1801 TTGAGAGACATAAATTACGGCTGTTCAAGATGGAGGACGTGAGTGTGGGAATGTGGGTTG 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1906 TTGAGAGACATAAATTACGGCTGTTCAAGATGGAGGACGTGAGTGTGGGAATGTGGGTTG 1965 Query 1861 AGCATTTCAAGAACACAACAAACCCAGTGGATTACAGACACAGTCTGAGATTCTGCCAAT 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1966 AGCATTTCAAGAACACAACAAACCCAGTGGATTACAGACACAGTCTGAGATTCTGCCAGT 2025 Query 1921 TTGGTTGTGTTGAGAACTACTACACAGCTCATTACCAGTCGCCAAGACAGATGATATGCT 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2026 TTGGTTGTGTTGAGAACTACTACACAGCTCATTACCAGTCGCCAAGACAGATGATATGCT 2085 Query 1981 TATGGGATAAGCTTTTAAGACAGAACAAGCCTGAGTGTTGTAACATGAGATGAT-A--CT 2037 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct 2086 TATGGGATAAGCTCTTAAGACAGAACAAGCCTGAGTGTTGTAACATGAGATGATGATACT 2145 Query 2038 TGAGGAAACAGTTGC 2052 ||||||||||||||| Sbjct 2146 TGAGGAAACAGTTGC 2160 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 101756504715 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5