BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg927456
Length=3406
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G80490.2 | Symbols: TPR1 | TOPLESS-related 1 | chr1:30260903... 5703 0.0
AT1G15750.1 | Symbols: WSIP1, TPL | Transducin family protein /... 2555 0.0
> AT1G80490.2 | Symbols: TPR1 | TOPLESS-related 1 | chr1:30260903-30267038
REVERSE LENGTH=3787
Length=3787
Score = 5703 bits (3088), Expect = 0.0
Identities = 3274/3367 (97%), Gaps = 0/3367 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATCATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTGTTCTTGATCTTACAGTTTTTAGACGAAGAG 80
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 231 ATCATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTCTTCTTGATCTTACAGTTTTTAGATGAAGAG 290
Query 81 AAGTTCAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAG 140
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 AAGTTTAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAG 350
Query 141 TATTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAGGTATCTCTCTGGT 200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 351 TATTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGT 410
Query 201 TTTACCAAAGTTGATGATAATAGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAG 260
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 TTTACTAAAGTTGATGATAATCGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAG 470
Query 261 AAGTATCTCGAGGCCTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGAAATTCTAGTCAAA 320
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||
Sbjct 471 AAGTATCTCGAGGCCTTGGATAGGCATGATCGTCCCAAGGCTGTCGATATTTTAGTCAAA 530
Query 321 GATTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTG 380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 GATTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTG 590
Query 381 ACCTTAGAAAACTTCCGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCC 440
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 ACCTTAGAAAACTTCAGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCC 650
Query 441 CGAGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCATTGTTCCGTGAT 500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 651 AGAGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCTTTATTCCGTGAT 710
Query 501 AAATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAAATTCACGGCTGAGGACTCTCATTAATCAGAGCTTA 560
||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 711 AAATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAACTTCACGCCTCAGGACTCTGATTAATCAGAGCTTA 770
Query 561 AATTGGCAACATCAGCTTTGTAAAAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTT 620
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 AATTGGCAACACCAGCTTTGTAAGAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTT 830
Query 621 GTGGATCATTCCTGCCGCCTACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCG 680
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GTCGATCATTCCTGCCGCCTACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCG 890
Query 681 CTGCTTGGATCATTACCAAAAGCCGGGGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 740
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 891 CTTCTTGGATCATTACCAAAAGCCGAGGGATTTCCTCCTCTAGGCGCACACGGGCCTTTT 950
Query 741 CAACCAACATCTTCTCCTGTTCCTACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTCT 800
||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 CAACCAACACCTTCTCCGGTTCCGACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTCT 1010
Query 801 GTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGAGCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGCA 860
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 GTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGACCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGCA 1070
Query 861 GCCTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGAT 920
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 GCCTTGAAACACCCGAGAACTCCTCCTTCTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGAC 1130
Query 921 TCAGACCATGTCTCAAAGCGAACAAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGGT 980
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 TCAGACCATGTCTCAAAGCGAACCAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGGT 1190
Query 981 GTCAACATGTTACCAATGACATTCCCGGGACAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAAA 1040
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 GTGAACATGTTACCAATGACATTCCCGGGGCAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAAA 1250
Query 1041 GCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTAGCACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCATG 1100
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTTGCACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCATG 1310
Query 1101 AGCATGGATTTCCATCCTAGTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGGAT 1160
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 AGCATGGATTTCCATCCTATTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGGAT 1370
Query 1161 ATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACGACTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTTGG 1220
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 ATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACGTCTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTTGG 1430
Query 1221 GACTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCT 1280
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 GACTTGAGTAAATGTTCGATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCT 1490
Query 1281 GTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGATGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCAAGACAT 1340
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1491 GTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGACGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCGAGACAT 1550
Query 1341 ATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGATATGAGGCAACACCTCGAGATTGAT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1551 ATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTGAT 1610
Query 1401 GCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTCTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTGTT 1460
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 GCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTTTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTGTT 1670
Query 1461 ACTACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGTAAAACGG 1520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 ACTACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGTAAAACGG 1730
Query 1521 CATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGAAAAC 1580
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 TATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGAAAAC 1790
Query 1581 ATTCAGTTCATCTTTTCAACTGCGCTTGACGGGAAAATAAAAGCATGGTTATATGATAAT 1640
|||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 ATTCAGTTTATCTTTTCAACTGCTCTTGACGGAAAAATAAAAGCATGGTTATATGATAAT 1850
Query 1641 ATGGGTTCTCGGGTTGACTATGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTACAGT 1700
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATGGGTTCTCGGGTTGACTACGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTACAGT 1910
Query 1701 GCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCATAGTT 1760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 GCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCATAGTT 1970
Query 1761 GAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCAGTTAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCT 1820
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 GAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCTGTGAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCC 2030
Query 1821 CTTGGTGTTGTGCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGACTTC 1880
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 CTTGGTGTTGTCCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGACTTC 2090
Query 1881 TCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACTATACAGCTTTTGACTGCCATTGATGCTGATGGA 1940
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 TCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACCATACAGCTTTTGACTGCCATTGATGCTGATGGA 2150
Query 1941 GGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCGTTTCT 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2151 GGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCTGTTTCC 2210
Query 2001 GCAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTTAGGCTATTGCACACA 2060
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2211 GCAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGCACACA 2270
Query 2061 GTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCATCCCGGTGGCAGAG 2120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||
Sbjct 2271 GTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCATTCCGATGGTAGAG 2330
Query 2121 AGACCTGCCTCTGTCGTTTCCATTCCTGGAATGAATGGAGATTCACGGAATATGGTGGAT 2180
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2331 AGACCTGCCTCTGTCGTTTCCATCCCTGGAATGAATGGAGATTCGCGGAATATGGTGGAT 2390
Query 2181 GTGAAGCCAGTGATCACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAA 2240
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 GTGAAGCCAGTGATTACCGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAA 2450
Query 2241 CTCGGCGAACCCTCTCAATGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGCCACCAAG 2300
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2451 GTCGGCGAACCCTCTCAGTGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGTCACCAAG 2510
Query 2301 ATATCGAGATTGATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCATTGGCATCAAATGCT 2360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 ATATCGAGATTGATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCATTGGCATCAAATGCT 2570
Query 2361 ATTCATCTGCTATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGAAAGGCAACGGCT 2420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2571 ATTCATCTGCTATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGGAAGGCAACGGCT 2630
Query 2421 TCTTTACCTCCTCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGATCTTAATGACAAACGATGTGGTT 2480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2631 TCTTTACCTCCTCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGATCTTAATGACAAACGATGTGGCT 2690
Query 2481 GAAACTAATCCAGAAGAAGCCGTACCATGTTTTGCTTTATCCAAAAATGATTCCTACGTA 2540
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2691 GAAACTAATCCAGAAGAAGCCGTACCCTGTTTTGCTTTATCGAAAAATGATTCCTACGTG 2750
Query 2541 ATGTCAGCATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCT 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2751 ATGTCAGCATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCT 2810
Query 2601 ACTTTCATGCCGCCGCCCCCTGCTGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAAT 2660
|||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 ACTTTCATGCCGCCTCCTCCTGCCGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAAT 2870
Query 2661 ATCATTGCGATCGGGATGGATGATAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAG 2720
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871 ATCATTGCGATCGGGATGGATGACAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAG 2930
Query 2721 GTTAAGAGCAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTA 2780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2931 GTTAAGAGCAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTA 2990
Query 2781 CTAAACGTTCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGTGTATGGAACACGGATGGA 2840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2991 TTAAACGTTCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGCGTATGGAACACGGATGGA 3050
Query 2841 TGGGAGAAGCAGAAAAGCAAGGTCCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCGACGTCTGCTCTG 2900
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||
Sbjct 3051 TGGGAGAAGCAGAAAAGCAAGGTTCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCCACGTCTTCTTTG 3110
Query 2901 TCAGACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAGTACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3111 TCAGACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAGTACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACT 3170
Query 2961 CAGCTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAA 3020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3171 CAGCTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAA 3230
Query 3021 TCATCAGCTCCAATCACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAACTGATATACACAAGT 3080
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3231 TCAGCAGCTCCAATAACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAATTGATATACACAAGT 3290
Query 3081 TTCATGGACGCTACGATATGTGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTC 3140
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TTCATGGACGCTACAATATGCGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTC 3350
Query 3141 AATCCCTCTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAACGTCCATCCGCTGGTGATA 3200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3351 AATCCCTCTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAATGTCCATCCACTGGTGATA 3410
Query 3201 GCGGCTCATCCGCAAGAATCGAATATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGGGTCCAT 3260
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 GCGGCTCATCCGCAAGAATCCAACATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGGGTCCAT 3470
Query 3261 ATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACCGCCTGAAAATGGC 3320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3471 ATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACCGCCTGAAAATGGC 3530
Query 3321 TCAGCCAGCGCTGTTACGGCTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCCTCAG 3380
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 TCAGCCAGCGCTGTCACGGCTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCCTCAG 3590
Query 3381 AGATGAT 3387
|||||||
Sbjct 3591 AGATGAT 3597
> AT1G15750.1 | Symbols: WSIP1, TPL | Transducin family protein
/ WD-40 repeat family protein | chr1:5414817-5420630 REVERSE
LENGTH=3829
Length=3829
Score = 2555 bits (1383), Expect = 0.0
Identities = 1859/2093 (89%), Gaps = 16/2093 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 23 CATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTGTTCTTGATCTTACAGTTTTTAGACGAAGAGAA 82
|||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||
Sbjct 164 CATGTCTTCTCTTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTCGATGAAGAGAA 223
Query 83 GTTCAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTA 142
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 GTTTAAAGAGACTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTA 283
Query 143 TTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAGGTATCTCTCTGGTTT 202
||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 284 TTTTGAGGATGAGGTTCACAATGGAAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTTT 343
Query 203 TACCAAAGTTGATGATAATAGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAGAA 262
|| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 344 CACTAAAGTAGATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGAA 403
Query 263 GTATCTCGAGGCCTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGAAATTCTAGTCAAAGA 322
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||
Sbjct 404 GTATCTCGAGGCTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGGA 463
Query 323 TTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTGAC 382
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 464 TTTGAAAGTGTTTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACACAGCTCTTGAC 523
Query 383 CTTAGAAAACTTCCGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCCCG 442
|| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 524 ATTGGAGAACTTCCGGGAGAATGAACAGTTATCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAAG 583
Query 443 AGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCATTGTTCCGTGATAA 502
||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||||||
Sbjct 584 AGCGATCATGTTGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCTTTATTCCGTGATAA 643
Query 503 ATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAAATTCACGGCTGAGGACTCTCATTAATCAGAGCTTAAA 562
||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||
Sbjct 644 ATTGCAGTTCCCTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAAA 703
Query 563 TTGGCAACATCAGCTTTGTAAAAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTTGT 622
||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 704 TTGGCAACACCAGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATCAAGACTCTTTTTGT 763
Query 623 GGATCATTCCTGCCGCC-TACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCGC 681
|||||| || || ||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 764 GGATCACTCTTGTGGCCCT-CCAAATGGCGCACGAGCTCCATCTCCTGTGAACAATCCAC 822
Query 682 TGCTTGGATC-ATTACCAAAAGCCGGGGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 740
|||||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 TGCTTGGAGGGAT-ACCAAAGGCTGGAGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 881
Query 741 CAACCAACATCTTCTCCTGTTCCTACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTCT 800
|||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 882 CAACCAACGGCGTCACCTGTTCCAACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTCT 941
Query 801 GTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGAGCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGCA 860
||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||
Sbjct 942 GTCCCACATCCAGCTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGCG 1001
Query 861 GCCTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGAT 920
|| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||| |||
Sbjct 1002 GCGTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATGCTTCTTTAGACTACCCGTCAGCAGAT 1061
Query 921 TCAGACCATGTCTCAAAGCGAACAAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGGT 980
|| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1062 TCTGAACATGTCTCAAAAAGAACAAGACCAATGGGAATCTCTGACGAGGTGAATCTAGGC 1121
Query 981 GTCAACATGTTACCAATGACATTCCC-GGGACAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAA 1039
|| ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||||||| || | |||||
Sbjct 1122 GTGAACATGTTACCGATGTCATTTTCAGGG-CAGGCCCATGGTCATTCTCCGGCTTTCAA 1180
Query 1040 AGCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTAGC-ACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCA 1098
||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1181 AGCACCTGACGACTTGCCCAAGACAGTTGCGA-GAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCA 1239
Query 1099 TGAGCATGGATTTCCATCCTAGTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGG 1158
||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1240 TGAGCATGGATTTCCATCCAATTAAACAGACCCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTG 1299
Query 1159 ATATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACGACTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTT 1218
|||| ||||| |||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 1300 ATATCGGGCTGTGGGAAGTTGGTTCTCGCGAAAGATTAGTACAGAAGACGTTCAAAGTCT 1359
Query 1219 GGGACTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1278
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1360 GGGATTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1419
Query 1279 CTGTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGATGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCAAGAC 1338
|||||||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||| || ||||
Sbjct 1420 CTGTCAACCGTGTGATATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGAC 1479
Query 1339 ATATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGATATGAGGCAACACCTCGAGATTG 1398
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1480 ATATTGTACAACTATACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTG 1539
Query 1399 ATGCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTCTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTG 1458
||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1540 ATGCTCATGTTGGTGGTGTGAATGATATTTCCTTCTCGACTCCAAACAAGCAACTATGTG 1599
Query 1459 TTACTA-CTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGT-AAA 1516
| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 1600 TAA-TAACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAA 1658
Query 1517 ACGGCATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGA 1576
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||
Sbjct 1659 A-GGCATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGA 1717
Query 1577 AAACATTCAGTTCATCTTTTCAACTGCGCTTGACGGGAAAATAAAAGCATGGTTATATGA 1636
||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||||
Sbjct 1718 AAACATTCAGTTCATATTTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCTTGGTTGTATGA 1777
Query 1637 TAATATGGGTTCTCGGGTTGACTATGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTA 1696
|||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 1778 TAATATGGGTTCCCGAGTTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTA 1837
Query 1697 CAGTGCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCAT 1756
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1838 TAGTGCCGATGGTACTAGGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCAT 1897
Query 1757 AGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCAGTTAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 1816
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898 TGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 1957
Query 1817 TTCTCTTGGTGTTGTGCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGA 1876
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1958 TTCTCTAGGTGTTGTGCAGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGA 2017
Query 1877 CTTCTCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACTATACAGCTTTTGACTGCCATTGATG-CTG 1935
|||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |
Sbjct 2018 TTTCTCCATCAAGTTCTGGGATATGGACGCTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGC-G 2076
Query 1936 ATGGAGGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCG 1995
||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2077 ATGGAGGCCTCCAGGCAAGCCCGCGTATCCGGTTCAACAAGGAAGGCTCTCTCCTGGCCG 2136
Query 1996 TTTCTG-CAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTTAGGCTATTG 2054
| |||| ||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2137 TGTCTGGCAAC-GAGAATGTGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTG 2195
Query 2055 CACACAGTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCAT 2107
||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2196 CACACTTTTGAGAACATATCATCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATAAACAGCAT 2248
Score = 1290 bits (698), Expect = 0.0
Identities = 1082/1268 (85%), Gaps = 24/1268 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2132 TGTCGTTTCCATTCC-TGGAATGAATGGAGATTCACGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAG 2190
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2306 TGTAGTTTCCA-TCCAAGGAATGAATGGAGATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAG 2364
Query 2191 TGATCACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAACTCGGCGAAC 2250
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |
Sbjct 2365 TGATCACAGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGC 2424
Query 2251 CCTCTCAATGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGCCA-CCAAGATATCGAGA 2309
| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||
Sbjct 2425 CTTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTGAGAATCTGAGAGT-AGCCAAGATATCAAGA 2483
Query 2310 TTGATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCAT-TGGCATCAAATGCTATTCATCT 2368
||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||
Sbjct 2484 TTGATTTTCACGAATTCGGGAAATGCTATTTTGGC-TCTGGCATCAAACGCAATTCATCT 2542
Query 2369 GCTATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGAAAGGCAACGGCTTCTTTACC 2428
|||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2543 TCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACGCAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACC 2602
Query 2429 TCCTCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGATCTTAATGACAAACGATGTGGTTGAAACTAA 2488
|||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||| | |||||| ||
Sbjct 2603 GCCTCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATCCTCATGACTAACGATGTTGCTGAAACCAA 2662
Query 2489 TCCAGAAGAAGCCGTACCATGTTTTGCTTTATCCAAAAATGATTCCTACGTAATGTCAGC 2548
||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 2663 TCCCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTTTATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAGC 2722
Query 2549 ATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCTACTTTCAT 2608
|| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2723 CTCCGGAGGAAAGATATCCTTATTTAACATGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTCAT 2782
Query 2609 GCCGCCGCCCCCTGCTGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAATATCATTGC 2668
||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2783 GCCCCCACCACCGGCTGCTACTTTTCTTGCTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATCGC 2842
Query 2669 GATCGGGATGGATGATAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAGGTTAAGAG 2728
|| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2843 TATTGGGATGGATGATAGCACGATTCAGATTTATAATGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGAG 2902
Query 2729 CAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTACTAAACGT 2788
||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||| |||||||
Sbjct 2903 TAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAACTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAACGT 2962
Query 2789 -TCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGTGTATGGAACACGGATGGATGGGAGA 2847
| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2963 GT-TGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGCTTTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAAA 3021
Query 2848 AGCAGAAAAGCAAGGTCCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCGA-C-GTCTGCTC-TGTCAG 2904
|||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | || || | | ||||
Sbjct 3022 AGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCACAGGGAAGACCAAACAGT--GCACCT-TCAG 3078
Query 2905 ACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAG-TACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACTCAG 2963
| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || || || || || ||
Sbjct 3079 ATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCT-CACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGCAA 3137
Query 2964 CTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAATCA 3023
|| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||
Sbjct 3138 CTTGCTATATACGAAACTACCAAGCTCGAATGCATGAAACAGTGGGCTGTTCGAGAATCA 3197
Query 3024 TCAGCTCCAATCACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAACTGATATACACAAGTTTC 3083
| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| | |||||
Sbjct 3198 TTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCGATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTTTT 3257
Query 3084 ATGGACGCTAC-GATATGTGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTCAA 3142
||||| || || | | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| | |||||
Sbjct 3258 ATGGATGCAACAGTT-TGTGTATTTAGCTCTGCAAATCTACGGCTGCGTTGCCGGGTCAA 3316
Query 3143 TCCCT-CTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAACGTCCATCCGCTGGTGATAG 3201
|||| |||| ||| | |||||| ||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |
Sbjct 3317 -CCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATTCAAACGTACATCCACTAGTGATTG 3375
Query 3202 CGGCTCATCCGCAAGAATCGAATATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGG-GTCCAT 3260
| || |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||
Sbjct 3376 CTGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCAGTTGGTCTCTCAGACGG-GGGAGTGCAC 3434
Query 3261 ATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACCGCCTGAAAATGGC 3320
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||
Sbjct 3435 ATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAGTCGCTCCACCGGCTGAGAACGGG 3494
Query 3321 TCAGCCAGCGCTGTTACGG-CTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCCTCA 3379
|| || |||| || || || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3495 TCGGCTAGCGGTGC-ACCAACTGCACCTTCCGTTGGAGCCTCTGCATCTGATCAGCCTCA 3553
Query 3380 GAGATGAT 3387
||||||||
Sbjct 3554 GAGATGAT 3561
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 169514100397
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5