BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg927518
Length=2534
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G79930.1 | Symbols: HSP91 | heat shock protein 91 | chr1:300... 4006 0.0
AT1G79920.1 | Symbols: | Heat shock protein 70 (Hsp 70) family... 3962 0.0
> AT1G79930.1 | Symbols: HSP91 | heat shock protein 91 | chr1:30063478-30067547
REVERSE LENGTH=2997
Length=2997
Score = 4006 bits (2169), Expect = 0.0
Identities = 2419/2541 (95%), Gaps = 11/2541 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAACTGCC 60
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 179 TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGCC 238
Query 61 TTGTTGCCGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG 120
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG 298
Query 121 AGACTCCCGCTATTGTCTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG 180
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 AGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG 358
Query 181 CTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAACGCTTAATTGGTCGCC 240
|||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 359 CTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTCGCC 418
Query 241 AGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAAG 300
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 419 AGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCGAAG 478
Query 301 GGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGAGAGCCTTTACCC 360
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 479 GCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTACCC 538
Query 361 CGACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA 420
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA 598
Query 421 ATGCAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGAA 480
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 599 ATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGTA 658
Query 481 GGGCTGTTCTCGATGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCCTGCGCTTGATCCACGAGA 540
|||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 659 GGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCACGAGA 718
Query 541 CAACAGCTACAGCTTTGGCATATGGAATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAATGAACAGC 600
| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 719 CTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGACCAGC 778
Query 601 TCAACGTCGCTTTCATTGACATTGGGCATGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTCA 660
|||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 779 TCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTTA 838
Query 661 AAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCGCTTGGGGGAAGGGACT 720
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 839 AAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGACT 898
Query 721 TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGACG 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 899 TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGACG 958
Query 781 TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAAGG 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct 959 TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAAAAGG 1018
Query 841 TTCTAAGCGCAAATCCTGTGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGACGAGAAAGATG 900
|||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1019 TTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAAGATG 1078
Query 901 TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTCTGGAGCGTG 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1079 TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCGTG 1138
Query 961 TTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACATA 1020
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1139 TAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTACATA 1198
Query 1021 TGGTCGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATAT-TAACTGAG 1079
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1199 TGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGAT-TCTAACTGAG 1257
Query 1080 TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATGT 1139
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1258 TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGATGT 1317
Query 1140 GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG 1377
Query 1200 AGCTTTCCTTTCTCAATATCGCTGGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGATGCTCAAATTGGA 1259
||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 1378 AGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAATGGA 1437
Query 1260 GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC 1497
Query 1320 AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTATGGTGATGTG 1379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1498 AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGATGTG 1557
Query 1380 AACGATTTGCAAGCACCTCCGAAAATCAGCACATACACGATTGGTACC-TTCCAGTCATC 1438
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1558 AACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGT-CCGTTCCAGTCATC 1616
Query 1439 AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCTC 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1617 AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTCTC 1676
Query 1499 AGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGATCA 1558
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1677 AGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAACA 1736
Query 1559 ATCAGTGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCTTC 1618
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1737 TTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCTTC 1796
Query 1619 TGGTGACTCTGATATTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCTGA 1678
||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1797 TGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACTGA 1856
Query 1679 CAATGGTGTTGCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCTGA 1738
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1857 CAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCTGA 1916
Query 1739 GGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGTGC 1798
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1917 GGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGTGC 1976
Query 1799 CTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA 1858
||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 CTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA 2036
Query 1859 CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT 1918
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT 2096
Query 1919 GCGAAACAAATTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGA-TGCTGAGAGGGAAGCAT 1977
||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 2097 GCGGAACAAACTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGACT-CGGAGAGGGAAGCAT 2155
Query 1978 TCCTGGCGAAGCTGCAGGAAGTGGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA 2037
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 TCCTGGCGAATCTGCAGGAAGTTGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA 2215
Query 2038 AAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTAC 2097
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2216 AAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGC 2275
Query 2098 GTTACAAAGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA 2157
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 GTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA 2335
Query 2158 GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTTTGACCACATTGAATTGGCTGAGA 2217
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2336 GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTTTGATCACATTGAATTGGCAGAGA 2395
Query 2218 AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGTTGCGGGAGAA-GAAGAAG 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||
Sbjct 2396 AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGCTGCGGG-GAAAGCAGCAG 2454
Query 2277 CAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC 2336
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 CAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC 2514
Query 2337 AAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGG---CT 2393
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2515 AAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTGGCT 2574
Query 2394 AAAGCAGAAGCACCACAAGCCAAGGGATGTGAGCCGGCAGATGAGGGCAAGAGTGAGGCA 2453
|||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2575 AAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGCGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCA 2634
Query 2454 GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCCGAAGGTAGTGCCTAA 2513
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 2635 GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAA 2694
Query 2514 ATGAATGACGAGAGCGAGATG 2534
|||||||||||||| ||||||
Sbjct 2695 ATGAATGACGAGAGAGAGATG 2715
> AT1G79920.1 | Symbols: | Heat shock protein 70 (Hsp 70) family
protein | chr1:30058632-30062744 REVERSE LENGTH=2964
Length=2964
Score = 3962 bits (2145), Expect = 0.0
Identities = 2413/2543 (95%), Gaps = 15/2543 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAATAACAC--AGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAACTGC 59
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 145 TGAAGAACACAAAGCCTAACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC 204
Query 60 CTTGTTGCCGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGT 119
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 205 CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCAAATCGC 264
Query 120 GAGACTCCCGCTATTGTCTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCT 179
|||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 265 GAGACTCCGGCTATCGTTTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT 324
Query 180 GCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAACGCTTAATTGGTCGC 239
||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 325 GCTTCTACCATGATGAACCCCAAAAACTCCATCTCACAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC 384
Query 240 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAA 299
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 385 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACTGAA 444
Query 300 GGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGAGAGCCTTTACC 359
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 445 GGCCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGATTAGAGCCTTTACC 504
Query 360 CCGACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTG 419
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 505 CCGACTCAGGTCATGGGTATGATGTTGTCCAACTTGAAAGGTATTGCTGAGAAGAATTTG 564
Query 420 AATGCAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGA 479
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 AATACAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGT 624
Query 480 AGGGCTGTTCTCGATGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCCTGCGCTTGATCCACGAG 539
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||
Sbjct 625 AGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCATGAG 684
Query 540 ACAACAGCTACAGCTTTGGCATATGGAATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAATGAACAG 599
|| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 685 ACTACAGCTACGGCTTTGGCATACGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCAG 744
Query 600 CTCAACGTCGCTTTCATTGACATTGGGCATGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTC 659
||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 CTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTC 804
Query 660 AAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCGCTTGGGGGAAGGGAC 719
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 805 AAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGAT 864
Query 720 TTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGAC 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 865 TTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGAC 924
Query 780 GTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAAG 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 925 GTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGCGCTACATGCGAGAAACTGAAAAAG 984
Query 840 GTTCTAAGCGCAAATCCTGTGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGAC-GAGAAAGA 898
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 985 GTTCTAAGCGCTAATCCTATGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGG-CTGAGAAAGA 1043
Query 899 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTCTGGAGCG 958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1044 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCG 1103
Query 959 TGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACA 1018
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1104 TGTTAAGAGGCCTTTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACTGTTGAAGATGTACA 1163
Query 1019 TATGGTCGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATAT-TAACTG 1077
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 1164 TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGAT-TCTAACTG 1222
Query 1078 AGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGAT 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 AGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGAT 1282
Query 1138 GTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATG 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283 GTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATG 1342
Query 1198 AGAGCTTTCCTTTCTCAATATCGCTGGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGATGCTCAAATTG 1257
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 1343 AGAGCTTCCCTTTCTCAATATCGCTTGCTTGGAAAGGAGCAGCGACTGATGCTCAAAATG 1402
Query 1258 GAGG-AGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1316
|||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1403 GAGGCA-CTGAGAACCAGCAGAGCACTATTGTTTTTCCGAAAGGAAATCCTATTCCTAGT 1461
Query 1317 GTCAAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTATGGTGAT 1376
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 1462 GTCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGAT 1521
Query 1377 GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCGAAAATCAGCACATACACGATTGGTACCTTCCAGTCA 1436
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1522 GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCTAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCA 1581
Query 1437 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC 1496
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTGAAAGTGAAAGTTAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC 1641
Query 1497 TCAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGT-TCCGGTCACAAAAGA 1555
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1642 TCTGTTGAATCAGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTATC-GGTCACAAAAGA 1700
Query 1556 TCAATCAGTGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGC 1615
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 TCAATCAGAGGAAACTGCTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGC 1760
Query 1616 TTCTGGTGACTCTGATATTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTC 1675
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1761 TTCTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAAGATACCAGTGATGCAACTGGTAC 1820
Query 1676 TGACAATGGTGTTGCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGC 1735
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1821 TGACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGC 1880
Query 1736 TGAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGG 1795
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1881 AGAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGG 1940
Query 1796 TGCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCA 1855
|||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1941 TGCCTTGAAAACTGTGGAAGTTGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTCTGCA 2000
Query 1856 AGACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGA 1915
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2001 AGACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGA 2060
Query 1916 TATGCGAAACAAATTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGA-TGCTGAGAGGGAAG 1974
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||
Sbjct 2061 TATGCGAAACAAACTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGACT-CGGAGAGGGAAG 2119
Query 1975 CATTCCTGGCGAAGCTGCAGGAAGTGGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGA 2034
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120 CATTCCTGGCGAATCTGCAGGAAGTTGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGA 2179
Query 2035 CCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAG 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180 CCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAG 2239
Query 2095 TACGTTACAAAGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTA 2154
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2240 TGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGCTACTGTATTA 2299
Query 2155 ACAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTTTGACCACATTGAATTGGCTG 2214
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2300 ACAGCTACAGAGAGGCAGCTGTGTCTAATGATCCCAAGTTTGATCACATTGAATTGGCAG 2359
Query 2215 AGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGTTGCGGGAGAAGAAGA 2274
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2360 AGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGCTGCGGGAGAAGCAGC 2419
Query 2275 AGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAA 2334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2420 AGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTAAAAA 2479
Query 2335 GCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGC-- 2392
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2480 GCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGCGG 2539
Query 2393 -TAAAGCAGAAGCACCACAAGCCAAGGGATGTGAGCCGGCAGATGAGGGCAAGAGTGAGG 2451
||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2540 CTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGCGGATGAGGGCAAGAGTGAGC 2599
Query 2452 CAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCCGAAGGTAGTGCCT 2511
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2600 CAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAAGCAATGGAGACTGAGAATCCCGCGGAAGGTAGTACCT 2659
Query 2512 AAATGAATGACGAGAGCGAGATG 2534
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2660 AAATGAATGACGAGAGCGAGATG 2682
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 125768526101
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5