BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg927617
Length=6593
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G01460.1 | Symbols: MBD9, ATMBD9 | methyl-CPG-binding domain... 1.008e+04 0.0
> AT3G01460.1 | Symbols: MBD9, ATMBD9 | methyl-CPG-binding domain
9 | chr3:173316-182454 FORWARD LENGTH=6947
Length=6947
Score = 1.008e+04 bits (5458), Expect = 0.0
Identities = 6218/6583 (94%), Gaps = 59/6583 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 22 ATGGAACTCACTGATTCTAC-AACCGAGCAACTCGGAGACACTCGGACCGCCGCTCTCAA 80
||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 1 ATGGAACCCACTGATTCTACTAA-CGAGCAACTCGGAGACACTAAGACCGCCGCTGTCAA 59
Query 81 GGAAGAGAATCGCTCCTTTCTCGGTATCGATCTCAACGAAATCCCTACCGGCCCTACTCT 140
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 60 GGAAGAGAGTCGCTCCTTTCTCGGCATCGATCTCAACGAAATCCCTACCGGCGCTACTCT 119
Query 141 CGGCGGTGGTTGCACCGGC-GGTCAGGACGACGACGGCGAATATGAACCTGTTGAAGTTG 199
|||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CGGCGGTGGTTGCACC-GCTGGTCAGGATGACGACGGCGAATATGAACCTGTTGAAGTTG 178
Query 200 TTAGGTCAATTCACGATAACCCGGACCCAGCGCCTGGAGCCCCTGCGGAGGTTCCTGAAC 259
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 179 TTAGGTCAATTCACGATAACCCGGACCCAGCCCCTGGAGCCCCTGCCGAGGTTCCTGAAC 238
Query 260 CGGATCGGGATGCTTCGTGCGGCGCGTGTGGAAGACCAGAGTCTATGGAGCTCGTTGTAG 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 239 CGGATCGGGATGCTTCGTGCGGCGCGTGTGGAAGACCTGAGTCTATAGAGCTCGTTGTAG 298
Query 320 TCTGCGATGCTTGTGAGCGAGGGTTTCATCTGTCTTGTGTTAACGATGGAGTTGAGGCGG 379
|||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 299 TCTGCGATGCCTGTGAGCGAGGCTTTCATATGTCTTGTGTCAACGATGGAGTTGAGGCGG 358
Query 380 CTCCTTCCGCCGATTGGATGTGCAGCGACTGT-GTTACTGGCGGCGAGAGGAGTAAACTG 438
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 359 CTCCTTCCGCCGATTGGATGTGCAGCGACTGTCG-TACTGGCGGCGAGAGGAGCAAACTG 417
Query 439 TGGCCGTTGGGGGTGAAGTCCAAGCTCATTCTGGATATGAACGCCTCGCCGCCCAGCGAT 498
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 418 TGGCCGTTGGGGGTTAAGTCCAAGCTCATTCTGGACATGAACGCCTCGCCGCCCAGTGAT 477
Query 499 GCAGAGGGATACGGAGGC-GAGGAGACGTCTGATTCGAGAAAGCATATGCTCGCCAGCAG 557
|| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 GCTGAGGGATACGGA-GCTGAGGAGACGTCTGATTCGAGAAAGCATATGCTCGCCAGCAG 536
Query 558 CTCTTGCATGGGAAACTCTTTTGATTATGCAATGATGCATTCAAGCTTCTCAAGTCCT-G 616
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 537 CTCTTGCATTGGAAACTCTTTTGATTATGCAATGATGCATTCAAGCTTCTCAAGT-CTCG 595
Query 617 GTAGAGGACTTGCTAGTCTCGAAGCTTCAGGGTTAATAG-CTCGTAATACCAAAATGAGT 675
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||
Sbjct 596 GTAGAGGACATGCTAGTCTCGAAGCTTCAGGGTTAAT-GTCTCGTAATACTAAAATGAGT 654
Query 676 ATGGATGCATTGGCTACACATAATCTAGGTTTTGGATTCCCATTAAGCCTGAACAATAGT 735
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 655 ATGGATGCATTGGGTTCACATAATCTAGGTTTTGGATTCCCATTAAACTTGAACAATAGT 714
Query 736 AGTTTGCCCATGAGATTTCCATCCTTGGATCCAAGTGAGTTGTTTCTGCAAAATCTCAGG 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 AGTTTGCCCATGAGATTTCCATCCTTGGATCCAAGTGAGTTGTTTCTGCAAAATCTCAGG 774
Query 796 CATTTCATATCTGAAAGGCATGGAGTATTGGAAGATGGTTGGCGTGTCGAATTTAAACAA 855
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||
Sbjct 775 CATTTCATATCTGAAAGGCATGGAGTATTGGAAGATGGCTGGCGTGTCGAATTCAGACAA 834
Query 856 CCTTTAAATGGTTATCAGTTATGTGCAGTGTATTGTGCTCCGAATGGAAAAACATTTAGT 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 CCTTTAAATGGTTATCAGTTATGTGCAGTGTATTGTGCTCCGAATGGAAAAACATTTAGT 894
Query 916 TCAATACAAGATGTTGCTTGTTATCTGGGCTTGGCAGTTAATGGTAACTACAGCTGTATG 975
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TCAATACAAGAAGTTGCTTGTTATCTGGGCTTGGCAATTAATGGTAACTACAGCTGTATG 954
Query 976 GATGCTGACATCAGGAATGAGAGTTCTCTTCTTCAAGAAAGATTGCATATGCCCAAGAGA 1035
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 955 GATGCTGAAATCAGGAATGAGAATTCTCTTCTTCAAGAAAGATTGCATACGCCCAAGAGA 1014
Query 1036 AGAAAGACATCAAGATGGCCAAACAATGGTTTCCCTGAGCAAAAGGGTAGTTCAGTCAGT 1095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1015 AGAAAGACATCAAGATGGCCAAACAATGGTTTCCCTGAGCAAAAGGGTAGTTCAGTGAGT 1074
Query 1096 GCCCAACTCAGGCGTTTTCCATTCAATGGTCAGACAATGTTTCCTTTTGTTGTTAAATCT 1155
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||
Sbjct 1075 GCTCAACTCAGGCGTTTTCCATTCAATGGTCAGACCATGTCTCCTTTCGCCGTTAAATCT 1134
Query 1156 GGTACTCATCTCCAGGCTGGTGATTCTCTTAACTCTGGAAATAATGGATGCGGTTGTGAG 1215
||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 GGTACTCATTTTCAGGCTGGTGGTTCTCTTAGCTCTGGAAATAATGGATGCGGTTGTGAG 1194
Query 1216 GAAGCTAATAATGGACT-TCCGATGCAGTATGAAGATTTCTTTGTTCTGTCGCTTGGACG 1274
|||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 GAAGCTAAGAATGGA-TGTCCGATGCAGTTTGAAGATTTCTTTGTTCTGTCGCTTGGACG 1253
Query 1275 AATTGACATAAGACAGTCTTACCATAATGTCAACGTAATTTATCCAATAGGATATAAGTC 1334
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 AATTGACATAAGACAGTCTTACCATAATGTCAACGTGATTTATCCAATAGGATATAAGTC 1313
Query 1335 CTGCTGGCATGATAAGATCACGGGGTCTCTATTTACATGTGAAGTATCTGATGGCACTTC 1394
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1314 CTGCTGGCATGACAAGATCACGGGGTCACTATTTACATGTGAAGTATCTGATGGCAATTC 1373
Query 1395 TGGTCCTGTTTTCAAGGTTACACGGTCACCATGTTCTAAATCATTTATTCCAGTTGGATC 1454
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1374 TGGTCCCATTTTCAAGGTTACACGGTCACCATGCTCGAAATCATTTATTCCAGCTGGATC 1433
Query 1455 AACTGTCTTCTCCTGCCCAAAGATTGATGAAATGGTGGAACAGAACATTGACAAACAAAG 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1434 AACTGTCTTCTCCTGCCCAAAGATTGATGAAATGGTGGAACAGAACAGTGACAAACTTAG 1493
Query 1515 TGATCGTAGAGACAGTACTCTAGAGCATGATGATGACGCTAATATTGAGACCCTTCTTTC 1574
| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 1494 TAATCGTAGAGATAGTACTCAAGAGCGTGATGATGACGCTAGTGTTGAGATCCTTCTTTC 1553
Query 1575 GGATCACAGCCCACCTCTTGGAGATGATATATTGTCTTGTTTACGTGAGAAGAATTTCTC 1634
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1554 GGAACACTGCCCACCTCTTGGAGATGATATATTGTCTTGTTTACGTGAGAAGAGTTTCTC 1613
Query 1635 CAAGACATTCAATTGCCTGCGCTCAGAGGTTGGTTCTTCTCAAGTAGAATCTGATAAAGT 1694
||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||
Sbjct 1614 CAAGACAGTCAATTCCCTGCGCTCAGAGGTTGATTCTTCTCGAGTAGATTTTGATAAAAA 1673
Query 1695 TTTATCCTATAATCAGGACCGTGGGGTTGAAATTGGTGAAATTGTTGTGGAAGAAGATTC 1754
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TTTATCCTATGATCAGGACCATGGGGTTGAAATTGGTGACATTGTTGTGGAAGAAGATTC 1733
Query 1755 ACTATCTGCTGCATGGAATAAGGTGTCTCAAAAACTTGTTGATGCATGCTCCATTGTAAT 1814
| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
Sbjct 1734 ATTGTCTGATGCATGGAAAAAAGTGTCTCAAAAACTTGTTGATGCATGTTCAATTGTACT 1793
Query 1815 GAAGCAGAAGGGTACCTTGAATTTCCTTTGCAAGCATGTTGACAGAGAAACAAGGGAAAT 1874
|||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1794 GAAGCAGAAGGGTACCCTGAATTTCCTATGTAAGCATGTTGACAGAGAAACAAGTGAAAT 1853
Query 1875 CAACTGGGATACCATGAATGAGAAAGACAATGTATTTTTATCGTTGTCTAGATTTTGCTG 1934
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1854 CAACTGGGATACCATGAATGAGAAAGACAATGTAATTTTATCGTTGTCAAAATTTTGCTG 1913
Query 1935 TACTTTGGGTCCTCACAGTGTTACGTGTGGTGAAAAGGATAAAAGTGAGA-TTGCAACTC 1993
| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |
Sbjct 1914 TTCGTTGGCTCCTTGCAGTGTCACGTGTGGTGAAAAGGATAAAAGCGA-ATTTGCAGCAG 1972
Query 1994 TAGTTGATGCTTTGTCAAGGTGGCTGGATCAAAACAGATTTGGACTTGATGCAGATTTTG 2053
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 TAGTTGATGCTTTGTCAAGGTGGCTCGATCAAAACAGATTTGGACTTGATGCAGATTTTG 2032
Query 2054 TACAGGAAATGATTGAACATATGCCTGGTGCCGAATCATGTACAAATTATAGGACTCTGA 2113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2033 TACAGGAAATGATTGAACATATGCCTGGTGCCGAATCATGTACGAATTATAGGACTCTGA 2092
Query 2114 AGAGTAGAAGTTCTTCTTCTGTTCCTGTAACTGTAGCGGAAGGAGCGCTAGTTGTCAAAC 2173
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2093 AGAGTAGAAGTTCTTCTTCTGTTCCTATAACTGTAGCGGAAGGAGCGCTAGTGGTCAAAC 2152
Query 2174 CAAAAGGTGGGGAAAATGTCAAGGAAGAAGTTTTCGGTGAGATTTCTCGGAAATCCAAGA 2233
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2153 CAAAAGGTGGGGAAAATGTCAAGGACGAAGTTTTCGGTGAGATTTCTCGGAAAGCCAAGA 2212
Query 2234 AGCCTAAACTAAATGGAGATTTTGGTGTCAGAAATCTACACCCTCCTCCTGGGAGGCCAA 2293
|||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 AGCCTAAACTAAATGGTGGTCATGGTGTCAGAAATCTACACCCTCCTCCTGGGAGGCCAA 2272
Query 2294 TGTGTTTGAGGCTTCCTCCTGGGCTTGTTGGTGACTTCCTTCAGGTATCTGAAGTGTTCT 2353
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 TGTGTTTGAGGCTCCCTCCTGGGCTTGTTGGTGACTTCCTTCAGGTATCTGAAGTGTTCT 2332
Query 2354 GGCGTTTCCATGAAATTTTGGGTTTTGAAGAGGCTTTCTCATCTGAGAAGCTTGAACAGG 2413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 2333 GGCGTTTCCATGAAATTTTGGGTTTTGAAGAGGCTTTCTCACCTGAAAACCTTGAACAGG 2392
Query 2414 AGCTTATCAATCCAGTGTTTGATGGTTTGTTTCTTGATAAACCTGGGAAAGATGATAAGA 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 AGCTTATCAATCCAGTGTTTGATGGTTTGTTTCTTGATAAACCTGGGAAAGATGATAAGA 2452
Query 2474 GAAGTGAGATGAACTTTACTAATAAGGATTGTTCCGGTACTGAAtttttttCTTTGTTCG 2533
|||||||||| ||||||||| ||||||||| | | | |||| || |||||||||||||||
Sbjct 2453 GAAGTGAGATTAACTTTACTGATAAGGATTCTACAGCTACTAAACTTTTTTCTTTGTTCG 2512
Query 2534 ATGAATCTCGCCAACCTTTTCCTGCTAAAAATACCTCTGCTTCTGTACTAAAGGAGACAA 2593
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2513 ATGAATCTCGCCAACCTTTTCCTGCAAAAAATACCTCTGCTTCTGAACTAAAGGAGAAAA 2572
Query 2594 AGGCAGAGGATTCTTCTGATTTTGCGATTTCATATTCCTCTCATGGGCCGTGTGTGGGTG 2653
|||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 2573 AGGCAGGGGATTCTTCTGATTTTAAGATTTCAGATTCCTCTCGTGGGTCGTGTGTGGGTG 2632
Query 2654 CACTTCTAACAAGGACTCACATTTCGCTTCTGCAAGTGCTAATATGTGAGCTGCAATCCA 2713
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 CACTTCTAACAAGGGCTCACATTTCGCTTCTGCAAGTGCTAATATGTGAGCTGCAATCCA 2692
Query 2714 AGGTAGCTGCATTTGTTGATCCAAACTTTGATTCTGGAGAGTCGAGATCCAGACGAGGAC 2773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2693 AGGTAGCTGCATTTGTTGATCCAAACTTTGATTCTGGCGAATCGAGATCCAGACGAGGAC 2752
Query 2774 GGAAAAAGGATGACAGTACACTTTCTGCTAAAAGAAACAAGCTGCATATGCTTCCTGTTA 2833
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 GAAAAAAGGATGACAGTACACTTTCTGCTAAAAGAAATAAGCTGCATATGCTTCCTGTTA 2812
Query 2834 ATGAGTTCACTTGGCCCGAATTGGCCCGTAGGTACATCTTGTCTCTTTTATCAATGGATG 2893
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2813 ATGAGTTCACTTGGCCTGAATTGGCCCGTAGGTACATCTTGTCTCTTTTATCCATGGATG 2872
Query 2894 GGAACCTCGAATCAGCAGAGATTTCTGCGCGTGAAAGTGGTAAGGTATTCCGTTGCTTAC 2953
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 GGAACCTCGAATCAGCAGAGATTGCTGCACGTGAAAGTGGTAAGGTATTCCGTTGCTTAC 2932
Query 2954 AAGGGGATGGTGGTTTGCTTTGCGGCTCGCTTACAGGAGTGGCTGGGATGGAAGCAGATT 3013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 AAGGGGATGGTGGTTTGCTTTGCGGCTCGCTTACAGGAGTGGCTGGGATGGAAGCAGATT 2992
Query 3014 CAATGTTACTTGCAGAGGCTATTAAGAAAATATCTGGTTCTTTGACAAGCGAAAATGATG 3073
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2993 CAATGTTACTTGCAGAGGCTATTAAGAAAATATCTGGTTCGTTGACAAGCGAAAATGATG 3052
Query 3074 TTCTTTCTGTGGAAGATGATGATTCCGACGGCCTTGATGCTACTGAGACAAACACTTGCA 3133
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053 TTCTTTCTGTGGAAGATGATGATTCCGATGGCCTTGATGCTACTGAGACAAACACTTGCA 3112
Query 3134 ATGGTGATATTCCAGAGTGGGCACAGGTTCTAGAACCTGTGAAAAAGCTTCCAACAAATG 3193
||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 GTGGTGATATTCCAGAGTGGGCTCAGGTTTTGGAACCTGTGAAAAAGCTTCCAACAAATG 3172
Query 3194 TTGGGACTAGAATCAGAAAGTGTGTCTATGAAGCTTTAGAGAGAAATCCACCAGAGTGGG 3253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 TTGGGACTAGAATCAGAAAGTGTGTCTATGAAGCTTTAGAGAGAAATCCACCAGAGTGGG 3232
Query 3254 CAAAGAAGATATTGGAGCATTCCATCAGTAAAGAAGTATATAAAGGCAATGCATCAGGAC 3313
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 CAAAGAAGATATTGGAGCATTCTATCAGTAAAGAAATATATAAAGGCAATGCATCAGGAC 3292
Query 3314 CAACAAAGAAAGCTGTCCTCTCATTGCTAGCGGATGTTCGAGGTGGAGATTTGGTGCAGA 3373
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3293 CAACAAAGAAAGCTGTCCTCTCATTGCTAGCGGATATTCGAGGTGGAGACTTGGTGCAGA 3352
Query 3374 GGTCTGTTAAAGGAACCAAAAAGCGAACATCTATAGGTGTATCTGATGTCATTATGAAGA 3433
||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3353 GGTCTATTAAAGGAACCAAAAAGCGGACATATATAAGTGTATCTGATGTCATTATGAAGA 3412
Query 3434 AATGCCGTGCTGTATTGCGTGGTGTTGCAGCCGCAGACGAAGATAAAGTCTTTTGCACTT 3493
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 3413 AATGCCGTGCTGTATTGCGTGGTGTTGCAGCTGCAGACGAGGATAAAGTCCTTTGCACTT 3472
Query 3494 TGCTGGGGCGAAAGTTGCTGAATTCCAGTGATAATGATGATGACGGGCTCCTGGGAACAC 3553
| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3473 TACTGGGAAGAAAGTTACTGAATTCCAGTGATAATGATGATGACGGGCTCCTGGGATCAC 3532
Query 3554 CTGCAATGGTTTCGCGTCCCTTGGACTTCAGAACTATTGATTTGAGGTTGGCTGCTGGTG 3613
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3533 CTGCAATGGTTTCGCGTCCCTTAGACTTCAGAACTATTGATTTGAGGTTGGCTGCTGGTG 3592
Query 3614 CATATGACGGATCAACTGAAGCTTTTCTTGAGGATGTTCTTGAGCTGTGGAGTAGTATAC 3673
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3593 CGTATGACGGATCAACTGAAGCTTTTCTTGAAGATGTTCTTGAGCTGTGGAGTAGTATAC 3652
Query 3674 GTGTTATGTATGCAGATCAGCCCGATTGTGTGGAACTGGTTGCAACATTGTCTGAAAAAT 3733
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3653 GTGTTATGTATGCAGATCAGCCCGATTGTGTGGACCTGGTTGCAACATTGTCTGAAAAAT 3712
Query 3734 TCAAGTCGTTATATGAGGCTGAGGTTCTACCACTCGTTCAGAAACTTATGGAGTACAGGA 3793
||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 3713 TCAAGTCGTTATACGAGGCTGAGGTTGTACCACTTGTTCAGAAACTTAAGGACTACAGGA 3772
Query 3794 AATTGGAATGCCTAAGTGCAGAGATGAAGAAAGAAATTAAGGACATAGTTGTTTCAGTAA 3853
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3773 AATTGGAATGCCTAAGTGCAGAGATGAAGAAGGAAATTAAGGACATAGTTGTTTCAGTAA 3832
Query 3854 ATAAGCTTCCCAAGGCCCCGTGGGATGAGGGGGTATGTAAAGTATGTGGTGTTGACAAAG 3913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3833 ATAAGCTTCCCAAGGCCCCGTGGGATGAGGGGGTATGTAAAGTATGTGGCGTTGACAAAG 3892
Query 3914 ATGATGACAGTGTTCTCTTGTGTGATACATGCGATGCTGAGTATCACACATATTGTTTAA 3973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3893 ATGATGACAGTGTTCTCTTGTGTGATACATGCGATGCTGAGTATCACACATATTGTTTAA 3952
Query 3974 ATCCACCTCTTATTCGAATTCCTGATGGAAATTGGTATTGTCCATCTTGTGTCATTGCCA 4033
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3953 ATCCACCTCTTATTAGAATTCCTGATGGAAATTGGTATTGTCCATCTTGTGTCATTGCCA 4012
Query 4034 AACGCATGGCTCAAGAGGCTTTGGAATCTTACAAACTAGTCAGGCGGCGGAAAGGTAGAA 4093
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4013 AGCGCATGGCTCAAGAGGCTTTGGAATCTTACAAACTAGTTAGGCGGCGGAAAGGTAGAA 4072
Query 4094 AGTATCAGGGGCAACTCACCCGAACTTCTATGGAAATGACTGCTCACCTGGCAGATGTGA 4153
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4073 AGTATCAGGGGGAACTCACCCGAGCTTCTATGGAACTGACTGCTCACCTGGCAGATGTGA 4132
Query 4154 TGGAAGAAAAGGACTACTGGGAGTTCAGTGCTGAGGAGAAAATCTTGCTGCTCAAGCTTC 4213
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 4133 TGGAAGAAAAGGACTACTGGGAGTTTAGTGCTGAGGAGAGAATCTTGCTGCTTAAGCTTC 4192
Query 4214 TATGCGATGAACTGCTTAGTTCATCTCTTGTCCATCAACACCTTGAGCAGTGTGCCGAAG 4273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4193 TATGCGATGAACTGCTTAGTTCATCTCTTGTCCATCAACACCTTGAGCAGTGTGCCGAAG 4252
Query 4274 CAATAATTGAAATGCAGCAGAAGTTACGCTCTCTTTCCTCAGAATGGAAAAATGCAAAAA 4333
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4253 CAATAATTGAAATGCAGCAGAAGTTACGCTCTCTTTCCTCAGAATGGAAAAACGCAAAAA 4312
Query 4334 TGCGCCAAGAATTCCTGACGGCTAAACTCGCAAAGGTTGAACCGAGTATTCTGAAGGAAG 4393
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4313 TGCGGCAAGAATTCCTGACGGCTAAACTGGCAAAGGTTGAACCGAGTATTCTGAAGGAAG 4372
Query 4394 TGGGTGAACCACATAATTCAGG-TCACTTTGCAGACCAAATGGGATGTGATCAACGACCA 4452
|||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 4373 TGGGCGAACCACATAATTCAAGCT-ACTTTGCAGACCAAATGGGATGTGATCCACAACCA 4431
Query 4453 CAGGAGGGCGTTGGAGACGGAGTTACTC---ATGATGA---TTCCTCTACTGCATATCTT 4506
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4432 CAGGAGGGCGTTGGAGACGGAGTTACTCGTGATGATGAGACTTCCTCTACTGCATATCTT 4491
Query 4507 AACAAGAATCAAGGTAAAGCTCCGCTTGAAACCGATTCTCAACCTGGAGAGTTTCAAGAT 4566
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || | |
Sbjct 4492 AACAAGAATCAAGGTAAATCTCCACTTGAAACCGATACTCAACCCGGAGAGTCGCATG-T 4550
Query 4567 TCTCAACCTGGAGAGTCGCATGTTAATTTCGAGAGCAAAATTTCCTCCCCAGAAACAAT- 4625
| || | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4551 T---AAT-T------TCG---GT-------GAGAGCAAAATTTCCTCCCCGGAAACAATA 4590
Query 4626 TACATCCCCTGGAAGGCATGAGAAACCTATAGCAGATACCTCTCCTCATGTAACGGATAA 4685
| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 4591 T-CATCCCCTGGGAGGCATGAGCTACCTATAGCAGATACCTCTCCTCTTGTAACAGATAA 4649
Query 4686 TCCGTCTTTTGAAAAAGATACCTCAGAGACCTTGCACAAGTCAGTTGGAAGGAATCATGA 4745
|| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4650 TCTGCCT---GAAAAAGATACCTCGGAGACCTTGCTTAAGTCAGTTGGAAGGAATCATGA 4706
Query 4746 AACACATTCACTAAATTCCAATGCAGTAGAATTCCCGACAGCTCATGATGCATCTTCTCA 4805
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4707 AACACATTCACCAAATTCCAATGCAGTAGAATTGCCGACAGCTCATGATGCATCTTCTCA 4766
Query 4806 GGCTTCCCAAGAGTTGCAGGCTTGTCTA-CAGGATTTGAATGCCACTAGTCATGAAATTC 4864
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 4767 GGCTTCCCAAGAGTTGCAGGCTTGTC-AGCAGGATTTGAGTGCCACTAGTAATGAAATTC 4825
Query 4865 AGAATCTGCAGCAATCAATTAGAAGCATAGAATCACAGCTTCTAAAGCAATCTATACGGA 4924
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4826 AGAATCTTCAGCAATCAATTAGAAGCATAGAATCACAGCTTCTAAAGCAATCTATACGGA 4885
Query 4925 GAGACTTTCTGGGAAACGATGCTAGTGGTCGTTTATATTGGGGTTGCTGCTTCCCAGACG 4984
|||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4886 GAGATTTTCTGGGAACCGATGCTAGTGGTCGGTTATATTGGGGTTGCTGCTTCCCAGATG 4945
Query 4985 AAAATCCTCGTATATTGGTTGATGGAAGCATATCTTTGCAGAAACCTGTTCAAGCCGATT 5044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4946 AAAATCCTCGTATATTGGTTGATGGAAGCATATCTTTGCAGAAACCTGTTCAAGCCGATT 5005
Query 5045 TGATGGGTTCAAAAGTCCCCTCTCCGTTTCTCCATGCCGTTGACCATGGAAGACTAAGGC 5104
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5006 TGATAGGTTCAAAAGTCCCCTCTCCGTTTCTCCATACCGTTGACCATGGAAGACTAAGGC 5065
Query 5105 TTTCACCCTGGACTTATTATGAAACCGAAACCGAGATCAGCGAGCTTGTCCAATGGCTTC 5164
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5066 TTTCACCCTGGACGTATTATGAAACTGAAACCGAGATCAGTGAGCTTGTCCAATGGCTTC 5125
Query 5165 ATGATGATGATCTGAAAGAAAGAGACCTGAGAGAGTCTATTTTGTGCTGGAAAAGGTTAC 5224
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5126 ATGATGATGATCTGAAAGAAAGAGACCTGAGAGAGTCTATTTTGTGGTGGAAAAGGTTAC 5185
Query 5225 GATTTGGGGACGTCCAAAAGGAAAAGAAACAAGCTCAGAATTTATCTGCTCCGATATTGG 5284
||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 5186 GATATGGAGACGTTCAAAAGGAAAAGAAACAAGCTCAGAATTTATCTGCTCCGGTATTTG 5245
Query 5285 CTAGGGGTCTTGAGACCAAGGCTGCCATGTCAATGGAGAAGAAATATGGTCCATGCATCA 5344
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5246 CTACGGGTCTTGAGACCAAGGCTGCCATGTCAATGGAGAAGAGATATGGTCCATGCATCA 5305
Query 5345 AACTAGAGACGGAAACCTTaaaaaaaCGGGGGAAGAAGACAAAGGTTTCAGAGCGAGAGA 5404
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5306 AACTGGAGATGGAAACCTTAAAAAAACGGGGGAAGAAGACAAAGGTTGCAGAGCGAGAGA 5365
Query 5405 AAGTGTGTAGATGCGAGTGCTTGGAATCCATTTTGCCATCCATGATTCACTGCCTCATAT 5464
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5366 AATTGTGTAGATGCGAATGCTTGGAATCCATTTTGCCATCTATGATTCACTGCCTCATAT 5425
Query 5465 GCCATAAAACATTCGCAAGTGATGATGAGTTTGAGGAGCACACTGAGAGTAAGTGTATTC 5524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5426 GCCATAAAACATTCGCAAGTGATGATGAGTTTGAGGATCACACTGAGAGTAAGTGTATTC 5485
Query 5525 CTTATTCATTAGCAACTGAAGAAAGCAAGGAAATCTCTGATTCTTCAAAAGCAAAAGAAA 5584
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5486 CTTATTCATTAGCAACTGAAGAAGGCAAGGACATCTCTGATTCTTCAAAAGCCAAAGAAA 5545
Query 5585 GTCTGAAATCTGATTATCTTAATGTAAAGTCTAGCGCCGGCAAAGCTGTAGGTGAAATAT 5644
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 5546 GTCTGAAATCCGATTATCTTAATGTAAAGTCTAGTGCCGGCAAAGATGTAGCTGAAATAT 5605
Query 5645 CCAATGTGTCTGAACTTGATTCTGGGTTGATAAGATATCAAGAAGAAGAATCTATTTCCC 5704
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5606 CCAATGTTTCTGAACTTGATTCTGGGTTGATAAGATATCAAGAAGAAGAATCTATTTCCC 5665
Query 5705 CATACCATTTTGAGGAGATCTGCTCCAAGTTTGTGACAAAGGATTCCAACAGAGATTTGG 5764
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5666 CATACCATTTTGAGGAGATCTGTTCCAAGTTTGTGACAAAGGATTGCAACAGAGATTTGG 5725
Query 5765 TTAAAGAAATTGGTCTGATCGGTTCAAATGGCATTCCAACATTTCTTCCAGCGTCATCTA 5824
||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5726 TTAAAGAGATCGGTCTGATCAGTTCAAATGGCATTCCAACATTTCTTCCATCGTCATCTA 5785
Query 5825 CTCACCATAACGACTCAGTGCTCATCAATGCCAA-TCCCAATAAGCTAGATGGTGGTGAT 5883
|||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 5786 CTCATCTTAACGACTCCGTGCTCATCTCTGCCAAATCC-AATAAGCCAGATGGTGGTGAT 5844
Query 5884 TCAGGGGACCAGGTCATTTTTGCTGGTCCTGAAACCAATGTTGAAGGCTTAAATTCTGAA 5943
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5845 TCAGGGGATCAGGTCATTTTTGCTGGTCCTGAAACCAATGTTGAAGGCTTAAATTCTGAA 5904
Query 5944 TCTAACTTGTCATTCGATGGATCTGTCACAGACAATCATGGCGGTCCACTGAATAAACTG 6003
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||
Sbjct 5905 TCTAACATGTCATTCGATAGATCTGTCACAGACAGTCACGGGGGTCCACTGGATAAACCA 5964
Query 6004 ACCGGACTGGGTTTTGGCTTCTCAGAGCAAAAGAATAAGAAATCTTCAGGTAGTGGGCTG 6063
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5965 AGTGGACTGGGTTTTGGCTTCTCAGAGCAAAAGAATAAGAAATCTTCAGGTAGTGGGTTG 6024
Query 6064 AAAAGCTGCTGTGTGGTTCCACAGGCTGCTTTGAAACGAATAACTGGCAAAGCTTTGCCG 6123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6025 AAAAGCTGCTGTGTGGTTCCACAGGCTGCTTTGAAACGAGTAACTGGCAAAGCTTTGCCG 6084
Query 6124 GTTTTCAGGTTCCTTAAAACCAACTTACTTGATATGGATGTGGCACTGCCTGAAGAAGCT 6183
| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6085 GGTTTCAGGTTCCTGAAAACCAACTTGCTTGATATGGATGTAGCACTGCCTGAAGAAGCT 6144
Query 6184 TTAAGACCATCGAAATCTCATCCAGACCGTAGAAGAGCTTGGCGTGTATTTGTGAAATCC 6243
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6145 TTAAGACCATCGAAATCACATCCAAACCGTAGAAGAGCTTGGCGTGTATTTGTTAAATC- 6203
Query 6244 G-CGCAAAGCATATACGAGTTGGTTCAGGCAACATTTGTGGTAGAAGATATGATTAAGAC 6302
| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6204 GTCGCAAAGTATATACGAGTTGGTTCAGGCAACAATTGTGGTAGAAGATATGATTAAGAC 6263
Query 6303 AGAGTACTTGAAAAATGAATGGTGGTACTGGTCTTCTCTTTCAGCGGCTGCTAAAATATC 6362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6264 AGAGTACTTGAAAAATGAATGGTGGTACTGGTCTTCTCTTTCAGCGGCTGCTAAAATCTC 6323
Query 6363 TACTCTCTCAGCGTTATCCGTTCGTATCTTCTCCCTCGATGCAGCTATCATTTATGATAA 6422
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 6324 GACTCTCTCAGCGTTATCCGTCCGTATCTTCTCCCTCGACGCTGCTATCATTTATGATAA 6383
Query 6423 ACCCATAACCCCATCAGATCATAACGATGAAACTAAGCCGATCATCAGCTTACCAGACCA 6482
||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6384 ACCCATAACTCCATCAAATCCTATCGATGAAACAAAGCCGATCATCAGCTTACCGGACCA 6443
Query 6483 GAAGTCACAGCCGGTTTCAGATTCACAAGAAAAAAGCAGCAGAGTAAACAGAAGATCTGG 6542
||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 6444 AAAGTCACAGCCGGTTTCGGATTCTCAAGAAAGAAGCAGCAGAGTTA---GAAGATCTGG 6500
Query 6543 TAAGAAGAGGAAAGAACCCGAGGGATCATAGTTATTTATTAAA 6585
||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 6501 CAAGAAAAGGAAAGAACCCGAGGGATCCTAGTTAATTATTAAA 6543
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 329125383665
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5