BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg927930
Length=2149
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G03940.1 | Symbols: | Protein kinase family protein | chr3:... 3760 0.0
AT5G18190.1 | Symbols: | Protein kinase family protein | chr5:... 2259 0.0
AT3G03930.1 | Symbols: | protein kinase-related | chr3:1011414... 856 0.0
> AT3G03940.1 | Symbols: | Protein kinase family protein | chr3:1014025-1019224
REVERSE LENGTH=2862
Length=2862
Score = 3760 bits (2036), Expect = 0.0
Identities = 2110/2146 (98%), Gaps = 3/2146 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 TTTTGCATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCAAGGAGATCGAGACGCCTTG 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 TTTTGCATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCAAGGAGATCGAGACGCCTTG 412
Query 64 ACGAGCAGCCTAACCCTCAGCTAGTTGAACAAGCAGAAAATATTGTACTTCCTCCTCAGA 123
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 413 ACGAGCAGCCTAACCCTCCGCTAGTTGAACAAGCAGAAAATATCGTACTTCCTCCTCAGA 472
Query 124 CTGCAACAAGGAGAAGAGGTGGTGGTAGAGGAAGGGGGAATGCTGCTTTAGCTAAAGCTG 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 473 CTGCAACAAGGAGAAGAGGTGGTGGTAGAGGAAGGGGGAATGCTGCTTTAGCTAAAGGTG 532
Query 184 CGCCACCTCCAAGACCAACTGCTGCCGGTAGGGGCAGGGGTATCAGGTTGACTGACTTAG 243
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 533 CGGCACCTCCAAGACCAACTGCTGCCGGTAGGGGCAGGGGTATCAGGTTGACAGACTTAG 592
Query 244 AGCCAGAACCTTGTGAGGTTCGTCCAGCTGCAGGTGCTGCTATAGGGGCCACTGAACCTG 303
|||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCCAGAACCTTGTGAGGTTCGTCCAGCTGCA-G-G-TGCTATAGGGGCCACTGAACCTG 649
Query 304 CCTTAAATCGAGTTGAAGGGGTCGCTGATAAGGATATTGCTGCGGAAGGCGGTAGCGCAG 363
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 CCTTAAATCGAGTTGAAGGGGTAGCTGATAAGGATATTGCTGCGGAAGGCGGTAGCGCAG 709
Query 364 AGAAAGTAGTAGGCATGGAAGAAGATTCCAGCATGGGTCCAGTCCCTGAAAGGGTACAAG 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 710 AGAAAGTAGTAGGCATGGAAGAAGATTCCAGCATGGGTCCAGTCCCTGAGAGGGTACAAG 769
Query 424 TTGGAAATTCTCCTGTTTATAAGACGGAGAGGAAACTTGGTAAGGGTGGCTTTGGTCAAG 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 770 TTGGAAATTCTCCTGTTTATAAGACGGAGAGGAAACTTGGTAAAGGTGGCTTTGGTCAAG 829
Query 484 TTTATGTTGGCAGAAGGGTGAGTGGGGGCAGTGATAGGATTGGAGCAGATGCAATTGAGG 543
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 TTTATGTTGGCAGAAGGGTGAGTGGTGGCAGTGATAGGATTGGAGCAGATGCAATTGAGG 889
Query 544 TAGCTCTGAAACTTGAACATCGAAATAGTAAAGGCTGTAATTTTGGCCCACCTTACGAGT 603
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 890 TAGCTCTAAAACTTGAACATCGCAATAGTAAAGGCTGTAACTTTGGCCCACCTTACGAGT 949
Query 604 GGCAAGTGTACAATACGCTCAATAGCTGTTATGGAATTCCTGCTGTACATCATAAGGGTC 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 GGCAAGTGTACAATACGCTCAATAGCTGTTATGGAATTCCTGCTGTACATCATAAGGGTC 1009
Query 664 GTCAAGGAGATTTTTACATTCTGGTCATGGACATGCTTGGGCCTAGCCTTTGGGATGTTT 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 GTCAAGGAGATTTTTACATTCTGGTCATGGACATGCTTGGGCCTAGCCTTTGGGATGTTT 1069
Query 724 GGAATTCTTTGGCTCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCATGCATTGCAGTGGAGGCGA 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070 GGAATTCTTTGGCTCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCATGCATTGCAGTGGAGGCGA 1129
Query 784 TATCTATTCTTGAAAAACTGCATATGAAGGGGTTTGTGCATGGAGATGTGAAACCAGAAA 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 TATCTATTCTTGAAAAACTGCATATGAAGGGGTTTGTGCATGGAGATGTGAAACCAGAAA 1189
Query 844 ACTTTTTACTTGGTCAGCCTGGAACAGCAGACGAGAAGAAACTATACCTTATCGATCTTG 903
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 ACTTTTTGCTTGGTCAGCCTGGAACAGCAGACGAGAAGAAACTATACCTTATCGATCTTG 1249
Query 904 GTCTAGCATCAAGATGGAAAGATTCACACTCTGGCCAGCATGTTGAATATGATCAAAGGC 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 GTCTAGCATCAAGATGGAAAGATTCACACTCTGGCCAGCATGTTGAATATGATCAAAGGC 1309
Query 964 CAGATGTATTTAGAGGAACAATAAGGTATGCAAGTTGTCATGCACATCTTGGTCGGACAG 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1310 CAGATGTATTTAGAGGAACAATAAGGTATGCAAGTTGCCATGCACATCTTGGTCGTACAG 1369
Query 1024 GAAGTCGGAGGGATGATCTGGAGTCATTGGCTTATACATTAATATTTTTGATGCGGGGAA 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1370 GAAGTCGGAGGGATGATCTGGAGTCATTGGCTTATACATTAATATTTCTGATGCGGGGAA 1429
Query 1084 GGTTGCCATGGCAAGGGTACCAGGGTGACAACAAGAGCTTTCTTGTTTGTAAGAAAAAGA 1143
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1430 GGTTGCCATGGCAAGGATACCAGGGTGATAACAAGAGCTTTCTTGTTTGCAAGAAAAAGA 1489
Query 1144 TGTCAACCTCTCCTGAATTGATGTGTTGTTTTTGTCCTCCCCCGTTTAAGCTGTTCCTCG 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 TGTCAACCTCTCCTGAATTGATGTGTTGTTTTTGTCCTCCCCCGTTTAAGCTGTTCCTCG 1549
Query 1204 AGGCAGTTACTAATATGAAGTTTGATGAGGAGCCCAACTATGCCAAGCTTATCTCGATTT 1263
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 AGGCAGTTACGAATATGAAGTTTGATGAGGAGCCCAACTATGCCAAGCTTATCTCGATTT 1609
Query 1264 TTGATACTCTTATCGAGCCATGTGCTATATCTAGACCAATTAGAATTGATGGGGCTCTTA 1323
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1610 TTGATACTCTTATCGAGCCATGTGCTATATCTAGACCAATTAGAATTGATGGGGCTCTAA 1669
Query 1324 AGGTTGGCCAAAAGCGAGGAAGATTGCTTATCAATTTGGAAGAGGATGAACAGCCAAGGA 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 AGGTTGGCCAAAAGCGAGGAAGATTGCTTATCAATTTGGAAGAGGATGAACAGCCAAGGA 1729
Query 1384 AGAAAATTAGAATCGGCAGTCCTGCCACACAGTGGATTTCAGTCTATAATGCACGCCGTC 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 AGAAAATTAGAATCGGCAGTCCTGCCACACAGTGGATTTCAGTCTATAATGCACGCCGTC 1789
Query 1444 CTATGAAACAGAGATATCATTACAATGTTGCAGACTCAAGACTTGCACAGCATGTTGAGA 1503
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 CTATGAAACAGAGATATCATTACAACGTTGCAGACTTAAGACTTGCACAGCATGTTGAGA 1849
Query 1504 AAGGTAACGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATCTCTGGGCCA 1563
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1850 AAGGTAATGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCATCAGCTAATCTCTGGGCCA 1909
Query 1564 TCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCGGTCTTCC 1623
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1910 TCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCAGTCTTCC 1969
Query 1624 TGCACAAGGACTGGATTATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTG 1683
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 TGCACAAGGACTGGATCATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTG 2029
Query 1684 GTGCAAATAATGGGAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAAT 1743
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 GTGCAAATAATGGAAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAAT 2089
Query 1744 CATACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTT 1803
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 CTTACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTT 2149
Query 1804 TTCATGTAACATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACT 1863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 TTCATGTAACATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACT 2209
Query 1864 CGGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTTTTGTACCCAAGTGAAGGAATACATC 1923
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 CAGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTCTTGTACCCAAGTGAAGGAATACATC 2269
Query 1924 GAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTC 1983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 GAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTC 2329
Query 1984 TTATATTGAGTATACCTAAACGAAAAATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGCACTT 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2330 TTATATTGAGTATACCTAAACGAAAAATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGGACTT 2389
Query 2044 CTGCCTTCCCAAGTACCCATGTCAAGGAGAAATGGGCAAAAAATCTGTACATTGCATCAA 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 CTGCCTTCCCAAGTACCCATGTCAAGGAGAAATGGGCGAAAAATCTGTACATTGCATCAA 2449
Query 2104 TATGCTATGGTCGGACAGTTTGCTGATGAAACATGGAGTATACTGT 2149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450 TATGCTATGGTCGGACAGTTTGCTGATGAAACATGGAGTATACTGT 2495
> AT5G18190.1 | Symbols: | Protein kinase family protein | chr5:6009967-6014689
REVERSE LENGTH=2674
Length=2674
Score = 2259 bits (1223), Expect = 0.0
Identities = 1848/2143 (86%), Gaps = 69/2143 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 TTTGCATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCAAGGAGATCGAGACGCCTTGA 64
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||
Sbjct 335 TTTGTATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGC-A--CG-T--AGA----TTGA 384
Query 65 CGAGCAGCCTAACCCTCAGCTAG-TTGAACAAGCAGAAAATATTGTACTTCCTCCTCAGA 123
|| || |||| ||||||| | | || || || || ||||||| |||||||||||||
Sbjct 385 -GA-CAACCTAGCCCTCAGGT-GACTGGTCAGGCGGATAATATTGAACTTCCTCCTCAGC 441
Query 124 CTGCAACAAGGAGAAGA---GGTGGTGGTAGAGGAAGGGGGAATGCTGCTTTAGCTAAAG 180
||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | || | ||||
Sbjct 442 CTGTAACAAGGAGAAGAGGCGGTGGTGGTAGAGGAA-GGGGAA-AC-GC-----C-AAAG 492
Query 181 CTGC-GCCACCTCCAAGACCAAC---TGCTGCCGGTAGGGG-CAGGGGTATCAGGTTGAC 235
||| | |||||||||||||| | || || ||||||||| | | || ||||| || |
Sbjct 493 GTGCTG-CACCTCCAAGACCAGCTGGTGGTGTCGGTAGGGGTC-GAGGCATCAGATT-AA 549
Query 236 T-GACTTAGAGCCAGAACCTTGTGAGGTTCGTCCAGCTGCAGGTGCTGCTATAGGGGCCA 294
| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||
Sbjct 550 TAGATTTAGAGGCAGAACCTTGTGAAGTTCGTCCA---GCA------G---TA--GG--- 592
Query 295 CTGAACCTGCCTTAAATCGAGTTGAAGGGGTCGCTGATAAGGATATTGCTGCGGAAGGCG 354
||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |
Sbjct 593 -TGAACCTGCTTTTAATCAAGTTGAAGCGGTAGCTGAAAAGGATATTGCTATGGAAGGTG 651
Query 355 GTAGCGCAGAGAAAGTAGTAGGCATGGAAGAAGATTCCAGCATGGGTCCAGTCCCTGAAA 414
||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||
Sbjct 652 GTAGCGCAGAGAAGGTAGTTGGTGTGGAAGAAGATTCTAGCACAGCTCCAGTCCCTGAAA 711
Query 415 GGGTACAAGTTGGAAATTCTCCTGTTTATAAGACGGAGAGGAAACTTGGTAAGGGTGGCT 474
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 712 GGGTACAAGTTGGAAATTCTCCTGTATATAAGACTGAGAGGAAACTCGGTAAAGGAGGCT 771
Query 475 TTGGTCAAGTTTATGTTGGCAGAAGGGTGAGTGGGGGCAGTGATAGGATTGGAGCAGATG 534
|||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||
Sbjct 772 TTGGTCAAGTTTTTGTTGGTAGAAGGGTGAGTGGTGGCAGCGATAGGATTGGGGCCGATG 831
Query 535 CAATTGAGGTAGCTCTGAAACTTGAACATCGAAATAGTAAAGGCTGTAATTTTGGCCCAC 594
|||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||
Sbjct 832 CAATTGAGGTGGCCCTGAAATTTGAGCATCGAAATAGCAAAGGATGCAATTTTGGTCCAC 891
Query 595 CTTACGAGTGGCAAGTGTACAATACGCTCAATAGCTGTTATGGAATTCCTGCTGTACATC 654
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| |||||||
Sbjct 892 CTTACGAGTGGCAAGTGTACAATACCCTCAATGGTTGCTATGGAGTTCCTGCGGTACATC 951
Query 655 ATAAGGGTCGTCAAGGAGATTTTTACATTCTGGTCATGGACATGCTTGGGCCTAGCCTTT 714
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |
Sbjct 952 ATAAGGGTCGTCAAGGAGATTTTTACATTCTTGTCATGGACATGCTTGGTCCGAGTCTCT 1011
Query 715 GGGATGTTTGGAATTCTTTGGCTCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCATGCATTGCAG 774
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1012 GGGATGTTTGGAATTCTTCGGGGCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCCTGCATTGCAG 1071
Query 775 TGGAGGCGATATCTATTCTTGAAAAACTGCATATGAAGGGGTTTGTGCATGGAGATGTGA 834
| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 1072 TTGAGTCCATATCTATTCTTGAGAAACTTCATATGAAAGGGTTTGTCCACGGAGATGTGA 1131
Query 835 AACCAGAAAACTTTTTACTTGGTCAGCCTGGAACAGCAGACGAGAAGAAACTATACCTTA 894
| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 1132 AGCCGGAAAACTTTTTACTCGGTCAACCAGGAACAGCAGATGAGAAAAAACTCTACCTTA 1191
Query 895 TCGATCTTGGTCTAGCATC-AAGATGGAAAGATTCACACTCTGGCCAGCATGTTGAATAT 953
||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1192 TCGATCTTGGTCTGGCATCTAA-ATGGAAAGATTCACACTCAGGCCAGCATGTTGAATAT 1250
Query 954 GATCAAAGGCCAGATGTATTTAGAGGAACAATAAGGTATGCAAGTTG-TCATGCACATCT 1012
|||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||
Sbjct 1251 GATCAAAGACCTGATGTGTTCAGGGGAACGATAAGGTATGCAAG-TGTTCATGCACACCT 1309
Query 1013 TGGTCGGACAGGAAGTCGGAGGGATGATCTGGAGTCATTGGCTTATACATTAATATTTT- 1071
||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1310 AGGTCGAACTGGAAGTAGGAGAGATGATCTGGAGTCGCTGGCTTATACTTTAAT-TTTTC 1368
Query 1072 TGATGCGGGGAAGGTTGCCATGGCAAGGGTACCAGGGTGACAACAAGAGCTTTCTTGTTT 1131
| || |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 TTTTGAAGGGAAGATTGCCATGGCAAGGATATCAGGGTGACAACAAGAGCTTTCTTGTTT 1428
Query 1132 GTAAGAAAAAGATGTCAACCTCTCCTGAATTGATGTGTTGTTTTTGTCCTCCCCCGTTTA 1191
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1429 GCAAGAAAAAGATGTCAACTTCTCCTGAATTGATGTGCTGTTTTTGTCCACCCCCGTTTA 1488
Query 1192 AGCTGTTCCTCGAGGCAGTTACTAATATGAAGTTTGATGAGGAGCCCAACTATGCCAAGC 1251
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 1489 AGCTCTTCCTCGAGGCAGTTACAAACATGAAGTTTGACGAAGAGCCCAACTATGCAAAGC 1548
Query 1252 TTATCTCGATTTTTGATACTCTTATCGAGCCATGTGCTA-TATCTAGACCAATTAGAATT 1310
|||| |||||||||||| ||||||| || | |||||| | ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1549 TTATTTCGATTTTTGATTCTCTTATTGAACAATGTGC-ACTATCTAGACCAATTAAAATT 1607
Query 1311 GATGGGGCTCTTAAGGTTGGCCAAAAGCGAGGAAGATTGCTTATCAATTTGGAAGAGGAT 1370
||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||
Sbjct 1608 GATGGTGCTCTTAAGGTTGGGCAAAAACGAGGAAGAATGCTTCTTAATTTGGATGAGGAT 1667
Query 1371 GAACAGCCAAGGAAGAAAATTAGAATCGGCAGTCCTGCCACACAGTGGATTTCAGTCTAT 1430
|||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1668 GAACAGCCAAAGAAGAAAATCAGAATTGGCAGTCCTGCTTGTCAGTGGATCTCAGTCTAT 1727
Query 1431 AATGCACGCCGTCCTATGAAACAGAGATATCATTACAATGTTGCAGACTCAAGACTTGCA 1490
||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1728 AATGCTCGTCGTCCCATGAAACAGAGATATCACTACAACGTTGCAGACTCAAG-GTTGCA 1786
Query 1491 -CAGCATGTTGAGAAAGGTAACGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCAGCAGC 1549
|||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1787 TCAGCATGTACAGAAGGGTAATGAGGATGGCCTTTTAATTAGCTGTGTAGCATCAGCAGC 1846
Query 1550 TAATCTCTGGGCCATCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACT 1609
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1847 TAATCTCTGGGCCCTCATAATGGATGCTGGGACTGGATTCACCTCTCAAGTTTATGAATT 1906
Query 1610 GTCCTCGGTCTTCCTGCACAAGGACTGGATTATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATAT 1669
||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 GTCAACTGTCTTCCTTCACAAGGACTGGATTATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATAT 1966
Query 1670 CAGTTCCATAGCTGGTGCAAATAATGGGAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAAC-TC 1728
|||||||||||||||| || |||| |||| ||| || ||||||||| | |||||||| ||
Sbjct 1967 CAGTTCCATAGCTGGTTCAGATAACGGGAACTCATTAGTTGTTATGTCAAAAGGAACGTC 2026
Query 1729 CTTATACCCAGCAATCATACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAA-A 1787
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |
Sbjct 2027 -TTATACTCAGCAATCTTACAAAGTCAGCGACTCTTTTCCTTTCAAGTGGATAAACAAGA 2085
Query 1788 AAGTGGAAAGAAGGTTTTCATGTAACATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTA 1847
|| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||
Sbjct 2086 AA-TGGAAAGAAGATTTCCATGTAACCTCCATGACAACTGCTGGGAATCGTTGGGGTGTG 2144
Query 1848 GTAATGTCCAGGAACTCGGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTTTTGTACCCA 1907
|||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2145 GTAATGTCGAGGAATTCTGGCTACTCTGATCAGGTCGTGGAGCTCGACTTTTTGTACCCA 2204
Query 1908 AGTGAAGGAATACATCGAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACA 1967
|| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2205 AGCGATGGAATACATAGGAGGTGGGAAAGTGGGTATAGGATAACATCAATGGCAGCAACT 2264
Query 1968 GCTGATCAAGCAGCTCTT-ATATTGAGTATACCTAAACGAAAAATAACCGATGAAACCCA 2026
|| |||||||||||| || ||||| || |||| ||||| ||||| | |||||||| ||
Sbjct 2265 GCAGATCAAGCAGCT-TTCATATTAAGCGTACCAAAACGTAAAATGATGGATGAAACTCA 2323
Query 2027 AGAGACTCTCCGCACTTCTGCCTTCCCAAGTACCCATGTCAAGGAGAAATGGGCAAAAAA 2086
||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2324 AGAGACTCTTCGCACCACCGCCTTTCCAAGCACTCATGTCAAGGAAAAATGGGCGAAAAA 2383
Query 2087 TCTGTACATTGCATCAATATGCTATGGTCGGACAGTTTGCTGA 2129
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2384 TCTGTACATTGCATCAATATGCTTTGGGAGGACAGTTTGCTGA 2426
> AT3G03930.1 | Symbols: | protein kinase-related | chr3:1011414-1012810
REVERSE LENGTH=888
Length=888
Score = 856 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 647/736 (88%), Gaps = 12/736 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1416 TGGATTTCAGTCTATAATGCACG-CCGTCCTATGAAACAGAGATATCATTACAATGTTGC 1474
|||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||
Sbjct 154 TGGATTTCAGTCTATACCAAACGTCC-TCCTATGAAACAGAGATTTCACCACAACATTGC 212
Query 1475 AGACTCAAGACTTG-CACAGCATGTTGAGAAAGGT-AACGAGGATGGCCTTTTCATAAGC 1532
| | ||||| ||| | || |||| || |||||| || | |||||||||||||||||||
Sbjct 213 AAATTCAAG-GTTGTCGCATCATGCAGAAAAAGGTAAAAG-GGATGGCCTTTTCATAAGC 270
Query 1533 TGTGTAGCATCAGCAGCTAATCTCTGGGCCATCA-TCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAG 1591
||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 271 TGTGTAGCATCAGAAGCTAATCTCTGGGCC-TTAGTCATGGATGCTGGAACTGGTTTCAC 329
Query 1592 TTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCGGTCTTCCTGCACAAGGACTGGATTATGGAACAATG 1651
||||||||||||| || | || || |||||| | |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 330 TTCTCAAGTTTATAAATTTTCTTCTACCTTCCTCCCCAAGGACTGGATTATGAAACAATG 389
Query 1652 GGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGTGCAAATAATGGGAGCTCGTTGGTTGT 1711
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 390 GGAGAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGTGCAAATAATGGGAGCTCATTGGTCGT 449
Query 1712 TATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAATCATACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATT 1771
|||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||
Sbjct 450 TATGTCAAAAGGAACTCGTTATATCCAGCAATCATACAAAACCGGTGACTCAATTCCATT 509
Query 1772 CAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTTTTCATGTAACATCCATGACCACCGCTGG 1831
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 510 AAAGTGGATGGATAAAAAGTGGAAAGAAGGTTTTCATGTAACATCCATGACCACGGGTGG 569
Query 1832 GAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACTCGGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAGCT 1891
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
Sbjct 570 GAGCCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACTCAGGCTTCTCTGAACAGGTGATGGAGGT 629
Query 1892 TGACTTTTTGTACCCAAGTGAAGGA-ATACATCGAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGATAA 1950
|||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 630 TGACTTTTTGAACCCAAGTGAA-GATATAAATCGAAGGTTGGAAAGTGGATACATGATAA 688
Query 1951 CATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTCTTATATTGAGTATACCTAAACGAAAAA 2010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 689 CATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTCTTATATTGAGTATACCTAGACGTAAAA 748
Query 2011 TAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGCACTTCTGCCTTCCCAAG-TACCCATGTCAAG 2069
|||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| || | || ||||||||
Sbjct 749 TAACCGATGAAATCCAAGAGACTTTACGCACTTCTTCCTTCCCTAGCT-CCTATGTCAAG 807
Query 2070 GAGAAATGGGCAAAAAATCTGTACATTGCATCAATATGCTATGGTCGGACAGTTTGCTGA 2129
|| ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |
Sbjct 808 GACAAATGGGGGAAAAATATGTTCATAACATCAATATGTTATGGTCGGACAGTTTGATAA 867
Query 2130 TGAAACATGGAGTATA 2145
|||||||||||| |||
Sbjct 868 TGAAACATGGAGCATA 883
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 106575757035
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5