BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg928168
Length=6220
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G05680.2 | Symbols: EMB2016 | embryo defective 2016 | chr3:1... 4098 0.0
> AT3G05680.2 | Symbols: EMB2016 | embryo defective 2016 | chr3:1660523-1672522
REVERSE LENGTH=6904
Length=6904
Score = 4098 bits (2219), Expect = 0.0
Identities = 2361/2432 (97%), Gaps = 0/2432 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 64 GGGCAACTTCACCTCCTTCATTTGCATTGGAAGTGTTCGTTCGATGTGAAGGAGAATCAA 123
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 GGGCAACTTCACCTCCTTCATTTGCGTTGGAAGTGTTCGTTCGATGTGAAGGAGAATCAA 389
Query 124 AATTTAAGCGACTTTGTAATCCTTTTCTTTACACTCCTTCAGCGCCCTACCCATTGGAAG 183
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 390 AGTTTAAGCGACTTTGTAATCCTTTTCTTTACACTCCTTCAGCGCCCTACCCTTTGGAAG 449
Query 184 TGGAGGCTGTTGTAACAAACCATCTGGTGGTTAGAGGCAGCTATCGAAGTTTGAGCTTGA 243
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 450 TGGAGGCTGTTGTAACAAACCATCTGGTGGTCAGAGGTAGCTATCGAAGTTTGAGCTTGA 509
Query 244 TCGTCTATGGGAACATCGTGAAAGATTTGGGGCAGTACAATATCATTCTTGAAGGTCGTT 303
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 TCGTCTATGGGAACATCGTCAAAGATTTGGGGCAGTACAATATCATTCTTGAAGGTCGTT 569
Query 304 CTGTAACTGATATTGTGAGTACCACTGAGGGTAATCTTGAGGACTTGCCATTGGTACTGC 363
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 570 CTGTAACTGATATTGTGAGTTCCACTGAGGGTAATCTTGAGGACTTGCCATTGGTATTGC 629
Query 364 ACTCAGTTAACAGAACAATAGAGGAATGTCTATCCTCTCTAGACATAGTATCTCTCCCCC 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 630 ACTCAGTTAACAGAACAATAGAGGAATGTCTATCCTCTCTAGACATAGTATCTCTCCCCC 689
Query 424 TCGCTACTGTAGATGTGCCTGTGGAAGTAAAGCGATTGTTGCAGCTGCTGCTAAAAGTCT 483
| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 690 TGGCTGCTGTAGATTTGCCGGTGGAAGTAAAGCGATTGTTGCAGCTGCTGCTAAAAATCT 749
Query 484 TTGATAAGCTAGCTACTAGTGATGTAGTAAATAAATTTGTGGATACGGTAGTGTCTGGGG 543
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 TTGATAAGCTAGCTACTAATGATGTAGTAAATAAATTTGTGGATACGGTAGTGTCTGGGG 809
Query 544 TCTCGTCTTATGTCACAGACAATGTAGATTTCTTTTTAAAGAATAAGAATTGTCCGGCCG 603
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 810 TCTCCTCGTATGTCACAGACAATGTAGATTTCTTTTTAAAGAATAAGAATTGTTCGGCTG 869
Query 604 TGGCCAGTTCCGTAGATTCTGGGTTATTTCATGATATAATTGACAAGGTTAAGAAAGAAA 663
|| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| |
Sbjct 870 TGACCAGTTCCCTAGATTCTGGGTTATTCCATGATATAGTTGACAGGGTTAAGGAAGATA 929
Query 664 TTCTTGATCTCAATGAAATTCAAGAATCAGATGTGGCACTAGGAGTGTTCAGTTTTCTTG 723
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||
Sbjct 930 TTCTTGATCTCAATGAAATTCAAGAATCAGATGTGGCACTTGGATTGTTCAGCTTTCTTG 989
Query 724 AATCAGAGACTTGTTTGGCTACTTCACAACAATTGGTTGATATGTTGAGCCCATATATTC 783
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 990 AATCAGAGACTTATTTGGCTACTTCCCAACAATTGGTTGTTATGTTGAGCCCATATATTC 1049
Query 784 AGTTTGAAAGAGATTCCTTATGTACTGTCCTTCCACAGCTTTCAAAGGGAAAAGCCACTC 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1050 AGTTTGAAAGAGATTCCTTATGTACTGTCCTTCCAAAACTTTCAAAGGGGAAAGCCACTC 1109
Query 844 TTTTGGGTTTAAGTTTGGCCTTCTTATTATGCTCTGGCCGAGAAGGCTGCCTCCAATTTG 903
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TTTTAGGTTTAAGTTTGGCCTTCTTATTATGCTCTGGCCGAGAAGGCTGCCTCCAATTTG 1169
Query 904 TCAATTCCGGTGGGATGGATCAACTTGTATATTTGTTTGGTCATGATGTTCAGAATTCTA 963
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1170 TCAATTCGGGTGGGATGGATCAACTTGTATATTTGTTTGGTCATGATGGTCAGAATTCTA 1229
Query 964 CCACCATTACATTGTTGTTGCTTGGAGTTGTTGAGCAGGCTACACGCCATTCAGTTGGGT 1023
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 CCACCATTACTTTGCTGTTGCTTGGAGTTGTTGAGCAGGCTACACGCCATTCAGTTGGGT 1289
Query 1024 GTGAAGGATTTTTAGGTTGGTGGCCTCGTGAGGATGGAAGTATCCCATCTGGGAAGAGTG 1083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1290 GTGAAGGATTTTTAGGTTGGTGGCCTCGTGAGGATGGAAGTATCCCATCTGGTAAGAGTG 1349
Query 1084 AGGGCTACTGTCTTCTGTTGAAATTACTTATGCAGAAACCATGCCATGAGATTGCCTCTC 1143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 AGGGCTACTGTCTTCTGTTGAAATTACTTATGCAGAAACCATGCCATGAGATTGCCTCTC 1409
Query 1144 TTGCAATTTATATTCTTCGTCGTTTGAGAATTTACGAGGTTATATCAAGATATGAGTTTG 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410 TTGCAATTTATATTCTTCGTCGTTTGAGAATTTACGAGGTTATATCAAGATATGAGTTTG 1469
Query 1204 CAGTGTTGTCAGCATTGGAAGGTCTCTCCAATTCTCATGCGGCTGCAACTCATAATCTGG 1263
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1470 CAGTGTTGTCAGCACTGGAAGGTCTCTCTAATTCTCATGGGGCTGCAACTCATAATCTGA 1529
Query 1264 ATATGCTATCTGATGCTAAGTCACAACTTCAAAAGCTCCAGAACCTGATGAAGTCACTTG 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1530 ATATGCTATCTGATGCTAAGTCACAACTTCAAAAGCTCCAGAACCTGATGAAGTCACTTG 1589
Query 1324 GATCAGTTGAAGATCCCTCACCATCAGCCTACGCAGAAAGAAGTTTGGTTTCTGATCATT 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590 GATCAGTTGAAGATCCCTCACCATCAGCCTACGCAGAAAGAAGTTTGGTTTCTGATCATT 1649
Query 1384 CGGAAGGCTGGTTGTCATACAAAGCCACGAGTAAACTAACTGCTTCATGGGCATGTCCGT 1443
| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |
Sbjct 1650 CTGAAGGGTGGTTGTCATACAAAGCCACAAGTAAACTAACTTCTTCATGGACATGTCCCT 1709
Query 1444 TTTATAGCTCTGGAATTGATTCGCACATGTTGGCACTTCTGACGGAGCGGGGTTTTCTTC 1503
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1710 TTTATAGCTCTGGAATTGATTCGCACATATTGGCACTTCTGAAGGAGCGGGGTTTTCTTC 1769
Query 1504 CTTTGTCAGCAGCACTTCTCTCAATGCCTGGATTGCATTCTAAAGTTGGAGACATTATGG 1563
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1770 CTTTGTCAGCAGCGCTTCTCTCAATGCCTGAATTGCATTCTAAAGTTGGAGATATTATGG 1829
Query 1564 ATGTCTTTACTGATATCGCAATGTTTATTGGCAACATAATTCTTTCATTGATGTTTTCAC 1623
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1830 ATGTCTTTACTGATATCGCAATGTTTATTGGGAACATAATTCTTTCATTTATGTTTTCAC 1889
Query 1624 GCACAGGATTGAGCTTTTTGCTACATCATCCTGAACTGACTGCTACAATAATACAATCTC 1683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1890 GCACAGGATTGAGCTTTTTGCTACATCATCCTGAACTGACTGCTACAATAATACAATCTC 1949
Query 1684 TGAAGGGATCCGTCGATCTGAACAAGGAGGAGTGTGTCCCCCTCCACTATGCTTCAATTT 1743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950 TGAAGGGATCCGTCGATCTGAACAAGGAGGAGTGTGTCCCCCTCCACTATGCTTCAATTT 2009
Query 1744 TAATATCCAAGGGTTTTACTTGCAGCTTACTGGAAATTGGAATAAATCTTGAGATGCATT 1803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2010 TAATATCCAAGGGTTTTACTTGCAGCTTACTGGAAATTGGAATAAATCTTGAGATGCATT 2069
Query 1804 TGAGGGTGGTGAGTGCGGTAGATCGTTTGCTCAAGTCGACACAACAAACAGAAGAATTTC 1863
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2070 TGAGGGTGGTGAGTGCAGTAGATCGTTTGCTCAAGTCGATACAGCAAACAGAAGAATTTC 2129
Query 1864 TATGGATTTTATGGGAGTTGCGTGATGTTTCTAGGTCTGATTGTGGGCGTGAAGCTTTAT 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130 TATGGATTTTATGGGAGTTGCGTGATGTTTCTAGGTCTGATTGTGGGCGTGAAGCTTTAT 2189
Query 1924 TGACGTTAGGTGTTTTTCCAGAGGCTTTAGTAGTCTTGATTGAAGCTTTGCATTCAGCCA 1983
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2190 TGACGTTAGGTGTTTTTCCAGAGGCTTTAGCAGTCTTGATTGAAGCTTTGCATTCAGCTA 2249
Query 1984 AGGATATGGAGCCAGCAGTTGAAAATAGTGGAATTTCACCGCTTAATCTAGCAATATGTC 2043
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 AGGATATGGAGCCGGCAGTTGAAAATAGTGGAATTTCACCGCTTAATCTAGCAATATGTC 2309
Query 2044 ACTCAGCTGCTGAGATTTTTGAGGTCATAGTCTCTGACTCAACTGCATCATGCTTGCATG 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2310 ACTCAGCTGCTGAGATTTTTGAGGTCATAGTCTCTGACTCAACTGCATCATGCTTGCATG 2369
Query 2104 CTTGGATTGAACATGCCCCAGTCCTTCATAAGGCCTTGCATACTTTGTCACCGGGTGGTT 2163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2370 CTTGGATTGAACATGCCCCAGTCCTTCATAAGGCCTTGCATACTTTGTCACCGGGTGGTT 2429
Query 2164 CTAATCGAAAAGATGCTCCTTCACGATTACTTAAATGGATTGATGCGGGTGTGGTTTATC 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2430 CTAATCGAAAAGATGCTCCTTCACGATTACTTAAATGGATTGATGCGGGTGTGGTTTATC 2489
Query 2224 ACAAGCATGGTGTAGTTGGCCTTTTACGTTATGCTGCTGTCTTGGCTTCTGGAGGGGACG 2283
|||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2490 ACAAACATGGCGTAGGTGGCCTTTTACGTTATGCTGCTGTCTTGGCTTCTGGAGGGGACG 2549
Query 2284 CCCAATTATCATCATCAAGCATCCTTGCACTGGATTTAACACAGGCTGAGAATGGTGCCG 2343
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2550 CCCAATTATCATCATCAAGCATCCTTGCACTCGATTTAACACCGGCTGAGAATGGTGCTG 2609
Query 2344 GAGAATCAACAAATGTCTCTGAGATGAACGTCCTCGATAATCTTGGAAAAGTTATCTTTG 2403
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2610 GAGAATCAACAAATGTCTCTGAGATGAACGTCCTAGATAATCTTGGAAAAGTTATCTTTG 2669
Query 2404 AGAAATCTTTCGAAGGTGTTAACCTTTCTGATTCATCAATTTCACAGTTGACAACAGCAC 2463
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2670 AGAAATCTTTTGAAGGTGTTAACCTTTCTGATTCATCAATTTCACAGTTGACAACAGCAC 2729
Query 2464 TTCGAATTTTAGCGCTGATTTCAGATAATTCA 2495
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2730 TTCGAATTTTAGCGCTGATTTCAGATAATTCA 2761
Score = 3616 bits (1958), Expect = 0.0
Identities = 2191/2303 (95%), Gaps = 18/2303 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3924 AAGGTTGCAGGACTAAAATCCCTCTTTGGCCTTCCAAGTGAGTTTAGTGGTACAGACACT 3983
|||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4355 AAGGTTGCAGCACTAAAATCTCTTTTTGGCCTTCCAAGTGAGTTTAGTGGTACAGACACT 4414
Query 3984 TTTAGAGAGGAAAATATTGGTTTTATTGAACAAATGGTGACATTGTTGAGTTCAACGACT 4043
|||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 4415 TTTAGAGAGGAAAACATTGGTTTGATTGAACAGATGGTGACACTGTTGAGTTCAATGACT 4474
Query 4044 TCTGGATCTGATAGTTCCGAAACAGCTGAGATGAAGCCCTATTTGCATGAGGCATCTCGG 4103
|| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4475 TCGGGGTCTGATAGTTCCGCAACAGCTGAGATGAAACCCTATTTGCATGAGGCATCTCAG 4534
Query 4104 TCGTTGCTGTCGTTGCTAAAAGATGGGAATATTGATGATATTATCTCCTGCAAAGGTGTT 4163
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4535 TCGTTGCTGTCGTTGCTAAAAGACGGGAATATTGATGATATTATCTCCTGCAAAGGTGTT 4594
Query 4164 CTTGTTTCTCCTGGGAATTTTGATATGGATGATTTTGACTTT-GA-AAACATTGAGGACG 4221
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| || |
Sbjct 4595 TTTGTTTCTCCTGGGAATCTTGATATGGATGA-TTTG-GTTTCTAGAAACATTGAAGATG 4652
Query 4222 ATCTCTATCAAAGAGGACTTGAAGACAAGTTCTGGTGGGAATGTCCAGAAACATTACCTG 4281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4653 ATCTCTATCAAAGAGGACTTGAAGACAAGTTCTGGTGGGAATGTCCAGAAACATTACCTG 4712
Query 4282 AGCGTCTGCCCCAGTCATCTCTCCCTGCGAAAAGGAAACTACCAACTTTGGAGAGCTCTA 4341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4713 AGCGTCTGCCCCAGTCATCTCTCCCTGCGAAAAGGAAACTACCAACTTTGGAGAGCTCTA 4772
Query 4342 GCAGGCGTGCTAAAGGCGAAAACTCTTCTGTTGACATACCGACCCAAAATTCAGTTCACC 4401
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
Sbjct 4773 GCAGGCGTGCTAAAGGCGAAAACTCTTCTGTTGACATACCTACCCAAAATTCAATTCAAC 4832
Query 4402 GGGCG-CTGGGTTCTTTATCCCTTCCTCCTGCTCCCACACGTAGAGATACCTTTAGGCAG 4460
||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4833 GGG-GAATGGGTTCTGTATCCCTTCCTCCTGCTCCTACACGTAGAGATGCCTTTAGGCAG 4891
Query 4461 CGCAAGCCGAATACCAGCAGGCCTCCCTCTATGCATGTAGATGATTATGTTGCTAGGGAA 4520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4892 CGCAAGCCGAATACCAGCAGGCCTCCCTCTATGCATGTAGATGATTATGTTGCTAGGGAA 4951
Query 4521 AGGAGTGTTGATACAGCTGGTAATTCTAATGCAATAACCATTTCACGAGCAGGATCTAGC 4580
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4952 AGAAGTGTTGATACAGCTGGTAATTCTAATGCAATAACCATTTCACGAGCAGGATCTAGC 5011
Query 4581 AGTGGTAGACCTCCATCTATTCATGTTGATGAGTTTATGGCCAGACAGAGAGAACGAGGC 4640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5012 AGTGGTAGACCTCCATCTATTCATGTTGATGAGTTTATGGCCAGACAGAGAGAACGAGGC 5071
Query 4641 CAAAATCCCTCCACCATTGTGGTTGGAGAGGCTGTTGTGCAAGTGAAAAATCCTACTCCT 4700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5072 CAAAATCCCTCCACCATTGTGGTTGGAGAGGCTGTTGTGCAAGTGAAAAATCCTACTCCT 5131
Query 4701 GCTAGAGATTCTGAAAAAGTTGCAGGTAAACCTAAACAATTCAAAGCCGATCCTGATGAT 4760
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5132 GCTAGAGATACTGAAAAAGTTGCAGGTAAACCTAAACAATTCAAAGCCGATCCTGATGAT 5191
Query 4761 GATCTACAAGGAATAGATATAGTGTTTGATGGTGAGGAGTGTGAAGGACCTGATGACAAG 4820
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5192 GATCTACAAGGAATAGATATAGTTTTTGATGGTGAGGAATGTGAAGGACCTGATGACAAG 5251
Query 4821 TTGCCCTTTCTTCAGCCAGATGAGAACCTTATGCAGCCTGCTCCTGTCATGGTTGAACAA 4880
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5252 TTGCCCTTTCTTCAGCCCGATGAGAACCTTATGCAGCCTGCTCCTGTCATGGTTGAACAA 5311
Query 4881 AACTCTCCTCACTCCATTGTTGAAGAAACCGAGAGTGATGCAAATGGAAGTAGTCAATTC 4940
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5312 AACTCTCCTCACTCTATTGTTGAAGAAACTGAGAGTGATGCAAATGGAAGTAGTCAATTC 5371
Query 4941 TCTCACATGGGCACACCAGTGGCATCTAATATTGACGAAAACG-TCCAGAGCGAATTTTC 4999
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||
Sbjct 5372 TCTCACATGGGCACACCAGTGGCATCTAATGTTGACGAAAACGCTC-AGAGTGAATTTTC 5430
Query 5000 ATCAAGGATTTCAGTTTCACGCCCTGATATGTCGTTGATTCGGGAACCAAGCATTTCTTC 5059
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5431 ATCAAGGATTTCAGTTTCACGCCCTGAGATGTCGTTGATTCGGGAACCAAGCATTTCTTC 5490
Query 5060 AGACAGAAAATTTGTTGAGCAAGCAGACGAATCAAAGAAAATGGCCCCTCTAAAGAGTGC 5119
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5491 AGACAGAAAATTTGTTGAGCAAGCAGACGAAGCAAAGAAAATGGCCCCTCTAAAGAGTGC 5550
Query 5120 CGGCATATCTGAATCCGTGTTTGTACCTGCTTA-CAACATGCCAGGATCTTCAGGACAAA 5178
||||||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5551 CGGCATATCTGAATCTGGGTTTATACCTGCTTATCA-CATGCCAGGATCTTCAGGACAAA 5609
Query 5179 ATTTGATTGATCCTAGAGTGGGTCCTCAGGGCTTCTATTCAAAGAGTAGTCAGCAACACA 5238
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 5610 ATTCAATTGATCCTAGAGTGGGTCCTCAGGGTTTCTATTCAAAGAGTGGTCAGCAACATA 5669
Query 5239 CGGGCCATATTCATGGTGGATTCAGTGGTCGGGGGGTATATGAACAGAAAGTGATGCCAA 5298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5670 CGGGCCATATTCATGGTGGATTCAGTGGTCGGGGGGTTTATGAACAGAAAGTGATGCCAA 5729
Query 5299 ACCAGCCTCCTTTACCCTTAGTGCCACCTCCATCAGTCTCACCTGTGATACCACATTCCT 5358
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5730 ACCAACCTCCTTTACCCTTAGTGCCACCTCCATCAGTCTCACCTGTGATACCACATTCTT 5789
Query 5359 CTGATTCTCACTCTAATCAATCCTCCCCGTTTATTAGTCATGGAACACAATCTTCAGGAG 5418
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5790 CTGATTCTCTTTCTAATCAATCCTCCCCGTTTATTAGTCATGGAACACAATCTTCAGGAG 5849
Query 5419 GACCCATCCGGCTTACGCCACCCCTCCCTTCAGCAATGCCCCAGTACTCATCTAACCCAT 5478
|||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 5850 GACCCACCCGGCTTATGCCACCGCTCCCTTCAGCAATTCCTCAGTACTCATCTAACCCAT 5909
Query 5479 ATGCCTCGTTACCACCAAGGACATCTACAACTCAATCTTTTGGATACAGCCAGGCCGGCG 5538
|||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||
Sbjct 5910 ATGCATCTTTACCACCAAGGACATCTACAGTTCAATCTTTTGGATACAACCACGCAGGCG 5969
Query 5539 TAGGTACCACTGAACAACAACAGAGTGGGCCAGTCATTGATCATCAGTCTGGCAATCTAT 5598
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5970 TAGGTACCACTGAACAACAACAGAGTGGCCCAACCATTGATCATCAGTCTGGCAATCTAT 6029
Query 5599 CTGTTTCAGGTACCGGAATGACCTCTTACCCTCCCC-ACACTTTAATGTCAGCCCATAAT 5657
||||| | |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||
Sbjct 6030 CTGTT--A----CCGGAATGACGTCTTACCCTCCCCCAAA-TTTAATGCCATCCCATAAT 6082
Query 5658 TTTAGCAGGCCATCATCTCTCCCTGTGCCATTCTATGCAAATCCTTCGCATCAAGGAGGT 5717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6083 TTTAGCAGGCCATCATCTCTCCCTGTGCCATTCTATGGAAATCCTTCGCATCAAGGAGGT 6142
Query 5718 GATAAGCCGCAAACTATGTTGTCGGTTCCCTCCATCCCTCAATCACTCAATCCACAGTCC 5777
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6143 GATAAGCCGCAAACTATGTTGTTGGTTCCTTCCATTCCTCAATCACTCAATACACAGTCC 6202
Query 5778 ATCCCTCAGCTGCAATCGATGCAGCTTTCACAGTTACAACGCCCTATGCAGCCTCCTCAG 5837
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6203 ATCCCTCAGCTGCCATCGATGCAGCTTTCACAATTACAACGCCCTATGCAGCCTCCTCAG 6262
Query 5838 CATGTTAGACCACCCATACAGATATCTCAACCATCAGAGCAAGGAGTATCAATGCAAAAC 5897
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6263 CACGTTAGACCACCCATACAGATATCTCAACCATCAGAGCAAGGAGTATCAATGCAAAAC 6322
Query 5898 CCATTTCAGATTCCAATGCATCAAATGCAGATGATGCAACAGACGCAAGTCCAGCCGTAC 5957
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6323 CCATTTCAGATTCCAATGCATCAGATGCAGCTGATGCAACAGACGCAAGTCCAGCCTTAC 6382
Query 5958 TATCACACTCCTCAACAGCAAGATCTCTCTCAGGTGCAGCAACAGCCACAGCATCATGCT 6017
|||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 6383 TATCACCCTCCTCAACAACAAGAGATCTCCCAGGTGCAGCAACAGCAACAGCATCATGCT 6442
Query 6018 GTTCAAGGTCAGCAAGGAGCTGGGACTTCTCAGCAACAAGAATCTGGAATGTCATTACAT 6077
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6443 GTTCAAGGTCAGCAAGGAGCTGGGACTTCCCAGCAACAAGAATCTGGAATGTCATTACAT 6502
Query 6078 GATTACTTCAAGTCTCCAGAAGCCATTCAGTCTCTATTAAGTGACCGTGACAAGCTGTGT 6137
|||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6503 GATTACTTCAAGTCCCCTGAAGCCATTCAGGCTCTATTAAGTGACCGTGACAAGCTGTGT 6562
Query 6138 CAGCTTCTGGAACAACATCCAAAGTTAATGCAGATGCTTCAGGAAAAACTTGGGCAGCTA 6197
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6563 CAGCTACTGGAACAACATCCAAAGTTAATGCAGATGCTTCAGGAAAAACTTGGGCAGCTA 6622
Query 6198 TGAGGAGAGAGAGACTTTTCAGC 6220
|||| |||||||||||| |||||
Sbjct 6623 TGAGAAGAGAGAGACTTGTCAGC 6645
Score = 2191 bits (1186), Expect = 0.0
Identities = 1264/1302 (97%), Gaps = 4/1302 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2606 GGGAACTAAGGAGCAGTATAGAAACACCAAACTGATGAAGGCACTCCTAAGGCTACATCG 2665
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 GGGAACTAAGGAGCAGTACAGAAACACCAAATTGATGAAGGCACTCCTAAGGCTACATCG 3054
Query 2666 GGAAGTCAGCCCGAAGCTAGCTGCTTGTGCAGCTGACTTGTCCTCCCATTATCCGGACTC 2725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3055 GGAAGTCAGCCCGAAGCTAGCTGCTTGTGCAGCTGACTTGTCCTCCCATTATCCAGACTC 3114
Query 2726 TGCTCTTGGCTTTGGAGCAGTGTGCCACCTCATTGTGTCCGCCCTTGTCTGCTGGCCAGT 2785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 TGCTCTTGGCTTTGGAGCAGTGTGCCACCTCATTGTGTCCGCCCTTGTCTGCTGGCCAGT 3174
Query 2786 TTATGGATGGATTCCTGGACTATTCCACACTCTTCTTTCGGGTGTCCAGACGTCCTCTGT 2845
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 TTATGGATGGATTCCTGGGCTATTCCACACTCTTCTTTCGGGTGTCCAGACGTCCTCTGT 3234
Query 2846 TCCTGCCTTGGGTCCAAAGGAGACCTGTAGTTTCCTCTGCATTCTAACCGATATTCTCCC 2905
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3235 TCCTGCCTTGGGTCCAAAGGAGACCTGTAGCTTCCTCTGCATTCTAAGCGATATTCTCCC 3294
Query 2906 TGAAGAAGGAGTCTGGTTTTGGAAGAGTGGCATGCCCTTATTAAGTGGTCTCAGAAAGTT 2965
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3295 CGAAGAAGGAGTCTGGTTTTGGAAGAGTGGCATGCCCTTATTAAGTGGTCTAAGAAAGTT 3354
Query 2966 GGCGGTTGGGACATTGATGGGTCCACAGAAGGAGAAACAGATCAACTGGTATCTGGAGGC 3025
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3355 GGCGGTTGGGACATTGATGGGTCCACAGAAGGAGAAACAGATCAACTGGTATCTGGAGCC 3414
Query 3026 TGGTCCTCTTGAAAAGCTGATAAACCATTTGACACCTAATCTTGAAAAGATTGCAAAGAT 3085
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3415 TGGTCCACTTGAAAAGCTGATAAACCATTTGACACCTAATCTTGACAAGATTGCAAAGAT 3474
Query 3086 TATCCAACATCATGCAGTATCTGCATTGGTGGTCATTCAGGATATGCTTCGGGTTTTCAT 3145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 TATCCAACATCATGCAGTATCTGCATTGGTGGTCATTCAGGATATGCTTCGGGTTTTCAT 3534
Query 3146 AGTTCGTATTGCATGTCAAAGGGTTGAGCATGCTTCTATCCTTCTGAGGCCCATATTTTC 3205
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3535 TGTTCGTATTGCATGTCAAAGGGTTGAACATGCTTCTATCCTTCTGAGGCCCATATTTTC 3594
Query 3206 ATCTATCAGAGATGGTATTTTGGATCAGTCATCAACAAGAGACACTGAAGCTTATATGGT 3265
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3595 ATCTATCAGAGATGGAATTTTGGATCAGTCATCAACAAGAGACACTGAAGCTTATATGGT 3654
Query 3266 CTACAGATATCTTAATTTTCTGGCTAGTTTATTAGAGCACCCGCATGCTAAGGGATTACT 3325
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 CTACCGATATCTTAATTTTCTGGCTAGTTTATTAGAGCATCCGCATGCTAAGGGATTACT 3714
Query 3326 CTTAGAGGAGGGTATTGTTCAACTGCTTGTGGAAGTTCTGGAAAGATGTTATGATGCCAC 3385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 GTTAGAGGAGGGTATTGTTCAACTGCTTGTGGAAGTTCTGGAAAGATGTTATGATGCCAC 3774
Query 3386 TTATCCAAGTGAAAACAGGGTTCTAGAGTATGGAATTGTGTCCGAGTCTAGTGTGATTCA 3445
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3775 TTATCCAAGTGAAAACAGGGTTCTAGAGTATGGAATTGTGTCCGCGTCTAGTGTGATTCA 3834
Query 3446 GTGGTGTATTCCAGCTTTCAGATCGATCTCACTGCTATGTGATTCACAAGTGCCTCTCTT 3505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3835 GTGGTGTATTCCAGCTTTCAGATCGATCTCACTGCTATGCGATTCACAAGTGCCTCTCTT 3894
Query 3506 GTGCTTTCAGAAGAAAGAGCTATTGGCCAGTTTGAGTGCAAAAGATTGTGCATTGAT-TT 3564
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3895 GTGCTTTCAGAAAAAAGAGCTATTGGCCAGTCTGAGTGCAAAAGATTGTGCATTGATATT 3954
Query 3565 TACCCTTTGTGCTGAAGTTCTGCCAGGTCTTGCCTGTTGGCAATGAGCTATTATCTTGTC 3624
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3955 T-CCCTTTGTGCTGAAGTTCTGCCAGGTGTTGCCTGTTGGCAATGAGCTATTATCTTGTC 4013
Query 3625 TCGGCGCTTTCAAAGACCTGATCTCATGTGGTGAAGGTCAAGATGGTCTGGTTTCACTTT 3684
| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4014 TTGGCGCTTTCAAAGACCTGAGCTCATGTGGTGAAGGTCAAGATGGTCTGGTTTCACTTT 4073
Query 3685 TGTTTCAAT-TGCTTTCTGGTGCCGAAGAACCTGTATCTGAAAGGTGGTGTGACACTCAT 3743
||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4074 TGTTTCA-TCTGTTTTCTGGTACCGAAGAATCTGTATCTGAAAGGTGGTGTGACACTAAT 4132
Query 3744 AATTTGAGTCTCGATCAACTAGAAATGAAGAAAAATCCCCCTTTTCTGTCTTGCTGGATC 3803
| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4133 AGTCTCAGTCTCGATCAACTAGATATGAAGAAAAATCCCCCTTTTCTGTCTTGCTGGATC 4192
Query 3804 AAGTTATTGAACTCAATTAATTCAAAAGGTGGTTTGTCTAGTCTTGCAATTAAGGCAGTA 3863
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4193 AAGTTATTGAACTCAATTAATTCAAAAGATGGTTTGTCTAGTCTTGCAATGAAGGCAGTA 4252
Query 3864 AACGTTCTGAGCGTGGGCTCCATCAGATTATGCCTTGATGGT 3905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4253 AACGTTCTGAGCGTGGGCTCCATCAGATTATGCCTTGATGGT 4294
Score = 108 bits (58), Expect = 8e-22
Identities = 58/58 (100%), Gaps = 0/58 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2550 ACTGTTGCTGCTGCTTTATATGACGAGGGTGCGGTTACAGTTGTGTATGCTATCTTGG 2607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762 ACTGTTGCTGCTGCTTTATATGACGAGGGTGCGGTTACAGTTGTGTATGCTATCTTGG 2819
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 310425647472
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5