BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg928483
Length=2188
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G07960.1 | Symbols: | Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-ki... 3674 0.0
> AT3G07960.1 | Symbols: | Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
family protein | chr3:2534887-2538372 FORWARD LENGTH=2817
Length=2817
Score = 3674 bits (1989), Expect = 0.0
Identities = 2122/2188 (97%), Gaps = 1/2188 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAAAGAAGAAGAGAGAAATGTCGGTAGCACACGCAGATGACGCCGACGATTACAGCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 GAAGAAAGAAGAAGAGAGAAATGTCGGTAGCACACGCAGATGACGCCGACGATTACAGCA 427
Query 61 GACCAACGGGAGAGAGTTACCACGCCGAGAAAGCATTACCAAGCGGTGATTTCTACACAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 GACCAACGGGAGAGAGTTACCACGCCGAGAAAGCATTACCAAGCGGTGATTTCTACACAG 487
Query 121 GACAATGGCGAGATAATCTCCCTCACGGTCATGGCAAATACCTTTGGACCGATGGTTGTA 180
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 GACAATGGCGAGACAATCTCCCTCACGGTCATGGCAAATACCTTTGGACCGATGGTTGTA 547
Query 181 TGTATGTCGGAGATTGGCACAGAGGCAAAACCATGGGCAAAGGTCGTTTTAGTTGGCCTA 240
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 TGTATGTCGGAGATTGGCACCGAGGCAAAACCATGGGCAAAGGTCGTTTTAGTTGGCCTA 607
Query 241 GTGGTGCCACCTACGAAGGCGATTTCAAAAACGGTTACATGGACGGCAAAGGTACTTACA 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 GTGGTGCCACCTACGAAGGCGATTTCAAAAACGGCTACATGGACGGCAAAGGTACTTACA 667
Query 301 TTGATTCCTCTGGAGATTTATATAGAGGATCATGGGTGATGAATCTGAGACATGGGCAAG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 TTGATTCCTCTGGAGATTTATATAGAGGATCATGGGTGATGAATCTGAGACATGGGCAAG 727
Query 361 GGACGAAAAGTTACGTCAACGGAGATTGCTACGACGGTGAATGGAGGAGAGGTTTACAAG 420
| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||
Sbjct 728 GAACGAAAAGTTACGTCAACGGAGATTGCTACGATGGAGAATGGAGAAGAGGTTTACAAG 787
Query 421 ATGGACATGGGAGGTATCAGTGGAAGAACGAGAATCATTACATTGGACAATGGAAGAATG 480
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 ATGGACATGGGAGGTATCAATGGAAGAACGAGAATCATTACATTGGACAATGGAAGAATG 847
Query 481 GGTTGATGAATGGTAACGGGACGATGATATGGAGCAACGGGAACCGTTACGATGGCTCTT 540
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 848 GTTTGATGAATGGTAACGGGACGATGATATGGAGCAACGGGAACCGTTACGATGGGTCTT 907
Query 541 GGGAAGACGGAGCTCCTAAAGGCAATGGAACTTTCCGATGGTCGGACGGGAGTTTCTACG 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 908 GGGAAGACGGAGCTCCTAAAGGCAATGGAACTTTCCGATGGTCGGATGGGAGTTTCTACG 967
Query 601 TCGGAGTTTGGAGCAAAGATCCTAAAGAACAGAACGGGACTTATTACCCTTCGACATCTT 660
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 968 TTGGAGTTTGGAGTAAAGATCCTAAAGAACAGAACGGGACTTATTACCCTTCGACTTCTT 1027
Query 661 CAGGGAATTTTGATTGGCAACCACAACAAGTGTTCTATGTTGATTTGAGTGAATGTGTGG 720
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 CCGGGAATTTTGATTGGCAACCACAACAAGTGTTTTATGTTGATTTGAGTGAATGTGTGG 1087
Query 721 TTTGTACTTGTCAGAGAATCCCGGTTTTGCCATCTCAGAAGATGCCGGTTTGGTACGGTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 TTTGTACTTGTCAGAGAATCCCGGTTTTGCCGTCTCAGAAGATGCCGGTTTGGTACGGTG 1147
Query 781 CTTCGGAGCAGAGTAGTAGTGGGAACAGGACCAAGAACAGTGAGAGGCCGAGGAGGAGAT 840
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 CTTCTGAGCAGAGTAGTAGTGGGAACAGGACGAAGAACAGTGAGAGGCCGAGGAGGAGAT 1207
Query 841 CTGTTGATGGAAGAGTAAGTAATGGTGAAATGGAATTGAGGAATAATGGTTCTGGTTATC 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1208 CTGTTGATGGAAGAGTAAGTAATGGTGAAATGGAATTGAGGAGTAATGGTTCTGGTTATC 1267
Query 901 TTCAGTTAGATGATAATGCAGAGAGTAATAGATCATCATTAGGGCCTTTGAGAATACAGC 960
||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 1268 TTCAGGTAGATGATAATGCTGAGAGTACTAGATCATCACTAGGGCCTTTGAGAATACAAC 1327
Query 961 CTGCTAAGAAACAAGGACAAACTATCTCTAAAGGTCACAAGAATTATGAACTCATGCTTA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 CTGCTAAGAAACAAGGACAAACTATCTCTAAAGGTCATAAGAATTATGAACTCATGCTTA 1387
Query 1021 ACTTGCAGCTCGGAATTAGGCATTCTGTTGGAAGACCAGCACCAGCTACATCTCTTGATT 1080
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1388 ACTTGCAGCTTGGAATTAGACATTCTGTTGGAAGACCAGCACCAGCTACTTCTCTTGATT 1447
Query 1081 TGAAGGCTTCAGCTTTTGATCCAAAGGAGAAACTTTGGACGAAATTTCCATCTGAAGGAT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1448 TGAAGGCTTCAGCTTTTGATCCAAAGGAGAAACTTTGGACGAAGTTTCCATCTGAAGGGT 1507
Query 1141 CTAAATACACTCCTCCACACCAGTCCTGTGAGTTTAAATGGAAGGATTATTGTCCTGTGG 1200
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508 CTAAATACACTCCTCCACACCAGTCTTGTGAGTTTAAATGGAAGGATTATTGTCCTGTGG 1567
Query 1201 TTTTCAGGACTCTGCGTAAATTATTTAGTGTGGACGCAGCAGATTACATGTTATCGATTT 1260
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1568 TTTTCAGGACTCTGCGGAAACTATTTAGTGTGGACGCAGCAGATTATATGTTATCGATTT 1627
Query 1261 GTGGGAATGATGCTCTTAGGGAGCTATCATCTCCAGGGAAAAGTGGAAGCTTTTTCTACT 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 GTGGGAATGATGCTCTTAGGGAGCTATCATCTCCAGGGAAAAGTGGAAGCTTTTTCTACT 1687
Query 1321 TGACCAACGATGACCGCTACATGATCAAGACTATGAAGAAGGCAGAAACCAAAGTTCTTA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 TGACCAACGATGACCGCTACATGATCAAGACTATGAAGAAGGCAGAAACCAAAGTTCTTA 1747
Query 1381 TAAGGATGCTTCCGGCTTACTACAATCATGTCAGGGCATGTGAAAACACTTTAGTTACCA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1748 TAAGGATGCTTCCGGCTTACTACAATCATGTCAGGGCGTGTGAAAACACTCTAGTTACCA 1807
Query 1441 AGTTCTTCGGTCTTCATTGCGTGAAATTGACTGGCACTGCACAGAAAAAGGTTCGATTTG 1500
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1808 AGTTCTTCGGTCTTCATTGCGTGAAATTAACTGGCACTGCACAGAAAAAGGTTCGATTTG 1867
Query 1501 TAATAATGGGTAACCTATTCTGTACTGGTCACTCCATCCATAGGCGGTTTGACCTCAAAG 1560
| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1868 TGATAATGGGTAATCTTTTCTGTACTGGTCACTCCATCCATAGGCGGTTTGACCTCAAAG 1927
Query 1561 GATCCTCTCATGGCCGTCTTACTACTAAACCAGAGTCCGAAATCGATCCAAACACGACGC 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1928 GATCCTCTCATGGCCGTCTTACTACTAAACCAGAGTCCGAAATCGATCCAAACACGACGC 1987
Query 1621 TTAAAGATCTTGATCTAAATTTTGCATTCCGATTGCAAAAGAATTGGTTCCAAGAATTCT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1988 TTAAAGATCTTGATCTAAATTTTGCATTCCGATTGCAAAAGAACTGGTTCCAAGAATTCT 2047
Query 1681 GCAGGCAAGTGGACAGAGACTGTGAATTCCTTGAACAAGAGAGAATTATGGATTATAGTC 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2048 GCAGGCAAGTGGACAGAGACTGTGAATTCCTTGAACAAGAGAGGATTATGGATTATAGTC 2107
Query 1741 TCTTGGTTGGTCTTCACTTTCGAGAAGCTTCTTTCAAGGACTCTGCCACTCCTACTTCTG 1800
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2108 TCTTGGTTGGTCTTCACTTTCGAGAAGCTGCTATCAAGGACTCTGCCACTCCTACTTCCG 2167
Query 1801 GTGCTCGAACCCCGACCGGAAATTCAGATACTCGTCTCTCCCGAGCAGAAATGGACCGGT 1860
| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 GCGCTCGAACCCCTACCGGAAATTCAGAAACTCGTCTCTCCCGAGCAGAAATGGACCGGT 2227
Query 1861 TTCTTCTTGATGCCAGCAAGCTAGCATCAATAAAATTGGGTATTAACATGCCTGCAAGAG 1920
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2228 TTCTTCTCGATGCCAGCAAGCTAGCATCAATAAAATTGGGTATAAACATGCCTGCAAGAG 2287
Query 1921 TTGAAAGAACATCAAGAAGAAGTGACTGTGAGAATCAGCTTGTTGGGGAACCAACAGGTG 1980
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2288 TTGAAAGAACAGCGAGAAGAAGTGACTGTGAGAATCAGCTTGTTGGGGATCCAACTGGTG 2347
Query 1981 AATTTTACGATGTGATTCTGTATTTCGGTATTATAGACATTCTCCAAGACTACGACATAA 2040
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2348 AATTTTACGATGTGATAGTGTATTTCGGTATTATAGACATTCTCCAAGACTACGACATAA 2407
Query 2041 GCAAGAAGCTTGAACATGCCTACAAATCAATGCAGTATGATCCGACATCAATCTCAGCAG 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2408 GCAAGAAGCTTGAACATGCCTACAAATCAATGCAGTATGATCCGACATCGATCTCAGCCG 2467
Query 2101 TTGATCCAAAGCAATACTCTCGACGTTTCAGGGATTTCATCTTAAGGGTCTTCGTTGAAG 2160
||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2468 TTGATCCGAAGCAATACTCACGACGATTCAGGGATTTCATCTTCAGGGTCTTCGTTGAAG 2527
Query 2161 ACACTTGAGAGAACAATCATTCTAACTT 2188
|| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2528 ACGCTTGAGAGAACAATCAT-CTAACTT 2554
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 108533578290
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5