BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg928500
Length=5152
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G08530.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:2586806-... 8959 0.0
AT3G11130.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:3482149-... 7295 0.0
> AT3G08530.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:2586806-2595572
REVERSE LENGTH=5638
Length=5638
Score = 8959 bits (4851), Expect = 0.0
Identities = 5036/5128 (98%), Gaps = 2/5128 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 GATCTGAGGTCAAACATGGCTGCTGCCAACGCCCCCATCACGATGAAGGAGGTCCTGACG 65
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 GATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCCAACGCCCCCATCACGATGAAGGAGGTCCTGACG 206
Query 66 CTTCCGAGCGTCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAATGTTACTATGGAGTCT 125
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 CTTCCGAGCATCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAATGTTACTATGGAGTCT 266
Query 126 GACAAGTACATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTTGTAATTATAGATATG 185
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267 GACAAGTATATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTTGTAATTATAGATATG 326
Query 186 AATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATTACTGCAGATTCTGCTCTTATGAACCCA 245
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 327 AATATGCCGATGCAGCCTCTTAGGAGGCCTATTACTGCAGACTCTGCTCTTATGAACCCA 386
Query 246 AACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAAGATCATCTACAG 305
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 387 AACTCGAAGATCCTTGCCTTGAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAGGATCATCTACAG 446
Query 306 ATATTTAACATTGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAATCTCATCAGATGCCTGAGCAGGTTGTC 365
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 ATATTTAACATTGAAGCCAAAGCAAAGTTGAAATCACATCAGATGCCTGAGCAGGTTGTC 506
Query 366 TTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACAGAATTCCGTCTATCAT 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 TTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACAGAATTCCGTCTATCAT 566
Query 426 TGGTCAATTGAAGGCGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACAGCCAATTTGACC 485
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 567 TGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACAGCCAATTTGGCC 626
Query 486 AACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTTTTAATTGGA 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 AACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTTTTAATTGGA 686
Query 546 ATTGCTCCTGGCTCCCCTGAGAGACAACAATTGGTTAAAGGAAATATGCAGCTTTTCTCT 605
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 687 ATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACAACAATTGGTAAAAGGAAATATGCAGCTTTTCTCT 746
Query 606 GTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCATCGTTTGCGCAGTTTAAG 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747 GTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCATCGTTTGCGCAGTTTAAG 806
Query 666 GTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTTTAATGCT 725
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 GTTCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTTTAATGCT 866
Query 726 GGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCCAACCTGGAAAACCATCA 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 GGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCCAACCTGGAAAACCATCA 926
Query 786 TTTACAAAAAAGCAAGCAGATCTC-TTTTTCCCACCTGATTTTGCTGATGATTTTCCTGT 844
||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 TTTACAAAAAAACAAGCAGATCTCTTTTTTCCC-CCTGATTTTGCTGATGATTTTCCTGT 985
Query 845 TGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCACCAAACTTGGCCTGTT 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 986 TGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCACCAAACTTGGCCTGTT 1045
Query 905 GTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATTAGTCCAGACCC 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 GTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATTAGTCCAGACCC 1105
Query 965 AATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAGGCGAGG 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 AATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAGGCGAGG 1165
Query 1025 ACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTTTTATTAGTGGCCAATT 1084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 ACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTTTTATTAGTGGCCAATT 1225
Query 1085 GAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCAGGTGCAGAAAA 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 GAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCAGGTGCAGAAAA 1285
Query 1145 TCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGCTGCTGA 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 TCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGCTGCTGA 1345
Query 1205 GCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATACAGTGGCCAAATTCCA 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 GCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATACAGTGGCCAAATTCCA 1405
Query 1265 GAGTGTTCCTGTACAAGCTGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGACTCTTTT 1324
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GAGTGTTCCTGTACAAGCTGGACAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGACTCTTTT 1465
Query 1325 GACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTCGGCTGGTTGTGAACCA 1384
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 GACTAGAGGGAAACTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTCGGCTGGTTGTGAACCA 1525
Query 1385 AAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGCTAGAATGCAGTGAAGA 1444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1526 AAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAACTAGAATGCAGTGAAGA 1585
Query 1445 ACTTGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGATCTTGCTCTGAAAATATACATCAAAGC 1504
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 ACTTGGAGACCTTGTGAAGACTGTGGATAATGATCTCGCTCTGAAAATATACATCAAAGC 1645
Query 1505 ACGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGGAGTTTGACAAAATATT 1564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1646 TCGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGGAGTTTGACAAAATACT 1705
Query 1565 GATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTCTTCTGCAAACCATACT 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 GATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTCTTCTGCAAACCATACT 1765
Query 1625 CCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGTCTCAAATGGAAGGAGG 1684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 CCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGTCTCAAATGGAAGGAGG 1825
Query 1685 TTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGAGAAATCTGATTCGTGA 1744
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1826 TTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGAGAAATCTGATCCGTGA 1885
Query 1745 AGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTGAGCATGCTTTTCTGCA 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 AGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTGAGCATGCTTTTCTGCA 1945
Query 1805 AACTAAGGTTCTGGAGATCAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGGCTGATGCGGTATTAGC 1864
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1946 AACTAAGGTTCTGGAGATAAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGGCTGATGCGGTATTAGC 2005
Query 1865 AAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAACTTTGTGAAAAGGCTGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2006 AAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAACTTTGTGAAAAGGCTGG 2065
Query 1925 ACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTGCCTGATATAAAACGTGTGATTGT 1984
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2066 ACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATAAAACGTGTAATTGT 2125
Query 1985 AAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTGGCACTCTTTCTAGCGA 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126 AAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTGGCACTCTTTCTAGCGA 2185
Query 2045 GTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGAGAGGCAATCTGCAGAT 2104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 GTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGAGAGGCAATCTGCAGAT 2245
Query 2105 AATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGTATTAAGCT 2164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2246 AATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGTATTAAGCT 2305
Query 2165 CTTTGAGCAGTTCAAGTCATACGAAGGGCTATACTTTTTCCTAGGTTCATATTTGAGTAT 2224
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2306 CTTTGAGCAGTTCAAGTCATATGAAGGGCTATACTTTTTCCTAGGTTCATATTTGAGTAT 2365
Query 2225 GAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAATACATTGAAGCAGCTGCCAAGACTGGTCAAAT 2284
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 GAGTGAGGATCCTGAGATCCATTTCAAGTACATTGAAGCAGCTGCCAAGACTGGTCAAAT 2425
Query 2285 AAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATGCTGAAAAGACGAAGAA 2344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2426 AAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATGCTGAAAAGACGAAGAA 2485
Query 2345 CTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAAATGTCTGCGATCGTTT 2404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2486 CTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAAATGTCTGTGATCGTTT 2545
Query 2405 TGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTTCGTTACATTGA 2464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2546 CAGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTTCGTTACATTGA 2605
Query 2465 AGGTTACGTACAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTCGGGCAGTTGCTTGA 2524
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606 AGGCTACGTGCAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTCGGGCAGTTGCTTGA 2665
Query 2525 TGATGAATGCCCCGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTGTCTGTTCGTTCATTGCTTCC 2584
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2666 TGATGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTCTCTGTTCGTTCATTGCTTCC 2725
Query 2585 TGTTGAACCACTTGTCGAGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTCACTCAGTT 2644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2726 TGTTGAACCACTTGTCGAGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTCACTCAGTT 2785
Query 2645 CTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAGGATGTGCATGTCCATAATGCCTTGGGTAA 2704
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2786 CTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATAATGCCTTGGGTAA 2845
Query 2705 AATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCACCAACCCTTACTACGA 2764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2846 AATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCACCAACCCTTACTACGA 2905
Query 2765 CTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCCTGGCGGTTGTGGCATA 2824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2906 CTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCCTAGCAGTTGTGGCATA 2965
Query 2825 CAGAAGAGGACAATGTGATGAGGAACTCATCAATGTCACTAACAAAAACTCTTTGTTCAA 2884
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2966 CAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACTAACAAAAACTCTTTGTTTAA 3025
Query 2885 GTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGTGGGATAAGGTTCTCGA 2944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3026 GTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGTGGGATAAGGTTCTCGA 3085
Query 2945 TGAAAACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTGTTTCTACTGCTTTACCTGA 3004
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3086 TGAAAACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTGTGTCTACTGCTTTACCTGA 3145
Query 3005 AAGCAAGAGCCCGGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACTGCTGATTTGCC 3064
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3146 AAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACTGCTGATTTGCC 3205
Query 3065 GCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTTCAAAATTCTGCTTTCAGTGGAAA 3124
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3206 GCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTACAAAATTCTGCCTTCAGTGGAAA 3265
Query 3125 CTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGGCAGATCCATCTAGAGTTAT 3184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3266 CTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGGCAGATCCGTCTAGAGTTAT 3325
Query 3185 GGATTACATTAACAGGCTGGACAACTTTGATGGACCTGCGGTTGGAGAAGTCGCAGTTGA 3244
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3326 GGATTACATCAACAGGCTGGACAACTTTGATGGACCTGCAGTTGGAGAAGTCGCAGTTGA 3385
Query 3245 AGCCCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGTTCAACTTAAATGTTCAGGC 3304
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3386 AGCCCAATTATATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGTTCAACTTAAATGTTCAGGC 3445
Query 3305 TGTCAATGTATTGCTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTGCAGTTGAGTTTGCATTCCG 3364
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3446 TGTCAATGTATTGCTGGATAATGTCAGGAGCATTGAGCGTGCAGTTGAGTTTGCATTCCG 3505
Query 3365 GGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTTGCTAAGGCGCAACTCAGAGAAGGATTAGT 3424
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 3506 GGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTCGCTAAGGCGCAACTCAGGGAAGGACTAGT 3565
Query 3425 CAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCACTCATTTCTTGGAAGTCAT 3484
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3566 CAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCACTCATTTCTTGGAGGTCAT 3625
Query 3485 ACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCAAATACCTTCTGATGGTTAG 3544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3626 ACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCAAATACCTTCTGATGGTTAG 3685
Query 3545 ACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCTATGCATATGCAAAGATTGA 3604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3686 ACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCTATGCATATGCAAAGATTGA 3745
Query 3605 TAGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACGTTGCTAATCTACAAAATGT 3664
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3746 TCGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACGTTGCTAATCTACAACATGT 3805
Query 3665 TGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAAATAATCTATGCGTTCAT 3724
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3806 TGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTCTATGAGGCTGCAAAAATAATCTATGCGTTCAT 3865
Query 3725 ATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGCAACAGTTCCAAGGTGCTGT 3784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3866 ATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGCAACAGTTCCAAGGTGCTGT 3925
Query 3785 TGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTGCTTTGCTTGCGT 3844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3926 TGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTGCTTTGCTTGCGT 3985
Query 3845 TGATGCAGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTAACATTATCATTCAGGTGGA 3904
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3986 TGATGCTGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTAACATTATCATTCAGGTGGA 4045
Query 3905 TGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGTGCTTCAATGAATTAATCTC 3964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4046 TGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGTGCTTCAATGAATTAATCTC 4105
Query 3965 ACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGGGTATCTTCACCGAGTTGGG 4024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4106 ACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGGGTATCTTCACCGAGTTGGG 4165
Query 4025 TGTACTGTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAACACATCAAGTTATTTTCAAC 4084
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4166 TGTACTCTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAACACATCAAGTTATTTTCAAC 4225
Query 4085 TCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAACAACAGCACTGGCAGGAACT 4144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4226 TCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAACAACAGCACTGGCAGGAACT 4285
Query 4145 TACTTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCGACCACCGTCATGAACCA 4204
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4286 TACCTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCGACCACCGTCATGAACCA 4345
Query 4205 TTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAAGGTAGCGAATGT 4264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4346 TTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAAGGTAGCGAATGT 4405
Query 4265 TGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGCATCCTGATCTAATCAATGA 4324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||
Sbjct 4406 TGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGCATCCGGATATAATCAACGA 4465
Query 4325 TCTTCTCAACGTGCTTGCGTTGCGGTTAGACCATACTCGTGTTGTTGATATAATGCGAAA 4384
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4466 TCTTCTCAACGTACTTGCGTTGCGGTTAGACCATACTCGTGTTGTTGATATAATGCGGAA 4525
Query 4385 GGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCAGTTCAGAGCAACAATGTCTC 4444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4526 GGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCAGTTCAGAGCAACAATGTCTC 4585
Query 4445 TGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAAGAAGACTATGATAGGTTGCG 4504
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4586 TGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAAGAAGACTACGATAGGTTGCG 4645
Query 4505 AGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGCCTCGCTCAGAAGATCGAGAA 4564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4646 AGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGCCTCGCTCAGAAGATCGAGAA 4705
Query 4565 ACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGAAAGCGGGCAGATG 4624
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4706 ACACGAACTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGAAAGCGGGCAGATG 4765
Query 4625 GAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTACAAGGACTGTATGGAAACTGC 4684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4766 GAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTACAAGGACTGTATGGAAACGGC 4825
Query 4685 TTCACAATCCGGTGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTGGTGTACTTCATTGAACAGGG 4744
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4826 TTCACAATCAGGCGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTGGTGTATTTCATTGAACAGGG 4885
Query 4745 CAAAAAGGAATGCTTTGCTACGTGTCTATTTGTATGTTATGACTTAATCCGACCAGACGT 4804
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4886 CAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTATGTTATGACTTAATCCGACCAGACGT 4945
Query 4805 GGCTCTTGAACTTGCGTGGATCAACAATATGATGGACTTTGCCTTCCCGTATCTCCTCCA 4864
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4946 GGCTCTAGAACTTGCCTGGATCAACAATATGATGGACTTTGCCTTCCCGTATCTCCTCCA 5005
Query 4865 GTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGTTAATAAAGGACAAGCTGGAGGCACA 4924
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5006 GTTTATCCGAGAGTACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATAAAGGACAAGCTTGAGGCACA 5065
Query 4925 AAAAGAGGTGAAGGCTAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTTATGTCCCAACAGAACATGTA 4984
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 5066 AAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTCATATCCCAACAGAACATGTA 5125
Query 4985 CGCCCAACTATTGCCACTTGCTTTACCTGCACCACCGATGCCAGGAATGGGAGGTGGTGG 5044
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5126 TGCCCAAATGTTGCCACTTGCTTTACCTGCACCACCGATGCCAGGAATGGGAGGTGGTGG 5185
Query 5045 TGGGTATGGTCCGCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGGAATGCCTCCCATGCCACCATA 5104
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5186 TGGGTATGGTCCTCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGGAATGCCTCCCATGCCACCATA 5245
Query 5105 TGGAATGCCACCGATGGGTGGCTACTAA 5132
|||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5246 TGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAA 5273
> AT3G11130.1 | Symbols: | Clathrin, heavy chain | chr3:3482149-3491908
REVERSE LENGTH=5785
Length=5785
Score = 7295 bits (3950), Expect = 0.0
Identities = 4755/5150 (92%), Gaps = 30/5150 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCTGCTGCCAACGCCCCCATCACGATGAAGGAGGTCC 60
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 222 GCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCTAACGCGCCCATCATTATGAAGGAGGTCC 281
Query 61 TGACGCTTCCGAGCGTCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAATGTTACTATGG 120
| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 282 TAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAATGTTACTATGG 341
Query 121 AGTCTGACAAGTACATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTTGTAATTATAG 180
||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 342 AGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCGCAGAACAGTGTTGTAATTATCG 401
Query 181 ATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATTACTGCAGATTCTGCTCTTATGA 240
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 402 ATATGAATATGCCGATGCAGCCTTTAAGGAGGCCTATAACTGCTGATTCTGCTCTTATGA 461
Query 241 ACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAAGATCATC 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 462 ACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAGGATCATC 521
Query 301 TACAGATATTTAACATTGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAATCTCATCAGATGCCTGAGCAGG 360
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 522 TACAGATATTTAACATTGAAGCAAAGGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATGCCTGAGCAGG 581
Query 361 TTGTC-TTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACAGAA-TTCCGT 418
||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||| ||
Sbjct 582 TTG-CTTTTTGGAAGTGGATCACACCTAAGATGCTGGGACTGGTCACACA-AACTTCTGT 639
Query 419 CTATCATTGGTCAATTGAAGGCGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACAGCCAA 478
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 640 GTATCATTGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACGGCTAA 699
Query 479 TTTGACCAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTTTT 538
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 700 TTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTCTT 759
Query 539 AATTGGAATTGCTCCTGGCTCCCCTGAGAGACAACAATTGGTTAAAGGAAATATGCAGCT 598
||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 760 GATTGGAATTGCCCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTGAAAGGAAATATGCAGCT 819
Query 599 TTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCATCGTTTGCGCA 658
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 820 TTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCACATGCTGCATCTTTTGCTCA 879
Query 659 GTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTT 718
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 GTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCGATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTT 939
Query 719 TAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCCAACCTGGAAA 778
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 940 TAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGCTGCATGTTATTGAACTTGGTGCCCAACCAGGGAA 999
Query 779 ACCATCATTTACAAAAAAGCAAGCAGATCTCTTTTTCCCACCTGATTTTGCTGATGATTT 838
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1000 ACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTGCTGATGATTT 1059
Query 839 TCCTGTTGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCACCAAACTTGG 898
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 1060 TCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCACCAAGCTTGG 1119
Query 899 CCTGTTGTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATTAGTCC 958
|||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1120 CCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATAAGTCC 1179
Query 959 AGACCCAATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAG 1018
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 GGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAG 1239
Query 1019 GCGAGGACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTTTTATTAGTGG 1078
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1240 GCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACAGTAAATGAGGCCACCATAATACCTTTTATTAGTGG 1299
Query 1079 CCAATTGAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCAGGTGC 1138
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1300 TCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCTGGTGC 1359
Query 1139 AGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGC 1198
||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1360 AGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGC 1419
Query 1199 TGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATACAGTGGCCAA 1258
||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1420 TGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATACGGTGGCCAA 1479
Query 1259 ATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCTGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGAC 1318
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 ATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGAC 1539
Query 1319 TCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTCGGCTGGTTGT 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1540 CCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCTTTGGAACTATCTCGGCTTGTTGT 1599
Query 1379 GAACCAAAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGCTAGAATGCAG 1438
||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1600 GAATCAAAACAAAAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGTTAGAATGCAG 1659
Query 1439 TGAAGAACTTGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGATCTTGCTCTGAAAATATACAT 1498
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1660 TGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAAACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAAAAATATACAT 1719
Query 1499 CAAAGC-ACGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGGAGTTTGACA 1557
|||||| | | || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1720 CAAAGCTA-GAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGGAGTTTGACA 1778
Query 1558 AAATATTGATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTCTTCTGCAAA 1617
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1779 AAATATTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTCTTCTGCAAA 1838
Query 1618 CCATACTCCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGTCTCAAATGG 1677
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1839 CGATACTCCGTACGGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGTCCCAAATGG 1898
Query 1678 AAGGAGGTTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGAGAAATCTGA 1737
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1899 AAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGAGAAATCTGA 1958
Query 1738 TTCGTGAAGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTGAGCATGCTT 1797
| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1959 TCCGTGAAGCGACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAATTTACCCGAGCATGCTT 2018
Query 1798 TTCTGCAAACTAAGGTTCTGGAGATCAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGGCTGATGCGG 1857
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2019 TTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGGCTGATGCAA 2078
Query 1858 TATTAGCAAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAACTTTGTGAAA 1917
| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 2079 TCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACCGGCCTCGTGTTGCTCAGCTTTGTGAAA 2138
Query 1918 AGGCTGGACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTGCCTGATATAAAACGTG 1977
||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2139 AGGCTGGACTTTACATCCAATCTTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATCAAACGTG 2198
Query 1978 TGATTGTAAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTGGCACTCTTT 2037
| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2199 TAATTGTGAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTTGGTACTCTTT 2258
Query 2038 CTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGAGAGGCAATC 2097
||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |
Sbjct 2259 CTAGCGAGTGGGCAATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGAGAGGCAACC 2318
Query 2098 TGCAGATAATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGTA 2157
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2319 TTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGCA 2378
Query 2158 TTAAGCTCTTTGAGCAGTTCAAGTCATACGAAGGGCTATACTTTTTCCTAGGTTCATATT 2217
|||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2379 TTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCGTACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAGGTTCATACT 2438
Query 2218 TGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAATACATTGAAGCAGCTGCCAAGACTG 2277
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2439 TGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTGCCAAGACTG 2498
Query 2278 GTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATGCTGAAAAGA 2337
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2499 GTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATGCGGAAAAGA 2558
Query 2338 CGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAAATGTCTGCG 2397
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2559 CGAAGAACTTTTTAATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATTAATGTCTGTG 2618
Query 2398 ATCGTTTTGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTTCGTT 2457
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2619 ATCGTTTTGGCTTTGTACCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTGCGTT 2678
Query 2458 ACATTGAAGGTTACGTACAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTCGGGCAGT 2517
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2679 ACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTGAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTGGGGCAGT 2738
Query 2518 TGCTTGATGATGAATGCCCCGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTGTCTGTTCGTTCAT 2577
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2739 TGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTGTTCGTTCAT 2798
Query 2578 TGCTTCCTGTTGAACCACTTGTCG-AGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTC 2636
| |||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2799 TACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTGCA-GAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTC 2857
Query 2637 ACTCAGTTCTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAGGATGTGCATGTCCATAATGCC 2696
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2858 ACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATAATGCC 2917
Query 2697 TTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCACCAACCCT 2756
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2918 TTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCACCAATCCT 2977
Query 2757 TACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCCTGGCGGTT 2816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 2978 TACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTCTGGCTGTT 3037
Query 2817 GTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGATGAGGAACTCATCAATGTCACTAACAAAAACTCT 2876
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 3038 GTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACAAGAACTCT 3097
Query 2877 TTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGTGGGATAAG 2936
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 3098 TTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCTGGGAGAAG 3157
Query 2937 GTTC-T-CGATGAA-AACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTGTTTCTACT 2993
|||| | || ||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 3158 GTTCTTACG--GAAGAA-AATGAATATAGGAGGCAACTTATAGACCAAGTTGTGTCTACT 3214
Query 2994 GCTTTACCTGAAAGCAAGAGCCCGGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACT 3053
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3215 GCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACT 3274
Query 3054 GCTGATTTGCCGCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTTCAAAATTCTGCT 3113
||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3275 GCTGATTTGCCACATGAGCTAATTGAGCTTCTGGAAAAAATTGTGCTTCAAAATTCTGCC 3334
Query 3114 TTCAGTGGAAACTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGGCAGATCCA 3173
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3335 TTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTACTTATACTGACAGCTATTAAGGCAGATCCG 3394
Query 3174 TCTAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGACAACTTT-GATGGACCTGCGGTTGGAGA 3232
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || || ||||||||
Sbjct 3395 TCCAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAA-TTTCGATGGTCCAGCTGTTGGAGA 3453
Query 3233 AGTCGCAGTTGAAGCCCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGTTCAACTT 3292
||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||
Sbjct 3454 AGTGGCAGTGGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGTTTAACTT 3513
Query 3293 AAATGTTCAGGCTGTCAATGTATTGCTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTGCAGTTGA 3352
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3514 AAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAACGTGCTGTTGA 3573
Query 3353 GTTTGCATTCCGGGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTTGCTAAGGCGCAACTCAG 3412
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||
Sbjct 3574 GTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCACAGCTCAG 3633
Query 3413 AGAAGGATTAGTCAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCACTCATTT 3472
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||
Sbjct 3634 GGAAGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGACACCACTCAGTT 3693
Query 3473 CTTGGAAGTCATACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCAAATACCT 3532
|||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3694 CTTGGAGGTCATCCGAGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCAGATACCT 3753
Query 3533 TCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCTATGCATA 3592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3754 TCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCTATGCTTA 3813
Query 3593 TGCAAAGATTGATAGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACGTTGCTAA 3652
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3814 TGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACGTTGCCAA 3873
Query 3653 TCTACAAAATGTTGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAAATAAT 3712
|| ||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3874 CCTTCAACATGTTGGTGACCGTTTGTACGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAGATAAT 3933
Query 3713 CTATGCGTTCATATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGCAACAGTT 3772
||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3934 ATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGCAACAGTT 3993
Query 3773 CCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTG 3832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3994 CCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTG 4053
Query 3833 CTTTGCTTGCGTTGATGCAGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTAACATTAT 3892
||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 4054 CTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCTCAAATCTGTGGACTTAACATTAT 4113
Query 3893 CATTCAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGTGCTTCAA 3952
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4114 CATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGATGCTTCAA 4173
Query 3953 TGAATTAATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGGGTATCTT 4012
|||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4174 TGAATTGATCTCCCTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGGGTATCTT 4233
Query 4013 CACCGAGTTGGGTGTACTGTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAACACATCAA 4072
||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4234 CACCGAGTTAGGAGTACTGTACGCCAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAACACATCAA 4293
Query 4073 GTTATTTTCAACTCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAACAACAGCA 4132
||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4294 GTTGTTCTCTACTCGACTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAACAACAGCA 4353
Query 4133 CTGGCAGGAACTTACTTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCGACCAC 4192
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4354 TTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCAACCAC 4413
Query 4193 CGTCATGAACCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAA 4252
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4414 TGTTATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAA 4473
Query 4253 GGTAGCGAATGTTGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGCATCCTGA 4312
||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4474 GGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGCACCCTGA 4533
Query 4313 TCTAATCAATGATCTTCTCAACGTGCTTGCGT-TGCGGTTAGACCATACTCGTGTTGTTG 4371
| ||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||| || || ||||| ||||
Sbjct 4534 TATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGC-TCTGCGGTTAGATCACACGCGTGTCGTTG 4592
Query 4372 ATATAATGCGAAAGGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCAGTTCAGA 4431
|||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 4593 ATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATTAAGCCATATATGGTTGCAGTTCAGA 4652
Query 4432 GCAACAATGTCTCTGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAAGAAGACT 4491
|||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 4653 GCAATAATGTATCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGCAGAAGAAGAAGACT 4712
Query 4492 ATGATAGGTTGCGAGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGCCTCGCTC 4551
|||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||
Sbjct 4713 ATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGTCTCGCTC 4772
Query 4552 AGAAGATCGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGA 4611
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4773 AGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTATAAGA 4832
Query 4612 AAGCGGGCAGATGGAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTACAAGGACT 4671
|||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4833 AAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTGTCAAAGAAAGATAACATGTACAAGGACT 4892
Query 4672 GTATGGAAACTGCTTCACAATCCGGTGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTGGTGTACT 4731
|||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||
Sbjct 4893 GTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTCGTCTACT 4952
Query 4732 TCATTGAACAGGGCAAAAAGGAATGCTTTGCTACGTGTCTATTTGTATGTTATGACTTAA 4791
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 4953 TCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAA 5012
Query 4792 TCCGACCAGACGTGGCTCTTGAACTTGCGTGGATCAACAATATGATGGACTTTGCCTTCC 4851
||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5013 TCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATCGACTTTGCCTTCC 5072
Query 4852 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGTTAATAAAGGACA 4911
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 5073 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCCGGCAAAGTGGATGAGCTAATCAAGGACA 5132
Query 4912 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCTAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTTATGTCCC 4971
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 5133 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCAC 5192
Query 4972 AACAGAACATGTACGCCCAACTATTGCCACTTGCTTTACCTGCACCACCGATGCCAGGAA 5031
|||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5193 AACAGAACATGTACGCCCAATTATTACCACTGGCTCTACCCGCACCACCGATGCCAGGAA 5252
Query 5032 TGGGAGGTGGTGGTGGGTATGGTCCGCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGGAATGCC-- 5089
|||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |
Sbjct 5253 TGGGAGGTGGCGG-G--TATGGTCCACCACCACAAATGGGTGGAATGCCAGGAATGTCAG 5309
Query 5090 ---T-CC-C-A-TGCCACCATATGGAATGCCACCGATGGGTGGCTACTAA 5132
| || | | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5310 GAATGCCTCCAATGCCTCCATATGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAA 5359
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 257105582875
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5