BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg929130
Length=2777
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G13750.1 | Symbols: BGAL1 | beta galactosidase 1 | chr3:4510... 4761 0.0
AT4G26140.1 | Symbols: BGAL12 | beta-galactosidase 12 | chr4:13... 516 5e-145
> AT3G13750.1 | Symbols: BGAL1 | beta galactosidase 1 | chr3:4510965-4516298
FORWARD LENGTH=3313
Length=3313
Score = 4761 bits (2578), Expect = 0.0
Identities = 2712/2778 (98%), Gaps = 3/2778 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACAAGTTTTCTTCTTTTTACACTCAAGAATATAAATTTCCTCTTCTCCAGATCTTTTA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 19 AAACAAGTTTTCTTCTTTTTACACTCAAGAATATAAATTCCCTGTTCTCCAGATCTTTT- 77
Query 61 TTCAAGAAAATTTAAAGCTTTAAGC-TAAGAAAGCTTGAACCTTTCTCTTCCAACCACAT 119
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 CTCAAGAAAATTTAAAGCTTTAA-CTTAAGAAAGCTTGAACCTTTCTCTTCCAACCACAT 136
Query 120 CTTCCTTCTTTTTATCCTTTAGCTCAAATTAGGAAGAATAGAATAAAGTGGCAAAACCGA 179
|||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CTTCCTTCTTTTTATCCTCTAGCTCAACTTAGAAAGAATAGAATAAAGTGGCAAAACCGA 196
Query 180 AAGTGAACCAACTTGTAGTAAATTAATAGGTATGGGTTTGAAACCTAATGCCATGAAGAA 239
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 197 AAGTGAACCAACTTGTAGTAAATTAATAGTTATGGGTTCGAAACCTAATGCCATGAAGAA 256
Query 240 TGTGGTGGCTATGGCGGCAgtttctgctctgtttcttctagggtttcttgtttgctctgt 299
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 TGTGGTGGCTATGGCGGCAGTTTCTGCTCTGTTCCTTCTAGGGTTTCTTGTTTGCTCTGT 316
Query 300 ttctggttctgtctctTACGATAGCAGAGCTATTACCATCAATGGCAAAAGAAGAATCCT 359
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 TTCTGGTTCTGTCTCTTACGATAGCAGAGCCATTACCATCAATGGCAAAAGAAGAATCCT 376
Query 360 TATCTCTGGATCTATTCATTACCCCAGAAGTACTCCTGAGATGTGGCCAGATCTAATCCG 419
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 377 TATCTCTGGATCTATTCACTACCCCAGAAGTACTCCTGAGATGTGGCCAGATCTAATTCG 436
Query 420 GAAAGCAAAGGAAGGAGGCTTAGATGTGATTCAGACTTATGTTTTCTGGAATGGGCATGA 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 437 GAAAGCAAAGGAAGGAGGCTTAGATGTGATTCAGACTTATGTGTTCTGGAATGGGCATGA 496
Query 480 GCCATCTCCTGGAAAATATTACTTCGAGGGCAACTATGATTTGGTTAAGTTTGTCAAGTT 539
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 GCCATCTCCTGGAAAATATTATTTCGAGGGCAACTATGATTTGGTTAAGTTTGTCAAGTT 556
Query 540 GGTCCAACAATCTGGACTCTATCTTCATCTAAGGATTGGTCCTTATGTCTGTGCTGAATG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 GGTCCAACAATCTGGACTCTATCTTCATCTAAGGATTGGTCCTTATGTCTGTGCTGAATG 616
Query 600 GAACTTCGGTGGATTTCCTGTTTGGCTTAAGTACATTCCAGGGATTAGCTTCAGAACTGA 659
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 617 GAACTTCGGAGGATTTCCTGTTTGGCTTAAGTACATTCCAGGGATTAGCTTCAGAACAGA 676
Query 660 TAACGGTCCTTTCAAGGCTCAAATGCAAAGATTCACCACGAAGATTGTTAACATGATGAA 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 TAACGGTCCTTTCAAGGCTCAAATGCAAAGATTCACCACGAAGATTGTTAACATGATGAA 736
Query 720 AGCTGAGAGGCTTTTTGAATCTCAAGGCGGTCCTATAATCCTCTCTCAGATTGAAAATGA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 737 AGCTGAGAGGCTTTTTGAATCTCAAGGCGGTCCTATAATTCTCTCTCAGATTGAAAATGA 796
Query 780 ATATGGACCAATGGAGTATGAGCTTGGTGCACCGGGACGGTCATACACCAACTGGGCAGC 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 ATATGGACCAATGGAGTATGAGCTTGGTGCACCGGGCCGGTCATACACCAACTGGGCAGC 856
Query 840 TAAGATGGCGGTGGGGCTAGGCACTGGTGTCCCTTGGGTCATGTGCAAACAAGACGATGC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 TAAGATGGCGGTGGGGCTAGGCACTGGTGTCCCTTGGGTCATGTGCAAACAAGACGATGC 916
Query 900 TCCCGACCCCATTATCAATGCTTGCAATGGATTCTACTGTGATTACTTCTCCCCAAACAA 959
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 TCCCGACCCCATTATCAATGCTTGCAATGGCTTCTACTGTGATTACTTCTCCCCAAACAA 976
Query 960 GGCTTACAAGCCTAAAATGTGGACCGAAGCCTGGACTGGATGGTTTACAAAGTTTGGAGG 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 GGCTTACAAGCCTAAAATGTGGACCGAAGCCTGGACTGGATGGTTTACAAAGTTTGGAGG 1036
Query 1020 CCCAGTTCCTTACCGCCCAGCTGAAGATATGGCCTTTTCTGTTGCAAGGTTTATCCAAAA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCAGTTCCTTACCGCCCAGCTGAAGATATGGCCTTTTCCGTTGCAAGGTTTATCCAAAA 1096
Query 1080 GGGTGGATCTTTCATCAACTACTATATGTATCATGGTGGAACGAATTTTGGTCGGACTGC 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 1097 GGGTGGATCTTTCATCAACTACTATATGTATCATGGTGGAACAAACTTTGGTCGAACTGC 1156
Query 1140 TGGTGGTCCGTTTATCGCAACCAGCTATGATTATGACGCTCCTCTTGACGAATATGGACT 1199
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 TGGTGGTCCGTTTATCGCAACTAGCTATGATTATGATGCTCCTCTTGACGAATATGGACT 1216
Query 1200 CGAAAGGCAGCCTAAGTGGGGGCACTTGAAAGATTTGCATAGAGCAATAAAGCTCTGTGA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1217 TGAAAGGCAGCCTAAGTGGGGGCACTTGAAAGATTTGCATAGAGCAATTAAGCTGTGTGA 1276
Query 1260 ACCAGCATTAGTATCAGGAGAGCCCACAAGAATGCCTCTCGGAAACTATCAAGAGGCTCA 1319
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 ACCAGCTTTAGTATCAGGAGAGCCCACAAGAATGCCTCTCGGAAACTATCAAGAGGCTCA 1336
Query 1320 TGTGTACAAAGCCAAATCTGGAGCTTGTTCTGCATTCTTAGCAAATTATAATCCAAAATC 1379
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TGTGTACAAATCAAAATCTGGAGCTTGTTCTGCATTCTTAGCAAATTATAATCCAAAATC 1396
Query 1380 TTACGCCAAAGTTTCTTTCGGGAGCAATCACTACAATCTACCTCCGTGGTCTATTAGTAT 1439
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1397 TTACGCCAAAGTTTCTTTCGGGAACAATCACTACAATCTCCCTCCGTGGTCTATAAGTAT 1456
Query 1440 TCTCCCAGACTGCAAAAACACAGTTTACAACACAGCCAGGGTTGGTGCTCAAACTTCTAG 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457 TCTCCCAGACTGCAAAAACACAGTTTACAACACAGCCAGGGTTGGTGCTCAAACTTCTAG 1516
Query 1500 GATGAAAATGGTTCGGGTTCCTGTTCATGGTGGTTTATCTTGGCAAGCATACAACGAAGA 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1517 GATGAAAATGGTTCGGGTTCCTGTTCATGGTGGTTTATCTTGGCAAGCATACAATGAAGA 1576
Query 1560 CCCATCAACTTACATTGATGAGTCTTTCACAATGGTCGGATTAGTGGAGCAGATCAACAC 1619
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1577 CCCATCAACTTACATCGATGAGTCATTCACAATGGTCGGATTAGTGGAGCAGATAAACAC 1636
Query 1620 TACACGAGACACTTCGGATTACCTGTGGTACATGACTGATGTTAAAATTGATGCCAATGA 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1637 TACACGAGACACTTCGGATTACCTGTGGTACATGACTGATGTTAAAGTTGATGCCAATGA 1696
Query 1680 AGGATTTTTGAGGAATGGAGATTTGCCAACTCTTACTGTTCTATCAGCTGGCCATGCTAT 1739
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 AGGATTTTTGAGGAATGGAGATTTGCCGACTCTTACTGTTCTATCAGCTGGCCATGCTAT 1756
Query 1740 GCATGTGTTTATCAATGGCCAATTATCTGGATCTGCGTATGGTAGTTTAGACTCTCCTAA 1799
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 GCATGTGTTTATCAATGGTCAATTATCTGGATCTGCATATGGTAGTTTAGACTCTCCTAA 1816
Query 1800 GCTAACTTTTCGGAAAGGTGTGAGTCTAAGAGCTGGTTTCAACAAAATTGCGATACTAAG 1859
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817 GCTAACTTTTCGGAAAGGTGTGAATCTAAGAGCTGGTTTCAACAAAATTGCGATACTAAG 1876
Query 1860 CATTGCTGTTGGTCTCCCGAATGTGGGTCCACATTTTGAGACATGGAATGCTGGAGTTTT 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 CATTGCTGTTGGTCTCCCGAATGTGGGTCCACATTTTGAGACATGGAATGCTGGAGTTTT 1936
Query 1920 GGGTCCAGTTTCATTGAACGGTCTCAATGGGGGACGGAGAGATCTATCATGGCAGAAATG 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1937 GGGTCCAGTTTCATTGAACGGTCTCAATGGGGGACGGAGAGATCTATCATGGCAGAAATG 1996
Query 1980 GACTTATAAGGTTGGTCTTAAAGGAGAGTCTCTGAGTCTTCATTCACTCAGTGGGAGCTC 2039
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1997 GACTTATAAGGTTGGTCTTAAAGGAGAGTCTCTGAGTCTTCATTCACTTAGTGGTAGCTC 2056
Query 2040 ATCGGTTGAGTGGGCAGAAGGTGCTTTTGTTGCACAGAAGCAACCACTTACTTGGTACAA 2099
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057 ATCGGTTGAGTGGGCAGAAGGTGCATTTGTTGCACAGAAGCAACCACTTACTTGGTACAA 2116
Query 2100 GACGACTTTCTCTGCTCCAGCTGGAGATTCACCGTTGGCTGTAGACATGGGAAGCATGGG 2159
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117 GACGACTTTCTCTGCTCCAGCTGGAGATTCGCCATTGGCTGTAGACATGGGAAGCATGGG 2176
Query 2160 AAAAGGTCAAATATGGATAAATGGGCAGAGCTTGGGACGTCACTGGCCTGCATATAAAGC 2219
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2177 AAAAGGTCAAATATGGATAAATGGGCAGAGCCTGGGACGTCACTGGCCTGCATATAAAGC 2236
Query 2220 AGTTGGTTCTTGCAGCGAGTGTTCTTATACTGGAACATTCAGAGAGGACAAGTGCTTAAG 2279
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 AGTTGGTTCTTGCAGCGAGTGTTCTTATACCGGAACATTCAGAGAGGACAAGTGCTTAAG 2296
Query 2280 AAACTGCGGAGAGGCTTCTCAAAGATGGTACCATGTCCCACGGTCGTGGCTAAAACCAAC 2339
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2297 AAACTGTGGAGAGGCTTCTCAAAGATGGTACCATGTCCCAAGGTCGTGGCTAAAACCAAG 2356
Query 2340 TGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAATGGGGAGGAGACCCGAACGGAATCTCGTTGGT 2399
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2357 TGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAATGGGGAGGAGACCCGAACGGAATCACGTTGGT 2416
Query 2400 CAGAAGAGAAGTGGACAGTGTATGTGCAGATATCTATGAATGGCAATCAACGCTGGTGAA 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 CAGAAGAGAAGTGGACAGTGTATGTGCAGATATCTATGAATGGCAATCAACGCTGGTGAA 2476
Query 2460 CTACCAATTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAACCATTGCATCCTAAAGTGCATTTACA 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 2477 CTACCAATTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAACCATTGCATCCCAAAGCACATTTACA 2536
Query 2520 ATGCGGGCCTGGACAAAAGATCACCACCGTGAAGTTTGCTAGCTTCGGGACACCTGAAGG 2579
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2537 ATGCGGGCCCGGACAAAAGATCACCACCGTGAAGTTTGCTAGTTTCGGGACACCTGAAGG 2596
Query 2580 GACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTGTCACGCCCATCACTCCTATGATGCTTTCAA 2639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2597 GACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTGTCACGCCCATCACTCCTATGACGCTTTCAA 2656
Query 2640 CAAACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCGGAGATGTTTGGTGG 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2657 CAAACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCGGAGATGTTTGGTGG 2716
Query 2700 AGATCCATGTCCAAATGTGATGAAGAAACTCGCGGTGGAAGCCATTTGTGCTTAAATGAA 2759
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2717 AGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAAACTCGCGGTGGAAGCCGTTTGTGCTTAAATGAA 2776
Query 2760 AGCAGACGCAGCAGCAAT 2777
|||||||||| |||||||
Sbjct 2777 AGCAGACGCAACAGCAAT 2794
> AT4G26140.1 | Symbols: BGAL12 | beta-galactosidase 12 | chr4:13243076-13247926
REVERSE LENGTH=2433
Length=2433
Score = 516 bits (279), Expect = 5e-145
Identities = 911/1208 (75%), Gaps = 76/1208 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 309 tgtctctTACGATAGCAGAGCTATTACCATCAATGG-CAAAAGAAGAATCCTTATCTCTG 367
|||| |||||||| | | |||| | | ||||||||| | | ||||| |||||| ||||||
Sbjct 187 TGTCACTTACGATCGTAAAGCTGTGATCATCAATGGTC-AGAGAAGGATCCTTCTCTCTG 245
Query 368 GATCTATTCATTACCCCAGAAGTACTCCTGAGATGTGGCCAGATCTAATCCGGAAAG-CA 426
| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || | |||| ||
Sbjct 246 GCTCCATTCACTACCCAAGAAGCACACCTGAGATGTGGCCTGACCTTATACAAAAAGCCA 305
Query 427 AAGGAAGGAGGCTTAGATGTGATTCAGACTTATGTTTTCTGGAATGGGCATGAGCCATCT 486
|| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 306 AA-GATGGAGGGTTGGATGTTATACAGACTTATGTTTTCTGGAATGGGCATGAACCTTCT 364
Query 487 CCTGGAAAATATTACTTCGAGGGCA-ACTATGATTTGGTTAAGTTTGTCAAGTTGGTCCA 545
|||||| ||||||| || |||| || | |||||| | |||||||| ||||| |||| ||
Sbjct 365 CCTGGACAATATTATTTTGAGGACAGA-TATGATCTAGTTAAGTTCATCAAGGTGGTACA 423
Query 546 ACAATCTGGACTCTATC-TTCATCTAAGGATTGGTCCTTATGTCTGTGCTGAATGGAACT 604
|||| |||| || || | ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 424 ACAAGCTGGTCTTTA-CGTTCATCTCAGGATTGGTCCCTATGTTTGCGCTGAATGGAACT 482
Query 605 TCGGTGGATTTCCTGTTTGGCTTAAGTACATTCCAGGGAT--TAGCTTCAGAACTGATAA 662
| || || |||||||| ||||| || || |||| || || || || || || || ||
Sbjct 483 TTGGAGGGTTTCCTGTGTGGCTCAAATATGTTCCCGGTATGGTAT-TT-AGGACCGACAA 540
Query 663 CGGTCCTTTCAAGGCT-CAAATGCAAAGATTCACC-ACGAAGATTGTTAACATGATGAAA 720
| |||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||
Sbjct 541 TGAACCTTTCAAGGCTGCAA-TGCAAAAATTCACTGA-GAAGATTGTGAGGATGATGAAA 598
Query 721 GCTGAGAGGCTT-TTTGA-ATCTCAAGGCGGTCCTATAATCCTCTCTCAGATTGAAAATG 778
| || | || ||||| | ||||||| || || || || || || ||||| || ||||
Sbjct 599 GAAGAAAAA-TTATTTGAGA-CTCAAGGAGGACCCATCATTCTGTCACAGATAGAGAATG 656
Query 779 AATATGGACCAATGGAGTATGAGCTTGGTGCACC-GGGACGGTCATACACCAACTGGGCA 837
| ||||||||||| |||| ||| | || ||||| |||| || ||||||| || |||| |
Sbjct 657 AGTATGGACCAATAGAGTGGGAGATAGGAGCACCAGGGAAGG-CATACACAAAATGGGTA 715
Query 838 GCT-AAGATGGCGGTGGGGCTAGGCACTGGTGTCCCTTGGGTCATGTGCAAACAAGACGA 896
||| || ||||| || || |||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||
Sbjct 716 GCTGAA-ATGGCACAAGGACTCTCCACTGGTGTCCCATGGATTATGTGCAAGCAAGATGA 774
Query 897 TGCTCCCGACCCCATTATCAATGCTTGCAATGGATTCTACTGTGATTACTTCTCCCCAAA 956
|||||| || | ||||| || | || ||||| || || ||||| | ||| |||||
Sbjct 775 TGCTCCTAACTCTATTATAAACACATGTAATGGGTTTTATTGTGAGAATTTCAAACCAAA 834
Query 957 CAAGG-CTTACAAGCCTAAAATGTGGACCGA-AGCCTGGACTGGATGGTTTACAAAGTTT 1014
| || | | ||||| ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 835 CTCGGACA-ATAAGCCGAAAATGTGGACAGAGAAC-TGGACTGGTTGGTTTACAGAGTTT 892
Query 1015 GGAGGCCCAGTTCCTTACCGCCCAGCTGAAGATATGGCCTTTTCTGTTGCAAGGTTTATC 1074
||||| |||| || ||| | ||||| ||||| || ||||| || || || | || ||
Sbjct 893 GGAGGTGCAGTACCATACAGGCCAGCCGAAGACATTGCCTTATCCGTGGCTCGCTTCATA 952
Query 1075 CAAAAGGGTGGATCTTTCATCAACTACTATATGTATCATGGTGGAACGAATTTTGGTCGG 1134
|| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | |
Sbjct 953 CAGAACGGTGGCTCTTTCATCAACTATTATATGTACCATGGAGGAACCAACTTCGA-CAG 1011
Query 1135 A-CTGCTGGTGGTCCGTTTATCGCAACCAGCTATGATTATGACGCTCCTCTTGACGAATA 1193
| | || |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1012 AACAGCCGGTGAA---TTCATCGCCACCAGCTATGACTATGATGCTCCTCTTGATGAATA 1068
Query 1194 TGGACT-C-GAAAGGCAGCCTAAGTGGGGGCACTTGAAA-GATTTGCATAGAG--CAATA 1248
|| | | || || | ||||||| | ||||||||| | | ||||| || || |
Sbjct 1069 CGGGTTACCGAGAGA-A-CCTAAGTATAGTCACTTGAAAAGGCT-GCATA-AGGTCA-TC 1123
Query 1249 AAGCTCTGTGAACCAGCATTAGTATCAGGAGAGCCCACAAG--A-ATGC-CTCTCGGA-A 1303
|||||||| ||||| ||||| || || | || || ||| | | || | ||| ||| |
Sbjct 1124 AAGCTCTGCGAACCGGCATTGGTCTCTGCTGATCCTACA-GTCACAT-CACTCGGGGATA 1181
Query 1304 ACTATCAAGAGGCTCATGTGTACAAAGCCAAA-TCTGGAGCTTGTTCTGCATT-CT-TAG 1360
| | ||||| ||||| |||| ||| | | || || | |||| |||| || || |
Sbjct 1182 A--A-CAAGAAGCTCACGTGTTCAA-GTCTAAGTC---ATCTTGCGCTGCTTTTCTCT-- 1232
Query 1361 CAAATTATAATC-CAAAATCTTAC-GCCAA-AGT-TTCTTTCG-GGAGCAATCACTACAA 1415
|||| || || | ||| ||| | || || ||| || ||| | ||| | | || || |
Sbjct 1233 CAAACTACAA-CACAAGTTCTG-CTGC-AAGAGTCTTGTTTGGCGGATCTA-CA-TATGA 1287
Query 1416 TCTACCTCCGTGGTCTATTAGTATTCT-CCCAGACTGCAAAAACACAGT-TTACAACACA 1473
||| ||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||
Sbjct 1288 TCTGCCTCCTTGGTCTGTCAGTATTCTACCC-GACTGCAAAA-CTGAGTATTACAACACT 1345
Query 1474 GCCAGGGT 1481
|||| |||
Sbjct 1346 GCCAAGGT 1353
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 137959093250
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5