BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg929511
Length=3335
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G16785.1 | Symbols: PLDP1, PLDZ1, PLDZETA1, PLD ZETA 1 | pho... 5638 0.0
> AT3G16785.1 | Symbols: PLDP1, PLDZ1, PLDZETA1, PLD ZETA 1 | phospholipase
D P1 | chr3:5711082-5719023 FORWARD LENGTH=3865
Length=3865
Score = 5638 bits (3053), Expect = 0.0
Identities = 3244/3337 (97%), Gaps = 9/3337 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GTTTGCAGAGATCAGA-AAATGGCATCTGAGCAGTTGATGTCTCCCGCCAGTGGTGGTGG 61
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 GTTTGAAGAGATCAGAGAAATGGCATCTGAGCAGTTGATGTCTCCCGCCAGTGGTGGT-- 286
Query 62 AGGACGCTACTTTCAGATGCAGCCTGAGCAGTTTCCTTCCATGGTCTCTTCGTTGTTTTC 121
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||
Sbjct 287 -GGACGCTACTTTCAGATGCAGCCTGAGCAATTTCCTTCGATGGTCTCTTCGCTCTTCTC 345
Query 122 GTTT-GCGCCGGCTCCTACGCAGGAGTCTAATCGCATATTTGAAGAATTACCCAAAGCAG 180
||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||
Sbjct 346 -TTTCGCGCCGGCTCCTACGCAGGAGACTAATCGTATTTTTGAAGAATTACCAAAAGCAG 404
Query 181 TTATCGTCTCTGTCTCTCGGCCTGATGCTGGCGATATTAGCCCTGTACTCTTGTCTTACA 240
| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 TGATCGTCTCTGTCTCTCGCCCTGATGCCGGCGATATTAGCCCTGTACTCTTGTCTTACA 464
Query 241 CCATTGAGTGCCAATACAAGCAGTTCAAGTGGCAACTTGTGAAGAAAGCATCTCAAGTAT 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 465 CCATTGAGTGCCAATACAAGCAGTTCAAGTGGCAGCTTGTGAAGAAAGCATCTCAAGTCT 524
Query 301 TTTATTTGCATTTTGCATTGAAGAAACGTGCTTTTATTGAAGAAATTCACGAGAAGCAGG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 TTTATTTGCATTTTGCATTGAAGAAACGTGCTTTTATTGAAGAAATTCACGAGAAGCAGG 584
Query 361 AACAGGTTAAAGAATGGCTTCAAAATCTAGGAATAGGGGATCATGCACCCGTTGTGCAAG 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 585 AACAGGTTAAAGAATGGCTTCAAAATCTAGGAATAGGGGATCATCCACCCGTTGTGCAAG 644
Query 421 ATGAAGATGCTGATGAAGTTCCTCTACATCAAGATGAGAGTGCCAAAAATAGAGATGTTC 480
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 ATGAAGATGCTGATGAAGTTCCGCTACATCAAGATGAAAGTGCCAAAAATAGAGATGTTC 704
Query 481 CCTCAAGCGCTGCTTTGCCAGTCATTCGTCCTTTGGGAAGACAGCAGTCCATATCAGTCA 540
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 705 CTTCGAGCGCTGCTTTGCCAGTCATTCGTCCTTTGGGAAGACAGCAGTCCATATCAGTTA 764
Query 541 GAGGAAAGCATGCAATGCAAGAATATCTGAATCATTTTCTAGGGAATCTTGATATTGTCA 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 765 GAGGAAAGCATGCAATGCAAGAATATCTGAATCATTTTCTGGGGAATCTTGATATCGTCA 824
Query 601 ATTCACGGGAGGTTTGCAGGTTTTTGGAGGTCTCGATGTTGTCATTCTCACCAGAGTATG 660
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 825 ATTCACGGGAGGTTTGCAGGTTTTTGGAGGTTTCGATGTTGTCATTCTCACCAGAGTATG 884
Query 661 GGCCCAAATTGAAAGAAGACTATATTATGGTAAAACATCTACCGAAATTTTCAAAGAGTG 720
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 885 GGCCCAAATTGAAAGAAGACTATATCATGGTAAAACATCTACCGAAGTTTTCAAAGAGTG 944
Query 721 ATGATGATTCTAATAGATGCTGTGGATGCTGTTGGTTCTGTTGCTGCAACGATAATTGGC 780
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 945 ATGATGATTCTAATAGATGTTGTGGGTGCTGTTGGTTCTGTTGCTGCAACGATAATTGGC 1004
Query 781 AAAAGGTGTGGGGGGTACTAAAGCCAGGTTTTCTCGCGTTATTGGAAGATCCATTTGATG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 AAAAGGTGTGGGGGGTACTAAAGCCAGGTTTTCTCGCCTTATTGGAAGATCCATTTGATG 1064
Query 841 CGAAGCTATTAGATATAATTGTTTTTGATGTCCTGCCAGTTTCTAATGGAAATGATGGTG 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 CGAAGCTATTAGATATAATTGTTTTTGATGTCCTACCAGTTTCTAATGGAAATGATGGTG 1124
Query 901 TGGATGTATCACTAGCAGTAGAACTGAAGGATCATAATCCTTTGCGGCATGCATTCAAGG 960
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 TGGATATATCACTAGCAGTAGAACTGAAGGATCATAATCCTTTGCGGCATGCATTCAAGG 1184
Query 961 TAACATCTGGAAACAGGAGTATAAGAATAAGGGCAAAGAGTAGTGCAAAAGTTAAAGATT 1020
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAACATCTGGAAACCGGAGTATAAGAATAAGGGCAAAGAATAGTGCAAAAGTTAAAGATT 1244
Query 1021 GGGTGGCTTCTATTAACGATGCTGCTCTTAGACCTCCTGAGGGTTGGTGTCATCCCCATC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1245 GGGTGGCTTCTATTAACGATGCTGCTCTTAGACCTCCTGAGGGTTGGTGCCATCCCCATC 1304
Query 1081 GCTTTGGCTCATATGCTCCACCGAGGGGTTTGACAGATGACGGAAGTCAAGCCCAGTGGT 1140
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 GCTTTGGCTCATATGCTCCGCCGAGGGGTTTGACGGATGACGGAAGTCAAGCCCAGTGGT 1364
Query 1141 TTGTAGATGGTGGGGCAGCTTTTGCAGCCATTGCTGCAGCGATTGAAAATGCTAAATCTG 1200
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 TTGTAGATGGTGGAGCAGCTTTTGCAGCCATTGCTGCAGCGATTGAAAATGCTAAATCTG 1424
Query 1201 AGATTTTCATCTGTGGCTGGTGGGTGTGCCCAGAACTCTATCTTAGGCGCCCTTTTGACC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1425 AGATTTTCATCTGTGGCTGGTGGGTGTGCCCAGAACTCTATCTTAGGCGTCCTTTTGACC 1484
Query 1261 CGCATACTTCATCCAGACTTGATAA-TATGTTGGAGAATAAAGCTAAGCAAGGAGTTCAG 1319
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 CGCATACTTCATCCAGACTTGATAACT-TGTTGGAGAATAAAGCTAAGCAAGGAGTTCAG 1543
Query 1320 ATATACATCCTTCTCTACAAGGAGGTTGCTCTTGCTTTAAAGATCAACAGTGTATATAGC 1379
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 ATATACATCCTTATCTACAAGGAGGTTGCTCTTGCTTTAAAGATCAACAGTGTATATAGC 1603
Query 1380 AAACGCAGGCTTCTTGGCATTCATGAGAATGTGCGGGTACTTCGTTATCCTGATCATTTC 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1604 AAACGCAGGCTTCTTGGCATTCATGAGAATGTGCGGGTACTTCGTTATCCTGATCATTTC 1663
Query 1440 TCAAGTGGTGTCTACCTCTGGTCTCACCATGAAAAACTCGTCATCGTCGATAATCAGGTT 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664 TCAAGTGGTGTCTACCTCTGGTCTCACCATGAAAAACTCGTCATCGTCGATAATCAGGTT 1723
Query 1500 TGCTTTATTGGAGGGCTAGACTTGTGTTTTGGCCGGTATGACACGTTTGAACATAAAGTT 1559
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724 TGCTTTATCGGAGGGCTAGACTTGTGTTTTGGCCGATATGACACGTTTGAACATAAAGTT 1783
Query 1560 GGAGATAACCCTTCTGTGACATGGCCTGGAAAGGACTATTACAACCCCAGAGAGTCTGAA 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1784 GGAGATAACCCTTCTGTGACATGGCCTGGAAAGGACTATTACAACCCCAGAGAGTCTGAA 1843
Query 1620 CCCAATACTTGGGAGGATGCTCTGAAAGATGAATTAAACCGTAAAAAGCATCCACGGATG 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1844 CCCAATACTTGGGAGGATGCTCTGAAAGATGAATTAGAGCGTAAAAAGCATCCACGGATG 1903
Query 1680 CCTTGGCATGATGTGCATTGTGCTTTATGGGGACCACCTTGCCGTGACGTGGCTAGGCAC 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1904 CCTTGGCATGATGTGCATTGTGCTTTATGGGGACCACCTTGCCGTGATGTGGCTAGGCAC 1963
Query 1740 TTTGTTCAACGCTGGAACTATGCTAAGAGAAACAAAGCACCATATGAGGATTCAATTCCG 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1964 TTTGTTCAACGCTGGAACTATGCTAAGAGAAACAAAGCACCATATGAGGATTCAATTCCG 2023
Query 1800 CTTCTTATGCCTCAGCATCACATGGTAATACCCCACTACATGGGAAGGCAAGAGGAGTCA 1859
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2024 CTTCTTATGCCTCAACATCACATGGTTATACCCCACTACATGGGAAGGCAAGAGGAGTCA 2083
Query 1860 GACCCTGAATCCAAGAAAGACGAAGAGAGCATTAAAGGGATTAGAAGAGATGATTCATTT 1919
||| |||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2084 GACATTGAAAGCAAGAAAGAGGAAGACAGTATTAGAGGGATTAGAAGAGATGATTCATTT 2143
Query 1920 TCTTCTAGATCATCTTTGCAGGACATTCCATTACTTTTGCCTCAAGAACCCGTTGATCAG 1979
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2144 TCTTCTAGATCATCTTTGCAGGACATTCCATTACTTTTGCCTCACGAACCAGTTGATCAG 2203
Query 1980 GATGGTTCGAGTAGGGGGCATAAAGAAAATGGAACAAACAATAGAAATGGTCCTTTCTCT 2039
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2204 GATGGTTCGAGTGGGGGGCATAAAGAAAATGGAACAAACAACAGAAATGGTCCTTTCTCT 2263
Query 2040 TTCCGGAAATCAAAAATTGAACCAGTTGATGGAGATACTCCTATGAGGGGCTTTGTAGAT 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 TTCCGGAAATCAAAAATTGAACCAGTTGATGGAGATACTCCTATGAGGGGCTTTGTAGAT 2323
Query 2100 GATCGTAATGGGCTAGATCTTCCAGTAGCAAAGCGTGGTTCTAATGCAATAGATTCAGAG 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 GATCGTAATGGGCTAGATCTTCCAGTAGCAAAGCGTGGTTCTAATGCAATAGATTCAGAG 2383
Query 2160 TGGTGGGAAACACAAGAACATGATTATCAGGTTGGGTCGCCAGATGAGACAGGGCAAGTC 2219
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2384 TGGTGGGAAACACAAGATCATGATTATCAGGTTGGGTCGCCAGATGAGACTGGGCAAGTC 2443
Query 2220 GGTCCGAGAACTTCATGCCGCTGTCAGATTATACGAAGTGTCAGTCAGTGGTCTGCCGGT 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 GGTCCGAGAACTTCATGCCGCTGTCAGATTATACGAAGTGTCAGTCAGTGGTCTGCCGGT 2503
Query 2280 ACAAGCCAAGTTGAAGAGAGTATCCATTCTGCTTACCGTTCTCTCATTGACAAAGCTGAA 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 ACAAGCCAAGTTGAAGAGAGTATCCATTCTGCTTACCGTTCTCTCATTGACAAAGCTGAA 2563
Query 2340 CATTTTATCTACATCGAGAATCAGTTTTTCATATCAGGCCTTTCTGGAGATGACACAATA 2399
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2564 CATTTTATCTACATTGAGAATCAGTTTTTCATATCAGGCCTTTCTGGAGATGACACAGTA 2623
Query 2400 AAGAACCGTGTCTTGGAAGCATTGTACAAGAGGATTTTGCGTGCCCATAACGAGAAGAAA 2459
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 AAGAACCGTGTCTTAGAAGCATTGTACAAGAGGATTTTGCGTGCCCATAACGAGAAGAAA 2683
Query 2460 AGTTTCAGGGTTGTTGTTGTTATACCTCTTCTCCCAGGTTTCCAGGGAGGTATTGACGAC 2519
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 ATTTTCAGGGTTGTTGTTGTTATACCTCTCCTCCCCGGTTTCCAGGGAGGTATTGACGAC 2743
Query 2520 AGTGGTGCAGCATCTGTTAGAGCCATAATGCATTGGCAGTATCGAACCATATACAGAGGA 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2744 AGTGGTGCAGCATCTGTTAGAGCCATAATGCATTGGCAGTATCGAACCATATACAGAGGA 2803
Query 2580 CATAACTCAATATTGACTAATCTTTACAATACTATTGGCGCAAAGGCTCATGATTATATT 2639
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2804 CATAACTCAATATTGACTAATCTTTACAATACTATTGGCGTAAAGGCTCATGATTATATT 2863
Query 2640 TCCTTCTATGGCCTTAGGGCATATGGTAAACTTTCTGAGGATGGACCTGTAGCCACTAGT 2699
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2864 TCCTTCTATGGCCTTAGGGCATATGGTAAACTTTCTGAGGATGGACCTGTCGCCACTAGT 2923
Query 2700 CAGGTGTATGTTCACAGTAAAATCATGATAGTTGATGACCGTGCCGCATTGATTGGATCT 2759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2924 CAGGTGTATGTTCACAGTAAAATCATGATAGTTGATGACCGTGCTGCATTGATTGGATCT 2983
Query 2760 GCCAATATCAACGACCGGAGTTTACTTGGCTCAAGGGATTCTGAGATTGGGGTACTAATA 2819
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2984 GCCAATATTAACGACCGGAGTTTGCTTGGCTCAAGAGATTCTGAGATTGGAGTACTAATC 3043
Query 2820 GAAGACACAGAGTTCGTAGATTCTCGCATGGCAGGAAAACCATGGAAGGCTGGAAAATTT 2879
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3044 GAAGACACAGAGTTAGTAGATTCTCGCATGGCAGGAAAACCATGGAAGGCTGGAAAATTT 3103
Query 2880 TCTTCAAGTCTTAGGCTCTCTTTGTGGTCCGAACACCTTGGACTTCGTACTGGAGAGATC 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3104 TCTTCAAGTCTTAGGCTCTCTTTGTGGTCCGAACACCTTGGACTTCGTACTGGAGAGATC 3163
Query 2940 GACCAGATTATTGATCCAGTCTCTGATTCAACCTACAAGGAGATATGGATGGCAACCGCA 2999
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3164 GACCAGATTATTGATCCCGTCTCTGATTCAACCTACAAGGAGATATGGATGGCAACCGCA 3223
Query 3000 AAGACAAACACAATGATATACCAGGATGTCTTCTCTTGTGTGCCCAATGATCTCATCCAT 3059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 AAGACAAACACAATGATATACCAGGATGTCTTCTCTTGTGTGCCCAATGATCTCATCCAT 3283
Query 3060 TCAAGAATGGCCTTCAGACAAAGCCTATCGTATTGGAAAGAGAAACTGGGACACACAACG 3119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3284 TCAAGAATGGCCTTCAGACAAAGCCTATCGTATTGGAAAGAGAAGCTGGGACACACAACG 3343
Query 3120 ATCGATTTGGGAATAGCACCCGAGCAGCTGGAGTCTTACCACAATGGAGACATCAAGAGA 3179
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3344 ATCGATTTGGGAATAGCACCAGAGAAGCTGGAGTCTTACCACAATGGAGACATCAAGAGA 3403
Query 3180 AGCGATCCAATGGACAGACTAAAGTCGATAAAGGGACATCTCGTCTCTTTCCCTTTAGAT 3239
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3404 AGCGATCCAATGGACAGACTAAAGGCGATAAAAGGACATCTCGTCTCTTTCCCTTTAGAT 3463
Query 3240 TTCATGTGTAAAGAAGATCTAAGACCGGTATTCAATGAGAGTGAATACTACGCCTCCCCT 3299
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 TTCATGTGCAAAGAAGATCTAAGACCGGTCTTCAATGAGAGTGAATACTACGCCTCCCCT 3523
Query 3300 CAAGTCTTCCATTGAGATCAG-ACATCAATTCTTGAC 3335
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3524 CAAGTCTTCCATTGAGATCATTACATCAATTCTTGAC 3560
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 165952247444
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5