BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg929511 Length=3335 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G16785.1 | Symbols: PLDP1, PLDZ1, PLDZETA1, PLD ZETA 1 | pho... 5638 0.0 > AT3G16785.1 | Symbols: PLDP1, PLDZ1, PLDZETA1, PLD ZETA 1 | phospholipase D P1 | chr3:5711082-5719023 FORWARD LENGTH=3865 Length=3865 Score = 5638 bits (3053), Expect = 0.0 Identities = 3244/3337 (97%), Gaps = 9/3337 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3 GTTTGCAGAGATCAGA-AAATGGCATCTGAGCAGTTGATGTCTCCCGCCAGTGGTGGTGG 61 ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 229 GTTTGAAGAGATCAGAGAAATGGCATCTGAGCAGTTGATGTCTCCCGCCAGTGGTGGT-- 286 Query 62 AGGACGCTACTTTCAGATGCAGCCTGAGCAGTTTCCTTCCATGGTCTCTTCGTTGTTTTC 121 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || || Sbjct 287 -GGACGCTACTTTCAGATGCAGCCTGAGCAATTTCCTTCGATGGTCTCTTCGCTCTTCTC 345 Query 122 GTTT-GCGCCGGCTCCTACGCAGGAGTCTAATCGCATATTTGAAGAATTACCCAAAGCAG 180 ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| Sbjct 346 -TTTCGCGCCGGCTCCTACGCAGGAGACTAATCGTATTTTTGAAGAATTACCAAAAGCAG 404 Query 181 TTATCGTCTCTGTCTCTCGGCCTGATGCTGGCGATATTAGCCCTGTACTCTTGTCTTACA 240 | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 405 TGATCGTCTCTGTCTCTCGCCCTGATGCCGGCGATATTAGCCCTGTACTCTTGTCTTACA 464 Query 241 CCATTGAGTGCCAATACAAGCAGTTCAAGTGGCAACTTGTGAAGAAAGCATCTCAAGTAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 465 CCATTGAGTGCCAATACAAGCAGTTCAAGTGGCAGCTTGTGAAGAAAGCATCTCAAGTCT 524 Query 301 TTTATTTGCATTTTGCATTGAAGAAACGTGCTTTTATTGAAGAAATTCACGAGAAGCAGG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 525 TTTATTTGCATTTTGCATTGAAGAAACGTGCTTTTATTGAAGAAATTCACGAGAAGCAGG 584 Query 361 AACAGGTTAAAGAATGGCTTCAAAATCTAGGAATAGGGGATCATGCACCCGTTGTGCAAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 585 AACAGGTTAAAGAATGGCTTCAAAATCTAGGAATAGGGGATCATCCACCCGTTGTGCAAG 644 Query 421 ATGAAGATGCTGATGAAGTTCCTCTACATCAAGATGAGAGTGCCAAAAATAGAGATGTTC 480 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 645 ATGAAGATGCTGATGAAGTTCCGCTACATCAAGATGAAAGTGCCAAAAATAGAGATGTTC 704 Query 481 CCTCAAGCGCTGCTTTGCCAGTCATTCGTCCTTTGGGAAGACAGCAGTCCATATCAGTCA 540 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 705 CTTCGAGCGCTGCTTTGCCAGTCATTCGTCCTTTGGGAAGACAGCAGTCCATATCAGTTA 764 Query 541 GAGGAAAGCATGCAATGCAAGAATATCTGAATCATTTTCTAGGGAATCTTGATATTGTCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 765 GAGGAAAGCATGCAATGCAAGAATATCTGAATCATTTTCTGGGGAATCTTGATATCGTCA 824 Query 601 ATTCACGGGAGGTTTGCAGGTTTTTGGAGGTCTCGATGTTGTCATTCTCACCAGAGTATG 660 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 825 ATTCACGGGAGGTTTGCAGGTTTTTGGAGGTTTCGATGTTGTCATTCTCACCAGAGTATG 884 Query 661 GGCCCAAATTGAAAGAAGACTATATTATGGTAAAACATCTACCGAAATTTTCAAAGAGTG 720 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 885 GGCCCAAATTGAAAGAAGACTATATCATGGTAAAACATCTACCGAAGTTTTCAAAGAGTG 944 Query 721 ATGATGATTCTAATAGATGCTGTGGATGCTGTTGGTTCTGTTGCTGCAACGATAATTGGC 780 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 945 ATGATGATTCTAATAGATGTTGTGGGTGCTGTTGGTTCTGTTGCTGCAACGATAATTGGC 1004 Query 781 AAAAGGTGTGGGGGGTACTAAAGCCAGGTTTTCTCGCGTTATTGGAAGATCCATTTGATG 840 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1005 AAAAGGTGTGGGGGGTACTAAAGCCAGGTTTTCTCGCCTTATTGGAAGATCCATTTGATG 1064 Query 841 CGAAGCTATTAGATATAATTGTTTTTGATGTCCTGCCAGTTTCTAATGGAAATGATGGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1065 CGAAGCTATTAGATATAATTGTTTTTGATGTCCTACCAGTTTCTAATGGAAATGATGGTG 1124 Query 901 TGGATGTATCACTAGCAGTAGAACTGAAGGATCATAATCCTTTGCGGCATGCATTCAAGG 960 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1125 TGGATATATCACTAGCAGTAGAACTGAAGGATCATAATCCTTTGCGGCATGCATTCAAGG 1184 Query 961 TAACATCTGGAAACAGGAGTATAAGAATAAGGGCAAAGAGTAGTGCAAAAGTTAAAGATT 1020 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1185 TAACATCTGGAAACCGGAGTATAAGAATAAGGGCAAAGAATAGTGCAAAAGTTAAAGATT 1244 Query 1021 GGGTGGCTTCTATTAACGATGCTGCTCTTAGACCTCCTGAGGGTTGGTGTCATCCCCATC 1080 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1245 GGGTGGCTTCTATTAACGATGCTGCTCTTAGACCTCCTGAGGGTTGGTGCCATCCCCATC 1304 Query 1081 GCTTTGGCTCATATGCTCCACCGAGGGGTTTGACAGATGACGGAAGTCAAGCCCAGTGGT 1140 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1305 GCTTTGGCTCATATGCTCCGCCGAGGGGTTTGACGGATGACGGAAGTCAAGCCCAGTGGT 1364 Query 1141 TTGTAGATGGTGGGGCAGCTTTTGCAGCCATTGCTGCAGCGATTGAAAATGCTAAATCTG 1200 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1365 TTGTAGATGGTGGAGCAGCTTTTGCAGCCATTGCTGCAGCGATTGAAAATGCTAAATCTG 1424 Query 1201 AGATTTTCATCTGTGGCTGGTGGGTGTGCCCAGAACTCTATCTTAGGCGCCCTTTTGACC 1260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1425 AGATTTTCATCTGTGGCTGGTGGGTGTGCCCAGAACTCTATCTTAGGCGTCCTTTTGACC 1484 Query 1261 CGCATACTTCATCCAGACTTGATAA-TATGTTGGAGAATAAAGCTAAGCAAGGAGTTCAG 1319 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 CGCATACTTCATCCAGACTTGATAACT-TGTTGGAGAATAAAGCTAAGCAAGGAGTTCAG 1543 Query 1320 ATATACATCCTTCTCTACAAGGAGGTTGCTCTTGCTTTAAAGATCAACAGTGTATATAGC 1379 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1544 ATATACATCCTTATCTACAAGGAGGTTGCTCTTGCTTTAAAGATCAACAGTGTATATAGC 1603 Query 1380 AAACGCAGGCTTCTTGGCATTCATGAGAATGTGCGGGTACTTCGTTATCCTGATCATTTC 1439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1604 AAACGCAGGCTTCTTGGCATTCATGAGAATGTGCGGGTACTTCGTTATCCTGATCATTTC 1663 Query 1440 TCAAGTGGTGTCTACCTCTGGTCTCACCATGAAAAACTCGTCATCGTCGATAATCAGGTT 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1664 TCAAGTGGTGTCTACCTCTGGTCTCACCATGAAAAACTCGTCATCGTCGATAATCAGGTT 1723 Query 1500 TGCTTTATTGGAGGGCTAGACTTGTGTTTTGGCCGGTATGACACGTTTGAACATAAAGTT 1559 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1724 TGCTTTATCGGAGGGCTAGACTTGTGTTTTGGCCGATATGACACGTTTGAACATAAAGTT 1783 Query 1560 GGAGATAACCCTTCTGTGACATGGCCTGGAAAGGACTATTACAACCCCAGAGAGTCTGAA 1619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1784 GGAGATAACCCTTCTGTGACATGGCCTGGAAAGGACTATTACAACCCCAGAGAGTCTGAA 1843 Query 1620 CCCAATACTTGGGAGGATGCTCTGAAAGATGAATTAAACCGTAAAAAGCATCCACGGATG 1679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1844 CCCAATACTTGGGAGGATGCTCTGAAAGATGAATTAGAGCGTAAAAAGCATCCACGGATG 1903 Query 1680 CCTTGGCATGATGTGCATTGTGCTTTATGGGGACCACCTTGCCGTGACGTGGCTAGGCAC 1739 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1904 CCTTGGCATGATGTGCATTGTGCTTTATGGGGACCACCTTGCCGTGATGTGGCTAGGCAC 1963 Query 1740 TTTGTTCAACGCTGGAACTATGCTAAGAGAAACAAAGCACCATATGAGGATTCAATTCCG 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1964 TTTGTTCAACGCTGGAACTATGCTAAGAGAAACAAAGCACCATATGAGGATTCAATTCCG 2023 Query 1800 CTTCTTATGCCTCAGCATCACATGGTAATACCCCACTACATGGGAAGGCAAGAGGAGTCA 1859 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2024 CTTCTTATGCCTCAACATCACATGGTTATACCCCACTACATGGGAAGGCAAGAGGAGTCA 2083 Query 1860 GACCCTGAATCCAAGAAAGACGAAGAGAGCATTAAAGGGATTAGAAGAGATGATTCATTT 1919 ||| |||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2084 GACATTGAAAGCAAGAAAGAGGAAGACAGTATTAGAGGGATTAGAAGAGATGATTCATTT 2143 Query 1920 TCTTCTAGATCATCTTTGCAGGACATTCCATTACTTTTGCCTCAAGAACCCGTTGATCAG 1979 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 2144 TCTTCTAGATCATCTTTGCAGGACATTCCATTACTTTTGCCTCACGAACCAGTTGATCAG 2203 Query 1980 GATGGTTCGAGTAGGGGGCATAAAGAAAATGGAACAAACAATAGAAATGGTCCTTTCTCT 2039 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2204 GATGGTTCGAGTGGGGGGCATAAAGAAAATGGAACAAACAACAGAAATGGTCCTTTCTCT 2263 Query 2040 TTCCGGAAATCAAAAATTGAACCAGTTGATGGAGATACTCCTATGAGGGGCTTTGTAGAT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2264 TTCCGGAAATCAAAAATTGAACCAGTTGATGGAGATACTCCTATGAGGGGCTTTGTAGAT 2323 Query 2100 GATCGTAATGGGCTAGATCTTCCAGTAGCAAAGCGTGGTTCTAATGCAATAGATTCAGAG 2159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2324 GATCGTAATGGGCTAGATCTTCCAGTAGCAAAGCGTGGTTCTAATGCAATAGATTCAGAG 2383 Query 2160 TGGTGGGAAACACAAGAACATGATTATCAGGTTGGGTCGCCAGATGAGACAGGGCAAGTC 2219 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2384 TGGTGGGAAACACAAGATCATGATTATCAGGTTGGGTCGCCAGATGAGACTGGGCAAGTC 2443 Query 2220 GGTCCGAGAACTTCATGCCGCTGTCAGATTATACGAAGTGTCAGTCAGTGGTCTGCCGGT 2279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2444 GGTCCGAGAACTTCATGCCGCTGTCAGATTATACGAAGTGTCAGTCAGTGGTCTGCCGGT 2503 Query 2280 ACAAGCCAAGTTGAAGAGAGTATCCATTCTGCTTACCGTTCTCTCATTGACAAAGCTGAA 2339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2504 ACAAGCCAAGTTGAAGAGAGTATCCATTCTGCTTACCGTTCTCTCATTGACAAAGCTGAA 2563 Query 2340 CATTTTATCTACATCGAGAATCAGTTTTTCATATCAGGCCTTTCTGGAGATGACACAATA 2399 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2564 CATTTTATCTACATTGAGAATCAGTTTTTCATATCAGGCCTTTCTGGAGATGACACAGTA 2623 Query 2400 AAGAACCGTGTCTTGGAAGCATTGTACAAGAGGATTTTGCGTGCCCATAACGAGAAGAAA 2459 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2624 AAGAACCGTGTCTTAGAAGCATTGTACAAGAGGATTTTGCGTGCCCATAACGAGAAGAAA 2683 Query 2460 AGTTTCAGGGTTGTTGTTGTTATACCTCTTCTCCCAGGTTTCCAGGGAGGTATTGACGAC 2519 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2684 ATTTTCAGGGTTGTTGTTGTTATACCTCTCCTCCCCGGTTTCCAGGGAGGTATTGACGAC 2743 Query 2520 AGTGGTGCAGCATCTGTTAGAGCCATAATGCATTGGCAGTATCGAACCATATACAGAGGA 2579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2744 AGTGGTGCAGCATCTGTTAGAGCCATAATGCATTGGCAGTATCGAACCATATACAGAGGA 2803 Query 2580 CATAACTCAATATTGACTAATCTTTACAATACTATTGGCGCAAAGGCTCATGATTATATT 2639 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2804 CATAACTCAATATTGACTAATCTTTACAATACTATTGGCGTAAAGGCTCATGATTATATT 2863 Query 2640 TCCTTCTATGGCCTTAGGGCATATGGTAAACTTTCTGAGGATGGACCTGTAGCCACTAGT 2699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2864 TCCTTCTATGGCCTTAGGGCATATGGTAAACTTTCTGAGGATGGACCTGTCGCCACTAGT 2923 Query 2700 CAGGTGTATGTTCACAGTAAAATCATGATAGTTGATGACCGTGCCGCATTGATTGGATCT 2759 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2924 CAGGTGTATGTTCACAGTAAAATCATGATAGTTGATGACCGTGCTGCATTGATTGGATCT 2983 Query 2760 GCCAATATCAACGACCGGAGTTTACTTGGCTCAAGGGATTCTGAGATTGGGGTACTAATA 2819 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 2984 GCCAATATTAACGACCGGAGTTTGCTTGGCTCAAGAGATTCTGAGATTGGAGTACTAATC 3043 Query 2820 GAAGACACAGAGTTCGTAGATTCTCGCATGGCAGGAAAACCATGGAAGGCTGGAAAATTT 2879 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3044 GAAGACACAGAGTTAGTAGATTCTCGCATGGCAGGAAAACCATGGAAGGCTGGAAAATTT 3103 Query 2880 TCTTCAAGTCTTAGGCTCTCTTTGTGGTCCGAACACCTTGGACTTCGTACTGGAGAGATC 2939 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3104 TCTTCAAGTCTTAGGCTCTCTTTGTGGTCCGAACACCTTGGACTTCGTACTGGAGAGATC 3163 Query 2940 GACCAGATTATTGATCCAGTCTCTGATTCAACCTACAAGGAGATATGGATGGCAACCGCA 2999 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3164 GACCAGATTATTGATCCCGTCTCTGATTCAACCTACAAGGAGATATGGATGGCAACCGCA 3223 Query 3000 AAGACAAACACAATGATATACCAGGATGTCTTCTCTTGTGTGCCCAATGATCTCATCCAT 3059 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3224 AAGACAAACACAATGATATACCAGGATGTCTTCTCTTGTGTGCCCAATGATCTCATCCAT 3283 Query 3060 TCAAGAATGGCCTTCAGACAAAGCCTATCGTATTGGAAAGAGAAACTGGGACACACAACG 3119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3284 TCAAGAATGGCCTTCAGACAAAGCCTATCGTATTGGAAAGAGAAGCTGGGACACACAACG 3343 Query 3120 ATCGATTTGGGAATAGCACCCGAGCAGCTGGAGTCTTACCACAATGGAGACATCAAGAGA 3179 |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3344 ATCGATTTGGGAATAGCACCAGAGAAGCTGGAGTCTTACCACAATGGAGACATCAAGAGA 3403 Query 3180 AGCGATCCAATGGACAGACTAAAGTCGATAAAGGGACATCTCGTCTCTTTCCCTTTAGAT 3239 |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3404 AGCGATCCAATGGACAGACTAAAGGCGATAAAAGGACATCTCGTCTCTTTCCCTTTAGAT 3463 Query 3240 TTCATGTGTAAAGAAGATCTAAGACCGGTATTCAATGAGAGTGAATACTACGCCTCCCCT 3299 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3464 TTCATGTGCAAAGAAGATCTAAGACCGGTCTTCAATGAGAGTGAATACTACGCCTCCCCT 3523 Query 3300 CAAGTCTTCCATTGAGATCAG-ACATCAATTCTTGAC 3335 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3524 CAAGTCTTCCATTGAGATCATTACATCAATTCTTGAC 3560 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 165952247444 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5