BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg929588
Length=6215
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G17360.1 | Symbols: POK1 | phragmoplast orienting kinesin 1 ... 9832 0.0
> AT3G17360.1 | Symbols: POK1 | phragmoplast orienting kinesin
1 | chr3:5936108-5946466 FORWARD LENGTH=6462
Length=6462
Score = 9832 bits (5324), Expect = 0.0
Identities = 5937/6232 (95%), Gaps = 45/6232 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGTCCCGAAACGTTCCGAGAATCGAGATGCCGGAATCAGAAGAAAACGAGTTCGCGAGC 80
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCCGAAACGTTCCGAGAATAGAGATGCCGGAATCGGAAGAAAACGAGTTCGCGAGC 60
Query 81 TTGTCTTTGTTTTCGCCTTCAAGAGCTCCTCTGAATTCGATACCGGATCCAAGTCAAATT 140
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGTCTTTGTTTTCGCCTTCAAGACCTCCTCTGAATTCGATACCGGATCCAAGTCAAATT 120
Query 141 CAGAAGGCGAATCATCTACCCGATTTCGATTTGGTTCAGAAATTGGAAGGTACAAGAGCG 200
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAGAAGGCGAATCATCTACCCCATTTCGATTTGGTTCAGAAATTGGAAGGTACAAGAGCG 180
Query 201 CAGCATCAACGAACACTGGGTCCGGAGAAGAGACTCGAAGTTTTGGAAGGTAGAGCTGGA 260
||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CAGCATCAACGAACACTTGGTCCAGAGAAGAAATTTGAAGTTTTGGAAGGTAGAGCTGGA 240
Query 261 AATTCGAGTGATTCGAACCCTAAGATTGTTAATCGTAATGGAAAATCTCGGTCGGAGCCA 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AATTCGAGTGATTCGAACCCTAAGATTGTTAATCGTAATGGAAAATCTCGGTCGGAGCCA 300
Query 321 AACTCTGCGCAGAGTACGCCCACTAGGAACGGTGCTAGGGTTTCTCTTGGAGGGGGTTGT 380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 301 AACTCTGCGCAGAGTACGCCCACTAGGAACGGTGCTAGGGTTTCTCTTGGTGGTGGTTGT 360
Query 381 GCTACCGGCGCAAGAGTTGTTCAGTCTTTCGGTGGAAGAGGAAGGATTCCAAGGGGGA-T 439
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
Sbjct 361 GCTACCGGCGCAAGATTTCTTCAGTCTTTCGGTGGAAGAGGAAGGATTCCGA-GGGGAGT 419
Query 440 TTCTATGGCGGAGTCTGTTAGCTTTGCGGAAACAACTCCACATTTTGAGCTCAATGAAGA 499
|||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 420 TTCTATTGCTGAGTCTGTTAGCTTCGCGGAAACAACTCCACATTTTGAACTCAATGAAGA 479
Query 500 TCATTCGTTTTGGAAAGAGCACAATGTCCAGGTTTTGATAAGGCTGCGGCCATTAAGTAC 559
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||
Sbjct 480 TCATTCGTTTTGGAAAGACCACAATGTGCAGGTTTTGATAAGGCTGAGACCATTAGGCAC 539
Query 560 AATGGAAAGGGCTAGTCAAGGACATGGTAGGTGTTTAAAACAGGAGAGTCCACAAACATT 619
|||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 540 AATGGAAAGGGCTAATCAAGGATATGGTAAGTGTTTAAAACAAGAGAGTCCACAAACATT 599
Query 620 GGTCTGGTTAGGCCATCCAGAGACCAGATTCACCTTTGACCATGTTGCCAGTGAGACAAT 679
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 600 GGTCTGGTTAGGCCATCCAGAGGCCAGATTCACCTTTGACCACGTTGCCAGTGAGACAAT 659
Query 680 ATCTCAGGAAAAGTTATTTCACGTTGCTGGACTCCCCATGGTGGAGAATTGCTTGTCTGG 739
|||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 660 ATCTCAGGAAAAACTGTTTCGCGTTGCTGGACTGCCCATGGTGGAGAATTGCTTATCTGG 719
Query 740 TTACAATAGTTGTGTGTTTGCCTATGGTCAGACTGGTAGTGGCAAGACTTATACTATGAT 799
|||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TTACAACAGCTGTGTGTTTGCCTACGGTCAGACTGGTAGTGGCAAGACTTATACTATGAT 779
Query 800 GGGAGAGATATCTGAGGCAGAGGGAAGCCTCGGTGAAGACTGCGGAGTTACTGCTCGTAT 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GGGAGAGATATCTGAGGCAGAGGGAAGCCTCGGTGAAGACTGCGGAGTTACTGCTCGTAT 839
Query 860 TTTTGAGTATCTATTCTCAAGAATTAAATTGGAAGAAGAGGGAAGGCGAGATGAAAAACT 919
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |
Sbjct 840 TTTTGAGTATCTGTTCTCAAGAATTAAAATGGAAGAAGAGGAAAGGAGAGATGAAAATTT 899
Query 920 GAAATTCAGTTGCAAATGTTCTTTTCTTGAGATATATAACGAACAGATAACTGACCTCTT 979
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 900 GAAGTTCAGTTGCAAATGTTCTTTTCTTGAGATATATAACGAGCAGATAACCGACCTCTT 959
Query 980 GGAACCATCATCAACCAATTTGCAACTCAGAGAAGACTTGGGAAAAGGAGTATATGTTGA 1039
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 960 GGAACCATCGTCAACCAATTTGCAACTTAGAGAAGACTTGGGGAAAGGAGTATATGTTGA 1019
Query 1040 AAATCTTGTAGAGCACAATGTGAGAACTGTTAATGATGTTCTAAAGCTTCTACTACAGGG 1099
|||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 AAATCTTGTAGAACATAATGTGAGAACTGTTAGTGACGTTCTAAAGCTTCTACTACAGGG 1079
Query 1100 AGCAACTAACCGGAAGATTGCTGCAACCCGTATGAACAGTGAAAGCAGCAGATCCCACAG 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AGCAACTAACCGGAAGATTGCTGCAACCCGTATGAACAGTGAAAGCAGCAGATCCCACAG 1139
Query 1160 CGTTTTCACATGTACAATCGAGAGCCTCTGGGAGACAGATTCTCTAACTCGTTCAAGATT 1219
||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CGTTTTCACTTGTACAATTGAGAGTCTCTGGGAGAAAGATTCTCTAACTCGTTCAAGATT 1199
Query 1220 TGCCAGACTAAACTTGGTCGATTTGGCTGGTTCTGAAAGGCAGAAAAGCTCAGGTGCGGA 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TGCCAGACTAAACTTGGTCGATTTGGCTGGTTCTGAAAGGCAGAAAAGCTCAGGTGCGGA 1259
Query 1280 AGGGGATCGCCTAAAAGAAGCAGCAAACATTAACAAATCCTTATCCACTTTGGGCTTAGT 1339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1260 AGGGGATCGCCTAAAAGAAGCAGCAAACATTAACAAATCCTTATCAACTTTGGGCTTGGT 1319
Query 1340 GATAATGTCTCTGGTGGATTTGGCACATGGGAAACATAGACATGTTCCCTATAGAGATTC 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GATAATGTCTCTGGTGGATTTGGCACATGGGAAACATAGACATGTTCCCTATAGAGATTC 1379
Query 1400 TCGACTTACCTTTTTACTGCAGGATTCTCTAGGGGGTAACTCCAAAACAATGATAATAGC 1459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TCGACTTACCTTTTTACTGCAGGATTCTCTAGGGGGTAACTCCAAAACAATGATAATAGC 1439
Query 1460 TAATGTCAGCCCATCTCTTTGCTCTACAAACGAAACCCTCAGCACCCTGAAGTTCGCGCA 1519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TAATGTCAGCCCATCTCTTTGCTCTACAAACGAAACCCTCAGCACCCTGAAGTTCGCGCA 1499
Query 1520 ACGGGCAAAACTAATCCAGAATAATGCTAAAGTCAATGAAGATGCCTCTGGGGATGTTAC 1579
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 ACGGGCAAAACTAATCCAGAATAATGCTAAAGTAAATGAAGATGCCTCTGGGGATGTTAC 1559
Query 1580 AGCACTCCAACAGGAAATAAGAAACTTAAAGGTCCAACTGTCTTCTCTTTTGAAGAACCA 1639
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1560 AGCACTCCAACAGGAAATAAGAAAGTTAAAGGTCCAACTGACTTCTCTTCTGAAGAACCA 1619
Query 1640 TGACTCTTGTGGGGCTCTTTCAGACTGCGTATCTTCTCATGAAGAATCCAGATACTCTGG 1699
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TGACTCTTGTGGGGCTCTTTCAGACTGCATATCTTCTCTTGAAGAATCCAGATACTCTGG 1679
Query 1700 CACATGTAAAGTAGCAGGCGAAACAAGACAAGACAAATGTCACTGTCAGGTGAAAAATAT 1759
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TACATGTAAAGTAGCAGGAGAAACAAGACAAGACAAGTGTCACTGTCAGGTGAAAAATAT 1739
Query 1760 GAAAGATAATTTGATTGGTGCTCTCAGAAGGGAAAAGATTGCTGAAACTGCCCTTCAGAA 1819
||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1740 GAACGATAATATGATTGGTGCTCTCAGAAGGGAAAAGATTGCTGAATCTGCCCTTCAGAA 1799
Query 1820 GTCCGAGGCTGAGATTGAGCGTATAGACTGCTTGGTTAGAGACATGGAAGAAGATGCCAA 1879
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1800 GTCCGAGGCTGAGATTGAGCGTATAGATTGCTTGGTTAGAGACATGGAAGAAGATGCTAA 1859
Query 1880 GCGCATTAAAATAATGCTTAATCTTAGGGAGGAGAAAGTTGGAGAGATGGAATTCTGTAC 1939
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 GCGCATTAAAATAATGCTTAATCTTAGGGAAGAGAAAGTTGGAGAGATGGAATTCTGTAC 1919
Query 1940 GCCTGGTCCATTGATGACAAAAGAGTGTCTCATTGAAGAAAATAAAACTCTAAAAGGAGA 1999
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GTCTGGTTCATTGATGACAAAAGAGTGTCTCATTGAAGAAAATAAAACTCTAAAAGGAGA 1979
Query 2000 GATCAAGCTTCTTCGCGACAGCATTGACAAGAATCCAGAGTTGACACGTTCGGCCTTGGA 2059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1980 GATCAAGCTTCTTCGCGACAGCATTGACAAGAATCCAGAGTTGACACGTTCAGCCTTGGA 2039
Query 2060 GAACACCAAGCTCTGGGAGCAGCTACAACGATATCAGAACTTTTATGAGCATGGGGAACG 2119
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2040 GAACACCAAGCTCCGGGAGCAGCTACAACGATATCAGAAATTTTACGAGCATGGGGAACG 2099
Query 2120 AGAGGCATTGGTTGCTGAGGTGACAAGACTACGTGACCAGCTTCTTGATGTTCTTGAAGC 2179
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AGAGGCATTACTTGCTGAGGTGACAGGACTACGTGACCAGCTTCTTGATGTTCTTGAAGC 2159
Query 2180 AAAAGATGAGTCCTTTCCTAAACACG--A-GAA------CGAAATGGAAAAGGAATTCGA 2230
||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 AAAAGATGAATCCTTTTCTAAACACGTTATGAAGGAGAACGAAATGGAAAAGGAATTCGA 2219
Query 2231 AGACTGCAGAAACATGAACTCTAGTTTGATCAGAGAACTAGATGAAATACAAGCAGGACT 2290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 AGACTGCAGAAACATGAACTCTAGTTTGATCAGAGAACTAGATGAAATACAAGCAGGACT 2279
Query 2291 TGGAAGACACTTGAATTTCGATCAAATACAATCCAACTTTGATGCATCTTCCACCAGTGG 2350
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 2280 TGGAAGATACTTGAATTTCGATCAAATACAATCCAACGTTGTTGCATCTTCCACCAGAGG 2339
Query 2351 AGCTGAGCAGGCAGAAACAATGCCAACTATAAGTGAAACCCAAGAGGAGGTGGCTATTTC 2410
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AGCTGAGCAGGCAGAAACAATGCCAACTATAAGTGAAATCCAAGAGGAGGTGGCTATTTC 2399
Query 2411 AGAGAGTAAAAACTATG---------CACTAGTGAAGACTGATGAGGGGATAGACCGGTC 2461
| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 ACATAGTAAAAACTATGATAGAGGTGCACTAGTGAAGACAGATGAGGGGATAGACCGGTC 2459
Query 2462 AATCCTGCAGTTCAAGTTAGGGAAACTAATGAAGGACCTTGAGGAGGCCAGAACACTTAA 2521
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2460 AATCCTGCAGTTCAAGTTAGGGAAGTTAATGAAGGACCTCGAGGAGGCCAGAACACTCAA 2519
Query 2522 TTGTCAATATGAAAAGGAGCATATGTCGCAGTTATCTCAACAGGAAGACATTGAAGTAGT 2581
|||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2520 TTGTAAATATGAAAAAGATCATAAGTCGCAGTTATCTCAACAAGAAGACATTGAAGTAGT 2579
Query 2582 CCGTGAGCAAGTTGAGACAGAAACTGCCAGAACCATTCTTGAGTTGCAGGAGGAGGTGAT 2641
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2580 CCGTGAGCAAGTCGAGACAGAAACTGCTAGAACCATTCTTGAGTTGCAGGAAGAGGTGAT 2639
Query 2642 TGCTCTCCAGTCTGATTTTCAAAGAAGAATCTGTAACTTGACCGAGGAAAATCAATCGAT 2701
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2640 TGCTCTCCAGTCTGAATTTCAAAGAAGAATCTGTAACTTGACCGAGGAAAATCAGTCGAT 2699
Query 2702 GAAAA-ATACTATTACTGCTAGAGAGGCAGAAATAAGAGCACTTAACCAAGACTGGGAAA 2760
|||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 -AAAAGATACTATAACTGCTAGAGAGTCAGAAATAAGAGCACTTAACCAAGACTGGGAAA 2758
Query 2761 AGGGTACCTTAGAACTGACAAATTTCATCGTCGATGGGTCTAAATCCATCAAAAATGCCT 2820
||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2759 AGGCTACCTTAGAACTGACTAATTTCATCGTCGCTGGGTCCAAATCCATCAAAAATGCCT 2818
Query 2821 CTACACAGATTGAAAGTATAATCTGTTCATTTCCACAAGTGAATGCGTGGATAGGTGATT 2880
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 CTACACAGATTGAAAGTATCATCTGTTCATTTCCACAAGTGAATGCGTGGATAGGTGATT 2878
Query 2881 ATGTTGAGAAGGCTGCAAAAAATTGTATAAAAAAGGAAGAAACAATTTTGCTTCTACAGA 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2879 ATGTTGAGAAGGCTGCAAAAAATTGTATAAAAAAGGAAGAAACAATTTTACTTCTACAGA 2938
Query 2941 AAAGCTTGGAAGATGCACGGATATTAGTAGCAGAGATGAATTTGAAGCTTAATTCCTTAA 3000
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2939 AAAGCTTGGAAGATGCAAGGATATTAGTAGCAGAGATGAATTTGAAGCTGAATTCTTTAA 2998
Query 3001 AGGGCGCAACAATTGCTCTCAACAAATTTCAACTGGGTGGCAATGCTGCAACCACTGAAG 3060
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2999 AGGGCGCAACAATTGCTCTCAACGAATTTCAACTGGGTGGCAATGCTGCAACGACTGAAG 3058
Query 3061 AGGCTTTCAACTTGAATAATGATGTAGACAGGATGAGCAATGAGGTAGACACGCTTGAGA 3120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 AGGCTTTCAACTTGAATAATGATGTAGACAGGATGAGCGATGAGGTAGACACGCTTGAGA 3118
Query 3121 GTGACTTAAAAGCAAAGCAGTATTCTATTCTGAAAACAGAACGACATGCTGAAGCTGCTT 3180
|| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3119 GTAACTTTAAAGCAAATCAATATTCTATTCTGAAAACAGAACGACATGCCGAAGCTGCTT 3178
Query 3181 TTGCTGTGAAAAAATGGCTTGCTGATTCTAGAAAGCAACACCAAATGCTGGAAAAAGTAC 3240
| ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3179 TAGCTGTTACAAAATGGCTTTCTGATTCTAGAGATCAACACCAAATGATGGAAAAAGTAC 3238
Query 3241 AAGATCAATCAGTTAAAGAATTTGGTACATTAAGTTCAATCTCTGCTTCTCCTAGTGCGG 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3239 AAGATCAATCAGTTAAAGAATTTGGTACATTAAGTTCAATCTCTGCTTCTCTTAGTGCGG 3298
Query 3301 AAGGGAATGCTGATATTAGTTTGTCAAAGGATGGATATCTAAGTGACGCAATATATCCAA 3360
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3299 AAGGGAATGCTGATATTAGTTTGTCAAGGGATGGACATCTAAGTGACGCAACATATCCAA 3358
Query 3361 AGGGTGATGAGCTTTCAACATCAATCTCTGAGTTTTCAAACAGTAGATGGCAACATGATT 3420
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3359 AGGGTGATGAGCTTTCAACATCAAGCTCTGACTTTTCAAACTGTAGATGGCAACATGATT 3418
Query 3421 GTGTACTCAACGTAAAATGTCAAGGAGTTTCAAGTTCTGAATCTGACGCTCAAGAAAGTA 3480
||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3419 GTGCACTGAACGTAAAGTGTCAAGGAGTTTCAAGTTCTGAATCTGACGCTCAAGAAAGTA 3478
Query 3481 ATAACAAGACTACATCAGCAGCTTTGATTGCTAAGAATGGGTCTGCACATTGTGTTTTCT 3540
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||
Sbjct 3479 ATAACAAGATTACATCAGCAGCTTTAATTGCTAAGAATGGTTCTGCACATTCTGTTTACT 3538
Query 3541 GTGGAGAGGGGAGGCAGTCAGTAGAAAAGCCATTGACTATTATGATGGGGAGAGCAGAAA 3600
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 3539 GTGGAGAGGGGAGGCAGTCAGTTGAGAAGCCATTGACCATTATGATGGGGAGAGAAGAAA 3598
Query 3601 CAGAATACAAATGCAGTAATCCGCTTTCTTCTGAGGTATATATGGGTCTTATGCAGAGAA 3660
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 CAGAATACAAATGCAGTAAACCGCTTTCTTCTGGGGTATATATGGGTCTTATGCAGAGAA 3658
Query 3661 TGGATCCTGTTAGAAGTTTCTTCGATCGATTTGAGGAAGTCAATGCTACCATGAAAGAAG 3720
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 TGGATCCTGTTAGAACTTTCTTCGATCGATTTGAGGAAGTCAATGCTACCATGAAAGAAG 3718
Query 3721 CTGATCTGACAATATGTGAATTAGTAAAGGCCAATGAGAAATCAAATAATGTTACTGAAA 3780
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 3719 CTGATCTCACAATATGTGAATTAGTAAAGGCCAATGAAAAATCAAATAGTGTTACTGAAA 3778
Query 3781 TGTGGCTTCAAACCCATGAAGAGCTAATG-GTTAAGGAAAAGTATCTGATGGATGATCTT 3839
||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 3779 TGTGGCTTCAAACCCATGAAGAGTTAATAAGT-AAGGAAAAAAATTTGATGGATGATCTT 3837
Query 3840 GAACAGGTCAAGTCTACACTATCTGCATGTGAAGAAGAAAATCAAATCTTGCTAAATCAA 3899
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 3838 GAACAGGTCAAGTCTATACTATCTGCTTGTGAAGAAGAAAAACAAGTCTTGCTAAATCAA 3897
Query 3900 ACACACTCCACTCTGGCTGACATGGAAAATTCAGTGTCTTTGCTTGAAGAATATATACAG 3959
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3898 ACACACACCACTTTGGCGGACATGGAAAATTCAGTGTCTTTGCTTGAAGAATATTTTCAG 3957
Query 3960 GAAATGAAAAGAGGAGTAGAAGAAACATTAGAGGCATTGTTTTCCCATGTCC-TCTTAGC 4018
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | |||||
Sbjct 3958 GAAATGAAAAGAGGAGTAGAAGAAACAGTAGAGGCTTTGTTTTCCCATGCCCGT-TTAGC 4016
Query 4019 TGGAAAAGAGCTTCTCCAATTGATTTCCAACTCAAGACCATCACTTGAACAGATTGTATC 4078
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4017 TGGAAAAGAGCTTCTCCAATTGATTTCCAACTCAAGACCATCACTTGAACAGATTGCATC 4076
Query 4079 TGAAACCATGGAAAGAGAGTTCACCATGTATGCAACATACCAATGCCACATTGGGAAACT 4138
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4077 TGAATTCATGGAGAGAGAGTTCACCATGTATGCAACATACCAATGCCACATTGGGAAACT 4136
Query 4139 GATCGATCAAATTTTGGATCAGAGAAAACAGGTTATCACTCCCAACCTTTCAGGCCAA-- 4196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4137 GATCGATCAAATTTTGGATCAGAGAAAACAGGTTATCACTCCCAACCTTTCAGGCCAAGA 4196
Query 4197 --C-A----GTCAGTGAAAATTAATGCCATTGGGTATAATGCCGAAGATGAAGTCACTGG 4249
| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4197 AACCAATCAGTCAGTGAAGATTAATGCCATTGGGTATAATGCCGAAGATGAAGTCACTAA 4256
Query 4250 AAAGCAAAACACAGCAGAGATCGTCACAGGTTTAGAAAATGATGAAGTTGTTCAGTCACA 4309
|||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4257 AAAGCAAAGCAGAGAAGAGATTGTCACAGGCTTAGAAAATGATGAAGTTGTTCAGTCACA 4316
Query 4310 TGAAAGCCTATTATATGAGAACTTGTATCTGAAAAAGGAGATTGAGAGAAAAGATGCTTT 4369
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 4317 TGAAAGCCTATTATATGAGAACTTGTATCTGAAAAAGGAGCTTGAGAGAAAAGAAGCTTT 4376
Query 4370 GTTTGAAGGCTTGCTTTTTGATTTTAGGCTACTTCAGGAATCAGCATCAAATAAAAGAGA 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4377 GTTTGAAGGCTTGCTTTTTGATTTTAGGCTACTTCAGGAATCAGCATCAAATAAAAGAGA 4436
Query 4430 TATCAAGAATGAAATGGATGAGCTGTTTGACGCACTATGCAAAGTACAGCTAGAGCTGGA 4489
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4437 TATCAAGAATGAAATGGATGAGCTGTTTGACGCATTATGCAAAGTACAGCTAGAGCTGGA 4496
Query 4490 GCTGAAAGCAAGTCAAGTTCATGATCTTTTTGTTCATAATGAGAATCTTGAAAATTGCTC 4549
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4497 ACTGAAAGCAAGTCAAGTTCATGAGCTTTTTGTTCATAACGAGAATCTTGAAAATTGCTC 4556
Query 4550 CATTGACTTAAAAACGGCTTTGTTCACGTCACAGTCAGATCTAGAGCAGGCCAAAGAGAG 4609
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 4557 CATTGACTTGAAAACGGCGTTGTTCACGTCACAGTCAGATCTAGAGCAGGCTAAACAGAG 4616
Query 4610 GATACAAATTCTTGTGCAGCAGAATGATGAGTTAAGGGTCCTTGTTAGTGATCTATGTAC 4669
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 4617 GATACAAATTCTTGCGGAGCAGAATGATGAGTTAAGGGCCCTTGTTAGTGATCTCTGTAA 4676
Query 4670 GGAAAAG-CTTGCAGCTGAGGAGGGATTGGACGAACAAAAAGATCTTGTCAAAAGGTTGG 4728
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 4677 GGAAAAGGCT-GCAGCTGAGGAGGGATTGGACGAACAAAGGGATCTTGTCAATAGGTTGG 4735
Query 4729 AAAAAGAAATCCTTCACTTGACTACTACATCAGAGAAGCAATTGCTTTCTGCGGTCAAGT 4788
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4736 AAAAAGAAATCCTTCACTTGACTACTACAGCAGAGAAGCAATTGCTTTCTGCGGTCAAGT 4795
Query 4789 CCATTGAAGAAAATTTGAAAAAGACCAGCGATGAGAAAGATCAGCTTGTTGACGAAATAT 4848
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4796 CCATTAAAGAAAATTTGAAAAAGACCAGCGATGAGAAAGATCAGATTGTTGACGAAATAT 4855
Query 4849 GTTCGTTGAATAATAAGCTTGAGTTGGCCTATGCTATAGCTGATGAAAAAGAAGCAATTG 4908
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4856 GTTCGTTAAATAATAAGCTTGAGTTGGCCTATGCTATAGCTGATGAAAAAGAAGCAATTG 4915
Query 4909 CCGTAGAGGCTCGTCAGGAATCTGAAGCAAGTAAAATATATGCTGAACAAAAGGAAGAGG 4968
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4916 CCGTAGAGGCTCATCAGGAATCTGAAGCAAGTAAAATATATGCTGAACAAAAGGAAGAGG 4975
Query 4969 AGGTCAAGATTCTAGAAATTTCTGTTGAGGAACTTGAGCGTACGATAAATATATTAGAAA 5028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4976 AGGTCAAGATTCTAGAAATTTCTGTTGAGGAACTTGAGCGTACGATAAATATATTAGAAA 5035
Query 5029 GACGGGTGTACGATATGGATGAGGAAGTTAAAAGGCATCGTACCACCCAAGATTCGTTAG 5088
|||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5036 GACGGGTGTATGATATGGATGAAGAAGTAAAAAGGCATCGTACCACCCAAGATTCGTTAG 5095
Query 5089 AGACAGAGCTGCAAGCTCTCAGACAGAGATTGTTTAGATTTGAAACCTTCACTGGCACTG 5148
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5096 AGACAGAGCTGCAAGCTCTCAGACAGAGATTGTTTCGATTTGAAAACTTCACTGGCACTA 5155
Query 5149 TGGTCACAACCAATGAAAGCACAGAGGAATATAAGAGTCACATATCCAGGTCGACAGGGC 5208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5156 TGGTCACAACCAATGAAAGCACAGAGGAATATAAGAGTCACATATCCAGGTCGACAGGGC 5215
Query 5209 TGCAAGGTGCGCATAGTCAAATACAAGTCCTCCAGAAGGAAGTAGCAGAACAAACCAAAG 5268
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5216 TGCAAGGTGCGCATAGTCAGATACAAGTCCTACAGAAGGAAGTAGCAGAACAAACCAAAG 5275
Query 5269 AGATTAAACAGCTAAAAGAGTACATCTCCGAAATCTTACTGCATTCTGAGGCCCAAGCAT 5328
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5276 AGATTAAACAGCTAAAAGAGTACATCTCCGAGATCTTACTGCATTCTGAGGCCCAATCAT 5335
Query 5329 CTGCTTACCAAGAGAAGTATAAAACTCTGGAGGTCATGATACGAGACTTCAAACTAGAAG 5388
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 5336 CTGCTTACCAAGAGAAGTATAAGACTCTGGAGGTCATGATTCGAGACTTCAAACTAGAGG 5395
Query 5389 ACTCAAGTTCGTCAGCTGCAGAGACCATATCACATAAAACTGAGAGAAGCTCAATAAGAA 5448
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |
Sbjct 5396 ATTCAAGTTCGTCAGCTGCAGAGACCATATCACATAAAACTGAAAAAAGCTCAACAAGGA 5455
Query 5449 GTAGAGGTTCAAGTTCACCCTTTC-GATGTATAGTTGGGTTGGTACAACAGATGAAACTG 5507
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5456 GTAGAGGTTCAAGTTCACCCTT-CAGATGTATAGTTGGGTTGGTACAACAGATGAAACTG 5514
Query 5508 GAGAAGGATCAGGAATTGACCATGGCAAGGGTTCGTGTTGAAGAATTGGAGTCACTGCTA 5567
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5515 GAGAAGGATCAGGAATTGACAATGGCAAGGGTTCGTGTTGAAGAATTGGAGTCATTGCTA 5574
Query 5568 GCTGTTAAACAGAAAGAGGTTTGCACATTGAGCACGAGGATAGCTGCAGCTGATAGCATG 5627
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5575 GCTGTTAAACAGAAAGAGATTTGCACATTGAACACGAGGATAGCTGCAGCTGATAGCATG 5634
Query 5628 ACTCATGATGTAATTCGGGATTTACTTGGTGTGAAAATGGATATAACCAGCTATGCTGAG 5687
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5635 ACTCATGATGTGATTCGGGATTTACTTGGTGTGAAAATGGATATAACCAGCTATGCTGAG 5694
Query 5688 TTGATTGACCAGCACCAGGTCCAAAGATTGGTTGAAGAGACTCAGCAACACGCTGAAGAG 5747
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||
Sbjct 5695 TTGATTGACCAGCACCAGGTCCAAAGAGTGGTTGAAAAGGCTCAGCAACATGCTGAAGAG 5754
Query 5748 ATCCTGTCCAAGGAGCACGAAATCATCAACCTGAAGAGACATATTGATTGTCT-TGTTAA 5806
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||
Sbjct 5755 ATCCTGTCCAAGGAGCAAGAAGTCATGAACCTGAAGAGACATATTGATTATCTAT-TTAA 5813
Query 5807 GGAAAGAGAGAGTTGCATGTCAGAGTTGAACAAGAAAGATACAGATGTTCTTGCGACACA 5866
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5814 GGATAGAGAGAGTTGCATGTCAGAGTTGAACAAGAAAGATACAGATGTTCTTGCGACACA 5873
Query 5867 GATATCTTTGGACCAACTACAAGAGCGAGTTCAGTTGCTTTCTATGCAAAACGAAATGCT 5926
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5874 GATATCATTAGACCAACTACAAGAGCGAGTTCAGTTGCTTTCTATGCAAAACGAAATGCT 5933
Query 5927 TAAGAATGACAAGAGCAATTTGCTGAGGAAGTTAGCTGAACTTGATCGAACAGTCCACGA 5986
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5934 TAAGAATGACAAGAGCAATTTGCTGAGGAAGTTAGCTGAACTTGATCGAACAGTCCACAA 5993
Query 5987 TGCACGGGCCAGTAACCATCGTGCTTC-ACAGACAACAAAGGATACAGTGTCATTTAAAC 6045
||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5994 TGCACAGGCCAGTAACCATCGTG-TTCCACAGACAACAAAGGATACAGCGTCATTTAAAC 6052
Query 6046 TTGCTGATACTGATTATACCAAGAGACTGGAAAACGCTCAGAAGCTTCTTTCCCATGCTA 6105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6053 TTGCTGATACTGATTATACCAAGAGACTGGAAAACGCTCAGAAGCTTCTTTCCCATGCTA 6112
Query 6106 ATAACGAATTGGCAAAGTATCGCAAAACGAGCAATAACCATCCATCTACAAGAACTCAAG 6165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6113 ATAACGAATTGGCAAAGTATCGCAAAACGAGCAATAACCATCCATCTACAAGAACTCAAG 6172
Query 6166 AACAGAGCTCTGGTACAAGATATCGGTAA-GAGttttttttt-AAAGCTTCT 6215
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 6173 GACAGAGCTCTGGTACAAGATATCGGTAAAGAGTTTTTTTTTTAAAGCTTCT 6224
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 310174980767
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5