BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg929759
Length=3929
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G18730.1 | Symbols: TSK, MGO3, BRU1 | tetratricopeptide repe... 4468 0.0
> AT3G18730.1 | Symbols: TSK, MGO3, BRU1 | tetratricopeptide repeat
(TPR)-containing protein | chr3:6445852-6453159 REVERSE
LENGTH=4260
Length=4260
Score = 4468 bits (2419), Expect = 0.0
Identities = 2675/2798 (96%), Gaps = 20/2798 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGAACGGA-AAA--ATCATCAGATGGGTCGACTAGATGTAGCTGCGGCGAAGAGAGCTT 57
||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 92 AAGAACGGAGAAATCATCATCCGATGGGTCGATTAGATGTAGCTGCGGCGAAGAGAGCGT 151
Query 58 ACCGGAAAGCAGCGGAAGTGGGTGACCGGAGGGAAGAAGCGAGGTGGGCCAACAATGTCG 117
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 152 ACCGGAAAGCAGAAGAAGTGGGTGACCGGAGAGAACAGGCGAGGTGGGCTAACAATGTCG 211
Query 118 GCGATATCCTTAAGAATCATGGAGAGTACGTTGATGCTCTCAAGTGGTTTAGGATCGATT 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 212 GCGATATCCTTAAGAATCATGGAGAGTACGTTGATGCTCTCAAGTGGTTTAGGATTGATT 271
Query 178 ACGATATCTCCGTCAAGTATTTACCTGGGAAAGATTTGTTACCTACTTGTCAGTCTCTTG 237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 ACGATATCTCCGTCAAGTATTTACCTGGGAAAGATTTGTTACCTACTTGTCAGTCTCTTG 331
Query 238 GCGAGATCTATCTCCGTCTCGAGGATTTCGAAGAAGCCTTGATTTATCAGAAGAAGCATT 297
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 GCGAGATCTATCTCCGCCTCGAAAATTTCGAAGAAGCCTTGATTTATCAGAAGAAGCATT 391
Query 298 TACAGCTAGCTGAAGAAGCTAATGACACTGTGGAGAAGCAACGAGCATGTACTCAACTTG 357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 392 TACAGCTAGCTGAAGAAGCTAATGACACTGTGGAGAAGCAAAGAGCATGTACTCAACTTG 451
Query 358 GTCGTACCTACCATGAGATATTCTTGAAGTCTGAGGATGATTGTGAAGCCATTCAGAGTG 417
| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 GACGTACTTACCATGAAATGTTCTTGAAGTCTGAGGATGATTGTGAAGCCATTCAGAGTG 511
Query 418 CTAAAAAGTACTTTAAGAAAGCCATGGAACTTGCACAGATTCTCAAGGAGAAACCACCTC 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 CTAAAAAGTACTTTAAGAAAGCCATGGAACTTGCACAGATTCTCAAGGAGAAACCACCTC 571
Query 478 CTGGTGAATCTAGAGGATTTCTTGAGGAATATATTAATGCACATAACAACATCGGTATGC 537
|||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 CTGGAGAATCTAGCGGATTCCTTGAGGAGTATATTAACGCACATAACAACATCGGTATGC 631
Query 538 TTGACCTTGATCTTGATAATCCTGAAGCAGCCTGCAGTATTCTGAAGAAAGGGCTGCAGA 597
|||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 632 TTGACCTTGATCTTGATAATCCTGAAGCAGCCCGTACTATTCTTAAGAAAGGGCTGCAGA 691
Query 598 TTTGCGATGAAGAGGAGGTGAGAGAATATGATGCTGCGCGGAGTAGGCTTCATCATAACC 657
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 TTTGCGATGAAGAGGAGGTGAGAGAGTATGATGCTGCTCGGAGTAGGCTTCATCATAACC 751
Query 658 TTGGAAATGTTTTTATGGTGCTGAGAAGTTGGGATGAAGCAAAGAAACACATCGAGATGG 717
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 752 TTGGAAACGTTTTTATGGCGCTGAGAAGTTGGGATGAAGCAAAGAAACACATTGAGATGG 811
Query 718 ATATTAATATCTGTCATAAGATCAATCATGTCCAAGGAGAAGCCAAGGGATATATCAATC 777
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 812 ATATTAATATCTGTCATAAGATTAATCATGTCCAAGGAGAAGCGAAGGGGTATATCAATC 871
Query 778 TAGCTGAATTACACAACAAGACCCAAAAGTACAATGATGCACTTTTATGTTATGGTAAAG 837
| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 872 TCGCTGAATTACACAACAAGACCCAAAAGTACATTGATGCTCTTTTATGTTATGGTAAAG 931
Query 838 CTTCTACG-CTAGCGAAATCTATGCAAGACGAGAGTGCATTGGTTGAACAGATAGAGGAT 896
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 932 CTTCTA-GTCTAGCGAAATCTATGCAAGACGAGAGTGCATTGGTTGAACAGATAGAGCAT 990
Query 897 AATATCAAGATAGTCAAGAAATCCATTAAAGTTATGGAAGAATTGAGAGAAGAAGAGCTT 956
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 991 AATACCAAGATAGTCAAGAAATCCATGAAAGTTATGGAAGAATTGAGAGAAGAAGAGCTT 1050
Query 957 ATGCTTAAGAAGTTGTCTACAGAAATGACTGATGCCAAAGGCACTTCGGAGGAACGAAAG 1016
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 ATGCTTAAGAAGTTGTCTGCAGAAATGACTGATGCCAAAGGCACTTCGGAGGAACGAAAG 1110
Query 1017 TCTATGCTCCAAGTACATGCTTGTCTTGGACGTCTTATTGATAAATCTAGCATGGTATTC 1076
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTATGCTCCAAGTAAATGCTTGTCTTGGAAGTCTTATTGATAAATCTAGCATGGTATTC 1170
Query 1077 GCATGGCTGAAGCATCTTCAATTTTCAAAAAGGAAGAAGAAAATATCAGATGAACTCTGT 1136
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 GCATGGCTGAAGCATCTTCAATATTCAAAAAGGAAGAAGAAAATATCAGATGAACTCTGT 1230
Query 1137 GACAAGGAAAAGCTTAGTGATGCCTTCTTGATTGTTGGAGAATCTTACCAAAATCTCAGA 1196
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 GACAAGGAAAAGCTGAGTGATGCCTTCATGATTGTTGGAGAATCTTACCAAAATCTCAGA 1290
Query 1197 AATTTCAGAAAATCCCTGAAGTGGTTCAAT-AGAAGTTATGAGGGATATGAAGCAATCGG 1255
||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 1291 AATTTCAGAAAGTCCCTGAAGTGGTTC-ATAAGAAGTTATGAGGGACATGAAGCAATTGG 1349
Query 1256 TAATCTGGAGGGTCAAGCACTAGCGAAAATTAATATTGGTAATGGTTTGGACTGTATTGG 1315
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 TAATCTGGAGGGTCAAGCACTAGCGAAGATTAATATTGGTAATGGTTTGGACTGTATTGG 1409
Query 1316 GGAATGGACAGGAGCACTCCAGGCATATGAAGAGGGATACAGAATTGCTTTGAAAGCTAA 1375
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410 GGAATGGACAGGAGCACTTCAGGCATATGAAGAGGGGTACAGAATTGCTTTGAAAGCTAA 1469
Query 1376 TCTTCCTTCAATTCAGCTTACTGCACTGGATCATATGCACTATAGCCATATGATGAGATT 1435
|||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1470 TCTTCCTTCAATCCAGCTTTCTGCACTGGAAGATATACACTATATCCATATGATGAGATT 1529
Query 1436 TGGGAATGCTCAAAAAGCCAGGGAATTGAAGGACAA-AATACAAAATCTGAAGGAGTCAG 1494
||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1530 TGGGAATGCTCAAAAAGCCAGTGAATTGAAGGA-AACAATACAAAATCTGAAGGAGTCAG 1588
Query 1495 AACATACTGAGAAAGCCGAATGTAGTACACAAGATGAATGCTCTGAAACCGAGTCAGAAG 1554
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1589 AACATGCTGAGAAAGCCGAATGTAGTACACAAGATGAATGCTCTGAAACTGACTCAGAAG 1648
Query 1555 GGCATGGGAATATATCAAATGATAGGCCAAATGCATGTGGCTCACCAGAACCCCAAACAC 1614
|||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||
Sbjct 1649 GGCATGCGAATGTATCGAATGATAGGCCAAATGCATGTAGCTCACC-G-----CAAACAC 1702
Query 1615 CAAATTCACTTAGATCAGAACGGTTAGCAGATCTGGATGAAGCAAATGATGATGTGCCTC 1674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1703 CAAATTCACTTAGATCAGAACGGTTAGCAGATCTGGATGAAGCAAATGATGATGTGCCAC 1762
Query 1675 TAATTTCATTTCTCCAGCCTGGAAAACGTCTGTTCAAAAGGAAACAAGTTTCAGGAAAAC 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1763 TAATTTCATTTCTCCAGCCTGGAAAACGTCTGTTCAAAAGGAAACAAGTTTCAGGAAAAC 1822
Query 1735 AAGATGTTGACACTGATCAGACTAAGAAAGATTTCTCTATAGTAGTAGACTCTCAGCAGA 1794
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1823 AAGATGCTGACACTGATCAGACGAAGAAAGATTTCTCTGTAGTAGCAGACTCTCAGCAGA 1882
Query 1795 CAGTTGTTGGTCGCAAGCGTATTCGTGTAATCCTCTCTGATGATGAAAGTGAAACCGAAT 1854
|||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1883 CAGTTGCTGGTCGAAAGCGTATTCGAGTAATCCTCTCTGATGATGAAAGTGAGACCGAAT 1942
Query 1855 ATGAGTTGGGATGCCCTAAAGACAGTTCTCACAAAGTTCTAAGGCAGAATGAGGAGGTTT 1914
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1943 ATGAGCTGGGATGCCCTAAAGACAGTTCTCACAAAGTTCTAAGGCAGAATGAAGAGGTTT 2002
Query 1915 CTGACGAAAGTATGTATTTTGATGGTGCTGTTAATTATACGGATAATCGTGCCATCCAAG 1974
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 CTGAGGAAAGTATGTATTTTGATGGTGCTATTAATTATACGGATAATCGTGCCATCCAAG 2062
Query 1975 ATAATGTAGAAGAAGGTTCTTGCTCGTATACGCCTCTCCATCCCGTTAAGGTGGCTCCAA 2034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2063 ATAATGTAGAAGAAGGTTCTTGCTCGTATACGCCTCTCCATCCTATTAAGGTGGCTCCAA 2122
Query 2035 ATGTCAGCAATTGTAGATCTTTGAGCAACAATATAGCTGTTGAAACAACTGGTTGTAGTA 2094
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2123 ATGTCAGCAATTGTAGATCTTTGAGTAATAATATAGCTGTTGAAACAACTGGTCGTCGTA 2182
Query 2095 AAAGAGGATCTCGATGTGATGCTGGCGACTCCAACGGCACG-CACTGCAAAACTGGAGCT 2153
||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2183 AAAAAGGATCTCAATGTGATGTTGGCGACTCCAACGGCACGTC-CTGCAAAACTGGAGCT 2241
Query 2154 GCTCTCGTGAACTTCCACGCTTACTCaaaaactgaggatcaaaaaataaaaattgaaatt 2213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2242 GCTCTCGTGAACTTCCACGCTTACTCAAAAACTGAGGATCGAAAAATAAAAATTGAAATT 2301
Query 2214 gaaaatGAACACATAGCTTTAAACTCCTGTTCTCACAATGATGAGTCTGTGAAGGTGGAA 2273
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2302 GAAAATGAACACATAGCTTTAGACTCCTGTTCTCACGATGATGAGTCTGTGAAGGTGGAA 2361
Query 2274 CTTACTTGCCTATACTATTTACAGCTTCCTGTCGATGAGAAAGCTAAAGGTCTGTTGCCG 2333
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2362 CTTACTTGCCTATACTATTTACAGCTTCCTGACGATGAGAAATCTAAAGGTCTGTTGCCG 2421
Query 2334 ATCATTCATCATTTGGAATATGGTGGAAGAGTTCTGAAACCATTGGATTTATATGCGACT 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 2422 ATCATTCATCATTTGGAATATGGTGGAAGAGTTCTGAAACCATTGGAACTATATGCGATT 2481
Query 2394 CTCAGGGGCTCTTCTCAAAATGTTGTTATTGAAGCTTCCATTAATGGCTGGGTTCACAAG 2453
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2482 CTCAGGGACTCTTCTGAAAATGTTGTTATTGAAGCTTCCGTTGATGGCTGGGTTCACAAG 2541
Query 2454 CGCCTGATGAAACTATACATGGACTGTTGCCAGTCGTTGTCAGAGAAACCCAGTATGAAA 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2542 CGCCTGATGAAACTATACATGGACTGTTGCCAGTCGTTGTCAGAGAAACCCAGTATGAAA 2601
Query 2514 TTGCTTAAGAAATTATATATTTCGGAGGTAGAGGATGATATCAATGTGTCAGAATGTGAA 2573
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2602 TTGCTTAAGAAATTATATATTTCGGAGGTAGAAGATGATATCAATGTGTCAGAATGTGAA 2661
Query 2574 CTGCAAGACATATCAGCTGCTCCATTATTGTGTGCCCTCCATGTCCACAATACAGTTGCT 2633
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2662 CTGCAAGACATATCAGCTGCTCCATTATTGTGTGCCCTCCATGTCCACAATA---TTGCT 2718
Query 2634 ATGTTGGATCTCTCCCACAATATGCTAGGGAATGGAACAATGGAGAAATTGAAACAACTC 2693
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2719 ATGTTGGATCTCTCCCACAATATGCTAGGGAATGGAACAATGGAGAAATTGAAACAACTT 2778
Query 2694 TTTGCCTCATCAAGCCAGATGTATGGTGCTTTAACTTTGGATTTGCACTGCAATCGATTT 2753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2779 TTTGCCTCATCAAGCCAGATGTATGGTGCTTTAACTTTGGATTTGCACTGCAATCGATTT 2838
Query 2754 GGTCCAACTGCTTTGTTTCAGATCTGTGAATGCCCTGT 2791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2839 GGTCCAACTGCTTTGTTTCAGATCTGTGAATGCCCTGT 2876
Score = 1740 bits (942), Expect = 0.0
Identities = 1090/1157 (94%), Gaps = 27/1157 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2789 TGTGTCCAGGAATCGACTTACAGATGCTTGTGGATCATACCTCTCAACTATAGTGAAAAA 2848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2904 TGTGTCCAGGAATCGACTTACAGATGCTTGTGGATCATACCTCTCAACTATAGTGAAAAA 2963
Query 2849 TTGCCGGGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAACATTGTTCACTAACATCAAGAACAATCCA 2908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2964 TTGCCGGGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAACATTGTTCACTTACATCAAGAACAATCCA 3023
Query 2909 AAAAGTTGCTAATGCTTTGGATTCGGAGTCAGGACTTTCACAACTCTGTATAGGTTATAA 2968
||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3024 AAAGGTAGCTAATGCTTTGGATTCGAAGTCAGGACTTTCACAACTCTGTATAGGTTATAA 3083
Query 2969 TAATCCTGTTTCAGGGAGTAGTATTCAAAACCTCTTGGCTAAATTGGCTACTCTAAGCAG 3028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3084 TAATCCTGTTTCAGGGAGTAGTATTCAAAACCTCTTGGCTAAATTGGCTACTCTAAGCAG 3143
Query 3029 CTTTGCAGAACTGAGCATGAATGGCATAAAGCTGAGCAGCCAAGTTGTTGATAGCCTTTC 3088
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3144 CTTTGCAGAACTGAGCATGAATGGCATAAAGCTGAGCAGCCAAGTTGTTGATAGCCTTTA 3203
Query 3089 TGCACTTGTTAAGACTCCATCTCTGTCAAAACTATTGGTTGGCAGCAGTGGAATAGGAAC 3148
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3204 TGCACTTGTTAAGACTCCATCTCTGTCAAAACTTTTGGTTGGCAGCAGTGGAATAGGAAC 3263
Query 3149 GGACGGAGCTGTAAAAGTCACTGAATCTCTATGTTATCTGAAGGAAGAAACTGTGAAGCT 3208
|||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3264 GGACGGGGCTATAAAAGTTACTGAATCTCTATGTTATCAGAAGGAAGAAACTGTGAAGCT 3323
Query 3209 CGACCTTTCGTGTTGTGGACTAGCGTCCCCTTTCTTTATTAAGCTCAACCAAGATATTAC 3268
||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3324 CGACCTTTCATGTTGTGGACTAGCTTCCTCTTTCTTTATTAAGCTCAACCAAGATGTTAC 3383
Query 3269 TCTAACTTCTAGCATTCTTGAGCTTAATGTTGGAGGAAATCCAATCACCGAAGAGGGAAT 3328
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3384 TCTAACCTCTAGCATTCTTGAGTTTAATGTTGGAGGAAATCCAATCACCGAAGAGGGAAT 3443
Query 3329 CAGTGCACTTGGGGAGCTGCTTAGGAATCCTTGTTCAAACATAAAAGTTCTTATTCTAAA 3388
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3444 CAGTGCACTTGGGGAGCTGCTTAGGAATCCTTGTTCAAACATAAAAGTTCTTATTCTAAG 3503
Query 3389 CAAGTGTCATTTGAAGCTCGGTGGACTTGTATGCATAATTCAAGCACTTTCAGATAATAA 3448
|||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3504 CAAGTGTCATCTGAAGCTCGCTGGGCTTCTATGCATAATTCAAGCACTTTCAGATAATAA 3563
Query 3449 GAATCTTGAAGAGCTTAATCTTTCTGAGAATGCTAAGATAGA---TGAGACTGTGTTTGG 3505
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3564 GAATCTTGAAGAGCTTAATCTTTCTGACAATGCTAAGATAGAAGATGAGACTGTGTTTGG 3623
Query 3506 CCAACCTGTGAAGGAA----CA-T---GG-A-A-CA------TG-----TG-AA-TCTGT 3541
|||||||||||||||| || | || | | || || || || |||||
Sbjct 3624 CCAACCTGTGAAGGAAAGATCAGTAATGGTAGAGCAAGAACATGGAACATGTAAATCTGT 3683
Query 3542 AACCTCAATGGACAAAGAACAAGAGCTATGTGAAACCAATATGGAGTGTGATGATCTCGA 3601
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3684 CACCTCAATGGACAAAGAACAAGAGCTATGTGAAACCAATATGGAGTGTGATGATCTCGA 3743
Query 3602 AGTTGCAGACAGCGAAGATGAGCAAATAGAGGAACGAACTGCAACCTCCAGTAGTCTTAG 3661
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3744 AGTTGCAGACAGCGAAGATGAACAAATAGAGGAAGGAACTGCAACCTCGAGTAGTCTTAG 3803
Query 3662 TTTACCACGCAAGAACCATATCGTGAAAGAGATTTCTATCGCTCTTGCAATGGCTAACCA 3721
||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 3804 TTTGCCACGCAAGAACCATATCGTGAAAGAGCTTTCTACCGCTCTTTCAATGGCTAACCA 3863
Query 3722 GTTGCAGATTCTGGACCTAAGCAACAATGGGTTCTCAGTCGAAGGCTTGGAAACATTATA 3781
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 3864 GTTGAAGATTCTGGACTTAAGCAACAATGGGTTCTCAGTTGAAGCCTTGGAAACATTATA 3923
Query 3782 CATGTCATGGTCATCATCAAGCTCCCGAACTGGCATAGCTCAAAGGCATGTGAAAGATGA 3841
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3924 CATGTCATGGTCATCATCAAGCTCCCGAACTGGCATCGCCCAAAGGCATGTAAAAGAAGA 3983
Query 3842 GATTGTCCATTTTTATGTGGAAGGAAAGATGTGTTGCGGAGTCAAATCATGCTGCAGAAA 3901
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3984 GACTGTCCATTTTTATGTCGAAGGAAAGATGTGTTGCGGAGTCAAATCATGCTGCAGAAA 4043
Query 3902 GGACTGAAGAAGATCTT 3918
|||||||||||||||||
Sbjct 4044 GGACTGAAGAAGATCTT 4060
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 195751411586
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5