BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg929807 Length=5629 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G19190.1 | Symbols: ATATG2, ATG2 | autophagy 2 | chr3:663971... 7725 0.0 > AT3G19190.1 | Symbols: ATATG2, ATG2 | autophagy 2 | chr3:6639711-6648857 FORWARD LENGTH=5990 Length=5990 Score = 7725 bits (4183), Expect = 0.0 Identities = 4601/4805 (96%), Gaps = 19/4805 (0%) Strand=Plus/Plus Query 8 AAC-AACAAAGAAGATGGTTTTTCCCTGGAACATTGCTAAATCAGCGGAGGAAGCTTTTT 66 ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 155 AACAAACAAACAAGATGGTGTTTCCGTGGAACATTGCTAAATCAGCGGAGGAAGCTTTTT 214 Query 67 CTAGATGGGCGGTGAAGAGGGTCGTCAAATTCTTGTTGAAGAAGAAATTGGGTAAACTCA 126 |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 215 CTAGATGGGCGGTGAAGAGGGTTGTCAAATTCCTGTTGAAGAAGAAATTGGGTAAACTCA 274 Query 127 TACTTGGTGATATCGACCTTGATCAGCTCGATATTCAGCTTCGTGATGGCTCTATTCAGC 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 275 TACTTGGTGATATCGACCTTGATCAGCTCGATATTCAGCTTCGTGATGGCACTATTCAGC 334 Query 187 TCTCCGATCTTGCTATCAACGTTGACTATTTTAATGACAAGTTTGATGCTCCGCTAC-TC 245 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || Sbjct 335 TCTCCGATCTTGCTATCAACGTTGACTATTTGAATGACAAGTTTGATGCTCCACT-CGTC 393 Query 246 ATAAAGGAAGGCTCAATTGGAGCTTTGGTAGTTAAAATGCCTTGGAAGACTAATGGTTGT 305 ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 394 ATAAAAGAAGGCTCAATTGGATCTTTGTTAGTTAAAATGCCTTGGAAGACCAATGGTTGT 453 Query 306 CAAGTTGAGGTTGACGAGCTTGAGCTTGTTCTTGCACCACGTTTGGAGACTAATGCATCA 365 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 454 CAAGTTGAGGTTGACGAGCTGGAGCTTGTTCTTGCACCACGTTTGGAGAGTAATAAATCA 513 Query 366 TCTTCAAATGAAGCCAGCACCTCCGCCTCTACCCGAGAAGATTCACATAATATACGTCTT 425 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 514 TCTTCAAATGAAGCCAGCACCTCCGCCTCTACACGAGAAGATTTACATAATATACGTCTT 573 Query 426 GAAAGAGGAAAGCATGAGAATGAGATGTTGTTGAACGCTGCAAAATCTGCGTCTATCGAT 485 |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 574 GAAATAGGAAAGCATGAGAATGAGATGTTGATGAATGCTGCAAAATCTGCGTCTATCGAT 633 Query 486 GTCCATGAAGGCGTTAAGACGGTTGCCAAGATAGTGAAATGGTTTCTTACAAGTTTTCAT 545 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 634 GTCCATGAAGGTGTTAAGACGGTTGCCAAGATAGTGAAATGGTTTCTTACTAGTTTTCAC 693 Query 546 GTCAAAATTAAGAATCTGATTATAGCATTTGATCCCGATTTTGGCCAAAAACTGAATGAA 605 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| Sbjct 694 GTCAAAATTAAGAATCTGATTATAGCATTTGATCCCGATTTTGGCAAAAAACAGTCTGAA 753 Query 606 GCTGGTCCTCGGCCAACATTGGTACTTAGAATGACAGAAATAGAGTGTGGAATTTCAGAG 665 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 754 GCTGGTCCTCGACCAACATTGGTACTTAGAATGACAGAAATAGAGTGTGGAATTTCAGAG 813 Query 666 GACCGAGTTTCGGCTGCTGATGTTTCTCCTGATAGTTTCCTTGGTACTAGTCGACTTGCA 725 || | |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| Sbjct 814 GAGCAAGTTTCGGCTAATGAAGTTTCTCCTGATAATTTCCTTGGTATTAATCGACTTGCA 873 Query 726 AACTGTGTGAAATTTCAAGGAGCCGTCGTAGAGCTTTTAAATAT-G--GATGATGATGAT 782 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 874 AACTGTGTGAAGTTTCAAGGAGCCGTTGTAGAGCTTTTAAATATGGATGATGATGATGAT 933 Query 783 GGCGACAAAACTTGTGGTaaaaaaaCATCAAATGATGTGACTTTGATCATGACCGGCGAA 842 |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 934 GGCGACAAAACTTGTGATAAAAAGACATCAAATGATGTGACTTTGATCATGACAGGCGTA 993 Query 843 GGAGGTGGCTTTTCAGGGAGTTTGAATTTTAGTATACCCTGGAAGAATGGTTCTTTAGAC 902 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 994 GGAGGTGGCTTTTCAGGGAGTTTAAATTTTAGTATACCCTGGAAGAATGGTTCTTTAGAC 1053 Query 903 ATTCGCAAGGTGGATGCTGATATTTCTATTGATCCTGTTGAAGTACGACTTCAACCGTCT 962 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1054 ATTCGCAAGGTGGATGCTGATATTTCTATTGATCCTGTTGAAGTACGATTTCAACCGTCT 1113 Query 963 ACAATTAGATGGTTCTTACAATTGTGGAAGACTTTCACAAGTTTCGGATCAGACTGTTGC 1022 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct 1114 ACAATTAGATGGTTCTTACAATTGTGGAAGACGTTCACAAGTTTTGGATCAGACTGTTTC 1173 Query 1023 CCATCAGTTTCTCATTCTGATTCATTGACAGATTCACCTACAATACCTACTAATGTAATG 1082 || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1174 CCCTCAGTTTCTCATTCTGATTTTTTGACGGATTCACCTACAATACCTACTAATGTAATG 1233 Query 1083 GTAACGCCTCCAGCTACACTATCATTGTCAGGTGGCCAAGAATTGGAGCCTGATACTACA 1142 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1234 GTAACGCCTCCAGCTACACTATCCTTGTCAGGTGGCCAAGAATTGGAGCATGATACTACA 1293 Query 1143 CCTAACTTACAGTTTATACCGGATTGGTTTCCGTCTTCTTTCAGCAAGAAAGAAGAGGAT 1202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1294 CCTAACTTACAGTTTATACCGGATTGGTTTCCGTCTTCGTTCAGCAAGAAAGAAGAGGAT 1353 Query 1203 GGAGAAGTAGATATTGGGGCAAGTGTGGACCAGTTTTTTGAATGTTTTGATGCAATGAGG 1262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1354 GGAGAAGTAGATATTGGGGCAAGTGTGGACCAGTTTTTTGAATGTTTTGATGCAATGAGG 1413 Query 1263 AGTTACCAATCAGCTTCTGGAAGCCAAGGAATGTGGAATTGGACATCTTCTGTCTTCACA 1322 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1414 AGTTACCAATCAGCTTCTGGAAGCCAAGGAATGTGGAATTGGACATCTTCTGTTTTCACA 1473 Query 1323 GCAATCAATGCTGCATCTAGCCTTGCTTCTGGGTCTTTGCTTCTTCCTTCTGAACAACAA 1382 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1474 GCAATAAATGCTGCATCTAGCCTTGCTTCGGGGTCTTTGCTTCTTCCTTCTGAACAACAA 1533 Query 1383 CATGTTGAAACAAGTTGTAAAGTATCCTTTGCTGGAGTTTCGGTGGTATTATTTTTCCAA 1442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1534 CATGTTGAAACAAGTTGTAAAGTATCCTTTGCTGGAGTTTCGGTGGTATTATTTTTCCAA 1593 Query 1443 GATGAAGACAATTGGAAGGATGTTTCCACGCGGATTCACTACTTGGGTGCAGAACTCAGA 1502 ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1594 GATGAAGTCAATTGGAAGGGTGTTTCAACGCGGATTCACTACTTGGGTGCCGAACTCAGA 1653 Query 1503 GATATTTCGGTCTCTTTTCAGGTATGCCCTCATGATCTGAGGTTAGAAGGAGAAGTGAAC 1562 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1654 GATATTTCGGTCTCTTTTCAGGTATGCCTTCATGATCTGAGGTTAGAAGGAGAAGTGAAC 1713 Query 1563 AGCATGGAGATCGCCGATTATTTTCAAGCTGGAAATGTTGTTGACACTGCTAATGCTGAA 1622 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1714 AGCATGGAGATCGCCGATTATTGTCAAGGTGGAAATGTTGTTGACACTGCTAATGCTGAA 1773 Query 1623 TCTCAGACTTGTTTGATTAAGGATTTACAAGCGAAAGTTCAGACTAGTCTTCCTCCCTTT 1682 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1774 TCTCAGACTTGTTTGATTAAGGATTTACAAGCCAAAGTTCAGACTAGTCTTCCTCCCTTT 1833 Query 1683 GCCTCGTCTGATATGCATACTGACTCTGAAAGATTAAGCGAGATAGTTTCTGATGGATTT 1742 ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1834 GCCTCTTCTGATATGCATTCTGACTCTGAAAGATTAAGCGAGATAGTTTCTGATGGATTC 1893 Query 1743 CTCTTTCGTAGCAAGGGTTTCGCAGTCAAGACATTGTTGGTTATAGCTGCAGGGGGCAGT 1802 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1894 CTCTTTCGTAACAAGGGTTTCGCAGTCAAGACATTGTTGGTTATAGCTGCAGGGGGCAGT 1953 Query 1803 GGATTTCAGTTTTTTGTCAATTTCCAATCATCCAAAGCCAGCCATAGAGGATCAAACTCA 1862 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1954 GGATTTCAGTTTACTGTCAATTTCCAATCATCCAAAGCCAGCCATAGAGGATCAAACTCA 2013 Query 1863 TTCTCGTTGAGTTTACCACCTACCACATTCTGGCTGAACCTTCATTCAGTAGAAATGTTG 1922 ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2014 TTCTCATTGAGTTTACCCCCTACCACATTCTGGCTGAACCTTCATTCGGTAGAAATGTTG 2073 Query 1923 GTAGATCTTTTCAACGATGTATCCGAATCTATCCCCATATTCAGTCATGAAAGGAATCAG 1982 ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2074 GTAAATCTTTTCAACGATGTATCAGAATCTATCCCCATAACCAGTCATGAAAGGAATCAG 2133 Query 1983 GTGGCATCCTCTTCTAAATCAGAAAGTTTGCGAGGTAGTGTGTCAATCGGGAATGCTCGA 2042 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 2134 GTGGCATCCTCTTCTAAATCAGAAAGTTTGCGAGGTAGTGTGTCAATCTGCAATGCTCGA 2193 Query 2043 GTGATTCTGTGGTTTCCTTTTGAGAGCATTTCAGAAAGGTTATGTAACTCGCTTGGTGAG 2102 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || Sbjct 2194 GTGATTCTGTGGTTTCCTTTTGAGAGCATTTCAGAAAGGTTCTGCAACTCGCTTGGTCAG 2253 Query 2103 CAGTTTATTGTTGTCGACT-TATCTTCCTCTCCGCCATCTGACAAGGATA-GGCGTAAGG 2160 || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| Sbjct 2254 CAATTTATCGTCGTCGA-TCTATCTTCCTCTCCGCCATCTGATAAGGAAAGGGC-TAAGG 2311 Query 2161 AAGGAAGTCCGGGAGAAATGTACTTTACATCGGCTACTCGCTCTATATGCTTCAGTGTCG 2220 || ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2312 AAAGAAGTCCAGGAGAAATGCACTTTCCATCAGCTACTCGCTCTATATGCTTCAGTGTTG 2371 Query 2221 GTGATGCTAGCATCTATTTGGTTACTTCTGACCTTAAAGATTCTGAAACAAATTCATATC 2280 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2372 GTGATGCTAGCATCTATTTGGTCACTTCTGACCTTAAAGATTCTGAAACAAATTCATATC 2431 Query 2281 ATAGGCAGGTTGAATTCTCTGCATATAATATTTTACATACCAACAATAAAACGAGGCACC 2340 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2432 ATAGGCAGGTTGAATTCTCTGCGTATAATATTTTACATACCAACAATAAAACTAGGCACC 2491 Query 2341 AACTTTCAACCATTGGTATGTTTTGGCAAGATAGACCTACTGTTAGCCCTTGGTTAGTGG 2400 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2492 AACTTTCAACAATTGGCATGTTTTGGCAAGATAGACCTACCGTTAGCCCTTGGTTAGTGG 2551 Query 2401 AGAGAGCTAAGATGTTGGCTACGCAGGAAGAATCTATTCAGACAGATAAATCTGGGGGGA 2460 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2552 AGAGAGCTAAGATGTTGGCTACGCAGGAAGAATCTATTCAGACAGATAAATCTGGCGGGA 2611 Query 2461 GTGGCCTTGAGTTTGCTGCTGTTGCTACGCCCAAAGATCAAGAAGACATCTACTCTCGAA 2520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2612 GGGGCCTTGAGTTTGCTGCTGTTGCTACGCCCAAAGATCAAGACGACATCTACTCTCGAA 2671 Query 2521 CCAGGAAAGAAATAATTTTGGCTTCTTCATTCTGCCTTTATCTTCATTTGCTTCCACTTG 2580 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2672 GCAGGAAAGAAATAATTTTGGCTTCTTCGTTCTGCCTTTATGTTCATTTGCTTCCACTTG 2731 Query 2581 CTATCCGTTTAGATGGTTGGCAATACAGCAAATTATGTAATCTCGTAGAAGAGGCAAAAA 2640 |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2732 CTATCCATTTAGATAGTTGGCAATACAGCAAATTATGTAATCTAATAGAAGAGGCAAAAA 2791 Query 2641 TTTGGCTATCACGTATGGCAGCCAATACGGCTGAGCAAACAGGGGAATCTGTTGTGTGTC 2700 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2792 ATTGGCTATCGCGTATGGCAGCCAATACAGCTGAGCAAACAGAGGAATCTGTTGTGTGTC 2851 Query 2701 AAACGTCTCTCGTTGTTGAATGTGATTCTATTGACATTTTGGTTAGGCCAGAACCTCAAA 2760 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct 2852 AAACGTCTCTCGTTGTTGACTGTGATTCTATTGACATATTGGTTAGGCCAGAACCTCGAA 2911 Query 2761 TGGGCATAAAAATTCAGCTTCAGACTGAGCTTCCTGGATCATGGATTCAGTTCAACCTGA 2820 |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2912 TGGGCATAAAAAAACAGCTTCAGACTGAGCTCCCTGGATCATGGATTCAGTTCAACCTGA 2971 Query 2821 GGGTTCAGAAATTAAATCTTATGTCTGTCTCAAATCTTGGCAGTATCTCTGGTGCTGATT 2880 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2972 GGGTTCAGAAATTAAATCTTATGTCTGTCCCAAATCTTGGCAGTGTCTCTGGTGCTGATT 3031 Query 2881 TCTTTTGGTTAGCCCATGGGGAAGGCACCTTATGGGGTTCTGTTACAGGTCTAGCTGACC 2940 ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 3032 TCTTTTGGTTAGCCCATGGGGAAGGTACATTATTGGGTTCTGTTACAGGTCTACCTGATC 3091 Query 2941 AGGAACTGCTATTACTCTCATGTAACAATTCTGCAATCAAGCGTGGTAATGGAGGAGGTT 3000 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3092 AGGAACTGTTATTACTCTCATGTAACAACTCTGCCATCAAGCGTGGTAATGGAGGAGGTT 3151 Query 3001 CAAATGCATTGTCGTCAAGGTTCGCTGGCTTAGATTTTCTGCACTTACAGGAACCAGGAA 3060 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3152 CAAATGCGTTGTCGTCAAGGTTCGCTGGCTTAGATTTTCTGCACTTACAGGAACCAGGAA 3211 Query 3061 TTTGTTATGATTATGTAGCAGTATCTGCCAGGGGCTGTACGATCTCGGCCGTAGGAGGAC 3120 ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3212 TTTGTAACGATTATTTAGCAGTATCTGCCAGGGGCTGTACGATCTCGGCCGTAGGAGGAC 3271 Query 3121 GCCTGGATTGGATAGAAGTGGTTACTTCTTTTTTCACATTTGAAGATGaaaaaaaaTCTC 3180 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| Sbjct 3272 GCCTGGATTGGATAGAAGTGGCTACTTCTTTTTTCTCTTTTGAAGATGAAAAAAAAACTC 3331 Query 3181 AAGAGATGAACTCCAGCTCATCTAGCGGCTCCTCGTTTATTCTGAATTTGGTTGATGTTG 3240 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3332 AAGAGATCAACTCCAGCTCATCTAGCGGCTCCTCGTTTATTCTGAATTTTGTTGATGTTG 3391 Query 3241 GTCTAAGCTATGAGCCCCACCATGAGAATACAGATCATTTACGTCAAGCAAGT-ATTCCA 3299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 3392 GTCTAAGCTATGAGCCCCACCATGAGAATACAGATCATTTACGTCAAGCAAGTGA-TCCA 3450 Query 3300 TGGGTTGCCTGTCTGGTAGCTGCATCTTCTTTTAGCCTTTCAAAGAAAAGTCTGGTTGAT 3359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3451 TGGGTTGCCTGTCTGGTAGCTGCATCTTCTTTTAGCCTTTCAAAGAAAAGTCTGGTTGAT 3510 Query 3360 TCCATAAGAAATGATTATAGAATCAGGATTCAAGATCTTGGGCTTCTTCTGTCCGTGGAT 3419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3511 TCCATAAGAAATGATTATAGAATCAGGATTCAAGATCTTGGGCTTCTTCTGTCCGTGGAT 3570 Query 3420 TTTGACCTTAGCAAGCTTAATGGAACGTACAGTTCAGAGCATCTTCATGAGACTGGCTAT 3479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3571 TTTGACCTTAGCAAGCTTGGTGGAACGTACAGTTCAGAGCATCTTCATGAGTCTGGCTAT 3630 Query 3480 GTTAAAGTTGCTAATGAGGCGCTTATTGAAGCAATTCTAAGGACTAACTCTGAAAATGGC 3539 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3631 GTTAAAGTTGCTAATGATTCGCTTATTGAAGCAATTCTAAGGACTAACTCTGAAAATGGC 3690 Query 3540 CTTCTTTGGGAGTTAGAGTGTTCCAAATCTCACTTATTAATTGAAACTTGCAGTGACACG 3599 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3691 CTTCTTTGGGAGTTAGAGTGTTCAAAATCTCACTTAGTAATTGAAACTTGCAGTGACACG 3750 Query 3600 ACTTCTGGTTTGATTCGCTTGGCCACCCAGCTCCAACAGTTACTTGCTCCTGATTTGGAG 3659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3751 ACTTCTGGTTTGATTCGCTTGGCCACCCAGCTCCAACAGTTACTTGCTCCTGATTTGGAG 3810 Query 3660 GAATCAGCTGTGCACTTGCAGACTCGATGGGACAGCATTCAGCAGGCAAATGCTAGGAAT 3719 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3811 GAATCAGCTGTGCACTTGCAGACTCGATGGGACAGCATTCAACAGGCAAATGCTAGGAAT 3870 Query 3720 GATTTTGATATCAGCGATAGACTCAGTAGCTCCGATTCAAGTGGAGAAATGAAATATTTA 3779 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3871 GATTTAGATATCAGCGATAGACTCAGTAGCTCCGATTCAAGTGGAGAAATGAAATATTTA 3930 Query 3780 AGATTAGAGTCAGAAAATGAAACTGGGGTCATTGGTTTGATGGACGAAATAAATGAAGAT 3839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3931 AGATTAGAGTCAGAAAATGAAACTGGGGTCATTGGTTTGATGGACGAAATAAATGAAGAT 3990 Query 3840 GCATTTCAATTTGATGTCAATCTGACAGGTCAGTCTGACTCTGTGGAATGTCAGAATAAC 3899 ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3991 GCATTCCAATTTGATGTCAATCCGACATATCAGTCTGACTCTGTGGAATGTCAGAATAAC 4050 Query 3900 TATATGTCACCTCATGGAATCTCTCATGGGCAGGCATATAATTGGGTACCTGCTACTCCT 3959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4051 TATATGTCACCTCATGGAATCTCTCATGGGCAGGCATATAATTGGGTACCAGCTACT--- 4107 Query 3960 GAGAAACTACCTTCTAATCACAGTATCTGTGGGTCATCATCTAGAATAAATTCAGAAAGC 4019 |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 4108 GAGAAACTACCTTCTAATCAAAGTATTTGTGGGTCGTCATCCAGAATAAACTCAGAAAGC 4167 Query 4020 AGTAAAATATTCCTAGATAGAGAGAGCCTGCCTGAAATATTTGAAAACTATTGTTTGTCT 4079 ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4168 AGTCAAGTATTCCTAGAAAGAGAGAGCCTGCCTGAAATATTTGAAAACTATTGTTTGTCT 4227 Query 4080 GAGTTCCGTCCATCGTCAGAGGTACCTCAAGAAGGGGATTCATCAGGGAGAGAATTGTTT 4139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 4228 GAGTTCCGTCCATCGTCAGAGGTACCTCAAGAAGGGGATTCGTCGGGGAGAGAATTGTTT 4287 Query 4140 CCTGAGACTGATCTGAGGAGAGGAAATTCTGGGTGGTATGATGACGGGTCCTTAAGAATT 4199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4288 CCTGAGACTGATCTGAGGAGAGGAAATTCTGGGTGGTATGATGACGCGTCCTTAAGAATT 4347 Query 4200 TTAGAAGACCATGTGTCAGAAGCAACTGAGGAAGATCATGAGGAACATATTCTGGATGGA 4259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4348 GTAGAAGACCATGTGTCAGAAGCAACTGAGGAAGATCATGAGGAACACATTCTGGATGGA 4407 Query 4260 GATTTTTCATCTTTTGGCCAGACGTCTTATTCTGCTGTAGCAGCTAATGGACGTATCCTT 4319 || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4408 GAATGTTCATCTTTTGGCCAGACGTCTTATTCTGCTGTAGCAGCTAATGGACGTATCCTT 4467 Query 4320 CTGAAAAACATTGACCTCAAATGGAGAATTTACTCTGGGTCTGATTGGCATGATTCTAGA 4379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 4468 CTGAAAAACATTGACCTCAAATGGAGAATTTACTCTGGCTCTGACTGGCATGATTCTAGA 4527 Query 4380 AAGAAAGGTGAAAATTTTAAACATACAAAGGGCCGGGATACAACTTCGTGCCTTGAGCTG 4439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4528 AAGAAAGGTGAAAATTTTAAACATACAAAGGGCCGGGATACAACTTCGTGCCTTGAGCTG 4587 Query 4440 GAGTTATCTAGGGTCCTTGGATATTACAACTCAAAAGATCACCCAAGAGATTCCTCTTCA 4499 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4588 GAATTATCTGGGGTCCTTGGATATTACAACTCAAAAGATCACCCAAGAGACTCCTCTTCG 4647 Query 4500 TATGCTTTCAAGTTGGAATTAAAAGCTGTCAGACCTGACCCTGAGACGCCACTTGAGGAA 4559 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4648 TATGCATTCAAGTTGGAATTAAAAGCTGTCAGACCTGACCCTGAGACGCCACTCGAGGAA 4707 Query 4560 AACCGCTTCTTTGGAGCTAACAGCCTAGAAAAGCCTGATGTTTCCATGCGAGACTCAGGT 4619 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| Sbjct 4708 AACCGCTTCTTTGGAGCTAACAGCCTAGAAAAGCCTGTTGTTTCTATGGGAGACTCAGGT 4767 Query 4620 GGTTCAAC-ATTGTCGGTTTCTGTTA-AAGGACATAATATCATAGAAGAAGCGCTTCTTC 4677 |||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4768 GGTTCAACGAT-GTCGGTTTCCGT-ACAAGGACATAATATCATAGAAGAAGCGCTTCTTC 4825 Query 4678 CATATTTCCAGAAATTTGACATATGGCCTGTTAGTGTTCGAGTTGATTACAGTCCCCATC 4737 ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4826 CATATTTTCAGAAATTCGACATATGGCCTGTTAATGTTCGAGTTGATTACAGTCCCCATC 4885 Query 4738 ATGTTGATATAGCAGCACTAACAGGAGGGAAATATGCAGAGCTTGTGAACCTTGTACCCT 4797 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4886 ATGTTGATATAGCAGCACTAACAGGAGGGAAATATGCAGAGCTTGTGAACCTTGTACCCT 4945 Query 4798 GGAAG 4802 ||||| Sbjct 4946 GGAAG 4950 Score = 1120 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 628/639 (98%), Gaps = 0/639 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4834 AGGGGATTGAATTACAGCTCAAACATGTGCATGCTGCTGGAATCTATGGCTGGGGAAATG 4893 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4949 AGGGGATTGAATTACAACTCAAACATGTGCATGCTGCTGGAATCTATGGCTGGGGAAATG 5008 Query 4894 TATGTGAGACTATACTGGGAGAATGGTTGGAAGATGTATCTCAGAATCAGATTCATCAAC 4953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5009 TATGTGAGACTATACTGGGAGAATGGTTGGAAGATGTATCTCAGAATCAGATTCATCAAC 5068 Query 4954 TGTTAAAGGGGATCCCAACAGTAAGATCACTTTCTGCTCTTTATGCTGCTGCTCTAAAGC 5013 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5069 TTTTAAAGGGGATCCCAACAGTAAGATCACTTTCTGCTCTTTATGCTGCTGCTCTAAAGC 5128 Query 5014 TGGTCTCGTCACCTGTTGAAAGTTACAGGAAAGATCGAAGGCTAGTGAAGGGAGTCCAAA 5073 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5129 TGGTCTCGTCACCTGTTGAAAGTTACAGGAAAGATCGAAGGCTAGTGAAGGGAGTCCAAA 5188 Query 5074 GAGGTACTATAGCGTTTCTCAGAAGCATCTCACTGGAAGCTGTTGGACTCGGTGTTCACT 5133 |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5189 GAGGGACTGTAGCGTTTCTCAGAAGTATCTCACTGGAAGCTGTTGGACTCGGTGTTCACT 5248 Query 5134 TGGCAGCCGGGGCTCATGATATTTTATTGAGAGCAGAATATATATTTGCAAGTGCACCAT 5193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 5249 TGGCAGCCGGGGCTCATGATATTTTATTGAGAGCAGAATATATATTTGCAAGTTCACCAT 5308 Query 5194 CATTGCCACAACCCCAAGGCAAAACGAAGACGAATGTTAGACATAATCAGCCTAGAAACG 5253 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 5309 CATTGCCACAACCCCAAGGCAGAACGAAGACGAATGTCAGACATAATCAGCCTAGAAATG 5368 Query 5254 CTAAGCAAGGCATGCTTAAGGCATGTGAGAGCATCGGTGATGGAATAGGAAAGACAGCTT 5313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5369 CTAAGCAAGGCATGCTTAAGGCATGTGAGAGCATCGGTGATGGAATAGGAAAGACAGCTT 5428 Query 5314 CTGCATTAGTCCGCACACCTTTGAAGAAGTATCAACGTGGAGACGGAGCTGGATCAGCAT 5373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5429 CTGCATTAGTCCGCACACCTTTGAAGAAGTATCAACGTGGAGACGGAGCTGGATCAGCAT 5488 Query 5374 TTGCAACAGTTGTTCAGGGAGTTCCAACAGCTGCTATAGCACCTGCTTCAGCTTGTGCTA 5433 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5489 TTGCAACTGTTGTTCAGGGAGTTCCAACAGCTGCTATAGCACCTGCTTCAGCTTGTGCTA 5548 Query 5434 GAGCTGTACATAGTGCTCTAGTTGGCATCAGAAATAGGT 5472 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5549 GAGCTGTACATAGTGCTCTTGTTGGCATCAGAAATAGGT 5587 Score = 122 bits (66), Expect = 3e-26 Identities = 76/81 (94%), Gaps = 0/81 (0%) Strand=Plus/Plus Query 5549 ATTATCTCTACTTTCAGTCTTGATCCTGAACATAAAAAGGAATCCATGGAAAAGTACTTA 5608 ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 5590 ATTATTTCTCCTTTCAGTCTTGATCCTGAACATAAAAAGGAATCCATGGAAAAATACTTA 5649 Query 5609 GGCCCTGATAAACAAAGGAAG 5629 ||||| || |||||||||||| Sbjct 5650 GGCCCCGACAAACAAAGGAAG 5670 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 281035214686 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5