BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg929807
Length=5629
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G19190.1 | Symbols: ATATG2, ATG2 | autophagy 2 | chr3:663971... 7725 0.0
> AT3G19190.1 | Symbols: ATATG2, ATG2 | autophagy 2 | chr3:6639711-6648857
FORWARD LENGTH=5990
Length=5990
Score = 7725 bits (4183), Expect = 0.0
Identities = 4601/4805 (96%), Gaps = 19/4805 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 AAC-AACAAAGAAGATGGTTTTTCCCTGGAACATTGCTAAATCAGCGGAGGAAGCTTTTT 66
||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 AACAAACAAACAAGATGGTGTTTCCGTGGAACATTGCTAAATCAGCGGAGGAAGCTTTTT 214
Query 67 CTAGATGGGCGGTGAAGAGGGTCGTCAAATTCTTGTTGAAGAAGAAATTGGGTAAACTCA 126
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 CTAGATGGGCGGTGAAGAGGGTTGTCAAATTCCTGTTGAAGAAGAAATTGGGTAAACTCA 274
Query 127 TACTTGGTGATATCGACCTTGATCAGCTCGATATTCAGCTTCGTGATGGCTCTATTCAGC 186
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 275 TACTTGGTGATATCGACCTTGATCAGCTCGATATTCAGCTTCGTGATGGCACTATTCAGC 334
Query 187 TCTCCGATCTTGCTATCAACGTTGACTATTTTAATGACAAGTTTGATGCTCCGCTAC-TC 245
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||
Sbjct 335 TCTCCGATCTTGCTATCAACGTTGACTATTTGAATGACAAGTTTGATGCTCCACT-CGTC 393
Query 246 ATAAAGGAAGGCTCAATTGGAGCTTTGGTAGTTAAAATGCCTTGGAAGACTAATGGTTGT 305
||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 394 ATAAAAGAAGGCTCAATTGGATCTTTGTTAGTTAAAATGCCTTGGAAGACCAATGGTTGT 453
Query 306 CAAGTTGAGGTTGACGAGCTTGAGCTTGTTCTTGCACCACGTTTGGAGACTAATGCATCA 365
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 454 CAAGTTGAGGTTGACGAGCTGGAGCTTGTTCTTGCACCACGTTTGGAGAGTAATAAATCA 513
Query 366 TCTTCAAATGAAGCCAGCACCTCCGCCTCTACCCGAGAAGATTCACATAATATACGTCTT 425
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 514 TCTTCAAATGAAGCCAGCACCTCCGCCTCTACACGAGAAGATTTACATAATATACGTCTT 573
Query 426 GAAAGAGGAAAGCATGAGAATGAGATGTTGTTGAACGCTGCAAAATCTGCGTCTATCGAT 485
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 GAAATAGGAAAGCATGAGAATGAGATGTTGATGAATGCTGCAAAATCTGCGTCTATCGAT 633
Query 486 GTCCATGAAGGCGTTAAGACGGTTGCCAAGATAGTGAAATGGTTTCTTACAAGTTTTCAT 545
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 634 GTCCATGAAGGTGTTAAGACGGTTGCCAAGATAGTGAAATGGTTTCTTACTAGTTTTCAC 693
Query 546 GTCAAAATTAAGAATCTGATTATAGCATTTGATCCCGATTTTGGCCAAAAACTGAATGAA 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||
Sbjct 694 GTCAAAATTAAGAATCTGATTATAGCATTTGATCCCGATTTTGGCAAAAAACAGTCTGAA 753
Query 606 GCTGGTCCTCGGCCAACATTGGTACTTAGAATGACAGAAATAGAGTGTGGAATTTCAGAG 665
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 GCTGGTCCTCGACCAACATTGGTACTTAGAATGACAGAAATAGAGTGTGGAATTTCAGAG 813
Query 666 GACCGAGTTTCGGCTGCTGATGTTTCTCCTGATAGTTTCCTTGGTACTAGTCGACTTGCA 725
|| | |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 814 GAGCAAGTTTCGGCTAATGAAGTTTCTCCTGATAATTTCCTTGGTATTAATCGACTTGCA 873
Query 726 AACTGTGTGAAATTTCAAGGAGCCGTCGTAGAGCTTTTAAATAT-G--GATGATGATGAT 782
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 874 AACTGTGTGAAGTTTCAAGGAGCCGTTGTAGAGCTTTTAAATATGGATGATGATGATGAT 933
Query 783 GGCGACAAAACTTGTGGTaaaaaaaCATCAAATGATGTGACTTTGATCATGACCGGCGAA 842
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 934 GGCGACAAAACTTGTGATAAAAAGACATCAAATGATGTGACTTTGATCATGACAGGCGTA 993
Query 843 GGAGGTGGCTTTTCAGGGAGTTTGAATTTTAGTATACCCTGGAAGAATGGTTCTTTAGAC 902
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 994 GGAGGTGGCTTTTCAGGGAGTTTAAATTTTAGTATACCCTGGAAGAATGGTTCTTTAGAC 1053
Query 903 ATTCGCAAGGTGGATGCTGATATTTCTATTGATCCTGTTGAAGTACGACTTCAACCGTCT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1054 ATTCGCAAGGTGGATGCTGATATTTCTATTGATCCTGTTGAAGTACGATTTCAACCGTCT 1113
Query 963 ACAATTAGATGGTTCTTACAATTGTGGAAGACTTTCACAAGTTTCGGATCAGACTGTTGC 1022
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 1114 ACAATTAGATGGTTCTTACAATTGTGGAAGACGTTCACAAGTTTTGGATCAGACTGTTTC 1173
Query 1023 CCATCAGTTTCTCATTCTGATTCATTGACAGATTCACCTACAATACCTACTAATGTAATG 1082
|| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 CCCTCAGTTTCTCATTCTGATTTTTTGACGGATTCACCTACAATACCTACTAATGTAATG 1233
Query 1083 GTAACGCCTCCAGCTACACTATCATTGTCAGGTGGCCAAGAATTGGAGCCTGATACTACA 1142
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1234 GTAACGCCTCCAGCTACACTATCCTTGTCAGGTGGCCAAGAATTGGAGCATGATACTACA 1293
Query 1143 CCTAACTTACAGTTTATACCGGATTGGTTTCCGTCTTCTTTCAGCAAGAAAGAAGAGGAT 1202
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 CCTAACTTACAGTTTATACCGGATTGGTTTCCGTCTTCGTTCAGCAAGAAAGAAGAGGAT 1353
Query 1203 GGAGAAGTAGATATTGGGGCAAGTGTGGACCAGTTTTTTGAATGTTTTGATGCAATGAGG 1262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 GGAGAAGTAGATATTGGGGCAAGTGTGGACCAGTTTTTTGAATGTTTTGATGCAATGAGG 1413
Query 1263 AGTTACCAATCAGCTTCTGGAAGCCAAGGAATGTGGAATTGGACATCTTCTGTCTTCACA 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1414 AGTTACCAATCAGCTTCTGGAAGCCAAGGAATGTGGAATTGGACATCTTCTGTTTTCACA 1473
Query 1323 GCAATCAATGCTGCATCTAGCCTTGCTTCTGGGTCTTTGCTTCTTCCTTCTGAACAACAA 1382
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 GCAATAAATGCTGCATCTAGCCTTGCTTCGGGGTCTTTGCTTCTTCCTTCTGAACAACAA 1533
Query 1383 CATGTTGAAACAAGTTGTAAAGTATCCTTTGCTGGAGTTTCGGTGGTATTATTTTTCCAA 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 CATGTTGAAACAAGTTGTAAAGTATCCTTTGCTGGAGTTTCGGTGGTATTATTTTTCCAA 1593
Query 1443 GATGAAGACAATTGGAAGGATGTTTCCACGCGGATTCACTACTTGGGTGCAGAACTCAGA 1502
||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1594 GATGAAGTCAATTGGAAGGGTGTTTCAACGCGGATTCACTACTTGGGTGCCGAACTCAGA 1653
Query 1503 GATATTTCGGTCTCTTTTCAGGTATGCCCTCATGATCTGAGGTTAGAAGGAGAAGTGAAC 1562
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654 GATATTTCGGTCTCTTTTCAGGTATGCCTTCATGATCTGAGGTTAGAAGGAGAAGTGAAC 1713
Query 1563 AGCATGGAGATCGCCGATTATTTTCAAGCTGGAAATGTTGTTGACACTGCTAATGCTGAA 1622
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714 AGCATGGAGATCGCCGATTATTGTCAAGGTGGAAATGTTGTTGACACTGCTAATGCTGAA 1773
Query 1623 TCTCAGACTTGTTTGATTAAGGATTTACAAGCGAAAGTTCAGACTAGTCTTCCTCCCTTT 1682
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TCTCAGACTTGTTTGATTAAGGATTTACAAGCCAAAGTTCAGACTAGTCTTCCTCCCTTT 1833
Query 1683 GCCTCGTCTGATATGCATACTGACTCTGAAAGATTAAGCGAGATAGTTTCTGATGGATTT 1742
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 GCCTCTTCTGATATGCATTCTGACTCTGAAAGATTAAGCGAGATAGTTTCTGATGGATTC 1893
Query 1743 CTCTTTCGTAGCAAGGGTTTCGCAGTCAAGACATTGTTGGTTATAGCTGCAGGGGGCAGT 1802
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894 CTCTTTCGTAACAAGGGTTTCGCAGTCAAGACATTGTTGGTTATAGCTGCAGGGGGCAGT 1953
Query 1803 GGATTTCAGTTTTTTGTCAATTTCCAATCATCCAAAGCCAGCCATAGAGGATCAAACTCA 1862
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1954 GGATTTCAGTTTACTGTCAATTTCCAATCATCCAAAGCCAGCCATAGAGGATCAAACTCA 2013
Query 1863 TTCTCGTTGAGTTTACCACCTACCACATTCTGGCTGAACCTTCATTCAGTAGAAATGTTG 1922
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2014 TTCTCATTGAGTTTACCCCCTACCACATTCTGGCTGAACCTTCATTCGGTAGAAATGTTG 2073
Query 1923 GTAGATCTTTTCAACGATGTATCCGAATCTATCCCCATATTCAGTCATGAAAGGAATCAG 1982
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2074 GTAAATCTTTTCAACGATGTATCAGAATCTATCCCCATAACCAGTCATGAAAGGAATCAG 2133
Query 1983 GTGGCATCCTCTTCTAAATCAGAAAGTTTGCGAGGTAGTGTGTCAATCGGGAATGCTCGA 2042
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2134 GTGGCATCCTCTTCTAAATCAGAAAGTTTGCGAGGTAGTGTGTCAATCTGCAATGCTCGA 2193
Query 2043 GTGATTCTGTGGTTTCCTTTTGAGAGCATTTCAGAAAGGTTATGTAACTCGCTTGGTGAG 2102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||
Sbjct 2194 GTGATTCTGTGGTTTCCTTTTGAGAGCATTTCAGAAAGGTTCTGCAACTCGCTTGGTCAG 2253
Query 2103 CAGTTTATTGTTGTCGACT-TATCTTCCTCTCCGCCATCTGACAAGGATA-GGCGTAAGG 2160
|| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||
Sbjct 2254 CAATTTATCGTCGTCGA-TCTATCTTCCTCTCCGCCATCTGATAAGGAAAGGGC-TAAGG 2311
Query 2161 AAGGAAGTCCGGGAGAAATGTACTTTACATCGGCTACTCGCTCTATATGCTTCAGTGTCG 2220
|| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2312 AAAGAAGTCCAGGAGAAATGCACTTTCCATCAGCTACTCGCTCTATATGCTTCAGTGTTG 2371
Query 2221 GTGATGCTAGCATCTATTTGGTTACTTCTGACCTTAAAGATTCTGAAACAAATTCATATC 2280
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 GTGATGCTAGCATCTATTTGGTCACTTCTGACCTTAAAGATTCTGAAACAAATTCATATC 2431
Query 2281 ATAGGCAGGTTGAATTCTCTGCATATAATATTTTACATACCAACAATAAAACGAGGCACC 2340
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2432 ATAGGCAGGTTGAATTCTCTGCGTATAATATTTTACATACCAACAATAAAACTAGGCACC 2491
Query 2341 AACTTTCAACCATTGGTATGTTTTGGCAAGATAGACCTACTGTTAGCCCTTGGTTAGTGG 2400
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2492 AACTTTCAACAATTGGCATGTTTTGGCAAGATAGACCTACCGTTAGCCCTTGGTTAGTGG 2551
Query 2401 AGAGAGCTAAGATGTTGGCTACGCAGGAAGAATCTATTCAGACAGATAAATCTGGGGGGA 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2552 AGAGAGCTAAGATGTTGGCTACGCAGGAAGAATCTATTCAGACAGATAAATCTGGCGGGA 2611
Query 2461 GTGGCCTTGAGTTTGCTGCTGTTGCTACGCCCAAAGATCAAGAAGACATCTACTCTCGAA 2520
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2612 GGGGCCTTGAGTTTGCTGCTGTTGCTACGCCCAAAGATCAAGACGACATCTACTCTCGAA 2671
Query 2521 CCAGGAAAGAAATAATTTTGGCTTCTTCATTCTGCCTTTATCTTCATTTGCTTCCACTTG 2580
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2672 GCAGGAAAGAAATAATTTTGGCTTCTTCGTTCTGCCTTTATGTTCATTTGCTTCCACTTG 2731
Query 2581 CTATCCGTTTAGATGGTTGGCAATACAGCAAATTATGTAATCTCGTAGAAGAGGCAAAAA 2640
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2732 CTATCCATTTAGATAGTTGGCAATACAGCAAATTATGTAATCTAATAGAAGAGGCAAAAA 2791
Query 2641 TTTGGCTATCACGTATGGCAGCCAATACGGCTGAGCAAACAGGGGAATCTGTTGTGTGTC 2700
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2792 ATTGGCTATCGCGTATGGCAGCCAATACAGCTGAGCAAACAGAGGAATCTGTTGTGTGTC 2851
Query 2701 AAACGTCTCTCGTTGTTGAATGTGATTCTATTGACATTTTGGTTAGGCCAGAACCTCAAA 2760
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2852 AAACGTCTCTCGTTGTTGACTGTGATTCTATTGACATATTGGTTAGGCCAGAACCTCGAA 2911
Query 2761 TGGGCATAAAAATTCAGCTTCAGACTGAGCTTCCTGGATCATGGATTCAGTTCAACCTGA 2820
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2912 TGGGCATAAAAAAACAGCTTCAGACTGAGCTCCCTGGATCATGGATTCAGTTCAACCTGA 2971
Query 2821 GGGTTCAGAAATTAAATCTTATGTCTGTCTCAAATCTTGGCAGTATCTCTGGTGCTGATT 2880
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2972 GGGTTCAGAAATTAAATCTTATGTCTGTCCCAAATCTTGGCAGTGTCTCTGGTGCTGATT 3031
Query 2881 TCTTTTGGTTAGCCCATGGGGAAGGCACCTTATGGGGTTCTGTTACAGGTCTAGCTGACC 2940
||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 3032 TCTTTTGGTTAGCCCATGGGGAAGGTACATTATTGGGTTCTGTTACAGGTCTACCTGATC 3091
Query 2941 AGGAACTGCTATTACTCTCATGTAACAATTCTGCAATCAAGCGTGGTAATGGAGGAGGTT 3000
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3092 AGGAACTGTTATTACTCTCATGTAACAACTCTGCCATCAAGCGTGGTAATGGAGGAGGTT 3151
Query 3001 CAAATGCATTGTCGTCAAGGTTCGCTGGCTTAGATTTTCTGCACTTACAGGAACCAGGAA 3060
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3152 CAAATGCGTTGTCGTCAAGGTTCGCTGGCTTAGATTTTCTGCACTTACAGGAACCAGGAA 3211
Query 3061 TTTGTTATGATTATGTAGCAGTATCTGCCAGGGGCTGTACGATCTCGGCCGTAGGAGGAC 3120
||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3212 TTTGTAACGATTATTTAGCAGTATCTGCCAGGGGCTGTACGATCTCGGCCGTAGGAGGAC 3271
Query 3121 GCCTGGATTGGATAGAAGTGGTTACTTCTTTTTTCACATTTGAAGATGaaaaaaaaTCTC 3180
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||
Sbjct 3272 GCCTGGATTGGATAGAAGTGGCTACTTCTTTTTTCTCTTTTGAAGATGAAAAAAAAACTC 3331
Query 3181 AAGAGATGAACTCCAGCTCATCTAGCGGCTCCTCGTTTATTCTGAATTTGGTTGATGTTG 3240
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3332 AAGAGATCAACTCCAGCTCATCTAGCGGCTCCTCGTTTATTCTGAATTTTGTTGATGTTG 3391
Query 3241 GTCTAAGCTATGAGCCCCACCATGAGAATACAGATCATTTACGTCAAGCAAGT-ATTCCA 3299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3392 GTCTAAGCTATGAGCCCCACCATGAGAATACAGATCATTTACGTCAAGCAAGTGA-TCCA 3450
Query 3300 TGGGTTGCCTGTCTGGTAGCTGCATCTTCTTTTAGCCTTTCAAAGAAAAGTCTGGTTGAT 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451 TGGGTTGCCTGTCTGGTAGCTGCATCTTCTTTTAGCCTTTCAAAGAAAAGTCTGGTTGAT 3510
Query 3360 TCCATAAGAAATGATTATAGAATCAGGATTCAAGATCTTGGGCTTCTTCTGTCCGTGGAT 3419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3511 TCCATAAGAAATGATTATAGAATCAGGATTCAAGATCTTGGGCTTCTTCTGTCCGTGGAT 3570
Query 3420 TTTGACCTTAGCAAGCTTAATGGAACGTACAGTTCAGAGCATCTTCATGAGACTGGCTAT 3479
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3571 TTTGACCTTAGCAAGCTTGGTGGAACGTACAGTTCAGAGCATCTTCATGAGTCTGGCTAT 3630
Query 3480 GTTAAAGTTGCTAATGAGGCGCTTATTGAAGCAATTCTAAGGACTAACTCTGAAAATGGC 3539
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3631 GTTAAAGTTGCTAATGATTCGCTTATTGAAGCAATTCTAAGGACTAACTCTGAAAATGGC 3690
Query 3540 CTTCTTTGGGAGTTAGAGTGTTCCAAATCTCACTTATTAATTGAAACTTGCAGTGACACG 3599
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3691 CTTCTTTGGGAGTTAGAGTGTTCAAAATCTCACTTAGTAATTGAAACTTGCAGTGACACG 3750
Query 3600 ACTTCTGGTTTGATTCGCTTGGCCACCCAGCTCCAACAGTTACTTGCTCCTGATTTGGAG 3659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3751 ACTTCTGGTTTGATTCGCTTGGCCACCCAGCTCCAACAGTTACTTGCTCCTGATTTGGAG 3810
Query 3660 GAATCAGCTGTGCACTTGCAGACTCGATGGGACAGCATTCAGCAGGCAAATGCTAGGAAT 3719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3811 GAATCAGCTGTGCACTTGCAGACTCGATGGGACAGCATTCAACAGGCAAATGCTAGGAAT 3870
Query 3720 GATTTTGATATCAGCGATAGACTCAGTAGCTCCGATTCAAGTGGAGAAATGAAATATTTA 3779
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3871 GATTTAGATATCAGCGATAGACTCAGTAGCTCCGATTCAAGTGGAGAAATGAAATATTTA 3930
Query 3780 AGATTAGAGTCAGAAAATGAAACTGGGGTCATTGGTTTGATGGACGAAATAAATGAAGAT 3839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3931 AGATTAGAGTCAGAAAATGAAACTGGGGTCATTGGTTTGATGGACGAAATAAATGAAGAT 3990
Query 3840 GCATTTCAATTTGATGTCAATCTGACAGGTCAGTCTGACTCTGTGGAATGTCAGAATAAC 3899
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3991 GCATTCCAATTTGATGTCAATCCGACATATCAGTCTGACTCTGTGGAATGTCAGAATAAC 4050
Query 3900 TATATGTCACCTCATGGAATCTCTCATGGGCAGGCATATAATTGGGTACCTGCTACTCCT 3959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4051 TATATGTCACCTCATGGAATCTCTCATGGGCAGGCATATAATTGGGTACCAGCTACT--- 4107
Query 3960 GAGAAACTACCTTCTAATCACAGTATCTGTGGGTCATCATCTAGAATAAATTCAGAAAGC 4019
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 4108 GAGAAACTACCTTCTAATCAAAGTATTTGTGGGTCGTCATCCAGAATAAACTCAGAAAGC 4167
Query 4020 AGTAAAATATTCCTAGATAGAGAGAGCCTGCCTGAAATATTTGAAAACTATTGTTTGTCT 4079
||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4168 AGTCAAGTATTCCTAGAAAGAGAGAGCCTGCCTGAAATATTTGAAAACTATTGTTTGTCT 4227
Query 4080 GAGTTCCGTCCATCGTCAGAGGTACCTCAAGAAGGGGATTCATCAGGGAGAGAATTGTTT 4139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 4228 GAGTTCCGTCCATCGTCAGAGGTACCTCAAGAAGGGGATTCGTCGGGGAGAGAATTGTTT 4287
Query 4140 CCTGAGACTGATCTGAGGAGAGGAAATTCTGGGTGGTATGATGACGGGTCCTTAAGAATT 4199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4288 CCTGAGACTGATCTGAGGAGAGGAAATTCTGGGTGGTATGATGACGCGTCCTTAAGAATT 4347
Query 4200 TTAGAAGACCATGTGTCAGAAGCAACTGAGGAAGATCATGAGGAACATATTCTGGATGGA 4259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4348 GTAGAAGACCATGTGTCAGAAGCAACTGAGGAAGATCATGAGGAACACATTCTGGATGGA 4407
Query 4260 GATTTTTCATCTTTTGGCCAGACGTCTTATTCTGCTGTAGCAGCTAATGGACGTATCCTT 4319
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4408 GAATGTTCATCTTTTGGCCAGACGTCTTATTCTGCTGTAGCAGCTAATGGACGTATCCTT 4467
Query 4320 CTGAAAAACATTGACCTCAAATGGAGAATTTACTCTGGGTCTGATTGGCATGATTCTAGA 4379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4468 CTGAAAAACATTGACCTCAAATGGAGAATTTACTCTGGCTCTGACTGGCATGATTCTAGA 4527
Query 4380 AAGAAAGGTGAAAATTTTAAACATACAAAGGGCCGGGATACAACTTCGTGCCTTGAGCTG 4439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4528 AAGAAAGGTGAAAATTTTAAACATACAAAGGGCCGGGATACAACTTCGTGCCTTGAGCTG 4587
Query 4440 GAGTTATCTAGGGTCCTTGGATATTACAACTCAAAAGATCACCCAAGAGATTCCTCTTCA 4499
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4588 GAATTATCTGGGGTCCTTGGATATTACAACTCAAAAGATCACCCAAGAGACTCCTCTTCG 4647
Query 4500 TATGCTTTCAAGTTGGAATTAAAAGCTGTCAGACCTGACCCTGAGACGCCACTTGAGGAA 4559
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4648 TATGCATTCAAGTTGGAATTAAAAGCTGTCAGACCTGACCCTGAGACGCCACTCGAGGAA 4707
Query 4560 AACCGCTTCTTTGGAGCTAACAGCCTAGAAAAGCCTGATGTTTCCATGCGAGACTCAGGT 4619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||
Sbjct 4708 AACCGCTTCTTTGGAGCTAACAGCCTAGAAAAGCCTGTTGTTTCTATGGGAGACTCAGGT 4767
Query 4620 GGTTCAAC-ATTGTCGGTTTCTGTTA-AAGGACATAATATCATAGAAGAAGCGCTTCTTC 4677
|||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4768 GGTTCAACGAT-GTCGGTTTCCGT-ACAAGGACATAATATCATAGAAGAAGCGCTTCTTC 4825
Query 4678 CATATTTCCAGAAATTTGACATATGGCCTGTTAGTGTTCGAGTTGATTACAGTCCCCATC 4737
||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4826 CATATTTTCAGAAATTCGACATATGGCCTGTTAATGTTCGAGTTGATTACAGTCCCCATC 4885
Query 4738 ATGTTGATATAGCAGCACTAACAGGAGGGAAATATGCAGAGCTTGTGAACCTTGTACCCT 4797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4886 ATGTTGATATAGCAGCACTAACAGGAGGGAAATATGCAGAGCTTGTGAACCTTGTACCCT 4945
Query 4798 GGAAG 4802
|||||
Sbjct 4946 GGAAG 4950
Score = 1120 bits (606), Expect = 0.0
Identities = 628/639 (98%), Gaps = 0/639 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4834 AGGGGATTGAATTACAGCTCAAACATGTGCATGCTGCTGGAATCTATGGCTGGGGAAATG 4893
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4949 AGGGGATTGAATTACAACTCAAACATGTGCATGCTGCTGGAATCTATGGCTGGGGAAATG 5008
Query 4894 TATGTGAGACTATACTGGGAGAATGGTTGGAAGATGTATCTCAGAATCAGATTCATCAAC 4953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5009 TATGTGAGACTATACTGGGAGAATGGTTGGAAGATGTATCTCAGAATCAGATTCATCAAC 5068
Query 4954 TGTTAAAGGGGATCCCAACAGTAAGATCACTTTCTGCTCTTTATGCTGCTGCTCTAAAGC 5013
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5069 TTTTAAAGGGGATCCCAACAGTAAGATCACTTTCTGCTCTTTATGCTGCTGCTCTAAAGC 5128
Query 5014 TGGTCTCGTCACCTGTTGAAAGTTACAGGAAAGATCGAAGGCTAGTGAAGGGAGTCCAAA 5073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5129 TGGTCTCGTCACCTGTTGAAAGTTACAGGAAAGATCGAAGGCTAGTGAAGGGAGTCCAAA 5188
Query 5074 GAGGTACTATAGCGTTTCTCAGAAGCATCTCACTGGAAGCTGTTGGACTCGGTGTTCACT 5133
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5189 GAGGGACTGTAGCGTTTCTCAGAAGTATCTCACTGGAAGCTGTTGGACTCGGTGTTCACT 5248
Query 5134 TGGCAGCCGGGGCTCATGATATTTTATTGAGAGCAGAATATATATTTGCAAGTGCACCAT 5193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5249 TGGCAGCCGGGGCTCATGATATTTTATTGAGAGCAGAATATATATTTGCAAGTTCACCAT 5308
Query 5194 CATTGCCACAACCCCAAGGCAAAACGAAGACGAATGTTAGACATAATCAGCCTAGAAACG 5253
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 5309 CATTGCCACAACCCCAAGGCAGAACGAAGACGAATGTCAGACATAATCAGCCTAGAAATG 5368
Query 5254 CTAAGCAAGGCATGCTTAAGGCATGTGAGAGCATCGGTGATGGAATAGGAAAGACAGCTT 5313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5369 CTAAGCAAGGCATGCTTAAGGCATGTGAGAGCATCGGTGATGGAATAGGAAAGACAGCTT 5428
Query 5314 CTGCATTAGTCCGCACACCTTTGAAGAAGTATCAACGTGGAGACGGAGCTGGATCAGCAT 5373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5429 CTGCATTAGTCCGCACACCTTTGAAGAAGTATCAACGTGGAGACGGAGCTGGATCAGCAT 5488
Query 5374 TTGCAACAGTTGTTCAGGGAGTTCCAACAGCTGCTATAGCACCTGCTTCAGCTTGTGCTA 5433
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5489 TTGCAACTGTTGTTCAGGGAGTTCCAACAGCTGCTATAGCACCTGCTTCAGCTTGTGCTA 5548
Query 5434 GAGCTGTACATAGTGCTCTAGTTGGCATCAGAAATAGGT 5472
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5549 GAGCTGTACATAGTGCTCTTGTTGGCATCAGAAATAGGT 5587
Score = 122 bits (66), Expect = 3e-26
Identities = 76/81 (94%), Gaps = 0/81 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5549 ATTATCTCTACTTTCAGTCTTGATCCTGAACATAAAAAGGAATCCATGGAAAAGTACTTA 5608
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5590 ATTATTTCTCCTTTCAGTCTTGATCCTGAACATAAAAAGGAATCCATGGAAAAATACTTA 5649
Query 5609 GGCCCTGATAAACAAAGGAAG 5629
||||| || ||||||||||||
Sbjct 5650 GGCCCCGACAAACAAAGGAAG 5670
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 281035214686
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5