BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg931114
Length=5813
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G13680.1 | Symbols: CALS5, GLS2, ATGSL02 | callose synthase ... 9779 0.0
AT2G31960.1 | Symbols: ATGSL03, GSL03, ATGSL3 | glucan synthase... 69.4 4e-10
> AT2G13680.1 | Symbols: CALS5, GLS2, ATGSL02 | callose synthase
5 | chr2:5694398-5706134 FORWARD LENGTH=5925
Length=5925
Score = 9779 bits (5295), Expect = 0.0
Identities = 5619/5780 (97%), Gaps = 4/5780 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 15 GGAGAGATGGCACAGAGTAGTACATCTCATGACTCAGGCCCTCAGGGGCTAATGAGGCGG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 148 GGAGAGATGGCACAGAGTAGTACATCTCATGACTCAGGCCCTCAGGGGCTCATGAGACGG 207
Query 75 CCATCTCGTAGTGCCGCCACAACAGTGTCTATTGAAGTTTTTGACCATGAGGTGGTTCCG 134
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 208 CCATCTCGTAGTGCTGCCACAACAGTGTCTATTGAAGTTTTTGATCATGAGGTGGTTCCG 267
Query 135 GCCTCCCTTGGTACCATTGCCCCTATTCTGCGTGTTGCTGCAGAGATTGAACATGAGCGC 194
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 GCCTCCCTTGGTACCATTGCTCCTATTCTGCGTGTTGCTGCAGAGATTGAACATGAGCGC 327
Query 195 CCTCGTGTTGCCTATCTTTGTCGATTTTATGCATTCGAGAAAGCTCACAGGTTGGATCCA 254
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328 CCTCGTGTTGCCTATCTCTGTCGGTTTTATGCATTTGAGAAAGCTCACAGGTTGGATCCA 387
Query 255 AGTTCTGGTGGTCGAGGTGTGAGGCAGTTTAAGACACTTCTCTTTCAAAGATTAGAAAGG 314
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 AGCTCTGGTGGTCGAGGTGTGAGGCAGTTTAAGACACTTCTCTTTCAAAGATTAGAAAGG 447
Query 315 GACAATGCTTCCAGTCTTGCTTCTAGGGTGAAGAAAACTGATGGACGGGAAGTTGAGAGC 374
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 GACAATGCTTCCAGTCTTGCTTCTAGGGTGAAAAAAACTGATGGACGGGAAGTTGAGAGC 507
Query 375 TTCTATCAACAATATTATGAGCACTATGTCAGGGCACTTGATCAAGGAGATCAAGCAGAC 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 TTCTATCAACAATATTATGAGCACTATGTCAGGGCACTTGATCAAGGAGATCAAGCAGAC 567
Query 435 AGAGCTCAACTTGGTAAAGCATACCAGACGGCCGGAGTGCTCTTTGAAGTGCTCATGGCA 494
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568 AGAGCTCAGCTTGGTAAAGCATACCAGACGGCTGGAGTGCTCTTTGAAGTGCTCATGGCA 627
Query 495 GTTAACAAGAGCGAGAAAGTTGAAGCAGTAGCTCCTGAGATTATCGCAGCTGCTAGAGAT 554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 628 GTTAACAAGAGCGAGAAAGTTGAAGCAGTAGCTCCTGAGATTATTGCAGCTGCTAGAGAT 687
Query 555 GTCCAAGAAAAGAACGAAATTTATGCACCATACAACATTCTTCCATTGGATTCTGCTGGG 614
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 688 GTCCAAGAAAAGAACGAAATTTATGCACCCTACAACATTCTTCCTTTGGATTCTGCTGGG 747
Query 615 GCCTCGCAGTCGGTAATGCAGCTTGAGGAGGTCAAAGCCGCTGTAGCTGCCTTGGGGAAC 674
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 748 GCCTCGCAGTCTGTTATGCAGCTTGAGGAGGTCAAAGCCGCTGTAGCTGCTTTGGGGAAC 807
Query 675 ACTCGTGGATTGAACTGGCCATCTGGATTTGAGCAGCACCGAAAGAAAACTGGAAATCTT 734
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 808 ACTCGTGGATTGAACTGGCCATCTGGGTTTGAGCAGCACCGAAAGAAAACCGGAAATCTG 867
Query 735 GATCTTCTTGACTGGTTAAGAGCTATGTTCGGATTCCAGAGAGACAATGTCAGAAACCAG 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 GATCTTCTTGACTGGTTAAGAGCTATGTTCGGATTCCAGAGAGACAATGTCAGAAACCAG 927
Query 795 AGGGAACATCTGGTTTGTTTACTTGCTGATAATCACATAAGATTGACTCCCAAACCAGAA 854
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 928 AGGGAACATCTGGTTTGTTTATTTGCTGATAATCACATAAGATTGACTCCCAAGCCAGAA 987
Query 855 CCTCTGAACAAGCTTGATGACAGAGCCGTTGATGCCGTCATGACAAAGCTCTTTAAGAAC 914
|||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 988 CCTCTGAACAAGCTCGATGACAGAGCCGTTGATACTGTCATGTCAAAGCTCTTTAAGAAC 1047
Query 915 TACAAGAACTGGTGCAAATTCTTAGGACGTAAACACAGTTTAAGGCTTCCTCAAGCTGCT 974
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 TACAAGAATTGGTGCAAATTTTTAGGACGTAAACACAGTTTAAGGCTTCCTCAAGCTGCT 1107
Query 975 CAAGATATACAACAGCGGAAGATACTATACATGGGCTTGTATCTTCTTATCTGGGGTGAA 1034
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1108 CAAGATATACAACAGCGGAAGATACTATATATGGGCTTGTATCTTCTCATCTGGGGAGAA 1167
Query 1035 GCTGCAAATATTCGCTTCATGCCAGAATGCTTGTGCTACATTTTCCACAATATGGCTTAT 1094
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 GCTGCAAATATTCGCTTCATGCCAGAATGCTTGTGCTATATTTTCCACAATATGGCTTAT 1227
Query 1095 GAACTCCATGGTCTCTTGGCTGGAAATGTCAGCATCGTAACTGGAGAAAATATTAAGCCT 1154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1228 GAACTCCATGGTCTCTTGGCTGGAAATGTCAGCATCGTTACCGGAGAAAATATTAAGCCT 1287
Query 1155 TCTTACGGTGGAGATGATGAGGCATTTCTACGGAAGGTCATTACACCAATCTACCGTGTA 1214
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 TCTTACGGTGGAGATGATGAGGCATTTTTAAGGAAGGTCATTACACCAATCTACCGTGTA 1347
Query 1215 GTTCAAAAGGAAGCAAATAAGAATGCGAATGGCAAGGCTGCTCACTCAGATTGGTCCAAC 1274
||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348 GTTCAAACGGAAGCAAACAAGAATGCAAATGGCAAGGCTGCTCACTCAGATTGGTCCAAC 1407
Query 1275 TATGATGATCTGAACGAATATTTCTGGACTCCTGACTGCTTCTCGCTTGGCTGGCCAATG 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1408 TATGATGATCTGAACGAATATTTCTGGACTCCTGATTGCTTCTCTCTTGGCTGGCCAATG 1467
Query 1335 CGTGATGATGGAGATCTTTTCAAATCAACCCGTGATACGACACAGGGGAAA-AAGGGATC 1393
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||
Sbjct 1468 CGTGATGATGGGGATCTTTTCAAATCAACCCGTGATACGACACA-GGGAAAGAAAGGATC 1526
Query 1394 GTTAAGAAAACCAGGAAGCACAGGCAAATCAAATTTCACCGAAACTCGAACATTTTGGCA 1453
||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1527 GTTTAGAAAAGCAGGACGCACAGGCAAATCAAATTTCACCGAAACTCGGACATTTTGGCA 1586
Query 1454 CATATATCATAGTTTTGACAGACTCTGGACATTCTATCTATTAGCACTCCAGGCAATGAT 1513
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1587 CATATATCATAGTTTTGACCGACTCTGGACATTCTATCTATTAGCCCTGCAGGCAATGAT 1646
Query 1514 CATTCTTGCATTTGAACGAGTAGAGCTGAGAGAAATATTACGCAAAGATGTTTTATATGC 1573
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1647 CATTCTAGCATTTGAACGAGTAGAGCTGAGAGAAATCTTACGCAAAGATGTTTTATATGC 1706
Query 1574 TCTCTCCAGTATCTTCATTACAGCAGCTTTTCTACGCTTCCTTCAGAGTGTCCTGGACGT 1633
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707 TCTCTCAAGTATCTTCATCACAGCAGCTTTTCTGCGCTTCCTTCAGAGTGTCCTGGACGT 1766
Query 1634 TATCTTAAACTTCCCAGGTTTCCACCGGTGGAAATTCACTGATGTTTTGAGAAATATTCT 1693
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767 TATCTTAAACTTCCCAGGTTTCCACAGGTGGAAATTTACTGATGTTTTGAGAAATATTCT 1826
Query 1694 CAAGATTGTTGTCAGTCTCGCTTGGTGTGTTGTTTTACCCCTTTGCTATGCCCAGTCTGT 1753
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827 CAAGATCGTTGTCAGTCTCGCTTGGTGTGTTGTGTTACCCCTTTGCTATGCCCAGTCTGT 1886
Query 1754 CTCTTTTGCTCCTGGGAAGCTGAAACAATGGTTATCATTTCTTCCACAAGTTAAAGGCGT 1813
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1887 CTCTTTTGCTCCTGGGAAGCTGAAACAATGGCTATCATTTCTTCCACAAGTTAAAGGCGT 1946
Query 1814 TCCTCCGCTTTATATCATGGCTGTAGCACTGTACTTGCTTCCAAATGTACTGGCAGCTAT 1873
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1947 TCCTCCTCTTTATATCATGGCTGTTGCACTGTACTTGCTTCCAAATGTACTGGCAGCTAT 2006
Query 1874 CATGTTCATTTTTCCAATGTTTCGGCGCTGGATCGAGAATTCAGACTGGCATATATTTAG 1933
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007 CATGTTCATTTTTCCAATGCTTCGACGCTGGATCGAGAATTCAGACTGGCATATATTTAG 2066
Query 1934 ATTGCTTTTGTGGTGGTCACAGCCAAGAATTTATGTTGGAAGAGGGATGCATGAAAGTCA 1993
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067 ATTGCTTCTGTGGTGGTCACAGCCAAGAATTTATGTTGGAAGAGGGATGCATGAAAGTCA 2126
Query 1994 AATTGCACTCATAAAGTATACGATTTTCTGGCTGTTGCTTTTCTGCTGCAAATTTGCATT 2053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2127 AATTGCACTCATAAAGTATACGATTTTCTGGCTGTTGCTTTTCTGCTGCAAATTTGCATT 2186
Query 2054 CAGCTACTTTCTACAGGTGAGACTTTTGGTGAAGCCAACTAACGCAATTATGAGCATTCG 2113
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2187 CAGCTACTTTCTACAGGTGAAACTTTTGGTGAAGCCAACTAACGCAATTATGAGCATTCG 2246
Query 2114 CCATGTAAAATACAAATGGCATGAGTTTTTCCCCAATGCTGAGCACAACTATGGAGCAGT 2173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2247 CCATGTAAAATACAAATGGCATGAGTTTTTCCCCAATGCTGAGCACAACTATGGAGCTGT 2306
Query 2174 GGTGTCGCTCTGGTTACCAGTAATCCTGGTTTACTTTATGGACACTCAAATTTGGTATGC 2233
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2307 GGTGTCACTCTGGTTACCAGTAATTCTGGTTTACTTTATGGACACTCAAATTTGGTATGC 2366
Query 2234 TATTTTCTCCACTATATGTGGTGGTGTCATTGGGGCCTTTGATCGTTTGGGAGAGATACG 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 TATTTTCTCCACTATATGTGGTGGTGTCATTGGGGCCTTTGATCGTTTGGGAGAGATACG 2426
Query 2294 AACGCTTGGAATGCTAAGGTCAAGGTTCCAATCACTACCTGGTGCATTTAATACGTACCT 2353
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2427 AACGCTTGGAATGCTAAGGTCAAGGTTCCAATCATTACCTGGTGCATTTAATACGTACCT 2486
Query 2354 GGTTCCTTCTGATAAAACAAGGAGAAGAGGCTTTTCCTTGTCAAAAAGATTTGCAGAGGT 2413
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2487 GGTTCCTTCTGATAAAACAAGGAGAAGAGGGTTTTCCTTGTCAAAAAGATTTGCAGAGGT 2546
Query 2414 CACTGCAGCAAGAAGAACTGAAGCGGCAAAATTTTCCCAACTCTGGAATGAAATCATTTC 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2547 CACTGCAGCAAGAAGAACTGAAGCGGCAAAATTCTCCCAACTCTGGAATGAAATCATTTC 2606
Query 2474 CAGCTTCCGAGAGGAAGATCTCATCAGTGACAGAGAGATGGATCTGTTGCTTGTTCCTTA 2533
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2607 CAGCTTCCGAGAGGAAGATCTAATCAGTGACAGGGAGATGGATCTGTTGCTTGTTCCTTA 2666
Query 2534 TACTTCGGACCCTAGTTTGAAACTAATTCAGTGGCCACCATTTTTGCTTGCAAGCAAGAT 2593
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2667 TACTTCAGACCCTAGTTTGAAACTAATTCAGTGGCCACCATTTTTGCTTGCAAGCAAGAT 2726
Query 2594 ACCGATAGCATTGGATATGGCAGCTCAATTTCGAACAAGAGATTCTGACCTCTGGAAGCG 2653
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727 ACCGATAGCATTGGATATGGCAGCTCAGTTTCGAACAAGAGATTCTGACCTCTGGAAGCG 2786
Query 2654 CATATGCGCAGACGAATACATGAAATGCGCTGTCATTGAATGCTACGAATCATTCAAACA 2713
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2787 CATATGCGCAGACGAATATATGAAATGTGCTGTCATTGAATGCTACGAATCTTTCAAACA 2846
Query 2714 TGTTTTGCACACCTTGGTAATTGGGGAGAATGAGAAAAGGATTATTGGTATCATCATCAA 2773
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2847 TGTCTTGCACACCTTGGTAATTGGGGAGAATGAGAAAAGGATTATTGGTATTATCATCAA 2906
Query 2774 AGAGGTGGAGAGCAACATATCAAAGAATTCCTTCCTTTCGAATTTCAGAATGGCGCCTTT 2833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2907 AGAGGTGGAGAGCAACATATCAAAGAATTCCTTCCTTTCGAATTTCAGAATGGCGCCTTT 2966
Query 2834 ACCTGCTCTTTGTAGTAAATTTGTCGAGCTTGTTGGAATCTTGAAAAATGCGGATCCAGC 2893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2967 ACCTGCTCTTTGTAGTAAATTTGTCGAGCTTGTTGGAATTTTGAAAAATGCGGACCCAGC 3026
Query 2894 CAAAAGAGACACATTGGTGCTATTGTTGCAAGATATGTTAGAAGTAGTGACTCGAGATAT 2953
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3027 GAAAAGAGACACAGTGGTGCTATTGTTGCAAGATATGTTAGAAGTAGTGACTCGAGATAT 3086
Query 2954 GATGCAAAATGAAAACCGTGAATTGGTAGAACTTGGGCATACTAACAAGGAATCCGGAAG 3013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3087 GATGCAAAATGAAAACCGTGAATTGGTAGAACTTGGGCATACTAACAAGGAATCCGGAAG 3146
Query 3014 GCAACTCTTTGCTGGTACTGACGCAAAACCTGCTATACTGTTTCCTCCAGTGGCAACAGC 3073
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3147 GCAACTCTTTGCTGGTACTGACGCAAAGCCTGCTATACTGTTTCCTCCAGTGGCAACAGC 3206
Query 3074 TCAATGGGATGAACAGATAAGTCGCCTGCATTTACTCTTGACGGTAAAAGAATCTGCAAT 3133
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3207 TCAATGGCATGAACAGATAAGTCGCCTTCATTTACTTTTGACGGTAAAAGAATCTGCAAT 3266
Query 3134 GGATGTTCCGACAAACCTTGAAGCGCAAAGAAGGATTGCTTTCTTCACAAATTCACTGTT 3193
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3267 GGATGTTCCAACAAACCTTGAAGCACAAAGAAGGATTGCCTTCTTCACAAATTCACTGTT 3326
Query 3194 TATGGATATGCCGCGAGCTCCTCGTGTCAGAAATATGCTGTCCTTCAGTGTTCTGACTCC 3253
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3327 TATGGATATGCCACGAGCTCCTCGTGTCAGAAATATGCTGTCCTTCAGTGTTCTGACTCC 3386
Query 3254 GTACTATAGTGAGGAAACCGTCTACTCTAAGAACGACCTGGAAATGGAAAATGAAGATGG 3313
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3387 GTACTATAGTGAGGAAACCGTCTACTCTAAGAACGACCTGGAAATGGAGAATGAAGATGG 3446
Query 3314 TGTATCAGTTGTATACTATTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAGTGGACTAACTTCTTGGA 3373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3447 TGTATCAGTTGTATACTATTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAGTGGACTAACTTCTTGGA 3506
Query 3374 GCGGCTTGGTTGTAAAGATGAAACTTCTGTTTTGGAGAGTGAAGAAAATATATTACAGCT 3433
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3507 GCGGCTTGATTGTAAAGATGAAACTTCTGTTTTGGAGAGTGAAGAAAATATATTGCAGCT 3566
Query 3434 TCGCCATTGGGTTTCTTTGAGGGGACAGACTTTGTTTAGAACTGTTAGAGGAATGATGTA 3493
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3567 TCGCCATTGGGTTTCTTTGAGGGGACAGACTTTGTTTAGAACAGTTAGAGGAATGATGTA 3626
Query 3494 TTACAGGCGGGCACTAAAGCTTCAGGCTTTTCTTGACATGGCTAATGAAACAGAAATATT 3553
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TTACAGGCGGGCATTAAAGCTTCAGGCTTTTCTTGACATGGCTAATGAAACAGAAATATT 3686
Query 3554 AGCAGGGTACAAAGCCATTTCAGAGCCAACTGAGGAGGACAAGAAAAGTCAGAGATCCTT 3613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3687 AGCAGGGTACAAAGCCATTTCAGAGCCAACTGAGGAGGACAAGAAAAGTCAGAGATCCTT 3746
Query 3614 GTACGCTCAGTTAGAGGCAGTGGCAGATCTCAAATTTACTTATGTTGCTACCTGTCAGAA 3673
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3747 GTACACTCAGTTAGAGGCAGTGGCAGATCTCAAATTTACTTATGTTGCTACCTGTCAGAA 3806
Query 3674 TTATGGAAATCAGAAGCGAAGTGGAGACAGGAGAGCTACTGACATCTTGAACCTAATGGT 3733
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3807 TTATGGAAATCAGAAGCGAAGTGGAGACCGGAGAGCTACTGACATCTTGAACCTGATGGT 3866
Query 3734 TAACAATCCCTCTCTCCGTGTAGCGTACATTGATGAGGTTGAGGAACGAGAAGGCGGAAA 3793
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3867 TAACAATCCCTCTCTCCGTGTAGCATACATTGATGAGGTTGAGGAACGAGAAGGCGGAAA 3926
Query 3794 AGTGCAGAAAGTTTTCTACTCGGTGCTTATCAAGGCTGTTGATAATCTTGATCAGGAAAT 3853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3927 AGTGCAGAAAGTTTTCTACTCGGTGCTTATCAAGGCTGTTGATAATCTTGATCAGGAAAT 3986
Query 3854 ATATCGGATAAAACTGCCTGGTCCAGCAAAAATTGGAGAAGGAAAACCCGAAAATCAGAA 3913
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3987 ATATCGGATAAAACTACCTGGACCAGCAAAAATTGGAGAAGGAAAACCCGAAAATCAGAA 4046
Query 3914 TCATGCTCTCATTTTTACAAGAGGAGAAGCTCTCCAGGCTATTGACATGAATCAGGACCA 3973
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4047 TCATGCTCTCATTTTTACTAGAGGAGAAGCTCTCCAGGCTATTGACATGAATCAGGACCA 4106
Query 3974 TTACTTGGAAGAAGCACTTAAAATGAGGAATTTGCTGGAAGAGTTCAATGAAGACCATGG 4033
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4107 TTACTTGGAAGAAGCACTTAAAATGAGGAATCTGCTGGAAGAGTTCAATGAAGACCATGG 4166
Query 4034 AGTACGTGCACCCACTATTCTTGGTTTCAGAGAGCATATTTTTACTGGCAGTGTTTCTTC 4093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4167 AGTACGTGCACCCACTATTCTTGGTTTCAGAGAGCATATTTTTACTGGCAGTGTTTCTTC 4226
Query 4094 TTTAGCCTGGTTTATGTCAAATCAGGAAACAAGTTTTGTGACCATTGGTCAGCGAGTCCT 4153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4227 TTTAGCCTGGTTTATGTCAAATCAGGAAACAAGTTTTGTGACCATTGGTCAGCGAGTCCT 4286
Query 4154 GGCAAGTCCTTTGAAGGTAAGGTTTCACTATGGTCACCCTGATGTCTTTGATAGAATCTT 4213
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4287 GGCAAGTCCTTTGAAGGTAAGGTTTCACTATGGACACCCTGATGTCTTCGATAGAATCTT 4346
Query 4214 CCACATTACTCGGGGTGGCATCAGCAAAGCATCACGGGGCATAAATCTTAGCGAGGATAT 4273
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4347 CCACATCACTCGGGGTGGCATCAGCAAAGCTTCACGGGGCATAAATCTTAGCGAGGATAT 4406
Query 4274 CTTTGCTGGTTTCAACTCAACTCTGAGGCGTGGTAATGTCACTCATCATGAGTACATCCA 4333
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4407 CTTTGCTGGTTTCAACTCAACTCTGAGGCGTGGTAATGTCACCCATCATGAGTACATCCA 4466
Query 4334 AGTAGGGAAAGGAAGAGATGTTGGTTTGAACCAGATATCTCTCTTTGAAGCCAAGGTTGC 4393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4467 AGTAGGGAAAGGAAGAGATGTTGGTTTGAACCAGATATCACTCTTTGAAGCCAAGGTTGC 4526
Query 4394 TTGTGGCAACGGAGAGCAAACATTGAGTAGGGATCTCTACCGACTTGGGCATCGCTTCGA 4453
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 4527 TTGTGGAAACGGAGAGCAAACATTGAGTAGGGATCTCTACCGACTTGGGCATCGTTTTGA 4586
Query 4454 TTTTTTCCGCATGATGTCTTGTTATTTCACAACAGTAGGCTTCTACATCAGCTCGATGAT 4513
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4587 CTTTTTCCGCATGATGTCTTGTTATTTCACAACTGTAGGCTTCTACATCAGCTCGATGAT 4646
Query 4514 TGTTGTCCTCACAGTTTATGCATTCTTGTATGGAAGACTTTACTTGTCATTGAGTGGAGT 4573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4647 TGTTGTCCTCACAGTTTATGCATTCTTGTATGGAAGACTTTACTTGTCATTGAGTGGAGT 4706
Query 4574 GGAAGAGGCGATAGTAAAGTTTGCAGCGGCGAAAGGAGATAGTTCGCTCAAGGCAGCCAT 4633
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 4707 GGAAGAGGCGATAGTAAAGTTTGCAGCAGCGAAAGGAGATAGTTCTCTTAAGGCAGCGAT 4766
Query 4634 GGCGTCACAGTCCGTAGTGCAATTGGGTCTGCTGATGACACTACCAATGGTGATGGAGAT 4693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4767 GGCGTCACAGTCCGTAGTGCAATTGGGTCTGCTGATGACACTACCAATGGTGATGGAGAT 4826
Query 4694 TGGGCTAGAAAGAGGATTCAGAACTGCGTTGTCCGATATAATCATAATGCAGCTTCAGTT 4753
||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4827 TGGGCTAGAGAGAGGATTCAGAACGGCGTTGTCTGATCTAATCATAATGCAGCTTCAGTT 4886
Query 4754 AGCGCCTGTCTTCTTCACCTTCTCACTTGGAACAAAGGTTCATTACTATGGTCGGACCAT 4813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4887 AGCGCCTGTCTTCTTCACCTTCTCACTTGGAACAAAGGTTCATTACTATGGTCGGACCAT 4946
Query 4814 CCTACATGGGGGAGCAAAGTACAGAGCAACAGGGCGTGGGTTTGTGGTGAAGCACGAGAA 4873
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4947 CCTACATGGGGGATCAAAGTACAGAGCAACAGGGCGTGGGTTTGTGGTGAAGCACGAGAA 5006
Query 4874 GTTTGCAGAGAACTACAGAATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAGAGGAATGGAGCTGAT 4933
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5007 GTTTGCAGAGAACTACAGAATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGAT 5066
Query 4934 GGTGCTGCTGATATGTTACAGGATTTATGGGAAAGCAGCAGAAGACACGGTGGCATATGC 4993
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||
Sbjct 5067 GGTGCTGCTGATATGTTACAGGATTTATGGGAAAGCAGCAGAGGACTCGGTGGGTTATGC 5126
Query 4994 GCTTGTCATGGGCTCAACATGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTCGCCCCATTCTTTTT 5053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5127 GCTTGTCATGGGCTCAACATGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTCGCCCCATTCTTTTT 5186
Query 5054 CAATCCCTCGGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAATAAGTG 5113
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5187 CAATCCCTCGGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAACAAGTG 5246
Query 5114 GATAAGCAGCAGAGGAGGCATCGGAGTGCCAGCACACAAAAGCTGGGAATCATGGTGGGA 5173
|||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5247 GATAAGCAGCAGAGGAGGTATCGGAGTACCAGCAAACAAAAGCTGGGAATCATGGTGGGA 5306
Query 5174 AGAAGAACAAGAGCATCTGCTTCACTCTGGGTTTTTCGGAAAGTTTTGGGAGATATTTCT 5233
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5307 AGAGGAACAAGAGCATCTTCTTCACTCTGGGTTTTTCGGAAAGTTCTGGGAGATATTTCT 5366
Query 5234 CTCACTGCGGTACTTCATTTACCAGTACGGTATTGTGTACCATTTGAACTTGACCAAGGA 5293
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5367 CTCACTGCGGTACTTCATTTACCAGTATGGTATTGTGTACCAATTGAACTTGACCAAGGA 5426
Query 5294 GAGCCGAATGGGAAAACAGCAGAGCATCATTGTGTATGGACTGTCTTGGCTGGTGATCGT 5353
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5427 GAGCCGAATGGGAAAACAGCACAGCATCATTGTGTATGGACTGTCTTGGCTGGTGATCGT 5486
Query 5354 GGCAGTGATGATAGTCCTGAAGATAGTGTCGATGGGGAGAAAGAAGTTCAGCGCCGATTT 5413
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 5487 GGCAGTGATGATAGTCCTCAAGATAGTGTCGATGGGGAGAAAGAAGTTCAGTGCTGATTT 5546
Query 5414 CCAGCTTATGTTCAGGCTTTTGAAGCTGTTTCTTTTCATAGGATCAGTGGTGATCGTGGG 5473
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5547 CCAGCTTATGTTCAGGCTTTTGAAGCTGTTTCTGTTCATAGGATCAGTGGTGATCGTGGG 5606
Query 5474 GATGCTATTCCACTTCTTAAAGCTGACGGTGGGAGACATAATGCAGTCTCTGTTGGCGTT 5533
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5607 GATGCTATTCCACTTCTTGAAGCTGACCGTGGGAGACATAATGCAGTCTCTGTTGGCGTT 5666
Query 5534 TTTACCCACGGGATGGGCTCTGCTTCAGATATCACAAGTGGCGAGGC-AGTTGATGAAGG 5592
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 5667 TTTACCCACGGGATGGGCTCTCCTTCAGATATCACAAGTGGCGAGGCCA-TTGATGAAGA 5725
Query 5593 CAGTAGGAATGTGGGGATCGGTCAAGGCCTTGGCTAGAGGGTATGAGTACATAATGGGAG 5652
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5726 CAGTAGGAATGTGGGGATCGGTCAAGGCCTTGGCTAGAGGGTATGAGTACATCATGGGAG 5785
Query 5653 TTGTTATCTTCATGCCAGTCACCGTACTCGCATGGTTCCCTTTCGTCTCTGAGTTCCAGA 5712
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5786 TTGTTATCTTCATGCCAGTTACTGTACTCGCGTGGTTCCCTTTCGTCTCTGAGTTCCAGA 5845
Query 5713 CCAGGCTTCTCTTCAACCAGGCCTTTAGCCGTGGTCTCCAGATCCAACGTATTCTCGCCG 5772
| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5846 CAAGGCTTCTCTTCAATCAAGCCTTTAGCCGTGGTCTCCAGATCCAACGTATTCTCGCCG 5905
Query 5773 GTGGTAAGAAGCAGAAATAA 5792
||||||||||||||||||||
Sbjct 5906 GTGGTAAGAAGCAGAAATAA 5925
> AT2G31960.1 | Symbols: ATGSL03, GSL03, ATGSL3 | glucan synthase-like
3 | chr2:13588887-13600229 FORWARD LENGTH=6067
Length=6067
Score = 69.4 bits (37), Expect = 4e-10
Identities = 62/74 (84%), Gaps = 2/74 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 3301 AAAATGAAGATGGTGTATC-AGTTGTATACTATTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAGTGG 3359
||||||||||||| || || | | | | || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 AAAATGAAGATGGAGTCTCTA-TACTCTTTTACTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAGTGG 3414
Query 3360 ACTAACTTCTTGGA 3373
|| ||||| |||||
Sbjct 3415 ACAAACTTTTTGGA 3428
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 290021377685
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5