BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg931357
Length=4363
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G20190.1 | Symbols: ATCLASP, CLASP | CLIP-associated protein... 7278 0.0
> AT2G20190.1 | Symbols: ATCLASP, CLASP | CLIP-associated protein
| chr2:8711596-8719018 REVERSE LENGTH=4791
Length=4791
Score = 7278 bits (3941), Expect = 0.0
Identities = 4227/4367 (97%), Gaps = 12/4367 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCGTCGGTGGTTTCGGT-----AAAAAATGGAGGAAGCTTTAGAAATGGCGAGAGCCAA 55
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 TCCGTCGGTGGTTT-GGTAAAAAAAAAAATGGAGGAAGCTTTAGAAATGGCGAGAGCCAA 237
Query 56 GGATACAAAAGAGCGCATGGCGGCTGTTGAAAGGCTACATCAACTTCTCGAAGCTTCTAG 115
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 GGATACAAAAGAGCGCATGGCTGCTGTTGAAAGGCTGCATCAACTTCTCGAAGCTTCTAG 297
Query 116 GAAGAGTTTGAGTCCAT-CGGAAGTGACGTCACTTGTTGATTCTTGTTTGGATCTCCTTA 174
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 GAAGAGTTTGAGTCC-TGCGGAAGTGACGTCACTTGTTGATTCTTGTTTGGATCTCCTTA 356
Query 175 AGGATAGTAATTTTAGAGTCTCTCAAGGTGCGCTTCAAGCTCTTGCTTCTGCTGCTGTTC 234
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 357 AGGATAGTAATTTTAGAGTCTCTCAAGGTGCTCTTCAAGCTCTTGCTTCTGCTGCTGTCC 416
Query 235 TTGCTGGTGAGCATTTGAAGCTTCATTTGAATGCTCTTGTTCCTGCTGTTGTCGAGCGGC 294
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 TCGCTGGTGAGCATTTGAAGCTTCATTTGAATGCTCTTGTTCCTGCTGTTGTCGAGCGGC 476
Query 295 TCGGTGATAGCAAGCAACCTGTTAGGGATGCTGCGAGACGTTTGTTGACGACTCTAATGG 354
| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 477 TTGGTGATAGTAAGCAACCTGTTAGAGATGCTGCGAGGCGTCTGTTGACGACTCTCATGG 536
Query 355 AGGTTTCATCTTCAACTATTATAGTTGAAAGAGCGGGTTCTTATGCTTGGATGCATAAGA 414
||||||||||| | || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 537 AGGTTTCATCTCCGACGATTATAGTGGAGAGAGCTGGTTCGTATGCTTGGATGCATAAGA 596
Query 415 GTTGGAGAGTTAGGGAAGAGTTTGCGCGTACTGTTACATCGGCTATTGGTCTTTTTGCAT 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 597 GTTGGAGAGTTAGGGAAGAGTTTGCGCGTACTGTTACATCGGCGATTGGTCTTTTCGCAT 656
Query 475 CTACGGAACTTCCTCTTCAGCGGGTTATACTTGCTCCGATACTTCAGATGTTAAATGATC 534
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 657 CTACGGAACTTCCTCTTCAGCGTGTTATACTTGCTCCGATACTTCAGATGTTAAATGA-C 715
Query 535 CC-AATCAAGCAGTTAGGGAAGCTGCAATTTTGTGCATTGAGGAGATGTACATGCAGGGT 593
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 716 CCTAATCAAGCAGTTAGGGAAGCTGCTATTTTGTGCATTGAGGAGATGTATATGCAAGGT 775
Query 594 GGGTCTCAATTTCGAGAAGAGCTTCAACGCCACCATCTTCCATCATATATGGTGAAGGAT 653
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 776 GGGTCTCAATTTCGAGAAGAGCTTCAACGTCACCATCTTCCATCGTATATGGTGAAGGAC 835
Query 654 ATTAATGCTAGACTGGAACGTATTGAGCCACAGCAGCGTTCTACAGATGGCCGTAGTGGT 713
|||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 ATTAATGCTAGACTAGAACGTATTGAGCCACAACTGCGTTCTACAGATGGCCGTAGTGCC 895
Query 714 CACCATGTTGTTAATGAGGTTAAGGCATCAAGTGTCAATCCCAAAAAGAGTAGTCCCAGG 773
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 896 CACCATGTTGTTAATGAGGTGAAGGCATCAAGTGTCAATCCCAAAAAGAGCAGTCCCAGG 955
Query 774 GCAAAGGCTCCCACGCGAGAGAACTCTTTATTTGGGGGAGATGCCGACATCACTGAAAAA 833
||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 GCAAAGGCTCCTACGAGGGAGAACTCTTTATTTGGGGGAGATGCCGACATCACTGAAAAA 1015
Query 834 CCCATTGAGCCAATCAAAGTGTACTCAGAGAAGGAGCTGATACGAGAATTTGAGAAAGTT 893
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||
Sbjct 1016 CCCATTGAGCCAATCAAAGTGTACTCAGAGAAGGAGTTAATACGAGAATTTGAGAAAATT 1075
Query 894 GCTGCAACACTCGTCCCAGAGAAAGACTGGTCAATGCGTATTTCAGCTATGCGGAGGGTT 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 GCTGCAACACTCGTCCCAGAGAAAGACTGGTCAATGCGTATTTCAGCTATGCGGAGGGTT 1135
Query 954 GAGGGACTTGTTGCAGGAGGTGCGACTGATTACTCTTGCTTTCGAGGTCTCCTGAAGCAA 1013
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 GAAGGACTTGTTGCAGGAGGTGCGACTGATTACTCCTGCTTTCGAGGTCTCCTGAAGCAA 1195
Query 1014 CTTGTTGGCCCCTTAAGTACACAATTAGCTGACCGGAGATCTACCATTGTTAAGCAGGCC 1073
|||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196 CTTGTTGGTCCTTTAAGTACTCAATTAGCTGACCGGAGATCTACCATTGTTAAGCAGGCC 1255
Query 1074 TGTCATCTATTGTGTCTCTTATCAAAAGAACTACTGGGAGATTTTGAAGCATGCGCTGAG 1133
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1256 TGTCATCTCTTGTGTCTCTTATCAAAAGAGCTACTGGGAGATTTTGAGGCATGCGCTGAG 1315
Query 1134 ATGTTTATTCCAGTGCTTTTCAAGCTGGTTGTGATCACTGTGCTTGTAATTGCAGAATCT 1193
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 ACGTTTATTCCAGTGCTTTTCAAGCTGGTTGTGATTACTGTGCTTGTAATTGCAGAATCT 1375
Query 1194 GCTGATAACTGCATAAAAACGATGCTGCGTAACTGCAAAGCTGCCCGTGTACTTCCTCGC 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 GCTGATAACTGCATAAAAACGATGCTGCGTAACTGCAAAGCTGCCCGTGTACTTCCTCGC 1435
Query 1254 ATAGCTGAATCAGCAAAACATGACCGTAATGCAATTCTGCGAGCAAGATGTTGTGAATAT 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 ATAGCTGAATCAGCAAAACATGACCGTAATGCAATTCTGCGAGCAAGATGTTGTGAATAT 1495
Query 1314 GCATTGTTAACACTCGAACATTGGCCTGATGCTCCAGAAATTCAACGATCAGTTGATTTA 1373
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 GCATTGTTAACACTTGAACATTGGCCTGATGCTCCAGAAATTCAACGATCAGTTGATTTA 1555
Query 1374 TATGAGGATCTGATTAGATGCTGTGTTGCAGATGCTATGAGTGAGGTACGGGCAACTGCT 1433
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1556 TATGAAGATCTGATTAGATGCTGTGTTGCAGATGCTATGAGTGAGGTGCGGGCAACTGCT 1615
Query 1434 AGAATGTGCTACAGAATGTTTGCAAAAACTTGGCCGGATCGTTCTCGTCGGTTGTTTTCC 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1616 AGAATGTGCTACAGAATGTTTGCAAAAACTTGGCCGGATCGTTCTCGCCGGTTGTTTTCG 1675
Query 1494 TCCTTTGACCCTGTCATTCAAAGGCTAATAAATGAAGAAGATGGTGGAATTCATAGGAGA 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 TCCTTTGACCCTGTCATTCAAAGGCTAATAAATGAAGAAGATGGTGGAATTCATAGGAGA 1735
Query 1554 CACGCCTCACCATCTGTCCGTGAGAGACATTCCCAGCCTTCATATGCTCAGACGTCTGCT 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1736 CACGCCTCACCATCTGTCCGTGAGAGACATTCCCAGCCTTCATTTTCTCAGACGTCTGCT 1795
Query 1614 CCTTCTAATCTACCTGGCTATGGAACATCAGCTATAGTCGCTATGGATAGAAGCTCAAAT 1673
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1796 CCTTCTAACCTACCTGGCTATGGAACATCAGCTATAGTCGCTATGGATAGAAGTTCAAAT 1855
Query 1674 TTATCATCTGGAGGATCACTTTCTTCTGGGTTACTCCTTTCGCAATCAAAGGATGTCAAT 1733
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 TTATCATCTGGAGGATCTCTTTCTTCTGGGTTACTCCTTTCGCAATCAAAGGATGTCAAT 1915
Query 1734 AAAGGTTCTGAACGTAGTCTGGAAAGTGTGTTACAATCAAGCAAGCAGAAGGTCAGTGCA 1793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 AAAGGTTCTGAACGTAGTCTGGAAAGTGTGTTACAATCAAGCAAGCAGAAGGTCAGTGCA 1975
Query 1794 ATTGAAAGTATGCTCCGAGGACTGCATATATCTGATAGACAAAACCCTGCAGCTCTTCGT 1853
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1976 ATTGAAAGTATGCTCCGAGGACTGCATATATCTGATAGACAAAATCCTGCAGCCCTTCGT 2035
Query 1854 TCAAGTAGTTTGGATCTAGGAGTTGACCCTCCATCGTCTCGTGATCCTCCTTTCCATGCT 1913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 TCAAGTAGTTTGGATCTAGGAGTTGACCCTCCATCGTCTCGTGATCCTCCTTTCCATGCT 2095
Query 1914 GCTGTTCCAGCATCCAATAATCACACAAGTAGTGCAGCTGCTGAATCAACACATAGTATC 1973
| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 GTTGCTCCAGCATCCAATAGTCACACAAGTAGCGCAGCTGCTGAATCAACACATAGTATC 2155
Query 1974 AACAAAGGCAGTAATCGCAATGGTGGCCTTGGTTTGTCAGATATCATCACCCAAATTCAA 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 AACAAAGGCAGTAATCGCAATGGTGGCCTTGGTTTGTCAGATATCATCACCCAAATTCAA 2215
Query 2034 GCTTCAAAGGACTCAGGAAGATCATCTTACCGTGGCAATCTGTTGTCCGAGTCTCATCCT 2093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 GCTTCAAAGGACTCAGGAAGATCATCTTACCGTGGCAATCTGTTGTCCGAGTCTCATCCT 2275
Query 2094 ACCTTTTCATCCTTGACAGCTAAACGGGTCTCCGAGAGAAATGAGAGAAGTTCTCTTGAG 2153
|| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 ACTTTTTCATCCTTGACCGCTAAACGGGGCTCAGAGAGAAATGAGAGAAGTTCTCTTGAG 2335
Query 2154 GAAAGCAATGATGCCAGAGAGGCGAGGCGGTTTATGGCAGGGCATTTTGACAGACAGCAG 2213
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||
Sbjct 2336 GAAAGCAATGATGCCAGAGAGGTGAGGCGGTTTATGGCTGGTCATTTTGACCGACAGCAG 2395
Query 2214 ATGGATACCGCTTATAGAGATTTGACTTTCAGGGAATCAAACGCTAGCCATGTTCCCAAT 2273
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 ATGGATACTGCTTATAGAGATTTGACTTTCAGGGAATCAAACGCTAGCCATGTTCCCAAT 2455
Query 2274 TTCCAGAGGCCACTTTTGAGGAAGAATGTTGGGGGAAGAATGTCCGCAGGCAGGAGGAGG 2333
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 2456 TTCCAGAGGCCACTTTTGAGGAAGAATGTAGGGGGAAGAATGTCTGCAGGCCGGAGGAGG 2515
Query 2334 AGTTTTGATGATAGCCAACTGCAAATTGGTGACATATCAAATTATGTTGATGGTCCAGCT 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2516 AGTTTTGATGATAGCCAACTGCAAATTGGTGACATATCAAATTTTGTTGATGGTCCAGCT 2575
Query 2394 TCCCTGAACGAGGCCCTTAACGACGGACTGAACTCAAGTTCTGATTGGTGTGCCAGAGTT 2453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 TCCCTGAACGAGGCCCTTAACGACGGACTGAACTCAAGTTCTGATTGGTGTGCCAGAGTT 2635
Query 2454 GCAGCTTTTAATTTTCTCCAAACTCTGCTGCAGCAAGGCCCAAAAGGTGCTCAAGAAGTA 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 GCAGCTTTTAATTTTCTCCAAACTCTGCTGCAGCAAGGCCCAAAAGGTGCTCAAGAAGTA 2695
Query 2514 ATTCAAAGTTTCGAGAAAGTAATGAAACTATTTCTCCGGCATTTGGATGATCCTCACCAC 2573
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696 ATTCAAAGTTTTGAGAAAGTAATGAAACTATTTCTCCGGCATTTGGATGATCCTCACCAC 2755
Query 2574 AAGGTCGCACAAGCAGCACTGTCGACACTCGCAGATCTTATACCATCTTGCCGAAAGCCT 2633
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2756 AAGGTCGCACAAGCAGCACTGTCGACACTTGCAGATCTTATACCATCTTGCCGAAAGCCT 2815
Query 2634 TTTGAGAGCTACATGGAAAGAGTCCTACCCCATGTCTTTTCACGGCTAATCGATCCTAAA 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2816 TTTGAGAGCTACATGGAAAGAGTCCTACCCCATGTGTTTTCACGGCTAATTGACCCTAAA 2875
Query 2694 GAGGTAGTTAGACAACCTTGCTCCTCAACCTTGGAAATTGTCAGCAAAACCTACAGTGTG 2753
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876 GAAGTAGTTAGACAACCTTGCTCCTCAACCTTGGAAATTGTCAGCAAAACCTACAGTGTG 2935
Query 2754 GATTCCCTTTTGCCTGCATTGCTTCGTTCACTGGATGAGCAGAGATCACCAAAGGCTAAA 2813
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 GATTCCCTTTTACCTGCATTGCTTCGTTCACTGGATGAACAGAGATCACCAAAGGCTAAA 2995
Query 2814 TTAGCTGTGATTGAATTTGCCATCAACTCCTTCAACAGGTACGCTGGTAACCCTGAAATT 2873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 TTAGCTGTGATTGAATTTGCCATCAACTCCTTCAACAGGTACGCTGGTAACCCTGAAATT 3055
Query 2874 TCGGGTAATAGTGGCATCTTAAAGTTGTGGCTGGCAAAGTTGACGCCATTAACCCGCGAC 2933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 TCGGGTAATAGTGGCATCTTAAAGTTGTGGCTGGCAAAGTTGACGCCATTAACCCGCGAC 3115
Query 2934 AAAAATACCAAGTTGAAAGAAGCTTCCATTACTTGCATCATATCTGTTTACAATCATTAT 2993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 AAAAATACCAAGTTGAAAGAAGCTTCCATTACTTGCATCATATCTGTTTACAATCATTAT 3175
Query 2994 GATTCTGCGGGACTGCTAAATTACATTCTTAGTTTGTCGGTTGAGGAGCAAAACTCTCTG 3053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 GATTCTGCGGGACTGCTAAATTACATTCTTAGTTTGTCGGTTGAGGAGCAAAACTCTCTG 3235
Query 3054 AGAAGAGCCCTCAAACAATATACTCCCCGCATCGAGGTGGACCTGTTAAACTATATGCAG 3113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 AGAAGAGCCCTCAAACAATATACTCCCCGCATCGAGGTGGACCTGTTAAACTATATGCAG 3295
Query 3114 AGTAAAAAGGAAAAACAGAGAATAAAGTCTTATGACCCGTCTGATGCCATTGGGACATCA 3173
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 AGTAAAAAGGAAAAACAGAGAATTAAGTCTTATGACCCATCTGATGCCATTGGGACATCA 3355
Query 3174 TCTGAGGAAGGATATGCTGGTGCCCCCAAGAAGAATATATTCCTTGGCCGGTATTCTGGG 3233
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 TCTGAGGAAGGATATGCTGGTGCCTCCAAGAAGAATATATTCCTTGGCCGGTATTCTGGG 3415
Query 3234 GGTTCTGTTGACAGTGATAGTGGCAGGAAGTGGAGTTCTTCCCAGGAGCCAACAATGACC 3293
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3416 GGTTCTATTGACAGTGATAGTGGCAGGAAGTGGAGTTCTTCCCAGGAGCCAACAATGATC 3475
Query 3294 ACTGGTGGTGTTGGTCAAAGTGTTTCCAGTGGAACCCAGGAAAAGCTGTATCAGAACCTC 3353
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3476 ACTGGTGGTGTTGGTCAAAATGTTTCCAGTGGAACCCAGGAAAAGCTGTATCAGAACGTT 3535
Query 3354 AGAACTGGGATCAGTTCAGCTAGTGATCTGTTGAACCCCAAGGATTCTGATTACACATTT 3413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3536 AGAACTGGGATCAGTTCAGCTAGTGATCTGTTGAACCCCAAGGATTCTGATTACACATTT 3595
Query 3414 GCTTCAGCTGGTCAGAATTTGATATCAAGAACTAGCCCTAATGGAAGCTCAGACAACATC 3473
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 3596 GCTTCAGCTGGTCAGAATTCGATATCAAGAACTAGCCCCAATGGAAGCTCAGAAAACATC 3655
Query 3474 GAAATCTTGGATGACTTATCTCCACCACATTTGGAGAAAAATGGTCTGAATCTGACAAGC 3533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3656 GAAATCTTGGATGACTTATCTCCACCACATTTGGAGAAAAATGGTCTAAATCTGACAAGC 3715
Query 3534 GCTGATTCCTTGGAAGGAAGACATGAAAATGAGGTCTCCCGCGAATTAGATTTAGGTAAC 3593
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3716 GTTGATTCCTTGGAAGGAAGACATGAAAATGAGGTCTCCCGCGAATTAGATTTAGGTCAC 3775
Query 3594 TACATGCTTGCATCTATAAAGGTCAATC-CAACACCGGAATCTGGACCTAGCATTCCTCA 3652
|||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3776 TACATGCTCACATCTATTAAGGTCAA-CACAACACCGGAATCTGGACCTAGCATTCCTCA 3834
Query 3653 GATTCTACATATGATCAACGGGAGTGATGGAAGCCCTTCTTCCAGCAAAAAATCTGGACT 3712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3835 GATTCTACATATGATCAACGGGAGTGATGGAAGCCCTTCTTCTAGCAAGAAATCTGGACT 3894
Query 3713 CCAGCAATTGATTGAAGCCTCTGTAGCTAACGAGGAATCAGTTTGGACCAAGTACTTCAA 3772
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3895 CCAGCAATTAATTGAAGCCTCTGTAGCTAACGAGGAATCAGTTTGGACCAAGTACTTCAA 3954
Query 3773 TCAAATTTTGACTGTGGTTCTTGAAGTGCTCGATGACGAAGATTTTTCAATCAGAGAGCT 3832
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3955 TCAAATTTTGACGGTTGTTCTTGAAGTGCTCGATGACGAAGATTTTTCAATCAAAGAGCT 4014
Query 3833 TGCTCTTTCACTGATTTCTGAAATGCTAAAGATCCAGAAAGATGCCATGGAAGATTCTGT 3892
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4015 TGCTCTTTCATTGATTTCTGAAATGCTAAAGAGCCAGAAAGATGCCATGGAAGACTCTGT 4074
Query 3893 TGAAATAGTGATCGAAAAGCTGCTTCATGTCTCAAAGGACACTGTTCCAAAAGTTTCCAC 3952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4075 TGAAATAGTGATCGAAAAGCTGCTTCATGTCTCAAAGGACACCGTTCCAAAAGTTTCCAC 4134
Query 3953 TGAAGCTGAGCAATGTTTGACCACGGTCTTGTCCCAATACGATCCTTTCAGATGCTTAAG 4012
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4135 TGAAGCTGAGCAATGTTTGACCACAGTCTTGTCCCAATACGATCCTTTCAGATGCTTAAG 4194
Query 4013 TGTTATTGTCCCATTATTGGTGACGGAAGATGAGAAAACTCTTGTCGCTTGCATAAATTG 4072
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4195 CGTTATTGTCCCATTATTGGTGACGGAAGATGAGAAAACTCTTGTCGCTTGCATAAATTG 4254
Query 4073 TTTAACGAAGCTTGTGGGTAGGCTCTCGCAAGAGGAATTAATGGATCAGTTGTCGTCTTT 4132
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4255 TTTAACGAAGCTTGTGGGTAGGCTCTCGCAAGAGGAATTAATGGATCAATTGTCGTCTTT 4314
Query 4133 TTTGCCGGCGGTTTTTGAAGCATTTGGGAGCCAAAGCGCAGATGTCCGCAAGACAGTGGT 4192
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4315 TTTGCCTGCGGTTTTTGAAGCATTTGGGAGCCAAAGCGCGGATGTCCGCAAGACAGTGGT 4374
Query 4193 GTTCTGTCTGGTAGACATATATATAATGCTTGGGAAAGCATTTTTGCCGTATTTGGAAGG 4252
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4375 GTTCTGTCTAGTAGACATATATATAATGCTTGGGAAAGCATTTTTGCCGTATTTGGAAGG 4434
Query 4253 TCTAAACAGCACGCAGGTTCGTCTAGTGACCATCTACGCAAACCGGATCTCGCAGGCTAG 4312
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4435 TCTAAACAGCACGCAGGTTCGTCTAGTGACCATCTATGCAAACCGGATCTCGCAGGCTAG 4494
Query 4313 AACCGGTGCTCCTATCGATGCAAACACCTGACGAACGGCGTGTACTT 4359
|| |||||| |||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||
Sbjct 4495 AAACGGTGCCCCTATCGACGCAGACACCTGACGAGCCGCTTGTACTT 4541
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 217523864848
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5