BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg931786
Length=472
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G06630.1 | Symbols: | proline-rich extensin-like family pro... 516 8e-146
AT4G08410.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 512 1e-144
AT4G08400.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 503 6e-142
AT2G24980.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 496 1e-139
AT5G06640.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 442 1e-123
AT5G49080.1 | Symbols: | transposable element gene | chr5:1989... 359 1e-98
AT5G35190.1 | Symbols: | proline-rich extensin-like family pro... 313 1e-84
AT3G54590.1 | Symbols: ATHRGP1, HRGP1 | hydroxyproline-rich gly... 309 2e-83
AT4G13390.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 233 9e-61
AT3G54580.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 213 1e-54
> AT5G06630.1 | Symbols: | proline-rich extensin-like family protein
| chr5:2036361-2037843 REVERSE LENGTH=1483
Length=1483
Score = 516 bits (279), Expect = 8e-146
Identities = 371/415 (89%), Gaps = 8/415 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 25 GTGTGATGAGATCCTTAAGAACGATGGGATT-ATGGCACTGCATGGTCTATGTTGTGGTC 83
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Sbjct 15 GTGTGATGAGATCCTCAAGAACAATGGGATTAAT-GAATTGCATGGTTTATGTTGTGGTC 73
Query 84 CTAAGTGCTATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCTTACTCATCCCCTCAAACCCCATCT 143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||
Sbjct 74 CTAAGTGCTATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCTTACTCATCTCCTCATACCCCAGCT 133
Query 144 TACAATTCTCCCGGCCACAAACACAAAGGCCCTAAA-TACGCGCCACATCCAAAACCATA 202
||| |||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 134 TACGATTCTCCCAGCTATGAACACAAAGGCCC-AAAGTACGCACCACATCCGAAACCATA 192
Query 203 TGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGT 261
||||||||| |||||||| ||||||||||| | | || || |||||||| |||| || |
Sbjct 193 TGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTA-TACTCCATCACCAAAGGTAAACTATAAAT 251
Query 262 CTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAA 321
|||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CTCCACCACCACCATACGTCTATAATTCTCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAA 311
Query 322 AGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACT 381
||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 312 AGGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCACCGTACT 371
Query 382 ACTCTCCTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 372 ACTCTCCTTCTCCTAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACA 425
Score = 326 bits (176), Expect = 2e-88
Identities = 220/241 (91%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGT-TGAC 254
|||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||| | ||
Sbjct 337 ACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCTAAGGTAT-AC 394
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
|||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 395 TACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCACTGTACTACTCTCCT 454
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 455 TCACCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGTTCCCCACCACCA 514
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 515 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTAC 574
Query 435 A 435
|
Sbjct 575 A 575
Score = 326 bits (176), Expect = 2e-88
Identities = 220/241 (91%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 487 ACCATACGTCTACAGTTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTTACT 545
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 546 ACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCAT 605
Query 316 CTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 606 CTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCTCCACCACCA 664
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 665 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTAC 724
Query 435 A 435
|
Sbjct 725 A 725
Score = 326 bits (176), Expect = 2e-88
Identities = 221/242 (91%), Gaps = 6/242 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGT-TGAC 254
|||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||||||| | ||
Sbjct 562 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTAC-TCTCCATCTCCAAAGGTAT-AC 619
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
|||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 620 TACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCT 679
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 TCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 739
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
|||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 740 CCGTACTACTCTCCATCTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTA 798
Query 434 CA 435
||
Sbjct 799 CA 800
Score = 326 bits (176), Expect = 2e-88
Identities = 220/241 (91%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 787 ACCGTACGTCTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTTACT 845
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 846 ATAAGTCTCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTT 905
Query 316 CTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 906 CTCCTAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCA 964
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 965 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTAC 1024
Query 435 A 435
|
Sbjct 1025 A 1025
Score = 322 bits (174), Expect = 2e-87
Identities = 242/274 (88%), Gaps = 8/274 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCC-AAAGGTTGAC 254
||| || || ||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||
Sbjct 1087 ACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCTAAA-GTTCAC 1144
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
|||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||
Sbjct 1145 TACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCCTATTACTCTCCT 1204
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1205 TCTCCTAAGGTTCACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCT 1264
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGACT-ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCT 432
|| ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1265 CCATACTACTCTCCTTCTCCTAAAG-TC-ACTTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCT 1322
Query 433 ACAAGACGCCTTACTATTGATTTTGAACTGTTTC 466
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 1323 ACAAGACGCCTTATTATTGATTTTGAATTGTTTC 1356
Score = 320 bits (173), Expect = 7e-87
Identities = 219/241 (91%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
||| || || ||||| || ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||| |||
Sbjct 412 ACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCACTGTACTAC-TCTCCTTCACCAAAGGTTTACT 470
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 471 ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGTTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTT 530
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 CTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 590
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 591 CGTACTACTCTCCATCTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTAC 649
Query 435 A 435
|
Sbjct 650 A 650
Score = 315 bits (170), Expect = 3e-85
Identities = 218/241 (90%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 637 ACCGTACGTCTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTTACT 695
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 696 ACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCAT 755
Query 316 CTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 756 CTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCTCCACCACCA 814
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 815 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTATAAGTCTCCACCTCCACCATACGTCTAC 874
Query 435 A 435
|
Sbjct 875 A 875
Score = 315 bits (170), Expect = 3e-85
Identities = 219/242 (90%), Gaps = 6/242 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGT-TGAC 254
|||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||| | ||
Sbjct 862 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCTAAGGTAT-AC 919
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
|||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 920 TACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCT 979
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 TCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 1039
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
||||||||||| || |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1040 CCGTACTACTCACCATCTCCAAATGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTA 1098
Query 434 CA 435
||
Sbjct 1099 CA 1100
Score = 309 bits (167), Expect = 2e-83
Identities = 217/241 (90%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || || | |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 262 ACCATACGTCTATAATTCTCCACCTCCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTTACT 320
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 321 ACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTT 380
Query 316 CTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 381 CTCCTAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCA 439
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 CTGTACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 499
Query 435 A 435
|
Sbjct 500 A 500
Score = 309 bits (167), Expect = 2e-83
Identities = 218/242 (90%), Gaps = 6/242 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGT-TGAC 254
|||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||||||| | ||
Sbjct 712 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTAC-TCTCCATCTCCAAAGGTAT-AC 769
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
|||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 770 TACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCT 829
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 830 TCTCCAAAGGTTTACTATAAGTCTCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCA 889
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
|||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 890 CCGTACTACTCTCCTTCTCCTAAGGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTA 948
Query 434 CA 435
||
Sbjct 949 CA 950
Score = 298 bits (161), Expect = 3e-80
Identities = 216/242 (89%), Gaps = 6/242 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 937 ACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTTACT 995
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 996 ACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCACCAT 1055
Query 316 CTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1056 CTCCAAATGTAT-ACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCACCA 1114
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
|| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1115 CCATACTACTCTCCTTCTCCTAAAG-TTCACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTA 1173
Query 434 CA 435
||
Sbjct 1174 CA 1175
Score = 182 bits (98), Expect = 3e-45
Identities = 143/165 (87%), Gaps = 2/165 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 272 ACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACT-CTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 330
||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| || |||||||| |||
Sbjct 187 ACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTA-TACTCCATCACCAAAGGTAAACT 245
Query 331 ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 390
| || || |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 246 ATAAATCTCCACCACCACCATACGTCTATAATTCTCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 305
Query 391 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 306 CTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTTTACA 350
Score = 99.0 bits (53), Expect = 4e-20
Identities = 80/92 (87%), Gaps = 6/92 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCC-AAAGGTTGAC 254
|||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| ||| | | ||
Sbjct 1237 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCTCCATACTAC-TCTCCTTCTCCTAAA-G-TCAC 1293
Query 255 -TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACA 285
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 TTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACA 1325
> AT4G08410.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr4:5339086-5341209 REVERSE LENGTH=2124
Length=2124
Score = 512 bits (277), Expect = 1e-144
Identities = 388/441 (88%), Gaps = 10/441 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGAAATAAGAAGAGTAGTAATGGGTGTGATGAGATCCTTAAGAACGATGGGATTATGG- 59
|||||| ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||
Sbjct 36 AAGAAAAAAG-ATAGTTGCAATGGGTGTGATTAGAACCTCAAGAACGATGGGGTTA-GGA 93
Query 60 CACTGCATGGTCTATGTTGTGGTCCTAAGTGCTATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCT 119
|| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 CAGTGCATGGTTTATGTTGTCGTCCTAAGTGCCATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCT 153
Query 120 TACTCATCCCCTCAAACCCCATC-TTACAATTCTCCCGGCCACAAACACAAAGGCCCTAA 178
||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||
Sbjct 154 TACACATCCCCTCAAACTCCA-CATTACAATTCTCCAAGCCATGAACACAAAATCCCTAA 212
Query 179 ATACGCGCCACATCCAAAACCATATGTTTACAGCTCTCCACC-CC-C-ACCATACTACT- 234
||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || | | |||||||||
Sbjct 213 GTACACACCACATCCAAAACCATCTATTTACAGCTCTTCACCACCTCCATCATACTACTC 272
Query 235 TCCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCAC 294
||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||
Sbjct 273 TCC-TTCTCCAAAGGTTGATTACAAGTCTCCACCACCATCATACGTTTACAGTTCCCCAC 331
Query 295 CCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACG 354
| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 332 CACCACCATACTACTCTCCGTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCTACCACCCCCATACG 391
Query 355 TCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCC 414
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
Sbjct 392 TCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTAACTACAAGTCTC 451
Query 415 CACCACCACCATACGTCTACA 435
|||| ||||||||||||||||
Sbjct 452 CACCGCCACCATACGTCTACA 472
Score = 335 bits (181), Expect = 2e-91
Identities = 220/239 (92%), Gaps = 2/239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
||||| || ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 1118
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||
Sbjct 1119 CAAGTCTCCACCACCACCATACGTTTACAGCTCCACACCACCACCATACTACAGTCCATC 1178
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1179 ACCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACC 1238
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1239 ATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACATCTACA 1297
Score = 331 bits (179), Expect = 3e-90
Identities = 220/240 (92%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 459 ACCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGGTGACT 517
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 518 ACAAGTCTCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTT 577
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 578 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 637
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 638 CATACTACAGTCCAACTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 697
Score = 329 bits (178), Expect = 1e-89
Identities = 220/240 (92%), Gaps = 4/240 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 1210 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 1268
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 1269 CAAGTCCCCACCACCACCATACATCTACAGCTCCACACCACTACCATACTACAGTCCATC 1328
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 1329 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 1388
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCC-CCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1389 ATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAG-CCTCCACCACCACCATACGTCTACA 1447
Score = 329 bits (178), Expect = 1e-89
Identities = 219/239 (92%), Gaps = 2/239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 1360 CCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 1418
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 1419 CAAGCCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACAGTCCATC 1478
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 1479 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTTCCCACCCCCACC 1538
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1539 ATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCCCCATACGTCTACA 1597
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Identities = 218/239 (91%), Gaps = 2/239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 535 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 593
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 594 CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACAGTCCAAC 653
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 654 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 713
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 714 ATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCCCCATACGTGTACA 772
Score = 324 bits (175), Expect = 5e-88
Identities = 218/239 (91%), Gaps = 2/239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 910 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCACCAAAGGTTAACTA 968
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 969 CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACGGCTCTCCACCACCACCATACTACAGTCCATC 1028
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 1029 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACC 1088
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1089 ATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTTTACA 1147
Score = 322 bits (174), Expect = 2e-87
Identities = 217/238 (91%), Gaps = 2/238 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 760 CCATACGTGTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCACCAAAGGTTAACTA 818
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 819 CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACGGCTCTCCACCACCACCATACTACAGTCCATC 878
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 879 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACC 938
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
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Sbjct 939 ATACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTAACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTAC 996
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Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 385 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCACCAAAGGTTAACTA 443
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 444 CAAGTCTCCACCGCCACCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCATACTACAGTCCATC 503
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 504 TCCAAAGGGTGACTACAAGTCTCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACC 563
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 564 ATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 622
Score = 318 bits (172), Expect = 3e-86
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Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 685 CCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGTTGACTA 743
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 744 CAAGTCTCCACCACCCCCATACGTGTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTTC 803
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 804 ACCAAAGGTTAACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACGGCTCTCCACCACCACC 863
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 864 ATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 922
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Identities = 217/240 (90%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 984 ACCATACGTCTACGGCTCTCCACCACCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGTTGACT 1042
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1043 ACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTT 1102
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1103 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTTTACAGCTCCACACCACCAC 1162
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1163 CATACTACAGTCCATCACCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 1222
Score = 315 bits (170), Expect = 3e-85
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTC-CACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGAC 254
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Sbjct 1134 ACCATACGTTTACAGCTC-CACACCACCACCATACTACAGT-CCATCACCAAAGGTTGAC 1191
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
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Sbjct 1192 TACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCT 1251
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
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Sbjct 1252 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACATCTACAGCTCCACACCACTA 1311
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
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Sbjct 1312 CCATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTAC 1371
Query 435 A 435
|
Sbjct 1372 A 1372
Score = 315 bits (170), Expect = 3e-85
Identities = 219/242 (90%), Gaps = 6/242 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTC-CACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGAC 254
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Sbjct 1284 ACCATACATCTACAGCTC-CACACCACTACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGTTGAC 1341
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
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Sbjct 1342 TACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCT 1401
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCC-CCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
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Sbjct 1402 TCTCCAAAGGTTGACTACAAG-CCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACC 1460
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1461 ACCATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTA 1520
Query 434 CA 435
||
Sbjct 1521 CA 1522
Score = 315 bits (170), Expect = 3e-85
Identities = 215/237 (91%), Gaps = 2/237 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACT-TCCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 1585 CCATACGTCTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTCTCC-TTCACCAAAGGTTAACTA 1643
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 1644 TAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTC 1703
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 1704 TCCAAAAGTTGAATACAAGTCCCCACCACCCCCATACATCTATAGTTCCCCACCTCCACC 1763
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
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Sbjct 1764 ATACTACGCTCCTTCACCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTA 1820
Score = 309 bits (167), Expect = 2e-83
Identities = 216/240 (90%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 834 ACCATACGTCTACGGCTCTCCACCACCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGTTGACT 892
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 893 ACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTT 952
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 953 CACCAAAGGTTAACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACGGCTCTCCACCACCAC 1012
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1013 CATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 1072
Score = 309 bits (167), Expect = 2e-83
Identities = 215/238 (90%), Gaps = 4/238 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGC-TCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1510 CCATACGTCTACAGCTTC-CCACCCCCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGTTGACT 1567
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1568 ACAAGTCTCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTCTCCTT 1627
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||
Sbjct 1628 CACCAAAGGTTAACTATAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGTTCTCCACCACCAC 1687
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
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Sbjct 1688 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAAGTTGAATACAAGTCCCCACCACCCCCATACATCTA 1745
Score = 302 bits (163), Expect = 3e-81
Identities = 202/221 (91%), Gaps = 2/221 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 216 CCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACC 274
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Sbjct 1753 CCACCTCCACCATACTAC-GCTCCTTCACCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACC 1811
Query 275 ATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAA 334
||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1812 ATACGTCTATAGCTCCCCACCCCCACCATATTACTCTCCTTCTCCAAAAGTTGACTATAA 1871
Query 335 GTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCC 394
||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1872 GTCTCCACCTCCACCATACGTCTATAGCTCACCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCC 1931
Query 395 AAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1932 AAAGGTTAACTACAAGTCCCCACCACCACCATATGTCTACA 1972
Score = 268 bits (145), Expect = 3e-71
Identities = 212/243 (87%), Gaps = 10/243 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 1884 ACCATACGTCTATAGCTCACCACCACCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTAACT 1942
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1943 ACAAGTCCCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCCCCTT 2002
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCC-CCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
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Sbjct 2003 CTCCTAAGGTCGACTACAAATCTTCC-CCACCACAATATGTCTACAGCTCACCACCCACA 2061
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGACT-ACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTC 431
|| ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct 2062 CCATACTACTCTCCTTCTCCTAAAG-TC-ACTTACAAGTCTCCC-CCACCACCATATGTT 2118
Query 432 TAC 434
|||
Sbjct 2119 TAC 2121
> AT4G08400.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr4:5323800-5325341 REVERSE LENGTH=1542
Length=1542
Score = 503 bits (272), Expect = 6e-142
Identities = 373/421 (89%), Gaps = 9/421 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGGGTGTGATGAGATCCTTAAGAACGATGGGATTATGG-CACTGCATGGTCTATGTTGT 79
||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGGGTGTGATTAGAACCTCAAGAACGATGGGGTTA-GGACAGTGCATGGTTTATGTTGT 59
Query 80 GGTCCTAAGTGCTATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCTTACTCATCCCCTCAAACCCC 139
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 60 CGTCCTAAGTGCCATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCTTACACATCCCCTCAAACTCC 119
Query 140 ATC-TTACAATTCTCCCGGCCACAAACACAAAGGCCCTAAATACGCGCCACATCCAAAAC 198
| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||
Sbjct 120 A-CATTACAATTCTCCAAGCCATGAACACAAAATCCCTAAGTACACACCACATCCAAAAC 178
Query 199 CATATGTTTACAGCTCTCCACC-CC-C-ACCATACTACT-TCCCTTCTCCAAAGGTTGAC 254
||| | ||||||||||| |||| || | | ||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 179 CATCTATTTACAGCTCTTCACCACCTCCATCATACTACTCTCC-TTCTCCAAAGGTTGAT 237
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
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Sbjct 238 TACAAGTCTCCACCACCATCATACGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCTCCG 297
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
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Sbjct 298 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCTACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCA 357
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
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Sbjct 358 CCATACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTAACTACAAGTCTCCACCGCCACCATACGTCTAC 417
Query 435 A 435
|
Sbjct 418 A 418
Score = 335 bits (181), Expect = 2e-91
Identities = 220/239 (92%), Gaps = 2/239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
||||| || ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 539
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 540 CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACAGTCCAAC 599
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 659
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 ATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 718
Score = 331 bits (179), Expect = 3e-90
Identities = 220/240 (92%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 405 ACCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGGTGACT 463
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 464 ACAAGTCTCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTT 523
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 524 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 583
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 584 CATACTACAGTCCAACTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 643
Score = 324 bits (175), Expect = 5e-88
Identities = 219/240 (91%), Gaps = 4/240 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 853 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 911
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 912 CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACAGTCCAAC 971
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 972 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACC 1031
Query 377 GTACTACTC-TCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1032 ATACTA-TAGTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 1090
Score = 318 bits (172), Expect = 3e-86
Identities = 217/239 (91%), Gaps = 2/239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
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Sbjct 331 CCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCACCAAAGGTTAACTA 389
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 390 CAAGTCTCCACCGCCACCATACGTCTACAGCTCTCCACCACCACCATACTACAGTCCATC 449
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 450 TCCAAAGGGTGACTACAAGTCTCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACC 509
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 510 ATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 568
Score = 316 bits (171), Expect = 9e-86
Identities = 218/240 (91%), Gaps = 5/240 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||
Sbjct 705 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCACCAAAGGTTAACT 763
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 764 ACAAGTCTCCACCACCACCATA---CTACAGATCTCCACCACCACCATACTACAGTCCAT 820
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 821 CTCCAAAGGTTGATTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCAC 880
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 CATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 940
Score = 313 bits (169), Expect = 1e-84
Identities = 212/233 (91%), Gaps = 2/233 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 555 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACAGT-CCAACTCCAAAGGTTGACT 613
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 614 ACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTACAGTCCAT 673
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 674 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 733
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATAC 428
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Sbjct 734 CATACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTAACTACAAGTCTCCACCACCACCATAC 786
Score = 313 bits (169), Expect = 1e-84
Identities = 210/230 (91%), Gaps = 2/230 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 207 TACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCC 265
||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 787 TACAGATCTCCACCACCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGTTGATTACAAGTCCCC 845
Query 266 ACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT 325
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Sbjct 846 ACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT 905
Query 326 TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTC 385
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Sbjct 906 TGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACAG 965
Query 386 TCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 966 TCCAACTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 1015
Score = 303 bits (164), Expect = 7e-82
Identities = 215/239 (90%), Gaps = 5/239 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 198 CCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 256
||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||
Sbjct 631 CCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTACAGT-CCATCTCCAAAGGTTGACTA 689
Query 257 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 316
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Sbjct 690 CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCTTC 749
Query 317 TCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACC 376
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Sbjct 750 ACCAAAGGTTAACTACAAGTCTCCACCACCACCATAC-T--ACAGATCTCCACCACCACC 806
Query 377 GTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 807 ATACTACAGTCCATCTCCAAAGGTTGATTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACA 865
Score = 300 bits (162), Expect = 9e-81
Identities = 214/239 (90%), Gaps = 4/239 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTAC-TTCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||
Sbjct 927 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACAGT-CCAACTCCAAAGGTTGACT 985
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACT-CTCCT 314
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Sbjct 986 ACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTA-TAGTCCA 1044
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
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Sbjct 1045 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCCCCATACGTCTACAGTTCCCCACCCCCA 1104
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
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Sbjct 1105 CCATACTACTCTCCTTCACCAAAAGTTGACTATAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTA 1163
Score = 279 bits (151), Expect = 1e-74
Identities = 214/243 (88%), Gaps = 10/243 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1302 ACCATACGTCTATAGCTCCCCACCACCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTAACT 1360
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1361 ACAAGTCCCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCCCCTT 1420
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1421 CTCCAAATGTCGACTACAAATCTCCC-CCACCACCATATGTCTACAGCTCACCACCCACA 1479
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGACT-ACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTC 431
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Sbjct 1480 CCATACTACTCTCCTTCTTCTAAAG-TC-ACTTACAAGTCTCCC-CCACCACCATATGTC 1536
Query 432 TAC 434
|||
Sbjct 1537 TAC 1539
> AT2G24980.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr2:10622453-10624132 FORWARD LENGTH=1680
Length=1680
Score = 496 bits (268), Expect = 1e-139
Identities = 350/390 (90%), Gaps = 4/390 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 48 ATGGGATTATG-GCACTGCATGGTCTATGTTGTGGTCCTAAGTGCTATTGCGGCTACAGT 106
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Sbjct 1 ATGGGAATA-GAGAACTGCATAGTTTATGTTGTGGTTCTAAGTGCTATTGCGGCTACGGT 59
Query 107 GACATCATACCCTTACTCATCCCCTCAAACCCCATCTTACAATTCTCCCGGCCACAAACA 166
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Sbjct 60 GACATCATACCCTTACTCATCTCCTCAAACCCCAAGTTACAATTCTCCCAGCTATGAACA 119
Query 167 CAAAGGCCCTAAATACGCGCCACATCCAAAACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACC 226
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||
Sbjct 120 CAAAGGCCCTAAGTACGCGCCACATCCAAAACCATATGTTAAAAGTTCCCCACCACCACA 179
Query 227 ATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACA 285
||||||| | || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 180 ATACTAC-ACTCCATCGCCAAAGGTAAACTACAAATCTCCACCACCACCATATGTATACA 238
Query 286 GCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCAC 345
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Sbjct 239 GCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCATCTCCAAAGGTAGACTACAAGTCCCCACCAC 298
Query 346 CACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 405
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 299 CACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTATTACTCTCCATCTCCAAAGGTTGACT 358
Query 406 ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
||||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 359 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTATACA 388
Score = 326 bits (176), Expect = 2e-88
Identities = 219/240 (91%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 300 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTATTAC-TCTCCATCTCCAAAGGTTGACT 358
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 359 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTATACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCAT 418
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 419 CTCCAAAGGTAGACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAACTCCCCGCCCCCAC 478
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 479 CGTACTATTCTCCATCTCCAAAGGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCGTACGTCTACA 538
Score = 326 bits (176), Expect = 2e-88
Identities = 222/243 (91%), Gaps = 8/243 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGT-TGAC 254
||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||
Sbjct 525 ACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCGTACTA-TTCTCCTTCTCCAAAGGTAT-AC 582
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 583 TACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTATTCTCCT 642
Query 315 TCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 643 TCTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACC 701
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCT 432
||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 702 ACCGTACTATTCTCCTTCTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCT 760
Query 433 ACA 435
|||
Sbjct 761 ACA 763
Score = 326 bits (176), Expect = 2e-88
Identities = 221/242 (91%), Gaps = 6/242 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGT-TGAC 254
|||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||
Sbjct 600 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTA-TTCTCCTTCTCCAAAGGTAT-AC 657
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 658 TACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTATTCTCCT 717
Query 315 TCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 718 TCTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACC 776
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 777 ACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCGTACGTCTA 836
Query 434 CA 435
||
Sbjct 837 CA 838
Score = 315 bits (170), Expect = 3e-85
Identities = 219/242 (90%), Gaps = 6/242 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
||| || || |||| ||| || |||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 450 ACCGTACGTCTACAACTCCCCGCCCCCACCGTACTA-TTCTCCATCTCCAAAGGTAGACT 508
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 509 ACAAGTCTCCACCACCACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCGTACTATTCTCCTT 568
Query 316 CTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 569 CTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCA 627
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
|||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 628 CCGTACTATTCTCCTTCTCCAAAGGTAT-ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTA 686
Query 434 CA 435
||
Sbjct 687 CA 688
Score = 198 bits (107), Expect = 3e-50
Identities = 146/165 (88%), Gaps = 2/165 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 272 ACCATATGTCT-ACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 330
||||||||| | | || |||||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||
Sbjct 150 ACCATATGT-TAAAAGTTCCCCACCACCACAATACTACACTCCATCGCCAAAGGTAAACT 208
Query 331 ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 390
|||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 209 ACAAATCTCCACCACCACCATATGTATACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCAT 268
Query 391 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 CTCCAAAGGTAGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 313
Score = 99.0 bits (53), Expect = 4e-20
Identities = 80/92 (87%), Gaps = 6/92 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCC-AAAGGTTGAC 254
|||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| ||| | | ||
Sbjct 1575 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCTCCATACTAC-TCTCCTTCTCCTAAA-G-TCAC 1631
Query 255 -TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACA 285
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632 TTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACA 1663
> AT5G06640.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr5:2039859-2041928 REVERSE LENGTH=2070
Length=2070
Score = 442 bits (239), Expect = 1e-123
Identities = 371/432 (86%), Gaps = 19/432 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGGGTGTGATGAGATCCTTAAGAACGATGGGATTATGGCACTGCATGGTCTATGTTGTG 80
|||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||
Sbjct 49 ATGGGTATGATGAGATCCTCAAGAACGATGGGGTTAGGGCATTGCATGGTTTACGTTGTG 108
Query 81 GTCCTAAGTGCTATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCTTACTC--------A-TC--CC 129
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 109 GTCCTAAGTGCCATTGCGGCTACAGTGACATCATACCCTTACTCCTCTCCTTACTCATCC 168
Query 130 C-TCAAACCCCATC-TTACAATTCTCCCGGCCACAAACACAAAGGCCCTAAATACGCGCC 187
| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 169 CCTCAAACCCCA-CATTACAATTCTCCCAGCCATGAACACAAAAGCCCTAAGTACGCGCC 227
Query 188 ACATCCAAAACCATATGTTTACAGCTCTCCACC-CC-C-ACCATACTACTTC-CCTTCTC 243
||||||||||||||| ||||| | |||||||| || | | ||||||| ||| |||||||
Sbjct 228 ACATCCAAAACCATACGTTTATATTTCTCCACCACCTCCATCATACTA-TTCTCCTTCTC 286
Query 244 CAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGT 303
|||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |
Sbjct 287 CAAAAGTAAACTATAAGTCTCCACCACCACCAAACGTCTACAACTCTCCACCTCCACCAT 346
Query 304 ACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCT 363
|||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 347 ACTATTCTCCTTCACCAAAGGTTGATTATAAGTCTCCACCACCACCTTACGTCTACAGTT 406
Query 364 CCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCAC 423
||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||
Sbjct 407 CCCCACCTCCACCATACTATTCTCCTTCTCCGAAGGTTGACTATAAGTCTCCTCCACCAC 466
Query 424 CATACGTCTACA 435
||||||||||||
Sbjct 467 CATACGTCTACA 478
Score = 331 bits (179), Expect = 3e-90
Identities = 221/241 (92%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||| |||
Sbjct 915 ACCATATGTCTACAGCTCTCCACCCCCACCGTACTAC-TCACCATCTCCAAAAGTTTACT 973
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 974 ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTACTCTCCAT 1033
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||
Sbjct 1034 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCGTATGTTTACAGCTCTCCACCCCCAC 1093
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTCTAC 434
| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1094 CATACTACTCTCCTTCGCCTAAGGTTGACTACAAGTCTCCC-CCACCACCATACGTCTAC 1152
Query 435 A 435
|
Sbjct 1153 A 1153
Score = 320 bits (173), Expect = 7e-87
Identities = 218/240 (91%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
||| || || |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| || |
Sbjct 840 ACCGTACGTCTACAATTCTCCACCTCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCTAAGGTAGAGT 898
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
Sbjct 899 ACAAGTCCCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCTCCACCCCCACCGTACTACTCACCAT 958
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CTCCAAAAGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 1018
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1019 CATACTACTCTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCGTATGTTTACA 1078
Score = 316 bits (171), Expect = 9e-86
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 465 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTA-TTCTCCTTCGCCAAAGGTTGAAT 523
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 524 ACAAGTCTCCACCACCACCGTACGTCTACAATTCTCCACCTCCACCATACTACTCTCCTT 583
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 584 CTCCTAAGATAGAGTACAAGTCCCCACCACCACCATATGTCTACAGTTCTCCACCCCCAC 643
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 644 CGTACTACTCTCCATCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACA 703
Query 436 A 436
|
Sbjct 704 A 704
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACT-TCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1065 ACCGTATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTCTCC-TTCGCCTAAGGTTGACT 1123
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1124 ACAAGTCTCCCCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCGCCCCCACAATACTACTCTCCTT 1183
Query 316 CTCCAAAGGTTGAC-TACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
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Sbjct 1184 CGCCAAAGGTTG-CGTACAAGTCTCCC-CCACCACCATACGTCTACAGCTCTCCGCCCCC 1241
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGAC-TACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTC 431
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Sbjct 1242 ACCTTACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTG-CGTACAAGTCTCCC-CCACCACCATACGTC 1299
Query 432 TACA 435
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Sbjct 1300 TACA 1303
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 540 ACCGTACGTCTACAATTCTCCACCTCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCTAAGATAGAGT 598
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 599 ACAAGTCCCCACCACCACCATATGTCTACAGTTCTCCACCCCCACCGTACTACTCTCCAT 658
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 659 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAACTCCCCACCCCCAC 718
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTCTAC 434
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Sbjct 719 CATACTACTCTCCTTCGCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCC-CCACCACCGTACGTCTAC 777
Query 435 A 435
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Sbjct 778 A 778
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 315 ACCAAACGTCTACAACTCTCCACCTCCACCATACTA-TTCTCCTTCACCAAAGGTTGATT 373
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 374 ATAAGTCTCCACCACCACCTTACGTCTACAGTTCCCCACCTCCACCATACTATTCTCCTT 433
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 434 CTCCGAAGGTTGACTATAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 493
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 494 CATACTATTCTCCTTCGCCAAAGGTTGAATACAAGTCTCCACCACCACCGTACGTCTACA 553
Query 436 A 436
|
Sbjct 554 A 554
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 765 ACCGTACGTCTACAGTTCCCCACCCCCACCATACTTC-TCTCCTTCGCCAAAGGTTGAAT 823
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 824 ACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAATTCTCCACCTCCACCATACTACTCTCCTT 883
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 884 CTCCTAAGGTAGAGTACAAGTCCCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCTCCACCCCCAC 943
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 944 CGTACTACTCACCATCTCCAAAAGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 1003
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGC-TCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGAC 254
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Sbjct 1815 ACCATACGTCTATAGCTTC-CCACCCCTACCATATTA-TTCTCCTTCTCCAAAGGTTGAC 1872
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
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Sbjct 1873 TACAAGTCTCCACCACTACCATACGTTTACAGCTCCCCACCCCCACTATATTACTCTCCT 1932
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
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Sbjct 1933 TCTCCAAAGGTTCATTACAAATCTCCACCACCACCATACGTGTATAACTCTCCACCTCCA 1992
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT-ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
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Sbjct 1993 CCATACTATTCTCCTTCTCCAAAGGTC-ACTTACAAGTCTCCACCACCCCCATATGTCTA 2051
Query 434 CAAGACGCCTTACTATTGA 452
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Sbjct 2052 CAAGGCGCCTTACTATTGA 2070
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1740 ACCATACGTTTACAGTTCTCCGCCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCTCCTATGGTTGACT 1798
Query 256 ACAAGTCT-CCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
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Sbjct 1799 ACAAGTCTACC-CCCCCACCATACGTCTATAGCTTCCCACCCCTACCATATTATTCTCCT 1857
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
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Sbjct 1858 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACTACCATACGTTTACAGCTCCCCACCCCCA 1917
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGT 430
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Sbjct 1918 CTATATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTCATTACAAATCTCCACCACCACCATACGT 1973
Score = 281 bits (152), Expect = 3e-75
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1440 ACCATACGTCTACAGCTCCCCTCCCCCACCTTACTAC-TCTCCTTCACCAAAGGTTGAGT 1498
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1499 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGTTCCCCTCCCCCACCATACCACTCTCCTT 1558
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCA-CCCCCA 374
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Sbjct 1559 CGCCTAAGGTAAACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCC-ATCCCCCA 1617
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
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Sbjct 1618 CCATACTACTCTCCTTCGCCTAAGGTAAACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTAC 1677
Query 435 A 435
|
Sbjct 1678 A 1678
Score = 276 bits (149), Expect = 2e-73
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1515 ACCATACGTCTACAGTTCCCCTCCCCCACCATACCAC-TCTCCTTCGCCTAAGGTAAACT 1573
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCA-CCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
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Sbjct 1574 ACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCT-CCCATCCCCCACCATACTACTCTCCT 1632
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
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Sbjct 1633 TCGCCTAAGGTAAACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 1692
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTCTA 433
|| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1693 CCATACTACTCTCCTTCGCCTAAGGTTAACTACAAGTCTCCC-CCACCACCATACGTTTA 1751
Query 434 CA 435
||
Sbjct 1752 CA 1753
Score = 276 bits (149), Expect = 2e-73
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1665 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCATACTAC-TCTCCTTCGCCTAAGGTTAACT 1723
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1724 ACAAGTCTCCCCCACCACCATACGTTTACAGTTCTCCGCCCCCACCATACTACTCTCCTT 1783
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTC--CCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
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Sbjct 1784 CTCCTATGGTTGACTACAAGTCTACCC-CC-CCACCATACGTCTATAGCTTCCCACCCCT 1841
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1842 ACCATATTATTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACTACCATACGTTTA 1901
Query 434 CA 435
||
Sbjct 1902 CA 1903
> AT5G49080.1 | Symbols: | transposable element gene | chr5:19890784-19892809
REVERSE LENGTH=2026
Length=2026
Score = 359 bits (194), Expect = 1e-98
Identities = 225/240 (94%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 450 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTACGCCAAAGGTTGACT 508
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 509 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTATTACTCTCCTT 568
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 569 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 628
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 629 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 688
Score = 359 bits (194), Expect = 1e-98
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 525 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTATTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 583
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 584 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTT 643
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 644 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 703
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 704 CGTACTACTCTCCTACGCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 763
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 375 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACTACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 433
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 434 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTA 493
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 494 CGCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 553
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 554 CGTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 613
Score = 353 bits (191), Expect = 7e-97
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 600 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 658
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 659 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTA 718
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 719 CGCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 778
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 779 CGTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACTACCATACGTCTACA 838
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 825 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTAC-TCTCCTTCGCCAAAGGTTGACT 883
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 884 ACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTT 943
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 944 CGCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 1003
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1004 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 1063
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 900 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCGCCAAAGGTTGACT 958
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 959 ACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTT 1018
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1019 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 1078
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1079 CGTACTACTCTCCTACGCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 1138
Score = 353 bits (191), Expect = 7e-97
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 975 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 1033
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1034 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTA 1093
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1094 CGCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 1153
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1154 CGTATTACTCTCCTTCGCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 1213
Score = 350 bits (189), Expect = 9e-96
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1125 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTATTAC-TCTCCTTCGCCAAAGGTTGACT 1183
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 1243
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1244 CGCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCAC 1303
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1304 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTTTACA 1363
Query 436 A 436
|
Sbjct 1364 A 1364
Score = 344 bits (186), Expect = 4e-94
Identities = 223/241 (93%), Gaps = 2/241 (1%)
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1425 ACCATACGTTTACAGCTCTCCACCTCCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGATT 1483
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1544 CACCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCTCCACCTCCAC 1603
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1604 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATATGTTTACA 1663
Query 436 A 436
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Sbjct 1664 A 1664
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 359 ACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACTACCGTACTACTCTCCTT 418
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 419 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 478
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 675 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTACGCCAAAGGTTGACT 733
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Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 750 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTATTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 808
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 809 ACAAGTCTCCACCACTACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 868
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 869 CGCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 928
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1050 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTAC-TCTCCTACGCCAAAGGTTGACT 1108
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1109 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTATTACTCTCCTT 1168
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1169 CGCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCAC 1228
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1229 CGTACTACTCTCCTTCGCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACA 1288
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1200 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTAC-TCTCCTTCGCCAAAGGTTGACT 1258
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1259 ACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 1318
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1319 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTTTACAACTCCCCACCTCCAC 1378
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1379 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTTTACA 1438
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1275 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 1333
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1334 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTTTACAACTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 1393
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1394 CTCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTTTACAGCTCTCCACCTCCAC 1453
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1454 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGATTACAAGTCTCCACCACCACCGTACGTCTACA 1513
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1350 ACCATACGTTTACAACTCCCCACCTCCACCGTACTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTTGACT 1408
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1409 ACAAATCTCCACCACCACCATACGTTTACAGCTCTCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 1468
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1469 CTCCAAAGGTTGATTACAAGTCTCCACCACCACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 1528
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 1529 CGTACTACTCTCCCTCACCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 1588
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 225 ACCATACGTCTACAGCTCACCACCTCCACCGTACTAC-ACTCCTTCTCCAAAGGTTGATT 283
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 284 ATAAATCTCCCCCACCACCATACGAATACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 343
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 344 CTCCAAAGATTGACTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACTAC 403
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 404 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA 463
Score = 311 bits (168), Expect = 4e-84
Identities = 214/236 (91%), Gaps = 4/236 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACT-TCCCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
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Sbjct 1500 ACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCC-TCACCAAAGGTTGACT 1558
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
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Sbjct 1559 ACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCTCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTT 1618
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
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Sbjct 1619 CTCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCACCACCACCATATGTTTACAACTCCCCACCTCCAC 1678
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTC-CCCACCACCACCATACGT 430
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Sbjct 1679 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAAGTTGACTACAAATCTCCC-CCACCACCATACGT 1733
> AT5G35190.1 | Symbols: | proline-rich extensin-like family protein
| chr5:13434181-13435167 FORWARD LENGTH=987
Length=987
Score = 313 bits (169), Expect = 1e-84
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Strand=Plus/Plus
Query 169 AAGGCCCTAAATACGCGCCACATCCAAAACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCAT 228
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Sbjct 197 AAGGCCCTAAGTACACGCCACATCCAAAACCGTATCTTTTCAACTCTCCACCACCACCTT 256
Query 229 ACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGC 287
| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 257 ATTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAAC 315
Query 288 TCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACC 346
|| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||| || || |||||
Sbjct 316 TCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAAG-TAGACTACAAATCTCCTCCACC 374
Query 347 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 406
|||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 375 ACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAATA 434
Query 407 CAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAA 436
|||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 435 CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAA 464
Score = 283 bits (153), Expect = 9e-76
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| || |
Sbjct 375 ACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTAGAAT 433
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||| ||
Sbjct 434 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTT 493
Query 316 CTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||
Sbjct 494 CTCCTAAAG-TAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCA 552
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
|| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 553 CCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTAC 612
Query 435 AA 436
||
Sbjct 613 AA 614
Score = 148 bits (80), Expect = 3e-35
Identities = 135/160 (84%), Gaps = 9/160 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || |||| ||||||||| ||||| || | | || |||||||||||||| ||||
Sbjct 675 ACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTTC-TCTCCTTCTCCAAAGGTAGACT 733
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACC-CC-C-ACCGTACTACTCTC 312
| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||
Sbjct 734 ATAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTCTC 793
Query 313 CTTCTCCA-AAGGTT-GACTACAAGTCCCCACCACCACCA 350
|||||||| ||| | | ||||||||| |||||||| |||
Sbjct 794 CTTCTCCAGAAG-TCAG-CTACAAGTCTCCACCACCTCCA 831
> AT3G54590.1 | Symbols: ATHRGP1, HRGP1 | hydroxyproline-rich glycoprotein
| chr3:20206160-20208472 FORWARD LENGTH=2163
Length=2163
Score = 309 bits (167), Expect = 2e-83
Identities = 216/240 (90%), Gaps = 2/240 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || || || |||||||||||||
Sbjct 750 ACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCACCATACTAC-TCACCATCCCCAAAGGTTGACT 808
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT 315
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |
Sbjct 809 ACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACTCACCAT 868
Query 316 CTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC 375
| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 869 CCCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCAC 928
Query 376 CGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA 435
| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 929 CATACTACTCACCATCCCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTTTACA 988
Score = 281 bits (152), Expect = 3e-75
Identities = 212/241 (88%), Gaps = 4/241 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCC-AAAGGTTGAC 254
|||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| || || || ||| || |||
Sbjct 675 ACCATACGTCTACAGTTCCCCACCACCACCATACTA-TTCACCATCCCCTAAA-GTAGAC 732
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||
Sbjct 733 TACAAGTCTCCCCCACCACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCACCATACTACTCACCA 792
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 793 TCCCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCA 852
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
|| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 853 CCATACTACTCACCATCCCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTAC 912
Query 435 A 435
|
Sbjct 913 A 913
Score = 270 bits (146), Expect = 7e-72
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT 255
|||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| || || || |||||||||||||
Sbjct 900 ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTAC-TCACCATCCCCAAAGGTTGACT 958
Query 256 ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTA-CTACTCTCCT 314
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Sbjct 959 ACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTTTACAGTTCCCCACCACCACC-AACCTACTCTCCA 1017
Query 315 TCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA 374
|| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1018 TCCCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCA 1077
Query 375 CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC 434
|| |||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||
Sbjct 1078 CCATACTACTCACCATCCCCAAAGGTTGAGTACAAATCTCCTCCACCACCGTATGTCTAC 1137
Query 435 A 435
|
Sbjct 1138 A 1138
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Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTG-AC 254
||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| || |
Sbjct 1350 ACCGTACGTGTACAGTTCTCCACCACCACCATACTAC-TCACCTTCTCCTAAGG-TGTAT 1407
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||
Sbjct 1408 TACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGTTCTCCACCTCCACCATATTACTCACCT 1467
Query 315 TCTCCAAAGGTTG-ACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
|| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1468 TCCCCTAAGG-TGTACTACAAATCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCTCCACCTCC 1526
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTG-ACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCT 432
||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527 ACCATATTACTCACCTTCCCCTAAGGT-GCACTACAAATCCCCACCACCACCATACGTCT 1585
Query 433 ACA 435
|||
Sbjct 1586 ACA 1588
Score = 255 bits (138), Expect = 2e-67
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Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTG-AC 254
|||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||| || |||| || ||
Sbjct 1425 ACCATACGTCTACAGTTCTCCACCTCCACCATATTAC-TCACCTTCCCCTAAGG-TGTAC 1482
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCT 314
||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||
Sbjct 1483 TACAAATCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCTCCACCTCCACCATATTACTCACCT 1542
Query 315 TCTCCAAAGGTTG-ACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
|| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1543 TCCCCTAAGG-TGCACTACAAATCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCTCCACCTCC 1601
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTG-ACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCT 432
||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 ACCATATTACTCACCTTCCCCTAAGGT-GCACTACAAATCCCCACCACCACCATACGTCT 1660
Query 433 ACAA 436
||||
Sbjct 1661 ACAA 1664
Score = 220 bits (119), Expect = 7e-57
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Strand=Plus/Plus
Query 255 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTAC-TACTCTCC 313
||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 283 TACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTATAGTTCTCCACCCCCACCA-ACATACTCCCC 341
Query 314 TTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCC 373
|||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 342 ATCTCCAAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAGTTCTCCACCACC 401
Query 374 ACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTA 433
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Sbjct 402 ACCATATTACTCGCCTTCTCCTAAGGTCGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTA 461
Query 434 CAA 436
|||
Sbjct 462 CAA 464
Score = 150 bits (81), Expect = 1e-35
Identities = 134/158 (85%), Gaps = 10/158 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCC-CCACCATACTACTTC-CCTTCTCC-AAAGGTTG- 252
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Sbjct 1725 ACCTTACGTCTACAGTTCTCC-CCCACCACCGTACTAC-TCTCCTTCACCTAAA-G-TGT 1780
Query 253 ACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTC 312
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Sbjct 1781 ACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCTCCACCACCACCATATTACTCCC 1840
Query 313 CTTCTCCAAAGGT-TGACTACAAGTCCCCACCACCACC 349
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Sbjct 1841 CTTCCCCTAAGGTGT-ACTACAAGTCTCCACCACCACC 1877
> AT4G13390.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr4:7783818-7785326 FORWARD LENGTH=1509
Length=1509
Score = 233 bits (126), Expect = 9e-61
Identities = 210/249 (84%), Gaps = 11/249 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 ACCATATGTTTACAGCTCTCCA-C-CC-CCACCATACTACTTCCCTTCTCCAAAGGTTGA 253
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Sbjct 494 ACCATACATCTACAGCTCCCCACCACCTCCCCCTTACTACTCCCCTTCTCCTAAGGTTGA 553
Query 254 CTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACC-CC-CA-CCGTACTACTC 310
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Sbjct 554 CTACAAATCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCTCCACCACCTCCTCCATACTACTC 613
Query 311 TCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCT--CC-CC 367
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Sbjct 614 CCCTTCTCCTAAGGTAGAGTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTACAGTTTTCCACC 673
Query 368 ACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTG-ACTACAAGTCCCCACCACCACCAT 426
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Sbjct 674 ACCTCCTCCATACTACTCCCCTTCTCCTAAGGTTGGA-TACAAATCTCCACCAGCACCAT 732
Query 427 ACGTCTACA 435
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Sbjct 733 ATGTCTACA 741
> AT3G54580.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr3:20200688-20203782 REVERSE LENGTH=3095
Length=3095
Score = 213 bits (115), Expect = 1e-54
Identities = 189/225 (84%), Gaps = 4/225 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 213 TCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACC 271
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Sbjct 2284 TCTCCTCCACCACCATACTAC-GCACCTACTCCTAAGGTACATTACAAGTCTCCTCCACC 2342
Query 272 ACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA 331
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Sbjct 2343 ACCATATGTCTACAGTTCTCCACCACCTCCATATTACTCACCTTCTCCTAAGGTTCACTA 2402
Query 332 CAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTC 391
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Sbjct 2403 CAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCACCATACTATTCACCCTC 2462
Query 392 TCCAAAGGTTGACTACAAGTC-CCCACCACCACCATACGTCTACA 435
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Sbjct 2463 TCCTAAGGTAGAATACAAGTCTCCC-CCACCACCGTATGTTTACA 2506
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 22454663709
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5