BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg932069
Length=3713
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G21390.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr2:915200... 4695 0.0
AT1G62020.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr1:229195... 3779 0.0
> AT2G21390.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr2:9152006-9156878
FORWARD LENGTH=4190
Length=4190
Score = 4695 bits (2542), Expect = 0.0
Identities = 2749/2850 (96%), Gaps = 9/2850 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 864 GCGAACTGGAATCCAAACTTTTCGCCGTGAACATGATCGATTTTGGATACTTGCAGTTCA 923
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1069 GCGAACTGGAATCCAAACTTTTCGTCGTGAGCATGACCGATTCTGGATTCTTGCAGTTCA 1128
Query 924 CCCTGAGATTAATTTACTGGCAGCAGGACATGACAATGGTATGATTGTCTTCAAACTTGA 983
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1129 CCCTGAGATTAATCTACTTGCAGCAGGACATGACAATGGTATGATTGTTTTCAAACTTGA 1188
Query 984 GAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGTGATTCATTATTCTATGCCAAGGATAGATT 1043
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1189 GAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGTGATTCGTTATTCTATGCCAAAGATAGATT 1248
Query 1044 TTTGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAAAGATTCCCAAGTTATTCCTATACGGCGTCC 1103
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 TCTGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAAAGATTCCCAAGTTATTCCTATACGGCGTCC 1308
Query 1104 TGGTACCCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTTTATCGTACAGTCCGACAGAAAATGC 1163
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 TGGTACCCCAAGCTTGAATCAAAGTCCGAGGACTTTATCCTACAGTCCGACAGAAAATGC 1368
Query 1164 AGTCCTAATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTACGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1223
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 AGTCTTAATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTACGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1428
Query 1224 TAGCGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGGGGGACAGGGGGTTCTGCGGT 1283
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 TAGCGTTGGCAGGAGTGATGTTGTACAAGATGCAAAGAGGGGGACAGGGGGTTCTGCGGT 1488
Query 1284 GTTCATTGCTCGAAATCGGTTTGCTGTGCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTGAA 1343
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1489 GTTCATTGCTCGAAATCGGTTTGCTGTTCTGGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGTTAGTGAA 1548
Query 1344 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1403
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTTTACCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1608
Query 1404 TTATGCTGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGGTCTGAGGATAAAGTGGTTATATTTGACCT 1463
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 TTATGCTGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTGGTTATATTTGACCT 1668
Query 1464 TCAACAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCTTTTGTTAGGTATGTTGTTTGGTC 1523
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1669 TCAACAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCGTTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTC 1728
Query 1524 TAACGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATTGCGAGCAAAAA 1583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 TAACGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATTGCGAGCAAAAA 1788
Query 1584 ACTTGTCCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACAATACGTGTGAAAAGCGGAGCTTGGGACGA 1643
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1789 ACTTGTCCTACAGTGCACGCTTCATGAGACAATACGTGTGAAAAGTGGAGCATGGGACGA 1848
Query 1644 CAATGGTGTCTTCATTTACACAACTCTGAACCACATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGA 1703
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1849 CAATGGTGTCTTCATTTACACTACTCTGAACCACATCAAGTACTGTCTGCCTAATGGAGA 1908
Query 1704 TAGTGGAATCATCAGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGAAATAC 1763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 TAGTGGAATCATCAGAACCCTGGATGTCCCAATCTACATCACCAAGGTGTCTGGAAATAC 1968
Query 1764 AATCTTTTACTTGGACCGGGATGGGAAAAACAGGGCTATCACCATTAATGCAACCGAATA 1823
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 AATCTTTTGCTTGGACCGGGATGGGAAAAACAGGGCTATCACCATTAATGCAACCGAATA 2028
Query 1824 CATTTTCAAGCTTGCACTGCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 1883
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 CATTTTCAAGCTTGCACTACTGAGAAAGAAATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 2088
Query 1884 CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATCGCTTATCTTCAGCAGAAAGGCTTTCCTGAAGT 1943
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2089 CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATCGCTTATCTTCAGCAGAAAGGATTTCCTGAAGT 2148
Query 1944 TGCCCTCCACTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAACTTGGCTCTTGAAAGTGGCAA 2003
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 TGCCCTACACTTTGTTGAAGACGAGAGGATCCGATTCAACTTGGCTCTTGAAAGTGGCAA 2208
Query 2004 CATCAGTGTAGCTGTTGCATCCGCTACAGAGATTAATGAGAAAGACCACTGGTATAGACT 2063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 CATCAGTGTAGCTGTTGCATCCGCTACAGAGATTAATGAGAAAGACCACTGGTATAGACT 2268
Query 2064 CGGAGTGGAGGCTCTTCGTCAAGGAAATTCTAGAATTGTTGAATTTGCATACCAGCAGAC 2123
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 2269 CGGAGTGGAAGCTCTTCGTCAAGGAAATTCTAGAATTGTTGAGTTTGCGTACCAGCAGAC 2328
Query 2124 AAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTATATCTCATTACTGGCAATTTAGACAAGCTGTC 2183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2329 AAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTATATCTCATTACTGGCAATTTAGACAAGCTGTC 2388
Query 2184 AAAGTTGATGAAAATTGCAGAGGTGAAGAACAATGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTCT 2243
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2389 AAAGTTGATGAAGATTGCAGAGGTGAAGAACAATGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCACT 2448
Query 2244 CTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTAGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCT 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 CTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTAGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCT 2508
Query 2304 AGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCCATTGA 2363
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2509 AGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAACTGACATTGCTGAGCGACTAGCAATTGA 2568
Query 2364 GTTAGGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGGAAAACTCCATCGCTTTTAATGCCACC 2423
| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 GCTAGGAGACAATGTGCCTTCATTGCCTGAAGGGAAGACTCCATCGCTTTTAATGCCACC 2628
Query 2424 GCCTCCCATCATGTGTGGTGGCGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGA 2483
| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2629 GTCTCCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTACTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGA 2688
Query 2484 AGGAGGGCTTGAGAGTGCAAACCGAGGAGGGGCTGTTGATGAAGTAGAAGAAGATGTTGA 2543
|||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2689 AGGAGGACTTGAGAGTGCAAA-C-A-GAGGGGCTGTTGATGAAGAAGAAGAAGATGTTGA 2745
Query 2544 AGGCGACTGGGGTGAGGGACTTGATAAATTCGATGTTGATGGAATGGAGAACACAGACAT 2603
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2746 AGGCGACTGGGGTGAGGGACTTGACAAATTCGATGTTGATGGAATGGAGAACACAGACAT 2805
Query 2604 TGAAGCCATATTGGATGGTGCAGAAGCAGCTGAAGATGAAGACGACGAGGAAGGTGGATg 2663
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806 CGAAGCCATATTGGATGGTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAGACGACGAGGAAGGTGGAT- 2864
Query 2664 ggggggACTTGAAGACTTGGAGCTTCCACCAGAGCTTGATACTCCTAAAGCCTCTGCTAA 2723
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 --GGGGACTT---GACTTGGATCTTCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTAA 2919
Query 2724 CGCACGTTCATCTATTTTTGTGACACCTACTCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATTTGGAG 2783
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2920 CGCACGTTCATCTACTTTTGTGACACCTCCTCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATTTGGAG 2979
Query 2784 CCAGAAATCTTCCCTTGCTGCTGAGCAGGCTGCAGCAGGAAGCTTCGACACTGCAATGCG 2843
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2980 TCAGAAATCTTCCCTTGCTGCTGAGCAGGCTGCAGCAGGAAGCTTCGACACTGCAATGCG 3039
Query 2844 TTTGCTCCACAGACAGCTTGGCATTAAGAACTTTGCTCCTTTGAAATCGATGTTTCTTGA 2903
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3040 TTTGCTCCACAGGCAGCTTGGCATTAAGAACTTTGCGCCTTTGAAATCGATGTTTCTTGA 3099
Query 2904 TCTGTTCAGTGGGAGCCATAGCTATCTGCGTGCCTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCTCT 2963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3100 TCTGTTCAGTGGGAGCCATAGCTATCTGCGTGCCTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCTCT 3159
Query 2964 TGCCATTGAGCGTGGATGGAGTGAGTCTTCCAGTCCTAACGTCCGTGGCCCGCCAGCTCT 3023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3160 TGCCATTGAGCGTGGATGGAGTGAGTCTTCCAGTCCTAACGTCCGTGGCCCGCCAGCTCT 3219
Query 3024 TGTTTTCGATTTCTCTCAGCTAGAAGCGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCCACAACAGC 3083
|||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3220 TGTTTTTGATTTCTCTCAGCTTGAAGCAAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAACAGC 3279
Query 3084 TGGGAAATTATCTGAGGCTCTCCGTGTCTTCCTTTCTATTCTCCAAACCATCCCATTGGT 3143
||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3280 TGGGAAACTATCTGAGGCTCTTCGTGTCTTCCTCTCTATTCTCCAAACCATCCCATTGGT 3339
Query 3144 GGTAGTTGAGTCAAGAAGAGAAGTCGATGATGTTAAGGAACTGGTCATCATTGTCAAAGA 3203
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3340 GGTAGTTGAGTCAAGAAGAGAAGTAGATGAGGTTAAGGAACTGGTCATCATTGTTAAAGA 3399
Query 3204 ATATGTCCTCGGTCTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAG 3263
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3400 ATATGTCCTCGGTCTTCAATTGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAG 3459
Query 3264 GCAGCAAGAGCTTGCTGCTTACTTCACTCACTGTAAACTCCAAACACCTCACCTACGGCT 3323
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3460 GCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTTCACTCACTGTAAACTTCAAACACCTCACCTACGGCT 3519
Query 3324 CGCGTACTTTAGTGCAATGACCGTCTGCTACAAGGCAAAGAACATGGCTACTGCTGCCCA 3383
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3520 CGCGTACTTCAGTGCAATGACCGTCTGCTACAAGTCAAAGAACATGGCTACTGCTGCTCA 3579
Query 3384 CTTCGCCAGAAGTTTGTTGGATACAAACCCTACTATTGAGAGCCAGGCCAGGACGGCTAG 3443
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3580 CTTCGCCAGAAGTTTGTTGGATACAAACCCAACTATTGAGAGCCAGGCCAGGACGGCTAG 3639
Query 3444 ACAAGTTATGCAAGCTGCTGACCGCAACATGACAGATGCAACCGCGCTCAACTACGACTT 3503
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3640 ACAAGTTATGCAAGCAGCTGAACGCAACATGACAGATGCAACAACACTCAACTACGACTT 3699
Query 3504 TAGAAACCCGTTTGTGATATGCGGGTCCACTTATGTGCCAATCTACAAAGGACAGAAAGA 3563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3700 TAGAAACCCGTTTGTGATATGCGGGTCCACTTATGTGCCAATCTACAAAGGACAGAAAGA 3759
Query 3564 TGTGGCATGTCCTTACTGCACTGCCCGGTTTGTACCAAGCCAGGAAGGTAACATCTGCTC 3623
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3760 CGTTGCATGTCCTTACTGCACTGCCCGGTTTGTACCAAGCCAGGAAGGTAACATTTGCTC 3819
Query 3624 GGTCTGTGATCTTGCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTCTGCGTCTCA 3683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 3820 GGTCTGTGATCTTGCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGCTTGCTATGCTCTGCCTCTCA 3879
Query 3684 AGTCCGGTGAACAAGTCAGATTGATTATGT 3713
|||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3880 AGTCCGGTGAACAAGTCAGAATGATTATGT 3909
Score = 1463 bits (792), Expect = 0.0
Identities = 841/865 (97%), Gaps = 2/865 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTAATGCTACGGATCGTCACCGTGAAGCTGAGCTTGATCGCTTCCCCTTGTGAACTGA 60
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134 TGGTAATGCTACTGATCGTCACCGTGAAGCTGAGCTTGATCGCTTCCCCTTGTGAACTGA 193
Query 61 TCTGATCTGAGAGTTGTTTCTGTTTCGTAATCTGTGAATATGCTGACGAAGTTCGAGACC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 194 TCTGATCTGAGAGTTGTTTCTGTTTCGTAATCTGTGAATATGCTGACCAAGTTCGAGACC 253
Query 121 AAGAGTAACCGAGTTAAGGGTCTGAGTTTCCACCCTAAACGACCATGGATTCTCGCCAGT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 254 AAGAGTAACCGAGTTAAGGGTCTGAGTTTCCACCCTAAACGACCATGGATTCTCGCGAGT 313
Query 181 TTGCACAGTGGTGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTATGGGTACTTTGATCGATAGATTT 240
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 314 TTACACAGTGGTGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTATGGGTACTTTGATCGACAGATTT 373
Query 241 GATGAGCACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCACAGTTCTCAGCCTTTATTCGTC 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 374 GATGAGCACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCACAACTCACAGCCTTTATTCGTC 433
Query 301 TCTGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTTTGGAACTAC-AAACTTCACAGGTGTCTTTT 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 434 TCTGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTTTGGAACTACAAAAC-TCACAGGTGTCTTTT 492
Query 360 CACTCTTCTCGGGCATCTTGATTATATCCGCACTGTCCAATTTCACCACGAAAACCCATG 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 CACTCTTCTCGGGCATCTTGATTATATCCGCACTGTCCAATTTCACCACGAAAACCCATG 552
Query 420 GATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGCATATGGAACTGGCAGTCAAGAACTTG 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct 553 GATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGCATTTGGAACTGGCAGTCTAGGACTTG 612
Query 480 TATTTCCGTGTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGTGCTTCTTTCCATCCAAAGGA 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 TATTTCCGTGTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGTGCTTCTTTCCATCCAAAGGA 672
Query 540 AGACCTTGTTGTGTCAGCATCACTGGATCAGACTGTCCGTGTTTGGGACATTGGTGCTCT 599
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 AGATCTTGTTGTATCAGCATCACTGGATCAGACTGTCCGTGTTTGGGACATTGGTGCTCT 732
Query 600 TAAGAAGAAGTCAGCATCTCCTGCTGATGACCTCATGCGATTTAGTCAGATGAATTCTGA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 TAAGAAGAAGTCAGCATCTCCTGCTGATGACCTCATGCGATTTAGTCAGATGAATTCTGA 792
Query 660 TCTTTTTGGTGGGGTTGACGCTATAGTTAAGTACGTACTTGAAGGTCATGATAGAGGAGT 719
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TCTTTTTGGAGGGGTTGACGCTATAGTTAAGTACGTCCTTGAAGGTCATGATAGAGGAGT 852
Query 720 AAACTGGGCTTCTTTTCATCCCACCCTTCCTCTCATTGTCTCTGGTGCCGATGACCGCCA 779
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 CAACTGGGCTTCTTTTCATCCCACACTTCCTCTCATTGTCTCTGGTGCCGATGACCGCCA 912
Query 780 AGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAAGTGGATACATTGCCAAGTCA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||
Sbjct 913 AGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAGGTGGATACATTGCGAGGTCA 972
Query 840 CATGAATAATGTTTCATCCGTTATG 864
|||||||| |||||||||||||||
Sbjct 973 TATGAATAACGTTTCATCCGTTATG 997
> AT1G62020.1 | Symbols: | Coatomer, alpha subunit | chr1:22919534-22924024
FORWARD LENGTH=4098
Length=4098
Score = 3779 bits (2046), Expect = 0.0
Identities = 2586/2849 (91%), Gaps = 28/2849 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 864 GCGAACTGGAATCCAAACTTTTCGCCGTGAACATGATCGATTTTGGATACTTGCAGTTCA 923
|||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||
Sbjct 988 GCGAACTGGACTTCAGACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCA 1047
Query 924 CCCTGAGATTAATTTACTGGCAGCAGGACATGACAATGGTATGATTGTCTTCAAACTTGA 983
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct 1048 CCCTGAGATGAATCTACTAGCAGCAGGACATGACAGTGGCATGATTGTGTTCAAGCTTGA 1107
Query 984 GAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGTGATTCATTATTCTATGCCAAGGATAGATT 1043
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATT 1167
Query 1044 TTTGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAAAGATTCCCAAGTTATTCCTATACGGCGTCC 1103
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1168 CTTGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAGGGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCC 1227
Query 1104 TGGTACCCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTTTATCGTACAGTCCGACAGAAAATGC 1163
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 1228 GGGTACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCCACTGAAAATGC 1287
Query 1164 AGTCCTAATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTACGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1223
||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 AGTTTTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCGTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1347
Query 1224 TAGCGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGGGGGACAGGGGGTTCTGCGGT 1283
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||
Sbjct 1348 TAGTGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACAGGTGGCTCTGCAGT 1407
Query 1284 GTTCATTGCTCGAAATCGGTTTGCTGTGCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTGAA 1343
|||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1408 ATTCATTGCCCGTAACCGATTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAAGTGCTAGTCAA 1467
Query 1344 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1403
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTCCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1527
Query 1404 TTATGCTGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGGTCTGAGGATAAAGTGGTTATATTTGACCT 1463
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1528 TTATGCTGGGACTGGGAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATCTTTGACCT 1587
Query 1464 TCAACAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCTTTTGTTAGGTATGTTGTTTGGTC 1523
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1588 CCAGCAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTC 1647
Query 1524 TAACGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATTGCGAGCAAAAA 1583
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1648 CAGTGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATCGCGAGCAAAAA 1707
Query 1584 ACTTGTCCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACAATACGTGTGAAAAGCGGAGCTTGGGACGA 1643
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1708 ACTTGTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGA 1767
Query 1644 CAATGGTGTCTTCATTTACACAACTCTGAACCACATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGA 1703
|||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 TAATGGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGA 1827
Query 1704 TAGTGGAATCATCAGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGAAATAC 1763
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1828 TAGTGGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATAC 1887
Query 1764 AATCTTTTACTTGGACCGGGATGGGAAAAACAGGGCTATCACCATTAATGCAACCGAATA 1823
|||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1888 AATCTTTTGCTTGGATCGGGATGGCAAAAACAAGGCTATCACCATTAATGCAACCGAGTA 1947
Query 1824 CATTTTCAAGCTTGCACTGCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 1883
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1948 CATTTTCAAGCTTTCACTGCTGAGGAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 2007
Query 1884 CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATCGCTTATCTTCAGCAGAAAGGCTTTCCTGAAGT 1943
||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2008 CTCTCAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTACCTGCAGCAGAAAGGATTCCCTGAAGT 2067
Query 1944 TGCCCTCCACTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAACT-TGGCTCTTGAAAGTGGCA 2002
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2068 TGCCCTCCATTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAA-TCTGGCTCTTGAAAGTGGCA 2126
Query 2003 ACATCAGTGTAGCTGTTGCATCCGCTACAGAGATTAATGAGAAAGACCACTGGTATAGAC 2062
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2127 ACATCAGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGAC 2186
Query 2063 TCGGAGTGGAGGCTCTTCGTCAAGGAAATTCTAGAATTGTTGAATTTGCATACCAGCAGA 2122
| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2187 TTGGAGTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTTGAGTTTGCATACCAGCAGA 2246
Query 2123 CAAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTATATCTCATTACTGGCAATTTAGACAAGCTGT 2182
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 2247 CAAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGAAATTTGGACAAGCTTT 2306
Query 2183 CAAAGTTGATGAAAATTGCAGAGGTGAAGAACAATGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTC 2242
||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2307 CAAAGTTGATGAAGATTGCAGAAGTGAAGAACAACGTAATGGGACAGTTTCACAATGCTC 2366
Query 2243 TCTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTAGAGAATGCTGGTCATTTGCCTC 2302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 TCTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTC 2426
Query 2303 TAGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCCATTG 2362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2427 TAGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTG 2486
Query 2363 AGTTAGGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGGAAAACTCCATCGCTTTTAATGCCAC 2422
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2487 AGTTAGGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCAC 2546
Query 2423 CGCCTCCCATCATGTGTGGTGGCGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTG 2482
|| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2547 CGACACCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTTCTTAGAGTGATGAAAGGAATATTTG 2606
Query 2483 AAGGAGGGCTTGAGAGTGCAAACCGAGGAGGGGCTGTTGATGAAGTAGAAGAAGATGTTG 2542
||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | | || |||||
Sbjct 2607 AAGGAGGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAAG-A-A-GA---TGTTG 2660
Query 2543 AAGGCGACTGGGGTGAGGGACTTGATAAATTCGATGTTGATGGAATGGAGAACACAGACA 2602
|||| || |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 2661 AAGGGGATTGGGGTGAGGAACTTGACA--TTA-ATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGATA 2717
Query 2603 TTGAAGCCATATTGGATGG-TGCAGAAGCAGCTGAAGATGAAGACGACGAGGAAGGTGGA 2661
|||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||
Sbjct 2718 TTGAAGACATTTTGGC-GGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGA 2776
Query 2662 TgggggggACTTGAAGACTTGGAGCTTCCACCAGAGCTTGATACTCCTAAAGCCTCTGCT 2721
||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2777 TGGGG---ACTTGAAGACTTGGTGCTCCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCT 2833
Query 2722 AACGCACGTTCATCTATTTTTGTGACACCTACTCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATTTGG 2781
|| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2834 AATGCACGTTCATCTGTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGAGCTGG 2893
Query 2782 AGCCAGAAATCTTCCCTTGCTGCTGAGCAGGCTGCAGCAGGAAGCTTCGACACTGCAATG 2841
|||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2894 AGCCAGAAATCTTCTCTTGCTGCTGAGCAAGCCGCAGCGGGAAGCTTCGACACTGCAATG 2953
Query 2842 CGTTTGCTCCACAGACAGCTTGGCATTAAGAACTTTGCTCCTTTGAAATCGATGTTTCTT 2901
||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 CGTCTGCTCCACAGACAGCTTGGTATCAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTA 3013
Query 2902 GATCTGTTCAGTGGGAGCCATAGCTATCTGCGTGCCTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCT 2961
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3014 GATCTGTTCAATGGCAGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATGTCCTGTGGTTCCA 3073
Query 2962 CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGTGAGTCTTCCAGTCCTAACGTCCGTGGCCCGCCAGCT 3021
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||
Sbjct 3074 CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTCCGTAGCCCACCAGCT 3133
Query 3022 CTTGTTT-TCGATTTCTCTCAGCTAGAAGCGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCCACAAC 3080
||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3134 CTTGTTTAT-GATTTCTCTCAGCTAGACGAGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAAC 3192
Query 3081 AGCTGGGAAATT-ATCTGAGGCTCTCCGTGTCTTCCTTTCTATTCTCCAAACCATCCCAT 3139
| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |
Sbjct 3193 AACTGGGAAATTCA-CTGAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTGCACACCATCCC-T 3250
Query 3140 -TGGTGGTAGTTGAGTCAAGAAGAGAAGTCGATGATGTTAAGGAACTGGTCATCATTGTC 3198
| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||| | || | || ||
Sbjct 3251 CTAGTGGTAGTCGAGACAAGAAGAGAAGTGGATGAGGTCAAGGAATTAATCGTTATCGTT 3310
Query 3199 AAAGAATATGTCCTCGGTCTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCG 3258
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3311 AAAGAATATGTCCTTGGTCTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCG 3370
Query 3259 GTGAGGCAGCAAGAGCTTGCTGCTTACTTCACTCACTGTAAACTCCAAACACCTCACCTA 3318
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||
Sbjct 3371 GTGAGGCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTA 3430
Query 3319 CGGCTCGCG-TACTTTAGTGCAATGACCGTCTGCTACAAGGCAAAGAACATGGCTACTGC 3377
||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||
Sbjct 3431 CGGCTTGCGCTGCTT-AGTGCAATGGGTGTCTGCTACAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGC 3489
Query 3378 TGCCCACTTCGCCAGAAGTTTGTTGGATACAAACCCTACTATTGAGAGCCAGGCCAGGAC 3437
| | | ||||||||||| ||||||| |||| ||| | | | || ||||| |||| ||
Sbjct 3490 TTCTAATTTCGCCAGAAGACTGTTGGAAACAAGCCC-AGT-T-GATAGCCAAGCCAAGAT 3546
Query 3438 GGCTAGACAAGTTATGCAAGCTGCTGACCGCAACATGACAGATGCAACCGCGCTCAACTA 3497
||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| ||| |||||
Sbjct 3547 GGCTAGACAAGTTGTGCAAGCCGCTGAACGTAACATGACCGATGAAACAAAGCTTAACTA 3606
Query 3498 CGACTTTAGAAACCCGTTTGTGATATGCGGGTCCACTTATGTGCCAATCTACAAAGGACA 3557
|||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||
Sbjct 3607 CGACTTCAGGAACCCTTTTGTGGTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACA 3666
Query 3558 GAAAGATGTGGCATGTCCTTACTGCACTGCCCGGTTTGTACCAAGCCAGGAAGGTAACAT 3617
|||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 3667 GAAAGACGTCTCATGTCCTTACTGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACAT 3726
Query 3618 CTGCTCGGTCTGTGATCTTGCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTCTGC 3677
|||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3727 CTGCACGGTCTGTGATCTAGCAGTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGTTATGCTCTCC 3786
Query 3678 GTCTCAAGTCCGGTGAACAAGT-CAGATT 3705
||||||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 3787 ATCTCAAGTCCGGTGATCAATTTCAGATT 3815
Score = 961 bits (520), Expect = 0.0
Identities = 685/767 (89%), Gaps = 2/767 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 99 TATGCTGACGAAGTTCGAGACCAAGAGTAACCGAGTTAAGGGTCTGAGTTTCCACCCTAA 158
|||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 151 TATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAAAGTAACAGAGTTAAGGGACTGAGTTTTCACCCTAA 210
Query 159 ACGACCATGGATTCTCGCCAGTTTGCACAGTGGTGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTAT 218
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 ACGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTAT 270
Query 219 GGGTACTTTGATCGATAGATTTGATGAGCACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCA 278
||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 GGGTACTTTGATCGATAGATTCGACGAACACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCA 330
Query 279 CAGTTCTCAGCCTTTATTCGTCTCTGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTTTGGAACTA 338
|| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 331 CAATTCTCAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTA 390
Query 339 CAAACTTCACAGGTGTCTTTTCACTCTTCTCGGGCATCTTGATTATATCCGCACTGTCCA 398
|||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 391 CAAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTAGGGCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCA 450
Query 399 ATTTCACCACGAAAACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGCATATG 458
|| || || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 451 GTTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCAAGTGATGATCAAACTATCCGTATATG 510
Query 459 GAACTGGCAGTCAAGAACTTGTATTTCCGTGTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTG 518
||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 GAACTGGCAATCACGGACTTGTGTTTCTGTATTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTG 570
Query 519 TGCTTCTTTCCATCC-AAAGGAAGACCTTGTTGTGTCAGCATCACTGGATCAGACTGTCC 577
||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || | ||||||||||| |
Sbjct 571 TGCTTCTTTCCATCCGAAA-GAAGACCTCGTCGTATCAGCTTCGTTAGATCAGACTGTTC 629
Query 578 GTGTTTGGGACATTGGTGCTCTTAAGAAGAAGTCAGCATCTCCTGCTGATGACCTCATGC 637
|||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||
Sbjct 630 GTGTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGATATCATGA 689
Query 638 GATTTAGTCAGATGAATTCTGATCTTTTTGGTGGGGTTGACGCTATAGTTAAGTACGTAC 697
| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |
Sbjct 690 GGTTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCCATTGTCAAGTACGTTC 749
Query 698 TTGAAGGTCATGATAGAGGAGTAAACTGGGCTTCTTTTCATCCCACCCTTCCTCTCATTG 757
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 750 TTGAAGGTCATGATAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTTATTG 809
Query 758 TCTCTGGTGCCGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGG 817
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 TCTCGGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGG 869
Query 818 AAGTGGATACATTGCCAAGTCACATGAATAATGTTTCATCCGTTATG 864
| ||||||||||||| | | || |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 870 AGGTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATG 916
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 184915351898
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5