BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg932155
Length=6617
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G22125.1 | Symbols: CSI1 | binding | chr2:9406263-9414518 FO... 1.127e+04 0.0
> AT2G22125.1 | Symbols: CSI1 | binding | chr2:9406263-9414518
FORWARD LENGTH=6941
Length=6941
Score = 1.127e+04 bits (6102), Expect = 0.0
Identities = 6448/6617 (97%), Gaps = 15/6617 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TTTAAGTGAAGTGAAGATATGGCAAGTGCACTTGGATGGAGATTTTCTTCCACTAATGGA 62
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 176 TTTAAGTGAAGTGAAGATATGACAAGTGCTCTTGGATGGAGATTTCCTTCCACTAATGGA 235
Query 63 AATGGCCTTGCCCCAAGCGACACGGAGAGAAATGGTGATATGAAGATGCAAGATTCAGAG 122
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 236 AATGGCCTTGCCCCAAGTGACACGGAGAGAAATGGGGATATGAAGATGCATGATTCAGAG 295
Query 123 CCCCCAACTCCACATTCAAGCACAAAGATGAGTTTGAGAGACCGGACAACCAGCATGGAA 182
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 CCCCCAACTCCACATTCAACCACAAAGATGAGTTTGAGAGACCGGACAACCAGCATGGAA 355
Query 183 GATCCAGATGGGACATTAGCAAGTGTTGCCCAATGCATTGAGCAGCTGCGCCAAGGTTCA 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 GATCCAGATGGGACATTAGCAAGTGTTGCCCAATGCATTGAGCAGCTGCGCCAAGGTTCA 415
Query 243 TCATCTGCACAAGAAAGAGAATATTGCCTGAAGCAGTTACTGGACCTTATAGAAATGCGT 302
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 TCATCTGCACAAGAAAGAGAATATTGTCTGAAGCAGTTACTGGACCTTATAGAAATGCGT 475
Query 303 GAAAATGCATTCAGCGCTGTCGGATCACACTCCCAAGCTGTGCCAGTACTTGTCTCTCTT 362
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 GAGAATGCATTCAGTGCTGTCGGATCACACTCCCAAGCTGTGCCAGTACTTGTCTCTCTT 535
Query 363 CTCCGATCAGGG-TCAGTTGGAGTGAAGATACAAGCTGCAACCGTCTTGGGTTCACTCTG 421
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 CTCCGATC-GGGATCAGTTGGAGTGAAGATACAAGCTGCAACCGTCTTGGGTTCACTCTG 594
Query 422 CAAGGAGAACGAACTTAGAGTTAAGGTGTTACTTGGGGGATGCATTCCCCCACTGCTTGG 481
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 595 CAAGGAGAACGAACTTAGAGTTAAGGTGTTACTTGGGGGATGCATTCCTCCATTGCTTGG 654
Query 482 TCTTCTCAAGTCCAGTTCAGTCGAAGGGCAGATCGCTGCAGCAAAGACAATCTATGCTGT 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TCTTCTCAAGTCCAGTTCAGTCGAAGGGCAGATCGCTGCAGCAAAGACAATCTATGCTGT 714
Query 542 TTCTGAAGGCGGGGTGAAAGACCATGTTGGATCAAAAATATTTTCCACTGAGGGAGTTGT 601
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 TTCTGAAGGTGGGGTTAAAGACCATGTTGGATCAAAAATATTTTCCACTGAGGGAGTTGT 774
Query 602 ACCAGTTCTGTGGGACCAATTGCGTAGTGGAAATAAGAAAGGAGAGGTTGATGGTTTGTT 661
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 ACCGGTTCTGTGGGACCAATTGCGCAGTGGAAATAAAAAAGGAGAGGTTGATGGTTTGTT 834
Query 662 AACTGGTGCACTTAAGAACCTTTCTAGTACCACTGAGGGATTTTGGTCTGAGACAATTCG 721
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 AACTGGTGCACTTAAGAACCTTTCTAGTACCACAGAGGGATTTTGGTCTGAGACAATTCG 894
Query 722 AGCTGGGGGAGTGGATGTACTTGTGAAGCTGCTTACAAGCGGGCAGTCAAGTACACTATC 781
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 AGCTGGGGGAGTGGATGTACTTGTGAAGCTGCTCACAAGCGGGCAGTCAAGTACACTATC 954
Query 782 TAATGTCTGCTTCCTTCTTGCATGTATGATGATGGAAGACGCCTCTGTTTGTTCCAGTGT 841
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TAATGTCTGCTTCCTTCTTGCGTGTATGATGATGGAAGACGCCTCTGTTTGTTCCAGTGT 1014
Query 842 ATTGACTGCAGACATTACAAAACAGCTTCTCAAGTTATTAGGATCGGGTAATGAAGCCCC 901
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 ATTGACTGCAGACATTACAAAACAGCTTCTCAAATTATTAGGATCGGGTAATGAAGCCCC 1074
Query 902 AGTGAGGGCAGAGGCTGCTGCTGCTCTCAAGTCGCTTTCTGCTCAATCTAAGGAAGCAAA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 AGTGAGGGCAGAGGCTGCTGCTGCTCTCAAGTCGCTTTCTGCTCAATCTAAGGAAGCAAA 1134
Query 962 GCGAGAAATCGCTAATTCGAATGGTATTCCTGTTTTAATAAATGCAACAATAGCTCCATC 1021
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 GCGGGAAATCGCTAATTCTAATGGTATTCCTGTTTTAATAAATGCAACAATAGCTCCATC 1194
Query 1022 TAAAGAATTTATGCAAGGTGAATATGCGCAAGCATTACAAGAAAATGCAATGTGTGCCCT 1081
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 TAAAGAATTCATGCAAGGTGAATATGCGCAAGCATTACAAGAAAATGCAATGTGTGCCCT 1254
Query 1082 TGCTAATATTTCCGGTGGTTTGTCATATGTCATATCAAGCCTTGGTCAGAGCCTTGAATC 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 TGCTAATATTTCCGGTGGTTTGTCATATGTCATATCAAGCCTTGGTCAGAGCCTTGAATC 1314
Query 1142 TTGCTCTTCGCCTGCTCAGACTGCCGACACCCTTGGGGCTTTAGCTTCAGCATTGATGAT 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 TTGCTCTTCGCCTGCTCAGACTGCCGACACCCTTGGGGCTTTAGCTTCAGCATTGATGAT 1374
Query 1202 ATATGATGGCAAGGCAGAAACTACAAGAGCATCAGATCCATTGGTCGTTGAGCAGACTCT 1261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1375 ATATGATGGCAAGGCAGAAACTACAAGAGCATCAGATCCATTGGTCGTTGAACAGACTCT 1434
Query 1262 GCTGAAGCAGTTTAAGCCTCGTCTACCATTCCTGGTGCAAGAACGTACAATTGAAGCACT 1321
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 GCTGAAGCAGTTTAAGCCTCGTCTACCATTCTTGGTGCAAGAACGTACAATTGAAGCACT 1494
Query 1322 TGCAAGTTTGTATGGGAACTCCATACTCTCTGTCAAACTTTCCAACTCGGATGCAAAACG 1381
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 TGCAAGTTTGTATGGGAATTCCATACTCTCTGTCAAACTTTCCAACTCGGATGCAAAACG 1554
Query 1382 TTTGCTTGTTGGTCAAATAACAATGGCGGTGAATGAGGTTCAAGATGAGCTTGTAAAGGC 1441
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTTGCTTGTTGGTCTAATAACGATGGCGGTGAATGAGGTTCAAGATGAGCTTGTAAAGGC 1614
Query 1442 TCTTCTGATGCTGTGTAACCATGAAGGTAGCCTGTGGCAAGCACTACAGGGCCGTGAAGG 1501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 TCTTCTGATGCTGTGTAACCATGAAGGTAGCCTGTGGCAAGCACTACAGGGCCGTGAAGG 1674
Query 1502 GATCCAATTGCTAATATCTCTTCTGGGTCTTTCATCCGAACAGCAGCAAGAATGTGCTGT 1561
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 GATCCAATTGCTAATATCTCTTTTGGGTCTTTCATCCGAACAGCAGCAAGAATGTGCTGT 1734
Query 1562 TGCACTTCTTTGCCTCTTGTCTAACGAAAATGATGAAAGCAAGTGGGCCATCACTGCTGC 1621
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 TGCACTTCTTTGCCTTTTGTCTAACGAAAATGATGAAAGCAAGTGGGCCATCACTGCTGC 1794
Query 1622 TGGAGGTATACCTCCACTTGTTCAAATTCTAGAGACTGGGTCGGCCAAAGCCAGGGAAGA 1681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 TGGAGGTATACCTCCACTTGTTCAAATTCTAGAGACTGGGTCGGCCAAAGCCAGGGAAGA 1854
Query 1682 CTCTGCAACCATCCTTAGGAACTTGTGCAATCATAGCGAAGATATACGTGCTTGTGTTGA 1741
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 CTCTGCAACTATCCTTAGGAACTTGTGCAATCATAGCGAAGATATACGTGCTTGTGTTGA 1914
Query 1742 AAGTGCTGATGCTGTCCCTGCTCTCTTATGGCTACTGAAGAATGGTAGTCCAAATGGTAA 1801
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 AAGTGCGGATGCTGTCCCTGCTCTCTTATGGCTACTAAAGAATGGTAGTCCAAATGGTAA 1974
Query 1802 AGAAATTGCCGCCAAGACATTGAATCATTTGATTCATAAATCAGATACTGCAACAATCAG 1861
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1975 AGAAATTGCCGCCAAGACATTGAATCATTTGATTCATAAATCAGATACTGCAACTATCAG 2034
Query 1862 TCAGCTTACTGCTTTGCTGACCAGTGATCTACCTGAGTCTAAAATTTACGTTTTGGATGC 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 TCAGCTTACTGCTTTGCTGACCAGTGATCTACCTGAGTCTAAAATTTACGTTTTGGATGC 2094
Query 1922 ATTGAAGAGTATGCTTTCTGTGGTCCCATTCAATGACATGTTACGTGAAGGCAGTGCTTC 1981
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2095 ATTGAAGAGTATGCTTTCTGTGGTCCCATTCAATGACATGCTACGTGAAGGCAGTGCTTC 2154
Query 1982 GAATGATGCTATTGAGACCATGATCAAGTTGATGAGCTCTGCTAAAGAAGAAACTCAAGC 2041
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2155 CAATGATGCTATTGAGACAATGATCAAGTTGATGAGCTCTGGTAAAGAAGAAACTCAAGC 2214
Query 2042 AAATTCAGCCTCAGCTCTTGCAGCTATCTTCCAGAGCAGAAAGGATTTGCGTGAGAGCGC 2101
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2215 AAATTCAGCATCAGCTCTTGCAGCTATCTTCCAGAGCAGAAAGGATTTGCGTGAGAGTGC 2274
Query 2102 TCTAGCCCTCAAAACTCTCTTGTCGGCCATAAAACTGTTAAATGTGGATTCGGAGAAGAT 2161
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2275 TCTAGCCCTCAAAACTCTCTTGTCGGCCATAAAACTGTTAAATGTGGATTCGGAGAGGAT 2334
Query 2162 CCTTGTTGAGTCTTGCCGCTGTGTGGCTGCAATTTTACTTTCGATTAAGGAGAATCGCGA 2221
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2335 CCTTGTTGAGTCTTGCCGCTGCCTGGCTGCAATTTTACTTTCAATTAAGGAGAATCGCGA 2394
Query 2222 TGTGGCCATTTCTGCCAGAGAAGCATTGCCTACCATTGTTTCTCTAGCCAACTCTTCCGT 2281
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2395 TGTGGCCATTTCTGCCAGAGAAGCATTGCCTACCATAGTATCTCTAGCCAACTCTTCTGT 2454
Query 2282 TCTAGAAGTTGCTGAGCAAGGAATGTGCGCTTTGGCTAATCTTATATTGGACAGTGAAGT 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 TCTAGAAGTTGCTGAGCAAGGAATGTGCGCTTTGGCTAATCTTATATTGGACAGTGAAGT 2514
Query 2342 GTCAGAGAAGGTCATTGTCGAAGATATTATTTTGTCAGCCACTAGAATCTTACGTGAAGG 2401
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 GTCAGAGAAGGTCATTGTCGAAGATATCATCTTGTCCGCCACTAGAATCTTACGTGAAGG 2574
Query 2402 TACAGTGTCTGGGAAGACTCTTGCTGCTGCGGCAATTGCCCGCCTGCTTAGTCGTCGCCG 2461
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2575 TACAGTGTCTGGGAAGACACTTGCTGCTGCGGCAATTGCCCGCCTCCTTAGTCGTCGCCG 2634
Query 2462 AATTGATTCTGCATTGACAGATTCTGTGAACCGTGCTGGAACAGTGCTTGCCTTAGTGTC 2521
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2635 AATTGATTCTGCATTGACAGATTCTGTGAACCGAGCTGGAACAGTGCTTACCTTAGTGTC 2694
Query 2522 TCTTCTAGAATCTGCCGACGGAAGATCTGATGCAATATCAGAGGCCCTCGATGCGCTTGC 2581
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2695 TCTTCTAGAATCTGCCGATGGAAGATCTGATGCAATATCAGAGGCCCTAGATGCGCTTGC 2754
Query 2582 TATATTCTCAAGGTCAGGAGTTAATGGAAATGTAAAACCAGCTTGGGTTGTTTTGGCTGA 2641
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2755 TATATTCTCAAGGTCAGGAGCTAATGGAAATGTAAAACCAGCTTGGGCTGTTTTGGCTGA 2814
Query 2642 ATCTCCTAACAGTATGGCCCCAATAGTCTCATCTATAGTGAGTGTTGCTAATCCTTCACT 2701
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 ATCTCCCAACAGTATGGCCCCAATAGTCTCATCTATAGTGAGTGTTGCTAATCCTTCACT 2874
Query 2702 ACAGGACAAAGCTATTGAAGTATTGTCAAGACTTTGCCGAGATCAGCCTATGGTTTTGGG 2761
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2875 ACAGGACAAAGCTATTGAAGTTTTGTCAAGACTTTGCCGAGATCAGCCTATTGTTTTGGG 2934
Query 2762 AAACATGGTCAACAATGCCAGAGATTGTGTGTCATCTATAGCTAAAAGGGTGATAAGTAC 2821
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2935 AAACATGGTCAACAATGCCAGAGATTGCGTGTCATCTATAGCTAAAAGGGTGATAAATAC 2994
Query 2822 CAGGGACCCGAAAATAAAAATTGGTGGAGCTGCTATTATTATCTGTGCTGCCAAAGTTAA 2881
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2995 CAGGGACCCGAAAATAAAAATTGGTGGAGCTGCTATTATTATCTGTGCTGCCAAAGTTGA 3054
Query 2882 CGACCAGAAGATGATAGAAAATCTGAATGAGACACAATTGTGTGCCAAATTTGTTCAAGC 2941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3055 CGACCAGAAGATGATAGAAAATCTGAATGAGACACAATTGTGTGCCAAATTCGTTCAAGC 3114
Query 2942 ACTTGTGCGGATTCTAGATTCATCTCAGATTTCTGTGCAAGATCAGGAAAAGGATGAGAA 3001
||||||| || || || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 ACTTGTG-GG------GA-TC--CT-AGA-TTCTGTGCAAGATCAGGAAAAGGATGAGAA 3162
Query 3002 AGATAAAATCTGCATATGCATTCATCCCAaagaaaaggaagaagatgaagaagaagaGGC 3061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3163 AGATAAAATCTGCATATGCATTCATCCCAAAGAAAAGGAAGAAGATGAAGAAGAAGAGGC 3222
Query 3062 AACAGAAAATAGGGAGGGTTCCACGGGGGCAACAGTTATTTCTGGTGACAATTTAGCCAT 3121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3223 AACAGAAAATAGGGAGGGTTCCACGGGGGCAACAGTTATTTCTGGAGACAATTTAGCCAT 3282
Query 3122 CTGGTTGCTCTCGGTTCTTTCTTGTCATGATGAAAAGAGCAGAGCAGTTATATTGGAGTC 3181
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3283 CTGGTTGCTCTCGGTTCTTTCTTGTCATGATGAAAAGAGCAGAGCAGTAATATTGGAGTC 3342
Query 3182 AGAAGGCATCGAGTTGATTACTGACAGAATAGGCAACCGTTTTCTCCAGGCTGATAATGG 3241
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3343 AGAAGGCATTGAGTTGATTACTGACAGAATAGGCAACCGTTTTCTCCAGGCTGATAATGG 3402
Query 3242 AGAAGACGCCAACATTTGGGTTTGTGCTTTATTGCTAGCCATACTTTTCCAGGACAGAGA 3301
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3403 AGAAGATGCCAACATTTGGGTTTGTGCTTTATTGCTGGCCATACTTTTCCAAGACAGAGA 3462
Query 3302 AATCACTCGCGCACATGCAACAATGAAGGCTGTTCCAGTGCTCTCAAATCTTGTGAAGTC 3361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3463 AATCACTCGCGCACATGCAACAATGAAGGCTGTTCCAGTGCTCTCAAATCTTGTGAAGTC 3522
Query 3362 AGAGGAATACGCAGACAGATATTTTGCAGCACAAGCTCTAGCTAGTCTTGTCTGTAACGG 3421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3523 AGAGGAATACGCAGACAGATATTTTGCAGCACAAGCTCTAGCTAGTCTTGTCTGTAACGG 3582
Query 3422 TAGTCGGGGAACTCTTCTATCTGTTGCAAACTCCGGTGCTGCGGCTGGGTTTATATCATT 3481
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3583 TAGTCGCGGAACTCTTCTATCTGTTGCAAACTCCGGTGCTGCGGCTGGGTTTATATCATT 3642
Query 3482 GCTTGGTTGTTCTGATGATGACATAAAAGAACTTCTGCAGCTGTCGCAGGAGTTTGCTTT 3541
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3643 GCTTGGTTGTTCTGATGATGACATAAAAGAACTTCTGCAGCTGTCGCAGGAGTTCACTTT 3702
Query 3542 AGTGCGATACCCGGACCAGGTTGCCCTTGAAAGGCTTTTCCGTGTTGAAGATATTAGAGT 3601
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3703 AGTGCGGTACCCAGACCAGGTTGCCCTTGAAAGGCTTTTCCGAGTTGAAGATATTAGAGT 3762
Query 3602 TGGGGCTACTTCTCGAAAGGCGATTCCCTTACTAGTTGAACTTCTTAAACCAATTCCAGA 3661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3763 TGGGGCTACTTCTCGAAAGGCGATTCCCTTACTAGTTGAACTTCTTAAACCAATTCCAGA 3822
Query 3662 CCGCCCCGGTGCTCCTCTACTTTCACTTAATCTTCTAACTCAGCTTGCTGGAGACTGTCC 3721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3823 CCGCCCCGGTGCTCCTCTACTTTCACTTAATCTTCTAACTCAGCTTGCTGGGGACTGTCC 3882
Query 3722 ACAAAATATGATTGTCATGGTAGAGTCAGGTGCTCTTGAGGGCCTCTCGAAATATCTTTC 3781
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3883 ACAAAATATGATTGTCATGGTAGAGTCAGGTGCTCTTGAGGGTCTCTCGAAATATCTTTC 3942
Query 3782 CCTTGGACCTCAGGACGAGCAAGAGGAAGCTGCAACTGGTCTTTTAGGCATCTTATTTAG 3841
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3943 CCTTGGACCTCAGGACGAGCAAGAGGAAGCTGCAACAGGTCTTTTAGGCATCTTATTTAG 4002
Query 3842 CAGTGCTGAAATTCGAAGGCATGAGTCAGCATTTGGCGCCGTCAGCCAACTTGTAGCAGT 3901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 4003 CAGTGCTGAAATTCGAAGGCATGAGTCAGCATTTGGCGCGGTCAGCCAACTTGTAGCTGT 4062
Query 3902 TTTGCGTCTTGGTGGAAGAGGAGCAAGGTACAGTGCCGCCAAGGCATTGGATAGTCTCTT 3961
||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4063 TTTGCGTCTAGGTGGAAGGGGGGCAAGGTACAGTGCCGCCAAGGCATTGGATAGTCTCTT 4122
Query 3962 TACTGCTGACCATATAAGAAATGCAGAGTCTTCTAGACAAGCTGTTCAGCCATTGGTAGA 4021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4123 TACTGCTGACCATATAAGAAATGCAGAGTCTTCTAGACAAGCTGTTCAGCCATTGGTAGA 4182
Query 4022 GATTCTTAACACTGGTTCAGAGAGGGAGCAGCATGCTGCTATTGCTGCACTTGTTAGGTT 4081
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4183 GATTCTCAACACTGGTTCAGAGAGGGAGCAGCATGCTGCTATTGCTGCACTTGTTAGGTT 4242
Query 4082 GTTGAGTGATAATCCATCACGGGCTCTGGCAGTTGCAGATGTGGAGATGAATGCAGTGGA 4141
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4243 GTTGAGTGATAATCCATCACGGGCTCTGGCAGTTGCAGATGTGGAGATGAATGCGGTGGA 4302
Query 4142 TGTTCTCTGCAGGATCCTTTCTTCAAACTATACGATGGAACTGAAGGGGGATGCTGCAGA 4201
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4303 TGTTCTCTGCAGGATCCTTTCTTCAAACTATACGATGGAACTGAAGGGAGATGCTGCAGA 4362
Query 4202 GCTGTGCTATGTTTTGTTTGCAAATACAAGGATTAGGTCTACAGTTGCTGCAGCGCGTTG 4261
|||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4363 GCTGTGTTATGTTCTGTTTGCAAATACAAGGATTAGATCTACAGTTGCTGCAGCGCGTTG 4422
Query 4262 TGTTGAGCCACTTGTCTCTCTTCTTGTGACTGAGTTCAGCCCTGCTCAGCATTCAGTTGT 4321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4423 TGTTGAGCCACTTGTCTCTCTTCTTGTGACTGAGTTCAGCCCTGCTCAGCATTCAGTTGT 4482
Query 4322 ACGTGCACTGGACAAGCTTGTCGATGATGAACAACTGGCTGAACTAGTTGCAGCTCATGG 4381
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4483 GCGTGCACTGGACAAGCTTGTCGACGATGAACAACTGGCTGAACTAGTTGCAGCTCATGG 4542
Query 4382 TGCTGTGGTTCCTCTTGTTGGCCTTCTCTATGGTAAAAACTATGTGCTTCATGAGGCTAT 4441
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4543 CGCTGTGGTACCTCTTGTTGGCCTTCTCTATGGTAAAAACTATGTGCTTCATGAGGCTAT 4602
Query 4442 ATCCAGGGCTTTAGTAAAGTTAGGTAAGGACAGGCCTTCTTGTAAACTGGAAATGGTGAA 4501
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4603 ATCCAGGGCTCTAGTAAAGTTGGGTAAGGACAGGCCTGCTTGTAAACTGGAAATGGTGAA 4662
Query 4502 AGCTGGAGTTATCGACTGCGTACTTGATATTCTCCACAAAGCTCCAGATTTTCTATGTGC 4561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4663 AGCTGGAGTTATCGACTGCGTACTTGATATTCTCCACGAAGCTCCAGATTTTCTATGTGC 4722
Query 4562 TGCGTTTTCAGAACTGCTTCGCATCCTCACAAATAATGCTACTATTGCCAAGGGACAATC 4621
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4723 TGCGTTTTCAGAACTGCTTCGAATCCTCACAAATAATGCTACTATTGCCAAGGGACAATC 4782
Query 4622 TGCTGCGAAAGTGGTGGAGCCACTTTTCCATTTGCTGACGAGATTGGAGTTTGGAGCTGA 4681
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4783 TGCTGCGAAAGTGGTGGAGCCACTTTTCCATTTGCTGACGAGGTTGGAGTTTGGAGCTGA 4842
Query 4682 TGGACAGCACAGTGCTCTGCAAGTTCTGGTAAATATCTTAGAACATCCACAATGCCGTGC 4741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4843 TGGACAGCACAGTGCTCTGCAAGTTCTGGTAAATATCTTAGAACATCCACAATGCCGCGC 4902
Query 4742 TGATTATACACTTACACCGCACCAAGTGATTGAACCGCTCATTCCGCTGCTGGAATCTCC 4801
||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||
Sbjct 4903 TGATTATACACTTACACCGCACCAAGTAATTGAGCCTTTAATTCCGCTACTGGAATCTCC 4962
Query 4802 ATCCCCAGCAGTACAGCAGTTGGCAGCTGAGCTTCTGTCTCATCTTCTCTACGAGGAACA 4861
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4963 ATCCCCAGCAGTCCAGCAGTTGGCAGCTGAGCTTCTATCTCATCTTCTCTACGAGGAGCA 5022
Query 4862 TCTGCAGAAAGATCCATTAACGCAACTTGCGATCGGTCCTTTAATCCATGTGCTGGGATC 4921
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5023 TCTGCAGAAAGATCCATTAACGCAACTTGCGATTGGTCCTCTAATCCATGTGCTGGGATC 5082
Query 4922 CGGCATACACCTATTACAGCAGAGAGCTGTGAAAGCTCTTGTTAGCATTGCTCTAACATG 4981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 5083 CGGCATACACCTATTACAGCAGAGAGCTGTGAAAGCTCTCGTCAGCATTGCTCTAACATG 5142
Query 4982 GCCAAATGAAATAGCTAAAGAAGGTGGTGTGAGTGAGCTGTCAAAGGTAATACTGCAAGC 5041
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5143 GCCAAATGAAATAGCTAAAGAAGGTGGTGTGAGTGAGCTGTCAAAGGTGATACTGCAAGC 5202
Query 5042 TGATCCATCGCTTTCCAATGTGTTATGGGAGTCTGCAGCATCAATTTTGGTTATCATCTT 5101
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5203 TGATCCATCGCTCTCCAATGTGTTATGGGAGTCTGCAGCATCAATTTTGGTTATCATCTT 5262
Query 5102 GCAATTTAGCTCCGAATTTTACCTGGAAGTTCCTGTCGCTGTTCTTGTAAGACTGCTTCG 5161
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5263 GCAATTTAGCTCCGAATTTTACCTGGAAGTTCCTGTTGCTGTTCTTGTAAGACTGCTTCG 5322
Query 5162 CTCTGCATCTGAAAACACTGTGGTTGGTGCACTTAACGCTCTTCTAGTGTTGGAAAGTGA 5221
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5323 TTCTGCATCTGAAAACACCGTGGTTGGTGCACTTAACGCTCTTCTAGTGTTGGAAAGCGA 5382
Query 5222 TGATGGAACCAGTGCAGAGTCCATGGCTGAAAGTGGTGCCATAGAAGCTCTGCTTGATCT 5281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5383 TGATGGAACCAGTGCAGAGTCCATGGCTGAAAGTGGTGCCATAGAAGCTCTGCTTGATCT 5442
Query 5282 TTTAAGGTCTCATCAGTGTGAGGACACAGCAGCGAGACTGCTCGAGGTACTGCTCAACAA 5341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5443 TTTAAGGTCTCATCAGTGTGAGGACACAGCAGCGAGACTGCTCGAGGTACTGCTCAACAA 5502
Query 5342 TGTGAAGATTAGAGATTCAAAAGCCACCAAGACTGCAATCTTGCCATTGTCTCAGTACCT 5401
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5503 CGTGAAGATTAGAGATTCAAAAGCCACCAAGACTGCAATCTTGCCATTGTCTCAGTACCT 5562
Query 5402 CTTGGATCCACAAACTCAAGCCCAGCAGGCACGATTACTAGCAACTTTGGCCCTTGGTGA 5461
||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5563 CTTGGATCCACAAACTCAAGCTCAGCAGGCGCGGTTACTAGCAACTTTGGCCCTTGGTGA 5622
Query 5462 TCTTTTCCAGAATGAAGCTCTTGCTAGAAGCACTGATGCAGCTTCTGCTTGCCGTGCTTT 5521
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5623 TCTTTTCCAGAATGAAGCTCTTGCTAGAAGCACCGATGCAGCTTCTGCTTGCCGTGCTTT 5682
Query 5522 AGTCAATGTCCTTGAAGAACAACCCACAGAAGAAATGAAAGTAGTTGCTATATGTGCTCT 5581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5683 AGTCAATGTCCTTGAAGAACAACCCACAGAAGAAATGAAAGTAGTTGCTATATGTGCTCT 5742
Query 5582 GCAAAACCTCGTCATGTATAGCCGGTCTAACAAAAGAGCAGTTGCCGAGGCAGGTGGTGT 5641
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5743 GCAAAATCTCGTCATGTATAGCCGATCTAACAAAAGAGCAGTTGCCGAGGCAGGTGGTGT 5802
Query 5642 GCAGGTTGTCTTGGATCTGATCAGTTCCAGTGATCCTGAAACATCTGTTCAGGCTGCAAT 5701
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5803 GCAGGTCGTCTTGGATCTGATCAGTTCCAGTGATCCTGAAACGTCTGTTCAGGCTGCAAT 5862
Query 5702 GTTTGTAAAACTACTCTTCTCTAATCACACTGTTCAAGAGTACGCATCTAGCGAAACCGT 5761
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5863 GTTCGTAAAACTACTCTTCTCTAATCACACCGTTCAAGAGTACGCATCTAGCGAAACCGT 5922
Query 5762 CAGAGCAATAACTGCTGCCATTGAGAAAGACCTATGGGCCACTGGAACCGTGAATGATGA 5821
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5923 CAGAGCAATAACTGCTGCCATTGAGAAAGACTTATGGGCCACTGGAACCGTGAATGATGA 5982
Query 5822 ATATCTAAAAGCTTTAAACTCTTTGTTTAACAACTTCCCGCGTCTAAGAGCCACAGAGCC 5881
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5983 ATACCTAAAAGCCTTAAACTCTTTGTTTAACAACTTCCCGCGTCTAAGAGCTACAGAGCC 6042
Query 5882 TGCAACACTAAGTATACCACATCTAGTTACATCCCTCAAGACAGGATCGGAAGCAACTCA 5941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 6043 TGCAACACTAAGTATACCACATCTAGTTACATCCCTCAAGACAGGATCAGAAGCAACACA 6102
Query 5942 AGAAGCTGCCTTGGATGCGTTGTTTCTTCTCAGACAAGCTTGGTCAGCCTGTCCTGCCGA 6001
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6103 AGAAGCTGCCTTGGATGCATTGTTTCTTCTCAGACAAGCTTGGTCAGCCTGTCCTGCCGA 6162
Query 6002 AGTTTCCAGGGCCCAATCAGTTGCTGCTGCAGACGCCATCCCCTTACTTCAGTACCTAAT 6061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6163 AGTTTCCAGGGCCCAATCAGTTGCTGCTGCAGACGCCATCCCCCTACTTCAGTACCTAAT 6222
Query 6062 TCAATCAGGTCCACCGCGGTTCCAGGAGAAAGCTGAATTCCTCTTGCAGTGTTTGCCAGG 6121
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6223 CCAATCAGGTCCACCACGGTTCCAGGAGAAAGCTGAATTCCTCTTGCAGTGTTTGCCAGG 6282
Query 6122 TACACTGGTGGTCACTATCAAACGTGGTAACAACATGAAACAATCCGTTGGTAACCCGAG 6181
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6283 TACTCTGGTAGTCACTATCAAACGTGGTAACAACATGAAGCAATCCGTTGGTAACCCGAG 6342
Query 6182 TGTGTTCTGCAAGATAACACTCGGCAACAATCCTCCTAGACAAACCAAGGTGATATCGAC 6241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 6343 TGTGTTCTGCAAGATAACACTCGGCAACAATCCTCCTAGACAGACCAAGGTGATATCGAC 6402
Query 6242 AGGTCCTAATCCAGAGTGGGACGAGAGCTTCTCATGGTCATTTGAGAGCCCTCCCAAAGG 6301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6403 AGGTCCTAATCCAGAGTGGGACGAGAGCTTCTCATGGTCATTTGAGAGCCCTCCCAAAGG 6462
Query 6302 TCAAAAACTCCACATTTCATGCAAGAACAAAAGCAAAATGGGAAAGAGTTCCTTTGGGAA 6361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6463 TCAAAAACTCCACATTTCATGCAAGAACAAAAGCAAAATGGGAAAGAGTTCCTTTGGGAA 6522
Query 6362 AGTAACGATCCAAATCGATAGGGTGGTGATGCTGGGAGCAGTAGCAGGTGAATACAGTTT 6421
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 6523 AGTAACGATCCAAATCGATAGGGTGGTGATGCTGGGAGCAGTCGCAGGTGAATATAGTTT 6582
Query 6422 GTTACCAGAAAGCAAAAGTGGCCCCAGAAACCTTGAGATCGAATTCCAGTGGTCTAACAA 6481
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6583 GTTACCAGAAAGCAAAAGTGGTCCCAGAAACCTTGAGATAGAATTCCAGTGGTCTAACAA 6642
Query 6482 GTAAACCACCACTTGAttttttgtttttgtttGAGAGGTTTCTTAAATCGAAACTTCTGC 6541
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6643 GTAAACCACCACTTCATTTTTTGTTTTTGTTTGAGAGGTTTCTTAAATCGAAACTTCTGC 6702
Query 6542 TTC-tttttttgccaaatttttttAAAATCGTTTGATTTATAATGCTACTGTATATAGTT 6600
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6703 TTCATTTTTTTGCCAAATTTTTTAAAAATCGTTTGATTTATAATGCTACTGTATATAGTT 6762
Query 6601 TGTATTGTAATGTAATG 6617
||||||||||||||||
Sbjct 6763 GGTATTGTAATGTAATG 6779
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 330328583849
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5