BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg932732
Length=6445
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G25660.1 | Symbols: emb2410 | embryo defective 2410 | chr2:1... 4279 0.0
> AT2G25660.1 | Symbols: emb2410 | embryo defective 2410 | chr2:10916203-10927390
REVERSE LENGTH=6754
Length=6754
Score = 4279 bits (2317), Expect = 0.0
Identities = 2563/2683 (96%), Gaps = 11/2683 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3754 TGATCACAGTTGAGAAAACTATTCTGGAACAAAGCAATAGCCGGTATGAGCTTCAAGGTG 3813
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3830 TGATCACTGTTGAGAAAACTATTCTGGAACAAAGCAATAGCCGGTATGAGCTTCAAGGTG 3889
Query 3814 AATATGTATTGCCGGGTTCCCGTGACCGAGATTTTGGTCAGAAGGAAGCTGGCAGTTTCT 3873
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3890 AATATGTATTGCCGGGTTCCCGTGACCGAGACCTTGGTCAGAAGGAAGCTGGCAGTTTTT 3949
Query 3874 TAATGAGAGCCATGACGGGTCATCTAGGAAGTGTTATATCTTCCATGGGAAGATGGAGAA 3933
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3950 TAATGAGAGCCATGACTGGTCATCTAGGAAGTGTTATATCCTCCATGGGAAGATGGAGAA 4009
Query 3934 TGAGACTTGAAGTGCCTAAGGCAGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTT 3993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4010 TGAGACTTGAAGTGCCTAAGGCAGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTT 4069
Query 3994 CAAGAAGTACAGATCCAGCTGTTCACTCAAGATCAAAGGATCTTTTCATTCAAAGCGTGC 4053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 4070 CAAGAAGTACAGATCCAGCTGTTCACTCAAGATCAAAGGATCTTTTCATCCAAAGCGTTC 4129
Query 4054 AAAATCTCTGTCTACAAGCTGAAAATCTTCGAGACTTACTTGAGGAGATACGTGGGTATT 4113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4130 AAAATCTCTGTCTACAAGCTGAAAATCTTCGAGACTTGCTTGAGGAGATACGTGGGTATT 4189
Query 4114 ATACTCCACCAAGTGAAGTCGTTCTTGAAGATCCAAGTCTTCCAGGTTTAGCTGAACTCA 4173
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4190 ATACTCCACCAAGTGAAGTCGTTCTTGAAGATCTAAGTCTTCCAGGTTTAGCTGAGCTCA 4249
Query 4174 AAGGTCATTGGCATGGTTCGCTGGATGCTAGTGGTGGAGGCAATGGAGACACCTTGGCCG 4233
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4250 AGGGTCATTGGCATGGTTCGCTTGATGCTAGTGGTGGAGGCAATGGAGACACTTTGGCCG 4309
Query 4234 AATTTGACTTCCATGGTGATGATTGGGAGTGGGGGACTTACAAAACACAGCGTGTTCTGG 4293
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 AATTTGACTTCCATGGAGATGATTGGGAGTGGGGGACTTACAAAACACAGCGTGTTCTGG 4369
Query 4294 CTACTGGTTCATATAGCAATGATGATGGTTTACGTCTTAAGGAGATGCTTATTCAAAAAG 4353
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4370 CTACTGGTTCGTATAACAATGATGATGGTTTACGTCTTAAGGAGATGCTCATTCAAAAAG 4429
Query 4354 GAAACGCTACACTGCATGCAGATGGGACCTTATTGGGGCCAAAAACAAATCTTCATTTTG 4413
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 GAAACGCTACACTGCACGCAGATGGGACCTTATTGGGGCCAAAAACAAATCTTCATTTTG 4489
Query 4414 CTGTTCTAAATTTTCCTGTTAGTTTGATACCTACCCTGATTGAGGTTGTTGAATCATCAG 4473
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4490 CTGTTCTGAATTTCCCTGTTAGTTTGATACCTACCTTGGTTGAGGTTGTTGAATCATCAG 4549
Query 4474 CTTCTGATCTTGTTCACTCTTTGAGGAAACTCTTGTCACCAATCAAAGGCATTTTGCACA 4533
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4550 CTACTGATATTGTTCACTCTTTGAGGAAACTCTTGTCACCAATCAAAGGCATTTTGCACA 4609
Query 4534 TGGA-GGGAGATCTTAGAGGGAGTCTTGAAAAACCAGAATGTGATGTACAAGTTAGATTA 4592
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4610 TGGAAGGG-GATCTTAGAGGGAGTCTTGAAAAACCAGAATGTGATGTACAAGTTAGGTTA 4668
Query 4593 TTGGATGGTGCTGTTGGTGGTATAGACCTTGGACGAGCTGAAGTTTTTGCTTCTCTTACA 4652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4669 TTGGATGGTGCTGTTGGTGGTATAGACCTTGGACGAGCTGAAGTTTTTGCTTCTCTTACA 4728
Query 4653 TCAAACAGTCGCTTTCTTTTCAATTCCAATTTTGAACCATTTGTCCAAAATGGTCATGTG 4712
|| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4729 TCTAACAGTCGTTTTCTTTTCAACTCCAACTTTGAACCATTTGTCCAAAATGGTCATGTC 4788
Query 4713 CACATACAAGGAAGTGTTCCTGTTAGCTTTTCGCAGAAAAATATCTCTGAGGGAGAAGAC 4772
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
Sbjct 4789 CATATACAAGGAAGTGTTCCTGTTAGCTTTTCGCAGAAAAATATGTCTGAAGGAGAAGTC 4848
Query 4773 AGGGAAACTGATAGAGGTGGTGCAGT-AAAAGTCCCTAGCTGGGCAAAAGAAAAGGAAGA 4831
|| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 4849 AGCGAAACAGATAGAGGTGGTGCAGTGAAAA-TCCCGAGTTGGGCAAAAGAGAAGGAAGA 4907
Query 4832 TGATGAGAAGAGAACCTCAAGGGATAGGGGCGAAGAGGGATGGGATAGCCAACTAGCTGA 4891
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4908 TGATGAGAAGAGAACCTCAAGGGATAGGAGCGAAGAGAGATGGGACAGCCAACTAGCTGA 4967
Query 4892 GAGTCTCAAGGGTTTGA-ACTGGAATATTTTAGATGAAGGAGTAGTTAGATTGGAGGCAG 4950
||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 4968 GAGTCTCAAGGGTTT-ATACTGGAATATTTTAGATGCAGGAGAAGTTAGACTGGAGGCAG 5026
Query 4951 ACATCAAGGATGGGGGAATGACTTTGTTAACAGCCATATCTCCTTATGCTAATTGGCTCC 5010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5027 ACATCAAGGATGGGGGAATGACTTTGTTAACAGCCATATCTCCTTATGCTAATTGGCTCC 5086
Query 5011 AAGGAAATGCTGATATCAGGCTTCAGGTCGGAGGTACAGTAGAGCATCCAGTGCTTGATG 5070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5087 AAGGAAATGCTGATATCAGGCTTCAGGTCGGAGGTACAGTAGACCATCCAGTGCTTGATG 5146
Query 5071 GGTCTGCTTCATTCCACAGGGCGTCTATCTCTTCACCTGTGCTCCGTAAACCTCTCACAA 5130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 5147 GGTCTGCTTCATTCCACAGGGCGTCTATCTCTTCACCTGTGCTTCGTAAACCGCTCACAA 5206
Query 5131 ACTTTGGTGGAACCTTACATGTTAAATCAAACAGGTTGTGCATCACCTCACTGGAAAGCA 5190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5207 ACTTTGGTGGAACCTTACATGTTAAATCAAACAGGTTGTGCATCACCTCACTGGAAAGCA 5266
Query 5191 GGGTAAGTAGAAGAGG-AAAGCTGGTTGTGAAAGGAAATCTTCCCCTTAGATCAAATGAA 5249
|||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5267 GGGTAAGTAGAA-AGGGAAAGCTGGTTGTTAAAGGAAATCTTCCCCTTAGATCAAATGAA 5325
Query 5250 GCATCTACTGGTGATGGAATAGATCTCAAATGTGAAGTTCTTGAAGTACGAGCAAAGAAT 5309
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5326 GCATCTGCTGGTGATGGAATAGAGCTCAAATGTGAAGTTCTAGAAGTACGAGCAAAGAAT 5385
Query 5310 TTCTTAAGTGGTCAGGTTGATACTCAGCTGCAAATTACTGGATCAATGTTGCAGCCAACT 5369
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5386 TTTTTAAGTTGTCAGGTTGATACTCAGCTGCAAATTACTGGATCAATGTTGCAGCCAACT 5445
Query 5370 ATATCAGGAAATATTAAATTAAGCCAAGGAGAAGCTTATTTGCCTCATGATAAGGGTGGG 5429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5446 ATATCAGGAAATATTAAATTAAGCCAAGGAGAAGCTTATCTGCCTCATGATAAGGGTGGT 5505
Query 5430 GGAGCTGCCCCACTCAATAGACTGGCAGCCAATCAATATAGGATTCCAGGTGCTGCTATT 5489
||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5506 GGAGCTGCCCCTTTAAATAGATTGGCAGCCAATCAGTATAGTATTCCAGGTGCTGCTATT 5565
Query 5490 AATCAAGCAGTTTCTTCACGATATTTTGCTCGATTTTTTGGCACAGAACGGGCTTCTTCA 5549
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5566 AATCAAGCAGTTTCTTCACGATATTTTGCTCGATTTTTTGGCACTGAACGGGCTTCTTCA 5625
Query 5550 AGGATGAAATTCTCCCAGTCTTCTGGTGAATCAAATGCTGTTGAAAAGGAGATTGACGAA 5609
||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5626 GGGATGAAATTCTCTCAGTCGACTGGTAAATCAAATTCTGTTGAAAAGGAGATTGAAGAA 5685
Query 5610 GTGAAAATGAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTGATATGAAACTTGTTTTAGGACCA 5669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5686 GTGAAAATGAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTGATATGAAACTTGTTTTAGGACCA 5745
Query 5670 GAGTTGAGGATAGTGTATCCTTTAATTCTTAATTTTGCTGTTAGTGGTGAGCTTGAGCTT 5729
||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5746 GAGCTGAGGATAATGTACCCTTTAATTCTTAATTTTGCTGTTAGTGGTGAGCTTGAACTT 5805
Query 5730 GATGGCATGGCTCATCCCAAATATATCAAACCAAAGGGTATCCTGATGTTCGAGAATGGA 5789
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| || |||
Sbjct 5806 GATGGCATGGCTCATCCAAAATTTATCAAACCAAAGGGTGTCCTAACATTCGAAAACGGA 5865
Query 5790 GATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGTCTGAAGAGGGAGCATCTCAACATTGCAAAG 5849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5866 GATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGTCTGAAGAGGGAGCATCTCAACGTTGCAAAG 5925
Query 5850 TTTGAGCCTGAACATGGACTAGATCCTCTGCTAGATTTAGCTTTAGTTGGTTCAGAATGG 5909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5926 TTTGAGCCTGAACATGGACTAGATCCTCTGCTAGATTTAGCCTTAGTTGGTTCAGAATGG 5985
Query 5910 CAATTTAGGGTCCAAAGTCGTGCCAGCAATTGGCAGGAAAAACTTGTGGTGACTTCAACT 5969
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 5986 CAATTTAGGGTTCAAAGTCGTGCCAGTAATTGGCAGGACAAACTTGTCGTGACTTCAACA 6045
Query 5970 CGTTCTGTGGAACAGGATGCTCTCTCACCTTCCGAGGCTGCAAAGGT-TTTCGAGAGCCA 6028
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 6046 CGTTCTGTTGAACAGGATGCTCTCTCACCTTCGGAGGCTGCAAAGGTGTTT-GAGAGCCA 6104
Query 6029 ATTAGCAGAATCCATATTAGAAGGAGATGGACAACTTGCTTTCAAAAAACTTGCAACCGC 6088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6105 ATTAGCAGAATCCATATTAGAAGGAGATGGACAACTTGCTTTCAAAAAACTTGCAACCGC 6164
Query 6089 AACACTTGAAACCATAATGCCAAGGATAGAAGGGAAAGGAGAGTTTGGTCAAGCAAGATG 6148
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 6165 AACACTTGGAACCATAATGCCAAGGATAGAAGGAAAAGGAGAGTTTGGTCAGGCGAGATG 6224
Query 6149 GAGGTTGGTGTACGCCCCACAGATCCCAAGTTTACTCTCTGTTGATCCAACTGTTGATCC 6208
|||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6225 GAGGTTGGTGTATGCTCCGCAGATCCCAAGTTTACTCTCTGTTGATCCAACTGTGGATCC 6284
Query 6209 TCTCAAGTCTCTGGCGAGCAACATCTCGTTTGGAACAGAAGTTGAAGTGCAGCTCGGAAA 6268
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6285 TCTCAAGTCTCTGGCGAGCAACATATCATTTGGAACGGAAGTTGAAGTGCAGCTCGGAAA 6344
Query 6269 ACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAAATGAAAGACTCTGAGATGGCAATGCAATGGAC 6328
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6345 ACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAGATGAAAGATTCTGAGATGGCAATGCAATGGAC 6404
Query 6329 ACTGATCTATCAACTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTTCTGCAATCTGCACCTTCCAAACG 6388
||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6405 ACTTATTTACCAGCTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTTCTGCAATCTGCACCTTCCAAACG 6464
Query 6389 TTTGCTTTTTGAATACTCTGCTACATCACAAGACTAAA-CCTT 6430
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6465 TTTGCTTTTTGAATACTCTGCTACATCACAAGACTAAATCCTT 6507
Score = 3653 bits (1978), Expect = 0.0
Identities = 2289/2433 (94%), Gaps = 45/2433 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1344 AAAAAGGCTTCAACGTTAGATAAGTTCACTGTATCATGTGATCCATTCCTTATGACTGTT 1403
||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 AAAAAGGCTTCCACGTTAGACAAGTTCACAGTATCATGTGATCCATTCCTTATGACTGTT 1449
Query 1404 GATAGACTCTGTGCACTCTTACAAACTAAA-GAAAGCTCATGTGTTGAAGATATTGTGAA 1462
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1450 GATAGACTCTGTGCACTCTTACAAACTAAACG-AAGCCCATCTGTTGAAGATATTGTGAA 1508
Query 1463 TTCTACTGAATCTGAGACTTTAAGCAGTAAGAGAGGGGATATATCTA-GAAAG--GTT-G 1518
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 1509 TTCTTCTGAATCTGAGACTTTAAGCAGTCAGAGAGGGGATATATCTATGAATGTTGTTAA 1568
Query 1519 T--G---GGTGATGATGTTCCACATGGTAATCGAAGTCGAAATCAACCTCGTGACTTCAC 1573
| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1569 TCAGAATACTGACGATGTTCCACATGGTAATCGAAGTGGAAATCAGCCTCGTGACTTTAC 1628
Query 1574 TTTCAAAAAGCATGAGCATCAACCTGTAGCAAATCATTGGCGTCCTA-CTTGGCCATGGA 1632
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||
Sbjct 1629 GTTCAAAAAGCATGAGCATCAACCTGTAGCAAACCATTGGCGTCCCAGC-TGGCCACGGA 1687
Query 1633 ACATAAAATTGAAGGAA-CTGGTGTTTAATATTCTAAGTGGTTCGTCTAAGAAGCTAACA 1691
||| |||||| || ||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1688 ACAAAAAATTAAAAGAAGC-AGTGTTTAATATTTTAACTGGTTCCTCTAAGAAGTTAACA 1746
Query 1692 GG-AGGGTCAGATCTGAATGCTGCTGACAATGCTCTTCACTTGAGTGATGGACTGGAGAA 1750
|| |||| | | | || | | | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1747 GGAAGGG-C--A---G-AT-C--C-G--AATGCTCCTCACTTGAGCGATGAACTGGAGAA 1793
Query 1751 GCTGCCTGCTGTTTATGTTGAGAAGACACTACCAGTTATGCTTGACTCTGTTCAGTTTAA 1810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1794 GCTGCCTGCTGTTTATGTTGAGAAGACACTACCAGTTATGCTTGACTCTGTGCAGTTTAA 1853
Query 1811 AGGTGGGACACTTATTCTATTGGCTTATGGCGATACAGAGCCCAGAGAAATGAGAAACGC 1870
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1854 AGGTGGGACACTTCTTCTATTAGCTTATGGCGATACAGAGCCCAGAGAAATGAGGAACGT 1913
Query 1871 CCATGGACATGTTAAGTTTCAGAATCATTATGGTCGTGTGTACGTGCAACTTGGTGGAAA 1930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 CCATGGACATGTTAAGTTTCAGAATCATTATGGTCGTGTGTACGTGCAACTTGGTGGAAA 1973
Query 1931 CTGTACCATGTGGAGATCAGATGTAACATCTGAAGATGGTGGGCTTTTGTCTGTTGATGT 1990
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 CTGTAATATGTGGAGATCAGATGTAACATCTGAAGATGGTGGGCTTTTGTCTGTTGATGT 2033
Query 1991 TTTTGTTGATACTGTGGAGCAGAATTGGCATGCAAATTTAAATGTCGCCAACTTCTTTGT 2050
|||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2034 TTTTGTTGATACCGTCGAGCAGAACTGGCATGCAAATTTAAATGTTGCCAACTTCTTTGT 2093
Query 2051 CCCGATTTTTGAAAGAATTCTAGAGATCCCAATCGAGTGGTCTACGGGAAGAGCTACTGG 2110
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2094 CCCGATTTTTGAAAGAATTCTAGAGATTCCAATCGAGTGGTCTAAGGGAAGAGCTACTGG 2153
Query 2111 TGAGGTTCATCTGTGTATGTCTAGAGGGGAAA-TATTTCCAAACCTTCATGGCCAGCTTG 2169
|||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2154 TGAGGTTCATCTATGTATGTCTAGAGGAGAAAGT-TTTCCAAACCTACATGGCCAACTTG 2212
Query 2170 ATGTCACAGGACTAGGCTTCCAAATATATGATGCACCTTCCTCGTTTTCTGATGTCTCGA 2229
| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2213 ACGTAACAGGACTAGGCTTCCATATAAATGATGCACCTTCTTCGTTTTCTGATGTCTC-A 2271
Query 2230 -CCAGCCTTTCTTTCCGCGGCCAGCGCATTTTCCTGCATAATGCTAATGGTTGGTTTGGA 2288
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2272 GCCAGCCTTTCTTTCCGCGGCCAGCGCATTTTCCTGCATAACGCTAATGGTTGGTTTGGA 2331
Query 2289 AAGGTTCCTTTGGAGGCTTCTGGAGATTTCGGTATACATCCAGATGAGGGGGAGTTTCAT 2348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 AAGGTTCCTTTGGAGGCTTCTGGAGATTTCGGTATACATCCAGATGAGGGGGAGTTTCAT 2391
Query 2349 CTGATGTGTCAGGTTCCCTATGTGGAAATTAATGCTTTGATGAAAACGTTCAAGATGAAG 2408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2392 CTGATGTGTCAGGTTCCCTATGTGGAAATTAATGCTTTGATGAAAACTTTCAAGATGAAG 2451
Query 2409 CCCTTGTTTTTCCCGCTAGCTGGTTCTGTCACAGCTGTATTCAACTGTCAAGGCCCGCTT 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 CCCTTGTTTTTCCCGCTAGCTGGTTCTGTCACAGCTGTATTCAACTGTCAAGGCCCGCTT 2511
Query 2469 GATGCTCCCGTTTTTGTGGGAAGTTGCATGGTCTCTAGGAAGATAGCTTATCTGTCTCCA 2528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 GATGCTCCCGTTTTTGTGGGAAGTTGCATGGTCTCTAGGAAGATAGCTTATCTGTCTCCA 2571
Query 2529 GATCTCCCTACATCTTTGGCATATGAGGCAATGCTTAAAAACAAGGAAGCTGGTGCAGTT 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 GATCTCCCTACATCTTTGGCATATGAGGCAATGCTGAAAAACAAGGAAGCTGGTGCAGTT 2631
Query 2589 GCAGCATTTGACCGTGTTCCATTTTCTTATCTTTCTGCTAATTTCACATTTAACACTGAC 2648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 GCAGCATTTGACCGTGTTCCATTTTCTTATCTTTCTGCTAATTTCACATTTAACACTGAC 2691
Query 2649 AACTGTGTTGCTGATTTATATGGTATTAGAGCTACCCTTGTTGATGGTGGGGAGATTCGA 2708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 AACTGTGTTGCTGATTTATATGGTATTAGAGCTACCCTTGTTGATGGTGGGGAGATTCGA 2751
Query 2709 GGAGCAGGGAATGCTTGGATCTGTCCAGAGGGGGAGGTAGATGATACCGCACTGGATGTG 2768
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2752 GGAGCAGGGAATGCTTGGATCTGTCCAGAGGGGGAGGTGGATGATACCGCACTGGATGTG 2811
Query 2769 AACTTTTCAGGAAATATATCTTTTGATAAGGTTTTGGATCGTTATATGCCTGAATATCTA 2828
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2812 AACTTTTCAGGAAATATATCTTTTGATAAGGTTTTGCATCGTTATATGCCTGAATATTTT 2871
Query 2829 AATC-TCGGG-TCACTGAAGTTGGGTGATTTAACTGGGGAAACAAAACTTTCTGGGGCCC 2886
|| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 AA-CATCGGGATG-CTGAAGTTGGGTGATTTAACTGGGGAAACAAAACTTTCTGGGGCCC 2929
Query 2887 TCTTGAAACCGAGGTTTGACATAAAATGGGCAGCCCCTAAAGCTGATGGCTCCTTGACTG 2946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 TCTTGAAACCGAGGTTTGACATAAAATGGGCAGCCCCTAAAGCTGATGGCTCCTTGACTG 2989
Query 2947 ATGCTCGGGGAGATATTGTGATATCACATGATAATATCATCGTTAATTCATCGTCCATTG 3006
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 2990 ATGCTCGGGGAGATATTGTGATATCACATGATAATATCATTGTTAATTCATCCTCTGTTG 3049
Query 3007 CTTTTGATCTATACTCAAAACTAGATACCACATACCGA-GACCAGTGTTTGTCTAACCAA 3065
|||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||
Sbjct 3050 CTTTTGATCTATTCACAAAATTAGATACCTCATACC-ATGACCCTTGTTTGTCGCACCAA 3108
Query 3066 GACTTCACTCAAGGGGAAGCCATGCCATTTGTTGTTGAGGGGCTTGATTTGGATTTACGT 3125
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GACTTCACTCAAGGGGAGGCCATGCCATTTGTTGTTGAGGGGCTTGATTTGGATTTACGT 3168
Query 3126 ATGCGTGGTTTTGAGTTTTTCAGCTTGGTGTCTTCCTATCCATTTGATTCCCCAAGACCT 3185
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 3169 ATGCGTGGTTTTGAGTTTTTCAGCTTGGTCTCTTCCTATCCATTTGATTCACCACGACCT 3228
Query 3186 ACACATTTAAAAGCAACAGGAAGGATCAAATTTCTTGGGAAGATAAAACGACACAGCACT 3245
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 ACACATTTAAAAGCAACAGGAAGGATCAAATTTCTGGGGAAGATAAAACGACACAGCACT 3288
Query 3246 ACAAAAGATGGAGAGGTGGGGTCAGACAAATGTGAAGATGCAGCTGCAATTTCTAGCCTC 3305
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3289 ACAAAAGATGGAGATGTTGGGTCAGACAAATGTGAAGATGCAGCTGCAATTTCTAGCCTC 3348
Query 3306 GATGGTGAAATTTCCATCTCAAGTCTCAAGCTGAATCAGTTGATTTTGGCCCCTCAACTA 3365
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 GATGGTGATATTTCCATTTCAAGTCTCAAGCTTAATCAGTTGATTTTGGCCCCTCAACTG 3408
Query 3366 TCTGGACTGTT-GAGCGTTTCACGTGATCATGTTAAGCTTGATGCCGTGGGCCGGCCAGA 3424
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 3409 TCTGGAC-GTTTGAGCGTTTCACGTGATCATGTTAAGCTTGATGCCGCGGGCCGACCAGA 3467
Query 3425 TGAAAGTCTTACACTAGACTTTATAGGTCCACTACAGCCTAATTCTGACGAAAATGTACA 3484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3468 TGAAAGTCTTACACTAGACTTTATAGGTCCACTACAGCCTAATTCTGACGAAAATGTACA 3527
Query 3485 AAGTGGAAAGTTGCTCTCATTTTCTCTTCGAAAGGGGCAACTAAGAGCTAACGCATGTTT 3544
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3528 AAGTGGAAAGTTGCTCTCCTTTTCTCTTCAAAAGGGACAACTAAGAGCTAACGCTTGTTT 3587
Query 3545 TCAACCACAACAGTCGGCTACTTTGGAGATACGCCATTTTCCACTTGATGAGTTAGAGTT 3604
||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3588 TCAGCCACAACAGTCCGCTACTTTGGAGATACGCAATTTTCCACTTGATGAGTTGGAGTT 3647
Query 3605 GGCCTCGCTGAGAGGAGT-GATTCAAAGGGCAGAGATTCAACTAAATCTTCAGAAGCGAA 3663
|||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3648 GGCCTCACTGAGAGG-GTTGATTCAAAAGGCAGAGATTCAACTAAATCTTCAGAAGCGAA 3706
Query 3664 G-GGGACATGGCCTGTTGTCTGTAATTCGGCCAAAATTTAGCGGGGTTCTAGGTGAAGCT 3722
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 3707 GAGGG-CATGGCCTGTTGTCTGTAATTCGGCCAAAGTTTAGTGGAGTTCTAGGTGAAGCT 3765
Query 3723 TTAGATGTTGCAGTAAGATGGAGCGGTGATGTG 3755
||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3766 TTAGATGTTGCAGTAAGATGGAGCGGTGACGTG 3798
Score = 1903 bits (1030), Expect = 0.0
Identities = 1217/1307 (93%), Gaps = 13/1307 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGAGCTTGAGATTGCAAAGCCCTTTTCTTTCTACTCCTCTGCTTCA-GAGTTCTTTCAT 79
||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1 ATGAGTTTGAGATTGCAAAACCCTTTCCTTTCTACTCCTCTGCTTCATG-GTTCTTTCAA 59
Query 80 TAGCAGAGAGAAGAGAATCAATGTTA-CTAGAAGGGCGTTTCGTAGAAAGAGTATATCA- 137
| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |
Sbjct 60 TCGCAGAGAGAAGAGAATCAATG-TAGCTAGAAGGGCGTTTCGTAGCAAGCGTATAT-AT 117
Query 138 TCGGAGAAGATACAGAATGATTGGTTAGCTAAAGTTGCCAAATTTTCTCAGTTTTGTGGG 197
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 118 TCGGAGAAGAAACAGAATGATTGGTTAGCTAAAGTTGCCAAATTTTCTCAATTTTGTGGG 177
Query 198 AAAAATGTACAATTGCTTAGGAAGTCTCTTGATTCTAGAAGTAGAATGGAGGTTAAATGT 257
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 178 AAAAATGTGCAATTGCTTAGGAAGTCTCTTGATTCTAGAAGTAGAATGGAAGTTAAATGT 237
Query 258 TTGAAAGATCCTTTTTTACGAAGCAAGGGA-TTGGTTAGGGCTTTGGCTCCTGTTTGGGA 316
|||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 238 TTGAAAGAGCCTTTCGTACGAAGCAA-GGATTTGGTTAGGTCTTTGGCTCCTGTTTGGGA 296
Query 317 AGAGGGTTTGTTTTTCTTGAGGTGTTCTGTTTTCTTTGCTGTTATCTCTGGGGTTTGCTT 376
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 297 AGAGGGTTTGTTTTTCTTGAGGTGTTCTGTGTTCTTTGCTGTTATCTCTGGGGTTTGTTT 356
Query 377 GTTGGTGTGGTATGGACAAAATAAGGCTCGTGCTTTTGTTGAGACTAAGCTTTTGCCATC 436
||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 ATTGGTGTGGTATGGACAGAACAAGGCTCGTGTTTTTGTTGAGACTAAGCTTTTGCCATC 416
Query 437 AGTTTGCTCTGTGCTTAGTGAGACTATTCAGCGTGAGGTTGATTTTGGAAAGGTTAGAAG 496
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 TGTTTGCTCTGTGCTTAGTGAGACTATTCAGCGTGAGGTTGATTTTGGAAAGGTTAGAAG 476
Query 497 AGTTTCACCATTGTGTATAACTCTTGAAGCGAGCTCTATTGGTCCTCATGGTGAAGAGTT 556
||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 AGTTTCACCATTGTGCATTACACTTGAAGCAAGCTCCATTGGTCCTCATGGTGAAGAGTT 536
Query 557 TTCGTGTGGTGAAGTTCCGACTATGAAACTTTGTGTCCGTCCTTTTGCTAGTCTTAGGAG 616
||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TTCCTGTGGTGAGGTTCCGACTATGAAAGTTTGTGTCCGTCCTTTTGCTAGTCTTAGGAG 596
Query 617 GGGAAAGATTGTGGTTGATGCGATTTTAAGTAATCCAACAGTTTTGGTTGCACAAAAGAA 676
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 GGGAAAGATTGTGGTTGATGCGATTCTAAGTAATCCAACAGTTTTGGTTGCACAAAAGAA 656
Query 677 AGATTTTACATGGTTAGGGATACCTTTATCTGACACTACTTTGCCAAGCCATTTGTCCTC 736
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 657 AGATTTTACATGGTTAGGGATACCTCTATCTGACACTACTTTGCCAAGCCATTTGTCATC 716
Query 737 TGAAGAAGGGATTGATTTTCGCACCAAAACTCGGAGAATTTCAAGGGAGGAAGCTGGGAT 796
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 717 TGAAGAAGGGATTGATTTTCGCACCAAAACTAGGAGAGTTTCAAGGGAGGAAGCAGGGAT 776
Query 797 CCGTTGGGATGAAGAAAGGGATAATGATGCAAGAAAAGCTGCAGAGATGGGCTATATTGT 856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 777 CCGTTGGGATGAAGAAAGGGATAATGATGCAAGAAAAGCTGCAGAGATAGGCTATATCGT 836
Query 857 TCCTTGTAAGAATT-CTTCTCAAGTTAAAGATGTTG---TGAAGCACGATAGGCATTTTA 912
|||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||| |||| |||||
Sbjct 837 TCCTTGTAAGAATTACT-CTCAAGCTAAAGATAATGCGGTGAAGCACGACAGGCGTTTTA 895
Query 913 CTGAAATAGCAAATCCCAACTCGTTTATTTGCATGGATGAAAAGATGCATTTAGCAGACC 972
| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
Sbjct 896 CGGAAATTGCAAATCCCAACTCCTTTATTTGCATGGATGAAAAGATGCATTCAGCTGAGC 955
Query 973 AACATTGCATGGATCCAGGTGTTGATTATGACGTGAAGCATGCTGAATTGGAGAAACCAT 1032
||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 956 AACATTGCATGGACCCAGGTGTTGAGTATGATGTGAAGCATGCTGAATTGGAGAAATCAT 1015
Query 1033 TTGGCATAAAAATTCCTGGTTCAGGACTCAAGTTCTTGTCCAAAATTTTAAAGGTTCCGA 1092
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 1016 TTGGCATAAAAATTCCTGGTTCAGGGCTCAAGTTCTTGTCCAAAATGTTAAAAGTCCCGA 1075
Query 1093 GGAAGTACAAATTTAAGTGGAATTCAAAATCACACAATAATTCAATGTCTGATATTAGTG 1152
||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1076 GGAAGTACAAATTCAAATGGAATTCAAAATCACATAAGAATTCAATGTCTAATATTAGTG 1135
Query 1153 CAAAGAAGCGAATTCTTGATCGCAGTGCTTCAGCAGCTCTATCGTATTTCTACAGCCTAT 1212
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||
Sbjct 1136 CAAAGAAGAGAATTCTTGAGCGCAGTGCTTCAGCAGCTCTATCTTATTTCCACAGTCTAT 1195
Query 1213 CACAACAAAAGCCTGACGAGCCTTCAGTATCATCCGCAGATTATGATGAGTTGAGTTTGG 1272
|||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1196 CACAACAAAAGCTTGACGAGCCTTCAGTGTTATCAACAAATTATGATGGGTTGAGTTTGG 1255
Query 1273 ATATGCTATTAGTTAAAGGTGAGAAAGAAACCAGTAATCAATATGAT 1319
|||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1256 ATATGCTATTAGTTAAAGGTGATAGAGAAATCAGTAATCAATATGAT 1302
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 321705649197
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5