BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg933069
Length=6457
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G27120.1 | Symbols: POL2B, TIL2 | DNA polymerase epsilon cat... 1.099e+04 0.0
AT1G08260.1 | Symbols: EMB142, EMB2284, POL2A, TIL1, EMB529, AB... 8239 0.0
AT1G08270.2 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: MIT (Inte... 263 2e-68
> AT2G27120.1 | Symbols: POL2B, TIL2 | DNA polymerase epsilon catalytic
subunit | chr2:11581223-11594346 FORWARD LENGTH=6417
Length=6417
Score = 1.099e+04 bits (5949), Expect = 0.0
Identities = 6282/6438 (98%), Gaps = 41/6438 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTGATCGGAGGTCGAATATGCAGAAAGTTTCAGCCGCAGATGAACTCGAAACTAAACTTG 63
|||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 17 GTGATCGGAGGTTGAATGTGCAGAAAGTTTCAGCGGCAGATGAACTCGAAACTAAACTTG 76
Query 64 GATTTGGGCTCTTCTCCCAAGGGGAAACGCGCCTCGGGTGGCTACTCACATTTGCATCAT 123
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 77 GATTTGGGCTTTTCTCCCAAGGGGAAACGCGGCTCGGGTGGCTACTCACGTTTGCATCAT 136
Query 124 CATCTTGGGAAGATGCCGATACTGGGAAAACCTTTAGTTGTGTGGACCTTTTCTTTGTCA 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CATCTTGGGAAGATGCCGATACTGGGAAAACCTTTAGTTGTGTGGACCTTTTCTTTGTCA 196
Query 184 CTCAGGACGGCTCTTCTTTTAAGACTAAGTACAAGTTCCGCCCTTACTTGTATGCCGCCA 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 CTCAGGACGGCTCTTCTTTTAAGACTAAGTACAAGTTCCGCCCTTACTTGTATGCCGCCA 256
Query 244 CCAAAGACAATATGGAACTGGAAGTTGAAGCCTACTTGAGACGCCGATATCAAACACAAG 303
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 257 CCAAAGACAATATGGAACTGGAAGTTGAAGCCTACTTGAGACGCCGATATGAAAGACAAG 316
Query 304 TTGCTGATATTCAGATTGTTCACAAAGAAGATCTTGATCTTAAAAATCATCTATCTGGCC 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 TTGCTGATATTCAGATTGTTCACAAAGAAGATCTTTATCTTAAAAATCATCTATCTGGCC 376
Query 364 TGCaaaaaaaaTATCTCAAAGTATCATTTGACACTGTGCAACAATTGGTGGAAGTCAAGA 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 377 TGCAAAAAAAATATCTCAAAGTATCATTTGACACTGTGCAACAATTGGTGGAAGTAAAGA 436
Query 424 GGGATCTGTTGCATATTGTCGAACGAAACCTCGCAAAATTTGATGCATTTGAAGCATACG 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||
Sbjct 437 GGGATCTGTTGCATATTGTCGAACGAAACCTCGCAAAATTTAATGCACTTGAAGCTTACG 496
Query 484 AATCCATATTGGCTGGAAAACGAGAACAACGTCCTCAAGACTGCTTAGACTCTGTGGTGG 543
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 AATCCATCTTGTCTGGAAAACGAGAACAACGTCCTCAAGACTGCTTAGACTCTGTGGTGG 556
Query 544 ACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATGTCCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGTA 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 ACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATGTCCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGTA 616
Query 604 GTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACTGATGTCATACTAGAGAAGAGGACGG 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 GTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACTGATGTCATACTAGAGAAGAGGACGG 676
Query 664 ATCTTCTCCAACGCGCAGAAGTTCGCGTTTGTGCATTCGATATAGAGACAGTAAAGCTTC 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 ATCTTCTCCAACGCGCAGAAGTTCGCGTTTGTGCATTCGATATAGAGACAGTAAAGCTTC 736
Query 724 CATTGAAGTTCCCGGATGCTGAATATGATCAAATTATGATGATATCCTACATGGTTGATG 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 CATTGAAGTTCCCGGATGCTGAATATGATCAAATTATGATGATATCCTACATGGTTGATG 796
Query 784 GGCAAGGTTTTCTAATTACTAACAGAGAGTGTGTTGGCAAAGACATAGAAGATCTGGAAT 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 GGCAAGGTTTTCTAATTACTAACAGAGAGTGTGTTGGCAAAGACATAGAAGATCTGGAAT 856
Query 844 ATACACCCAAACCAGAGTTTGAAGGGTATTTCAAAGTCACGAATGTTAACAACGAGGTTG 903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 857 ATACACCCAAACCAGAGTTTGAAGGGTATTTCAAAGTCACGAATGTTACCAACGAGGTTG 916
Query 904 AACTCCTCCGAAAATGGTTTTCTCATATGCAAGAGTTGAAACCTGGTATTTATGTTACAT 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 AACTCCTCCGAAAATGGTTTTCTCATATGCAAGAGTTGAAACCTGGTATTTATGTTACAT 976
Query 964 ACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATCA 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 ACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATCA 1036
Query 1024 AAATGAACGAGGAGTTAGGATTCCGTTGTGATCATAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAGT 1083
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAATGAACGAGGAGTTGGGATTCCGTTGTGATCAAAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAGT 1096
Query 1084 TTGTGTGCCATTTGGATTGTTTTTCTTGGGTGAAACGTGACAGCTATCTTCCTCAGGGAA 1143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1097 TTGTGTGCCATTTGGATTGTTTTTCTTGGGTGAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAA 1156
Query 1144 GCCAGGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGCAAAACTGGGTTACGATCCACTGGAAGTGAATC 1203
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 GCCAGGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGTAAAACTGGGTTACGATCCACTGGAAGTGAATC 1216
Query 1204 CTGAGGACATGGTTCGGTTTGCAATGGAAAAGCCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCT 1263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 CTGAGGACATGGTTCGGTTTGCAATGGAAAAGCCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCT 1276
Query 1264 CTGATGCTGTTGCAACTTACTACCTATACATGACATATGTCCATCCGTTCGTTTTTTCTC 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 CTGATGCTGTTGCAACTTACTACCTATACATGACATATGTCCATCCGTTCGTTTTTTCTC 1336
Query 1324 TCGCAACTATCATTCCAATGGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTT 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TCGCAACTATCATTCCAATGGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTT 1396
Query 1384 GTGAAATGCTTTTGATGGTTGAGGCTTACAAGGCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATC 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 GTGAAATGCTTTTGATGGTTGAGGCTTACAAGGCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATC 1456
Query 1444 AAGCTGACCCTGAGAAGTTCTACCAAGGTAAACTTCTTGAAAGCGAGACATATATTGGTG 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1457 AAGCTGACCCTGAGAAGTTCTACCAAGGTAAACTTCTTGAAAGTGAGACATATATTGGTG 1516
Query 1504 GCCATGTAGAGTGCCTCCAAAGTGGTGTTTTCAGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAGC 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517 GCCATGTAGAGTGCCTCCAAAGTGGTGTTTTCAGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAGC 1576
Query 1564 TCGATGCATCTGCATACCAGCAACTGATCGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTA 1623
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 TCGACGCATCCGCATACCAGCAACTGATCGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTA 1636
Query 1624 TCACTGTTGAAGGAAAAATGAAAATGGATTCAATTTCCAATTATGATGAAGTAGAGGATG 1683
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |
Sbjct 1637 TCACTGTTGAAGGAAAAATGAGAATGGATTCAGTTTCCAATTTTGATGAAGTAAAGGAAG 1696
Query 1684 TAATCAGGGAAAAGCTCGAGAAGTTACGGGATGATCCTATACGTGAAGAGGGGCCTCTTA 1743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 TAATCAGGGAAAAGCTCGAGAAGTTACGGGATGATCCTATACGTGAAGAGGGGCCTCTTA 1756
Query 1744 TTTATCACCTTGATGTCGCGGCGATGTATCCAAATATCATCTTAACAAACAGGCTTCAGC 1803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 TTTATCACCTTGATGTCGCGGCGATGTATCCAAATATTATCTTAACAAACAGGCTTCAGC 1816
Query 1804 CACCATCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCACAGCATGTGATTTCAACGGCCCGGAAAAGA 1863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817 CACCATCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCACAGCATGTGATTTCAACGGCCCGGAAAAGA 1876
Query 1864 CCTGTCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGGGTGACGTTCAAGGGAAATAAAAGTG 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 CCTGTCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGGGTGACGTTCAAGGGAAATAAAAGTG 1936
Query 1924 AATATTACCATCTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATCTGTTGATGCTGGTGCAAATATGC 1983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1937 AATATTACCATCTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATCTGTTGATGCTGGAGCAAATATGC 1996
Query 1984 AGTCTTCAAAACCTTTTCTTGATCTGCCAAAGGTGGAACAACAATCCAAATTAAAAGAAC 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 AGTCTTCAAAACCTTTTCTTGATCTGCCAAAGGTGGAACAACAATCCAAATTAAAAGAAC 2056
Query 2044 GACTGAAAAAATACTGTCAAAAGGCATATAGCCGAGTACTTGACAAGCCATTCACTGAAG 2103
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2057 GACTGAAAAAATACTGTCAAAAGGCATATAGCCGAGTACTTGACAAGCCAATCACTGAAG 2116
Query 2104 TTCGCGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTGTGCGTAGCT 2163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2117 TTCGCGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTGTGCGCAGCT 2176
Query 2164 TTCGAGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAGTTGTCAG 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2177 TTCGAGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAGTTGTCAG 2236
Query 2224 AGGCCAAGGCAAGTGGCAATTCAATCAAGATCCAGGAAGCACATGACATGGTAGTGGTTT 2283
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 AGGCCAAGGCAAGTGGCAATTTAATCAAGATCCAGGAAGCACATGACATGGTAGTGGTTT 2296
Query 2284 ACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATTCCTTTTATGGATATGTCATGC 2343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2297 ACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATTCCTTTTATGGATATGTCATGC 2356
Query 2344 GAAAGGGCGCAAGATGGTACTCCATGGAAATGGCTGGTGTAGTTACTTATACTGGAGCCA 2403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357 GAAAGGGCGCAAGATGGTACTCCATGGAAATGGCTGGGGTAGTTACTTATACTGGAGCCA 2416
Query 2404 AAATCATCCAGAATGCTCGTTTGCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGCTGGATA 2463
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 AAATCATCCAGAATGCTCGTTTGCTTATTGAACGAATTGGGAAACCACTTGAGCTGGATA 2476
Query 2464 CAGATGGTATATGGTGTGCTCTCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACGA 2523
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2477 CAGATGGTATATGGTGTGCTCTACCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACCTTTAAAACCA 2536
Query 2524 TAGATATGAAGAAATTCACCATCTCGTATCCGTGTGTAATACTTAATGTTGATGTGGCGA 2583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2537 TAGATATGAAGAAATTCACCATCTCGTATCCGTGTGTAATACTTAATGTTGATGTGGCGA 2596
Query 2584 AGAATAATTCAAATGACCAATATCAGACTCTAGTAGATCCTGTACGAAAGACATATAATT 2643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2597 AGAATAATTCAAATGACCAATATCAGACTCTAGTAGATCCTGTACGAAAGACATATAATT 2656
Query 2644 CACATAGCGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTGGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTC 2703
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2657 CACGTAGCGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTGGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTC 2716
Query 2704 CTGCATCCAAGGAAGAGGGAATCTTAATTAAGAAGCGGTATGCTGTTTTCAATCATGACG 2763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2717 CTGCATCCAAGGAAGAGGGAATCTTAATTAAGAAGCGGTATGCTGTTTTCAATCATGACG 2776
Query 2764 GAACCATAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATGAAGCGTAGAGGAGAGCTGAAACTCATTA 2823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2777 GAACCATAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATGAAGCGTAGAGGAGAGCTGAAACTCATTA 2836
Query 2824 AAGTTTTCCAGGCCGAGCTATTTGACAAATTTCTGCATGGATCAACCCTTGAAGAGTGTT 2883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2837 AAGTTTTCCAGGCCGAGCTATTTGACAAATTTCTGCATGGATCAACCCTTGAAGAGTGTT 2896
Query 2884 ATTCTGCTGTTGCAGCTGTTGCAGATCGTTGGCTTGACCTACTCGAGGGTCAAGGAAAAT 2943
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2897 ATTCTGCTGTTGCAGCTGTTGCAAATCGTTGGCTTGACCTACTCGAGGGTCAAGGAAAAG 2956
Query 2944 ATATTGCCGATAGTGAATTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACTATGAGCAAATCGT 3003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2957 ATATTGCCGATAGTGAATTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACTATGAGCAAATCGT 3016
Query 3004 TAGCAGATTATGGTCAACAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACGCCTGGCTGATT 3063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3017 TAGCAGATTATGGTCAACAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACGCCTGGCTGATT 3076
Query 3064 TTCTTGGTGATACAATGGTCAAAGATAAAGGACTGCGCTGCCAATACATCGTTGCTCGTG 3123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3077 TTCTTGGTGATACAATGGTCAAAGATAAAGGACTGCGCTGCCAATACATCGTTGCTCGTG 3136
Query 3124 AACCAGAGGGGACACCTGTAAGTGAACGTGCTGTCCCTGTTGCCATATTTAAAACGGATG 3183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 3137 AACCAGAGGGGACACCTGTAAGTGAACGTGCTGTCCCTGTTGCCATATTTCAAACAGATG 3196
Query 3184 ATCCTGaaaaaaaGTTTTATCTGCAAAAATGGTGCAAGATATCATCATATACTGGAATCC 3243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3197 ATCCTGAAAAAAAGTTTTATCTGCAAAAATGGTGCAAGATATCATCATATACTGGAATCC 3256
Query 3244 GTTCAATTATTGACTGGAGGTATTACAAGCAGCGTCTTCATTCAGCTATTCAAAAAGTTA 3303
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GTTCAATTATTGACTGGATGTATTACAAGCAGCGTCTTCATTCAGCTATTCAAAAAGTTA 3316
Query 3304 TTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTGGCAAATCCTGTACTTAGGGTGCGTCATCCTA 3363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3317 TTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTGGCAAATCCTGTACTTAGGGTGCGTCATCCTT 3376
Query 3364 ATTGGCTCGAGAAAAAGGTCTCTGACAAATTTCGTCAGGGAAAAATAGTTGATATGTTTA 3423
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3377 ATTGGCTCGAGAAAAAGGTCTGTGACAAATTTCGTCAGGGAAAAATAGTTGATATGTTTA 3436
Query 3424 GCTCAGCAAACAAAGATGGTGTCGTGGACAAAAATCATTTGACAACTCAAGATAATGTAC 3483
||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||
Sbjct 3437 GCTCAGCAAACAAAGAT-----CAT---------TC----GACAACTCAAGATAATGTAG 3478
Query 3484 TGGCGGATATTGAGGATTTTTACAAAGAAAACAGACCTTCCGTAAAAGGGCCAAAGCCAG 3543
||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TGGCGGATATTGAAGAGTTTTGCAAAGAAAACAGACCTTCCGTAAAAGGGCCAAAGCCAG 3538
Query 3544 TTGCGCATTCATATGAAGTCGATAGAAATCACTCTGAGGGTAAGCAGCAAGAGAGTTGGG 3603
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3539 TTGCGCGTTCATTTGAAGTCGATAGAAATCACTCTGAGGGTAAGCAGCAAGAGAGTTGGG 3598
Query 3604 ATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTTCAGAACGTTGACAAGAATGTAGATTACCAAGGAT 3663
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 ATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTACAGAACGTTGACAAGAATGTAGATTACCAAGGAT 3658
Query 3664 GGCTTGAACTGgaaaaaagaaaatggaaaatgactctaaagaataagaaaaaaagaagGT 3723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 GGCTTGAACTGGAAAAAAGAAAATGGAAAATGACTCTAACGAATAAGAAAAAAAGAAGGT 3718
Query 3724 TTGATGATCTAAAGCCTTGTAATCAGATT-GAT--GCT-CACAAGATAAATAAAAAAGTC 3779
| || || | || || | | || ||| | || || |||||||||||||||
Sbjct 3719 AC--TCCTC-AA-G--TT-TATTTGGTTTTGATTTGGAACAAAATATAAATAAAAAAGTC 3771
Query 3780 TGTAAGGGAAGAGCAGGTGTAGGCTCATACTTTAGGAGGCCTGAAGAAGCTTTGACTAGT 3839
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3772 TGTAAGGGAAGAGTAGGTGTAGGCTCATACTTTAGGAGGCCTGAAGAAGCTTTGACTAGT 3831
Query 3840 TCCTATTTGCAGATAATACAGTTGGTCCAAAGTCCACAGAGCGGGCAATTTTTTGCTTGG 3899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3832 TCCTATTTGCAGATAATACAGTTGGTCCAAAGTCCACAGAGCGGGCAATTTTTTGCTTGG 3891
Query 3900 GTTGTTGTGGAAGGATTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATCCCAAGGGTGTTTTACATT 3959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3892 GTTGTTGTGGAAGGATTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATCCCAAGGGTGTTTTACATT 3951
Query 3960 AATTCCAAAGCTTCTATAGCTGGAAACTTCACGGGAAAGTGTATCAACAAGATTCTTCCT 4019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3952 AATTCCAAAGCTTCTATAGCTGGAAACTTCACGGGAAAGTGTATCAACAAGATTCTTCCT 4011
Query 4020 CATGGAAAGCCTTGTTACAATTTGATGGAGGTCAATATTCAGGAAGATCAATTTaaaaaa 4079
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4012 CACGGAAAGCCTTGTTACAATTTGATGGAGGTCAATATTCAGGAAGATCAATTTATAAAA 4071
Query 4080 gaaagcaaaaaGCTTGCCGCTCTACTTGCAGACCCCGAAATTGAGGGCATATATGAAACT 4139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4072 GAAAGCAAAAAGCTTGCCGCTCTACTTGCAGACCCCGAAATTGAGGGCATATATGAAACT 4131
Query 4140 AAGATGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGTGTATGCAAAATTGAAGAC 4199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4132 AAGATGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGTGTATGCAAAATTGAAGAC 4191
Query 4200 ACGGCCAAACACCGTAACACCCAAGATGGATGGAAACTTGGTGAACTTCACAGGATAACT 4259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4192 ACGGCCAAACACCGTAACACCCAAGATGGATGGAAACTTGGTGAACTTCACAGGATAACT 4251
Query 4260 ACAACTGAGTGTCGCTACTTGGAGAATTCAATTCCACTTGTTTGTTTGTATCACAGCACC 4319
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4252 ACAACTGAGTGTCGCTACTTGGAGAATTCTATTCCACTTGTTTATTTGTATCACAGCACC 4311
Query 4320 TCAACAGGTCGTGCTATTTATGTTTTATATTGTCATGCTTTGAAGCGTATGTCTGTTGTG 4379
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 4312 TCAACAGGTCGTGCTGTTTATGTTTTATATTGTCATGCTTCGAAGCTTATGTCTGTTGTG 4371
Query 4380 GTAGTCAATCCTTACGGTGACAAGGAATTATTATCATCTGCCCTAGAGAGACAGTTTAGA 4439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4372 GTAGTCAATCCTTACGGTGACAAGGAATTATTATCATCTGCCCTAGAGAGACAGTTTAGA 4431
Query 4440 GATAGTTGCCAAGAATTGTCACTTGAGCCATTTTCTTGGGATGGTATCCTTTTCCAGGTC 4499
||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4432 GATAGATGCCAAGAACTGTCACCTGAGCCATTTTCTTGGGATGGTATCCTTTTCCAGGTC 4491
Query 4500 GAGTATGTTGACCATCCAGAAGCTGCCAAGAAAAATTTACAAAAAGCGCTCTGTGAATAC 4559
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4492 GAGTATGTTGACCATCCAGAAGCTGCCACGAAATTTTTACAAAAAGCGCTCTGTGAATAC 4551
Query 4560 AGAGAAGAAAATTGTGGACCAACTGTGGCAGTCATTGAATGCCCTGACTTTAACACCATG 4619
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4552 AGAGAAGAAAATTGTGGAGCAACTGTGGCAGTCATTGAATGCCCTGACTTTAACACCACG 4611
Query 4620 AAGGAAGGTGTAAAGGCCCTGGACGATTTCCCATGTGTGAGGATTCCCTTCAACGACGAT 4679
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4612 AAGGAAGGTGTAAAGGCCCTGGAAGATTTCCCATGTGTGAGGATTCCCTTCAACGACGAT 4671
Query 4680 GACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCAGCAAAAATAGCAGTGTTCCGT 4739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4672 GACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCAGCAAAAATAGCAGTGCTCCGT 4731
Query 4740 TGTGCTTCAGCAATTCAGTGGTTGGATCGGAGGATTGCCCAGTCAAGATACGCCCATGTG 4799
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4732 TGTGCTTCAGCAATTCAGTGGTTGGACCGGAGGATTGCCCAGTCAAGATACGCCCATGTG 4791
Query 4800 CCTCTGGGGAATTTTGGACGTGATTGGTTAACGTTCACAGTAGATATCTTCCTGTCCAGG 4859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4792 CCTCTGGGGAATTTTGGACGTGATTGGTTAACGTTCACAGTAGATATCTTCCTGTCCAGG 4851
Query 4860 GCACTCCGTGACGAGCAACAGGTTCTTTGGGTCTCAGATAATGGTGTTCCAGACCTTGGA 4919
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4852 GCACTCCGTGACCAGCAACAGGTTCTTTGGGTCTCAGATAATGGTGTTCCAGACCTTGGA 4911
Query 4920 GATATAAACAATGAAGAGACATTTCTAGCTGATGAGACAAGTTTGCTATTCCCTGGAGCG 4979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4912 GATATAAACAATGAAGAGACATTTCTAGCTGATGAGACAAGTTTGCTATTCCCTGGAGCG 4971
Query 4980 TACAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGGTCCATAGATTAGCTGTTAATGCCCTTCTGAAA 5039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4972 TACAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGGTCCATAGATTAGCTGTTAATGCCCTTCTGAAA 5031
Query 5040 AGTGACCTGGTGAGTGAAATGGAAGGAGGCAGCTTTTTGGGATTTGAACAAGGTGTGAAT 5099
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||
Sbjct 5032 AGTGACCTGGTGAGTGAAATGGAAGGAGGCGGCTTTTTGGG-T--G-------TG--AAT 5079
Query 5100 TCTAGAGGAAGTAGCTTAAACGATAATGGCAGTTTTGATGAGAATAATGGATGTGCGCAA 5159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5080 TCTAGAGGAAGTAGCTTAAACGATAATGGCAGTTTTGATGAGAATAATGGATGCGCGCAA 5139
Query 5160 GCATTTCGTGTCCTGAAACAATTGATCAAGCGCTTGTTGCATGATGCGTGTAAGTCTGGC 5219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5140 GCATTTCGTGTCCTGAAACAATTGATCAAGCGCTTGTTGCATGATGCGTGTAATTCTGGC 5199
Query 5220 AATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACATCTGTCTTGGTGGCTCCGCAGCCCTTCCTCA 5279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5200 AATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACATCTGTCTTGGTGGCTCCGCAGCCCTTCCTCA 5259
Query 5280 AAGCTTCACGATCCAGCTCTCCATCTCATGCTTCACAAGGTCATGCAAAAGGTGTTTGCG 5339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5260 AAGCTTCACGATCCAGCTCTCCATCTCATGCTTCACAAGGTCATGCAAAAGGTGTTTGCG 5319
Query 5340 CTGCTTTTGACTGATTTGCGGAGGTTAGGTGCTATAATAATATACGCAGACTTCTCAAAG 5399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5320 CTGCTTTTGACTGATTTGCGGAGGTTAGGTGCTATAATAATATACGCAGACTTCTCAAAG 5379
Query 5400 GTCATTATCGACACAGGGAAATTTGATCTATCTGCTGCTAAGACTTATTGTGAAAGCTTG 5459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5380 GTCATTATCGACACAGGGAAATTTGATCTATCTGCTGCAAAGACTTATTGTGAAAGCTTG 5439
Query 5460 CTCACAGTGATGGGGAGTAGAGATATCTTTAAGTGGATCTTGCTTGAGCCGGTTCACTAC 5519
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5440 CTCACAGTGATGGGGAGTAGAGATATCTTTAAGTTGATCTTGCTTGAGCCGGTTCACTAC 5499
Query 5520 TGGCACTCGTTACTTTTCATGGACCAGCATAACTATGCTGGTATCCGAGCTACCGAAGAT 5579
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5500 TGGCACTCGTTACTTTTCATGGACCAGCATAACTACGCTGGTATCCGAGCTACCGGAGAT 5559
Query 5580 GAAATTTCAGGTGATGAAGTGACTATTGAACCAAAGTGGAGCGTTGCACGGCATTTACCC 5639
|||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5560 GAAATTTCAGGTAACGAAGTTACTATTGAACCAAAGTGGAGCGTTGCACGGCATTTACCC 5619
Query 5640 GAGTATATTCAGAAGGATTTCATCATAATTGTTGCCACGTTTATATTTGGCCCCTGGAAA 5699
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5620 GAGTATATTCAGAAGGATTTTATCATAATTGTTGCCACGTTTATATTTGGCCCCTGGAAA 5679
Query 5700 TTTGCATTAGAGAAAAAGTGGGGCAGTGCAGAGAGTTTAGAGGCAGATATGGTAGAATAT 5759
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5680 TTTGCATTAGAGAAAAAAAGGGGCAGTGCAGAGAGTTTAGAGGCAGAGATGGTAGAATAT 5739
Query 5760 CTCAAGGAACAGATAGGAACCCGGTTCATAAGCATGATTGTTGAGAAGATTGGTAATATC 5819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5740 CTCAAGGAACAGATAGGAACCCGGTTCATAAGCATGATTGTTGAGAAGATTGGTAATATC 5799
Query 5820 AGGTCACACATGATGGATATAAACGTGTCAGATGCATCTTGGGCTTCTGGTCAAGCTCCC 5879
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5800 AGGTCACACATCAAGGATATAAACGTGTCAGATGCATCTTGGGCTTCTGGTCAAGCTCCC 5859
Query 5880 AAAGGAGATTACACGTTCGAATTTACACAAATTATTACTGCTGTTCTGGCTCTTGATCAA 5939
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5860 AAAGGAGATTACACGTTCGAATTTATACAAATTATTACTGCTGTTCTGGCTCTTGATCAA 5919
Query 5940 AACGTTCAGCAAGATGTTCTGGTAATGAGAAAGAGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAA 5999
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5920 AACGTTCAGCAAGATGTTCTGGTAATGAGAAAGATTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAA 5979
Query 6000 GAATGTGCTGCTGAAGCCGGATTTATTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCCAACGTG 6059
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5980 GAATGTGCTGCTGAAGCCGAATTTATTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCCAACGTG 6039
Query 6060 GCTTGCAGCAACTGCGGTGCCTACAGAGACCTAGATTTCTGCAGAGACCCAGCTCTCTTA 6119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6040 GCTTGCAGCAACTGCGGTGCCTACAGAGACCTAGATTTCTGCAGAGACTCAGCTCTCTTA 6099
Query 6120 ACAGAAAAAGAATGGTCATGTGCGGATCCGCAATGTGGGAAGATATATGACAAAGAGCAG 6179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6100 ACAGAAAAAGAATGGTCATGTGCGGATCCGCAATGTGTGAAGATATATGACAAAGAGCAG 6159
Query 6180 ATGGAGAATAGCCTTGTCCAGATGGTGAGACAGAGGGAGAGAATGTACCAGTTGCAGGAT 6239
|| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6160 ATAGAGAGTAGCATTATCCAGATGGTGAGACAGAGGGAAAGAATGTACCAGTTGCAGGAT 6219
Query 6240 CTAGTGTGCAATAGGTGCAATCAGGTGAAAGCCGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGT 6299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6220 CTAGTGTGCAATAGGTGCAATCAGGTGAAAGCCGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGT 6279
Query 6300 TCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCACAAGAGGATGGAGATTTTC 6359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6280 TCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCACAAGAGGATTGAGATTTTC 6339
Query 6360 TTGGATATAGCAAAGCGCCTGAAGTTTAGACTGCTAGAAGAATGCATCTCCTGGATTTTA 6419
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6340 TTGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTAGACTGCTAGAAGAATGCATCTCCTGGATTTTA 6399
Query 6420 TTTGCCACCAGCTGTTGA 6437
||||||||||||||||||
Sbjct 6400 TTTGCCACCAGCTGTTGA 6417
> AT1G08260.1 | Symbols: EMB142, EMB2284, POL2A, TIL1, EMB529,
ABO4, ESD7 | DNA polymerase epsilon catalytic subunit | chr1:2590944-2606892
FORWARD LENGTH=6486
Length=6486
Score = 8239 bits (4461), Expect = 0.0
Identities = 5805/6445 (90%), Gaps = 128/6445 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 41 AGATGAACTCGAAACTAAACTTGGATTTGGGCTCTTCTCCCAAGGGGAAACGCGCCTCGG 100
||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| || || ||
Sbjct 78 AGATGAACTCGAATCTAAACTCGGATTTGGGCTTTTCTCTGAAGGTGAAACCCGACTTGG 137
Query 101 GTGGCTACTCACATT-TGCATCATCATCTTGGGAAGATGC-CGATACTGGGAAAACCTTT 158
|||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |
Sbjct 138 GTGGTTACTCACATTCT-CATCGTCATCTTGGGAAGAT-CGCGATACTGGGAAAGTCTAT 195
Query 159 AGTTGTGTGGACCTTTTCTTTGTCACTCAGGACGGCTCTTCTTTTAAGACTAAGTACAAG 218
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||
Sbjct 196 AGTTGTGTGGACCTTTACTTTGTTACTCAGGACGGCTTTTCTTTCAAGACAAAGTACAAG 255
Query 219 TTCCGCCCTTACTTGTATGCCGCCACCAAAGACAATATGGAACTGGAAGTTGAAGCCTAC 278
||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||
Sbjct 256 TTCCGTCCTTACTTTTATGCAGCCACGAAAGACAAAATGGAATTGGAACTCGAAGCCTAC 315
Query 279 TTGAGACGCCGATATCAAACACAAGTTGCTGATATTCAGATTGTTCACAAAGAAGATCTT 338
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||
Sbjct 316 TTGAGACGCCGATATGAAAGACAAGTTGCTGATATTGAGATTGTTGAAAAAGAAGATCTT 375
Query 339 GATCTTAAAAATCATCTATCTGGCCTGCaaaaaaaaTATCTCAAAGTATCATTTGACACT 398
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||
Sbjct 376 GATCTTAAAAATCATCTATCTGGCCTGCAAAAAAAATACCTAAAAATATCATTTGATACT 435
Query 399 GTGCAACAATTGGTGGAAGTCAAGAGGGATCTGTTGCATATTGTCGAACGAAACCTCGCA 458
|||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 436 GTGCAACAATTGATGGAAGTCAAGCGGGATTTGTTACATATTGTCGAACGAAACCAGGCA 495
Query 459 AAATTTGATGCATTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAACGAGAACAACGTCCT 518
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 AAATTTGATGCACTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAACGAGAACAACGTCCT 555
Query 519 CAAGACTGCTTAGACTCTGTGGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATGTCCGA 578
||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 556 CAAGATTGCTTAGACTCTATCGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTACCTTATCATGTTCGA 615
Query 579 TTTGCAATTGATAATGATGTGCGTAGTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACT 638
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616 TTTGCAATTGATAATGATGTGCGGAGTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACC 675
Query 639 GATGTCATACTAGAGAAGAGGACGGATCTTCTCCAACGCGCAGAAGTTCGCGTTTGTGCA 698
||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 676 GATGTCATATTGGAGAAGAGGACAGATCTTCTTCAACGCGCAGAAGTCCGTGTTTGTGCC 735
Query 699 TTCGATATAGAGACAGTAAAGCTTCCATTGAAGTTCCCGGATGCTGAATATGATCAAATT 758
||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 736 TTCGATATAGAGACAACAAAGCTTCCGTTGAAGTTTCCTGATGCTGAATATGATCAAATT 795
Query 759 ATGATGATATCCTACATGGTTGATGGGCAAGGTTTTCTAATTACTAACAGAGAGTGTGTT 818
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 796 ATGATGATATCCTACATGGTCGATGGGCAAGGTTTTCTAATTATTAACAGAGAGTGTGTT 855
Query 819 GGCAAAGACATAGAAGATCTGGAATATACACCCAAACCAGAGTTTGAAGGGTATTTCAAA 878
||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 856 GGCGAAGATGTAGAAGATCTGGAATATACACCAAAACCAGAATTTGAAGGGTATTTCAAA 915
Query 879 GTCACGAATGTTAACAACGAGGTTGAACTCCTCCGAAA-ATGGTTTT-CTCATATGCAAG 936
|| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||
Sbjct 916 GTTACTAATGTTAAAAATGAGGTTGAACTCCTCC-AAAGATGGTTTTAC-CATATGCAAG 973
Query 937 AGTTGAAACCTGGTATTTATGTTACATACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAG 996
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 AGTTGAAACCCGGTATTTATGTTACATACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAG 1033
Query 997 AACGGAGAGCATCTCATCATGGGATCAAAATGAACGAGGAGTTAGGATTCCGTTGTGATC 1056
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1034 AACGGAGAGCATCTCATCATGGGATAAAAATGAATGAGGAATTGGGATTCCGTTGTGATC 1093
Query 1057 ATAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAGTTTG-TGTGCCATTTGGATTGTTTTTCTTGGGTG 1115
| ||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1094 AGAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAATTCGCT-TGTCATTTGGATTGTTTTGCTTGGGTT 1152
Query 1116 AAACGTGACAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCAGGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGCAAAA 1175
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 AAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCATGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGCAAAA 1212
Query 1176 CTGGGTTACGATCCACTGGAAGTGAATCCTGAGGACATGGTTCGGTTTGCAATGGAAAAG 1235
|| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1213 CTAGGTTATGATCCACTGGAAGTGAACCCAGAGGACATGGTTCGGTTTGCGATGGAAAAG 1272
Query 1236 CCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTTGCAACTTACTACCTATACATG 1295
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1273 CCCCAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTTGCAACTTATTACCTATACATG 1332
Query 1296 ACATATGTCCATCCGTTCGTTTTTTCTCTCGCAACTATCATTCCAATGGTCCCTGATGAG 1355
||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACATATGTCAATCCATTCATTTTTTCTCTCGCAACTATCATCCCAATGGTCCCTGATGAG 1392
Query 1356 GTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTTTTGATGGTTGAGGCTTACAAG 1415
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 GTTTTACGTAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTTCTGATGGTTGAGGCTTACAAG 1452
Query 1416 GCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAGTTCTACCAAGGTAAA 1475
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||
Sbjct 1453 GCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAATTCTACCAAAATCAA 1512
Query 1476 CTTCTTGAAAGCGAGACATATATTGGTGGCCATGTAGAGTGCCTCCAAAGTGGTGTTTTC 1535
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1513 CTTCTTGAAAGTGAGACATATATTGGTGGTCATGTAGAGTGCCTTGAAAGTGGTGTTTTC 1572
Query 1536 AGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAGCTCGATGCATCTGCATACCAGCAACTGATCGAT 1595
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1573 AGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAACTCGATTCATCGGCATACCAGCAACTGATCGAT 1632
Query 1596 AACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTATCACTGTTGAAGGAAAAATGAAAATGGATTCA 1655
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1633 AACCTTGGTCGTGATCTGGAATATGCTATCACTGTAGAAGGAAAAATGAGAATGGATTCA 1692
Query 1656 ATTTCCAATTATGATGAAGTAGA-GGATGTAATCAGGGAAAAGCTCGAGAAGTTACGGGA 1714
|||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1693 ATTTCCAATTATGATGAAGT-GAAGGACGAAATCAAGGAGAAGCTTGAGAAGTTACGAGA 1751
Query 1715 TGATCCTATACGTGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCGGCGATGTATCC 1774
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1752 TGACCCTATACGGGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCAGCCATGTATCC 1811
Query 1775 AAATATCATCTTAACAAACAGGCTTCAGCCACCATCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCAC 1834
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1812 AAATATCATCTTAACAAACAGGCTTCAGCCACCATCAATAGTTACGGATGAGATTTGCAC 1871
Query 1835 AGCATGTGATTTCAACGGCCCGGAAAAGACCTGTCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCG 1894
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1872 AGCATGTGATTTCAACCGCCCGGGAAAGACCTGTCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCG 1931
Query 1895 TGGGGTGACGTTCAAGGGAAATAAAAGTGAATATTACCATCTGAAGAAGCAGATTGAGTC 1954
||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1932 TGGTGTGACATTCATGGGAAAGAAAAGTGATTATTACCATTTGAAGAAGCAGATTGAGTC 1991
Query 1955 TGAATCTGTTGATGCTGGTGCAAATATGCA-GTCTTCAAAACCTTTTCTTGATCTGCCAA 2013
||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||||||||||||
Sbjct 1992 TGAATTTGTTGATGCTGGTGCAAATATA-ATGTCTTCAAAATCGTTCCTTGATCTGCCAA 2050
Query 2014 AGGTGGAACAACAATCCAAATTAAAAGAACGACTGAAAAAATACTGTCAAAAGGCATATA 2073
||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2051 AGGTGGATCAACAATCTAAGCTAAAAGAACGACTAAAAAAATATTGTCAAAAGGCTTATA 2110
Query 2074 GCCGAGTACTTGACAAGCCA-TTCACTGAAGTTCGCGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAA 2132
|||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 AACGAGTACTTGACAAGCCAATT-ACTGAAGTTCGTGAAGCTGGGATATGCATGAGAGAA 2169
Query 2133 AACCCGTTCTATGTGGACACTGTGCGTAGCTTTCGAGATAGGAGGTATGAATACAAAACA 2192
||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170 AACCCTTTCTATGTGGATACTGTTCGGAGCTTTCGAGATAGGAGGTATGAATACAAAACA 2229
Query 2193 CTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAGTTGTCAGAGGCCAAGGCAAGTGGCAATTCAATCAAG 2252
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2230 CTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAATTGTCAGAGGCCAAGGCAAGTGGTAATTCAATCAAG 2289
Query 2253 ATCCAGGAAGCACATGACATGGTAGTGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGT 2312
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2290 ATCCAGGAAGCACAGGACATGGTAGTGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGT 2349
Query 2313 ATACTTAATTCCTTTTATGGATATGTCATGCGAAAGGGCGCAAGATGGTACTCCATGGAA 2372
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2350 ATACTTAATTCCTTCTATGGATATGTCATGCGAAAGGGTGCAAGATGGTATTCCATGGAA 2409
Query 2373 ATGGCTGGTGTAGTTACTTATACTGGAGCCAAAATCATCCAGAATGCTCGTTTGCTTATT 2432
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 2410 ATGGCTGGTGTAGTTACCTATACTGGAGCCAAAATCATACAGAATGCCCGTTTGCTTATT 2469
Query 2433 GAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGCTGGATACAGATGGTATATGGTGT-GCTCTCCCTGG 2491
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2470 GAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGTTGGATACAGATGGTATATGGTGTTG-TCTCCCTGG 2528
Query 2492 ATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACGATAGATATGAAGAAATTCACCATCTCGTA 2551
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2529 ATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACAATAGACATGAAGAAACTCACCATCTCGTA 2588
Query 2552 TCCGTGTGTAATACTTAATGTTGATGTGGCGAAGAATAATTCAAATGACCAATATCAGAC 2611
||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 2589 TCCTTGTGTTATGCTTAATGTTGATGTGGCAAAGAATAATACAAATGATCAATATCAGAC 2648
Query 2612 TCTAGTAGATCCTGTACGAAAGACATATAATTCACATAGCGAATGCTCAATTGAATTTGA 2671
||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 TCTTGTAGATCCTGTACGCAAGACATATAAATCACATAGTGAATGCTCAATTGAATTTGA 2708
Query 2672 AGTGGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCTGCATCCAAGGAAGAGGGAATCTTAAT 2731
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||
Sbjct 2709 AGTAGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCTGCATCGAAAGAAGAAGGAATCTTAAT 2768
Query 2732 TAAGAAGCGGTATGCTGTTTTCAATCATGACGGAACCATAGCAGAACTCAAGGGGTTTGA 2791
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 CAAGAAGCGTTATGCTGTTTTCAATCATGATGGAACCTTAGCAGAACTCAAGGGGTTTGA 2828
Query 2792 GATGAAGCGTAGAGGAGAGCTGAAACTCATTAAAGTTTTCCAGGCCGAGCTATTTGACAA 2851
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2829 GATCAAGCGTAGAGGGGAGCTGAAACTCATTAAAGTTTTCCAGGCCGAGCTTTTTGACAA 2888
Query 2852 ATTTCTGCATGGATCAACCCTTGAAGAGTGTTATTCTGCTGTTGCAGCTGTTGCAGATCG 2911
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2889 ATTTCTCCATGGATCAACTCTTGAAGAGTGTTATTCTGCTGTTGCAGCGGTTGCTGATCG 2948
Query 2912 TTGGCTTGACCTACTCGAGGGTCAAGGAAAATATATTGCCGATAGTGAATTGCTAGATTA 2971
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2949 ATGGCTTGACCTACTCGATAATCAAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAACTGCTAGATTA 3008
Query 2972 TATATCAGAATCAAGCACTATGAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTCAACAAAAGTCATG 3031
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3009 TATATCAGAATCAAGCACAATGAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTGAGCAAAAGTCATG 3068
Query 3032 TGCAGTGACCACAGCAAAACGCCTGGCTGATTTTCTTGGTGATACAATGGTCAAAGATAA 3091
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3069 TGCAGTGACCACAGCAAAACGCCTGGCTGAATTTCTTGGTGTTACAATGGTCAAAGATAA 3128
Query 3092 AGGACTGCGCTGCCAATACATCGTTGCTCGTGAACCAGAGGGGACACCTGTAAGTGAACG 3151
|||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||
Sbjct 3129 AGGACTACGTTGCCAGTACATTGTTGCTTGTGAACCAAAGGGTACACCGGTAAGCGAACG 3188
Query 3152 TGCTGTCCCTGTTGCCATATTTAAAACGGATGATCCTGaaaa-a--aaGTTTTATCTGCA 3208
|||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||| | |||||| || |||
Sbjct 3189 TGCTGTTCCTGTTGCCATATTTACAACA-A--ATCCGGAAGTTATGAAGTTTCATTTGCG 3245
Query 3209 AAAATGGTGCAAGATATCATCATATA-CTGGAATCCGT-TCAATTATTGACTGGAGGTAT 3266
|||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||| | | ||||||||||| ||||
Sbjct 3246 AAAATGGTGCAAGACATCATCAGATGTC-GGAATTCGTCTGA-TTATTGACTGGTCGTAT 3303
Query 3267 TACAAGCAGCGTCTTCA-TTCAGCTATTCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCA 3325
||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3304 TACAAGCAGCGCCTT-AGTTCAGCTATCCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCA 3362
Query 3326 GAAGGTGGCAAATCCTGTACTTAGGGTGCGTCATCCTAATTGGCTCGAGAAAAAGGTCTC 3385
||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||| |
Sbjct 3363 GAAGGTGGCAAATCCCGTGCCTAGGGTGCTTCATCCTGACTGGCTCCATAAAAAGGTC-C 3421
Query 3386 -TGA------C-A-AA-TTTCGTCAGGGAAAAATAGTTGATATGTTTAGCTCAGCAAACA 3435
||| | | || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3422 GTGAGAAAGACGACAAATTTCGCCAGAGAAAACTAGTTGATATGTTCAGCTCAGCAAATA 3481
Query 3436 AAGATGGTGTCGT-GGACAAAAATCATTT-GACAACTCAAGATAATGTACTGGCGGATAT 3493
|||||| ||| || ||||| | ||| || | ||| |||||||||| || |||||
Sbjct 3482 AAGATGTTGT-GTTGGACACAGATC-TTCCGGTGACTAAAGATAATGT---GGAAGATAT 3536
Query 3494 TGAGGATTTTTACAAAGAAAACAGACCTTCCGTAAAAGGGCCAAAGCCAGTTGCGCATTC 3553
||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 3537 TGAGGATTTTTGCAAAGAAAATAGGCCTTCCGTCAAAGGGCCAAAGCCAATTGCGCGTTC 3596
Query 3554 ATATGAAGTCGATAGAAATCACTCTGAGGGTAAGCAGCAAGAGAGTTGGGATCCAGAGTT 3613
||||||||| ||| ||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3597 CTATGAAGTCAATAAAAAACAGTCTGAATGTGAGCAGCAAGAGAGCTGGGATACAGAGTT 3656
Query 3614 CCATGATATCTCATTTCAGAACGTTGACAAGAATGTAGATTACCAAGGATGGCTTGAACT 3673
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3657 CCATGATATCTCATTTCAGAACATTGACAAGAGCGTAAACTACCAAGGATGGCTTGAACT 3716
Query 3674 Ggaaaaa-agaaaatggaaaatgactctaaagaataagaaaaaaagaagGTTTGATGATC 3732
| ||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||
Sbjct 3717 G-AAAAAGAGAAAATGGAAAGTAACTCTAGAGAAGAAGAAAAAACGAAGGTTGGGTGATC 3775
Query 3733 TAA-AGCCTTGTAATCAGATTGATGCTCACAAGATAAATAAAAAAGTCTGTAAGGGAAGA 3791
||| | | || || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 3776 TAAGATC-TTCAAACCAGGTTGATACTCACGAGATAAATCAAAAAGTCGGTCAGGGAAGA 3834
Query 3792 GCAGGTGTAGGCTCATACTTTAGGAGGCCTGAAGAAGCTTTGACTAGTTC-CTATTTGCA 3850
| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||
Sbjct 3835 GGAGGTGTGGGTTCATACTTTAGGAGGCCTGAAGAAGCTTTGACTAGTTCAC-ATTGGCA 3893
Query 3851 GATAATACAGTTGGTCCAAAGTCCACAGAGCGGGCAATTTTTTGCTTGGGTTGTTGTGGA 3910
|||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3894 GATAATACAGCTGGTCCCAAGTCCACAGAGCGGACAATTTTTTGCTTGGGTGGTTGTGGA 3953
Query 3911 AGGATTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATCCCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAGC 3970
||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3954 AGGGTTGATGCTTAAGATCCCATTGTCGATCCCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAG- 4012
Query 3971 TTC-TATAGCTGGAA-ACTTC-ACGGGAAAGTGTATCAACAAGATTCTTCCTCATGGAAA 4027
||| ||||| || || | ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4013 TTCCTATAGATG-AATATTTCCAAGG-AAAGTGTGTCAACAAGATTCTTCCTCATGGAAG 4070
Query 4028 GCCTTGTTACAATTTGA-TGGAGGTCAATATTCAGGAAGATCAATTTaaaaaagaaagca 4086
||||||||| | ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4071 GCCTTGTTATAGTTTGACTG-AGGTCAAGATTCAAGAAGATCAATTTAAAAAAGAAAGTA 4129
Query 4087 aaaaGCTTGCCGCTCTACTTGCAGACCCCGAAATTGAGGGCATATATGAAACTAAGATGC 4146
|||||| ||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4130 AAAAGCGTGCAGCTCTTCTTGCAGACCCTGGAGTTGAGGGCATATATGAAACTAAGGTGC 4189
Query 4147 CTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGTGTATGCAAAATTGA-AGACACGGCC 4205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||
Sbjct 4190 CTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGTGTATGCAAAATTGATA-ACAAAGCC 4248
Query 4206 AAACACCGTAACACCCAAGATGGATGGAAACTTGGTGAACTTCACAGGATAACTACAACT 4265
|| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4249 AAGCACCGTAACACCCAAGATGGATGGGAAGTTGGTGAACTTCACATGAAAACTACAACT 4308
Query 4266 GAGTGTCGCTACTTGGAGAATTCAATTCCACTTGTTTGTTTGTATCACAGCACCTCAACA 4325
||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 4309 GAGTGTCACTACTTGAAGCGTTCAATTCCACTTGTTTACTTGTATAACAGCACCTCAACA 4368
Query 4326 GGTCGTGCTATTTATGTTTTATATTGTCATGCTTT-GAAGCGTATGTCTGTTGTGGTAGT 4384
|| |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| || |||||
Sbjct 4369 GGGCGTGCTATATATGTTTTATATTGTCATG-TATCGAAGCTTATGTCTGCCGTTGTAGT 4427
Query 4385 CAATCCTT--A-CGGTGACAAGGAATTATTATCATCTGCCCTAGAGAGACAGTTTAGAGA 4441
|||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4428 TGATCCTTTTAACGG---CAATGAATTATTACCATCTGCCTTAGAGAGACAGTTTAGAGA 4484
Query 4442 TAGTTGCCAAGAATTGTCACTTGAGCCATTTTCTTGGGATGGTATCCTTTTCCAGGT-CG 4500
|||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 4485 TAGTTGCCTAGAATTATCACTTGATTCATTGTCTTGGGATGGTATCCGTTTCCAGGTGC- 4543
Query 4501 AGTATGTTGACCATCCAGAAGCTGCCAAGAA-A-AATTTACAAAAAGCGCTCTGTGAATA 4558
| || ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||
Sbjct 4544 ACTACGTTGACCATCCCGAAGCTGCCAAGAAGATAAT--ACAAAGAGCAATAAGTGAATA 4601
Query 4559 CAGAGAAGAAAATTGTGGACCAACTGTGGCAGTCATTGAATGCCCTGACTTTAACACCAT 4618
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 4602 CAGAGAAGAAAATTGTGGACCAACTGTTGCTGTCATTGAATGCCCTGACTTTACCTTCAT 4661
Query 4619 GAAGGAAGGTGTAAAGGCCCTGGACGATTTCCCATGTGTGAGGATTCCCTTCAACGACGA 4678
|||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4662 GAAGGAAGGTATTAAGGCCCTAGATGATTTCCCATGTGTGAGGATTCCCTTCAACGACGA 4721
Query 4679 TGACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCAGCAAAAATAGCAGTGTTCCG 4738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 4722 TGACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCTGCAAAAATAGCAATGTTCCG 4781
Query 4739 TTGTGCTTCAGCAATTCAGTGGTTGGATCGGAGGATTGCCCAGTCAAGATACGCCCATGT 4798
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 4782 TTGTGCTGCAGCATTTCAGTGGTTGGATCGGAGGATTACCCAATCAAGATACGCCCATGT 4841
Query 4799 GCCTCTGGGGAATTTTGGACGTGATTGGTTAACGTTCACAGTAGATATCTTCCTGTCCAG 4858
|||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 4842 GCCTCTGGGGAATTTTGGACTTGATTGGCTAACATTCACAATAGATATCTTCCTATCCAG 4901
Query 4859 GGCACTCCGTGACGAGCAACAGGTTCTTTGGGTCTCAGATAATGGTGTTCCAGACCTTGG 4918
||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4902 GGCACTCCGTGACCAGCAACAGGTCCTTTGGGTGTCAGATAATGGTGTTCCAGACCTTGG 4961
Query 4919 AGATATAAACAATGAAGAGACATT-TCTAGC---TGA--TG-A---GACAAGTTT-GCTA 4967
|| |||||||||||||||| |||| | | || ||| || | ||||||||| | ||
Sbjct 4962 AGGTATAAACAATGAAGAGGCATTCTTT-GCCGATGAGGTGCAACAGACAAGTTTAG-TA 5019
Query 4968 TTCCCTGGAGCGTACAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGGTCCATAGA-TTAGCTGTTAA 5026
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||
Sbjct 5020 TTCCCTGGAGCGTATAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGATCCATA-ACTTGGCTGTTAA 5078
Query 5027 TGCCCTTCTGAAAAGTGACCTGGTGAGTGAAATGGAAGGAGGCAGCTTTT-TGGGATTTG 5085
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||
Sbjct 5079 TGCCCTTCTGAAAAGCAACCTGGTGAATGAAATGGAAGGAGGCGG-TTTTATGGGATTTG 5137
Query 5086 AACAAGG-TGTGAATTCTAGAGGAAGTAGCTT-AAACGATAATGGCAGTTTTGATGAGAA 5143
|||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5138 AACA-GGATGTGAATCCTAGAGGAATTAA-TTCAAACGATAACACCAGTTTTGATGAGAC 5195
Query 5144 TAATGGATGTGCGCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAATTGAT-CA-AGC-GCTTGT-TGC 5199
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||
Sbjct 5196 CACTGGATGTGCTCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAGTTGATTCATAGTTGCTTGACTG- 5254
Query 5200 ATGATGCGTGTAAGTCTGGCAATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACATCTGTCTTGGT 5259
||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 5255 ATG-TGCGTA-AA-TCTAAAAATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACGTTTGTCTTGGT 5311
Query 5260 GGCTCCGCAGCCCTTCCTCAAAGCTTCACGATCCAGCTCTCCATCTCATGCTTCACAAGG 5319
||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5312 GGCTCTGCAGCCCTTCCTCGAAGCTCCATGATCCAGCTCTTCATCTCATGCTTCACAAGG 5371
Query 5320 TCATGCAAAAGGTGTTTGCGCTGCTTTTGACTGATTTGCGGAGGTTAGGTGCTATAATAA 5379
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5372 TCATGCAAAAGGTGTTTGCACTGCTATTGACTGATTTGCGGAGATTAGGTGCTATAATAA 5431
Query 5380 TATACGCAGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGGGAAATTTGATCTATCTGCTGCTA 5439
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5432 TATATGCAGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGTGAAATTTGATCTATCTGCAGCTA 5491
Query 5440 AGACTTATTGTGAAAGCTTGCTCA-CAGTGATGGGGAGTAGAGATATCTTTAAGTGGATC 5498
|| ||||||||||||||||||| | || | || ||| ||| ||||||||| |||||||
Sbjct 5492 AGGCTTATTGTGAAAGCTTGCT-ATCAACGGTGCGGAATAGTGATATCTTTGAGTGGATA 5550
Query 5499 TTGCTTGAGCCGGTTCACTACTGGCACTCGTTACTTTTCATGGACCAGCATAACTATGCT 5558
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 5551 TTGCTCGAGCCGGTTCACTACTGGCACTCATTACTTTTCATGGACCAGTATAACTACGCT 5610
Query 5559 GGTATCCGAGCTACCGAAGATGAAATTTCAGGTGATGAAGTGACTATTGAACCAAAGTGG 5618
||||||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5611 GGTATCCGAGC--C-GATGATGAAATTTCACTTGACGAAGTGACTATTGAACCAAAGTGG 5667
Query 5619 AGCGTTGCACGGCATTTACCCGAGTATATTCAGAAGGATTTCATCATAATTGTTGCCACG 5678
|| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |
Sbjct 5668 AGTGTTGCACGACATTTACCTGAGTATATTGAGAGGGATTTCATTATAATCATTGCCAAG 5727
Query 5679 TTTATATTTGGCCCCTGGAAATTTGC-ATTAGAGAA-AAAGTGGGGCAGTGCAGAGAGTT 5736
|||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||| |||||||||
Sbjct 5728 TTTATATTTGACCCCTGGAAATTTGCGAT-AGAAAATAAAAAGGG-CAGTTCAGAGAGTT 5785
Query 5737 TAGAGGCAGATATGGTAGAATATCTCAAG-GAACAGATAGGAAC--CCGGTTCATAAGCA 5793
|||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||||| ||| | || ||||||| |
Sbjct 5786 TAGAGGCACAGATGATAGAATATCT-AAGAGAACAGATTGGATCAACC--TTCATAAATA 5842
Query 5794 TGATTGTTGAGAAGATTGGTAATATCAGGTCACACATGATGGATATAAACGTGTCAGATG 5853
|| |||| | ||| ||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||
Sbjct 5843 TGCTTGTCAAAAAGGTTGATGATATCATGTCACACATGAAGGAGATAAATGTTTCAGATG 5902
Query 5854 CATCTTGGGCTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGAGATTACACGTTCGAATTTACACAAATTA 5913
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||
Sbjct 5903 CATCTCGGGTTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGAGATTACTCGTTGGAATTTATACAGGTTA 5962
Query 5914 T-TACTGCTGTTCTGGCTCTTGATCAAAACGTTCAGCAAGATGTTCTGGTAATGAGAAAG 5972
| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5963 TCT-CTGCTGTTCTGGCTCTTGACCAAAACGTCCAGCAAGATGTTCTGGTAATGAGAAAG 6021
Query 5973 AGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAATGTGCTGCTGAAGCCGGATTTATTGATCCT 6032
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 6022 AGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAGTGTGCTGCTGAAGCCGAATTTCTTGATCCT 6081
Query 6033 GGGCCATCCTTCATCTTACCCAACGTGGCTTGCAGCAACTGCGGTGCCTACAGAGACCTA 6092
|||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 6082 GGGCCATCCTTCATCTTACCTAATGTAGCTTGCAGCAACTGTGATGCCTACAGAGACCTA 6141
Query 6093 GATTTCTGCAGAGACCCAGCTCTCTTAACAGAAAAAGAATGGTCATGTGCGGATCCGCAA 6152
||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 6142 GATATATGCAGAGACCCAGCACTGTTAACAGAGAAAGAATGGTCATGTGCGGATACACAA 6201
Query 6153 TGTGGGAAGATATATGACAAAGAGCAGATGGAGAATAGCCTTGTCCAGATGGTGAGACAG 6212
||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 6202 TGTGGGAAGATATATGACAGAGAGCAGATGGAGAGTAGCCTTCTAGAGATGGTGAGACAG 6261
Query 6213 AGGGAGAGAATGTACCAGT-TGCAGGATCTAGTGTGCAATAGGTGCAATCAGGTGAAAGC 6271
|| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6262 AGAGAAAGAATGTACCA-TATGCAGGATGTAGTGTGCATTAGGTGCAATCAGGTGAAAGC 6320
Query 6272 CGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGTTC 6331
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6321 GGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGGTC 6380
Query 6332 AGATTTCCA-CAAGAGGATGGAGATTTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCTGAAGTTTAGAC 6390
||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6381 AGAGTTC-AGCAAGAGGATGGAGATATTCATGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTAGAC 6439
Query 6391 TGCTAGAAGAATGCATCTCCTGGAT 6415
|| ||||||||| |||||| |||||
Sbjct 6440 TGTTAGAAGAATACATCTCTTGGAT 6464
> AT1G08270.2 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: MIT (InterPro:IPR007330);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is:
AAA-type ATPase family protein (TAIR:AT2G27600.1); Has 35333
Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798;
Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
| chr1:2606269-2607507 REVERSE LENGTH=1034
Length=1034
Score = 263 bits (142), Expect = 2e-68
Identities = 171/185 (92%), Gaps = 2/185 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 6232 TGCAGGATCTAGTGTGCAATAGGTGCAATCAGGTGAAAGCCGCTCATTTGACAGAGCAGT 6291
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 730 TGCAGGATGTAGTGTGCATTAGGTGCAATCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAGCAGT 671
Query 6292 GTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCA-CAAGAGGATG 6350
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||
Sbjct 670 GTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGGTCAGAGTTC-AGCAAGAGGATG 612
Query 6351 GAGATTTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCTGAAGTTTAGACTGCTAGAAGAATGCATCTCC 6410
||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 611 GAGATATTCATGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATCTCT 552
Query 6411 TGGAT 6415
|||||
Sbjct 551 TGGAT 547
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 322307249289
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5