BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg933091
Length=6443
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G27120.1 | Symbols: POL2B, TIL2 | DNA polymerase epsilon cat... 5879 0.0
AT1G08260.1 | Symbols: EMB142, EMB2284, POL2A, TIL1, EMB529, AB... 4680 0.0
AT1G08270.2 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: MIT (Inte... 257 8e-67
> AT2G27120.1 | Symbols: POL2B, TIL2 | DNA polymerase epsilon catalytic
subunit | chr2:11581223-11594346 FORWARD LENGTH=6417
Length=6417
Score = 5879 bits (3183), Expect = 0.0
Identities = 3376/3465 (97%), Gaps = 29/3465 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTGATCGGAGGTCGAATATGCAGAAAGTTTCAGCCGCAGATGAACTCGAAACTAAACTTG 63
|||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 17 GTGATCGGAGGTTGAATGTGCAGAAAGTTTCAGCGGCAGATGAACTCGAAACTAAACTTG 76
Query 64 GATTTGGGCTCTTCTCCCAAGGGGAAACGCGCCTCGGGTGGCTACTCACATTTGCATCAT 123
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 77 GATTTGGGCTTTTCTCCCAAGGGGAAACGCGGCTCGGGTGGCTACTCACGTTTGCATCAT 136
Query 124 CATCTTGGGAAGATGCCGATACTGGGAAAACCTTTAGTTGTGTGGACCTTTTCTTTGTCA 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CATCTTGGGAAGATGCCGATACTGGGAAAACCTTTAGTTGTGTGGACCTTTTCTTTGTCA 196
Query 184 CTCAGGACGGCTCTTCTTTTAAGACTAAGTACAAGTTCCGCCCTTACTTGTATGCCGCCA 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 CTCAGGACGGCTCTTCTTTTAAGACTAAGTACAAGTTCCGCCCTTACTTGTATGCCGCCA 256
Query 244 CCAAAGACAATATGGAACTGGAAGTTGAAGCCTACTTGAGACGCCGATATCAAACACAAG 303
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 257 CCAAAGACAATATGGAACTGGAAGTTGAAGCCTACTTGAGACGCCGATATGAAAGACAAG 316
Query 304 TTGCTGATATTCAGATTGTTCACAAAGAAGATCTTGATCTTAAAAATCATCTATCTGGCC 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 TTGCTGATATTCAGATTGTTCACAAAGAAGATCTTTATCTTAAAAATCATCTATCTGGCC 376
Query 364 TGCaaaaaaaaTATCTCAAAGTATCATTTGACACTGTGCAACAATTGGTGGAAGTCAAGA 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 377 TGCAAAAAAAATATCTCAAAGTATCATTTGACACTGTGCAACAATTGGTGGAAGTAAAGA 436
Query 424 GGGATCTGTTGCATATTGTCGAACGAAACCTCGCAAAATTTGATGCATTTGAAGCATACG 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||
Sbjct 437 GGGATCTGTTGCATATTGTCGAACGAAACCTCGCAAAATTTAATGCACTTGAAGCTTACG 496
Query 484 AATCCATATTGGCTGGAAAACGAGAACAACGTCCTCAAGACTGCTTAGACTCTGTGGTGG 543
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 AATCCATCTTGTCTGGAAAACGAGAACAACGTCCTCAAGACTGCTTAGACTCTGTGGTGG 556
Query 544 ACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATGTCCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGTA 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 ACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATGTCCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGTA 616
Query 604 GTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACTGATGTCATACTAGAGAAGAGGACGG 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 GTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACTGATGTCATACTAGAGAAGAGGACGG 676
Query 664 ATCTTCTCCAACGCGCAGAAGTTCGCGTTTGTGCATTCGATATAGAGACAGTAAAGCTTC 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 ATCTTCTCCAACGCGCAGAAGTTCGCGTTTGTGCATTCGATATAGAGACAGTAAAGCTTC 736
Query 724 CATTGAAGTTCCCGGATGCTGAATCTGATCAAATTATGATGATATCCTACATGGTTGATG 783
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 CATTGAAGTTCCCGGATGCTGAATATGATCAAATTATGATGATATCCTACATGGTTGATG 796
Query 784 GGCAAGGTTTTCTAATTACTAACAGAGAGTGTGTTGGCAAAGACATAGAAGATCTGGAAT 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 GGCAAGGTTTTCTAATTACTAACAGAGAGTGTGTTGGCAAAGACATAGAAGATCTGGAAT 856
Query 844 ATACACCCAAACCAGAGTTTGAAGGGTATTTCAAAGTCACGAATGTTAACAACGAGGTTG 903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 857 ATACACCCAAACCAGAGTTTGAAGGGTATTTCAAAGTCACGAATGTTACCAACGAGGTTG 916
Query 904 AACTCCTCCGAAAATGGTTTTCTCATATGCAAGAGTTGAAACCTGGTATTTATGTTACAT 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 AACTCCTCCGAAAATGGTTTTCTCATATGCAAGAGTTGAAACCTGGTATTTATGTTACAT 976
Query 964 ACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCGCATCATGGGATCA 1023
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 977 ACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATCA 1036
Query 1024 AAATGAACGAGGAGTTAGGATTCCGTTGTGATCATAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAGT 1083
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAATGAACGAGGAGTTGGGATTCCGTTGTGATCAAAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAGT 1096
Query 1084 TTGTGTGCCATTTGGATTGTTTTTCTTGGGTGAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAA 1143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 TTGTGTGCCATTTGGATTGTTTTTCTTGGGTGAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAA 1156
Query 1144 GCCATGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGCAAAACTGGGTTACGATCCACTGGAAGTGAATC 1203
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 GCCAGGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGTAAAACTGGGTTACGATCCACTGGAAGTGAATC 1216
Query 1204 CTGAGGACATGGTTCGGTTTGCAATGGAAAAGCCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCT 1263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 CTGAGGACATGGTTCGGTTTGCAATGGAAAAGCCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCT 1276
Query 1264 CTGATGCTGTTGCAACTTACTACCTATACATGACATATGTCCATCCGTTCGTTTTTTCTC 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 CTGATGCTGTTGCAACTTACTACCTATACATGACATATGTCCATCCGTTCGTTTTTTCTC 1336
Query 1324 TCGCAACTATCATTCCAATGGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTT 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TCGCAACTATCATTCCAATGGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTT 1396
Query 1384 GTGAAATGCTTTTGATGGTTGAGGCTTACAAGGCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATC 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 GTGAAATGCTTTTGATGGTTGAGGCTTACAAGGCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATC 1456
Query 1444 AAGCTGACCCTGAGAAGTTCTACCAAGGTAAACTTCTTGAAAGTGAGACATATATTGGTG 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457 AAGCTGACCCTGAGAAGTTCTACCAAGGTAAACTTCTTGAAAGTGAGACATATATTGGTG 1516
Query 1504 GCCATGTAGAGTGCCTCCAAAGTGGTGTTTTCAGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAGC 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517 GCCATGTAGAGTGCCTCCAAAGTGGTGTTTTCAGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAGC 1576
Query 1564 TCGAGGCATCCGCATACCAGCAACTGATCGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTA 1623
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 TCGACGCATCCGCATACCAGCAACTGATCGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTA 1636
Query 1624 TCACTGTTGAAGGAAAAATGAGAATGGATTCAATTTCCAATTATGATGAAGTAAAGGACG 1683
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1637 TCACTGTTGAAGGAAAAATGAGAATGGATTCAGTTTCCAATTTTGATGAAGTAAAGGAAG 1696
Query 1684 TAATCAGAGGAAAGAGTTTTTACGGCGAGAAGTTACGGGATGATCCAATACGTGAAGAGG 1743
||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1697 TAATCAG-GGAAA-AGCT----CG---AGAAGTTACGGGATGATCCTATACGTGAAGAGG 1747
Query 1744 GGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTTGCGGCGATGTATCCAAATATCATCTTAACAAACA 1803
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1748 GGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCGGCGATGTATCCAAATATTATCTTAACAAACA 1807
Query 1804 GGCTTCAGCCACCATCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCACAGCATGTGATTTCAACGGCC 1863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1808 GGCTTCAGCCACCATCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCACAGCATGTGATTTCAACGGCC 1867
Query 1864 TGGAAAAGACCTGTCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGGGTGACATTCAAGGGAA 1923
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1868 CGGAAAAGACCTGTCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGGGTGACGTTCAAGGGAA 1927
Query 1924 ATAAAAGTGAATATTACCATCTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATCTGTTGATGCTGGTG 1983
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1928 ATAAAAGTGAATATTACCATCTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATCTGTTGATGCTGGAG 1987
Query 1984 CAAATATGCAGTCTTCAAAACCTTTTCTTGATCTGCCAAAGGTGGAACAACAATCCAAAT 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988 CAAATATGCAGTCTTCAAAACCTTTTCTTGATCTGCCAAAGGTGGAACAACAATCCAAAT 2047
Query 2044 TAAAAGAACGATTGAAAAAATACTGTCAAAAGGCATATAGCCGAGTACTTGACAAGCCAA 2103
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2048 TAAAAGAACGACTGAAAAAATACTGTCAAAAGGCATATAGCCGAGTACTTGACAAGCCAA 2107
Query 2104 TCACTGAAGTTCGCGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTG 2163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108 TCACTGAAGTTCGCGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTG 2167
Query 2164 TGCGCAGCTTTCGAGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAA 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 TGCGCAGCTTTCGAGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAA 2227
Query 2224 AGTTGTCCGAGGCCAAGGCAAGTGGCAATTCAATCAAGATCCAGGAAGCACATGACATGG 2283
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2228 AGTTGTCAGAGGCCAAGGCAAGTGGCAATTTAATCAAGATCCAGGAAGCACATGACATGG 2287
Query 2284 TAGTGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATTCCTTCTATGGAT 2343
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2288 TAGTGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATTCCTTTTATGGAT 2347
Query 2344 ATGTCATGCGAAAGGGCGCAAGATGGTACTCCATGGAAATGGCTGGTGTAGTTACTTATA 2403
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2348 ATGTCATGCGAAAGGGCGCAAGATGGTACTCCATGGAAATGGCTGGGGTAGTTACTTATA 2407
Query 2404 CTGGAGCCAAAATCATCCAGAATGCACGTTTGCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTG 2463
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2408 CTGGAGCCAAAATCATCCAGAATGCTCGTTTGCTTATTGAACGAATTGGGAAACCACTTG 2467
Query 2464 AGCTGGATACAGATGGTATATGGTGTGCTCTCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTT 2523
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2468 AGCTGGATACAGATGGTATATGGTGTGCTCTACCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACCT 2527
Query 2524 TTAAAACGATAGACATGAAGAAATTCACCATCTCGTATCCGTGTGTAATACTTAATGTTG 2583
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2528 TTAAAACCATAGATATGAAGAAATTCACCATCTCGTATCCGTGTGTAATACTTAATGTTG 2587
Query 2584 ATGTGGCGAAGAATAATTCAAATGACCAATATCAGACTCTTGTAGATCCTGTACGAAAGA 2643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2588 ATGTGGCGAAGAATAATTCAAATGACCAATATCAGACTCTAGTAGATCCTGTACGAAAGA 2647
Query 2644 CATATAATTCACGTAGCGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTGGATGGACCGTACAAGGCAA 2703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2648 CATATAATTCACGTAGCGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTGGATGGACCGTACAAGGCAA 2707
Query 2704 TGATTATTCCTGCATCAAAGGAAGAGGGAATCTTAATTAAGAAGCGGTATGCAATTTTCA 2763
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2708 TGATTATTCCTGCATCCAAGGAAGAGGGAATCTTAATTAAGAAGCGGTATGCTGTTTTCA 2767
Query 2764 ATCATGACGGAACCATAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATGAAGCGTAGAGGAGAGCTGA 2823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2768 ATCATGACGGAACCATAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATGAAGCGTAGAGGAGAGCTGA 2827
Query 2824 AACTCATTAAAGTTTTCCAAGCCGAGCTATTTGACAAATTTCTGCATGGATCAACTCTTG 2883
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2828 AACTCATTAAAGTTTTCCAGGCCGAGCTATTTGACAAATTTCTGCATGGATCAACCCTTG 2887
Query 2884 AAGAGTGTTATTCTGCTGTTGCAGCTGTTGCAAATCGTTGGCTTGACCTACTCGAGGATC 2943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2888 AAGAGTGTTATTCTGCTGTTGCAGCTGTTGCAAATCGTTGGCTTGACCTACTCGAGGGTC 2947
Query 2944 AAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAATTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACTATGA 3003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2948 AAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAATTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACTATGA 3007
Query 3004 GCAAATCGTTAGCAGATTATGGTCAACAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACGCC 3063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3008 GCAAATCGTTAGCAGATTATGGTCAACAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACGCC 3067
Query 3064 TGGCTGATTTTCTTGGTGATACAATGGTCAAAGATAAAGGACTGCGCTGCCAATACATCG 3123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3068 TGGCTGATTTTCTTGGTGATACAATGGTCAAAGATAAAGGACTGCGCTGCCAATACATCG 3127
Query 3124 TTGCTTGTGAACCAGAGGGGACACCTGTAAGTGAACGTGCTGTCCCTGTTGCCATATTTC 3183
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3128 TTGCTCGTGAACCAGAGGGGACACCTGTAAGTGAACGTGCTGTCCCTGTTGCCATATTTC 3187
Query 3184 AAACGGATGATCCTGGTAAACATTCCAGAAAAAGTTTTATCTGTAAAAATGGTGCAAGAT 3243
|||| |||||||||| ||| | | || |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3188 AAACAGATGATCCTG--AAA-A----A-AA---GTTTTATCTGCAAAAATGGTGCAAGAT 3236
Query 3244 ATCATCATATGA-TGGAATCCGTTCAATTATTGACTGGATGTATTACAAGCAGCGCCTTC 3302
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3237 ATCATCATAT-ACTGGAATCCGTTCAATTATTGACTGGATGTATTACAAGCAGCGTCTTC 3295
Query 3303 ATTCAGCTATTCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTTCATTGTGGCA 3362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||
Sbjct 3296 ATTCAGCTATTCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGT-----G-G-CA 3348
Query 3363 AATCCTGTACCTAGGGTGCGTCATCCTCACTGGCTCGAGAAAAAGGTCTGTGACAAATTT 3422
|||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 AATCCTGTACTTAGGGTGCGTCATCCTTATTGGCTCGAGAAAAAGGTCTGTGACAAATTT 3408
Query 3423 CGTCAGGGAAAAATAGTGGATATGTTTAGCTCAGCAAATAAAGAT 3467
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3409 CGTCAGGGAAAAATAGTTGATATGTTTAGCTCAGCAAACAAAGAT 3453
Score = 4676 bits (2532), Expect = 0.0
Identities = 2794/2917 (96%), Gaps = 31/2917 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3512 GGGCCAAAGCCAGTTGCGCGTTCGTATGAAGTCGATAGAAATCACTCTTGAGGGTAAGCA 3571
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3526 GGGCCAAAGCCAGTTGCGCGTTCATTTGAAGTCGATAGAAATCACTC-TGAGGGTAAGCA 3584
Query 3572 GCAAGAGAGTTGTTGGGATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTTCAGAACGCTGACAAGAA 3631
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 3585 GCAAGAGA---GTTGGGATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTACAGAACGTTGACAAGAA 3641
Query 3632 TGTAGATTACCAAGGATGGCTTGAACTGgaaaaaagaaaatggaaaatgagtctaaagaa 3691
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 3642 TGTAGATTACCAAGGATGGCTTGAACTGGAAAAAAGAAAATGGAAAATGACTCTAACGAA 3701
Query 3692 gaagaaaaaaagaagGTTTGATGAT-CTAAAGCCTTGTAATCAG-ATTGA--T-GCTCAC 3746
||||||||||||||| | | | || ||| || || | | |||| | | ||
Sbjct 3702 TAAGAAAAAAAGAAGG--T-A--CTCCTCAAG--TT-TATTTGGTTTTGATTTGGAACAA 3753
Query 3747 AAGATAAATAAAAAAGTCTGTAAGGGAACAGCAGGTGTAGGCTCATACTTTAGGAGGCCT 3806
|| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3754 AATATAAATAAAAAAGTCTGTAAGGGAAGAGTAGGTGTAGGCTCATACTTTAGGAGGCCT 3813
Query 3807 GAAGAAGCTTTGACTAGTTCATATTTGCAGATAATACAGTTGGTCCAAAGTCCACAGAGC 3866
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3814 GAAGAAGCTTTGACTAGTTCCTATTTGCAGATAATACAGTTGGTCCAAAGTCCACAGAGC 3873
Query 3867 GGGCAATTTTTTGCTTGGGTTGTTGTGGAAGGATTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATC 3926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3874 GGGCAATTTTTTGCTTGGGTTGTTGTGGAAGGATTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATC 3933
Query 3927 CCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAGCTTCTATAGCTGAAAACTTCACGGGAAAGTGT 3986
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3934 CCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAGCTTCTATAGCTGGAAACTTCACGGGAAAGTGT 3993
Query 3987 ATCAACAAGATTCTTCCTCATGGAAAGCCTTGTTATAATTTGATGGAGGTCAATATTCAG 4046
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3994 ATCAACAAGATTCTTCCTCACGGAAAGCCTTGTTACAATTTGATGGAGGTCAATATTCAG 4053
Query 4047 GAAGATCAATTTaaaaaagaaagcaaaaaGCTTGCCGCTCTACTTGCAGACCCCGAAATT 4106
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4054 GAAGATCAATTTATAAAAGAAAGCAAAAAGCTTGCCGCTCTACTTGCAGACCCCGAAATT 4113
Query 4107 GAGGGCATATATGAAACTAAGATGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGT 4166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4114 GAGGGCATATATGAAACTAAGATGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGT 4173
Query 4167 GTATGCAAAATTGAAGACACGGCCAAACACCGTAACACCCAAGATGGATGGAAACTTGGT 4226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4174 GTATGCAAAATTGAAGACACGGCCAAACACCGTAACACCCAAGATGGATGGAAACTTGGT 4233
Query 4227 GAACTTCATAGGAAAACTACAACTGAATGTCGCTACTTGGAGAATTCAATTCCACTTGTT 4286
|||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4234 GAACTTCACAGGATAACTACAACTGAGTGTCGCTACTTGGAGAATTCTATTCCACTTGTT 4293
Query 4287 TATTTGTATCACAGCACCTCAACAGGTCGTGCTATTTATGTTTTATATTGTCATGCTTCG 4346
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4294 TATTTGTATCACAGCACCTCAACAGGTCGTGCTGTTTATGTTTTATATTGTCATGCTTCG 4353
Query 4347 AAGCTTATGTCTGTTGTGGTAGTCAATCCTTATGGTGACAAGGAATTATTATCACCTGCC 4406
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4354 AAGCTTATGTCTGTTGTGGTAGTCAATCCTTACGGTGACAAGGAATTATTATCATCTGCC 4413
Query 4407 CTAGAGAGACAGTTTAGAGATAGCTGCCAAGAATTGTCACCTGAGCCATTTTCTTGGGAT 4466
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4414 CTAGAGAGACAGTTTAGAGATAGATGCCAAGAACTGTCACCTGAGCCATTTTCTTGGGAT 4473
Query 4467 GGTATCCTTTTCCAGGTCGACTATGTTGACCATCCAGAAGCCGCCAAGAAAATTATACAA 4526
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||
Sbjct 4474 GGTATCCTTTTCCAGGTCGAGTATGTTGACCATCCAGAAGCTGCCACGAAATTTTTACAA 4533
Query 4527 AAAGCGCTCTGTGAATATAGAGAAGAAAATTGTGGACCAACTGTGGCAGTCATTGAATGC 4586
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4534 AAAGCGCTCTGTGAATACAGAGAAGAAAATTGTGGAGCAACTGTGGCAGTCATTGAATGC 4593
Query 4587 CCTGACTTTAACACCATGAAGGAAGGTATAAAGGCCCTGGATGATTTCCCATGTGTGAGG 4646
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4594 CCTGACTTTAACACCACGAAGGAAGGTGTAAAGGCCCTGGAAGATTTCCCATGTGTGAGG 4653
Query 4647 ATTCCCTTCAACGACGATGACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCCGCAGCA 4706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4654 ATTCCCTTCAACGACGATGACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCAGCA 4713
Query 4707 AAAATAGCAGTGTTCCGTTGTGCTTCAGCATTTCAGTGGTTGGATCGGAGGATTGCCCAG 4766
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4714 AAAATAGCAGTGCTCCGTTGTGCTTCAGCAATTCAGTGGTTGGACCGGAGGATTGCCCAG 4773
Query 4767 TCAAGATACGCCCATGTGCCTCTGGGGAATTTTGGACGTGATTGGTTAACATTCACACTA 4826
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 4774 TCAAGATACGCCCATGTGCCTCTGGGGAATTTTGGACGTGATTGGTTAACGTTCACAGTA 4833
Query 4827 GATATCTTCCTGTCCAGGGCACTCCGTGACCAGCAACAGGTCCTTTGGGTGTCAGATAAT 4886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 4834 GATATCTTCCTGTCCAGGGCACTCCGTGACCAGCAACAGGTTCTTTGGGTCTCAGATAAT 4893
Query 4887 GGTGTTCCAGACCTTGGAGATATAAACAATGAAGAGACATTTCTAGCTGATGAGACAAGT 4946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4894 GGTGTTCCAGACCTTGGAGATATAAACAATGAAGAGACATTTCTAGCTGATGAGACAAGT 4953
Query 4947 TTGGTATTCCCTGGAGCGTACAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGGTCCATAGATTAGCT 5006
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4954 TTGCTATTCCCTGGAGCGTACAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGGTCCATAGATTAGCT 5013
Query 5007 GTTAATGCCCTTCTGAAAAGTGACCTGGTGAGTGAAATGGAAGGAGGCGGCTTTTTGGGA 5066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5014 GTTAATGCCCTTCTGAAAAGTGACCTGGTGAGTGAAATGGAAGGAGGCGGC---TT---- 5066
Query 5067 TTTGAACAGGGTGTGAATTCTAGGGGAAGTAGTTTAAACGATAATGGCAGTTTTGATGAG 5126
||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5067 TTT-----GGGTGTGAATTCTAGAGGAAGTAGCTTAAACGATAATGGCAGTTTTGATGAG 5121
Query 5127 AATAATGGATGTGCTCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAATTGATCAAGCG-TTGCTTGCA 5185
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 5122 AATAATGGATGCGCGCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAATTGATCAAGCGCTTG-TTGCA 5180
Query 5186 TGATGCGCGTAATTCTGGCAATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACATCTGTCTTGGTG 5245
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5181 TGATGCGTGTAATTCTGGCAATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACATCTGTCTTGGTG 5240
Query 5246 GCTCTGCAGCCCTTCCTCGAAGCTTCACGATCCAGCTCTCCATCTCATGCTTCACAAGGT 5305
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5241 GCTCCGCAGCCCTTCCTCAAAGCTTCACGATCCAGCTCTCCATCTCATGCTTCACAAGGT 5300
Query 5306 CATGCAAAAGGTGTTTGCGCTGCTTTTGACTGATTTGCGGAGGTTAGGTGCTATAATAAT 5365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5301 CATGCAAAAGGTGTTTGCGCTGCTTTTGACTGATTTGCGGAGGTTAGGTGCTATAATAAT 5360
Query 5366 ATACGCAGACTTCTCAAAGATCGTTATCGACACAGGGAAATCTGATCTATCTGCTGCTAA 5425
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 5361 ATACGCAGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGGGAAATTTGATCTATCTGCTGCAAA 5420
Query 5426 GGCTTATTGTGAAAGCTTGCTCACAGTGATGGGGAGTAGAGATATCTTTGAGTTGATCTT 5485
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5421 GACTTATTGTGAAAGCTTGCTCACAGTGATGGGGAGTAGAGATATCTTTAAGTTGATCTT 5480
Query 5486 GCTTGAGCCGGTTAACTACTGGCACTCGTTACTTTTCATGGACCAGTATAACTACGCTGG 5545
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5481 GCTTGAGCCGGTTCACTACTGGCACTCGTTACTTTTCATGGACCAGCATAACTACGCTGG 5540
Query 5546 TATCCGAGCTACCGGAGATGAAATTTCTGGTGACGAAGTGACTATTGAACCAAAGTGGAG 5605
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5541 TATCCGAGCTACCGGAGATGAAATTTCAGGTAACGAAGTTACTATTGAACCAAAGTGGAG 5600
Query 5606 CGTTGCACGGCATTTACCCGAGTATATTCAGAAGGATTTTATCATAATTGTTGCCACGTT 5665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5601 CGTTGCACGGCATTTACCCGAGTATATTCAGAAGGATTTTATCATAATTGTTGCCACGTT 5660
Query 5666 TATATTTGGCCCCTGGAAATTTTCATTAGAGaaaaaaaGGGGCAGTGCAGAGAGTTTAGA 5725
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5661 TATATTTGGCCCCTGGAAATTTGCATTAGAGAAAAAAAGGGGCAGTGCAGAGAGTTTAGA 5720
Query 5726 GGCAGAGATGGTAGAATATCTCAAGGAACAGATAGGAACCCGGTTCATAACCATGATTGT 5785
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5721 GGCAGAGATGGTAGAATATCTCAAGGAACAGATAGGAACCCGGTTCATAAGCATGATTGT 5780
Query 5786 TGAGAAGATTGGTAATATCAGGTCACACATGAAGGAGATAAACGTGTCAGATGCATCTTG 5845
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5781 TGAGAAGATTGGTAATATCAGGTCACACATCAAGGATATAAACGTGTCAGATGCATCTTG 5840
Query 5846 GGTTTCTGGTCAAGCTCCGAAAGGAGATTACACGTTCGAATTTATACAAATTATTACTGC 5905
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5841 GGCTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGAGATTACACGTTCGAATTTATACAAATTATTACTGC 5900
Query 5906 TGTTCTGGTTCTTGATCAAAACGTTCAGCAAGATGTTCTGGTAATGAGAAAGAGTCTGTT 5965
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5901 TGTTCTGGCTCTTGATCAAAACGTTCAGCAAGATGTTCTGGTAATGAGAAAGATTCTGTT 5960
Query 5966 GAAGTACATTAAAGTAAAAGAATGCGCTGCTGAAGCCGGATTTATTGATCCTGGGCCATC 6025
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5961 GAAGTACATTAAAGTAAAAGAATGTGCTGCTGAAGCCGAATTTATTGATCCTGGGCCATC 6020
Query 6026 CTTCATCTTACCTAACGTGGCTTGCAGCAACTGCGGTGCCTACAGAGACCTAGATTTATG 6085
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6021 CTTCATCTTACCCAACGTGGCTTGCAGCAACTGCGGTGCCTACAGAGACCTAGATTTCTG 6080
Query 6086 CAGAGACCCAGCTCTCTTAACAGAGAAAGAATGGTCATGTGCGGATCCGCAATGTGGGAA 6145
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6081 CAGAGACTCAGCTCTCTTAACAGAAAAAGAATGGTCATGTGCGGATCCGCAATGTGTGAA 6140
Query 6146 GATATATGACAAAGAGCAGATAGAGAATAGCCTTGTCCAGATGGTGAGACAGAGGGAGAG 6205
|||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6141 GATATATGACAAAGAGCAGATAGAGAGTAGCATTATCCAGATGGTGAGACAGAGGGAAAG 6200
Query 6206 AATGTACCAGTTGCAGGATCTAGTGTGCGATAGGTGCAATCAGGTGAAAGCCGCTCATTT 6265
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6201 AATGTACCAGTTGCAGGATCTAGTGTGCAATAGGTGCAATCAGGTGAAAGCCGCTCATTT 6260
Query 6266 GACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCA 6325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6261 GACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCA 6320
Query 6326 CAAGAGGATGGAGATTTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCTGAAGTTTAGACTGCTAGAAGA 6385
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6321 CAAGAGGATTGAGATTTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTAGACTGCTAGAAGA 6380
Query 6386 ATGCATCTCCTGGATTTTATTTGCCACCAGCTGTTGA 6422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6381 ATGCATCTCCTGGATTTTATTTGCCACCAGCTGTTGA 6417
> AT1G08260.1 | Symbols: EMB142, EMB2284, POL2A, TIL1, EMB529,
ABO4, ESD7 | DNA polymerase epsilon catalytic subunit | chr1:2590944-2606892
FORWARD LENGTH=6486
Length=6486
Score = 4680 bits (2534), Expect = 0.0
Identities = 3163/3462 (91%), Gaps = 62/3462 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 41 AGATGAACTCGAAACTAAACTTGGATTTGGGCTCTTCTCCCAAGGGGAAACGCGCCTCGG 100
||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| || || ||
Sbjct 78 AGATGAACTCGAATCTAAACTCGGATTTGGGCTTTTCTCTGAAGGTGAAACCCGACTTGG 137
Query 101 GTGGCTACTCACATT-TGCATCATCATCTTGGGAAGATGC-CGATACTGGGAAAACCTTT 158
|||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |
Sbjct 138 GTGGTTACTCACATTCT-CATCGTCATCTTGGGAAGAT-CGCGATACTGGGAAAGTCTAT 195
Query 159 AGTTGTGTGGACCTTTTCTTTGTCACTCAGGACGGCTCTTCTTTTAAGACTAAGTACAAG 218
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||
Sbjct 196 AGTTGTGTGGACCTTTACTTTGTTACTCAGGACGGCTTTTCTTTCAAGACAAAGTACAAG 255
Query 219 TTCCGCCCTTACTTGTATGCCGCCACCAAAGACAATATGGAACTGGAAGTTGAAGCCTAC 278
||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||
Sbjct 256 TTCCGTCCTTACTTTTATGCAGCCACGAAAGACAAAATGGAATTGGAACTCGAAGCCTAC 315
Query 279 TTGAGACGCCGATATCAAACACAAGTTGCTGATATTCAGATTGTTCACAAAGAAGATCTT 338
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||
Sbjct 316 TTGAGACGCCGATATGAAAGACAAGTTGCTGATATTGAGATTGTTGAAAAAGAAGATCTT 375
Query 339 GATCTTAAAAATCATCTATCTGGCCTGCaaaaaaaaTATCTCAAAGTATCATTTGACACT 398
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||
Sbjct 376 GATCTTAAAAATCATCTATCTGGCCTGCAAAAAAAATACCTAAAAATATCATTTGATACT 435
Query 399 GTGCAACAATTGGTGGAAGTCAAGAGGGATCTGTTGCATATTGTCGAACGAAACCTCGCA 458
|||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 436 GTGCAACAATTGATGGAAGTCAAGCGGGATTTGTTACATATTGTCGAACGAAACCAGGCA 495
Query 459 AAATTTGATGCATTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAACGAGAACAACGTCCT 518
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 AAATTTGATGCACTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAACGAGAACAACGTCCT 555
Query 519 CAAGACTGCTTAGACTCTGTGGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATGTCCGA 578
||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 556 CAAGATTGCTTAGACTCTATCGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTACCTTATCATGTTCGA 615
Query 579 TTTGCAATTGATAATGATGTGCGTAGTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACT 638
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616 TTTGCAATTGATAATGATGTGCGGAGTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCAGCACC 675
Query 639 GATGTCATACTAGAGAAGAGGACGGATCTTCTCCAACGCGCAGAAGTTCGCGTTTGTGCA 698
||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 676 GATGTCATATTGGAGAAGAGGACAGATCTTCTTCAACGCGCAGAAGTCCGTGTTTGTGCC 735
Query 699 TTCGATATAGAGACAGTAAAGCTTCCATTGAAGTTCCCGGATGCTGAATCTGATCAAATT 758
||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||
Sbjct 736 TTCGATATAGAGACAACAAAGCTTCCGTTGAAGTTTCCTGATGCTGAATATGATCAAATT 795
Query 759 ATGATGATATCCTACATGGTTGATGGGCAAGGTTTTCTAATTACTAACAGAGAGTGTGTT 818
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 796 ATGATGATATCCTACATGGTCGATGGGCAAGGTTTTCTAATTATTAACAGAGAGTGTGTT 855
Query 819 GGCAAAGACATAGAAGATCTGGAATATACACCCAAACCAGAGTTTGAAGGGTATTTCAAA 878
||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 856 GGCGAAGATGTAGAAGATCTGGAATATACACCAAAACCAGAATTTGAAGGGTATTTCAAA 915
Query 879 GTCACGAATGTTAACAACGAGGTTGAACTCCTCCGAAA-ATGGTTTT-CTCATATGCAAG 936
|| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||
Sbjct 916 GTTACTAATGTTAAAAATGAGGTTGAACTCCTCC-AAAGATGGTTTTAC-CATATGCAAG 973
Query 937 AGTTGAAACCTGGTATTTATGTTACATACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAG 996
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 AGTTGAAACCCGGTATTTATGTTACATACAACGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAG 1033
Query 997 AACGGAGAGCATCGCATCATGGGATCAAAATGAACGAGGAGTTAGGATTCCGTTGTGATC 1056
||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1034 AACGGAGAGCATCTCATCATGGGATAAAAATGAATGAGGAATTGGGATTCCGTTGTGATC 1093
Query 1057 ATAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAGTTTG-TGTGCCATTTGGATTGTTTTTCTTGGGTG 1115
| ||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1094 AGAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAATTCGCT-TGTCATTTGGATTGTTTTGCTTGGGTT 1152
Query 1116 AAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCATGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGCAAAA 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 AAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCATGGTCTGAAGGCTGTTACAAAGGCAAAA 1212
Query 1176 CTGGGTTACGATCCACTGGAAGTGAATCCTGAGGACATGGTTCGGTTTGCAATGGAAAAG 1235
|| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1213 CTAGGTTATGATCCACTGGAAGTGAACCCAGAGGACATGGTTCGGTTTGCGATGGAAAAG 1272
Query 1236 CCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTTGCAACTTACTACCTATACATG 1295
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1273 CCCCAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTTGCAACTTATTACCTATACATG 1332
Query 1296 ACATATGTCCATCCGTTCGTTTTTTCTCTCGCAACTATCATTCCAATGGTCCCTGATGAG 1355
||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACATATGTCAATCCATTCATTTTTTCTCTCGCAACTATCATCCCAATGGTCCCTGATGAG 1392
Query 1356 GTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTTTTGATGGTTGAGGCTTACAAG 1415
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 GTTTTACGTAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTTCTGATGGTTGAGGCTTACAAG 1452
Query 1416 GCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAGTTCTACCAAGGTAAA 1475
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||
Sbjct 1453 GCAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAATTCTACCAAAATCAA 1512
Query 1476 CTTCTTGAAAGTGAGACATATATTGGTGGCCATGTAGAGTGCCTCCAAAGTGGTGTTTTC 1535
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1513 CTTCTTGAAAGTGAGACATATATTGGTGGTCATGTAGAGTGCCTTGAAAGTGGTGTTTTC 1572
Query 1536 AGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAGCTCGAGGCATCCGCATACCAGCAACTGATCGAT 1595
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1573 AGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAACTCGATTCATCGGCATACCAGCAACTGATCGAT 1632
Query 1596 AACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTATCACTGTTGAAGGAAAAATGAGAATGGATTCA 1655
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 AACCTTGGTCGTGATCTGGAATATGCTATCACTGTAGAAGGAAAAATGAGAATGGATTCA 1692
Query 1656 ATTTCCAATTATGATGAAGTAAAGGACGTAATCAGAGGAAAGAGTTTTTACGGCGAGAAG 1715
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | || || | |||||
Sbjct 1693 ATTTCCAATTATGATGAAGTGAAGGACGAAATCA-AGGAGA-AGCTT----G---AGAAG 1743
Query 1716 TTACGGGATGATCCAATACGTGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTTGCGGCG 1775
||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1744 TTACGAGATGACCCTATACGGGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCAGCC 1803
Query 1776 ATGTATCCAAATATCATCTTAACAAACAGGCTTCAGCCACCATCAATAGTTACGGATGAG 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 ATGTATCCAAATATCATCTTAACAAACAGGCTTCAGCCACCATCAATAGTTACGGATGAG 1863
Query 1836 GTTTGCACAGCATGTGATTTCAACGGCCTGGAAAAGACCTGTCTTAGAAAACTTGAATGG 1895
||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1864 ATTTGCACAGCATGTGATTTCAACCGCCCGGGAAAGACCTGTCTTAGAAAACTTGAATGG 1923
Query 1896 GTTTGGCGTGGGGTGACATTCAAGGGAAATAAAAGTGAATATTACCATCTGAAGAAGCAG 1955
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1924 GTTTGGCGTGGTGTGACATTCATGGGAAAGAAAAGTGATTATTACCATTTGAAGAAGCAG 1983
Query 1956 ATTGAGTCTGAATCTGTTGATGCTGGTGCAAATATGCA-GTCTTCAAAACCTTTTCTTGA 2014
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||||
Sbjct 1984 ATTGAGTCTGAATTTGTTGATGCTGGTGCAAATATA-ATGTCTTCAAAATCGTTCCTTGA 2042
Query 2015 TCTGCCAAAGGTGGAACAACAATCCAAATTAAAAGAACGATTGAAAAAATACTGTCAAAA 2074
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||
Sbjct 2043 TCTGCCAAAGGTGGATCAACAATCTAAGCTAAAAGAACGACTAAAAAAATATTGTCAAAA 2102
Query 2075 GGCATATAGCCGAGTACTTGACAAGCCAATCACTGAAGTTCGCGAGGCTGGGATATGCAT 2134
||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2103 GGCTTATAAACGAGTACTTGACAAGCCAATTACTGAAGTTCGTGAAGCTGGGATATGCAT 2162
Query 2135 GAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTGTGCGCAGCTTTCGAGATAGGAGGTATGAATA 2194
|||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 GAGAGAAAACCCTTTCTATGTGGATACTGTTCGGAGCTTTCGAGATAGGAGGTATGAATA 2222
Query 2195 CAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAGTTGTCCGAGGCCAAGGCAAGTGGCAATTC 2254
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2223 CAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAATTGTCAGAGGCCAAGGCAAGTGGTAATTC 2282
Query 2255 AATCAAGATCCAGGAAGCACATGACATGGTAGTGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCA 2314
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 AATCAAGATCCAGGAAGCACAGGACATGGTAGTGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCA 2342
Query 2315 TAAGTGTATACTTAATTCCTTCTATGGATATGTCATGCGAAAGGGCGCAAGATGGTACTC 2374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2343 TAAGTGTATACTTAATTCCTTCTATGGATATGTCATGCGAAAGGGTGCAAGATGGTATTC 2402
Query 2375 CATGGAAATGGCTGGTGTAGTTACTTATACTGGAGCCAAAATCATCCAGAATGCACGTTT 2434
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2403 CATGGAAATGGCTGGTGTAGTTACCTATACTGGAGCCAAAATCATACAGAATGCCCGTTT 2462
Query 2435 GCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGCTGGATACAGATGGTATATGGTGT-GCTC 2493
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2463 GCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGTTGGATACAGATGGTATATGGTGTTG-TC 2521
Query 2494 TCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACGATAGACATGAAGAAATTCACCA 2553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2522 TCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACAATAGACATGAAGAAACTCACCA 2581
Query 2554 TCTCGTATCCGTGTGTAATACTTAATGTTGATGTGGCGAAGAATAATTCAAATGACCAAT 2613
|||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2582 TCTCGTATCCTTGTGTTATGCTTAATGTTGATGTGGCAAAGAATAATACAAATGATCAAT 2641
Query 2614 ATCAGACTCTTGTAGATCCTGTACGAAAGACATATAATTCACGTAGCGAATGCTCAATTG 2673
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||
Sbjct 2642 ATCAGACTCTTGTAGATCCTGTACGCAAGACATATAAATCACATAGTGAATGCTCAATTG 2701
Query 2674 AATTTGAAGTGGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCTGCATC-AAAGGAAGAGGGA 2732
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||
Sbjct 2702 AATTTGAAGTAGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCTGCATCGAAAG-AAGAAGGA 2760
Query 2733 ATCTTAATTAAGAAGCGGTATGCAATTTTCAATCATGACGGAACCATAGCAGAACTCAAG 2792
|||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 2761 ATCTTAATCAAGAAGCGTTATGCTGTTTTCAATCATGATGGAACCTTAGCAGAACTCAAG 2820
Query 2793 GGGTTTGAGATGAAGCGTAGAGGAGAGCTGAAACTCATTAAAGTTTTCCAAGCCGAGCTA 2852
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2821 GGGTTTGAGATCAAGCGTAGAGGGGAGCTGAAACTCATTAAAGTTTTCCAGGCCGAGCTT 2880
Query 2853 TTTGACAAATTTCTGCATGGATCAACTCTTGAAGAGTGTTATTCTGCTGTTGCAGCTGTT 2912
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2881 TTTGACAAATTTCTCCATGGATCAACTCTTGAAGAGTGTTATTCTGCTGTTGCAGCGGTT 2940
Query 2913 GCAAATCGTTGGCTTGACCTACTCGAGGATCAAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAATTG 2972
|| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2941 GCTGATCGATGGCTTGACCTACTCGATAATCAAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAACTG 3000
Query 2973 CTAGATTATATATCAGAATCAAGCACTATGAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTCAACAA 3032
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3001 CTAGATTATATATCAGAATCAAGCACAATGAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTGAGCAA 3060
Query 3033 AAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACGCCTGGCTGATTTTCTTGGTGATACAATGGTC 3092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 3061 AAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACGCCTGGCTGAATTTCTTGGTGTTACAATGGTC 3120
Query 3093 AAAGATAAAGGACTGCGCTGCCAATACATCGTTGCTTGTGAACCAGAGGGGACACCTGTA 3152
|||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||
Sbjct 3121 AAAGATAAAGGACTACGTTGCCAGTACATTGTTGCTTGTGAACCAAAGGGTACACCGGTA 3180
Query 3153 AGTGAACGTGCTGTCCCTGTTGCCATATTT-CAAACGGATGATCCTGGTAAACATTCCAG 3211
|| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||| || || || |
Sbjct 3181 AGCGAACGTGCTGTTCCTGTTGCCATATTTACAA-CA-A--ATCC-GG-AAG--TTAT-G 3231
Query 3212 AAAAAGTTTTATCTGTAAAAATGGTGCAAGATATCATCATATGAT-GGAATCCGT-TCAA 3269
|| |||| || || |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||| | |
Sbjct 3232 AA---GTTTCATTTGCGAAAATGGTGCAAGACATCATCAGATG-TCGGAATTCGTCTGA- 3286
Query 3270 TTATTGACTGGAT-GTATTACAAGCAGCGCCTTCA-TTCAGCTATTCAAAAAGTTATTAC 3327
||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3287 TTATTGACTGG-TCGTATTACAAGCAGCGCCTT-AGTTCAGCTATCCAAAAAGTTATTAC 3344
Query 3328 CATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTTCATTGTGGCAAATCCTGTACCTAGGGTGCGTCATC 3387
|||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||| |||||
Sbjct 3345 CATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGT-----G-G-CAAATCCCGTGCCTAGGGTGCTTCATC 3397
Query 3388 CTCACTGGCTCGAGAAAAAGGTCTGTGA------C-A-AA-TTTCGTCAGGGAAAAATAG 3438
|| |||||||| | ||||||||| |||| | | || ||||| ||| ||||| |||
Sbjct 3398 CTGACTGGCTCCATAAAAAGGTCCGTGAGAAAGACGACAAATTTCGCCAGAGAAAACTAG 3457
Query 3439 TGGATATGTTTAGCTCAGCAAATAAAGATGGTGTCTTGGACA 3480
| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 3458 TTGATATGTTCAGCTCAGCAAATAAAGATGTTGTGTTGGACA 3499
Score = 3554 bits (1924), Expect = 0.0
Identities = 2600/2922 (89%), Gaps = 64/2922 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3512 GGGCCAAAGCCAGTTGCGCGTTCGTATGAAGTCGATAGAAATCACTCTTGAGGGTAAGCA 3571
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| || || ||| || ||||
Sbjct 3574 GGGCCAAAGCCAATTGCGCGTTCCTATGAAGTCAATAAAAAACAGTC-TGAATGTGAGCA 3632
Query 3572 GCAAGAGAGTTGTTGGGATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTTCAGAACGCTGACAAGAA 3631
|||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3633 GCAAGAGA---GCTGGGATACAGAGTTCCATGATATCTCATTTCAGAACATTGACAAGAG 3689
Query 3632 TGTAGATTACCAAGGATGGCTTGAACTGgaaaaa-agaaaatggaaaatgagtctaaaga 3690
||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||| |||
Sbjct 3690 CGTAAACTACCAAGGATGGCTTGAACT-GAAAAAGAGAAAATGGAAAGTAACTCTAGAGA 3748
Query 3691 agaagaaaaaaagaagGTTTGATGATCTAAAG-CCTTGTAATCAGATTGATGCTCACAAG 3749
||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||| || ||| ||||| ||||| ||
Sbjct 3749 AGAAGAAAAAACGAAGGTTGGGTGATCT-AAGATCTTCAAACCAGGTTGATACTCACGAG 3807
Query 3750 ATAAATAAAAAAGTCTGTAAGGGAACAGCAGGTGTAGGCTCATACTTTAGGAGGCCTGAA 3809
|||||| |||||||| || |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 3808 ATAAATCAAAAAGTCGGTCAGGGAAGAGGAGGTGTGGGTTCATACTTTAGGAGGCCTGAA 3867
Query 3810 GAAGCTTTGACTAGTTCATATTTGCAGATAATACAGTTGGTCCAAAGTCCACAGAGCGGG 3869
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 3868 GAAGCTTTGACTAGTTCACATTGGCAGATAATACAGCTGGTCCCAAGTCCACAGAGCGGA 3927
Query 3870 CAATTTTTTGCTTGGGTTGTTGTGGAAGGATTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATCCCA 3929
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3928 CAATTTTTTGCTTGGGTGGTTGTGGAAGGGTTGATGCTTAAGATCCCATTGTCGATCCCA 3987
Query 3930 AGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAGCTT-CTATAGCTGAAAACTT-CACGGGAAAGTGTA 3987
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| | || || |||||||||
Sbjct 3988 AGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAG-TTCCTATAGATGAATATTTCCA-AGGAAAGTGTG 4045
Query 3988 TCAACAAGATTCTTCCTCATGGAAAGCCTTGTTATAATTTGA-TGGAGGTCAATATTCAG 4046
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||
Sbjct 4046 TCAACAAGATTCTTCCTCATGGAAGGCCTTGTTATAGTTTGACT-GAGGTCAAGATTCAA 4104
Query 4047 GAAGATCAATTTaaaaaagaaagcaaaaaGCTTGCCGCTCTACTTGCAGACCCCGAAATT 4106
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | | ||
Sbjct 4105 GAAGATCAATTTAAAAAAGAAAGTAAAAAGCGTGCAGCTCTTCTTGCAGACCCTGGAGTT 4164
Query 4107 GAGGGCATATATGAAACTAAGATGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGT 4166
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4165 GAGGGCATATATGAAACTAAGGTGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGT 4224
Query 4167 GTATGCAAAATTGA-AGACACGGCCAAACACCGTAACACCCAAGATGGATGGAAACTTGG 4225
|||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 4225 GTATGCAAAATTGATA-ACAAAGCCAAGCACCGTAACACCCAAGATGGATGGGAAGTTGG 4283
Query 4226 TGAACTTCATAGGAAAACTACAACTGAATGTCGCTACTTGGAGAATTCAATTCCACTTGT 4285
||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 4284 TGAACTTCACATGAAAACTACAACTGAGTGTCACTACTTGAAGCGTTCAATTCCACTTGT 4343
Query 4286 TTATTTGTATCACAGCACCTCAACAGGTCGTGCTATTTATGTTTTATATTGTCATGCT-T 4344
||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4344 TTACTTGTATAACAGCACCTCAACAGGGCGTGCTATATATGTTTTATATTGTCATG-TAT 4402
Query 4345 CGAAGCTTATGTCTGTTGTGGTAGTCAATCCTTATGGTGACAAGGAATTATTATCACCTG 4404
||||||||||||||| || ||||| |||||| | | ||| ||||||||| || |||
Sbjct 4403 CGAAGCTTATGTCTGCCGTTGTAGTTGATCCTTTTAACGGCAATGAATTATTACCATCTG 4462
Query 4405 CCCTAGAGAGACAGTTTAGAGATAGCTGCCAAGAATTGTCACCTGAGCCATTTTCTTGGG 4464
|| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||| |||||||
Sbjct 4463 CCTTAGAGAGACAGTTTAGAGATAGTTGCCTAGAATTATCACTTGATTCATTGTCTTGGG 4522
Query 4465 ATGGTATCCTTTTCCAGGTCG-ACTATGTTGACCATCCAGAAGCCGCCAAGAAAATTATA 4523
||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||
Sbjct 4523 ATGGTATCCGTTTCCAGGT-GCACTACGTTGACCATCCCGAAGCTGCCAAGAAGATAATA 4581
Query 4524 CAAAAAGCGCTCTGTGAATATAGAGAAGAAAATTGTGGACCAACTGTGGCAGTCATTGAA 4583
|||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 4582 CAAAGAGCAATAAGTGAATACAGAGAAGAAAATTGTGGACCAACTGTTGCTGTCATTGAA 4641
Query 4584 TGCCCTGACTTTAACACCATGAAGGAAGGTATAAAGGCCCTGGATGATTTCCCATGTGTG 4643
||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4642 TGCCCTGACTTTACCTTCATGAAGGAAGGTATTAAGGCCCTAGATGATTTCCCATGTGTG 4701
Query 4644 AGGATTCCCTTCAACGACGATGACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCCGCA 4703
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4702 AGGATTCCCTTCAACGACGATGACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCT 4761
Query 4704 GCAAAAATAGCAGTGTTCCGTTGTGCTTCAGCATTTCAGTGGTTGGATCGGAGGATTGCC 4763
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4762 GCAAAAATAGCAATGTTCCGTTGTGCTGCAGCATTTCAGTGGTTGGATCGGAGGATTACC 4821
Query 4764 CAGTCAAGATACGCCCATGTGCCTCTGGGGAATTTTGGACGTGATTGGTTAACATTCACA 4823
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 4822 CAATCAAGATACGCCCATGTGCCTCTGGGGAATTTTGGACTTGATTGGCTAACATTCACA 4881
Query 4824 CTAGATATCTTCCTGTCCAGGGCACTCCGTGACCAGCAACAGGTCCTTTGGGTGTCAGAT 4883
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4882 ATAGATATCTTCCTATCCAGGGCACTCCGTGACCAGCAACAGGTCCTTTGGGTGTCAGAT 4941
Query 4884 AATGGTGTTCCAGACCTTGGAGATATAAACAATGAAGAGACATTTC-TAG-C--TGA--T 4937
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | | | ||| |
Sbjct 4942 AATGGTGTTCCAGACCTTGGAGGTATAAACAATGAAGAGGCA-TTCTTTGCCGATGAGGT 5000
Query 4938 G----AGACAAGTTTGGTATTCCCTGGAGCGTACAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGGT 4993
| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5001 GCAACAGACAAGTTTAGTATTCCCTGGAGCGTATAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGAT 5060
Query 4994 CCATAGA-TTAGCTGTTAATGCCCTTCTGAAAAGTGACCTGGTGAGTGAAATGGAAGGAG 5052
||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5061 CCATA-ACTTGGCTGTTAATGCCCTTCTGAAAAGCAACCTGGTGAATGAAATGGAAGGAG 5119
Query 5053 GCGGCTTTT-TGGGATTTGAACAGGGTGTGAATTCTAGGGGAAGTAGTTTAAACGATAAT 5111
|||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || || |||||||||
Sbjct 5120 GCGG-TTTTATGGGATTTGAACAGGATGTGAATCCTAGAGGAATTAATTCAAACGATAAC 5178
Query 5112 GGCAGTTTTGATGAGAATAATGGATGTGCTCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAATTGA-T 5170
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 5179 ACCAGTTTTGATGAGACCACTGGATGTGCTCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAGTTGATT 5238
Query 5171 CAAGCGTTGCTTGCA-TGATGCGCGTAATTCTGGCAATATATATGCTGATTCCATTTTGC 5229
| | |||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5239 C-ATAGTTGCTTG-ACTGATGTGCGTAAATCTAAAAATATATATGCTGATTCCATTTTGC 5296
Query 5230 AACATCTGTCTTGGTGGCTCTGCAGCCCTTCCTCGAAGCTTCACGATCCAGCTCTCCATC 5289
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 5297 AACGTTTGTCTTGGTGGCTCTGCAGCCCTTCCTCGAAGCTCCATGATCCAGCTCTTCATC 5356
Query 5290 TCATGCTTCACAAGGTCATGCAAAAGGTGTTTGCGCTGCTTTTGACTGATTTGCGGAGGT 5349
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 5357 TCATGCTTCACAAGGTCATGCAAAAGGTGTTTGCACTGCTATTGACTGATTTGCGGAGAT 5416
Query 5350 TAGGTGCTATAATAATATACGCAGACTTCTCAAAGATCGTTATCGACACAGGGAAATCTG 5409
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||
Sbjct 5417 TAGGTGCTATAATAATATATGCAGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGTGAAATTTG 5476
Query 5410 ATCTATCTGCTGCTAAGGCTTATTGTGAAAGCTTGCTCA-CAGTGATGGGGAGTAGAGAT 5468
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || | || ||| ||| |||
Sbjct 5477 ATCTATCTGCAGCTAAGGCTTATTGTGAAAGCTTGCT-ATCAACGGTGCGGAATAGTGAT 5535
Query 5469 ATCTTTGAGTTGATCTTGCTTGAGCCGGTTAACTACTGGCACTCGTTACTTTTCATGGAC 5528
|||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5536 ATCTTTGAGTGGATATTGCTCGAGCCGGTTCACTACTGGCACTCATTACTTTTCATGGAC 5595
Query 5529 CAGTATAACTACGCTGGTATCCGAGCTACCGGA-GATGAAATTTCTGGTGACGAAGTGAC 5587
||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5596 CAGTATAACTACGCTGGTATCCGAG---CC-GATGATGAAATTTCACTTGACGAAGTGAC 5651
Query 5588 TATTGAACCAAAGTGGAGCGTTGCACGGCATTTACCCGAGTATATTCAGAAGGATTTTAT 5647
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||
Sbjct 5652 TATTGAACCAAAGTGGAGTGTTGCACGACATTTACCTGAGTATATTGAGAGGGATTTCAT 5711
Query 5648 CATAATTGTTGCCACGTTTATATTTGGCCCCTGGAAATTTTC-ATTAGAGaaa-aaaaGG 5705
||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||| |||| |
Sbjct 5712 TATAATCATTGCCAAGTTTATATTTGACCCCTGGAAATTTGCGA-TAGA-AAATAAAAAG 5769
Query 5706 GGCAGTGCAGAGAGTTTAGAGGCAGAGATGGTAGAATATCTCAAG-GAACAGATAGGA-- 5762
|||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||
Sbjct 5770 GGCAGTTCAGAGAGTTTAGAGGCACAGATGATAGAATATCT-AAGAGAACAGATTGGATC 5828
Query 5763 ACCCGGTTCATAACCATGATTGTTGAGAAGATTGGTAATATCAGGTCACACATGAAGGAG 5822
| || ||||||| ||| |||| | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5829 AACC--TTCATAAATATGCTTGTCAAAAAGGTTGATGATATCATGTCACACATGAAGGAG 5886
Query 5823 ATAAACGTGTCAGATGCATCTTGGGTTTCTGGTCAAGCTCCGAAAGGAGATTACACGTTC 5882
||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 5887 ATAAATGTTTCAGATGCATCTCGGGTTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGAGATTACTCGTTG 5946
Query 5883 GAATTTATACAAATTAT-TACTGCTGTTCTGGTTCTTGATCAAAACGTTCAGCAAGATGT 5941
||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 5947 GAATTTATACAGGTTATCT-CTGCTGTTCTGGCTCTTGACCAAAACGTCCAGCAAGATGT 6005
Query 5942 TCTGGTAATGAGAAAGAGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAATGCGCTGCTGAAGC 6001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 6006 TCTGGTAATGAGAAAGAGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAGTGTGCTGCTGAAGC 6065
Query 6002 CGGATTTATTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCTAACGTGGCTTGCAGCAACTGCGG 6061
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
Sbjct 6066 CGAATTTCTTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCTAATGTAGCTTGCAGCAACTGTGA 6125
Query 6062 TGCCTACAGAGACCTAGATTTATGCAGAGACCCAGCTCTCTTAACAGAGAAAGAATGGTC 6121
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 6126 TGCCTACAGAGACCTAGATATATGCAGAGACCCAGCACTGTTAACAGAGAAAGAATGGTC 6185
Query 6122 ATGTGCGGATCCGCAATGTGGGAAGATATATGACAAAGAGCAGATAGAGAATAGCCTTGT 6181
|||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |
Sbjct 6186 ATGTGCGGATACACAATGTGGGAAGATATATGACAGAGAGCAGATGGAGAGTAGCCTTCT 6245
Query 6182 CCAGATGGTGAGACAGAGGGAGAGAATGTACCAGT-TGCAGGATCTAGTGTGCGAT-AGG 6239
|||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||
Sbjct 6246 AGAGATGGTGAGACAGAGAGAAAGAATGTACCA-TATGCAGGATGTAGTGTGC-ATTAGG 6303
Query 6240 TGCAATCAGGTGAAAGCCGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGA 6299
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6304 TGCAATCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGA 6363
Query 6300 TGCAAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCA-CAAGAGGATGGAGATTTTCTTGGATATAGCAAA 6358
|||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 6364 TGCAAGGAGAGTGGGTCAGAGTTC-AGCAAGAGGATGGAGATATTCATGGATATAGCAAA 6422
Query 6359 GCGCCTGAAGTTTAGACTGCTAGAAGAATGCATCTCCTGGAT 6400
||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||
Sbjct 6423 GCGCCAGAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATCTCTTGGAT 6464
> AT1G08270.2 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: MIT (InterPro:IPR007330);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is:
AAA-type ATPase family protein (TAIR:AT2G27600.1); Has 35333
Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798;
Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
| chr1:2606269-2607507 REVERSE LENGTH=1034
Length=1034
Score = 257 bits (139), Expect = 8e-67
Identities = 171/186 (92%), Gaps = 4/186 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 6217 TGCAGGATCTAGTGTGCGA-TAGGTGCAATCAGGTGAAAGCCGCTCATTTGACAGAGCAG 6275
|||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 730 TGCAGGATGTAGTGTGC-ATTAGGTGCAATCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAGCAG 672
Query 6276 TGTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCA-CAAGAGGAT 6334
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||
Sbjct 671 TGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGGTCAGAGTTC-AGCAAGAGGAT 613
Query 6335 GGAGATTTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCTGAAGTTTAGACTGCTAGAAGAATGCATCTC 6394
|||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 612 GGAGATATTCATGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATCTC 553
Query 6395 CTGGAT 6400
|||||
Sbjct 552 TTGGAT 547
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 321605382515
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5