BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg934119
Length=4324
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G35110.1 | Symbols: GRL, NAP1, NAPP | transcription activato... 7160 0.0
> AT2G35110.1 | Symbols: GRL, NAP1, NAPP | transcription activators
| chr2:14795715-14803850 REVERSE LENGTH=4643
Length=4643
Score = 7160 bits (3877), Expect = 0.0
Identities = 4166/4305 (97%), Gaps = 21/4305 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 18 GAATTAATGGCGAAATCCCGTCAATATTATCCATCTCAAGATGAATCAATGTCCCCGACT 77
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GAATTAATGGCGAATTCTCGTCAATATTATCCATCTCAAGATGAATCAATGTCCCCGACT 164
Query 78 TCTGTGAGATCGAGGGAATGGGAAGGTCCTTCCAGATGGACTGAGTACTTGGGACCTGAA 137
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 TCTGTGAGATCAAGGGAATGGGAAGGTCCTTCCAGATGGACTGAGTACTTGGGACCTGAA 224
Query 138 ATGGCTGCATCA--GT-TTCTTCTAGGAGCTCAAAGCAAATTGATGGAAATCTTCAGAGT 194
|||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| | || |
Sbjct 225 ATGGCTGCATCAGTGTCTTCTACTAGGAGCTCTAAGCAAATTGATGG--A----CA-TG- 276
Query 195 TCTGGTGGTTCCACAAAGGCTTTGAACATACAATGGGTAGTTCAAATGATTGAGGTTGCA 254
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 T-TGGTGGTTCCACAAAGGCTTTGAACATACAATGGGTAGTTCAAATGATTGAGGTTGCT 335
Query 255 GAAGGTCTCATGGCTAAAATGTATAGACTGAATCAAATCTTGGAGTACCCTGATCCTGTT 314
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 336 GACGGTCTCATGGCTAAAATGTATAGACTGAATCAAATCTTGGAGTATCCTGATCCTGTT 395
Query 315 GGCCATGTTTTCTCTGAAGCATTTTGGAAAGCGGGTGTCTTCCCTAACCATCCACGGATA 374
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 GGCCATGTATTCTCTGAAGCATTTTGGAAAGCGGGTGTCTTCCCTAACCATCCACGGATA 455
Query 375 TGCACTTTGCTCTCTAAAAAGTTCCCTGAGCATTTCAGCAAATTGCAACTTGAACGTATT 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 TGCACTTTGCTCTCTAAAAAGTTCCCTGAGCATTTCAGCAAATTGCAACTTGAACGTATT 515
Query 435 GACAAGTTTTCACTGGATAGCTTGCACGATGGTGCTGAACTTCACTTACAGAGCTTAGAG 494
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 GATAAGTTTTCACTGGATAGCTTGCATGATGGTGCTGAACTTCACTTACAGAGCTTAGAG 575
Query 495 CCATGGATACAGCTGCTGCTCGACTTGATGGCATTTCGAGAACAGGCACTGCGGCTTATA 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 CCATGGATACAGCTGCTGCTCGACTTGATGGCATTTCGAGAACAGGCACTGCGGCTTATA 635
Query 555 TTGGACCTAAGCAGCACTGTAATTACCTTGCTGCCTCATCAGAACTCACTTATTCTGCAT 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 TTGGACCTAAGCAGCACTGTAATTACCTTGCTGCCTCATCAGAACTCACTTATTCTGCAT 695
Query 615 GCATTCATGGATCTCTTTTGTGCATTTGTCCGAGTCAATCTTTTCGCAGAGAAGATTCCT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 696 GCATTCATGGATCTCTTTTGTGCATTTGTCCGAGTCAATCTCTTCGCAGAGAAGATTCCT 755
Query 675 AGGAAAATGTTGCTGCAAGTGTACAACCTTCTGCATGCGCTATCAAGAAATGATCGAGAC 734
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 AGGAAAATGTTGTTGCAAGTCTACAACCTTCTGCATGCGCTATCAAGAAATGATCGAGAC 815
Query 735 TGTGACTTTTATCACCGCTTGGTGCAATTCATAGACTCTTATGATCCCCCATTAAAAGGC 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 816 TGTGACTTTTATCACCGCTTGGTGCAATTCATAGACTCTTATGATCCCCCATTGAAAGGC 875
Query 795 TTGCAAGAAGATTTGAATTTTGTCAGCCCAAGGATTGGAGAGGTCCTGGAGGCTGTAGGA 854
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 TTACAAGAAGATTTGAATTTTGTCAGCCCAAGGATTGGAGAGGTCCTGGAGGCTGTAGGA 935
Query 855 CCCAGTATTTTTCTATCTGCAGATACGAGGAAGTTGAGAAATGAGGGATTTTTAAGCCCA 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 CCCAGTATTTTTCTATCTGCAGATACGAGGAAGTTGAGAAATGAGGGATTTTTAAGCCCA 995
Query 915 TATCATCCTAGATTCCCAGATATACTTACAAATTCTGCTCATCCCATGAGAGCGCAAGAT 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 TATCATCCTAGATTCCCAGATATACTTACAAATTCTGCTCATCCCATGAGAGCGCAAGAT 1055
Query 975 CTTGCGAATGTTACTTCGTACCGAGAATGGGTGCTTCTTGGATATCTCGTTTGCCCGGAC 1034
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1056 CTTGCAAATGTTACTTCGTACCGAGAGTGGGTGCTTCTTGGATATCTCGTTTGCCCCGAC 1115
Query 1035 GAGCTTCTTCGTGTTACTAGCATTGATATCGCCCTGGTTGTGCTAAAGGAAAACTTAGTC 1094
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 GAGCTTCTTCGTGTTACTAGCATTGATATCGCCCTGGTCGTGCTAAAGGAAAACTTAGTC 1175
Query 1095 GTGACGTTATTCCGGGATGAGGTGAGTTCATATCAAATTGTCAACGACAAAGAGTTTTGT 1154
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||
Sbjct 1176 GTGACGTTATTCCGGGATGAGGTGAGTTTATATCAAATGGTCTGCGAAAAAGAGTTTGGT 1235
Query 1155 ATTGGAATTTGTTTTGCATCAGCTGACTCTATTAACT-TGGCCATGCAGTACATTCTGTT 1213
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||
Sbjct 1236 ATTGGAATTAGTTTTGCATCAGCTGACTCTATTAA-TCTAACTATGCAGTACATTCTGTT 1294
Query 1214 GCACGAAGACTACCAGTTGTATGTTTTACCCCGTGTGTTAGAATCAAAGAAGATGGCAAA 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1295 GCACGAAGACTACCAGTTGTATGTTTTACCCCGAGTGTTAGAATCAAAGAAGATGGCTAA 1354
Query 1274 GTCTGGTCGGACTAAACAAAAGGAAGCTGATCTAGAATATAGTGTAGCAAAACAAGTTGA 1333
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 GTCTGGACGGACTAAACAAAAGGAAGCTGATCTAGAATATAGTGTAGCAAAACAAGTTGA 1414
Query 1334 GAAAATGATCAGTGAGGTGCATGAGCAAGCATTGCAATTATGTGATACCATACACCGAGA 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 GAAAATGATCAGTGAGGTGCATGAGCAAGCATTGCAATTATGTGATACCATACACCGAGA 1474
Query 1394 AAGGAGAATATTGCTGAAGCAGGAAATAGGGCGGATGGTTTTATTTTTCACTGATCAACC 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 AAGGAGAATATTGCTGAAGCAGGAAATAGGGCGGATGGTTTTATTTTTCACTGATCAACC 1534
Query 1454 AAGTTTGCTGGCTCCAAACATTCAGATGGTATTCTCTGCATTGGCTTTGGCCCAGTCTGA 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1535 AAGTTTGCTGGCTCCAAACATTCAGATGGTATTCTCTGCGTTGGCTTTGGCCCAATCTGA 1594
Query 1514 GGTTCTCTGGTATTTTCAACATGCTGGTATTGCATCCTCAAGATCTAAAGCTGCTCGAGT 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1595 GGTTCTCTGGTATTTTCAACATGCTGGTATTGCATCCTCAAGATCCAAAGCTGCTCGAGT 1654
Query 1574 GATACCAGTTGACATAGATCCAAATGATCCTACCATTGGCTTCCTGCTCGATGGAATGGA 1633
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 GATACCAGTAGACATAGATCCAAATGATCCTACCATTGGCTTCCTGCTCGATGGAATGGA 1714
Query 1634 CCGTCTCTGCTGTTTAGTGCGCAAGTACATCTCAGCTGCTCGAGGTTATGCACTATCATA 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 CCGTCTCTGCTGTTTAGTGCGCAAGTACATCTCAGCTGCTCGAGGTTATGCACTATCATA 1774
Query 1694 CCTTTCTTCATCTGCTGGAAGGATTCGTTACTTGATGGGTACTCCTGGAATTGTGGCTCT 1753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 CCTTTCTTCATCTGCTGGAAGGATTCGTTACTTGATGGGTACTCCTGGAATTGTGGCTCT 1834
Query 1754 GGACCTTGATCCTACCTTGAAAGGCCTATTTCAGCGTATTGTTCAACATCTCGAAAATAT 1813
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 1835 GGACCTTGATCCTACCTTGAAAGGCCTTTTTCAGCGTATTGTGCAACATCTCGAAAGTAT 1894
Query 1814 ACCCAAAGCGCAGGGAGAAAATGTTTCTGCAATCACATGTGACCTATCTGATTTCCGGAA 1873
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895 ACCCAAGGCGCAGGGAGAAAATGTTTCTGCAATCACATGTGACCTATCTGATTTCCGGAA 1954
Query 1874 AGATTGGTTGTCCATTTTAATGATTGTCACTTCTTCTCGATCATCGATAAACATCAGGCA 1933
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1955 AGATTGGTTGTCCATTTTGATGATTGTCACTTCTTCTCGATCATCGATAAACATCAGGCA 2014
Query 1934 TCTGGAAAAAGCCACTGTCTCTACTGGGAAGGAGGGCTTGCTATCGGAAGGAAATGCTGC 1993
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 TTTGGAAAAAGCCACTGTCTCTACTGGGAAGGAGGGCTTGCTATCGGAAGGAAATGCTGC 2074
Query 1994 ATATAACTGGTCCAGATGTGTTGATGAGTTAGAGTCTCAATTATCAAAGCATGGAAGTCT 2053
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2075 ATATAACTGGTCCAGATGTGTTGATGAGTTAGAGTCTCAATTGTCAAAGCATGGAAGTCT 2134
Query 2054 GAAGAAATTATATTTCTATCATCAACACCTCACAACTGTTTTCAGAAATACAATGTTTGG 2113
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 GAAGAAATTATATTTCTACCATCAACACCTCACAACTGTTTTCAGAAATACAATGTTTGG 2194
Query 2114 ACCAGAAGGACGTCCTCAACATTGTTGTGCATGGCTCAGTGTGGCTAGTAGTTTCCCGGA 2173
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 ACCAGAAGGACGTCCTCAGCATTGTTGTGCATGGCTCAGTGTGGCTAGTAGTTTCCCGGA 2254
Query 2174 ATGTGCTTCACTTATAATTCCTGAGGAGGTTACCAAATTCGGGCGAGATGCAGTGCTTTA 2233
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2255 ATGTGCTTCACTAATAATTCCTGAGGAGGTTACCAAATTTGGGCGAGATGCTGTGCTTTA 2314
Query 2234 CGTCGAGTCTCTTATTGAATCAATAATGGGGGGACTGGAGGGCCTAATAAATATTCTTGA 2293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2315 CGTCGAGTCTCTTATTGAATCAATAATGGGGGGACTGGAGGGCCTAATTAATATTCTTGA 2374
Query 2294 TTCAGAAGGCGGGTTTGGCGCTCTAGAATCTCAGCTTCTTCCAGAACAAGCTGCAGCGTA 2353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2375 TTCAGAAGGCGGGTTTGGCGCTCTAGAATCTCAGCTTCTTCCAGAACAAGCTGCAGCGTA 2434
Query 2354 TCTGAATAATGCATCAAGAATTTCTGCCTC-TTCAGTGAAATCCCCCAGGGTTGTAGGCG 2412
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 TCTGAATAATGCATCAAGAATTTCTGC-TCCTTCAGTGAAATCCCCCAGGGTTGTAGGCG 2493
Query 2413 GGTTTACTTTGCCCGGCCATGAGAGCTATCCTGAGAATAATAAGTCTATTAAGATGTTGG 2472
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2494 GGTTTACTTTGCCTGGCCATGAGAGCTATCCTGAGAATAATAAGTCTATAAAGATGTTGG 2553
Query 2473 AAGCTGCAATCCAAAGGTTGACTAATTTGTGTTCAATTCTGAACGACATGGAGCCTATCT 2532
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2554 AAGCTGCAATTCAAAGGTTGACTAATTTGTGTTCAATTCTGAACGACATGGAGCCTATTT 2613
Query 2533 GTGTTATAAACCACGTATTTGTGCTAAGAGAGTACATGAGAGAATGCATCCTTGGGAATT 2592
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2614 GTGTTATAAACCACGTATTTGTTCTAAGAGAGTACATGAGAGAATGCATCCTTGGGAACT 2673
Query 2593 TCAAGAGAAGATTTCTTACTGCACTACAAACAGATAATGATCTTCAGCGGCCTTCTGTCT 2652
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2674 TCAAGAGAAGATTTCTTACTGCTCTACAAACCGATAACGATCTCCAGCGGCCTTCTGTTT 2733
Query 2653 TGGAATCTCTTATCAGGCGGCATATGAGCATAGTTCACTTGGCAGAGCAGCACGTTAGCA 2712
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734 TGGAATCTCTTATCAGGCGGCATATGGGCATAGTTCACTTGGCAGAGCAGCACGTTAGCA 2793
Query 2713 TGGACCTAACCCAAGGCATCAGAGAAATTTTACTCACAGAAGCCTTTTCAGGGCCTGTGT 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794 TGGACCTAACCCAAGGCATCAGAGAAATTTTACTCACAGAAGCCTTTTCAGGGCCTGTGT 2853
Query 2773 CGTCTTTGCATACATTCGAAAAGCCTGGTGAACAACAGCAAAACACTGGATCTGCAGTTG 2832
| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2854 CATCTTTGCATACATTCGAAAAACCTGCTGAACAACAGCAAACCACTGGATCTGCAGTTG 2913
Query 2833 AAGTTGTGTGCAACTGGTACATGGACAATATCATCAAGGATGTGTCTGGCGCAGGAATCC 2892
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2914 AAGTTGTATGCAACTGGTACATGGACAATATCATCAAGGATGTGTCTGGCGCAGGAATCC 2973
Query 2893 TCTTCGCTCCAAGGCACAAATACTTCAAAAGCACTAGACCAGTTGGAGGGTATTTTGCAG 2952
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2974 TCTTCGCTCCGAGGCACAAATACTTCAAAAGCACTAGACCAGTTGGAGGGTATTTTGCAG 3033
Query 2953 AGTCAGTCACCGACCTCAAGGAATTACAGGGGTTTGTTCGTATCTTCGGCGGCTATGGAG 3012
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034 AGTCAGTCACCGACCTCAAGGAATTACAGGCGTTTGTTCGTATCTTCGGCGGCTATGGAG 3093
Query 3013 TAGACCGGCTGGATAGGATGATGAAAGTACATACAGCTGCCCTGGTAAACTGCATAGAAA 3072
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 TTGACCGGCTGGATAGGATGATGAAAGTACATACAGCTGCCCTGGTAAACTGCATAGAAA 3153
Query 3073 CATCTCTGAGATCAAACCGGGAATTGATTGAGGCAGCTGCTGCAAGTATGCATTCTGGTG 3132
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154 CTTCTCTGAGATCAAACCGGGAATTGATTGAAGCAGCTGCTGCAAGTATGCATTCTGGTG 3213
Query 3133 ACAGAGTAGAGAGAGACGCATCTGTTAGGCAGATAGTGGATTTGGATACCGTAATAGGAT 3192
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3214 ACAGAGTGGAGAGAGACGCATCTGTTAGGCAGATAGTTGATTTGGATACCGTAATAGGAT 3273
Query 3193 TTTGTATTGAAGCTGGTCAAGCGTTGGCTTTTGATGAGCTCCTCGCCGAAGCCTCTGGTG 3252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3274 TTTGTATTGAAGCTGGTCAAGCGTTGGCTTTTGATGACCTCCTCGCTGAAGCCTCTGGTG 3333
Query 3253 CTGTTCTTGAAGACAATGCATCCTTGATACACTCGATGATCTCTGGCATCGTTGAGCATA 3312
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3334 CTGTTCTTGAAGACAATGCATCCTTGATACACTCGATGATCTCTGGCATCGTTGAGCACA 3393
Query 3313 TACCTGAAGAAATACCTGAAAAGAAAGAAATCAGAAGGATCAAAGGCGTGGCAAATGGCG 3372
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3394 TACCTGAAGAAATACCTGAAAAGAAAGAAATCAGAAGGATCAAAGGCGTGGCAAATGGTG 3453
Query 3373 TTGGCGTAGCAGGAGATCACGACTCTGAATGGGTTAGATTAATCCTCGAAGAGGTAGGAG 3432
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3454 TTGGCGTAGCAGGTGATCACGACTCTGAATGGGTTAGATTAATCCTAGAAGAGGTAGGAG 3513
Query 3433 GTGCAAATGACAACTCATGGAGTTTGTTACCTTACTTTTTTGCCTCTTTCATGACCTCAA 3492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3514 GTGCAAATGACAACTCATGGAGTTTGTTACCTTACTTTTTTGCCTCTTTCATGACCTCAA 3573
Query 3493 ACGCCTGGAACACTACTGGCTTCAACATCGAGACTGGCGGATTCAGCAATAACATCCATT 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||
Sbjct 3574 ACGCCTGGAACACTACTGGCTTCAACATCGAGACTGGCGGATTCAGCAACAATATTCATT 3633
Query 3553 GCTTGGCTCGGTGTATTAGCGCTGTCATTGCAGGAAGTGAGTACGTTAGGTTACAGCGTG 3612
||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3634 GCTTGGCTCGGTGTATTAGTGCTGTCATCGCTGGAAGTGAGTACGTAAGGTTACAACGTG 3693
Query 3613 AATACCAGCAGCAGCATCAATCCCTCTCCAATGGTCATCACTCTAGTGAAAATCTAGACT 3672
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3694 AATACCAGCAGCAGCATCAGTCCCTCTCGAATGGTCATCACTCTAGTGAAAATCTCGACT 3753
Query 3673 CAGAGTTTCAACCCCGTGTAACTGCTGAAGCAAGCATTAAATC-TGCAATGTTACTCTTT 3731
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3754 CAGAGTTTCCACCCCGTGTAACTGCTGAAGCAAGCATTAAATCCT-CAATGTTACTCTTT 3812
Query 3732 GTAAAATTCGCTGCATCGATCGTGCTAGATTCATGGAGTGAAGCCAACAGATCTCATCTT 3791
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 3813 GTAAAATTCGCTGCATCGATCGTGCTAGATTCATGGAGCGAAGCCAACAGATCGCATCTC 3872
Query 3792 GTGGCTAAGCTTATCTTCCTGGACCAACTCTGTGAGATCTCACCATACCTCCCAAGAAGC 3851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3873 GTGGCTAAGCTTATCTTCCTGGACCAACTCTGTGAGATCTCACCATACCTCCCTAGAAGC 3932
Query 3852 TCCCTTGAATCACATGTCCCGTACACCATCCTCAGGTCAATCTACACCCAATACTACTCC 3911
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3933 TCCCTCGAATCACATGTCCCGTACACCATCCTCAGGTCAATCTACACCCAATACTACTCC 3992
Query 3912 AACACACCGTCCACACCGCTCTCAACAGCATCCCCGTACCACTCTCCATCCGTATCACTC 3971
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3993 AACACACCTTCCACACCGCTCTCAACAGCATCCCCGTACCACTCCCCATCCGTATCGCTC 4052
Query 3972 ATCCACGCTTCTCCATCCATGAAAAACTCCACCACTCCCCAGCGTGGTAGTGGTAGCGGC 4031
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4053 ATCCACGCTTCTCCCTCCATGAAAAACTCCACCACTCCCCAGCGTGGTAGTGGTAGCGGC 4112
Query 4032 AGTAGCTCCGCAGCTGCCCCAGATTCAGGGTACTTCAAAGGCTCATCATCTTCACTCTAC 4091
|||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4113 AGTAGCTCTACAGCTGCCCCTGATTCAGGCTACTTCAAAGGCTCATCATCTTCACTATAC 4172
Query 4092 AGTCAGgaacactacaacgaacccgaaactggaatctcaagaaacaatgagaacaacaac 4151
||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4173 GGTCAGGAACACTACACCGAATCCGAAACTGGAAACTCAAGAAACAATGAGAACAACAAC 4232
Query 4152 aacaa-a--caaaGGGGGAGCTCCCGTCGTTCTGGACCATTGGATTACAGCTCGAGCCAT 4208
||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4233 AACAACAAACAAAGGGGAAGTTCTCGTCGTTCCGGACCATTGGATTACAGCTCGAGCCAT 4292
Query 4209 AAAGGAGGGTCAGGATCAAACAGCACAGGTCCTAGTCCACTTCCCAGGTTTGCTGTCTCA 4268
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4293 AAAGGAGGGTCAGGATCAAACAGCACAGGTCCTAGTCCTCTTCCTAGGTTTGCTGTCTCA 4352
Query 4269 AGATCTGGTCCCATCTCATATAAGCAGCATAACTAAGTAACAACA 4313
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4353 AGATCTGGTCCCATCTCATATAAACAGCATAACTAAGTAACAACA 4397
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 215567354071
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5