BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg935637
Length=7417
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G46560.1 | Symbols: | transducin family protein / WD-40 rep... 4924 0.0
> AT2G46560.1 | Symbols: | transducin family protein / WD-40 repeat
family protein | chr2:19115371-19125856 REVERSE LENGTH=7741
Length=7741
Score = 4924 bits (2666), Expect = 0.0
Identities = 2934/3066 (96%), Gaps = 8/3066 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3332 TAGTCACAGTTCACCTGCAACAGACTTGGACTTTAGTGGCTTCTGCGAGCAGCTCAAGAA 3391
||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3333 TAGTCCCAATTCACCTGCAACAGACTTGGAATTTAGTGGCTTCTGCGAGCAGCTCAAGAA 3392
Query 3392 GTTATCAGATGGAGGAAATATTTCCAGTATAGAAAAATTGCAATATTTTGCAATTGTTGA 3451
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3393 GTTATCAGATGAAGGAAATATTTCCAGGATAGAAATATTGCAATATTTTGCAATTGTTGA 3452
Query 3452 CCTTCTTTGTGAAATTAGTAACCCACATTCTACGTCTGTCTATGCAAGTCTTGATGAAGC 3511
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3453 CCTTCTTTGTGAAATTAGTAACCCACATTCTACGTCTGTCTATGCAAGTCTTGATGAACC 3512
Query 3512 TGGGAGAAGATTTTGGGTCACACTTAGGTTTAAACAGCTATCCTTAGCTCGAAGATCTGG 3571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 3513 TGGGAGAAGATTTTGGGTCACACTTAGGTTTAAACAGCTATTCTTAGCTCGAAGTTCTGG 3572
Query 3572 GAAAACAGCATCTCTGGAAGAGCTGGATATTGACTCTAGTATGATAGGATGGGCTTTTCA 3631
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3573 TAAAACAGCATCTCTGGAAGAGCTTGATATTGACTCTAGTATGATAGGATGGGCTTTTCA 3632
Query 3632 CTCAGAGTCTCAAGAAAATTTGTCTGGTTCTCTTTTACCCAATGAATCATCATGGCAACA 3691
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3633 CTCAGAGTCTCAAGAAAATTTGTCTGGTTCTCTTTTGCCCAATGAATCATCATGGCAACA 3692
Query 3692 AATGCGATCATTGGGTTTTGGATTTTGGTATTCAAATGTAGCACAATTGCGTTCACGTAT 3751
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3693 AATGCGATCACAGGGTTTTGGATTTTGGTATTCAAATGCAGCACAATTGCGATCACGGAT 3752
Query 3752 GGAGAAACTGGCCCGACAGCAGTACCTGAAGAACAAGAATCCTAAAGATTGTGCGCTTCT 3811
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3753 GGAGAAACTGGCCCGACAGCAATACCTGAAGAACAAGAATCCTAAAGATTGTGCGCTTCT 3812
Query 3812 CTATATAGCTTTAAATAGAGTTCAAGTTTTGGCTGGTCTTTTCAAATTAAGCAAGGATGA 3871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3813 CTATATAGCTTTAAATAGAGTTCAAGTTTTGGCTGGTCTTTTCAAATTAAGCAAGGATGA 3872
Query 3872 GAAAGATAAACCCTTGGTGGTTTTTCTTTCACGCAATTTTCAGGAAGAGAAAAATAAGGC 3931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3873 GAAAGATAAACCCTTGGTGGTTTTTCTTTCACGCAATTTTCAGGAAGAGAAAAATAAGGC 3932
Query 3932 AGCAGCCTTGAAAAATGCATATGTGCTAATGGGTAAACACCAACTGGAGTTGGCTATAGG 3991
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3933 AGCAGCCTTGAAAAATGCATATGTACTAATGGGTAAACACCAACTGGAACTGGCTATAGG 3992
Query 3992 TTTCTTTCTGCTTGGAGGTGAAGCTTCATCTGCAATAAATGTTTGTGTGAAAAATCTTCA 4051
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3993 TTTCTTTCTCCTTGGAGGTGAAGCTTCATCTGCAATAAATGTTTGTGTGAAAAATCTTCA 4052
Query 4052 GGATGAGCAGCTTGCGCTCGTAATTTGCCGGCTTATTGATGGGCAGGGTGGGGCCCTGGA 4111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4053 GGATGAGCAGCTTGCGCTCGTAATTTGCCGGCTTATTGATGGGCAGGGTGGGGCCCTGGA 4112
Query 4112 AAGTAATCTTATAAAGAAATATATACTCCCATCTGCTGTTCAGAGAGGAGACTTTTGGCT 4171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4113 AAGTAATCTTATAAAGAAATATATACTCCCATCTGCTGTTCAGAGAGGAGACTTTTGGCT 4172
Query 4172 AGCAAGCCTTCTTAAGTGGGAATTAGGAGAGTACCACCAGTCAATTCTTGCTATGGCTGG 4231
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4173 AGCAAGCCTTCTTAAGTGGGAATTAGGAGAGTACCACCGGTCAATTCTTGCTATGGCTGG 4232
Query 4232 ATCTCTAGGGAACCCTGTTACTGAGAGCTCTACTGTTTCTTCAAATCACATCTCTTTTGT 4291
| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4233 GTGTCTAGAGAACCCTGCTACTGAGAGCTCTACTGTTTCTTCAAATCACGTCTCTTTTGT 4292
Query 4292 GGATCCTAGTATTGGCCTATACTGCCTCATGTTGGCAACCAAAAATAGTGTGAAGAACGC 4351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4293 GGATCCTAGTATTGGCCTATACTGCCTCATGTTGGCAACCAAAAATAGTGTGAAGAACGC 4352
Query 4352 ATTGGGGGAAAAAATTGCTTCAACTCTTAGTAGATGGGCAACCTTAATGGCTGCTACCGC 4411
||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4353 ATTGGGGGAAAGAACTGCCTCAACTCTTAGTAGATGGGCATCCTTAATGGCTGCTACCGC 4412
Query 4412 CTTCAGCAGATGTGGGCTCCCGCTCGAGGCGTTAGAATGTCTTTCAGCATCTGCCAGCGG 4471
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4413 CTTCAGCAGATGTGGGCTCCCGCTCGAGGCGTTAGAATGTCTTTCACCATCTGCCAGCGG 4472
Query 4472 TCATGGTGGTACCCATCAGACTAGCGATCCAAGTAATGGTCAGTTGCGTAGTCCTCAAGG 4531
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | | |||||
Sbjct 4473 TCATGGTGGGACCCATCAGACTAGCGTTCCAAGTAACGGTCAGTTGCATACTACACAAGG 4532
Query 4532 TGTTTTTGATCATTCTGTTCCTCATTCGTCGAATTGGGTATCAAGCGGTGTTTCATCTAC 4591
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4533 TGTTTTTGATCACTCTGTTCCTCATTCGTCGAATTGGGTATCAAGCGGTGTTTCATCTAC 4592
Query 4592 TGTGGACACTCATTTTAGACTGGGTTTAGCCGTCCAGTTTCTCTCAAGGATCTTACGGGA 4651
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||
Sbjct 4593 TGTGGACACTCATTTTAGATTGGGTTTAGCCGTCCAGTTCCTCTCGATGATCTTACGGGA 4652
Query 4652 AGCTACTGCACCCTTAATGAATTCTGAAATTGTTTCGTGTGAGAAAATT-TCACGATTTC 4710
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4653 AGCAACTGCACCCTTAATGAATTCTGAAGTTGTTTCATGTGAGAAA-TTCTCACGATTTC 4711
Query 4711 AACATAAGCTACAAACAGCGTTGGAGCAATTTTACCAGAGATTTTCGCTGTCTTCGTCTT 4770
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 4712 AACATAAGCTACAAACAGCTTTGGAGCAATTTCACCAGAGATTTTCGCTGTCTGCATCTT 4771
Query 4771 ACCTACGTAATATGATGATTCTGTCAGCATACAACCGAGGGTTACTATCCATGGGACACA 4830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4772 ACCTACGTAATATGATGATTCTGTCAGCATACAACCGAGGGTTACTATCCATGGGACACA 4831
Query 4831 ATATATTTCAGGAAAATAGTTCCTCAGGACTCTCAGACGACAAGTCTCACACAGATGAAG 4890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4832 ATATATTTCAGGAAAATAGTTCCTCAGGACTCTCAGACGACAAGTCTCACACAGATGAAG 4891
Query 4891 ATATCTTCCAGTATTCAGCTTTGTCTAAATTGATTCTAAAAGCGACTGAAGAGATATCAT 4950
|| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 4892 ATCTCCTCCAGTATTCAGCGTTGTCTAAATTGATTCTAAAAGCGACTGATGAGAAATCAT 4951
Query 4951 GTG-TATTATCACGTATCATTGCTGCATGCAGTGTCACTTGCTTACACTCAGTGCCATGG 5009
|| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4952 -TGGTGTTATCACGTATCATTGCTGCGTGCAGTGTCACTTGCTTACACTCAGTGCCATGC 5010
Query 5010 TTTGAGGAAAACAAGGTGTCATCTGGACCTGAACCAAAGTGGTCCAATGCTTTGCGATTT 5069
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5011 TTTGAGGAAAACAAGGTGTCATCTGGACCTGATCCAAAGTGGTCCAATGCTTTGCGGTTT 5070
Query 5070 TACTTTCAGGGAATTCTGGAATCGTTCTCTAATTTAAGAACTTCTTTAAGGTTGTGCTTG 5129
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 5071 TACTTTCAAGGAATTCTGGAATCGTTCTCTAATTTAAGAACTTCTATAAGGCTGTGCTTG 5130
Query 5130 AGCTCCTCTGTGGAAGACCTGAAAACAAGACTCGCAGTTGTTCTTGATTTAGTCGAATAT 5189
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5131 GGCTCCTCTGTGGAAGACCTGAAAACAAAACTTGCAGTTGTTCTTGATTTAGTCGAATAT 5190
Query 5190 TGTTCGAGACTCGCAATTGCTTGGGTTCTGGGAGATGTAAATTGTCTCTTTCGAATGGTT 5249
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 5191 TGTTTGAGACTCGCAATGGCTTGGGTTCTGGGAGACGTGCATTGTCTCTTTCGAATGGTT 5250
Query 5250 CAGCCCCTTGTGATAGCATATTTTCATGGGCATATGCCTTATGAGGTTGACCTGGAAAGT 5309
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5251 CAGCCCCTTGTGATATCATATTTTAATGGGCATATGCCTTATGAGGTTGACCTGGAAAGT 5310
Query 5310 GTGAAGAGAGTATACCACCAGGAAGCTTCTGCTAGTGTACCAGATGCATCAGATGTTGGA 5369
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5311 GTGAAGAGAGTATACCACCAGGAAGCTTCTGTTAGTGTACCAGATGCATCAGATGTAGGA 5370
Query 5370 GTTAATTCTAAGGTCAGCAGAGATGTTGAGAATTACGAAGTTGGCTATCCAGTGTACTCA 5429
|||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5371 GTTAATTCTAAGTTCAGCAGTGTTGTTGAGAATCACGGAGTTGGCTATCCAGTATACTCA 5430
Query 5430 ATTCCAGAAGATGAAAGATGTCTTGTAACACAAGCATGTTTCTGGAAGCACGTTTCAGAC 5489
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5431 ATTCCAGAAGATGAAAGATGTCTGGTAACACAAGCTTGTTTCTGGAAGCATGTTTCAGAC 5490
Query 5490 TTTGTGAAACATAAGCTAGTATCTATTTCGATCAATCTAGATGATGGTATTTCGAATAAT 5549
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5491 TTTGTGAAACTTAAGCTGGTATCTATTTCGATCAATCTAGATGATGGTATTTCGAATAGT 5550
Query 5550 GGTTCCCCTGAAAATTTTGATGCTCAGACATCATTGGACTCCAGTGATGACATTGTATGC 5609
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5551 GGTTCCGCTGAAAATTTTGATGCCCAGACATCATTGGACTCCAGTGATGACATTGTATGC 5610
Query 5610 GTAACGGAGAAGATAATGTCTGTTCTGGGAAAAACACTGATTAGTACCCTAGCTCAACTC 5669
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5611 GTAACGGAGAAGATAATGTCTGTTCTGGGAAAAACACTGATTAGCACCCTAGCTCAACTC 5670
Query 5670 TCTTCATACCATGTAAAACAAGTAGTATTGGTCTTGAAATC-GAAACTAGAGAAGAGAAT 5728
||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |
Sbjct 5671 TCTTCGTACCATGTAAAACAACTAGTATTAGTCTTGAAA-CAGAAACTAGAGAAGAGACT 5729
Query 5729 TCAGGTTCCTACCTTGTTATGGCTGCTCGAATGTCGGGGATCTCAAGCAAATTTTCTTAA 5788
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5730 TCAGGTTCCTACCTTGTTATGGCTGCTCGAATGTCAGGGATCTCAAGCAAATTTTCTTAA 5789
Query 5789 ACGGGATATCCCTGATGCAGGTATAGAAAATGAAAACAACGGTGACCCTGTGGTTTCTGT 5848
||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5790 TCGGGATATCCCAGATGCAGGTGTAGAGACGGAAAAAAACGGTGACCCTGTGGTTTCTGT 5849
Query 5849 GAGGTTCTGGAAGCTTTGTGTTGATCCTCATTTACTATACGAAGCTTTCTTGCTAGAAAA 5908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 5850 GAGGTTCTGGAAGCTTTGTGTTGATCCTCATTTACTACACGAAGCTTTCTTGTTAGAAAA 5909
Query 5909 TTTTGACATATTTGAATGGTCAAAATCTAAACCATTGGAATATTGGAGCGATATGTACAA 5968
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5910 TTTTGACATATTTGAATGGTCAAAATCTAAACCATTGGAAGATTGGAGCGATATGTACAG 5969
Query 5969 AGAAGTAACCAGGAAGAATGAGCTCCATGTGCCATGCAATCAAGATGGTCGAAGTAGTAA 6028
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5970 AGAAGTAATCAGGAAGAATGAGCTCTATGTGCCATGCAATCAAGATGGTCGAAGTAGTAA 6029
Query 6029 TGAGGTGGCTTCACTTGCAAGCCACACTTCAAATTCTTCAC-AGAAAGCTGCGATAACTG 6087
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||
Sbjct 6030 TGAGGTGGCTTCACTTGCAAACCACGCTTCAAATTCTTCACCA-AAAGCTGCGGTAACTG 6088
Query 6088 CCAATGAAAACTCTGCTTTCCAGAACCCCAAAGAAATCCATAAGAGGACCGGGGAGCTTA 6147
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6089 CCAATGAAAACTCTGCGTTCCAGAACCCCAAAGAAATCCATAAGAGGACCGGGGAGCTTA 6148
Query 6148 TAGAGGCCCTTTGTATCAACGCCATCAACCATCGGCAAGCTGCATTTGCTAGCAACCGCA 6207
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 6149 TAGAGGCCCTTTGTATCAACGCCATTAACCATCGGCAAGCTGCATTAGCTAGCAACCGCA 6208
Query 6208 AGGGTATAATTTTCTTTAACCTAGAAGATGGTGATTCCTGCAAAAATCAGTCAGACTATA 6267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||
Sbjct 6209 AGGGTATAATTTTCTTTAACCTAGAAGATGGTGATTCTTCCCAAAATCAGTCAGACTATA 6268
Query 6268 TCTGGTCAGATGCTGACTGGCCACATATTGGTTGGGCTAACTCTGAGTCAACTCCTGTTC 6327
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6269 TCTGGTCAGATGCTGACTGGCCACATAATGGTTGGGCTAACTCTGAGTCAACTCCCGTTC 6328
Query 6328 CAACATGTGTCTCACTCGGTGTTGGTCTTGGGGATAAGAAAGGAGCACACCTTGGATTAG 6387
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6329 CAACATGTGTTTCACTCGGTGTTGGTCTTGGGGATAAGAAAGGAGCACACCTTGGGTTAG 6388
Query 6388 GTTGGG 6393
|| |||
Sbjct 6389 GTGGGG 6394
Score = 4878 bits (2641), Expect = 0.0
Identities = 3039/3232 (94%), Gaps = 24/3232 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 72 GATCCGATCGATAATTTGCCTCTCCGGCAACTCAGATCGGAGATCGTTCCTCCAGCTCCG 131
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 GATCGGATCGATCATTTGCCTCTCCGGCAACTCAGATCGGAGATCGTTCCTCCAGCTCCG 123
Query 132 AATCGATCCCAATCTTCTATTGACTGGCTTCCCGACTTCGCCGGTTACTCATGGCTTGCT 191
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 124 ACTCGATCCCAATCTTCTATTGATTGGCTTCCCGACTTCGCTAATTACTCATGGCTTGCT 183
Query 192 TATGGAGCATCCACTCTCCTCGTCATCTCTCATCTACCTTCTCCTCTCCGCGGCGAAGAT 251
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TACGGAGCATCCACTCTCGTCGTCATCTCTCATCTACCTTCTCCTCTCCGCGGCGAAGAT 243
Query 252 TCTACTAACGGACCATTTTTCCGTCAGATTCTAGAGGTTTCCGGCGATGTTTCGTCTCCA 311
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 244 TCCACGAACGGACCATTTTTCCGTCAGATTCTAGAGGTTTCCGGCGA---------ACCA 294
Query 312 GTTACTTCCGTTTCCTGGTCTCCTGTAACGCCGTCAGTAGGCGAGCTCGCTGTTGGGTCT 371
|||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 295 GTTACTGCAGTTTGCTGGTCTCCTGTAACGCCGTCTGTAGGCGAGCTCGCTGTTGGCTCT 354
Query 372 GGGAACTATATCTTCCTCTTCGCGCGTGATTCCAGTAATTTGAATGGTTCTTTTTGTTGG 431
||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 355 GGGAACTATATCTTCCTCTTCGCGC--G--T---G--ATTTGAAAGGTTCTTTTTGTTGG 405
Query 432 AGTCAGAATGCCATACTGGTGCAAGAGACAAAAGTTGAGGCGATTGAGTGGACAGGATCC 491
||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 406 AGTCAGAATGCCATACTGGTGCAGGAAACAATAGTTGAAGCGATTGAGTGGACAGGATCC 465
Query 492 GGGGATGGGATAATAGTTGGTGGAACTGATATTGTTCTGTGGAAGAGAAGGAACCAATCT 551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 466 GGGGATGGGATAATAGTTGGTGGAACTGATATTGTTCTGTGGAAGAGAAGGAACCAATCT 525
Query 552 TGGGAAATAGCTTGGAAGTTCTCGGGGGATCACCTTCAAGATCTGGTATCCTCCACCTGG 611
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 526 TGGGAAATAGCTTGGAAGTTCTCTGGGGATCACCTTCAGGATCTGGTTTCCTCCACCTGG 585
Query 612 TCATTTGAGGGTCCTTTTGCCACAGCAACTTCTTGGAGGAAGCTTCCAGATGAGTGTGGC 671
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
Sbjct 586 TCATTCGAGGGTCCTTTTGCCACAGCAACTTCTTGGAGGAAGTTTCCAGCTGAGTGTGAC 645
Query 672 GAGGCAGGTAAAAGTGTCTTGGCCTATTATAGTGATGGGGAATCATATCATAAATTTGAA 731
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 646 GACGCAGGAAAAAGTGTCTTGGCCTATTATAGTGATGGTGAATCATATCATAACTTTGAA 705
Query 732 TTGCCACATCCTCAGAGAATATCCATGATTCAGTGGAGACCGATGGCTGCAGAACAGTCT 791
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 TTGCCTCATCCTCAGAGAATATCCATGATTCAGTGGAGACCGATGGCTGCAGAACAGTCT 765
Query 792 GCAATAGGTATAGGGAAATCAATGAGGAATGTGCTAATGACATGTTGCTTGGATGGGGCA 851
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 GCAATAGGTATAGGTAAATCAATGAGGAATGTGCTAATGACATGTTGCTTGGATGGGGCA 825
Query 852 GTAAGGTTATGGAGTGAGGTAGATGGTGGAAAGACAAAAAAGGGCATGAAAGATGTACCT 911
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 826 GTAAGGTTATGGTGTGAGGTAGATGGTGGAAAGACAAAAAAAGGCATGAAAGATGTGCCT 885
Query 912 GATCATAAAAAATCGTTTTGTGTGGCAGCTGTGATAGAGATAAATCAGGTCTTGGATGGC 971
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 GATCATAAAAAATCGTTTTGCGTGGCAGCTGTGATAGAGATAAATCAGGTCTTGGATGGC 945
Query 972 TGTTTGGGTAGAGATTTATTTCTTTTTTGGGGAACTCGTACAGGGGGTATATTGAAAACC 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 946 TGTTTGGGTAGAGATTTATTTCTTTTTTGGGGAACTCGTACAGGGGGTATATTCAAAACC 1005
Query 1032 ATCGAAGGTACTAATCAAtttttttCTATGGAAAAGTATGATCATGAGAATGTTGGAAAA 1091
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 1006 ATCGAAGGTACTAATCAAGTTTTTTCTATGGAAAAGTACGATAATGAGAATGTTGGAAAA 1065
Query 1092 TGTGAGTGGTTGGTAGGGTATGGCCCTGGAAATTTGGCTACTTTGTGGGCTGTCCATTGT 1151
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 TGTGAGTGGTTGGTAGGGTATGGCCCTGGAAATTTTGCTACTTTGTGGGCTGTCCATTGT 1125
Query 1152 CTTGATGACATCTCTCCTATGAGGTTTCCACGAGTAACATTGTGGGCGAAACAAGAATCA 1211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 CTTGATGACATCTCTCCTATGAGGTTTCCACGAGTAACATTGTGGGCGAAACAAGAATCA 1185
Query 1212 AATGAAATTGGTGCAGTATCACTCTCTCTAGCG-GATGCTACAGGTTATTCTGATCGATT 1270
|||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1186 AATGAAATTGGTGCAGGATCACTCTCTCTAGCGAG-TGCTACAGGTTCTTCTGATCGATT 1244
Query 1271 ACACCTTAAGAAAGTTTCTGTATTGAGAAATAACCTTTATAGCACACCACTTATCTGCTC 1330
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1245 ACCCCTTAAGAAAGTTTCTGTATTGAGAAATAACCTTTATGGCACACCACTTATCTGCTC 1304
Query 1331 GTCGATTTATTTATCTCCGCAGAATACTGTATATTGGTCTTCCTTGCACACAATAAAATC 1390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1305 GTCGATTTATTTATCTCCGCAGAATACTGTATATTGGTCTTCCTTGCACACAATAAAGTC 1364
Query 1391 ACATGACTCAGAAGATTCATCTCCAAATAAATCCAGTTTGTTGAAGTGCATTGATGGAAA 1450
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 ACATGACTCGGAAGATTCATCCCCAAATAAATCCAGTTTATTGAAGTGCATTGATGGAAA 1424
Query 1451 AGTATTATATCTAAATGGTCATGGTGGGAAAATCCTACAGGTTGCCTTTGATCCTTTCAT 1510
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1425 AGTATTATATCTTGATGGTCATGGTGGGAAAATCCTACAGGTTGCCTCTGATCCTTTTGT 1484
Query 1511 ATGTGAGGCGGGATACACTGCTTCCCTGGATTCTAATGGTTTGGTAATAATCTGGTCCTC 1570
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||
Sbjct 1485 ATGTGAGGCGGGATACACTGCTTCCCTGGATTCTAATGGTCTGATAATAATCTGCTCCTC 1544
Query 1571 TAGTACTTATTTGAACCGTG-CTATTGACCATCCTATATCAGTTGCCTCTTGGAAACCTT 1629
|||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1545 TAGTGTTTATTTGAACCG-GACTATTGAGCATCCTATATCTGTTGCCTCTTGGAAGCCTT 1603
Query 1630 GTGGATGGCTACAAAATCAAGAGTTCAGATTAAAGTACACAAGTTTATGCGGGGCACCTT 1689
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1604 GTGGACGGCTACAAAATCAAGAGTTCAGATTAAAGTACACAAGTTTATGTTGGGCACCTT 1663
Query 1690 CTTCATTGAAAGATGAGAGATTTCTACTTGTGGGACATGTAGGAGGCGTTGATTGCTTTA 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1664 CTTCATTGAAAGATGAGAGATTTCTACTTGTGGGACATGTAGGAGGCGTCGATTGCTTTA 1723
Query 1750 GTGTAAGGAATTGTGGGAAAGGTGATGATGGTTATCTAACCCATTACATTTGTACCATAC 1809
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1724 GTGTAAGGAATTGTGGGAAAGGTGATGACGGTTATCTAACCCATTATATATGTACCATAC 1783
Query 1810 CGTCTGCAGTTAACAGCCCTTTGCAGAGTGGTCCAACCAGCATATTTGCAAGACCTCTGT 1869
||| | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1784 CGTTTACGGTTAATAGCCCTTTGCAGAGTGGTCCGACCAGCATATTTGCAAAACCTCTGT 1843
Query 1870 CTAATTCTTGTGGAAAGACATTCAAAAGTAACAGATTTTTGCTTCTGAGTGTATGGATGA 1929
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1844 CTAATTCTTGTGGAAAGACATTTAAAAGTAACAGATTTTTGCTCCTGAGTGTATGGATGA 1903
Query 1930 AAGAGAAACAGTTTGATGCTCTGTCATGGAGTGTGACCTTGCATCATTTTGATACTGCAG 1989
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1904 AAGAGAAACGGTTTGATGCTCTGTCATGGAGTGTAACCTTACATCATTTTGATACAGCAG 1963
Query 1990 GAAGCACCTGCGATTGTCATTTTCATGATTTTGATAGTACTGGATTGGGAAAGTGGTTAT 2049
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1964 GAAGTACCTGCGATTGTCATTTTCATGATTTTGATAGTATTGGATTGGGAAAGTGGTTGT 2023
Query 2050 TCGAAGATACTTTTGCTGGTAAGAAGAATTGCATTGCTATTAGGTCATGCTCTTCAGAAA 2109
||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2024 TCGAAGATACTTTTGCTGGCAAGACGAATTGCCTTGCTATTAGATCATGCTCTTCAGAAA 2083
Query 2110 TACCTGAATCTCACCGTGACGATGAAGTTACGAGTTTTGCTGTGGTCAATCCAAGTGGCA 2169
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2084 TACCTGAATCTCACCGTGAGGATGAAGTTACGAGTTTTGCTGTGGTCAATCCAAGTGGGA 2143
Query 2170 GGGCTATAGAGAATGACATGAACAGTGAAATTCAAGCTTATACTATGGCAACTGGTCAGG 2229
||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2144 GGGATCTAGAGAATGGTGTGAACAGTGAAAGTCAAGCTTATACTATTGCAACTGGTCAAG 2203
Query 2230 CTGATGGCTCTTTAAAAATTTGGAGAAGTAGTTTTCAGGAAAGTTCAACACCTTGCGTTC 2289
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2204 CTGATGGCTCTTTAAAACTTTGGAGAAGTAGTTTTCAGGAAAGTTCAACACCTTCCGGTC 2263
Query 2290 CGTGGGAGCTAGTTGGCATGCTTACCATTGGCCAAAATCCTGTCAGTGCTATATTTCTGA 2349
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2264 TGTGGGAGCTAGTTGGCATGCTTACGGTTGGCCAAAATCCTGTCAGTGCTATATCTCTGA 2323
Query 2350 CTGATTCGGGACATAAGATAGCAGCCCTCTGTACAGAGAATCATTCAAAAGCTACCTGCA 2409
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||
Sbjct 2324 CTGATTCGGGACACAAGATAGCAGCCCTCTGTACAGAGAGTCATTCAAAAGCTGCCCGCG 2383
Query 2410 CAATTAGCATATGGGAGATTATACACCTTATAGATTCAGGGGTTTTCATACTAGAGGATA 2469
|| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384 CAGTTAGTATATGGGAGATTGTACACCTTATAGATTCAGGGGTTTTCATACTAGAGGATA 2443
Query 2470 AGTTACATGTTGATGCAGAGGTTGTTGCTGTAAGATGGTCAACTGCGAGTAATGGTCAGC 2529
|| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||
Sbjct 2444 AGGTACATGTTGATGCAGAAGTTGTTGCTGTAAGATGGTCAACTACGGGTAATGATCAGC 2503
Query 2530 TATTGCTTGGAGTTTGCACACAGAAGGAGCTGCGGGTGTATGGTATTGCTCGGCAGTCCT 2589
|||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2504 TATTACTTGGAGTTTGCACACAGATTGAGATGCGGGTGTATGGTATTGCTCGGCAG-CCT 2562
Query 2590 -GCAAAAGTACCAGTTTCGCGGTCTCTGATTATTCTTCAGAGGCACAGATTTGGCAATGC 2648
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563 TGCAAAAGTACCAGTTTCGCGGCCTATGATTATTCTTCAGAGGCACAGATTTGGCAATGC 2622
Query 2649 TTCGCTGTTACTCGTACATTTTCTGCTATATGTGATTTATGGTGGGGACCCAAAGCCATG 2708
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 TTCGCTGTTACTCGTACATTTTCGGCTATACATGATTTATGGTGGGGACCCAAAGCCATG 2682
Query 2709 ACTTGTCTTGCTCATAATGATTATATTAGTCTACATGGTCAATGGCTGGCTGTTGTTGAT 2768
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2683 ACTTGTCTTGTTCACAATGATTATATTAGTCTACATGGTCAATGGCTGGCTGTTGTTGAT 2742
Query 2769 AAGAAACAAAAGATCGATAACTATCCAGAAATTTTTGCAGCCAATCTTCCCAACCTAGTA 2828
||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2743 AAGAAGCAAAAGATTGATAACTATCCAGAAATATTTGCATCCAATCTTCCCAACTTAGTA 2802
Query 2829 AATGCTACAGAAGAAGGCAGAGACTTTGAATTGTTATCTGACTCTGGTACTAATGATATC 2888
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2803 AATGCTACAGAAGAAGGCAGAGACTCTGAATTCTTATCTGATTCTGGTACTAATGATATC 2862
Query 2889 AAAGAAGCTGATACTGCATATATTAGCAGAGGATGTATTCCTCAACCTTCAACTAGGAAT 2948
|| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 2863 AACGAAGCTGATACCACATCTACTAGCAGAGGTTGTATTCCTCTACCTTCAACTAGTAAT 2922
Query 2949 GCAATTGATGACGGGCAAGTCAATAGTATGTCATTGATTGGGACCGCATATGGTTCAGAT 3008
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2923 GCAATTGATGACGGGCAAGTCAATAGTATGTCACTGATTGGGACCGCATATGGCTCAAAT 2982
Query 3009 ACTATTAATGAAATTATGAGCATGGGACATATGGTGGAGAAGTTAGGAGGTGCTTTACCA 3068
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2983 ACTATTGATGACATTATGAGCATGGGACATATGGTGGAGAAGTTAGGAGGTGCTTTACCA 3042
Query 3069 CTTTATCACCCTCAAGCCCTCCTTGTAGCTATACATTCAGGCAATTGGAAACGAGCAAGC 3128
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3043 CTTTATCATCCTCATGCCCTCCTTGTAGCTATACGTTCAGGCAATTGGAAACGAGCAAGT 3102
Query 3129 GCAGCTCTAAGGCATCTTGCTGAATATATTACTTCAAGTGATGCCTCCGAGAAGGTATAT 3188
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 3103 GCAGCTCTTAGACATCTTGCTGAATATATTACTTCAAGTGATACCTCCGAGAAGGGATAT 3162
Query 3189 ACTGTAAAGTCAGTTCTTTATCCAGATATCCTTTTGTCAAAATATTATGAAGGGTCTCTC 3248
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3163 GCTGTAAAGTCAGTTCTTTGTCCAGATATCCTTTTGTCAAAATATTATGAAGGATCTCTC 3222
Query 3249 TCCACTGGTCCAAATCATAAGGATTTCCAGTGGGGTGGGACATCTGGTTCAA 3300
|||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3223 TCCAATGGCCCAAATCCTAAGGATTTCCAATGGGGTGGGACGTCTGGTTCAA 3274
Score = 1628 bits (881), Expect = 0.0
Identities = 989/1040 (95%), Gaps = 11/1040 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 6385 TAGGTTGGGAAACTCAAGAAGAATTTGAAGAGTTTGTTGATCCTCCCCCAACAGTTGAAA 6444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6527 TAGGTTGGGAAACTCAAGAAGAATTTGAAGAGTTTGTTGATCCTCCCCCAACAGTTGAAA 6586
Query 6445 CTGTTATTACGAGAGCATTCTCTAATCACCCAACAATGCCCCTCTTCTTGGTTGGCTCAA 6504
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6587 GTGTTATTACGAGAGCATTCTCTAATCACCCGACAATGCCCCTCTTCTTGGTTGGCTCAA 6646
Query 6505 GCAACACTTACATATACTTGTGGGAGTTTGGAAAAGACAGAGCTACTGCAACTTATGGTG 6564
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6647 GCAACACTCACATATACTTGTGGGAGTTTGGAAACGAAAGAGCTACTGCAACTTATGGTG 6706
Query 6565 TTCTGCCTGCTGCAAATG-TTCCTCCTCCATATGCTTTGGCGTCAATATCAGCAGTGCAA 6623
|||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6707 TTCTTCCTGCTGCAAATGTTTCC-CCTCCTTATGCTTTGGCGTCGATATCAGCAGTGCAA 6765
Query 6624 TTCGGTCCATGCGGACACAGATTTGCTAGCGCTGCACTGGATGGAACTGTATGCACTTGG 6683
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6766 TTCGGTCCATTCGGACACAGATTTGCTAGCGCTGCACTGGATGGAACTGTATGCACTTGG 6825
Query 6684 CAATCAGAAGTTGGGGGAAGAAGCAATATCCATCCTGTTGAATCATCTCTTTGCTTCAAT 6743
|||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6826 CAATCAGAAGTTGGAGGAAGGAGCAATATTCATCCTGTTGAATCATCTCTTTGCTTCAAT 6885
Query 6744 GGCCATGCATCAGATGTAGAATATATTAGTTCGAGTGGATCCATTGTTGCAGCTTCAGGA 6803
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6886 GGCCATGCATCAGATGTAGGATATATTAGTTCGAGTGGATCCATTGTTGCAGCTTCAGGA 6945
Query 6804 TATAGCTCAAGTGGTGCAAACGTAGTTGTGTGGGATACTCTAGCTCCGCCTTCAACCTCC 6863
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6946 TATAGCTCAAGTGGTGCAAATGTCGTTGTGTGGGATACTCTAGCTCCCCCTTCAACCTCC 7005
Query 6864 CAGGCATCTATCAATTGTCATGAAGGTGGTGCACGGTCTATCTCAGTATTCGATAATGAC 6923
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 7006 CAGGCATCTATCAATTGCCATGAAGGTGGTGCACGCTCTATCTCGGTATTTGATAATGAC 7065
Query 6924 ATTGGTAGTGGCTCAATTTCTCCTATGATTGTGACTGGTGGCAAAAACGGTGATGTCGGT 6983
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 7066 ATTGGTAGTGGTTCAATTTCTCCTATGATTGTGACTGGTGGCAAAAATGGTGATGTCGGT 7125
Query 6984 CTGCACGATTTCCGGTATATTGCAACCGGAAAGATGAAGAAGCAAAGGAATCCTGACGGA 7043
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 7126 TTGCACGATTTCCGGTTTATTGCAACCGGAAAGATGAAGAAGCAAAGGAACCCTGACGGT 7185
Query 7044 AGATCTTCGACTGATGGCGATCAAAACAAGAATGGGATGCTTTGGTATATACCAAAGGCT 7103
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7186 GGATCTTCGACTGATGGAGATCAAAACAAGAATGGGATGCTTTGGTATATACCAAAGGCT 7245
Query 7104 CACTTAGGGAGTGTGACGAAAATAGCGACAATCCCACGCACAAGTCTGTTCTTGACGGGA 7163
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 7246 CACTTAGGGAGTGTGACAAAAATAGCGACAATCCCACGCACAAGTCTTTTCTTGACGGGA 7305
Query 7164 AGCAAAGACGGAGAAGTAAAACTTTGGGATGCGAAAGCAGCAAAGTTGATTCATCACTGG 7223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 7306 AGCAAAGACGGAGAAGTAAAACTTTGGGATGCGAAAGCTGCAAAGTTGATTCATCATTGG 7365
Query 7224 CCTAAACTACACGAAAGACACACTTTTCTGCAGCCAAACTCTAGAGGCTACGGTGGAATA 7283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 7366 CCTAAACTACACGAAAGACACACTTTTCTGCAGCCAAACTCGAGAGGCTACGGTGGAATC 7425
Query 7284 ATCCGGGCTGGGGTGACTGACATACAA-TATTGTCCGAATGGATTTATAACGTGCGGTGG 7342
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 7426 ATCCGGGCTGGGGTGACTGACATACAAGT-TTGTCCGAATGGATTTATAACGTGTGGTGG 7484
Query 7343 TGATGGCACGGTGAAGTTCGTCAGCCT--TAGAGA-TTCCTGTGACGATGGTAAATAAAA 7399
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 7485 TGATGGCACGGTGAAGTTCGTCAGCCTCGTAGATTCTTCCTATGGCGATGCTAAATAAAA 7544
Query 7400 -GAA-A--CATTTTCCGGGA 7415
||| | ||||||||||||
Sbjct 7545 AGAAGATACATTTTCCGGGA 7564
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 370435256649
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5