BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg936878
Length=4089
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G33530.3 | Symbols: | Transducin family protein / WD-40 rep... 3110 0.0
> AT3G33530.3 | Symbols: | Transducin family protein / WD-40 repeat
family protein | chr3:14085298-14093652 FORWARD LENGTH=4390
Length=4390
Score = 3110 bits (1684), Expect = 0.0
Identities = 1842/1916 (96%), Gaps = 19/1916 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TTGGTAGGAAGCTGCAACAATGGCAGCATCGAAGCCGTCACCAACCGATACCTGGGATTC 61
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 38 TTGGTAGAAAGCTGCAACAATGGCAGCATCGAAGCCATCACCAACCGATACCTGGGATTC 97
Query 62 TACTCTCCCTGGTCCTCCCAGCCGTAACAACTTCGGATCCGCCGATCTCAGTCCCTCCGG 121
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 TACTCTCCCCGGTCCTCCCAGCCGTAACAACTTCGGATCCGCCGATCTCAGTCCCTCCGG 157
Query 122 TCTCTTCGCCTTCGCCTCTGGCTCCTCCGTCTCTGTCGTCGATtctcgttctctccagct 181
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 TCTCTTCGCCTTTGCCTCTGGCTCCTCCGTCTCTGTCGTCGATTCTCGTTCTCTCCAGCT 217
Query 182 cgtttccactatccctctccctcctcctcccggtgctctctctccctttgttacttccgt 241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 218 CGTTTCCACTATCCCTCTCCCTCCTCCTCCCGGTGCTCTCTCTCCCTTCGTCACTTCCGT 277
Query 242 ccgttggattcctctccctctcccccgcgatctactctccaccgaaccctccgcctctca 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 CCGTTGGATTCCTCTCCCTCTCCCCCGCGATCTACTCTCCACCGAACCCTCCGCCTCTCA 337
Query 302 ccttctcctcGCCGTTGCAGATCGCCACGGCCGTGTCGCTCTCGTTGACTTCCATCTTCG 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 CCTTCTCCTCGCCGTTGCAGATCGCCACGGCCGTGTCGCTCTCGTTGACTTCCATCTTCG 397
Query 362 CTCCGTCGTCCTCTGGCTTAATCCTTCCTCCGATCCCAACCTTGGGATTCAAGACCTTTG 421
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 398 CTCCGTCGTCGTCTGGCTTAATCCTTCCTCCGATCCCAAGCTCGGAATTCAAGACCTTTG 457
Query 422 CTGGGTTCAAGCTCGCCAGGATTCTCATGTCCTCGCCGCCATTTCTGGATCTTCCTTTCT 481
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 458 TTGGGTTCAAGCTCGCCACGATTCTCATGTCCTCGCTGCGATTTCTGGATCTTCGTTTCT 517
Query 482 CTCGCTCTACACGACCTCCGGTGGACTTTTCTGGAAGTACGATGCCGGTACGGAGATTCT 541
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 518 CTCGCTCTACACGACCTCCGGTGGACTTTTCTGGAAGTACGATGCCGGCACGGAGATTCT 577
Query 542 CTCCTGTCTCCACCGCGATCCCTATGATTCTCGCCATTTCTGTGTGCTTGGCCTCAAAGG 601
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 578 CTCCTGTCTCCGCCGCGATCCCTATGATTCTCGCCATTTCTGTGTGCTTGGCCTTAAAGG 637
Query 602 ATTCCTATTGTCGGTTAAGATACTTGGAGATACTGAGAACGACGTTGTGATTCAGAAGAT 661
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 638 ATTCCTATTGTCGGTTAAGGTACTTGGAGATAGTGAGAACGATGTTGTGATTCAGGAGAT 697
Query 662 GCAGATAAAGACAGATTTCAGTGAGCTACTGAGGTTGGAAAGAGAGGCGGCTAGTAATGG 721
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 698 GCAGATAAAGACAGATTTCAGTGAGCTACCGAGGTTGGAAAGAGAGGCAGCTAGTAATGG 757
Query 722 CAATTCATCATCTTCTTCGTCTTCTTCGCCTGCTTCAGCCGCATTTCCGTTGTACTTCGC 781
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 758 CAATTCATCATC------GTCTTC---GCCTGCTTCAGCCGCATTTCCGTTATACTTTGC 808
Query 782 TAGATTTGCCTTCTCGCCACATTGGAAGAATATACTCTTTGTGACGTTTCCTAGGGAGCT 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 TAGATTTGCCTTCTCGCCACATTGGAAGAATATACTCTTTGTGACGTTTCCTAGGGAGCT 868
Query 842 ATTGGTGTTTGATCTGCAATATGAGACACCCCTCTCCACTACGCCATTACCTCGTGGTTG 901
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 ATTGGTGTTTGATCTGCAATATGAGACGCCCCTCTCGACTACGCCATTACCTCGTGGTTG 928
Query 902 CGCCAAGTTTCTTGATGTCTTGCCTGATCCAAACAAGGAGTTGCTTTATTGTGCTCATGT 961
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 929 CGCCAAGTTTCTTGATATCTTGCCTGATCCAAACAAGGAGTTGCTTTATTGTGGTCATGT 988
Query 962 CGATGGTAGGCTCAGCATTTGGCGTCGGAAAGAAGGAGAACAGTTGCATGTCATGTGTAC 1021
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 989 CGATGGCAGGCTCAGCATTTGGCGTCGGAAAGAAGGAGAACAGGTGCATGTCATGTGTAC 1048
Query 1022 CATGGAAGAGTTTATGCCATCTATTGGAATGTCCATCCCGTCTCCTTCCGCTCTGGCTGT 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049 CATGGAAGAGTTTATGCCATCTATTGGAATGTCCATCCCGTCTCCTTCCGCTCTGGCTGT 1108
Query 1082 TCTCCTCAGTCATTCAGACTCCACAATGCAAACCATTACAAAACTTCACCCGGATGGAAC 1141
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1109 TCTACTCAGTCATTCAGACTCCACAATGCAAACCATTACAAAAATTCACCCGGATGGAAC 1168
Query 1142 CTCTTCTATAGATTTTGATAACCCATTTGACTTTTATGACGAAAGTCTTCTTGTTTCGAA 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1169 CTCTTCTATAGATTTTGATAACCCATTTGACTTTTATGACGAAAGTCTTCTTGTTTCTAA 1228
Query 1202 GACAACTTTTATCTCCCTATCTGATGACGGTAAAATATGGAAGTGGGTCTTAAGTGCTGA 1261
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 GACAACTTTTATCTCCCTATCTGATGATGGCAAAATATGGAAGTGGGTCTTAAGTGCTGA 1288
Query 1262 AGGTGTTGAAGATGCTCTGAAAAATGCATCAGACTTGGACATGGGTACTGGAGGCACTGA 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1289 AGGTGTTGAAGATGCTCTGAAAAATGCATCAGACTTGGACATGGGTATTGGAGCCACTGA 1348
Query 1322 AGCAGCACTTCCTGGAGCTATTCAGAAAAATAATTCCTCAAGTCTGGATGATGATTTAGT 1381
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1349 AGCAGCACTTCCTGGAGCTATTCAGGAAAATGATTCCTCAAGTCTGGATGATGAATTAGT 1408
Query 1382 TGTTGCACCTACAAATCGAAGCAGAGGTCACACATCAAGTTCCTCCATGGAAAAATCAGA 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409 TGTTGCACCTACAAATCGAAGCAGAGGTCACACATCAGGTTCCTCCATGGAAAAATCAGA 1468
Query 1442 TCTATCATTTAAG--GTTGGTGGCTGGAAGATTTTTGGGGCTTATACTTGTTTACGTCGC 1499
||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1469 TCTATCATTTAAGAAGTT--TGGC-G-----TTACCAGGGCTTATACTTGTTTACTTCGC 1520
Query 1500 TCAATGCAGATCAGCCTGACTGGACAGCTTCAGCTTCTCTCTTCCACAGTCTCTACACTT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 TCAATGCAGATCAGCCTGACTGGACAGCTTCAGCTTCTCTCTTCCACAGTCTCTACACTT 1580
Query 1560 GCTGTACCATCTCCGTCTCTTACAGCAACCCTAGCAAGAGGGGGTAACATTCCTGCGGCA 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1581 GCTGTACCATCTCCGTCTCTTACAGCAACCCTAGCAAGAGGGGGTAACATTCCTGCTGCA 1640
Query 1620 GCTGTTCCGTTGGTTGCTTTGGGAACTCAGAGTGGGACAATCGATGTTGTTGATGTATCA 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1641 GCTGTTCCGTTGGTTGCTTTGGGAACTCAGAGTGGGACAATCGATGTTGTTGATGTATCA 1700
Query 1680 ACAAATGCTGTTGCTGCAAGCACTTCGGTTCATACTGGTGTTGTTAGGGGCCTTCGGTGG 1739
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1701 ACGAATGCTGTTGCTGCAAGCACTTCGGTTCATACTGGTGTTGTTAGAGGCCTTCGGTGG 1760
Query 1740 CTTGGAAATTCAAGATTAGTTTCATTTTCTTACAGTCAGGTGAATGACAAAAGCAGAGGC 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 CTTGGAAATTCAAGATTAGTTTCATTTTCTTACAGTCAGGTGAATGACAAAAGCAGAGGC 1820
Query 1800 TACATAAATAAGCTTGTTGTTACCTGCCTTAGGAGTGGGTTGAATAAAACATTTCGTGAT 1859
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1821 TACATAAATAGGCTTGTTGTTACCTGCCTTAGAAGTGGGTTGAATAAACCATTTCGTGAT 1880
Query 1860 TTACAAAAGCCAGAGCGCACTCCCATAAGAGCTCTTAGAACTTCTTCTTCTGGAAG 1915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1881 TTACAAAAGCCAGAGCGCACTCCCATAAGAGCTCTTAGAACTTCTTCTTCCGGAAG 1936
Score = 2726 bits (1476), Expect = 0.0
Identities = 1548/1583 (98%), Gaps = 3/1583 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2509 TTGATTCACCAGATCCGTTAGCCCAGTCACTTCTCCAGCCTCAAATTCCTGGAACCCTTG 2568
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2629 TTGATTCACCAGATCCGTTAGCCCAATCACTTCTCCAGCCTCAAATTCCTGGCACCCTTG 2688
Query 2569 TACTGGAACTTGATTGGCTGCCTCTGAGAACTGATAAAAATGATCCACTTGTTCTATGCA 2628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2689 TACTGGAACTTGATTGGCTGCCTCTGAGAACTGATAAAAATGATCCGCTTGTTCTATGCA 2748
Query 2629 TTGCTGGGGCTGATAGCACCTTCCGGCTCGTTGAGGTTACTGTAAATGAAAAGAAAGCTG 2688
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2749 TTGCCGGGGCTGATAGCACCTTCCGGCTCGTTGAGGTTACTGTAAATGAAAAGAAAGCTG 2808
Query 2689 GCTTTGTGCCCCAGTCTAAATCAGTAAAGGAGAGGTTTCGTCCTATGCCTATGTACTCCC 2748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2809 GCTTTGTGCCCCAGTCTAAATCAGTAAAGGAGAGGTTTCGTCCTATGCCTATGTATTCCC 2868
Query 2749 CTATCCTACTTCCTGTGCCACATGCGCTGGCACTGCGGATGATTTTACAGTTAGGAGTGA 2808
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2869 CTATCTTACTTCCTGTGCCACATGCGCTGGCACTGCGGATGATTTTACAGTTAGGAGTGA 2928
Query 2809 AACCATCTTGGTTTAATACGTCTAGCACAACTTTGGAGAAGAGGCCTCATTTGATCCGTG 2868
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2929 AACCATCTTGGTTTAATACGTCTAGCACAACTTTGGAGAAGAGGCCTCATTTAATCCGTG 2988
Query 2869 GAATGGCTTCATCCTCTAAGGATCTACGGAGCTACATGATTCAGTTACCGCCTTTAGGAG 2928
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2989 GGATGGCTTCATCCTCTAAGGATCTACGGAGTTACATGATTCAGTTACCGCCTTTAGGGG 3048
Query 2929 ACCCTGTAGTGCCAGAAATGCTGTTGAAGATACTAGAACCTTATCGGAAAGAAGGTTGCT 2988
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3049 ACCCTGTAGTGCCCGAAATGCTGTTGAAGATACTAGAACCTTATCGGAAAGAAGGTTGCT 3108
Query 2989 TGCTGGACGATGAAAGAGCAAAACTGTACGCTGATGTGGTCAAGAAAGGTTATGCTGCAA 3048
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TGCTGGACGATGAAAGAGCAAAACTTTACGCTGATGTGGTCAAGAAAGGTTATGCTGCAA 3168
Query 3049 GATTTGCTTTTGCAGCTTCTGTTTTTGGTGAAACCTCAGAAGCACTTTTCTGGTTGCAAC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 GATTTGCTTTTGCAGCTTCTGTTTTTGGTGAAACCTCAGAAGCACTTTTCTGGTTGCAAC 3228
Query 3109 TGCCTCAAGCCATTCGCCATCTGATGAACAAGCTGACGAGAAAGTCTCCGCAGAAAATCT 3168
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3229 TTCCTCAAGCCATTCGCCATCTGATGAACAAGCTAACGAGAAGGTCTCCGCAGAAAATCT 3288
Query 3169 CTTCCCCTACTTTAGACTCAGGAGTTGATGAAGTAGCTATGCTGAGTAAAATACCATCTA 3228
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3289 CTTCCCCTACTTTAGACTCAGGAGCTGATGAAGTAGCTATGCCGAGTAAAATACCATCTA 3348
Query 3229 CTGGTA-TATCGACACCTGAAGCCAGGAAGATAGATTCTATGTGTGATGGTTCACTTAGA 3287
|||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 CTGG-ATTATCGTCACCTGAAGCCAGGAAGATAGACTCTATGTGTGATGGTTCACTTAGA 3407
Query 3288 TTGATGGCTTTTGAGCGAGAAGAATTACGGACACGTGCCAATGAACGTCTTCCTTGGCAT 3347
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 TTGATGGCTTTTGAGCGAGAAGAATTACGGACGCGTGCCAATGAACGTCTTCCTTGGCAT 3467
Query 3348 GAAAAATTACACGGAGAAGATTGCATTCAGAAACAAGTACACGAGCTGATATCAGTTGGA 3407
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3468 GAAAAATTAGACGGAGAAGATTGCATTCAGAAACAAGTACACGAGCTGATATCAGTTGGA 3527
Query 3408 AATTTGGAAGCTGCTGTTAGTTTGCTGCTTTCTTCAGCTCCAGATTCTCCATACTTCTAT 3467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3528 AATTTGGAAGCTGCTGTTAGTTTGCTGCTTTCTTCAGCTCCAGATTCTCCATACTTCTAT 3587
Query 3468 CCAAATGCTCTCCGAGCTGTTGCACTCGCTTCTGCTGTGTCTAAATCTCTTCTCGACCTT 3527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3588 CCAAATGCTCTCCGAGCTGTTGCACTCGCTTCTGCTGTGTCTAAATCTCTTCTCGACCTT 3647
Query 3528 GCACTAAAGGTTGTTGCAGCCAACATGGTAAGGACCGACAATTCACTCACTGGTACTCAT 3587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3648 GCACTAAAGGTTGTTGCAGCCAACATGGTAAGGACCGACAATTCACTCACTGGTACTCAT 3707
Query 3588 CTTTTATGTGCCGTTGGTAGGCACCAAGAAGCTTGTTCACAGCTCCAAGATTCTGGACGA 3647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3708 CTTTTATGTGCCGTTGGTAGGCACCAAGAAGCTTGTTCACAGCTCCAAGATTCTGGACGA 3767
Query 3648 TGGACCGATGCTGCTACCTTGGCTGCAACACATTTAGAAGGATCGGATTATGCCAGGGTA 3707
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3768 TGGACCGATGCTGCTACCTTGGCCGCAACACATTTAGAAGGATCGGATTATGCCAGGGTA 3827
Query 3708 TTGCAAAGGTGGGCTGATCATGTTCTCCATGCGGAGCACAATGTCTGGCGGGCCCTTATT 3767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3828 TTGCAAAGGTGGGCTGATCATGTTCTCCATGCGGAGCACAACGTCTGGCGGGCCCTTATT 3887
Query 3768 TTATATGTGGCTGCTGGTTCCCTGCAAGAGGCGTTTGCAGCTCTCAGAGAGGTGCAACAG 3827
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3888 TTATATGTGGCTGCTGGTTCCCTGCAAGAGGCGCTTGCAGCTCTCAGAGAGGTGCAACAG 3947
Query 3828 CCTGATACAGTAGCCATGTTTGTGCTCGCGTGTCAGGAGATTCATTCAGAAATCATAACC 3887
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3948 CCTGATACAGTAGCCATGTTTGTCCTCGCGTGTCAGGAGATTCATTCAGAAATCATAACC 4007
Query 3888 GAGCTCTCAACCCAAGACGAGGAATCTGAATCTGCTTCTGGTGAAGGCACAGTACCGCTG 3947
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4008 GAGCTATCAACCCAAGACGAGGAGTCTGAATCTGCTTCTGGTGATGGCACAGTACCGCTG 4067
Query 3948 CCCGATCTGCCTGGTCTTGAATCAGGGAAGGAAGAAGTTACAGCGGTTTGCGAATACTTT 4007
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 4068 CCCGATCTGCCTGGTCTTGAATCAGGGAAGGAAGAAGTGACAGCGGTTTGTGAATACTTT 4127
Query 4008 CAACAGTACCAGAGAAAGCTAGTGCATTTGTGCATGGACTCTCAACCCTACACCGACTGA 4067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4128 CAACAGTACCAGAGAAAGCTAGTGCATTTGTGCATGGACTCTCAACCCTACACCGACTGA 4187
Query 4068 TGAGGAA-CTACACAACCAAACT 4089
||||||| ||| || ||||||||
Sbjct 4188 TGAGGAAACTATACTACCAAACT 4210
Score = 909 bits (492), Expect = 0.0
Identities = 564/594 (95%), Gaps = 24/594 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1916 GTATCTTCTAATTCTTTTCCGTGATGCTCCTGTAGAAGTTTGGGCAATGACCAAGCATCC 1975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982 GTATCTTCTAATTCTTTTCCGTGATGCTCCTGTAGAAGTTTGGGCAATGACCAAGCATCC 2041
Query 1976 AGTCATGCTTAGATCATTAGCTCTTCCTTTCACGGTAGTGGAATGGACGCTTCCAGCTGT 2035
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 AGTTATGCTTAGATCATTAGCTCTTCCTTTCACGGTAGTGGAATGGACGCTTCCAGCTGT 2101
Query 2036 TCCGCGCCCAGGTCAAGGCGGTCCTTCCAAACAATCGCTCTCAGCATCCGAAGGAGTAAC 2095
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102 TCCGCGCCCAGGTCAAGGCGGTCCGTCCAAACAATCGCTCTCAGCATCCGAAGGAGTAAC 2161
Query 2096 TGCTTCAGCAGACTCTTGGGCGGTAATTGACATATCTGCAGCATCGGTGGGCTCAGATGG 2155
|||||||| ||| | | | || | | | || ||||||||||||||
Sbjct 2162 TGCTTCAGGAGA--C-T---C-----TT--C--A--T----CA---GTGGGCTCAGATGG 2197
Query 2156 ATCGCAAGAAGAAACTGTAGAGAGTTTTGCATTTGCACTAGTAAATGGTGCTCTTGGAGT 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2198 ATCGCAAGAAGAAACTGTAGAGAGTTTTGCATTTGCACTAGTAAATGGTGCTCTTGGAGT 2257
Query 2216 ATTTGAAGTCCAAGGACGTCGAATTCGAGATTTCAGACCTAAATGGCCATCTACTTCATT 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 ATTTGAAGTCCAAGGACGTCGAATTCGAGATTTCAGACCTAAATGGCCATCTACTTCATT 2317
Query 2276 CATTCCCTCAGATGGATTGGTTACAGCCATGGCATATCGCTTGCCTCATGTGGTTATGGG 2335
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 CGTTCCCTCAGATGGATTGGTTACAGCCATGGCATATCGCTTGCCTCATGTGGTTATGGG 2377
Query 2336 AGATAGATCAGGAAACATAAGATGGTGGGATGTAACAACAGGACAGTCATCTGCATTTAA 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2378 AGATAGATCAGGAAACATAAGATGGTGGGATGTAACAACAGGACAGTCATCTGCATTTAA 2437
Query 2396 TAGTCACAGAGATGGAATAAGGAGGATCAAATTTTCTCCTGTTGTTGCTGGAGATCGCAG 2455
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2438 TAGTCACAGAGATGGAATACGGAGGATCAAATTTTCTCCTGTTGTTGCTGGAGATCGCAG 2497
Query 2456 CCGAGGGCGTGTAGCTGTGCTATTTAATGACAATACATTCTCTGTATTTGATCT 2509
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498 CAGAGGGCGTGTAGCTGTGCTATTTAATGACAATACATTCTCTGTATTTGATCT 2551
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 203778122466
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5