BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg937399 Length=2017 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G46790.1 | Symbols: CRR2 | Tetratricopeptide repeat (TPR)-li... 3273 0.0 > AT3G46790.1 | Symbols: CRR2 | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr3:17231773-17234002 REVERSE LENGTH=2230 Length=2230 Score = 3273 bits (1772), Expect = 0.0 Identities = 1930/2008 (96%), Gaps = 3/2008 (0%) Strand=Plus/Plus Query 12 TCACCGG-AAAATGTTTCTATCCCACCCTCCTCAAGTAATACAACCAAATTATTACACAG 70 ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| Sbjct 44 TCATCGGAAAAATGTTTCTGTCTCACCCTCCTCAAGTAATACAACCAACTTATCATACAG 103 Query 71 TTAACTTCTTACCTCGCTCTCCTCTGAAGCCACCGTTGTGTTCCGTTGCTTTAAACAATC 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 104 TTAACTTCTTACCTCGCTCTCCTCTGAAGCCACCGTCGTGTTCCGTTGCTTTAAACAATC 163 Query 131 TTTCGATTTCTTCCGGCGCCGGAGCTAAACTCTCTAATAATCAGCTAATTCAATCATTGT 190 ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 164 CTTCAATTTCCTCCGGCGCCGGAGCTAAAATCTCTAATAATCAGCTAATTCAATCATTGT 223 Query 191 GCAAAGAGGGTAAACTTAAACAAGCGCTTCGCGTCTTGTCTCAAGAATCTAGCCCGAGTC 250 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 224 GCAAAGAGGGTAAACTTAAACAAGCGATTCGCGTCTTGTCTCAGGAATCTAGCCCAAGTC 283 Query 251 AACAGACTTACGAGCTTCTGATTCTCTGTTGCGGTCATCGGAGCTCTCTTTCTGATGGTC 310 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 284 AACAGACTTACGAGCTTCTGATTCTCTGCTGCGGTCATCGGAGCTCTCTTTCTGATGCTC 343 Query 311 TACGTGTTCATCGACATATTTTGGATAATGGGTCTGATCAAGATCCTTTTTTGGCTACGA 370 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 344 TACGTGTTCATCGACATATTCTGGATAATGGGTCTGATCAAGATCCTTTTTTGGCTACGA 403 Query 371 AGCTTATTGGTATGTATTCGGATTTGGGTTCTGTGGATTATGCACGGAAGGTGTTCGATA 430 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 404 AGCTTATTGGTATGTACTCGGATTTGGGTTCTGTGGATTATGCACGGAAGGTGTTCGATA 463 Query 431 AAACGCGTAAAAGAACTATATATGTCTGGAACGCTTTGTTTCGAGCGCTTACGTTAGCGG 490 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 464 AAACGCGTAAGAGAACTATATATGTCTGGAACGCTTTGTTTCGAGCCCTTACGTTAGCAG 523 Query 491 GTCATGGAGAAGAAGTGTTGGGTTTGTATTGGAAGATGAATAGGATTGGAGTTGAGTCAG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 524 GTCATGGAGAAGAAGTGTTGGGTTTGTATTGGAAGATGAATAGGATTGGAGTTGAGTCAG 583 Query 551 ATAGGTTCACATACACTTACGTTCTCAAGGCTTGTGTTGCATCGGAATGCACGGCGGATC 610 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 584 ATAGGTTCACATACACTTATGTTCTCAAGGCTTGTGTTGCATCGGAATGCACGGTGAATC 643 Query 611 ATCTGACGAAAGGGAAAGAGATTCATGCACATCTTACTCGACGAGGTTACAATTCTCATG 670 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 644 ATCTGATGAAAGGGAAAGAGATTCATGCACATCTTACTCGACGAGGTTACAGTTCTCATG 703 Query 671 TTTACATCATGACTACGTTGGTGGACATGTATGCTCGATTTGGCTGTGTGGATTATGCCA 730 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 704 TTTACATTATGACTACGTTGGTGGACATGTATGCTAGATTTGGCTGTGTGGATTATGCCA 763 Query 731 GCTATGTGTTTAATGGAATGCCGGTGAGGAACGTTGTTTCTTGGAGCGCTATGATTGCCT 790 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 764 GCTATGTGTTTGGGGGAATGCCGGTGAGGAACGTTGTTTCTTGGAGCGCTATGATCGCCT 823 Query 791 GCTATGCAAAGAACGGGAAAGCTTTTGAAGCTCTGAGGACTTTCCGTGAAATGATGACCG 850 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 824 GCTATGCAAAGAACGGGAAAGCTTTTGAAGCTCTGAGGACTTTCCGTGAAATGATGAGAG 883 Query 851 AAACTAAAGATTCATCTCCGAATTCTGTGACTATGGTTAGTGTGCTTCAAGCTTGTGCTT 910 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 884 AAACCAAAGATTCATCTCCGAATTCTGTGACTATGGTTAGTGTGCTTCAAGCTTGTGCTT 943 Query 911 CGCTTGCGGCTTTAGAGCAAGGGAGATTGATTCATGGGTACATACTCAGACGGGGGCTTG 970 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 944 CGCTTGCGGCTTTAGAGCAAGGGAAATTGATTCATGGGTACATACTCAGACGGGGGCTTG 1003 Query 971 ACTCCATATTACCGGTGATCAGTGCTCTTGTGACAATGTATGGTAGATGCGGTAAGCTCG 1030 |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1004 ACTCCATATTGCCAGTGATCAGTGCTCTTGTGACGATGTATGGTAGATGCGGTAAGCTTG 1063 Query 1031 AAGTGGGACAGAGAGTATTTGATCGAATGCATGACAGGGATGTTGTATCCTGGAATTCCT 1090 |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1064 AAGTGGGACAAAGAGTATTTGATCGAATGCATGACCGGGATGTTGTGTCCTGGAATTCCT 1123 Query 1091 TGATATCAAGCTATGGCGTTCACGGGTATGGAAGGAAAGCAATTCAGATATTTGAAGAGA 1150 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1124 TGATATCAAGCTATGGCGTTCACGGGTATGGAAAAAAAGCAATTCAGATATTTGAAGAGA 1183 Query 1151 TGCTCGCCAATGGGGCTTCTCCAACTCCCGTAACATTTGTCAGCGTTTTGGGGGCTTGCA 1210 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1184 TGCTCGCCAACGGGGCTTCCCCAACTCCCGTAACATTTGTCAGCGTTTTGGGAGCTTGCA 1243 Query 1211 GCCACGAGGGACTTGTTGAAGAAGGAAAAAGATTGTTTGAATCAATGTGGAGAGACCATG 1270 |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1244 GCCACGAGGGTCTTGTTGAAGAAGGAAAGAGACTGTTTGAAACAATGTGGAGAGACCATG 1303 Query 1271 GGATAAAACCACAAGTCGAGCATTATGCTTGTATGGTTGATCTGTTAGGTCGGGCAAATA 1330 |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1304 GGATAAAACCACAAATCGAACATTATGCTTGTATGGTTGATCTGTTAGGTCGGGCGAATA 1363 Query 1331 GGTTAGACGAGGCAGCAAAGATGGTACAAGACATGAGGACTGAACC-GGGACCTAAGGTT 1389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct 1364 GGTTAGACGAGGCAGCAAAGATGGTACAAGACATGAGGACTGAACCAGGG-CCTAAGGTT 1422 Query 1390 TGGGGTTCCCTTCTCGGGTCTTGTAGAATTCACGGTAATGTTGAGCTTGCAGAGCGGGCG 1449 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1423 TGGGGTTCCCTTCTTGGTTCTTGTAGAATTCACGGTAATGTTGAGCTTGCAGAGCGGGCG 1482 Query 1450 AGTAGAAGGCTCTTTGCACTTGAACCAAAAAATGCAGGGAACTATGTGTTGTTGGCAGAC 1509 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1483 AGTAGAAGGCTCTTTGCGCTTGAACCAAAAAATGCAGGGAACTATGTGTTGTTGGCAGAC 1542 Query 1510 ATTTACGCGGAAGCTCAGATGTGGGATGAGGTTAAGAGAGTGAAGAAGCTTCTAGAACAC 1569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1543 ATTTACGCGGAAGCTCAGATGTGGGATGAGGTTAAGAGAGTGAAGAAGCTTCTAGAACAC 1602 Query 1570 CGGGGACTGCAGAAGCTGCCTGGTCGATGCTGGATGGAAGTGAGGAGAAAAATGTACTCA 1629 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1603 AGGGGACTGCAGAAGCTGCCTGGTCGATGCTGGATGGAAGTGAGGAGGAAAATGTACTCG 1662 Query 1630 TTTGTCTCGGTGGATGAGTTTAACCCTCTTATGGAACAGATTCATGCTTTCTTGGTTAAG 1689 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1663 TTTGTCTCGGTTGATGAGTTTAACCCTCTTATGGAACAGATTCATGCTTTCTTGGTTAAG 1722 Query 1690 TTAGCCGAAGATATGAAGGAGAAAGGGTACATACCACAGACCAAAGGAGTTCTGTATGAG 1749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1723 TTAGCCGAAGATATGAAGGAGAAAGGGTACATACCACAGACCAAAGGAGTTCTGTATGAG 1782 Query 1750 CTTGAAACAGAAGAAAAAGAGAGGATAGTGTTGGGACACAGTGAGAAACTGGCGTTGGCG 1809 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1783 CTTGAAACAGAAGAAAAAGAGAGGATAGTGTTGGGACACAGTGAGAAACTTGCGTTGGCG 1842 Query 1810 TTTGGGCTGATAAATACATCAAAAGGAGAACCAATTAGAATCACAAAGAACTTGCGTTTG 1869 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1843 TTTGGGCTGATAAATACATCGAAAGGAGAACCAATCAGAATCACGAAGAACTTGCGTTTG 1902 Query 1870 TGCGAGGACTGTCACTTGTTTACAAAGTTCATCTCAAAGTTTATGGAGAAGGAGATTCTT 1929 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1903 TGCGAGGACTGTCACTTGTTTACAAAGTTCATCTCGAAGTTTATGGAGAAAGAGATTCTA 1962 Query 1930 GTTAGAGATGTGAACCGGTTTCATAGGTTCAAGAATGGAGTGTGTTCTTGTGGAGATTAC 1989 || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1963 GTCAGAGATGTGAACCGGTTTCATCGATTCAAGAATGGAGTGTGTTCTTGTGGAGATTAC 2022 Query 1990 TGGTAATACTTGTGGGGACTTATACATT 2017 ||||||| | | |||||||||||||||| Sbjct 2023 TGGTAATGCATATGGGGACTTATACATT 2050 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 99949285095 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5