BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg937974
Length=3922
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G51120.1 | Symbols: | DNA binding;zinc ion binding;nucleic ... 6268 0.0
AT2G18090.1 | Symbols: | PHD finger family protein / SWIB comp... 202 2e-50
> AT3G51120.1 | Symbols: | DNA binding;zinc ion binding;nucleic
acid binding;nucleic acid binding | chr3:18985900-18992010
REVERSE LENGTH=4129
Length=4129
Score = 6268 bits (3394), Expect = 0.0
Identities = 3753/3929 (96%), Gaps = 14/3929 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTTCGAATTCTTGACTAATCATGGACAATCAACAGAAGCAACTCCAGCAAGGCGTGC 60
||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 TTTTTTCAAATTCTTCACTAATCATGGAGAATCAACAGAAGCAACTCCAGCAAGGCGTGC 161
Query 61 CGGAGTTGGCTTCTTTGGCTGGTCGCGAAGAGAGTTCCGTCAGAGGGATCGATCTTATGA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 162 CGGAGTTGGCTTCTTTGGCTGGTCGCGAAGAGAGTTCCGTCAGAGGAATCGATCTTATGA 221
Query 121 GAGTTGATCAATGTGAAGAGATCGGTGTTAAACAAGTTCCTGCTCTCTCTGTACCTGCCT 180
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GAGTTGATCAATGTGAAGAGATCGGTGTTAACCAAGTTCCTGCTCTCTCTGTACCTGCCT 281
Query 181 TGTCGGTGGCTGGGACGGTTGCTGTACCTGTGTCCATTGAGCAAGAGGTTAAAGTTGTTG 240
|||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 282 CCACGGTTGCTGGGGCGGTTGCTGTGCCTATGTCCAATGAGCAAGAGGTTAAAGTTATTG 341
Query 241 ATGAAGCTGCCCCTGTGAAACGAAAACGGGGTCGTCCTCCGAGGGCACAGGCTAAGACGC 300
||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 342 ATGAAGCTGCCCCAATAAAACGAAAACGGGGGAGGCCTCCAAGGGCACAGGCTAATACGC 401
Query 301 CGTTGCATATTCGGCCACCCCCACCGCCGCCGCGGAAGGACGACAAGGAAGAAGATGTTT 360
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 402 CGTTGCATATTCGTCCACCCCCACCGCCGCCGAAGAAGGAAGACAAGGAAGAAGATGTTT 461
Query 361 GCTTCATTTGCTTCGACGGTGGAGACCTCGTTCTCTGTGATCGCCGGAATTGCCCCAAGG 420
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 GCTTTATTTGCTTCGACGGTGGAGACCTTGTTCTCTGTGATCGCCGGAATTGCCCCAAGG 521
Query 421 CATACCATCCAGCTTGTATTAAGAGAGATGAGGCATTCTTCCGAACAACGGCTAAATGGA 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 522 CATACCATCCAGCTTGTATTAAGAGAGATGAGGCATTCTTTCGAACAACGGCCAAATGGA 581
Query 481 ATTGTGGTTGGCACATATGTGGTACATGCCAAAAGGCTTCCAGTTACATGTGTTATACAT 540
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 ATTGTGGGTGGCACATATGTGGTACATGCCAAAAAGCTTCCAGTTACATGTGTTATACAT 641
Query 541 GCACTTTTTCCGTTTGTAAGCGGTGCATTAAAGATGCCGACTATGTGATTGTGAGAGGTA 600
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 GCACTTTTTCTGTTTGTAAGCGGTGCATTAAAGATGCTGACTATGTGATTGTGAGAGGTA 701
Query 601 ACATGGGTCTTTGTGGCACATGTATTAAGCCTATAATGCTGATTGAGAATATTGCTCAAG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 ACATGGGTCTTTGTGGCACATGTATTAAGCCTATAATGCTGATTGAGAATATTGCTCAAG 761
Query 661 GAGATAATGAAGCAGTTAAGGTGGATTTTGATGACAAGCTTAGTTGGGAATATCTATTCA 720
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 762 GAGATAATGAAGCGGTTAAGGTGGATTTCGATGACAAGCTTAGTTGGGAGTATCTATTCA 821
Query 721 AGGTATATTGGCTTTGCCTGAAGGAAGATCTATCTCTAACTGTCGATGAGCTTACTAAAG 780
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 822 AGGTATATTGGCTTTGCCTGAAGGAAGAGCTGTCTCTAACTGTTGATGAGCTTACTAGAG 881
Query 781 CAAATAATCCTTGGAAGGAGGTTCCTAACACTGCTCCTAACGTGGAGTCACGAAATGATC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||
Sbjct 882 CAAATAATCCTTGGAAGGAGGTTCCTAACACTGCTCCCAAAGTGGAGTCACAAAATGATC 941
Query 841 ATACCAATAACAGAGCTTTAGATGTAGCAGTGAATGGAACAAAAAGAAGAAAGACCAGTG 900
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 942 ATACCAATAACAGAGCTTTAGATGTAGCAGTAAATGGAACAAAAAGAAGAAGGACCAGTG 1001
Query 901 ATTCCCCCACCTTACCCAACAAGTTGGATGGCAAAAATTCAAATAATATCCTAAAGAAGG 960
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 1002 ATTCCCCTACCTTACCCAACAAGTTGGATGGCAAAAATCCAAGTAATATCCTAAAGAAGG 1061
Query 961 CTCCTAGAGATACGAGCTGGGCAACAAAAGAACTCCTCGAGTTTGTGTCGTTCATGAAAA 1020
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 CTCCTGGAGATACGAGCTGGGCAACAAAAGAACTCCTCGAGTTTGTGTCGTTCATGAAAA 1121
Query 1021 ATGGCGATACATCTGTTCTATCTCAGTTTGACGTGCAGGGTCTTCTGCTTGACTATATCA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 ATGGCGATACATCTGTTCTATCTCAGTTTGACGTGCAGGGTCTTCTGCTTGACTATATCA 1181
Query 1081 AGaaaaaaaaTCTTAGGGATCCTCTTCAGAAGTCTCAAGTTCTTTGTGACCTGATGCTTG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1182 AGAAAAAAAATCTTAGGGATCCTCTTCAGAAGTCTCAAGTTCTTTGTGACCAGATGCTTG 1241
Query 1141 TGAAGTTGTTTGGAAAACAGCGAGTGGGTCACTTTGAAATGCTTAAGCTTCTCGAGTCTC 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1242 TGAAGTTGTTTGGAAAACAGCGAGTGGGTCACTTTGAAATGCTTAAGCTTCTAGAGTCTC 1301
Query 1201 ACGTCCTTATTCAAGAGAAACCGAAAGGTGATAAGACCACGAATGGTGAAACTACTCATG 1260
| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 ATGTCCTTATTCAAGAGAAACCGAAAGGCGCTAAGACCACGAATGGTGAAACTACTCATG 1361
Query 1261 CCGTACCTAGCCAAATAGAGGAGGATAGTGTTCATGATCCAGCGGTCAGGGATAGAAGAC 1320
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1362 CTGTACCTAGCCAAATAGAGGAGGATAGTGTTCATGATCCAATGGTCAGGGATAGAAGAC 1421
Query 1321 GTAAGATGCGCAGGAAAACTGATGGCAGAGTACAAAATGAAAATCTGGATGCATATGCAG 1380
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1422 GGAAGATGCGTAGGAAAACTGATGGCAGAGTACAAAATGAAAATCTGGATGCATACGCAG 1481
Query 1381 CCATTGATGTTCACAATATCAACCTGATTTATTTGAGACGTAAATTTTTGGAGTCTCTAC 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1482 CCATTGATGTTCACAATATCAACCTGATTTATTTGAGACGTAAATTTTTGGAGTCTCTTC 1541
Query 1441 TTGATGATATCAACAAAGTTCACGAAAAGGTGGTAGGCACAATTTTGAGAATCAAGGTAT 1500
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542 TTGATGATATCAACAAAGTTGACGAAAAGGTGGTAGGCACAATTTTGAGAATCAAGGTAT 1601
Query 1501 CTGGCAGCGACCAGAAGGTGGATATTCACAGGCTTGTTCAAGTTGTAGGTACAAGCAAGG 1560
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 CTGGCAGCGACCAGAAGCTGGATATTCACAGGCTTGTTCAAGTTGTAGGTACAAGCAAGG 1661
Query 1561 CAACAGCATCCTACCAACTTGGCGCAAAGACTACAGATGTTATGCTAGAAATACTGAATT 1620
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1662 CAATAGCATCCTACCAACTTGGCGCAAAGACTACAGATGTTATGCTTGAAATACTGAATT 1721
Query 1621 TAGACAAGAGAGAAGTCATCTCGATTGATCAATTATCAGACCAGAATATCACAGAGGATG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 TAGACAAGAGAGAAGTCATCTCGATTGATCAATTATCAGACCAGAATATCACAGAGGATG 1781
Query 1681 AGTGCAAACGGCTGCGCCAGAGCATAAAATGTGGCCTCAATAAACGTTTGACTGTGGGTG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1782 AGTGCAAACGGCTGCGCCAGAGCATAAAATGTGGCCTCAATAAACGTTTGACTGTGGTTG 1841
Query 1741 AGATCTTGAAGACAGCAGCAACACTGCAAGCCATGAGAACCAATGAGGCTCTGGAAGCTG 1800
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 ACATCTTGAAGACGGCAGCAACACTGCAAGCCATGAGAATCAATGAGGCTCTGGAAGCTG 1901
Query 1801 AGATATTAAAGCTCAATCATCTCCGTGATCGGGCCAAAAAGCTGGAGCTTCTAAAATCAC 1860
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 AGATATTAAAGCTCAACCATCTCCGTGATCGGGCAAAAAAGCTGGAGCTTCTAAAATCAC 1961
Query 1861 CTGAGGAACGTCAGCGGCTTCTGCAGGAAGTCCCAGAAGTTCATACAGATCCAAGCATGG 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 CTGAGGAACGTCAGCGGCTTCTGCAGGAAGTCCCAGAAGTTCATACAGATCCAAGCATGG 2021
Query 1921 ATCCGAGTAATGCATCATCATCAGATGCAGGGTTGGGTACAACAAAACAAGTTAATCACA 1980
|||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2022 ATCCAAGTCATGCATTATCAGAAGATGCAGGGTTGGGTACAAGGAAACAAGATAATCACG 2081
Query 1981 TAAAGGCACAAAGTAAAGGTCCGCAGAATAAAGGGGCTATCTTGAACAACGTAGGAAATA 2040
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||
Sbjct 2082 TAAAGGCACAAAGTAAAGGTCCACAGAATAAAGGGGTTAACTTGAACAACGTGGGAAATA 2141
Query 2041 ATGCGCAGAAAAAATATGATGCACCAATTTTGCGAAGCAGAAATGTCGTGCATGCTGATA 2100
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2142 ATGTGCAGAAAAAATATGATGCACCAATTTTGCGAAGCAGAAATAACGTACATGCTGATA 2201
Query 2101 AAGATGATTGTTCTAAGGTCCACAACAACTCATCAAATATCCAGGAAACTGGTAAAGATG 2160
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 AAGATGATTGTTCTAAGGTCCACAATAACTCATCAAATATCCAGGAAACTGGTAAAGATG 2261
Query 2161 ACGAGGAGAGTGAAATATGGCATTATCGAGATCCAACAGGAAAGACCCAGGGACCGTTTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 ACGAGGAGAGTGAAATATGGCATTATCGAGATCCAACAGGAAAGACCCAGGGACCGTTTT 2321
Query 2221 CTATGGTGCAGCTCCGTAGATGGAAATCTAGTGGCCATTTTCCCCCTTATCTTAGGATAT 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 CTATGGTGCAGCTCCGTAGATGGAAATCTAGTGGCCATTTTCCCCCTTATCTTAGGATAT 2381
Query 2281 GGAGAGCGCATGAGAACCAAGACGAGTCTGTGCTTCTGACTGATGCTCTTGCTGGACGGT 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 GGAGAGCGCATGAGAACCAAGACGAGTCTGTGCTTCTGACTGATGCTCTTGCTGGACGGT 2441
Query 2341 TTGATAAAGCAACTACTTTGCCAAGTTCTTCTTTGCTTCCCCAAGAACAAAAACCATTTC 2400
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||
Sbjct 2442 TTGATAAAGCAACTACTTTGCCGAGTTCTTCTTCGCTTCCCCAAGAACTAAAACCGTCTC 2501
Query 2401 CGCACGATTCTGGCCGCACTGGCGTGGATGTGAACTGTCTTCAGAAGAACCAGACGCCAG 2460
| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2502 CACACGATTCTGGCCGCACTGGCGCGGATGTGAACTGTCTTCAGAAGAACCAGATGCCAG 2561
Query 2461 TTAACACCAGTGCAACCTCCTCTTCCTCCTCTACTGTCACTGCCCATTCTAACGATCCTA 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TTAACACCAGTGCAACCTCCTCTTCCTCCTCTACTGTCACTGCCCATTCTAACGATCCTA 2621
Query 2521 AAGAGAAACAAGTTGTGGCTCTTGTAGTTTGCTCTGGAAAAGTCGAGGATGGTAATTCTG 2580
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2622 AAGAGAAACAAGTTGTGGCTCTTGTAGCTTGCTCTGGAAAAGTTGAGGATGGTAATTCTG 2681
Query 2581 TTTGTCCCCAGTCTCAAGTTAGTTGTCCGGCGTCAATGTCTGTGGTTCCTGGACACGTTG 2640
|| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 TTCGTCCCCAGCCTCAAGTTAGTTGTCCGGCGTCGATCTCTGTGGTTCCTGGACACGTTG 2741
Query 2641 TTAGTCCTGATGTAAGACAAACTCCAGGAACTGATCAATCCAATGCTGTGCGGGCAGATG 2700
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 2742 TTACTCCTGATGTAAGAGAAACTCCAGGAACTGATCAATACAATACTGTGCGGGCAGATG 2801
Query 2701 GTAACCATAACACAACTAAGACTCTGGATGATGGAACAAATGGTGGTTCTG---CCATAA 2757
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2802 GTAACCATAACACAACTAAGACTCTGGAGGATGAAACAAATGGTGGTTCTGTTTCCATAA 2861
Query 2758 ATGGTTCTGTTCAGGCACCAAACCTGAATCAAGAAAGCCATTTCCTTGATTTCCCTAGTC 2817
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 ACGGTTCTGTTCATGCACCAAACCTGAATCAAGAAAGTCATTTCCTTGATTTCCCTAGTC 2921
Query 2818 CTACGCCTAAGTCGAGCCCTGAGGACTTGGAAGCTCAAGCGGCAGAGACTATTCAGTCTC 2877
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2922 CTACACCTAAGTCGAGCCCTGAAGACTTGGAAGCTCAAGCGGCGGAGACTATCCAGTCTC 2981
Query 2878 TGTCTTCATGTGTTCTGGTCAAAGGACCATCTGGTGTCACTTGGAGCACCACAACAACA- 2936
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2982 TGTCTTCATGTGTTCTGGTCAAAGGGCCATCTGGTGTCACTTGGAGCACCACAACCACAA 3041
Query 2937 GCTACCACCGATGCTGCTACTACTACTTCAAGTGTTGTGGTCGCTGGAGGACAGCTTCCT 2996
| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3042 G-TACAACCGATGCTGCTACTACCACTTCAAGTGTTGTGGTTACTGGAGGACAGCTTCCT 3100
Query 2997 CAAGTAACTCAGCAGAATGCTGTTGTTTTAGCTGCACCGTCTGTAAAGCCAATTGATTTG 3056
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3101 CAAGTAATTCAGCAGAATACTGTTGTTTTAGCTGCACCGTCTGTAAAGCCAATTGAGTTG 3160
Query 3057 GCAGCTGATCACGCCACAGCTACGCAGACTTCAGACAACACCCAAGTGGCTCAAGCATCT 3116
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3161 GCAGCTGATCACGCCACAGCTACTCAGACTTCAGACAACACCCAAGTGGCTCAAGCATCT 3220
Query 3117 GGGTGGCCGGCCATTGTGGCTGACCCTGACGAGTGTGATGAATCAGTTTCAGATCTATTA 3176
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3221 GGGTGGCCGGCCATTGTGGCTGACCCCGACGAGTGTGATGAATCAGTTTCAGATCTATTA 3280
Query 3177 GCTGAAGTTGAAGCAATGGAGCAGAACGGTCTT-CCCTCTTCACCCACCTCAACGTTTCA 3235
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3281 GCTGAAGTTGAAGCAATGGAGCAGAACGGT-TTACCCTCTTCACCCACCTCGACATTTCA 3339
Query 3236 CTGCGATGATGATGATGATTTGACAAAAGGGCCAGAGAAAGATTTCTTTAACCCCGTGGC 3295
||| |||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3340 CTGTGATGATGACGATGATTTGA-AA--GGGCCCGAAAAAGATTTCTTTAACCCTGTGGC 3396
Query 3296 ACGCATGTCCCTGACACCTGAAACATGTAGATTGGATGTCTCTCAGGCGAGTATTCTCGA 3355
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 3397 ACGCATGTCTCTCACACCTGAAACATGTAGATTGGATGTCTCTCAGACGAGTATCCTCGA 3456
Query 3356 CAATGTCTCTGCCGGGAAAAGCTCAATGGGTACAGAAGCAAAAGACAACACTCCCTTCGG 3415
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 3457 CAATGTCTCTGCCGGGAAAAGCTCAATGCTTACAGAAGCAAAAGACAATACTCCCTTCAG 3516
Query 3416 CCACTTCGGAACCGCTGGTCCAGAGCTCCTGCTTTTTGCACCACCAGCGCCAGCGCCAAC 3475
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||
Sbjct 3517 CCACTGCGGAACTGCTGGTCCAGAGCTCCTGCTTTTTGCACCGCCACCGCCACCGCCAAC 3576
Query 3476 TTCAATAAGTCACGACCTGACTCTAACGACAACGGCTCTCAGACTAGGATCAGAAACCAC 3535
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3577 TGCAATAAGTCACGACCTGACTCTAACGACAACGGCTCTCAGACTAGGATCAGAAACCAC 3636
Query 3536 AGTTGAAGCTGGATCGGTCGAGAGGCTCCCCAAATCTGTTTTGGGAGTAAGTTCGGAACC 3595
||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3637 AGTTGAAGCTGGAACGGTCGAGAGGCTTCCTAAATCTGTTTTGGGAGTAAGTTCGGAACC 3696
Query 3596 AAGCCCTAGGTCATTTAT-ATCTCATGACTCAGGCTCAGCCCGTGGAAACACCGAGCGAA 3654
||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3697 AAGCCCTAGATCATT-ATCATCTCATGACTCAAGCTCAGCCCGTGGAAGCACCGAGCGAA 3755
Query 3655 GTCCACGAGGGAGCCAGC-AGAAGAGATCCAGCGGGCACAGCAGAGACCGGCAGTGGTTG 3713
||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3756 GTCCACGAGTGAGCCAGCCA-AAGAGATCCAGCGGGCACAGCAGAGACCGGCAGTGGTTG 3814
Query 3714 AACAGCAGTCACAACAGTAGCTTCAACAACAGTCATAATAACCGTCAATGGCCATACAGC 3773
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3815 AACAACGGTCACAACAGTAGCTTCAACAACAGTCATAATAACCGGCAATGGCCATACAGC 3874
Query 3774 AATAGCCATGGGTATGACCATGGATCAGGTTCGTACGCAGCTCATCCGCCCAAAGGGCTG 3833
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3875 AATAGCCATGGGTATGACCATGGATCAGGTTCGTATGCAGCCCATCCGCCCAAAGGGCTG 3934
Query 3834 AAAATCTGTAAATTCTATGAGAGTGGATACTGCAAAAGAGGTGCATCTTGTAGTTTTTGG 3893
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3935 AAAATATGTAAATTCTATGAGAGTGGATACTGCAAAAGAGGTGCATCTTGTAGTTTTTGG 3994
Query 3894 CACCCCTGAATTTTCATTTCTTGTATTTT 3922
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3995 CACCCCTGAATTTTCATTTCTTGTATTTT 4023
> AT2G18090.1 | Symbols: | PHD finger family protein / SWIB complex
BAF60b domain-containing protein / GYF domain-containing
protein | chr2:7864314-7867766 FORWARD LENGTH=3111
Length=3111
Score = 202 bits (109), Expect = 2e-50
Identities = 363/481 (75%), Gaps = 36/481 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 334 GGAAG-GACGACAAGGAAGAAGATGTTTGCTTCATTTGCTTCGACGGTGG-AGACCTCGT 391
||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||
Sbjct 405 GGAAGAGAAGAGAA-GATGAAGATGTTTGCTTTGTTTGCTTCGATGGTGGTAG-TCTTGT 462
Query 392 TCTCTGTGATCG-CCGGAATTGCCCCAAGGCATACCATCCAGCTTGTATTAAGAGAGA-T 449
|||||| ||||| || | || || ||||| || || ||||||||| ||||| | | |
Sbjct 463 TCTCTGCGATCGTAGGGGA-TGTCCAAAGGCTTATCACCCAGCTTGTGTTAAGCG-TACT 520
Query 450 GAGGCATTCTTCCGAACAACG-GCTAAATGGAATTGTGGTTGGCACATATGTGGTACATG 508
|| ||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 521 GAAGCATTCTTCAGATCGA-GATCTAAATGGAATTGTGGTTGGCACATATGTACTACTTG 579
Query 509 CCAAAAGGCTTCCAGTT--ACATGTGTTATACATG-CACTTTTTCCGTTTGTAAGCGGTG 565
||||||| ||| ||| ||||||||||||| || | | | ||| ||||||||| ||||
Sbjct 580 TCAAAAGGATTC--GTTCTACATGTGTTATACTTGTC-CGTATTCAGTTTGTAAGAGGTG 636
Query 566 CATTA-AAGATGCCGACTATGT-GATTGTGAGAG-GTAACATGGGTCTT-TGTGGCACAT 621
||| ||| | | || ||||| | |||| || | | |||| || || ||||| | |
Sbjct 637 TGTTAGAAGCT-CAGAGTATGTAG-TTGTAAGGGAG-AACAAAGGA-TTCTGTGGAATTT 692
Query 622 GTATTAAGCCTATAATGCTGATTGAGAATATTGCTCAAGG-AGATAATGAAGCAG-TTAA 679
|||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| | | || ||| || || |
Sbjct 693 GTATGAAGACTATAATGCTTATTGAGAATGCAGCTGAAGCTA-ACAAAGAAA-AGGTTCA 750
Query 680 GGTGGATTTTGATGA-CAAG-CTTAGTTGGGAATATCTATTCAAGGTATATTGGCTTTGC 737
||| ||||||||||| |||| | || ||||| ||||| || ||| | || ||| ||| |
Sbjct 751 GGTTGATTTTGATGATCAAGGC--AGCTGGGAGTATCTTTTTAAGATTTACTGGGTTT-C 807
Query 738 -CTGAAGGAAGATCTATCTCTAACTGTC-GATGAGCTTACTAAAGCAAATAATCCTTGGA 795
|| || ||| | ||| | || | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||
Sbjct 808 TCTTAAAGAAAAGCTAGGTTTATC-GTTAGATGATCTTACCAAAGCAAAAAATCCATGGA 866
Query 796 A 796
|
Sbjct 867 A 867
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 195400242985
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5