BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg938089
Length=4201
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G52140.4 | Symbols: | tetratricopeptide repeat (TPR)-contai... 4815 0.0
> AT3G52140.4 | Symbols: | tetratricopeptide repeat (TPR)-containing
protein | chr3:19332828-19341599 FORWARD LENGTH=4765
Length=4765
Score = 4815 bits (2607), Expect = 0.0
Identities = 2847/2959 (96%), Gaps = 32/2959 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1272 AGGATCTTACGTGACAGGGCACTTTACAAAGTGTCTTCTGATTTTGTCGATGCAGCGCTT 1331
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1525 AGGATATTACGAGACAGGGCACTTTACAAAGTGTCTTCTGATTTTGTCGATGCAGCACTT 1584
Query 1332 AACGGAGCTATTGGTGTAATCAGCCGTTGTATACCACCCATAAACCCAACTGATCCAGAG 1391
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585 AACGGAGCTATTGGAGTAATCAGCCGGTGTATACCACCCATAAACCCAACTGATCCAGAG 1644
Query 1392 TGTTTGCACATGTATGTGCACAACAACATCTTTTTCAGTTTTGCTGTTGATGCCGACATT 1451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645 TGTTTGCACATGTATGTGCACAACAACATCTTTTTCAGTTTTGCTGTTGATGCCGACATT 1704
Query 1452 GAACAGCTCTCCAAGAAACGTCCATCTAATCAAGTGACGGAGAAGGTGTCCTCATCTGAA 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 GAACAGCTCTCCAAGAAACGTCCATCTAATCAAATGACGGAGAAGGTGTCCTCATCTGAA 1764
Query 1512 AAGGTTTCATGCACAGATGCAACCTGCGATAATGAAGAGCATAACAGCTGTAATGAGGCG 1571
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1765 AAGGTTTCATGCACAGAAGGAACCTGCGATAATGAAGAGCATAACAACTGTAATGAGGCG 1824
Query 1572 CCACTTGTTGAAAATGAGCAGGCAACGTATGCCTCTGCAAACAATGATTTGAAAGGCACA 1631
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825 CCACTTGTTGAGAATGAGCAGGCTACGTATGCCTCTGCAAACAATGATTTGAAAGGCACA 1884
Query 1632 AAGTTATATCAAGAAGCAGATGTCCCAGGGCTATATAATCTGGCAATGGCCATTATTGAT 1691
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1885 AAATTATATCAAGAAGCTGATGTCCCAGGGCTATATAATCTGGCAATGGCCATTATTGAT 1944
Query 1692 TACAGAGGGCATAGGGTTGTTGCTCAGAGTGTTCTACCGGGAATCCTTCAAGGGGATAAA 1751
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1945 TACAGAGGCCATAGGGTTGTTGCTCAGAGTGTTCTACCGGGAATCCTTCAAGGGGATAAA 2004
Query 1752 TCAGATGCGCTTTTGTATGGTTCAGTCGACAATGGCAAGAAAATATGCTGGAATGAAGAT 1811
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 TCAGATGCGCTTTTGTACGGTTCAGTCGACAATGGCAAGAAAATATGCTGGAATGAAGAT 2064
Query 1812 TTTCATGCTAAGGTGCTAGAGGCTGCAAAGCTTCTTCACATTAAGGAACATTCTGTTATT 1871
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 TTTCATGCTAAGGTGCTAGAGGCCGCAAAGCTTCTTCACATTAAGGAACATTCTGTTATC 2124
Query 1872 GATGCATCCGAAACTGTCTTCAAGTTGGCTGCGCCAGTAGAGTGCAAGGGGATTGTTGGG 1931
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2125 GATGCATCCGAAACTGTCTTTAAGTTGGCTGCACCAGTAGAGTGCAAAGGGATTGTTGGG 2184
Query 1932 AGTGATAACAGGCATTATCTCTTGGACTTGATGAGAGTGACGCCTCGTGATGCCAATTAT 1991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2185 AGTGATAACAGGCATTATCTCTTGGACTTGATGAGAGTGACACCTCGTGATGCCAATTAT 2244
Query 1992 ACGGGTCCAGAGTCCCGCTTTTGTGTTCTAAGACCAGAACTGATCACATCATTTTGCCAG 2051
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2245 ACGGGCCCAGAGTCACGCTTTTGTGTCCTAAGACCAGAACTGATCACATCATTTTGCCAG 2304
Query 2052 GCCGAATCATTGGAAAAATCGAAATTGAAAACCAAGACTGATGAA-GGGGCGGATGATTC 2110
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2305 GCCGAATCATTGGAAAAATCAAAATTTAAAACCAAGGCTGATGAAGGGGGC-GATGATTC 2363
Query 2111 TTCTAATGTTAGTGCTGATATTTCTAAAGTTGGTGATACATTGATCGATGGAGAGGAAAA 2170
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 2364 TTCTAATGTTAGTGCTGATACTTCTAAAGTTGGTGATGCATTGATCGATGGAGAGGCAAA 2423
Query 2171 TGGGGCTTCAAATTCTGATCAGAAAACTATTTCAGACAAGCAAAATACCACCACCGAAGA 2230
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2424 TGGGGCTTCAAATTCTGATCAGAAATCTATTTCAGACAAGCAAAATACCACTGCCGAAGA 2483
Query 2231 TTCTGCAGCCGGGT-TGTCTGAAAGTTCCAAATCATGTGATGAAATAGCATTTAACCCCA 2289
|| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2484 TTATGCAGCCGGGTCT-TCTGAAAGTTCCAAATCATGTGATCAAATAGCATTTAACCCCA 2542
Query 2290 ATGTCTTCACTGACTTCACATTAGGTGGCAATCAAGAGGAGATAGCTGCTGATGAAGAAA 2349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2543 ATGTCTTCACTGACTTCACATTAGGTGGCAATCAAGAGGAGATAGCTGCTGATGAAGAAA 2602
Query 2350 ATGTGAAGAAAGTTAGCTCATACCTTGTGGATGTGGTTCTTCCAAAATTTATAGAAGATC 2409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2603 ATGTGAAGAAAGTTAGCTCATACCTTGTGGATGTGGTCCTTCCAAAGTTTATAGAAGATC 2662
Query 2410 TTTGCAGTCTCGAAGTTTCTCCAATGGATGGTCAGACTTTGACTGAAGCACTCCATGCTC 2469
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2663 TTTGCACTCTCGAAGTTTCTCCAATGGATGGTCAGACTTTGACAGAAGCACTCCATGCTC 2722
Query 2470 ATGGTGTTAATGTTCGTTACATTGGAAGAGTTGCTAATGGGGTGAAGCATTTGCCTCATT 2529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2723 ATGGTGTTAATGTTCGTTACATTGGAAGAGTTGCTAATGGGGTGAAGCATTTGCCTCATT 2782
Query 2530 TGTGGGATCTTTGTCTGAATGAGATTACTGTAAGATCCGCGAAGCACATTTTGAAGGACA 2589
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2783 TGTGGGACCTTTGTCTGAATGAGATTACTGTAAGATCCGCAAAGCACATTTTGAAGGACA 2842
Query 2590 TTCTAAGAGACATAGAGGATCATGATATTGGATCAGCAGTCTCACATTTCCTCAATTGTT 2649
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2843 TTCTAAGAGATATAGAGGATCACGATATTGGATCAGCAGTCTCACATTTCCTCAATTGTT 2902
Query 2650 TCTTTGGAAACTATCAAGCTGCTGGGGGAAAAGCT---------AG------TGCCAAAA 2694
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2903 TCTTTGGAAACTATCAAACTGCTGGGGGAAAAGCTAGCGCCAACAGCTCTACTGCCAAAA 2962
Query 2695 ATCAAAAG-A---------AG--GATCAACCCATCACAAAGAAGGGTCAAGGAAGAGGGA 2742
|||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2963 ATCAAAAGAAGTTCTTTGGAGCCGATCAACCCATCACCAAGAAGGGTCAAGGAAGAGGGA 3022
Query 2743 AGGGAAAATCTTCTTCAAAGAAAAGCTTTTCATCGTATATGATGGTTGACTCCAACATTC 2802
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3023 AGGGAAAAGCTTCTTCAAAGAAAAGTTTTTCATCGTATATGATGGTTGACTCCAACATTC 3082
Query 2803 TATGGTCTGACATTCAGGAATTTGCCAAAGCTAAATATGAGTTTGAGTTGCCTGAGCTAT 2862
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3083 TATGGTCTGACATTCAGGAATTTGCCAAAGCGAAATATGAGTTTGAGTTGCCCGAGCTAT 3142
Query 2863 CAAGAACTACGGCTAAAAAAGTATCTGTTCTTCGTAATCTTTGCCAAAAGGTTGGTGTCA 2922
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3143 CAAGAACTACCGCTAAAAAAGTATCTGTTCTTCGTAATCTTTGCCAAAAGGTTGGTGTCA 3202
Query 2923 GTATTGCTGCACGCAAATACGACTTCAGTGCAACCTCGCCTTTTGAGACGTCAGATATTT 2982
|||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3203 GTATTGCTGCTCGCAAATACGACTTCAGTGCAAACACGCCTTTTGAGACGTCAGATATTT 3262
Query 2983 TGGATCTTCGGCCCGTAATTAAGCACTCTGTCCCTGTATGCTGTGAGGCTAAAGATCTTG 3042
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3263 TGGATCTTCGGCCCGTAATTAAGCACTCCGTCCCTGTATGCTCTGAGGCTAAAGATCTTG 3322
Query 3043 TTGAGATGGGAAAGGTCCAACTGGCTGAGGGCATGCTTAGTGAATCCTACACGTTCTTTT 3102
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3323 TTGAGATGGGGAAGGTCCAACTGGCTGAGGGCATGCTTAGTGAATCCTACACGTTCTTTT 3382
Query 3103 CAGAGGCATTTTCGATACTTCAACAGGTGACTGGTCCAATGCACAGGGAAGTTGCAAACT 3162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3383 CAGAGGCATTTTCGATACTTCAACAGGTGACTGGTCCAATGCACAGGGAAGTTGCAAACT 3442
Query 3163 GCTGCAGGTACCTGGCCATGGTTTTGTACCATGCAGGAGATATGGCTGGGGCCATAATGC 3222
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3443 GCTGCAGGTACCTGGCTATGGTTTTGTACCATGCAGGAGATATGGCTGGGGCCATAATGC 3502
Query 3223 AGCAACACAAGGAACTCATTATTAATGAGCGATGCCTTGGTTTAGACCATCCTGATACTG 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3503 AGCAACACAAGGAACTCATTATTAATGAGCGATGCCTTGGTTTGGACCATCCTGATACTG 3562
Query 3283 CCCATAGCTATGGCAATATGGCTCTTTTCTACCATGGACTGAATCAGACAGAACTTGCTC 3342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3563 CCCATAGCTATGGCAATATGGCTCTTTTCTACCATGGACTGAATCAGACAGAACTTGCTC 3622
Query 3343 TACAGAACATGGGTCGAGCCTTGCTTCTCCTTGGCCTTTCATCTGGCCCTGATCATCCAG 3402
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3623 TACAAAACATGGGTCGAGCCTTGCTTCTACTTGGCCTTTCATCTGGCCCTGACCATCCAG 3682
Query 3403 ATGTTGCAGCTACATTTATAAATGTTGCCATGATGTATCAAGACATGGGCAAAATGGACA 3462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3683 ATGTTGCAGCTACATTTATAAATGTTGCCATGATGTATCAAGACATGGGCAAAATGGACA 3742
Query 3463 CAGCTCTACGTTATCTTCAAGAGGCTTTGAAGAAAAATGAGAGACTTCTTGGTCCTGAAC 3522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3743 CAGCTCTACGTTATCTTCAAGAGGCTTTGAAGAAAAATGAGAGACTTCTTGGTCCTGAAC 3802
Query 3523 ACATTCAGACTGCAGTATGCTACCACGCTCTTGCCATTGCGTTCAACTGTATGGGCGCAT 3582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3803 ACATTCAGACTGCAGTATGCTACCACGCTCTTGCCATTGCGTTCAACTGTATGGGTGCAT 3862
Query 3583 TCAAGCTCTCACACCAGCATGAGAAGAAAACCTACGACATACTTGTTAAACAATTGGGAG 3642
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3863 TCAAGCTCTCACACCAGCATGAGAAGAAAACATACGACATACTTGTTAAACAATTGGGAG 3922
Query 3643 ACGATGATTCTAGGACACGAGACTCTCTAAACTGGATGAAGACGTTTAAGATGCGTGAGC 3702
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 ACGATGATTCTAGGACACGAGACTCTCTAAATTGGATGAAGACGTTTAAGATGCGTGAGC 3982
Query 3703 TTCAGATGACTGCACAAAAGCAGAAAGGACAGGCAGCCAATGCGGCCAACACGCAAAAGG 3762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3983 TTCAGATGACTGCACAAAAGCAGAAAGGACAGGCAGCTAATGCAGCCAACACGCAAAAGG 4042
Query 3763 CTATCGATCTCCTAAAGGCACATCCAGACCTGATACATGCGTTCCAAAACGCAGCAGCTA 3822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4043 CTATCGATCTCCTAAAGGCACATCCAGACCTGATACATGCGTTCCAAAACGCAGCTGCTA 4102
Query 3823 CTGGGAGGTCAAATGCACTGAACTCGGCTGTCCTTGGGGAGACTCAACCACGGGGCAGAG 3882
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4103 CTGGGAGGACAAATGCACTGAACTCTGCTGTCCTTGGGGAGACTCAACCACGGGGCAGAG 4162
Query 3883 GTTTTGATGAAAGAGCAGCTCGTGCTGCAGCTGAAGTTAGGAAGAAGGCAGCTGCTAAGG 3942
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 4163 GTTTTGATGAAAGAGCAGCTCGTGCTGCAGCTGAAGTTAGGAAGAAAGCAGCTGCAAAGG 4222
Query 3943 GGCTACTGGTTCGCCCCCAGGGTGGTGTTCCAGTACAAGCCATGCCACCACTCTCTCAAC 4002
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 4223 GGCTACTGGTTCGCCCCCAGGGTGGTGTTCCAGTTCAAGCCATGCCACCGCTCTCTCAGC 4282
Query 4003 TCCAAAACATGATCAATACCGCCACAGATTCGTCTGAGAAAGGTGGAGAAAATGGGGAAG 4062
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4283 TCCAAAACATGATCAATACCGCCACAGTTTCGTCTGAGAAAGGTGGAGAAAACGGGGAGG 4342
Query 4063 CAAAGGTACAAGAGAAGAAAGAATCCTCTGAAAATGGAAAAACAGAAAACCTGGCTCCTG 4122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4343 CAAAGGTACAAGAGAAGAAAGAATCCTCTGAAAATGGGAAAACAGAAAACCTGGCTCCTG 4402
Query 4123 CAGGATTAGGTGCTGGTTTAACATCTTTGGATAGGAAGAAGCaaaaagccaaaaaataag 4182
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4403 CAGGATTAGGTGCTGGTTTAACATCTTTGGATAAGAAGAAGCAAAAAGCCAAAAAATAAG 4462
Query 4183 aaaaaGTAGGGATCTTGAA 4201
||| |||||| ||||||||
Sbjct 4463 AAACAGTAGG-ATCTTGAA 4480
Score = 1958 bits (1060), Expect = 0.0
Identities = 1222/1293 (95%), Gaps = 40/1293 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 19 AAATGGCTGGGAAGTCGAACAAATCGAAGGCCAAGAGAGCGGCTCAGAGCTCTACCACCA 78
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 200 AAATGGCTGGGAAGTCGAACAAATCGAAGGCCAAGAGAGCGGCTCAGAGCACTACCACCA 259
Query 79 ATT---CTACTGATGTT-AA----A------------TCC-GATGCT-C--CTG----T- 109
||| ||||||||||| || | ||| | |||| | ||| |
Sbjct 260 ATTCCACTACTGATGTTAAATCCGATGCTCCTGCTCCTCCTGTTGCTGCTACTGTTCCTG 319
Query 110 C-ACTGCTCCGGTTACTGC--C-CCTGTTAC---TGCCCCTGCTACTGCTCCGGTTACTG 162
| ||||||||||||||||| | ||| | | ||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 320 CTACTGCTCCGGTTACTGCTGCTGCTGCTCCGGTTGCTACTGCTGCTGCTCCGGTTACTG 379
Query 163 CTCCCGATAACGGCACCGC-CAATGCTGTTGACTCTGCGGTGTCTGAAGCCAATGAAGTT 221
|||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 380 CTCCCGATAATGGCACC-CTCACTGCTGTTGACTCTGCGGTGCCTGAAGCCAATGAAGTT 438
Query 222 CCTCCTACGATTCCTAAGGCTGACGAAAGTGAATCACAAGTAGCAAACAACGATGCCCAA 281
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||
Sbjct 439 GCTCCTACGATTCCTAAGGCTGACGAAAGTGAGTCACAAGTTGAAAATAACGATGCCCAA 498
Query 282 CCCAAGCAAGGTGAACTCCGTCTTTATCCTGTGTCTGTCAAAACACAAAGTGGGGGTAAA 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CCCAAGCAAGGTGAACTCCGTCTTTATCCTGTGTCTGTCAAAACACAAAGTGGGGGTAAA 558
Query 342 ATGGAGCTTCAATTGAACCCTGGAGACTCTGTGATGGATATAAGGCAGTTCCTCCTTGAT 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 ATGGAGCTTCAATTGAACCCTGGAGACTCTGTGATGGATATAAGGCAGTTCCTCCTTGAT 618
Query 402 GCTCCAGAGACGTGCTACTTCACTTGTTATGAGTTGTTACTCCGCAATAAAGATGGAGAG 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 GCTCCAGAGACGTGCTACTTCACTTGTTATGAGTTGTTACTCCGCAATAAAGATGGAGAG 678
Query 462 ACTCATCATTTGGAAGACTACAATGAGATCTCTGAAGTAGCTGACATCACCCTTGGTGGT 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 679 ACTCATCATTTGGAAGACTACAATGAGATCTCTGAAGTAGCTGACATCACCATTGGTGGT 738
Query 522 TGCTCCTTGGAAATGGTTGCAGCATTGTATGATGATAGATCTATCAGAGCGCATGTTCAC 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 TGCTCCTTGGAAATGGTTGCAGCATTGTATGATGATAGATCTATCAGAGCGCATGTTCAC 798
Query 582 CGTGCCAGAGATCTTTTGTCGCTTTCAACACTTCACTCTTCCT-TATCAACAACACTTGC 640
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 799 CGTGCCAGAGATCTTTTGTCTCTTTCAACACTTCACTCTT-CTCTATCAACAACACTTGC 857
Query 641 CTTGCAGTATGACGCAGCACTGAACAAAGTTCAGAACCCCGGAGATAAACCAAAGTCTGA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 858 CTTGCAGTATGACGCAGCACTGAACAAAGTTCAGAACCCTGGAGATAAACCAAAGTCTGA 917
Query 701 CGTTCCAGAGCTGGAATGTTTGGGTTTTATGGAAGATGTGCCTGGCTCTCTCAGGAAGTT 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 918 CGTTCCAGAGCTGGAATGTTTGGGTTTTATGGAAGATGTGCCTGGCTCTCTCAAGAAGTT 977
Query 761 AATAAATTCTACATCAGAAGAGATCAAATCTGTGGAAAACATTGTGTTCTCATCGTTCAA 820
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 978 AATAAATTCTACATCAGAAGAGATCAGATCTGTGGAAAACATTGTGTTCTCATCGTTCAA 1037
Query 821 CCCTCCTCCAAGCCACAGAAGGCTTGTAGGAGATTTAATATATTTGGATGTTGTGACCTT 880
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1038 CCCTCCTCCAAGCCACAGAAGGCTTGTAGGAGATCTAATATATTTAGATGTTGTGACCTT 1097
Query 881 GGAAGGTAACAAGTACTGCATTACAGGCACAACAAAAACATTTTATGTTAATTCCAGCTC 940
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 GGAAGGTAACAAGTACTGCATAACAGGCACAACCAAAACATTTTATGTTAATTCCAGCTC 1157
Query 941 AGGGAATATTCTCGATCCAAGGCCAAATAAATCTGGACATGAAGCAGCTACGCTGATTGG 1000
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 AGGGAATATTCTCGATCCAAGACCAAGTAAATCTGGATTTGAAGCAGCTACGCTGATTGG 1217
Query 1001 ACTATTGCAAAAACTTAGCTCTAAGTTTAAAAAAGCTTTCCGTGAAGTCATGGAAAAGAA 1060
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218 ACTATTACAAAAGCTTAGCTCTAAGTTTAAAAAAGCTTTCCGTGAAGTCATGGAAAAGAA 1277
Query 1061 AGCCTCTGCTCATCCGTTTGAAAATGTTCAATCGCTTTTGCCACCACACTCATGGCTAAG 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 AGCCTCTGCTCATCCGTTTGAAAATGTTCAATCGCTTTTGCCACCACACTCATGGCTAAG 1337
Query 1121 AACTTATCCAGTACCCGATCACAAGCGTGATGCAGCGAGAGCAGAAGAAGCACTTACCAT 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 AACTTATCCAGTACCCGATCACAAGCGTGATGCAGCGAGAGCAGAAGAAGCACTTACCAT 1397
Query 1181 TTCCTATGGTAGTGAGTTAATTGGCATGCAGAGAGATTGGAACGAAGAGTTGCAATCTTG 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 TTCCTATGGTAGTGAGTTAATTGGCATGCAGAGAGATTGGAACGAAGAGTTGCAATCTTG 1457
Query 1241 CAGAGAGTTCCCTCACACTTCTCCTCAAGAGAG 1273
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 CAGAGAGTTCCCTCACACTTCTCCTCAAGAGAG 1490
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 209396820082
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5