BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg938101
Length=5009
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G52250.1 | Symbols: | Duplicated homeodomain-like superfami... 7745 0.0
> AT3G52250.1 | Symbols: | Duplicated homeodomain-like superfamily
protein | chr3:19376138-19383100 FORWARD LENGTH=5366
Length=5366
Score = 7745 bits (4194), Expect = 0.0
Identities = 4753/5018 (95%), Gaps = 57/5018 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGATTCTTCTGGATAACTTGATGCCGCAGGATCACGCTTCGTGGGATCGGAAAGAGCTCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 CGATTCTTCTGGATAACTTGATGCCGCAGGATCACGCTTCGTGGGATCGGAAAGAGCTCT 435
Query 61 TGAGGCAAAGGAAGCACGATAGGCCTGAACAATCTTCTTTTGATTCGCCGCCTTTTAGAT 120
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||
Sbjct 436 TGAGGCAAAGGAAACACGATAGGCCTGAACAA---TCTTTTGAATCCCCGCCTTTTCGAT 492
Query 121 GGAGGGATTCGCCTTCTACTCCTTCTTCTCACCATGTTCC-CAGAGAGTTTTCTTCTCGT 179
||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 493 GGAGGGATTCG---------CCTTCTTCTCACCATGTTCCTC-GAGAGTTTTCTTCTCGT 542
Query 180 TGGGGATCTGCAGACTTCCGCAGACCTTCTTGTCATGGTAAGCAGGGTGGACGGCACCAG 239
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 TTGGGATCTGGAGACTTCCGCAGACCTTCTTGTCATGGTAAGCAGGGTGGACGGCACCAG 602
Query 240 TTTGTGGAGGAGACTAGTCATGGATACGCATCTTCTCGGTCCAGTGCCCGGATGTTTGAT 299
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 603 TTTGTGGAGGAGACTAGTCATGGATACACATCTTCTCGGTCCAGTGCCCGAATGTTTGAT 662
Query 300 AATGATTACTATAGGCCATCAGCATCACGTGGAGACTGGAGATATACCAGGAATTGCAGG 359
| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 -A--A-T--TATAGGCCATCAGCATCGCGTGGAGACTGGAGATATACCAGGAATTGCAGG 716
Query 360 GATGATCGAGTTTCTGTAAGCCAAAAGGAATGGAAATGCAATACATGGGAGATGAGTAAC 419
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 717 GATGATAGAGTTTCTGTAAGCCAAAAGGAATGGAAATGCAATACATGGGAGATGAGCAAC 776
Query 420 GGGTCTTCCAGAAGTTTTGAGAGGCCATTTGGTATTAGAAATGGTCGGAGGTCAGTTGAT 479
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 GGATCTTCTAGAAGTTTTGAGAGGCCATTTGGTATTAGAAATGGTCGGAGGTCAGTTGAT 836
Query 480 GAAAGGCCGTTACATGCTTCAGATACTCATACTACTGTGGTGAACTCTTTGGATCCAGCC 539
||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 GAAAGGCCGCTACATGCTTCAGATACTCATTCTACCGTGGTGAACTCTTTGGATCCAGCC 896
Query 540 AACTCCACTCATCAGCCGGACAATGAGATCTGTACCCCAGTACGCTCACTCAAATTTAAA 599
||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||
Sbjct 897 AACTCGGCTCATTATCTGGACAATGAGATCAGTACCCCAGTACGGTCTCTTAAAATTAAA 956
Query 600 AATGAGCAGAAATTTTCAGATCAAAGGCTATCACTTCCTTCAGATCCTCATTCTGACTGT 659
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 957 AATGAGCATAAATTTTCAGATCAAAGGTTATCACTTCCTTCAGATCCTCATTCTGAATGT 1016
Query 660 GTTAGCTTGTTTGAACAGCCTCCTTCGGAGAACAATTATGGCAATAAGGTTTGTTCACCA 719
||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 ATTAGCTTGTTTGAACGGCCTTCTTCTGAGAACAATTATGGCAATAAGGTTTGTTCACCA 1076
Query 720 GCAAAGCAATGCAATGATTTGATGTATGGTCGGAGGTTAGCTAATGACAATTCATTAGAT 779
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||
Sbjct 1077 GCAAAGCAATGCAATGATTTGATGTATGGTCGAAGGTTAGTTAGTGATAATTCATTAGAT 1136
Query 780 CCTCCAGTCCTCAATGCAGAGCTGGCGGGGACTTGGGAGCAACTTCACCCGAAAGACCCG 839
||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct 1137 GCTCCAATCCCCAATGCAGAGCTGGAGGGGACTTGGGAACAACTTCGCCTGAAAGACCCG 1196
Query 840 CAAGATAATAATGGGTTACATGGTATCAGTGATTTAGACGGTGCTACGAAATGTGCAAAG 899
|||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1197 CAAGATAACAATAGTTTACATGGTATCAATGATATAGACGGTGATAGGAAATGTGCAAAG 1256
Query 900 GAG-GCTTCTCTGGGAGCAATTGGGAAACTTCCACTGTGGAACAGTTCTGGGAGTTTTGC 958
||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1257 GAGAG-TTCTCTGGGAGCAACTGGGAAACTTCCACTGTGGAATAGTTCTGGGAGTTTTGC 1315
Query 959 ATCTCAGAGTTCTGGTTTTAGTCATTCAAGTAGCTTAAAAAGCTTGGGGGCTGTTGATTC 1018
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 ATCTCAGAGTTCAGGTTTTAGTCATTCAAGTAGCTTGAAAAGCTTGGGGGCTGTTGATTC 1375
Query 1019 CAGCGATCGGAAAATTGAGGTTCTTCCTAAAATTGTTACTGTGACTCAATCTTCTTCAGG 1078
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 CAGCGATCGGAAGATTGAGGTTCTTCCTAAAATTGTTACTGTGACTCAATCTTCTTCAGG 1435
Query 1079 AGACGCTACTGCATGTGCCACAACTACTCATCTTTCTGAGGAGATGAGTTCTAGAAAGAA 1138
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 AGACGCTACTGCCTGTGCCACAACTACTCATCTTTCTGAGGAGATGAGTTCTAGAAAGAA 1495
Query 1139 ACAACGTCTCGGGTGGGGTGAGGGCCTGGCGAAATATGAGAAAAAGAAAGTTGATGTTAA 1198
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 ACAACGTCTCGGGTGGGGTGAGGGACTGGCGAAATATGAGAAAAAGAAAGTTGATGTTAA 1555
Query 1199 CACAAATGAAGATGGAACGACATTGTTGGAAAACAGTTCAGAGGAACTGCATTCTTTGAA 1258
| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||
Sbjct 1556 CCCAAATGAAGATGGAACAACATTGATGGAAAACGGTTTAGAGGAACTACATTCGTTAAA 1615
Query 1259 CAAAAATATTGCTGATAAAAGTCCCACAGCAGCCATTGTTCCAGATTATGGTTCCCCTAC 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 CAAAAATATTGCTGATAAAAGTCCCACAGCAGCCATTGTTCCAGATTATGGTTCCCCTAC 1675
Query 1319 AACTCCATCCTCTGTAGCTTGCAGTTCATCACCAGGGTTTGCAGATAAATCATCTCCGAA 1378
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1676 AACACCATCCTCTGTAGCTTGCAGTTCATCACCAGGGTTTGCTGATAAATCATCTCCGAA 1735
Query 1379 GGCTGCTATAGCTGCTAGTGATGTCAGTAACATGTACCGCTCACCTAGTCCCGTGTCTAG 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1736 GGCTGCTATAGCTGCTAGTGATGTCAGTAACATGTGCCGTTCGCCTAGTCCCGTGTCTAG 1795
Query 1439 TATTCACCTTGAACGATTCCCAATTAATATAGAGGAGCTTGATAACATCTCAATGGAGCG 1498
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 TATTCACCTTGAACGATTCCCAATCAATATCGAGGAGCTCGATAACATCTCAATGGAGCG 1855
Query 1499 TTTTGGCTGTTTGCTCAATGAGTTGCTTGGTACTGATGACCCTGGTACAGGGGATTCCAG 1558
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1856 TTTTGGCTGTTTACTCAATGAGTTACTTGGTACTGATGATTCTGGTACAGGGGATTCCAG 1915
Query 1559 TTCTGCCCAATTGACATCAATGAACAGATTACTTGCCTGGAAAGGTGAAATTTTGAAAGC 1618
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 TTCTGTCCAATTGACATCAATGAACACATTACTTGCCTGGAAAGGTGAAATTTTGAAAGC 1975
Query 1619 TGTGGAGATGACTGAATCGGAAATTGATCTCCTTGAAAACAAACATAGGACGCTAAAGCT 1678
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1976 TGTGGAGATGACTGAATCAGAAATTGATCTCCTTGAAAACAAACATAGGACACTAAAGCT 2035
Query 1679 TGAAGGTGGAAGACACTGC-CGTGTTGTTCAACCCAGTTCATACT-TCTGTGACGGAGAT 1736
||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||
Sbjct 2036 TGAAGGTAGAAGACACT-CTCGTGTTGTTGGACCCAGTTCATACTGT-TGTGATGGAGAT 2093
Query 1737 GCAAATGTTCCCAAGGAGCAGGCTTCTTGTATTTTGGATCCTAAGGCAGCAGCTTCCTCT 1796
|||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 2094 GCAAATGTGCCCAAGGAGCAGGCTTCTTGTAGTTTGGATCCTAAGGCAACAGCTTCTTCT 2153
Query 1797 GTAGCTGAAACACTGGTGAGATCTCCTGTTCATCAGGCCGGTTTAGCCAAGGTTCCTGTT 1856
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 2154 GTAGCTAAAACACTGGTGAGAGCTCCTGTGCATCAGGCTGGTTTAGCCAAGGTTCCTGCT 2213
Query 1857 GATGTTTCTGAAGATAATCCTGGAGCAGTTAAATCTCTATCCCAATCTTTTGCCACTGTC 1916
||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 GATGTTTTTGAAGATAGTCCTGGGGAAGTTAAACCTCTATCCCAATCTTTTGCCACTGTT 2273
Query 1917 AAAAGCA-ATGAAGATATACTGCCCATACCGTCTATGAAGGCAGCCGCTTCTTCCAAAGA 1975
|||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||
Sbjct 2274 GAAAG-AGAGGAAGATATACTGCCCATACCATCTATGAAGGCAGCTGTTTCTTCGAAAGA 2332
Query 1976 GATTAACACACCTGCTTTTGTCAATCAGGAAACTATTGAGGTTTCTTCTGCTGATGATAG 2035
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2333 GATTAACACACCTGCTTTTGCCAATCAGGAAACTATTGAGGTTTCTTCTGCTGATGACAG 2392
Query 2036 CATGGCCTCCAATGAAGACTTGCTCTGTGCGAAGTTATTATCTGCCAATAAGAAATATGC 2095
|||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 CATGGCCTCCAAAGAAGACTTGTTCTGGGCTAAGTTATTATCTGCCAATAAGAAATATGC 2452
Query 2096 TTGTGAATCATCTGGAGTATTCAATGAGTTGCTTCCAAAAGATTTCAGTTCGTCTGACAA 2155
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||||
Sbjct 2453 TTGTGAATCATCTGGAGTATTCAATCAATTGCTTCCAAGAGATTTTAATTCGTCTGACAA 2512
Query 2156 CTCAAGATTCCCTGGCATATGTCAAACGCAGTTTGATTCTCATGTCAAAGAAAAAATTGC 2215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2513 CTCAAGATTCCCTGGCATATGTCAAACGCAGTTTGATTCTCATGTCCAAGAAAAAATTGC 2572
Query 2216 AGATAGGGTAGACCTTTTGAGAGCTAGGGAGAAAATTTTACTCCTTCAGTTTAAAGCGTT 2275
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 AGATAGGGTAGGCCTATTGAGAGCTAGGGAGAAAATTTTACTCCTTCAGTTTAAAGCGTT 2632
Query 2276 TCAGCTCTCATGGAAGAAAGATTTGGATCAGCTAGCTTTAACAAAGTACCAATCAAAGTC 2335
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2633 TCAGCTCTCATGGAAGAAAGATTTGGATCAGCTAGCTTTAGCAAAGTACCAATCAAAGTC 2692
Query 2336 TAGCaaaaaaaCAGAACTATATCCGAATGCAAAAAATGGAGGGTATCTGAAGCTTCCCCA 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 TAGCAAAAAAACAGAACTATATCCGAATGCAAAAAATGGAGGGTATCTGAAGCTTCCCCA 2752
Query 2396 ACCTGTACGCCTGAGGTTCTCTTCTTCAGCTCCAAGAAGGGATAGTGTAGTCCCCACAAC 2455
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 ATCTGTACGCCTGAGGTTCTCTTCTTCAGCTCCAAGAAGGGATAGTGTAGTCCCCACAAC 2812
Query 2456 AGAGCTCGTAAGTTATATGGAAAAGCTACTTCCGGGTACCCATCTAAAGCCTTATAGAGA 2515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2813 AGAGCTCGTAAGTTATATGGAAAAGCTACTTCCGGGTACCCATCTAAAGCCTTTTAGAGA 2872
Query 2516 CATTTTGAAAATGCCTGCTATGATTTTGGATGAGAAAGAGAGGGTGATGTCGAGGTTTAT 2575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 CATTTTGAAAATGCCTGCTATGATTTTGGATGAGAAAGAGAGGGTGATGTCGAGGTTTAT 2932
Query 2576 TTCTAGCAATGGACTGATTGAAGATCCATGTGACGTTGAGAAGGAAAGAACAATGATTAA 2635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 TTCTAGCAATGGACTGATTGAAGATCCATGTGACGTTGAGAAGGAAAGAACAATGATTAA 2992
Query 2636 TCCTTGGACCTCAGAGGAGAAAGAAATATTTCTGAATTTGCTAGCATTGCATGGGAAGGA 2695
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2993 TCCTTGGACCTCAGAGGAGAAAGAAATCTTTCTGAATTTGCTAGCAATGCATGGGAAGGA 3052
Query 2696 TTTCAAGAAGATTGCTTCATATCTTACCCAAAAGACAACTGCGGACTGTATTGATTACTA 2755
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053 TTTCAAGAAGATTGCTTCATCTCTTACCCAAAAGACAACTGCGGACTGTATTGATTACTA 3112
Query 2756 CTACAAAAACCACAAGTCTGATTGTTTTGGGAAAATAAAGAAGCAGCGTGCTTATGGTAA 2815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 CTACAAAAACCACAAGTCTGATTGTTTTGGGAAAATAAAGAAGCAGCGTGCTTATGGTAA 3172
Query 2816 GGAAGGGAAGCACACCTACATGTTAGCGCCACGAAAAAAGTGGAAACGTGAGATGGGGGC 2875
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 GGAAGGGAAGCACACCTACATGTTGGCTCCACGAAAAAAGTGGAAACGTGAGATGGGGGC 3232
Query 2876 TGCCTCTCTTGATATTTTAGGGGATGTCTCCATTATAGCAGCAAACGCCGGAAAGGTTGC 2935
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3233 TGCCTCTCTTGATATTTTAGGGGATGTCTCCATTATAGCAGCAAACGCTGGAAAGGTTGC 3292
Query 2936 ATCAACCAGGCTGATCTCTTCCAAAAGGATCACCCTTAGAGGTTGCAGCAGTGCTAATTC 2995
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 ATCAACCAGGCCGATCTCTTCCAAAAAGATCACCCTTAGAGGTTGCAGCAGTGCTAATTC 3352
Query 2996 ATTGCAGAACGATGGAAATAACTCTGAAGGGTGCTCCTACAGTTTCGATTTCCCTCGTAA 3055
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3353 ATTGCAGCACGATGGAAATAACTCTGAAGGGTGCTCCTACAGTTTTGATTTCCCACGTAA 3412
Query 3056 GAGAACTGCTGGTGCAGATGTTTTAGCTGTTGGTCCTTTGTCATCAGAGCAGATTAATTC 3115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 3413 GAGAACTGCTGGTGCAGATGTTTTAGCTGTTGGTCCTTTGTCACCAGAGCAGATAAATTC 3472
Query 3116 TTGCTTAAGGACTTCTGTGAGCTCTAGAGAGAGGTGTATGGATCATCTAAAGTTTAATCA 3175
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3473 TTGCTTAAGGACTTCTGTGAGCTCTAGAGAGAGGTGTATGGATCATCTGAAGTTTAATCA 3532
Query 3176 TGTCGTaaaaaaaCCTCGGATATCTCACACTCTACATAATGAGAACAGCAAT-------- 3227
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3533 TGTCGTAAAGAAACCTCGGATATCTCATACTCTACATAATGAGAACAGCAATACTCTACA 3592
Query 3228 ----GA-A---G-AA-GA------TGACTCATGTTCGGAAGAGAGCTGTGGGGAAACAGG 3271
|| | | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3593 CAATGAGAACAGCAACGAAGAAGATGACTCATGTTCGGAAGAGAGCTGTGGGGAAACAGG 3652
Query 3272 TCCTATTCACTGGACAGATGATGAGAGATCTGCCTTTATACAGGGGTTCTCGCTTTTTGG 3331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 3653 TCCTATTCACTGGACAGATGATGAGAGATCTGCCTTTATACAGGGTTTTTCGCTTTTTGG 3712
Query 3332 CAAGAATTTTGCTTCAATATCAAGGTACGTCGGGACAAGATCTCCAGATCAGTGTAAGGT 3391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3713 CAAGAATTTTGCTTCAATATCAAGGTACGTCGGGACAAGATCTCCAGATCAGTGTAAGGT 3772
Query 3392 TTTCTTCAGCAAAGTTCGGAAATGTCTTGGGTTGGAATTTATACAGTCTGGATCTGGAAA 3451
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||
Sbjct 3773 TTTCTTCAGCAAAGTTCGGAAATGTCTTGGGTTGGAATCTATAAAGTTTGGATCTGGAAA 3832
Query 3452 TGTAAGCACGTCCGTAAGTGTTGATAATGGCAATGAGGGTGGTGGAAGCGACTTGGAAGA 3511
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3833 TGTAAGCACATCCGTAAGTGTTGATAATGGCAATGAGGGTGGTGGGAGCGACTTGGAAGA 3892
Query 3512 TCCTTGTCCTATGGAGAGTAACTCTGGCATATGCGA-TAATGGAGTTTGTGCCAAGATGG 3570
||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3893 TCCTTGTCCTATGGAGAGTAACTCTGGCATA-GTGAATAATGGAGTTTGTGCCAAGATGG 3951
Query 3571 GTATGAATTCTCCTACCTCACCTTTTAATATGAATCGGGATGGTGCTAATCATTCAGGCT 3630
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3952 GTATGAATTCTCCTACCTCACCTTTTAATATGAATCAGGATGGTGTTAATCAATCAGGCT 4011
Query 3631 CTGCAAATGGGAAAGCCGACCTTAGTAGATCAGAACAAGAGAATGGGCAGACATATTTGT 3690
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4012 CTGCAAATGTGAAAGCCGACCTTAGTAGATCAGAAGAAGAGAATGGGCAGAAATATTTGT 4071
Query 3691 GTGTGAAAGATGATAATAATCTCGTGAACAATGCATATATCAATGGCGGTTTCCCGAGTC 3750
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4072 GTCTGAAAGATGATAATAATCTCGTGAACAATGCATATGTCAATGGCGGTTTCCCGAGTC 4131
Query 3751 TAGTTTCAGAATCTTGTAGAGATTTGGTAGACATTAATACTGTTGAGAGCCAGTCTCAGG 3810
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4132 TAGTTTCAGAATCTTGTAGAGATTTGGTAGATATTAATACTGTTGAGAGCCAGTCTCAGG 4191
Query 3811 CTGCCGGAAAAAGCAAGAGCAATGATCTAATGTCAATGGAAATCGATGAAGGTGTCTTAA 3870
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4192 CTGCCGGAAAAAGCAAGAGCAATGATCTCATGTCAATGGAAATCGATGAAGGTGTCTTAA 4251
Query 3871 CATCTGTCGTTGTATCTTCTGAGCCCTTGTATTGTGGCCTAAGTGTTCTTTCCAATGTTA 3930
|||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4252 CATCTGTCACTATATCTTCCGAGCCATTGTATTGTGGCCTAAGTGTTCTTTCCAATGTTA 4311
Query 3931 TTGTGGAAACCCCTACAGAAATCTCACGAAAGGGCTCAGGAGATCAAGGTGCTGCAATTC 3990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 4312 TTGTGGAAACCCCTACAGAAATCTCACGAAAGGGCTCAGGAGATCAAGGTGCTACAATGC 4371
Query 3991 CTAAACTTAGTTCAAAGAATCAGGATGAAGTGATGCAAGCTGCAAACAGAACCAGAAATT 4050
||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4372 CTAAATTTAGTTCAAAGAATCAAGATGGAGTGATGCAAGCTGCAAACAGAACCAGAAATT 4431
Query 4051 CTGGCCTTGAACCTGAAAGTGCACCTTCAGGTTTCAGGTACCCTGAGTGTCTGCACCATG 4110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4432 CTGGCCTTGAACCTGAAAGTGCACCTTCAGGTTTCAGGTACCCTGAGTGTCTTCACCATG 4491
Query 4111 TTCCGATTGAGGTGTGTACGGAAAACCCTATAGGCGTCAGTGTACCACGAGGAAATCCAA 4170
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4492 TTCCGATTGAGGTGTGTACGGAAAACCCTATAGGCGTCAGTGCACCACGAGGAAATCCAA 4551
Query 4171 ATTGCCATGCAGAATCTGAGTCGGGAAATTCTCTTGTTGGAAAAGTTGTCGAAACACATG 4230
||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 4552 ATTGCCATGCAGAGTCCGAGTCAGGAAATTCTCTTGTTGGACAAGTTGACGAAACACATG 4611
Query 4231 ACTTGGGTTGGCCGAAGAACAATCTGGAATTGAATAGGAAGCTTCGGGTTTTAGGCCATG 4290
||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4612 ACTTGGGTTGGCCCAAGAACAATCTGGAATTGGATGGGAGGCTTCAGGTTTTAGGCCATG 4671
Query 4291 TAAACCCTGATGAGCAGAATGGTCAACTAAATGCAACCAATGCAGGATCTTGTCAAATTC 4350
|||||||||| | |||| ||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct 4672 TAAACCCTGA-G--CAGATTGGTCTACTAAAAGCGACCAATACAGAATCTTGTCAAAATC 4728
Query 4351 CCCAGAGAGCAGTCACCCAAGATCTGAGCAGGATAAGTAGATCAAAATCCGATTTGATCG 4410
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4729 CCCAGAGATCAGTCACCCAAGATCTGAGCAGGATAAGTAGATCAAAATCTGATTTGATCG 4788
Query 4411 TAAAAACCCAACGTACAGGTGAAGGTTTCACACTCAACAAGTGTACTAGTTCAGCTCCTA 4470
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4789 TAAAAACCCAACGTACAGGTGAAGGCTTCTCACTCACCAAGTGTACTAGTTCAGCTCCTA 4848
Query 4471 AGCCTCTGGCAGTATTCCATAAAGAGGGTAGATCTGGTCATAGCAGGAGCCATTCGTTTA 4530
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4849 AGCCTCTGGCAGTATCCCATAAAGAGGGCAGATCTGGTCATAGCAGGAGCCATTCGTTTA 4908
Query 4531 GTTTGTCTGATACTGAGAGACTCGACAAGAATGGAGATGTGAAGCTGTTTGGTACAGTAC 4590
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4909 GTTTGTCTGATACTGAGAGACTCCACAAGAATGGAGATGTGAAACTGTTTGGTACAGTAC 4968
Query 4591 TTACTGCTGATGAGAATGGAATAAAACAAAAACACAATCCATGTGGAATTGTCAGGTCAT 4650
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4969 TTACTACTGATGAGAATGGAATAAAACAAAAACACAATCCATGTGGAATTGTCAGGTCAT 5028
Query 4651 CATCAGCCTTGAGCAGGGACCATGATACAAGACATCATTACATTAATCAGCAACACCTTC 4710
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5029 CATCAACCTTGAGCAGGGACCATGATACAAGACATCATTACATTAATCAGCAACACCTTC 5088
Query 4711 AGAATGTTCCCATTACGAGCTATGGGTTTTGGGATGGCAACAGAATTCAAACCGGGCTCA 4770
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5089 AGAACGTTCCCATTACGAGCTACGGTTTTTGGGATGGCAACAGAATTCAAACCGGGCTCA 5148
Query 4771 CATCTTTGCCAGAGTCGGCCAAGTTGCTTGCAAGTTGCCCTGAAGCATTTTCCACGCATC 4830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5149 CATCTTTGCCAGAGTCGGCCAAGTTGCTTGCAAGTTGCCCTGAAGCATTTTCCACGCATC 5208
Query 4831 TTAAGCAGCAAGTTGGTAACAGCAAAGAGATTCTGCTTGATGTTCATGGTGGAGTTTTGA 4890
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||
Sbjct 5209 TAAAGCAGCAAGTTGGTAACAGCAAAGAGATTCTGGTGGATGTTAATGGTGGAATTTTGA 5268
Query 4891 GCTTTGGTAAGCATAATGAAGATAGAGCCGAGTCCTCAAGCGCTAAGGATGAAGGTAACA 4950
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5269 GCTTTGGTAAGCATAACGAAGATAGAGCTGAGTCCTCAAGCGCTAAGGATGAAGGTAACA 5328
Query 4951 TAGGAGGGGTAAATGGTGTAGCAGAGGCAGCCACGTGA 4988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5329 TAGGAGGGGTAAATGGTGTAGCAGAGGCAGCCACGTGA 5366
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 249931710026
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5