BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg938705
Length=4565
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G57300.2 | Symbols: INO80 | INO80 ortholog | chr3:21199488-2... 4183 0.0
> AT3G57300.2 | Symbols: INO80 | INO80 ortholog | chr3:21199488-21207885
FORWARD LENGTH=4997
Length=4997
Score = 4183 bits (2265), Expect = 0.0
Identities = 2411/2483 (97%), Gaps = 4/2483 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2085 GGATGCTGGCTTTCATATTTTGATTACTAGCTATCAGCTATTAGTCACCGATGAAAAGTA 2144
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2287 GGATGCTGGCTTTCATATTTTGATTACTAGCTATCAGCTATTAGTCACTGATGAAAAGTA 2346
Query 2145 TTTTCGCCGGGTGAAGTGGCAATACATGGTGCTAGATGAGGCCCAAGCAATCAAGAGTT- 2203
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347 TTTTCGCCGGGTGAAGTGGCAATATATGGTGCTAGATGAGGCCCAAGCAATCAAGAGTTC 2406
Query 2204 CTGCCAGTATAAGATGGAAAACCCTTCTTAGTTTTAACTGTCGGAACCGATTGCTTCTGA 2263
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2407 CT-CCAGTATAAGATGGAAAACCCTTCTTAGTTTTAACTGTCGGAACCGATTGCTTCTGA 2465
Query 2264 CTGGTACTCCAATTCAGAACAACATGGCAGAGTTATGGGCCCTGCTGCATTTCATCATGC 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 CTGGTACTCCAATTCAGAACAACATGGCAGAGTTATGGGCCCTGCTGCATTTCATCATGC 2525
Query 2324 CAATGTTGTTTGACAACCATGATCAATTTAATGAGTGGTTCTCAAAAGGAATTGAGAATC 2383
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2526 CAATGTTGTTTGACAACCATGATCAATTTAATGAATGGTTCTCAAAAGGAATTGAGAATC 2585
Query 2384 ATGCTGAACACGGAGGCACTTTAAATGAGCACCAGCTTAACAGACTGCATGCGATTTTGA 2443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2586 ATGCTGAACACGGAGGCACTTTAAATGAGCACCAGCTTAACAGACTGCATGCGATCTTGA 2645
Query 2444 AACCGTTCATGCTTCGACGGGTAAAGAAGGATGTGGTTTCTGAGCTAACTACAAAGACGG 2503
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646 AACCGTTCATGCTTCGACGGGTAAAAAAGGATGTGGTTTCTGAGCTAACTACAAAGACGG 2705
Query 2504 AAGTTACAGTACACTGCAAGCTCAGTTCGCGACAACAAGCTTTTTATCAGGCTATTAAGA 2563
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2706 AAGTTACAGTACACTGCAAGCTCAGTTCTCGACAACAAGCTTTTTATCAGGCTATTAAGA 2765
Query 2564 ACAAAATTTCTCTGGCTGAGTTGTTTGATAGCAACCGCGGACAATTTACTGATAAGAAAG 2623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2766 ACAAAATTTCTCTGGCTGAGTTGTTTGATAGCAACCGCGGACAATTTACTGATAAGAAAG 2825
Query 2624 TACTGAATTTAATGAATATTGTCATTCAACTTAGGAAGGTTTGCAACCATCCAGAGTTGT 2683
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2826 TATTGAATTTAATGAATATTGTCATTCAACTAAGGAAGGTTTGCAACCATCCAGAGTTGT 2885
Query 2684 TCGAAAGGAATGAAGGGAGCTCGTATCTCTACTTTGGAGTAACTTCCAATTCTCTTTTAC 2743
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2886 TCGAAAGGAATGAAGGGAGCTCGTATCTCTACTTTGGAGTGACTTCCAATTCTCTTTTGC 2945
Query 2744 CCCATCCCTTTGGTGAGCTAGAGGATGTACATTATTCTGGTGGTCAAAATCCGATAATAT 2803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 CCCATCCCTTTGGTGAGCTAGAGGATGTACATTATTCTGGTGGTCAAAATCCGATAATAT 3005
Query 2804 ACAAGATGCCTAAACTACTACACCAAGAGGTCCTCCAAAATTCTGAAACATTTTGTTCTT 2863
||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006 ACAAGATACCTAAGCTACTACACCAAGAGGTGCTCCAAAATTCTGAAACATTTTGTTCTT 3065
Query 2864 CCGTCGGGCGTGGCATCTCAAGAGAATCCTTTCTGAAGCATTTTAATATATATTCACCTG 2923
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3066 CTGTCGGGCGTGGCATCTCAAGAGAATCTTTTCTGAAGCATTTTAATATATATTCACCTG 3125
Query 2924 AGTATATTCTTAGGTCAATATTCCCATCTGATAGTGGGGTAGATCAAATGGTTAGTGAAA 2983
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 3126 AGTATATTCTTAAGTCAATATTCCCATCTGATAGTGGGGTAGATCAAGTGGTTAGTGGAA 3185
Query 2984 GTGGAGCATTTGGCTTTTCACGCTTGATGGATCTATCACCGGT-AGAAGTTGGATATCTG 3042
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 3186 GTGGAGCATTTGGCTTTTCACGCTTGATGGATCTATCACCA-TCAGAAGTTGGATATCTG 3244
Query 3043 GCGCTGTGTTCTGTTGCAGAAAGGCTATTATTCTCTATACTGAGATGGGAGCGGCAATTT 3102
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3245 GCTCTGTGTTCTGTTGCAGAAAGGCTATTATTTTCTATACTGAGGTGGGAGCGGCAATTT 3304
Query 3103 TTGGATGAATTAGTGAACTCTCTTATGGAATCCAAGGATGATGATCTTAGTGACAATAAC 3162
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3305 TTGGATGAATTAGTTAACTCTCTTATGGAGTCCAAGGATGGTGATCTTAGTGACAATAAC 3364
Query 3163 ATCGAGAGAGTTAAAACCAAAGCTGTCACAAGAATGTTACTGATGCCATCAAAAGTTGAA 3222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3365 ATCGAGAGAGTTAAAACCAAAGCTGTCACAAGAATGTTGCTGATGCCATCAAAAGTTGAA 3424
Query 3223 ACGAATTTTCAGAAAAGGAGACTAAGCACAGGGCCTACCCGTCCTTCATTTGAAGCGCTA 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3425 ACGAATTTTCAGAAAAGGAGACTAAGCACAGGGCCTACCCGTCCTTCATTTGAAGCGCTA 3484
Query 3283 GTGATCTCTCATCAGGATAGGCTTCTTTCAAATATCAAACTCCTGCATTCTGCATATACT 3342
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3485 GTGATCTCTCATCAGGATAGGTTTCTTTCAAGTATCAAACTCCTGCATTCTGCATATACT 3544
Query 3343 TATATCCCAAAAGCCAGAGCTCCACCGGTAAGCATTCATTGCTCGGACAGAAATTCTGCA 3402
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3545 TATATCCCAAAAGCCAGAGCTCCACCTGTAAGCATTCATTGCTCGGACAGAAATTCGGCA 3604
Query 3403 TACAGAGTTACAGAAGAATTACATCAACCATGGCTCAAGAGACTATTAATCGGTTTTGCA 3462
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3605 TACAGAGTTACAGAAGAATTACATCAACCATGGCTTAAGAGACTATTAATCGGTTTTGCA 3664
Query 3463 CGTACATCAGAAGCTAACGGACCCAGGAAGCCGAACAGCTTTCCACATCCTTTAATCCAA 3522
|| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3665 CGAACGTCAGAAGCTAATGGACCCAGGAAGCCTAACAGCTTTCCACATCCTTTAATCCAA 3724
Query 3523 GAAATTGATTCAGAACTTCCACTTGTGCAGCCTGCGCTACAACTGACACACAGAATATTT 3582
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3725 GAAATTGATTCAGAACTTCCAGTTGTGCAGCCTGCGCTTCAACTGACACACAGAATATTT 3784
Query 3583 GGTTCTTGCCCTCCAATGCAAAGTTTCGACCCAGCAAAGTTGCTCACGGACTCTGGGAAG 3642
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3785 GGTTCTTGCCCTCCAATGCAAAGTTTTGACCCAGCAAAGTTGCTCACGGACTCTGGGAAG 3844
Query 3643 CTGCAGACACTTGATATATTATTGAAGCGGCTTCGAGCTGGAAATCACAGGGTGCTCCTC 3702
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3845 CTGCAGACACTTGATATATTATTGAAGCGGCTTCGAGCTGGAAATCACAGGGTGCTCCTG 3904
Query 3703 TTTGCACAAATGACAAAGATGCTGAACATTCTTGAGGATTACATGAACTATAGAAAGTAC 3762
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3905 TTTGCACAAATGACAAAGATGCTGAACATTCTCGAGGATTATATGAACTATAGAAAGTAC 3964
Query 3763 AAGTACCTCAGGCTTGATGGATCCTCCACCATCATGGATCGCCGAGATATGGTTAGGGAT 3822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3965 AAGTACCTCAGGCTTGATGGATCCTCCACCATCATGGATCGCCGAGATATGGTTAGGGAT 4024
Query 3823 TTTCAGCATAGGAGCGATATTTTTGTATTCTTGCTGAGCACGAGAGCTGGAGGACTTGGT 3882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4025 TTTCAGCATAGGAGCGATATTTTTGTATTCTTGCTGAGCACCAGAGCTGGAGGACTTGGT 4084
Query 3883 ATCAACTTGACGGCTGCAGACACTGTCATTTTCTATGAAAGTGATTGGAATCCCACCTTG 3942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4085 ATCAACTTGACGGCTGCAGACACTGTCATTTTCTATGAAAGTGATTGGAATCCCACCTTG 4144
Query 3943 GATTTACAAGCTATGGACAGAGCTCATCGTCTTGGACAGACAAAAGATGTTACTGTGTAT 4002
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4145 GATTTACAAGCTATGGACAGGGCTCATCGTCTTGGACAGACAAAAGATGTTACTGTTTAT 4204
Query 4003 CGGCTCATCTGCAAGGAGACGGTGGAAGAGAAAATTTTGCACAGGGCAAGTCAGAAAAAT 4062
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4205 CGTCTCATCTGTAAGGAGACGGTGGAAGAGAAAATTTTGCACAGGGCAAGTCAGAAAAAT 4264
Query 4063 ACAGTTCAACAGCTTGTTATGACTGGAGGGCATGTTCAGGGTGATGATTTTCTTGGAACT 4122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4265 ACAGTTCAACAGCTTGTTATGACTGGAGGGCATGTTCAGGGTGATGATTTTCTTGGAGCT 4324
Query 4123 GCGGATGTGGTATCGCTGCTAATGGATGATGCAGAGGCAGCACAACTGGAGCAGAAATTC 4182
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4325 GCGGATGTGGTATCTCTGCTAATGGATGATGCGGAGGCAGCACAACTGGAGCAGAAATTC 4384
Query 4183 AGAGAACTACCATTACAGGTAAAGGACAGGCAGAAGAAAAGGACGAAATGTATCAGAATA 4242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 4385 AGAGAACTACCATTACAGGTAAAGGACAGGCAGAAGAAAAAGACGAAACGTATCAGAATA 4444
Query 4243 GATGCTGAAGGAGATGCAACTTTGGAAGAGTTAGAAGATACTGAACGACAAGATAACGGA 4302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||
Sbjct 4445 GATGCTGAAGGAGATGCAACTTTGGAAGAGTTAGAAGATGTTGACCGACAGGATAACGGA 4504
Query 4303 CAGGAACCTTTGGAAGAACCGGAAAAGACAAAACCCAGTAACAAAAAGAGGAGAGCTGCT 4362
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4505 CAGGAACCTTTGGAAGAACCGGAAAAGCCAAAATCCAGTAATAAAAAGAGGAGAGCTGCT 4564
Query 4363 TCAACTCCGAAATCTAGAGCTCCTCAGAAAGCAAAGGAAGAAGCAAATGGTGAAGATACT 4422
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4565 TCAAATCCGAAAGCTAGAGCTCCTCAGAAAGCAAAGGAAGAAGCAAATGGTGAAGATACT 4624
Query 4423 CCTCAAAGGACAAAAAGGGTAAAGAGACAAACAAAGAGCATAAACGAGAGTCTTGAACCT 4482
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4625 CCTCAGAGGACAAAAAGGGTAAAGAGACAAACAAAGAGCATAAACGAAAGTCTTGAACCT 4684
Query 4483 GTCTTCTCTGCCTCTGTTACAGAAACAAATAGAGGATTCGATCCAAGTAGCTCCGCCAAC 4542
|| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4685 GTATTCTCTGCCTCTGTAACAGAATCAAATAAAGGATTCGATCCAAGTAGCTCCGCTAAC 4744
Query 4543 TAATCTGAAGATGATTAGAGCTT 4565
||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4745 TAATCCGAAGATGATTAGAGCTT 4767
Score = 3518 bits (1905), Expect = 0.0
Identities = 2018/2074 (97%), Gaps = 1/2074 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATTCTCTT-CTGTCTCTCATGGATCCTTCAAGACGACCACCGAAGGACTCTCCTTA 59
||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103 TGTTATTCTCTTCCCGTCTCTCATGGATCCTTCAAGACGACCACCGAAGGACTCTCCTTA 162
Query 60 CGCGAATCTCTTCGATCTCGAGCCGTTGATGAAGTTCAGAATTCCGAAACCTGAAGATGA 119
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 CGCGAATCTATTCGATCTCGAGCCGTTGATGAAGTTTAGAATTCCGAAACCTGAAGATGA 222
Query 120 AGTTGATTATTATGGGAGTAGTAGCCAGGATGAAAGTAGAAGCACTCAAGGTGGGGTAGT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTTGATTATTATGGGAGTAGTAGCCAGGATGAAAGTAGAAGCACTCAAGGTGGGGTAGT 282
Query 180 GGCAAACTACAGCAATGGGTCTAAATCGAGAATGAATGTGAACTCCAAGAAGAGAAAGCG 239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 283 GGCAAACTACAGCAATGGGTCTAAATCGAGAATGAATGCGAGCTCCAAGAAGAGAAAGCG 342
Query 240 GTGGACAGAAGCTGATGATGCAGAGGATGATGATGACCTCTACAATCAACATGTTACTGA 299
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 GTGGACAGAAGCTGAGGATGCAGAGGACGATGATGATCTCTACAATCAACATGTTACTGA 402
Query 300 GGAGCACTACCGATCAATGCTTGGGGAGCATGTACAAAAATTCAAAACTAGGTCCAAGGA 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 403 GGAGCACTACCGATCAATGCTTGGGGAGCATGTACAAAAATTCAAAAATAGGTCCAAGGA 462
Query 360 GTCTCAAGGGAATCCTCCACATCTGATGGGTGTTCCGGTGCTAAAGAGCAATGTGGGCAG 419
| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 463 GACTCAAGGGAATCCTCCTCATCTGATGGGTTTTCCGGTGCTAAAGAGCAATGTGGGCAG 522
Query 420 TTACAGAGGTAGGAAACCAGTGAATGATCACTATGGGAGATTCTATGATATGGACAGCTC 479
|||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||
Sbjct 523 TTACAGAGGTAGGAAACCAGGGAATGATTACCATGGGAGGTTCTATGACATGGACAACTC 582
Query 480 TCCAAATTTTGCTGCTGATGTGATCCCACATAGGCGAGGAAGCTACCATGATCGTGATAT 539
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 TCCAAATTTTGCAGCTGATGTGACCCCACATAGGCGAGGAAGCTACCATGATCGTGATAT 642
Query 540 TACCCCCAAAATAGCATATGAACCTTCGTATTTGGACATTGGTGATGGTGTCATCTACAA 599
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TACACCCAAGATAGCATATGAACCTTCGTATTTGGACATTGGTGATGGTGTCATCTACAA 702
Query 600 AATCCCCCCAAGCTATGACAAGCTGGTGGCATCATTAAACTTACCAAGCTTTTCAGATAT 659
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 703 AATCCCCCCAAGTTATGACAAGCTGGTGGCATCATTAAACTTACCGAGCTTTTCAGACAT 762
Query 660 TCATGTGGAAGAATTTTACTTGAAAGGAGCTCTGGATCTGAGATCATTAGCAGAACTGAT 719
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 TCATGTGGAAGAATTTTACTTGAAAGGAACTCTGGATCTGAGATCATTAGCAGAACTGAT 822
Query 720 GGCTAGTGATAAAAGGTCTGGAGTAAGAAGCCGTAATGGAATGGGTGAGCCTCGACCTCA 779
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 GGCAAGTGATAAAAGGTCTGGAGTAAGAAGCCGTAATGGAATGGGTGAGCCTCGACCTCA 882
Query 780 ATATGAATCTCTTCAAGCTAGAATGAAGGCCCTGTCACCTTCAAACTCCACCCTAAATTT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 883 ATATGAATCTCTTCAAGCTAGAATGAAGGCCCTGTCACCTTCAAACTCCACCCCAAATTT 942
Query 840 TAGCCTCAAGGTGTCAGAAGCTGCAATGAATTCTGCCATTCCAGAAGGATCTGCTGGAAG 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 TAGCCTCAAGGTGTCAGAAGCTGCAATGAATTCTGCCATTCCAGAAGGATCTGCTGGAAG 1002
Query 900 TACTGCACGAACAATTCTGTCTGAGGGTGGTGTTTTACAGGTCCATTACGTGAAGGTTCT 959
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1003 TACTGCACGGACAATTCTGTCTGAGGGTGGTGTTTTACAGGTCCATTACGTGAAGATTCT 1062
Query 960 GGAGAAGGGGGATACATACGAGATTGTTAGACGAAGTCTACCGAAGAAGCTGAAAGCGAA 1019
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1063 GGAGAAGGGGGATACATACGAGATTGTTAAACGAAGTCTACCGAAGAAGCTGAAAGCAAA 1122
Query 1020 GAATGATCCTGCAGTCATTGAGAAAACAGAAAGGGATAAAATTAGAAAAGCCTGGATCAA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 GAATGATCCTGCAGTCATTGAGAAAACAGAAAGGGATAAAATTAGAAAAGCCTGGATCAA 1182
Query 1080 TATAGTCAGAAGAGATATAGCAAAACACCATAAAATTTTCACTACTTTCCATCGAAAACT 1139
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1183 TATTGTCAGAAGAGATATAGCAAAACACCATAGAATTTTCACTACTTTTCATCGTAAACT 1242
Query 1140 ATCAATTGATGCCAAGAGGTTTGCAGATGGTTGCCAAAGAGAGGTGCGAATGAAGGTGGG 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1243 ATCAATTGATGCCAAGAGGTTTGCAGATGGTTGCCAAAGAGAGGTGAGAATGAAGGTGGG 1302
Query 1200 TAGATCATACAAAATCCCAAGGACTGCACCGATTCGCACTAGGAAGATATCCAGAGACAT 1259
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 TAGATCATACAAAATCCCAAGAACTGCACCAATTCGCACTAGGAAGATATCCAGAGACAT 1362
Query 1260 GCTGCTATTCTGGAAGCGACATGACAAGCAGATGGCAGAAGAGAGGAAAAAGCAAGAAAA 1319
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 GCTGCTATTCTGGAAGCGATATGACAAGCAGATGGCAGAAGAGAGGAAAAAGCAAGAAAA 1422
Query 1320 GGAAGCTGCAGAGGCTTTTAAACGTGAACAGGAGCTTCGAGAGGCAAAAAGGCAGCAACA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1423 GGAAGCTGCAGAGGCTTTTAAACGTGAACAGGAGCAGCGAGAGTCAAAAAGGCAGCAACA 1482
Query 1380 AAGGCTCAATTTTCTTATTAAACAGACTGAGCTTTACAGTCACTTCATGCAAAACAAGAC 1439
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 AAGGCTCAATTTCCTTATTAAACAGACTGAGCTTTACAGTCACTTCATGCAAAACAAGAC 1542
Query 1440 CGATTCAAATCCTTCCGAAGCCTTACCAATAGGTGATGAAAATCCGATTGACGAAGTGCT 1499
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 CGATTCGAATCCTTCCGAAGCCTTACCAATAGGTGATGAAAATCCGATTGACGAAGTGCT 1602
Query 1500 CCCAGAAACTTCAGCAGCAGGACCTTCTGAGGTGGAGGATCCTGAAGAGGCTGAACTGAA 1559
||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 CCCAGAAACTTCAGCGGCAGAACCTTCTGAGGTAGAGGATCCTGAAGAGGCTGAACTGAA 1662
Query 1560 GGAAAAGGTCCTGAGAGCTGCCCAAGATGCGGTGTCTAAGCAGAAGCAAATAACAGATGC 1619
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 GGAAAAGGTCTTGAGAGCTGCCCAAGATGCGGTGTCTAAGCAGAAGCAAATAACAGATGC 1722
Query 1620 ATTTGACACTGAATATATGAAGCTACGCCAAACTTCTGAAATGGAAGGTCCTTTGAATGA 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1723 ATTTGACACTGAATATATGAAGCTACGCCAAACTTCTGAAATGGAAGGTCCTTTAAATGA 1782
Query 1680 TATATCAGTTTCTGGCTCGAGCAATATAGATTTGCATAACCCATCTACAATGCCTGTTAC 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 TATATCAGTTTCTGGCTCGAGCAATATAGATTTGCATAACCCATCTACAATGCCTGTTAC 1842
Query 1740 ATCAACAGTTCAGACTCCAGAGTTATTTAAAGGAACCCTTAAAGAATACCAAATGAAAGG 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 ATCAACAGTTCAGACTCCAGAGTTATTTAAAGGAACCCTTAAAGAATACCAAATGAAAGG 1902
Query 1800 CCTTCAGTGGCTAGTCAATTGTTATGAGCAGGGTTTGAATGGCATACTTGCTGATGAAAT 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 CCTTCAGTGGCTAGTCAATTGTTATGAGCAGGGTTTGAATGGCATACTTGCTGATGAAAT 1962
Query 1860 GGGCTTGGGTAAGACTATTCAAGCTATGGCTTTCTTGGCACATTTGGCTGAGGAAAAGAA 1919
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 GGGCTTGGGTAAGACTATTCAAGCTATGGCGTTCTTGGCACATTTGGCTGAGGAAAAGAA 2022
Query 1920 CATTTGGGGTCCATTTCTGGTTGTTGCCCCTGCCTCTGTTCTTAACAATTGGGCTGATGA 1979
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 CATTTGGGGTCCATTTCTTGTTGTTGCCCCTGCCTCTGTTCTTAACAATTGGGCTGATGA 2082
Query 1980 AATCAGTCGTTTCTGTCCTGATTTGAAAACTCTTCCATATTGGGGAGGATTGCAAGAACG 2039
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2083 AATCAGTCGTTTCTGTCCTGACTTGAAAACTCTTCCATATTGGGGAGGATTACAAGAACG 2142
Query 2040 AACAATTTTAAGAAAGAATATCAATCCCAAGCGT 2073
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 AACAATTTTAAGAAAGAATATCAATCCCAAGCGT 2176
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 227657587334
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5