BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg938922
Length=5845
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G59100.1 | Symbols: ATGSL11, gsl11 | glucan synthase-like 11... 6501 0.0
AT5G13000.1 | Symbols: ATGSL12, gsl12 | glucan synthase-like 12... 60.2 2e-07
> AT3G59100.1 | Symbols: ATGSL11, gsl11 | glucan synthase-like
11 | chr3:21843407-21853860 FORWARD LENGTH=5766
Length=5766
Score = 6501 bits (3520), Expect = 0.0
Identities = 3710/3805 (98%), Gaps = 0/3805 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2015 GCCAAAACTATATGTTGGAAGAGGTATGCATGAGGACATGTTCTCTCTCTTCAAGTATAC 2074
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956 GCCAAAACTATACGTTGGAAGAGGTATGCATGAGGACATGTTCTCTCTCTTCAAGTATAC 2015
Query 2075 CACCTTCTGGATCATGCTACTGATCAGCAAGCTTGCTTTCAACTATTATGTGGAGATACT 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2016 CACCTTCTGGATCATGCTACTGATCAGCAAGCTTGCTTTCAACTATTATGTGGAGATACT 2075
Query 2135 ACCCCTTATTACGCCAACAAAGATGATCATGAATCTGCACATTGGTCACTACCAGTGGCA 2194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2076 ACCCCTTATTACGCCAACAAAGATGATCATGAATCTGCACATTGGTCACTACCAGTGGCA 2135
Query 2195 TGAATTTTTTCCCCATGCAACTAACAATATTGGAGTGGTTATTGCTATATGGGCTCCAAT 2254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136 TGAATTTTTTCCCCATGCAACTAACAATATTGGAGTGGTTATTGCTATATGGGCTCCAAT 2195
Query 2255 TGTACTGGTTTACTTGATGGATACTCAAATATGGTACGCCATATTTTCCACTCTGTTTGG 2314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2196 TGTACTGGTTTACTTGATGGATACTCAAATATGGTACGCCATTTTTTCCACTCTGTTTGG 2255
Query 2315 AGGCATACATGGGGCCTTCAGTCATCTGGGAGAAATACGGACTCTTGGGATGTTGCGGTC 2374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2256 AGGCATACATGGGGCCTTCAGTCATCTGGGAGAAATACGGACTCTTGGGATGTTGCGATC 2315
Query 2375 TAGATTTGAGTCAATACCAACTGCCTTCAGCCGCACCCTCATGCCATCAGAAGATGCAAA 2434
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2316 TAGATTTGAGTCAATACCAATTGCCTTCAGCCGCACCCTCATGCCATCCGAAGATGCAAA 2375
Query 2435 AAGAGAACATGCTGATGACTATGTGGACCAGAAAAACATCACTAATTTCTCCCAGGTGTG 2494
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2376 AAGAAAACATGCGGATGACTATGTGGACCAGAAAAACATCACTAATTTCTCCCAGGTGTG 2435
Query 2495 GAACGAGTTCATTTACTCTATGAGAAGCGAGGATAAGATCAGTGACAGAGATAGGGATTT 2554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436 GAACGAGTTCATTTACTCTATGAGAAGCGAGGATAAGATCAGTGACAGAGATAGGGATTT 2495
Query 2555 GCTGCTTGTACCTTCTTCTTCGGGTGATGTGTCTGTCATCCAGTGGCCACCTTTCTTGCT 2614
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2496 GCTGCTTGTACCATCTTCGTCGGGTGATGTGTCTGTCATCCAGTGGCCACCTTTCTTGCT 2555
Query 2615 TGCTAGTAAGATTCCTATTGCTGTGGACATGGCAAAAGATTTCAGGGGAAAAGAGGATGC 2674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2556 TGCTAGTAAGATTCCTATTGCTGTGGACATGGCAAAAGATTTCAAGGGAAAAGAGGATGC 2615
Query 2675 TGAACTATTTAGAAAGATTAAGAGTGATAGCTACATGTATTTTGCTGTTATTGAGAGTTA 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2616 TGAACTATTTAGAAAGATTAAGAGTGATAGCTACATGTATTATGCTGTTATTGAGAGTTA 2675
Query 2735 TGAGACATTGAAGAAAATAATTTACGCTCTACTGGAAGATGAAGCAGATAGAAGGGTCAT 2794
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2676 TGAGACATTGAAGAAAATAATTTACGCTCTTCTGGAAGATGAAGCAGATAGAAGGGTCAT 2735
Query 2795 GAATCAGGTATTTTTGGAAGTGGACATGAGCATACAGCAACAGAGATTCATATATGAATT 2854
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 GAATCAGGTATTTTTAGAAGTGGACATGAGCATGCAGCAACAGAGATTCATATATGAATT 2795
Query 2855 CCGGATGAGTGGATTGCCGCTCCTTAGTGATAAGTTGGAGAAGTTTCTAAGTATATTGTT 2914
||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2796 CCGCATGAGTGGATTACCGCTCCTTAGTGATAAGCTGGAGAAGTTTCTAAGTATATTGTT 2855
Query 2915 AAGTGACTATGAAGACCAGGGTACATACAAGTCTCAATTAATTAATGTCTTCCAGGATGT 2974
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2856 AAGTGACTATGAAGACCAGGGTACATACAAGTCTCAGTTAATTAATGTCTTCCAGGATGT 2915
Query 2975 TATCGAAATTATTACTCAAGATCTCTTGGTTAATGGGCATGAAATTCTTGAAAGGGCTCG 3034
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2916 TATCGAAATTATCACTCAAGATCTCTTGGTTAATGGGCATGAAATTCTTGAAAGGGCTCG 2975
Query 3035 GGTTCATTCTCCTGACATCAAAAATGATAAAAAGGAACAGAGGTTTGAGAAAATTAATAT 3094
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2976 TGTTCATTCTCCTGACATCAAAAATGAGAAAAAGGAACAGAGGTTTGAGAAAATTAATAT 3035
Query 3095 TCACCTCGTAGGGGATAAATGCTGGCGGGAGAAGGTTATTCGACTTCATTTGCTCTTGTC 3154
||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3036 CCACCTAGTACGGGATAGATGTTGGCGGGAAAAGGTTATTCGGCTTCATTTGCTCTTATC 3095
Query 3155 GGTCAAAGAATCTGCAATAAATGTTCCTCAAAACTTGGAAGCTCGCCGCCGTATCACATT 3214
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3096 GGTCAAAGAATCTGCAATAAATGTTCCTCAAAACTTGGAAGCCCGCCGACGTATCACATT 3155
Query 3215 CTTTGCTAATTCTCTGTTTATGAATATGCCTAATGCTCCAAAAATACGAGATATGCTATC 3274
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3156 CTTTGCTAATTCTCTGTTTATGAATATGCCTAGTGCTCCAAGAATACGAGATATGCTATC 3215
Query 3275 TTTCAGTGTTTTAACTCCTTACTACAAAGAAGATGTTCTCTATTCAGAGGAGGACCTTAA 3334
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3216 TTTCAGTGTTTTAACTCCTTACTACAAAGAAGATGTGCTGTATTCAGAGGAAGACCTTAA 3275
Query 3335 CAAGGAAAATGAAGATGGGATCTCAATACTGTTTTACCTACAAAAGATTTATCCTGATGA 3394
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3276 CAAGGAAAATGAAGATGGGATCTCAATTCTGTTTTATCTACAAAAGATTTATCCTGATGA 3335
Query 3395 GTGGACCAATTATTTGGATCGCTTAAATGATCCTAAGCTTCCTGAGAAAGACAAGTCAGA 3454
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3336 GTGGACCAATTATTTGGATCGCTTAAAGGATCCTAAGCTTCCTGAGAAAGACAAGTCAGA 3395
Query 3455 GTTCCTTCGAGAGTGGGTATCTTACAGAGGTCAGACGCTAGCCAGAACAGTTAGGGGTAT 3514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3396 GTTCCTTCGAGAGTGGGTATCTTACAGAGGTCAGACGTTAGCCAGAACAGTTAGGGGTAT 3455
Query 3515 GATGTACTATAGGCAGGCTTTGGAGCTTCAATGCTACCAGGAAGTTGCAGGGGAACAAGC 3574
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3456 GATGTACTATAGACAGGCTCTGGAGCTTCAATGCTACCAGGAAGTTGCAGGGGAACAAGC 3515
Query 3575 CGAATTTAGTGTCTCCCGGGCCATGGCGTCCAATGATGATAATCAGAAAGCTTTCCTGGA 3634
||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 3516 CGAGTTTAGTGTCTTTCGGGCCATGGCGTCCAACGATGAAAATCAGAAGGCTTTCCTGGA 3575
Query 3635 ACGTGCTAAAGCTCTTGCAGATCTGAAGTTCACTTATGTTGTTTCTTGTCAGGTCTACGG 3694
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3576 ACGTGCCAGAGCTCTTGCAGATCTGAAGTTCACTTATGTTGTTTCTTGTCAGGTCTACGG 3635
Query 3695 AAATCAGAAAAAGTCCAGTGATATTCACAACCGTAGTTGCTACACGAATATTCTGCAGCT 3754
|||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3636 AAATCAGAAAAAGTCCGGTGATATCCACAACCGCAGCTGCTACACGAATATTCTGCAGCT 3695
Query 3755 CATGCTGAAATATCCATCATTACGGGTTGCTTATGTAGATGAGAGGGAGGGGACAGCAGA 3814
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3696 CATGCTAAAATATCCATCATTGCGGGTTGCTTATGTAGATGAGAGGGAGGAGACAGCAGA 3755
Query 3815 TGCAAAATCTCCTAAGGTCTTTTACTCTGTACTTCTAAAGGGAGGTGACAAGTTTGATGA 3874
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3756 TGCAAAATCTCCGAAGGTCTTTTACTCTGTACTTCTAAAAGGAGGTGACAAGTTTGATGA 3815
Query 3875 GGAAATTTACCGCATAAAGCTTCCTGGTCCTCCAGCTGAGATTGGTGAAGGAAAGCCTGA 3934
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3816 GGAAATTTACCGCATCAAGCTTCCTGGTCCTCCAGCTGAGATTGGTGAAGGAAAGCCTGA 3875
Query 3935 AAATCAAAATCATGCTATCATATTTACACGTGGTGAAGCACTACAAACTATAGATATGAA 3994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3876 AAATCAAAATCATGCTATCATATTTACACGTGGTGAAGCACTACAAACTATAGATATGAA 3935
Query 3995 TCAAGACAATTACTTTGAAGAAGCTTTCAAACTAAGAAATGTATTGGAGGAATTCAATAA 4054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3936 TCAAGACAATTACTTTGAAGAAGCTTTCAAACTAAGAAATGTATTGGAGGAATTCAATAA 3995
Query 4055 GGAGCGTGTTGGTAGACGCAAGCCAACAATTTTGGGTCTCCGAGAACATATATTTACTGG 4114
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3996 GGAGCGTGTTGGTAGACGCAAGCCAACAATATTGGGTCTCCGAGAACATATATTTACTGG 4055
Query 4115 AAGTGTTTCGTCATTAGCTTGGTTCATGTCCAATCAGGAGAGTAGTTTTGTGACAATTGG 4174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4056 AAGTGTTTCGTCATTAGCTTGGTTCATGTCCAATCAGGAGAGTAGTTTTGTGACAATTGG 4115
Query 4175 CCAAAGAATTTTGGCAAACCCTCTGAGGGTCCGTTTTCATTATGGCCATCCTGACATATT 4234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4116 CCAAAGAATTTTGGCAAACCCTCTGAGGGTCCGTTTTCATTATGGTCATCCTGACATATT 4175
Query 4235 TGACAGAATCTTTCACATAACAAGGGGCGGTGTGAGCAAGGCTTCGAAAGTAATAAACTT 4294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4176 TGACAGAATCTTTCACATAACAAGGGGCGGTGTGAGCAAGGCTTCGAAAGTAATAAATTT 4235
Query 4295 GAGTGAGGATATTTTCGGAGGCTTCAATTCAACTCTCCGTGGAGGATATGTTACACATCA 4354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4236 GAGTGAGGATATTTTCGGAGGCTTCAATTCAACTCTCCGTGGAGGATATGTTACACATCA 4295
Query 4355 CGAGTATATCCAAGTTGGAAAGGGACGGGACGTGGGGTTGAACCCAATCTCTATTTTTGA 4414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4296 CGAGTATATCCAAGTTGGAAAGGGACGGGACGTGGGGTTGAACCCAATCTCTATTTTTGA 4355
Query 4415 AGCAAAAGTAGCAAATGGAAACGGGGAGCAAACGCTAAGCCGTGATGTTTACCGTTTGGG 4474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4356 AGCAAAAGTAGCAAATGGAAACGGGGAGCAAACGCTAAGCCGTGATGTTTACCGTTTGGG 4415
Query 4475 GCATCGGTTTGACTTTTACAGGATGCTCTCATTCTATTTTACGACCATTGGATTCTATTT 4534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4416 GCATCGGTTTGACTTTTACAGGATGCTCTCATTCTATTTTACGACCATTGGATTCTATTT 4475
Query 4535 TAGTAGCATGCTCACCGTTCTTACTGTATATGCATTCCTGTATGGACGTATGTACATGGT 4594
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4476 TAGTAGCATGCTCACCGTTCTTACTGTATATGCATTCCTGTATGGACGGATGTACATGGT 4535
Query 4595 TATGAGCGGATTGGAGAAAGAGATTTTGCGACTCGCAAGCCCGAATCAGCTTGAGGCTCT 4654
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4536 TATGAGCGGATTGGAGAAAGAGATTTTGAGACTCGCAAGCCCGAATCAGCTTGAGGCTCT 4595
Query 4655 TGAGCAGGCTCTGGCTACACAGTCAATATTTCAGCTTGGTTTCTTGATGGTGTTACCGAT 4714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4596 TGAGCAGGCTCTGGCTACACAGTCAATATTTCAGCTTGGTTTCTTGATGGTGTTACCGAT 4655
Query 4715 GGTAATGGAGATTGGCTTGGAACACGGTTTTCGCTCTGCTATAGTCGATTTTTTCATAAT 4774
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4656 GGTAATGGAGATTGGCTTGGAACACGGTTTTCGCTCTGCTATTGTCGATTTTTTCATAAT 4715
Query 4775 GCAGCTGCAGCTAGCCTCGGTATTCTTTACATTCCAGCTTGGGACAAAGTCACATTATTA 4834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4716 GCAGCTGCAGCTAGCCTCGGTATTCTTTACATTCCAGCTTGGGACAAAGTCACATTATTA 4775
Query 4835 TGGGAGAACAATTTTACATGGTGGTTCCAAATATAGACCGACGGGCCGTGGGTTTGTTGT 4894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4776 CGGGAGAACAATTTTACATGGTGGTTCCAAATATAGACCGACGGGCCGTGGGTTTGTTGT 4835
Query 4895 TTTCCATGCTAAGTTTGCGGAGAACTACAGGTTGTATTCGAGAAGTCACTTTGTGAAGGG 4954
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4836 TTTCCATGCCAAGTTTGCGGAGAACTACAGGTTGTATTCGAGAAGTCACTTTGTGAAGGG 4895
Query 4955 ACTAGAGCTGCTTTTATTGCTAGTTGTTTATCAAATCTATGGGCATTCATACCGGAGTTC 5014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4896 ACTAGAGCTGCTTTTATTGCTAGTTGTTTATCAAATCTATGGGCATTCATACCGGAGTTC 4955
Query 5015 AAGCCTTTATCTGTATATCACAGTCTCGATGTGGTTTATGGTTGGTTCTTGGTTGTTCGC 5074
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4956 AAACCTTTATCTGTATATCACAGTCTCGATGTGGTTTATGGTTGGTTCTTGGTTGTTTGC 5015
Query 5075 ACCATTTATATTCAATCCCTCGGGTTTTGAGTGGCAAAAGACGGTTGATGATTGGACTGA 5134
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 5016 ACCATTTATATTCAATCCTTCGGGGTTTGAGTGGCAAAAGACAGTTGACGATTGGACTGA 5075
Query 5135 CTGGAAACGATGGCTCGGAGATCGGGGTGGCATAGGCATCCCGGTTGAAAAAAGCTGGGA 5194
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5076 TTGGAAACGATGGCTTGGAGATCGGGGTGGTATAGGCATCCCGGTTGAAAAAAGCTGGGA 5135
Query 5195 ATCATGGTGGAACGTAGAGCAAGAACACCTCAAACATACAAGTATTAGAGGGAGGATTCT 5254
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5136 ATCGTGGTGGAACGTAGAGCAAGAACACCTCAAACATACAAGTATTAGAGGGAGGATTCT 5195
Query 5255 GGAAATCACACTTGCTCTCCGCTTTTTCATTTATCAGTACGGAATTGTTTACCAGCTCAA 5314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5196 GGAAATCACACTTGCTCTCCGCTTTTTCATTTATCAGTACGGAATTGTTTACCAGCTCAA 5255
Query 5315 TATCTCTCAGCGCAGCAAGAGCTTTTTGGTTTATGGACTCTCTTGGGTGGTCTTGCTCAC 5374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5256 TATCTCTCAGCGCAGCAAGAGCTTTTTGGTTTATGGACTCTCTTGGGTGGTCTTGCTCAC 5315
Query 5375 ATCATTACTTGTTCTAAAGATGGTATCAATGGGCAGACGAAGATTTGGAACAGATTTTCA 5434
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5316 ATCATTACTTGTTCTAAAGATGGTATCTATGGGCAGACGAAGATTTGGAACAGATTTTCA 5375
Query 5435 GCTAATGTTCAGGATTCTTAAAGCACTTCTCTTCCTCGGCTTTTTGTCAATCATGACTGT 5494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 5376 GCTAATGTTCAGGATTCTTAAAGCACTTCTCTTCCTCGGCTTTTTGTCAGTCATGACAAT 5435
Query 5495 GTTATTTGTTGTGTTCAAACTCACACTCACCGACCTATCTGCTTCAATTCTTGCTTTTCT 5554
|||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5436 ATTATTTGTGGTGTTCAAACTCACACTCACCGATCTCTCTGCTTCAGTTCTTGCTTTTCT 5495
Query 5555 TCCAACCGGGTGGGCGATTCTTCTGATTGGGCAAGTACTGAGGTCACCGATCAAAGCTTT 5614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5496 TCCAACCGGGTGGGCGATTCTTCTGATTGGGCAAGTACTGAGGTCACCGATCAAAGCTTT 5555
Query 5615 AGGGATTTGGGACTCGGTGAAGGAGCTAGGAAGAGCCTATGAGAAGATCATGGGACTTGT 5674
|||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5556 AGGGGTTTGGGACTCGGTGAAAGAGCTAGGAAGAGCGTATGAGAATATCATGGGACTTGT 5615
Query 5675 AATCTTTGCACCAATCGCTGTTCTGTCTTGGTTTCCCATTGTCTCCGAGTTTCAAGCTCG 5734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5616 AATCTTTGCACCAATCGCTGTTCTGTCTTGGTTTCCCATTGTCTCCGAGTTTCAAGCTCG 5675
Query 5735 TCTGCTTTTCAATCAAGCGTTTAGCAGAGGCCTTCAAATCTCTATGATTCTCGCTGGTCG 5794
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5676 TCTGCTTTTCAATCAAGCTTTTAGCAGAGGCCTTCAAATCTCTATGATTCTCGCTGGTCG 5735
Query 5795 GAAAGACAAAGCAGCAACTTCGCAC 5819
||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 5736 GAAAGACAAAGCAACTTCTTCGCAC 5760
Score = 3227 bits (1747), Expect = 0.0
Identities = 1889/1960 (96%), Gaps = 0/1960 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGGAAGCTAGTTCGAGTGGAACGGCGGAATTGCCGCGTTCTCTTTCCCGGAGAGCTCCG 80
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAGCTAGTTCGAGTGGAACGGCGGAGTTGCCGCGGTCTCTTTCTCGGAGAGCTCCG 60
Query 81 TCACGTGCGACTACTATGATGATTGATAGACCAAACGAAGATGCTAGCGCTATGGATAGC 140
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 TCGCGTGCGACTACTATGATGATTGATAGACCAAACGAAGATGCTAGTGCTATGGATAGC 120
Query 141 GAGCTTGTTCCTTCCTCTCTTGCTTCTATTGCTCCGATTCTTCGCGTTGCTAATGAAATT 200
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAGCTTGTTCCTTCCTCTCTCGCTTCTATTGCCCCGATTCTTCGCGTTGCTAATGAAATT 180
Query 201 GAGAAGGATAATCCTCGAGTGGCTTATCTCTGCCGGTTTCATGCGTTTGAGAAGGCTCAT 260
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 GAGAAGGACAATCCTCGAGTGGCTTATCTATGCCGGTTTCATGCGTTTGAGAAAGCTCAT 240
Query 261 AGGATGGATGCTACATCGAGTGGACGCGGTGTTCGTCAGTTTAAGACCTATCTGTTACAT 320
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AGGATGGATGCTACATCCAGTGGACGAGGTGTTCGTCAGTTTAAGACCTATCTGTTACAT 300
Query 321 AGACTGGAGAAGGAAGAAGTGGAAACCAAGCCTCAGCTGGCGAAAAATGATCCTAGAGAA 380
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 AGACTTGAGAAGGAAGAAGAGGAAACCAAGCCTCAGCTGGCGAAAAACGATCCTAGAGAA 360
Query 381 ATTCAGGCATATTACCAGAATTTCTATGAGAAATGTATTAAAGAAGGAGAAACATCAAGA 440
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATTCAGGCATATTACCAGAACTTCTATGAGAAATATATTAAAGAAGGAGAAACATCAAGA 420
Query 441 AAACCGGAAGAGATGGCAAGGCTTTACCAAATTGCTTCGGTATTGTACGATGTACTGAAG 500
|||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAACCGGAGGAAATGGCAAGGCTTTACCAAATTGCATCGGTATTGTACGATGTACTGAAG 480
Query 501 ACTGTAGTACCTTCTCCAAAAGTGGATTACGAGACCCGTAGATATGCAGAAGAAGTTGAA 560
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 481 ACTGTAGTACCTTCACCTAAAGTGGATTACGAGACCCGTAGATATGCCGAAGAAGTTGAA 540
Query 561 AAGAAAAGGGACAGATATGAGCACTACAACATTCTTCCTTTATATGCTGTAGGGACTAAA 620
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGGAAAAGGGATAGATATGAGCACTACAACATTCTTCCTTTATATGCTGTAGGGACTAAA 600
Query 621 CCAGCTATTGTGGAACTTCCTGAGGTCAAGGCTGCATTCAGTGCTGTTTGTAATGTGCGC 680
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 601 CCAGCAATTGTGGAACTTCCTGAGGTCAAGGCTGCATTCAGTGCTGTCCGTAATGTGCGC 660
Query 681 AATCTTCCACGAAGAAGAGTTCACTTGCCATCTAATGCCCCTAATGAAATGCGTAAGGCT 740
|||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AATCTTCCACGACGAAGAATTCATTTGCCATCTAATACCCCTAATGAAATGCGTAAGGCT 720
Query 741 AGAACCAAACTTAATGACATACTTGAATGGCTTGCTTCTGAGTTCGGATTTCAGAGAGGG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 721 AGAACCAAACTTAATGACATACTTGAATGGCTTGCTTCTGAGTTCGGGTTTCAGAGAGGG 780
Query 801 AACGTAGCAAATCAGAGGGAGCACATAATTCTGCTTCTTGCTAATGCTGATATTAGAAAC 860
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 781 AACGTGGCAAATCAGAGGGAGCACATAATACTGCTTCTTGCTAATGCTGACATTAGAAAG 840
Query 861 AGAAATGATGAAGAATATGATGAGTTGAAACCTAGCACCGTCATTGAGTTGATGGACAAA 920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 841 AGAAATGATGAAGAATATGATGAGTTGAAACCTAGCACCGTCACTGAGTTGATGGACAAA 900
Query 921 ACTTTTAAAAGTTATTACTCATGGTGTAAATATTTGCACTCTACGCCTAATCTCAAGTTT 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 901 ACTTTTAAAAGTTATTACTCATGGTGTAAATATTTGCACTCTACGTCTAATCTCAAGTTT 960
Query 981 CCAGAAGGTTGTGATAAACAGCAGCTGCGGCTTATCTATATTTCCCTGTACCTTTTAATA 1040
||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCAGATGATTGTGATAAACAGCAGCTGCAGCTTATCTATATTTCCCTGTACCTTTTAATA 1020
Query 1041 TGGGGCGAAGCCTCAAATGTTAGATTTATGCCCGAATGTATCTGCTATATTTTCCATAAT 1100
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGGGGTGAAGCCTCGAATGTTAGATTTATGCCCGAATGTATCTGCTATATTTTCCATAAT 1080
Query 1101 ATGGCAAATGACGTCTACGGAATTCTGTTTAGCAATGTTGAAGCTGTTAGTGGTGAGACA 1160
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATGGCAAATGACGTCTATGGAATTCTGTTTAGCAATGTTGAAGCTGTTAGTGGTGAGACA 1140
Query 1161 TATGAAACAGAAGAAGTTATTGATGAAGAATCATTTCTGAGAAATGTCATAACTCCAATC 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1141 TATGAAACAGAAGAAGTTATTGATGAAGAATCATTTCTGAGAACTGTTATAACTCCAATC 1200
Query 1221 TATCAGGTCATACGCAAGGAAGCCAGAAGGAACAAGGGGGGCACAGCAAGCCATTCGCAA 1280
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TATCAGGTCATACGCAACGAAGCCAAAAGGAACAAGGGAGGTACAGCAAGCCATTCGCAA 1260
Query 1281 TGGAGAAATTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTCTAAGAAATGCTTCAAGATAGGA 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TGGAGAAATTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTCTAAGAAATGCTTCAAGATAGGA 1320
Query 1341 TGGCCTCTTGACCTTAAAGCAGACTTTTTCCTAAACGCTGACGAGATAACCCCACAGAAC 1400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1321 TGGCCTCTTGACCTTAAAGCAGACTTTTTCCTAAACTCTGACGAGATAACCCCACAGGAC 1380
Query 1401 GAGAGGCTGAATCAAGTCACTTATGGGAAAAGCAAGCCTAAAACCAACTTTGTTGAAGTC 1460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GAGAGGCTGAATCAAGTCACTTATGGGAAAAGCAAGCCTAAAACCAACTTTGTTGAAGTC 1440
Query 1461 CGCACATTCTGGAACCTCTTCAGAGATTTTGATCGAATGTGGATATTTCTTGTCATGGCT 1520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CGCACATTCTGGAACCTCTTCAGAGATTTTGATCGAATGTGGATATTTCTTGTCATGGCT 1500
Query 1521 TTTCAGGCTATGGTAATAGTTGGATGGCATGGTTCTGGGTCTCTAGGCGACATCTTTGAC 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 1501 TTTCAGGCTATGGTAATAGTTGGATGGCATGGTTCTGGGTCACTAGGTGACATATTTGAC 1560
Query 1581 AAGGATGTATTCAAAACGGTGTTAACTATTTTTATTACTTCGGCGTATCTGACTCTTTTA 1640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 AAGGATGTATTCAAAACGGTGTTAACTATTTTTATTACTTCGGCGTATCTGACTCTTTTA 1620
Query 1641 CAAGCTGCACTGGACATTATCCTTAATTTCAATGCTTGGAAGAATTTCAAGTTTTCCCAG 1700
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CAAGCTGCACTGGATATTATCCTAAATTTCAATGCCTGGAAGAATTTCAAGTTTTCCCAG 1680
Query 1701 ATATTGCGGTACCTTTTGAAATTCGCAGTAGCAGCTATGTGGGCAGTGCTGCTTCCAATT 1760
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1681 ATATTGCGGTACCTTTTGAAATTCGCAGTAGCATTTATGTGGGCGGTACTGCTTCCAATT 1740
Query 1761 GCTTACTCGAAGTCTGTCCAACGCCCAACTGGAGTTGTAAAGTTCTTCAGTACTTGGACT 1820
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GCTTACTCGAAGTCTGTTCAACGCCCAACTGGAGTTGTAAAGTTCTTCAGTACTTGGACT 1800
Query 1821 GGGGATTGGAAGGATCAGTCCTTTTATACGTACGCTGTTTTATTTTACGTGTTACCAAAC 1880
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1801 GGGGATTGGAAGGATCAGTCCTTTTATACGTACGCTGTTTCATTTTATGTGTTACCAAAC 1860
Query 1881 ATACTGGCAGCTCTGTTATTCCTCGTTCCACCATTCCGGAGAGCCATGGAGTGTTCAGAC 1940
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 ATATTGGCAGCTCTGTTATTCCTCGTTCCACCATTCCGGAGAGCCATGGAGTGTTCAGAC 1920
Query 1941 ATGCGAATTATCAAGGTTATAATGTGGTGGGCTCAGGCAA 1980
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1921 ATGCGACCTATCAAAGTTATAATGTGGTGGGCTCAGCCAA 1960
> AT5G13000.1 | Symbols: ATGSL12, gsl12 | glucan synthase-like
12 | chr5:4110295-4121427 REVERSE LENGTH=6160
Length=6160
Score = 60.2 bits (32), Expect = 2e-07
Identities = 45/51 (88%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1268 AAGCCATTCGCAATGGAGAAATTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTC 1318
||| || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1367 AAG-CACTCTCAGTGGAGGAACTACGATGATTTGAATGAATACTTTTGGTC 1416
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 291625644597
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5