BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg939002
Length=4931
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G59770.3 | Symbols: SAC9 | sacI homology domain-containing p... 4351 0.0
> AT3G59770.3 | Symbols: SAC9 | sacI homology domain-containing
protein / WW domain-containing protein | chr3:22079033-22086149
REVERSE LENGTH=5308
Length=5308
Score = 4351 bits (2356), Expect = 0.0
Identities = 2566/2669 (96%), Gaps = 8/2669 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2270 AGGGTGCTTCAATACCACGCTGTGCAAATGGTACAAATCTTCTGATACCCTTACCAGGGC 2329
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2413 AGGGTGCTTCAATACCACGCTGTGCAAATGGTACAAATCTTCTGGTACCCTTACCAGGGC 2472
Query 2330 CAATTAGTTCTGAGGATATGGCTGTTACTGGAGCTGGTGCACGTCTTCATGAAAAAGATA 2389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473 CAATTAGTTCTGAGGATATGGCTGTTACTGGAGCTGGTGCACGTCTTCATGAAAAAGATA 2532
Query 2390 CGTCAAGTCTTTCACTGCTATATGATTTTGAAGAACTAGAAGGACAGTTGGATTTCTTAA 2449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533 CGTCAAGTCTTTCACTGCTATATGATTTTGAAGAACTAGAAGGACAGTTGGATTTCTTAA 2592
Query 2450 CCCGTGTAGTTGCTGTTACATTTTATCCAGCTGGTGCTGTTAGAATTCCTATGACTCTTG 2509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2593 CCCGTGTAGTTGCTGTTACATTTTATCCAGCTGGTGCTGTTAGAATTCCTATGACTCTTG 2652
Query 2510 GTCAGATAGAAGTCCTTGGAATTTCTCTTCCATGGAAACGAATGTTTACTTGTGAACGTA 2569
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 GTCAGATAGAAGTCCTTGGAATTTCTCTTCCATGGAAAGGAATGTTTACTTGTGAACGTA 2712
Query 2570 CTGGAGGAAGATTAGCTGAACTTGCAAGAAAACCAGATGAAGATGAAAGTCCTTTTTCAT 2629
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2713 CTGGAGGAAGATTAGCTGAACTTGCAAGGAAACCAGATGAAGATGGAAGTCCTTTTTCAT 2772
Query 2630 CTTGTTCTGACTTGAATCCGTTTGCTTCAACA---TCTTTACAGACTGAAACTGTTTCCA 2686
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2773 CTTGTTCTGACTTGAATCCGTTTGCTGCAACAACATCTTTACAGGCTGAAACTGTTTCCA 2832
Query 2687 CACCAGTACAACAGAAGGATCCCTTTCCCAGTAATCTGCTTGACCTTTTGACAGGAGAGG 2746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2833 CACCAGTACAACAGAAGGATCCCTTTCCCAGTAATCTGCTTGACCTTTTGACAGGAGAGG 2892
Query 2747 ACTCTTCTTCTGACCCCTTCCCACAACCAGTGGTGGAATGTGTTGCAAGTGGAGGAAATG 2806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 2893 ACTCTTCTTCTGACCCCTTCCCACAACCAGTGGTGGAATGTATTGCAAGTGGAGGCAATG 2952
Query 2807 ACATGCTTGATTTCTTAGACCAAGCAGTTGTTGAATATCGCGGCTCTGACACTGTTCCTG 2866
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2953 ACATGCTTGATTTCTTAGACGAAGCAGTTGTTGAATATCGCGGCTCTGACACTGTTCCTG 3012
Query 2867 GCGAGTCTGTCCCACAAGACAAAAGGCCCAAGGACAGTGGTGCTCATCTGTACTTAAATT 2926
|| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3013 ACGGGTCTGTCCCACAAAATAAAAGGCCCAAGGACAGTGGTGCTCATCTGTACTTAAATT 3072
Query 2927 GTCTAAAATCCCTTGCGGGTCCAAACATGGGAAAGAGGCTTGAGTTTGTAGAAGCGATGA 2986
| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3073 GCCTAAAGTCCCTTGCGGGTCCAAACATGGCAAAGAAGCTTGAGTTTGTAGAAGCTATGA 3132
Query 2987 AGCTTGAAATTGAACGTCTACGTCTCAATATTTCTGCAGCAGAAAGAGATAAGGCACTGT 3046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3133 AGCTTGAAATTGAACGTCTACGTCTCAATATTTCTGCAGCAGAAAGAGATAGGGCACTGT 3192
Query 3047 TATCGGTTGGAATGGATCCAGCTACCATTAATCCAAACTCTTCATACGACGAGTCATATA 3106
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3193 TATCGATTGGAATTGATCCAGCTACCATTAATCCAAACTCTTCATACGACGAGTTATATA 3252
Query 3107 TTGGAAGATTATGCAGAATAGCAAATGCACTTGCAGTTATGGGCCAGGCTTCTCTTGAAG 3166
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3253 TTGGAAGATTATGCAAAATAGCAAATGCACTTGCAGTTATGGGCCAGGCTTCTCTTGAAG 3312
Query 3167 ATAAAATTATAGCTTCTATTGGTCTAGGGAAGCTGGAAAATAATGTGATAGATTTCTGGA 3226
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3313 ATAAAATTATAGCTTCTATTGGTCTAGAGAAGCTGGAAAATAATGTGATAGATTTCTGGA 3372
Query 3227 ACATAACCGGAACTGGTGAGGGTTGTGATGGCGGAATGTGTCAAGTCAGAGCCGAGGTCA 3286
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3373 ACATAACCAGAATTGGTGAGGGTTGTGATGGCGGAATGTGTCAAGTCCGAGCCGAGGTCA 3432
Query 3287 ATAAAAGTCCAGTTGGATCTTCTACCAAGAGTTCAGGACGAGAGTCGGGCTCAGTGTTCA 3346
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3433 ATAAAAGTCCAGTTGGATCTTCTACCAAGAGTTCAAGAGGAGAGTCGGGCTCAGTGTTCT 3492
Query 3347 TGTGTTTCCAATGTATGAAAAAAGCTTGCAAGTTTTGTTGTGCTGGAAAAGGAGCTCTTC 3406
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3493 TGTGCTTCCAATGTATGAAAAAAGCTTGCAAGTTTTGTTGTGCTGGAAAAGGAGCTCTTC 3552
Query 3407 TGCTTTCAAAATCTTACTCCAGGGACACTGCGAATGGAGGTGGAAGTCTTGCAGATGTCT 3466
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 TGCTTTCAAAATCCTACTCCAGGGACACTGCGAATGGAGGTGGAAGTCTTGCAGATGTCT 3612
Query 3467 CTGCTACTTCGATAGGTTCAGATCATTACATTTGTAAAAAATGCTGCAGCTCGATAGTGC 3526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3613 CTGCTACTTCGATAGGTTCAGATCATTACATTTGTAAAAAATGCTGCAGCTCGATAGTGC 3672
Query 3527 TTGAAGCCTTGATTGTAGATTATGTAAGGGTCATGATCAGCCTGCGAAGAAGTGGTCGTG 3586
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 3673 TTGAAGCCCTGATTGTAGATTATGTAAGGGTCATGGTCAGCTTGCGAAGAAGTGGCCGTG 3732
Query 3587 TTGATAGTGCTGGTCGGGAAGCTTTGAATGAGATATTTGGATCTAACATTACAAATCATC 3646
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3733 TTGATAATGCTGGTCGGGAAGCTTTGAATGAGGTATTTGGATCTAACATTACAAATCACC 3792
Query 3647 TTGCTGTTAGAGGTCAACCTTCTCCTAATGGAGAAGACTTCAATTTCCTTCGTCAAATTT 3706
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3793 TTGCTGTTAGAGGTCAACCTTCTCCTAATCGAGAAGACTTCAATTTCCTTCGTCAAATTT 3852
Query 3707 TGGGTCAAGAGGAGTCACTTGCTGAGTTCCCATATGCAAGCTTCTTACATAAGGTCGAAA 3766
||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3853 TGGGTAAAGAGGAGTCGCTTTCTGAGTTCCCATTTGCAAGCTTCTTACATAAGGTCGAAA 3912
Query 3767 CTGGGACTGATTCAGCACCATTTTTCTCATTGCTCACCCCTCTGAATCTTGCTTCAAGTA 3826
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3913 CTGCGACTGATTCAGCACCATTTTTCTCATTGCTCACCCCTCTGAATCTTGCTTCAAGTA 3972
Query 3827 ATGCCTACTGGAAAGCTCCTCCGTCTGCAAACTCTGTTGAAGCCGTCATTGTTCTCAACA 3886
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3973 ATGCCTACTGGAAAGCTCCTCCGTCTGCAGACTCTGTTGAAGCCGCCATTGTTCTCAACA 4032
Query 3887 GCCTTTCAGATGTCAGCAGTGTGATTCTACTCGTTAGTCCATGTGGTTACTCTGATGCTG 3946
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4033 CCCTTTCAGATGTCAGCAGTGTGATTCTACTCGTTAGTCCATGTGGTTACTCTGATGCTG 4092
Query 3947 ATGCTCCTACCGTCCAAGTTTGGGCCAGCAGCGACATAAATAAAGAAGCACGGACTTTGA 4006
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4093 ATGCTCCTACCGTCCAAATTTGGGCGAGCAGCGACATAAACAAGGAAGCACGGACTTTGA 4152
Query 4007 TGGGAAAGTGGGATGTACAGTCCTTTATTAGATCTTCGCCTGAGCTGTATGGTCCAGAAA 4066
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||
Sbjct 4153 TGGGAAAGTGGGATGTACAGTCCTTTATTAGATCTTCGCCTGAGCTTTCTGGTTCAGAAA 4212
Query 4067 AGTCTGGTAGAGCACCTAGGCATATAAAATTTGCTTTCAAGAATCCTGTTCGTTGCCGCA 4126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4213 AGTCTGGTAGAGCACCTAGGCATATAAAATTTGCTTTCAAGAATCCTGTCCGTTGCCGCA 4272
Query 4127 TTATATGGATAACACTGCGTCTTCCTCGGCTTGGATCCAG---CTCAGTTAGTTTGGACA 4183
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 4273 TTATATGGATAACACTGCGTCTTCCTAGGCTTGGATCTAGTAGCTCAGTTAGTTTGGACA 4332
Query 4184 AAAACATTAATCTCTTATCTTTGGATGAGAACCCATTTGCTCCAATTCCTCGGCGTGCCT 4243
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4333 AAAACATCAATCTCTTATCTTTGGATGAGAACCCATTTGCTCCAATTCCTCGACGTGCCT 4392
Query 4244 CTTTTGGAGCAACCATTGAGAATGATCCATGTCTTCATGCAAAACGCATCTTGGTCACTG 4303
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4393 CTTTTGGAGCAACCATTGAGAATGATCCATGTATTCATGCAAAACACATCTTGGTCACTG 4452
Query 4304 GAAACACCGTGAGGGATAAAACACTACAAAGTGTTGAGAGCATGAGCATAAGAAACTGGC 4363
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4453 GAAACACCGTGAGGGATAAAACGCTACAAAGTGTTGAGAGCATGAGCGTAAGAAACTGGC 4512
Query 4364 TGGACAGAGCCCCACGTTTGAATAGATTCCTGATACC-TCTAGAGGCTGAGAGACCAATG 4422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4513 TGGACAGAGCCCCACGTTTGAATAGATTCCTGATACCAT-TAGAGACTGAGAGACCAATG 4571
Query 4423 GAGAATGATCTAGTCTTGGAACTTTATCTGCAACCTGCTTCACCTTTAGCTGCTGGATTC 4482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4572 GAGAATGATCTAGTCTTGGAACTTTATCTGCAACCTGCTTCACCTTTAGCTGCTGGATTC 4631
Query 4483 CGTTTAGATGCTTTTAGTGCGATAAAGCCTCGTGTGACCCACTCACCTTCTTCGGATGTA 4542
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 4632 CGTTTAGATGCTTTTAGTGCGATAAAGCCTCGTGTAACCCACTCGCCTTCTTCAGATGTA 4691
Query 4543 GTTGACATATGGGACCCGGCGAGTATCATAATGGAAGATAGACACGTCTCTCCTGCCGTC 4602
|||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 4692 GTTGACATTTGGGACCCGACGAGTGTCATAATGGAAGATAGACACGTCTCTCCGGCCATC 4751
Query 4603 TTGTATATACAAGTATCTGTTCTTCAGGAGCAATACAAAACGGTGACAATTGCGGAATAC 4662
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 4752 TTGTATATACAAGTATCTGTTCTACAGGAGCAATACAAAATGGTGACAATCGCGGAATAC 4811
Query 4663 AGATTGCCTGAGACGAGAGATGGAACAAAGATGTTTTTTGACTTCCCTAAACAGATTCAA 4722
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4812 AGATTGCCTGAGGCGAGAGATGGAACAAAGTTGTATTTTGACTTCCCTAAACAGATACAA 4871
Query 4723 GCACACACAGTTTCGTTTAAGCTGCTAGGAGATGTAGCAGCTTTTGCAGATGATCCCGCA 4782
||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 4872 GCACAGAGAGTATCGTTTAAACTGCTAGGAGATGTAGCAGCTTTTACAGATGAGCCCGCA 4931
Query 4783 GAGGCTGTTGATTTAAGCGGTCGGGCATCTCCATTTGCTGCAGGACTGTCTTTAGCAAAC 4842
|||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4932 GAGGCTGTTGATTTGAGCAGCCGGGCTTCTCCTTTTGCTGCAGGACTGTCTTTAGCAAAC 4991
Query 4843 AGGATCAAGCTATATTACTATGCGGATCCTTACGAAGTAGGCAAATGGGCTAGCCTTTCA 4902
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4992 AGGATCAAGCTATATTACTATGCGGATCCTTACGAAGTAGGCAAATGGACTAGCCTTTCA 5051
Query 4903 AATGTCTGATTTTACTCTCTCACTGGCCG 4931
| ||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 5052 AGTGTCTGATTTTACACTTTCACTGGCCG 5080
Score = 3812 bits (2064), Expect = 0.0
Identities = 2205/2274 (97%), Gaps = 6/2274 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTCTGCTTGGCCCTGAGTTCAGATGGATCTGCATCCACCAGGTGGTTCAAAAAAGACA 60
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 TGGTCCGCTTGGTCCTGAGCTCAGATGGATCTGCATCCACCAGGTGGTTCAAAAAAGACA 155
Query 61 TCTATTGTTGTTGTCACCTTAAACTCTGGTGAAGTCTATGTCATTGCAAGTTTGCTATCT 120
||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 156 TCTGTAGTTGTTGTCACCTTAGACACTGGTGAAGTCTATGTCATTGCAAGTTTGTTATCT 215
Query 121 AAGGCTGATACTCAAGTTATCTATATCGATCCTACGACTGGTATCCTGCGGTACAATGGG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AAGGCTGATACTCAAGTTATCTATATCGATCCTACGACTGGTATCCTGCGGTACAATGGG 275
Query 181 AAGCCTGGTCTTGATAATTTTAAGTCAGAGCGTGAAGCCTTAGACTATATCACGAATGGA 240
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 276 AAGCCTGGCCTTGATAATTTTAAGTCAGAGCGTGAAGCCTTAGATTATATTACGAATGGA 335
Query 241 TCAAGAGGAGGTGTTAGAAACTCAGTTTATGGCAAGGCAATACTCGGCTATGCTG-CGTT 299
||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||
Sbjct 336 TCAAGAGGAGGTGTTAGAAGCTCTGTTTATGCCAGGGCAATACTCGGTTATGCTGTC-TT 394
Query 300 GGGGAGCTTTGGGATGCTTTTAGTTGCCACCAGGCTAAATCCAAGTATTCCAGATTTGCC 359
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 GGGGAGCTTTGGGATGCTTTTAGTTGCGACCAGGCTAAATCCAAGTATTCCAGATTTGCC 454
Query 360 TGGTGGTGGATGTGTTTATACAGTGACTGAGAGTCAGTGGGTCAAAATACCACTTC-ACA 418
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||
Sbjct 455 TGGTGGTGGATGTGTATATACAGTGGCTGAGAGTCAATGGGTCAAAATACCAC-TCTACA 513
Query 419 ATCCACAGCCTCAAGGGAAAGGTGAAACCAAGAATATTCAGGAGTTGACAGAGCTTGACA 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 514 ATCCACAGCCTCAAGGGAAAGGTGAAACCAAGAATATTCAGGAGTTGACTGAGCTTGACA 573
Query 479 TCGACGGGAAGCACTATTTCTGTGATACTAGAGACATCACTCGGCCCTTCCCAAGCCGTA 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 TCGACGGGAAGCACTATTTCTGTGATACTAGAGACATCACTCGGCCCTTCCCAAGCCGTA 633
Query 539 TGCCACTGCAAAGCCCTGATGATGAATTTGTTTGGAATAGATGGTTATCCGTGCCTTTCA 598
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 634 TGCCACTTCAAAGCCCTGATGATGAATTTGTTTGGAATAGATGGTTGTCCGTGCCTTTTA 693
Query 599 AGAATATTGGGCTGCCTGAACACTGTGTCATTCTTCTGCAGGGGTTTGCAGAATATCGAC 658
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 AGAATATTGGGCTACCTGAACACTGTGTCATTCTTCTGCAGGGGTTTGCAGAATATCGAC 753
Query 659 CTTTTGGGAGCTCAGGTCAGCTAGAAGGGATTGTTGCTCTAATGGCCCGTCGTAGCAGAC 718
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 CTTTTGGGAGCTCAGGCCAGCTAGAAGGGATTGTTGCTCTAATGGCCCGTCGTAGCAGAC 813
Query 719 TGCATCCAGGGACTCGTTACCTAGCTAGGGGCATTAATTCATGTTCTGGCACAGGTAACG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TGCATCCAGGGACTCGTTACCTAGCTAGGGGCATTAATTCATGTTCTGGCACAGGTAACG 873
Query 779 AAGTTGAGTGTGAGCAGCTTGTATGGATACCTAAAAGGCATGGTCAAAGCATTGCTTTCA 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 874 AAGTTGAGTGTGAGCAGCTTGTATGGATACCTAAAAGAAATGGTCAAAGCATTGCTTTCA 933
Query 839 ACTCGTACATTTGGCGACGTGGCACCATACCAATATGGTGGGGTGCAGAATTGAAGATGA 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 934 ACTCGTACATTTGGCGACGTGGCACCATACCAATATGGTGGGGTGCAGAATTAAAGATGA 993
Query 899 CTGCGGCAGAAGCAGAAATTTATGTGGCAGATAGGGATCCTTATAAAGGCAGTACGGATT 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 994 CTGCGGCAGAAGCAGAAATTTATGTGGCAGATAGGGATCCTTATAAAGGCAGTACAGAGT 1053
Query 959 ATTACCAAAGATTAAGCAAGCGATATGATACTAGGAATCTAGATGCACCAGTTGGAGAAA 1018
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1054 ATTACCAAAGGTTAAGCAAGCGATATGATACTAGGAATCTAGATGCACCTGTTGGAGAAA 1113
Query 1019 ACCAGAAGAAAAAGGCTTTTGTTCCTATTGTGTGCGTTAATTTGCTAAGAAGTGGAGAAG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1114 ACCAGAAGAAAAAGGCTTTTGTTCCTATTGTGTGCGTTAATTTACTAAGAAGTGGAGAAG 1173
Query 1079 GGAAATCAGAATGTATCTTAGTACAACATTTTGAAGAATCGATGAACTTTATCAGATCCA 1138
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1174 GGAAATCAGAATGTATCTTAGTACAACATTTTGAAGAATCGATGAACTTTATCAAATCCA 1233
Query 1139 GTGGAAAGCTTCCTCATACCCGTGTTCACCTAATAAATTATGATTGGCATGCCAGCGTGA 1198
|||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 GTGGAAAGCTTCCTTATACTCGTGTTCACCTGATAAATTATGATTGGCATGCCAGCGTGA 1293
Query 1199 AACTAAAGGGGGAACAGCAAACTATTGAAGGATTGTGGATGTATCTAAAATCTCCCACTA 1258
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 AACTAAAAGGGGAACAGCAAACTATTGAAGGATTGTGGATGTATCTAAAATCTCCCACTA 1353
Query 1259 TGGCAATAGGAATTTCTGAAGGTGACTATTTGCCTTCACGTCAAAGACTGAAAGATTGCA 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 TGGCAATAGGAATTTCTGAAGGTGACTATTTGCCTTCACGTCAAAGACTGAAAGATTGCA 1413
Query 1319 GAGGTGAGGTAATCTGTATTGATGACATTGAAGGTGCCTTCTGTTTGAGATCGCATCAAA 1378
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1414 GAGGTGAGGTAATCTGTATTGATGACATTGAAGGTGCCTTCTGTTTGAGATCACATCAAA 1473
Query 1379 ATGGGGTGATACGCTTTAACTGCGCTGATTCTTTGGATCGAACAAATGCGGCTAGTTTCT 1438
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 ATGGGGTGATACGTTTTAACTGCGCTGATTCCTTGGATCGAACAAATGCGGCTAGTTTCT 1533
Query 1439 TTGGTGGTCTTCAAGTGTTTGTAGAGCAATGTAGAAGGCTAGGAATATCGCTTGATACTG 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1534 TTGGTGGTCTTCAAGTGTTTGTAGAGCAATGTAGAAGGCTGGGAATATCACTTGATACTG 1593
Query 1499 ATCTTGGATATGGTTATAATTCTGTTAATAATCATGGGGGATATAATGCTCCCCTTCCAC 1558
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1594 ATCTTGGATATGGTCATAATTCTGTTAATAATCAGGGGGGATATAACGCTCCCCTTCCAC 1653
Query 1559 CAGGG-TGGGAAAAAAGAGCTGATGCAGTAACTGGAAAATCGTATTATATAGATCACAAT 1617
| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1654 C-GGGATGGGAAAAAAGAGCTGATGCCGTAACTGGAAAATCATATTATATAGATCACAAT 1712
Query 1618 ACAAAGACAACAACATGGAGTCATCCATGTCCTGATAAACCATGGAAGAGACTTGACATG 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1713 ACAAAGACAACAACATGGAGTCATCCATGTCCTGATAAACCATGGAAGAGACTTGACATG 1772
Query 1678 AAGTTTGAGGAATTTAAGAGATCAACTATCTTATCTCCTGTGTCTGAACTTGCTGATCTT 1737
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1773 AGGTTTGAGGAATTTAAGAGATCAACTATCTTATCTCCTGTGTCAGAACTTGCCGATCTT 1832
Query 1738 TTTCTGCAACAAGGTGATATCCATGCAACCCTCTATACTGGCTCAAAAGCTATGCACAGC 1797
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1833 TTTCTGCAACAAGGTGATATCCATGCAACCCTCTATACTGGCTCGAAAGCTATGCACAGC 1892
Query 1798 CAAATTCTCAACATCTTTAGCGAAGAATCAGGAGCATTTAAACAGTTTTCTGCAGCACAG 1857
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 CAAATTCTCAACATCTTCAGTGAAGAATCAGGAGCATTTAAACAGTTTTCTGCAGCACAG 1952
Query 1858 AAAAACATGAAAATTACGCTGCAGAGAAGATATAAAAATGCTATGGTTGATAGTTCACGG 1917
||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1953 AAAAACATGAAGATTACACTACAGAGAAGATATAAAAATGCTATGGTTGATAGTTCACGG 2012
Query 1918 CAAAAGCAGCTGGAGATGTTTCTGGGAATGAGGCTTTTCAAGCATCTTCCATCAATTCCT 1977
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013 CAAAAACAGCTCGAGATGTTTCTGGGAATGAGGCTTTTCAAGCATCTTCCATCAATTCCT 2072
Query 1978 GTCCATCCTTTACATGTACTTTCTCGACCATCTGGTTTCTTTCTGAAACCTGTACCTAAC 2037
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTCCAGCCTTTACATGTACTTTCTCGACCATCTGGTTTCTTTCTGAAACCTGTACCTAAC 2132
Query 2038 ATGTCCGAAAGTTCCAATGATGGGTCCAGTCTGCTCAGTATCAAGAGGAAGGACATAACT 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2133 ATGTCCGAAAGTTCCAATGATGGGTCCAGTCTGCTGAGTATCAAGAGGAAGGACATAACT 2192
Query 2098 TGGCTATGTCCACAAGCTGCAGATATTGTTGAATTATTTATCTATCTCAGTGAGCCTTGC 2157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 TGGCTATGTCCACAAGCTGCAGATATTGTTGAATTATTTATCTATCTCAGTGAGCCTTGC 2252
Query 2158 CATGTATGTCAACTTCTACTGACCATATCACACGGGGCGGATGATTTGACATGTCCATCC 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 CATGTATGTCAACTTCTACTGACCATATCACACGGTGCGGATGATTTGACATGTCCATCC 2312
Query 2218 ACTGTGGACGTGAGAACTGGACGCCACATAGAGGACCTTAAATTAGTTGTTGAG 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2313 ACTGTGGACGTGAGAACTGGACGCCACATAGAGGACCTTAAATTAGTTGTTGAG 2366
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 246018688472
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5