BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg939118
Length=3813
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G60740.1 | Symbols: TTN1, EMB133, TFC D, CHO | ARM repeat su... 6287 0.0
> AT3G60740.1 | Symbols: TTN1, EMB133, TFC D, CHO | ARM repeat
superfamily protein | chr3:22447245-22453364 REVERSE LENGTH=3944
Length=3944
Score = 6287 bits (3404), Expect = 0.0
Identities = 3679/3813 (96%), Gaps = 13/3813 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAATCCCTTTCTCTTTCCAGTAATGGCATCTAGAGCAGAGGAGA-GATCGCCGGCGAA 59
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||
Sbjct 16 TTGAACCCCTTTCTCTTTCCAGTAATGGCATCTAGAGCAGAGGAAATG-TCGCCGACGAA 74
Query 60 GATCAAAATCGAAACGGCGGTTAAAATGGAAGAGGAAGAAGACGACGAGCATGATTCTAA 119
|||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 75 GATCGAAATCGAAACGGCGGTAAAAATTGAAGAGGAAGAAGACGATGAGCATGATTCTAA 134
Query 120 GGAGAGAGTTCTACAGAGGTACTTTTTACAAGAATGGAAGCTCGTTAAATCCCTTCTCGA 179
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 135 GGAGAGAGTTCTACAGAGGTATTTTTTACAAGAATGGAAGCTCGTTAAATCTCTTCTCGA 194
Query 180 TGATATCGTTTCAAATGGCCGTGTCGTTGATCCTACTTCTGTTCATAAGATCCGATCCAT 239
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 TGATATTGTTTCAAATGGCCGTGTTGTTGATCCTACTTCTGTTCATAAGATCCGATCCAT 254
Query 240 TATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAACTAGTGGAACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTC 299
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 TATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAATTAGTGGAACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTC 314
Query 300 TCCATTAATGTTTATCATCCGCTCCAAAACAGTTGATTTAGAAGCCAGACCTGATGAAAT 359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 315 TCCATTAATGTTTATCATCCGCTCCAAAACAGTTGATTTAGAGGCCAAACCTGATGAAAT 374
Query 360 TCTTGAGATTATTAAGCCAATTAGCATCATTATCTATGCTTTAGTTACCGTATGTGGGTA 419
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 375 TCTTGAGATTATTAAGCCAATAAGCATCATTATCTATGCTTTAGTTACTGTATGTGGGTA 434
Query 420 CAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATCCGATCTGGAACTCGCTGTGTTGCT 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 435 CAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATCCGATCTGGAACTCGCCGTTTTGCT 494
Query 480 CCTGGAGAAGTGCCATAGTACAAATTCTGTTTCTGCCTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGA 539
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 CCTCGAGAAGTGCCATAGTACAAATTCTGTTTCTGCCTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGA 554
Query 540 AATGGAAGCCAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTTCCATCCTTGTGTTGGTTCCGTTTGA 599
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 AATGGAGGCCAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTTCAATCCTTGTGTTGGTTCCGTTTGA 614
Query 600 TATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCTGATGACAAGACCTTTGGTGTGGACGACCTTGC 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 615 TATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCTGATGACAAGACCTTTGGTGTGGATGACCTTGC 674
Query 660 TCCTTTGGTATTGAAGATATTAGGTTTCTGTAAGGACTATCTATGCAGTGCTGGACCAAT 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 675 TCCTTTGGTATTGAAGATATTAGGTTTCTGTAAGGACTATCTGTGCAGTGCTGGACCAAT 734
Query 720 GCGCAGGATATCTGGATTGCTTCTATCGAAGCTTTTAACCCGTCCGGATATGGGAAAAGC 779
|||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GCGCAGGATATCGGGGTTGCTACTCTCTAAGCTTTTAACTCGTCCGGATATGGGAAAAGC 794
Query 780 TTTTTCAAGCTTTTTTGAGTGGACACATGAAGTTTTATCATCTAAGGAAGATAGTGTCAC 839
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||
Sbjct 795 TTTTTCGAGCTTTTTTGAGTGGACATATGAAGTTTTGTCTTGTAAGGAAGATAGTGTCAC 854
Query 840 AAACCACTTTCGCTTGCTTGGTGTAATGGAAGCTCTGTCTGCCATTTTTAAGACTGCTAG 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 GAACCACTTTCGCTTGCTTGGTGTAATGGAAGCTCTATCTGCCATTTTTAAGACTGCTAG 914
Query 900 CCGGAAAGTGTTGCTAGATGTGCTTCCTATTGTTTTGAATGATGTGACCGTGCTAAGCAA 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 915 CCGGAAAGTGTTGCTAGATGTGCTTCCTATTGTTTTGAATGATGTGACTGTGCTAAGCAA 974
Query 960 ATCAAATGCGGCGGCTAAAAGTTCTCTGCTTCGCAAGTATTTGATCAAGTTAACTCAGAG 1019
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 ATCAAACGCGGCGGCTAAAAGTTCTCTGCTTCGCAAGTATTTGATCAAGTTAACTCAGAG 1034
Query 1020 GATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCACCTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACTGT 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1035 GATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCACCTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACCGC 1094
Query 1080 CTCTCTTTCTGAGAATATGTCTACGAGTTCAGCCCAAAGATTGCCGCCTGATCATACTGT 1139
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1095 CTCTCTTTCTGAGAATATGTCTACGAGTTCATCTCAAAGATTGGCGCCTGATCATACTGT 1154
Query 1140 GACTGCCATCTTACAACCAGAAAGTTTGGATGATCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 GACTGCCATCTTACAACCAGAAAGTTTGGATGATCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCC 1214
Query 1200 AGAAATCTTAGAAGAGATTATTGAAATGCTACTCGCGGGTTTGAGGGACACGGACACCGT 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215 AGAAATCTTAGAAGAGATTATTGAAATGCTACTATCTGGTTTGAGGGACACGGACACCGT 1274
Query 1260 GGTCCGTTGGTCTGCTGCGAAGGGTATAGGTCGTGTAACTTCACGTCTAACATCTGTTCT 1319
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 GGTTCGTTGGTCTGCTGCAAAGGGTATAGGTCGTGTTACTTCACGTCTAACATCTGTTCT 1334
Query 1320 GTCTGAAGAGGTGTTGTCATCTGTATTGGAGCTGTTTTCACCAGGAGAGGGAGATGGCTC 1379
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1335 GTCTGATGAGGTGTTGTCATCTGTATTGGAGCTTTTTTCACCAGGAGAGGGAGATGGTTC 1394
Query 1380 ATGGCATGGGGGTTGTTTGGCCTTAGCTGAACTGGCTCGTAGAGGGGTACTTTTGCCTAG 1439
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1395 ATGGCATGGGGGTTGTTTGGCCTTAGCTGAACTGGCTCGTAGAGGGTTACTTTTGCCTAG 1454
Query 1440 AAGTTTTCCACCAGTCGTTCCAGTTATTGTGAAGGCACTCCATTATGATGTTCGCCGTGG 1499
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1455 AAGTTTTCCACTAGTCGTCCCAGTTATTGTGAAGGCACTCCATTATGATGTTCGCCGAGG 1514
Query 1500 TCCACACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTATGTTTGTTGGGCATTTGG 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515 TCCACACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTATGTTTGTTGGGCATTTGG 1574
Query 1560 ACGTGCCTATTCCCACAAAGATATGAAAAACGTGCTGGATCAGCTTGCTCCAGATTTATT 1619
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1575 GCGCGCCTATTCCCACAAAGATATGAAAAACGTGCTGGATCAGCTTGCTCCAGATTTATT 1634
Query 1620 GATAGTAGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTGCCGCTGCTTTCCA 1679
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 GATAGTGGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTGCCGCTGCTTTCCA 1694
Query 1680 AGAGAATGTTGGAAGACAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAGTGAACATAGCTGA 1739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1695 AGAGAATGTTGGAAGACAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAGTGAGCATAGCTGA 1754
Query 1740 TTATTTTTCCCTTTCTTCTCGGGTGAACTCTTACCTTCAGGTTGCTGTTTCCATTGCTCA 1799
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 TTATTTTTCCCTATCTTCTCGGGTGAACTCTTACCTTCAGGTTGCTGTTTCCATTGCTCA 1814
Query 1800 ATATGAAGGGTATCTACATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACAAGATCTGCCACTG 1859
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 ATATGAAGGATATCTATATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACAAGATCTGCCACTG 1874
Query 1860 GGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCTGCAGAAGCTCTTGCTGCTCTTGTTAAGTACGAGCC 1919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1875 GGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCTGCAGAAGCTCTTGCTCCTCTTGTTAAGTACGAGCC 1934
Query 1920 TAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAATTCCTTGTACCCTTTCAACTGATTT 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 TAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAATTCCTTGTACCCTTTCAACTGATTT 1994
Query 1980 GTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAGCTCTGCACCAGTG 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 GTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAGCTCTGCACCAGTG 2054
Query 2040 TGGCTATGTCCTTTCTGCTGATAGCCAAAAGAGTATGGCTGGGATTGTTCCATCCATTGA 2099
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2055 TGGCTATGTCCTTTCTGCTGATAGCCAAAAGCGTATGGCTGGTATTGTTCCTTCCATTGA 2114
Query 2100 GAAAGCACGCCTTTACCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGGCTGTCTCACGGTT 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2115 GAAAGCACGCCTTTACCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGGCTGTCTCACGATT 2174
Query 2160 TATCGAGTGTATCTCGCTATCTCATGTGACATTAGCTGAAAGAACAGAACGGATCTTGCT 2219
|||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175 TATCGAGTGTATTTCGTTATCGCATGTGACTTTAGCTGAAAGAACAGAACGGATCTTGCT 2234
Query 2220 TGATACTCTCACTGAGAATTTAAGACATCCCAATTCTCAAATACAGAATGCTGCTGTCAG 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2235 TGATACTCTCACTGAGAATTTAAGACATCCCAATTCTCAAATACAGAATGCAGCTGTCAG 2294
Query 2280 TGCTGTTAAACAGCTTGTGCAATCCTATCTCGTTGGCAATGATAAGAAATCTGTTGATTT 2339
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGCTGTTAAACAGCTTGTGCAATCTTATCTCGTTGGCAATGATAAGAAATCTGTTGATTT 2354
Query 2340 AATATCAAAACACCTAAAACATCTAACGGACCCAAATGTAGCTGTCCGAAGAGGTTCTGC 2399
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2355 AATATTAAAACACCTAAAACATCTAACGGACCCAAATGTAGCTGTCCGAAGAGGTTCTGC 2414
Query 2400 ACTTGCACTAGGTGTCTTGCCATATGAACTATTGACTGCAAAATGGAAGGATATAGTTTT 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2415 ACTTGCACTAGGTGTCTTGCCATATGAACTATTGACTGCAAAATGGAAGGATATAGTTTT 2474
Query 2460 GAAGCTCTGCAGTGCGTGTAAGATAGAGGTGAACCCTGAAGACAGAGATGCAGAGGCACG 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2475 GAAGCTCTGCAGTGCGTGTAAGATAGAGGTGAACCCTGAAGACAGAGATGCAGAGGCACG 2534
Query 2520 TGTGAATGCTGTAAAAGGACTCACATCCGTGTGTGAGACTCTTACTCAGAAAAGGGCTAG 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2535 TGTGAATGCTGTAAAAGGACTCACATCCGTGTGTGAGACTCTTACTCAGAAAAGGGCTAG 2594
Query 2580 TGATCCTGAAAACGATGACCTGTCTCTTTTTCTTCTTATCAAGACTGAAGTGATGGATAC 2639
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595 CGATCCTGGAAATGATGACCTGTCTCTTTTTCTTCTTATCAAGACTGAAGTGATGGATAC 2654
Query 2640 TTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACCGAGGTGATGTAGGTTCTTGGGT 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655 TTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACCGAGGTGATGTAGGTTCTTGGGT 2714
Query 2700 TCGTGAAGCTGCAGTCCATGGCCTTGAGAAGTGTACATATATCCTCTGTAAGAAAATCGG 2759
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2715 TCGTGAAGCTGCAGTCCATGGTCTTGAGAAGTGTACATATATCCTCTGTAAGAAAAT-GG 2773
Query 2760 AA-CAAATTCAGAGGGTGATCATAACAATGATACGTCCTCACTTTTCGATTCAAATCTTG 2818
|| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2774 AAACATATTCAGAGGGTGATTATAACGATGATACGTCCTCACTTTTCGATTCGAATCTTG 2833
Query 2819 CGACCCGTCTAATTGGAGGTATTG-TGAAGCAAGGAGTGGAGAAAATGGATAAACTAAGA 2877
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2834 CGACCCGTCTAATTGGAGGTAT-GCTGAAGCAAGGAGTGGAGAAAATGGATAAATTAAGA 2892
Query 2878 GAAACAGCTGCGAAGGTTCTTCAACGGATTTTGTATCACAAATCTGTTTCCGTCCCTCAT 2937
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2893 GAAACAGCTGCAAAGGTTCTTCAAAGGATTTTGTATCACAAATCTGTTTCCGTCCCTCAT 2952
Query 2938 ATACCTCATAGAGAAAAACTGGAAGAAATTCTTCCCAACAAGGCAAGCTTACAGTGGGCG 2997
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2953 GTACCTTATAGAGAAAAACTGGAAGAAATTCTTCCCAACAAGGCAAACTTACAATGGGCG 3012
Query 2998 GTTCCGGCTTTCTCTTTCCCACGTTTTGTGCAGCTATTAAAACTCCGTTGCTACAGCAAA 3057
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3013 GTTCCGGCTTTCTCTTTCCCACGGTTTGTGCAGCTTTTGAAACTCCGTTGTTACAGCAAA 3072
Query 3058 GAGGTGATGTCTGGATTAGTAATTTCTATTGGAGGATTACAAGATTCACTTAGAAAGGCT 3117
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3073 GAGGTGATGTCTGGATTAGTAATTTCAATTGGAGGATTACAAGATTCACTTAGAAAGGCT 3132
Query 3118 TCTCTCGTTGCATTGTTGGAGTATATGAGGGAAGGTGAAGCTAAAGACCCTAAAGAACAA 3177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 TCTCTCGTTGCATTGTTGGAGTATATGAGGGAAGGTGAAGCTAAAGACCCTAAAGAACAA 3192
Query 3178 CAATCCAGAGAGTCTGCACTGGGAGATGACATTCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAA 3237
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3193 CAATCCAGAGAGTCTGCCCTGGGAGATGACATTCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAA 3252
Query 3238 TGTGACAGAGTTATGGTACCCTGTCTACAGACAATTGAGATCCTCTTCAGCAGCAAGATC 3297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3253 TGTGACAGAGTTATGGTACCCTGTCTACAGACAATTGAGATCCTCTTCAGCAGCAAGATC 3312
Query 3298 TTTCTGAATCTAGAGTCTTATACGTTGAGTTTCTACGCGGGTGCCATGGATTCTCTAGCC 3357
|||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3313 TTTCTGAATCAAGAGTCGTATACGTTTAGTTTCTACGCGGGTGTCATGGATTCTCTAGCC 3372
Query 3358 ATCGAACTAAGAGCTTCTAAGGATTTCACAAAGTTAAAAGCAGGCCTTGCAATACTTGGA 3417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3373 ATCGAACTAAGAGCTTCTAAGGATTTCACAAAGTTAAAAGCAGGCCTTGCAATACTTGGA 3432
Query 3418 TATATCGCTTCAGTCTCACATC-CAATCAGCACAAAAGCATTCTCTCAGCTTCTATCATT 3476
||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3433 TATATTGCTTCAGTCTCGCATTTCA-TCAGCACAAAAGCATTCTCTCAACTTCTATCATT 3491
Query 3477 CCTTGGCCACCGATACCCAATGATCCGAAAGGCGGCAGCTGAACAAGTCTATCTTGCGCT 3536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3492 CCTTGGCCACCGATACCCAATGATCCGAAAGGCGGCAGCGGAACAAGTCTATCTTGCGCT 3551
Query 3537 ACTTCAAAACGGAATCTTAGTGACAGAGGAGAAGATGGAGAAAGTTATAGAGATAATTTC 3596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3552 ACTTCAAAACGGAATCTTAGTGACAGAGGAGAAGATGGAGAAAGTGATAGAGATAATTTC 3611
Query 3597 AGAATCTTGTTGGGAAGCAGACATGGAAACGACTAAGAGTCAGAGGTTAGAATTGTGCGA 3656
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3612 AGAATCTTGTTGGGAAGCAGACATGGAAACGACTAAGACTCAGAGGTTAGAATTGTGCGA 3671
Query 3657 ATTGGCTGGTTTAGACCATGAAGTAGTGTTCAAGACAAGAAACAGATTGGCGACTAGGGA 3716
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||
Sbjct 3672 GTTGGCTGGTTTAGACCATGAAGTAGTGTTCAAGACCAGAAACAGATTGGTGATTAAGGA 3731
Query 3717 TATAGCCGGGAATGAAA-CGACTGCGTCTGACGAGAACGCGTCTTACTCTTCCTTGGTCG 3775
||||||||| ||| ||| || |||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3732 TATAGCCGGAAAT-AAATCGGCTGC-T--GACGAAAATGCGTCTTACTCTTCATTGGTCG 3787
Query 3776 ATTCCTCTGGCTTTTGATTTCACGCTTTGTCCT 3808
| ||||||||||| |||||| |||| |||||||
Sbjct 3788 ACTCCTCTGGCTTCTGATTTTACGCATTGTCCT 3820
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189932046198
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5