BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg939118 Length=3813 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G60740.1 | Symbols: TTN1, EMB133, TFC D, CHO | ARM repeat su... 6287 0.0 > AT3G60740.1 | Symbols: TTN1, EMB133, TFC D, CHO | ARM repeat superfamily protein | chr3:22447245-22453364 REVERSE LENGTH=3944 Length=3944 Score = 6287 bits (3404), Expect = 0.0 Identities = 3679/3813 (96%), Gaps = 13/3813 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTGAATCCCTTTCTCTTTCCAGTAATGGCATCTAGAGCAGAGGAGA-GATCGCCGGCGAA 59 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| Sbjct 16 TTGAACCCCTTTCTCTTTCCAGTAATGGCATCTAGAGCAGAGGAAATG-TCGCCGACGAA 74 Query 60 GATCAAAATCGAAACGGCGGTTAAAATGGAAGAGGAAGAAGACGACGAGCATGATTCTAA 119 |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 75 GATCGAAATCGAAACGGCGGTAAAAATTGAAGAGGAAGAAGACGATGAGCATGATTCTAA 134 Query 120 GGAGAGAGTTCTACAGAGGTACTTTTTACAAGAATGGAAGCTCGTTAAATCCCTTCTCGA 179 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 135 GGAGAGAGTTCTACAGAGGTATTTTTTACAAGAATGGAAGCTCGTTAAATCTCTTCTCGA 194 Query 180 TGATATCGTTTCAAATGGCCGTGTCGTTGATCCTACTTCTGTTCATAAGATCCGATCCAT 239 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 195 TGATATTGTTTCAAATGGCCGTGTTGTTGATCCTACTTCTGTTCATAAGATCCGATCCAT 254 Query 240 TATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAACTAGTGGAACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTC 299 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 255 TATGGATAAATACCAGGAGCAAGGTCAATTAGTGGAACCTTACTTAGAGAGTATAGTTTC 314 Query 300 TCCATTAATGTTTATCATCCGCTCCAAAACAGTTGATTTAGAAGCCAGACCTGATGAAAT 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct 315 TCCATTAATGTTTATCATCCGCTCCAAAACAGTTGATTTAGAGGCCAAACCTGATGAAAT 374 Query 360 TCTTGAGATTATTAAGCCAATTAGCATCATTATCTATGCTTTAGTTACCGTATGTGGGTA 419 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 375 TCTTGAGATTATTAAGCCAATAAGCATCATTATCTATGCTTTAGTTACTGTATGTGGGTA 434 Query 420 CAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATCCGATCTGGAACTCGCTGTGTTGCT 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 435 CAAAGCTGTTATCAAGTTCTTTCCGCATCAAGTATCCGATCTGGAACTCGCCGTTTTGCT 494 Query 480 CCTGGAGAAGTGCCATAGTACAAATTCTGTTTCTGCCTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGA 539 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 495 CCTCGAGAAGTGCCATAGTACAAATTCTGTTTCTGCCTTGAGGCAAGAAAGCACTGGAGA 554 Query 540 AATGGAAGCCAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTTCCATCCTTGTGTTGGTTCCGTTTGA 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 555 AATGGAGGCCAAATGTGTTACTCTTTTGTGGCTTTCAATCCTTGTGTTGGTTCCGTTTGA 614 Query 600 TATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCTGATGACAAGACCTTTGGTGTGGACGACCTTGC 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 615 TATTTCTTCTGTTGATACAAGCATTGCTGATGACAAGACCTTTGGTGTGGATGACCTTGC 674 Query 660 TCCTTTGGTATTGAAGATATTAGGTTTCTGTAAGGACTATCTATGCAGTGCTGGACCAAT 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 675 TCCTTTGGTATTGAAGATATTAGGTTTCTGTAAGGACTATCTGTGCAGTGCTGGACCAAT 734 Query 720 GCGCAGGATATCTGGATTGCTTCTATCGAAGCTTTTAACCCGTCCGGATATGGGAAAAGC 779 |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 735 GCGCAGGATATCGGGGTTGCTACTCTCTAAGCTTTTAACTCGTCCGGATATGGGAAAAGC 794 Query 780 TTTTTCAAGCTTTTTTGAGTGGACACATGAAGTTTTATCATCTAAGGAAGATAGTGTCAC 839 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| Sbjct 795 TTTTTCGAGCTTTTTTGAGTGGACATATGAAGTTTTGTCTTGTAAGGAAGATAGTGTCAC 854 Query 840 AAACCACTTTCGCTTGCTTGGTGTAATGGAAGCTCTGTCTGCCATTTTTAAGACTGCTAG 899 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 855 GAACCACTTTCGCTTGCTTGGTGTAATGGAAGCTCTATCTGCCATTTTTAAGACTGCTAG 914 Query 900 CCGGAAAGTGTTGCTAGATGTGCTTCCTATTGTTTTGAATGATGTGACCGTGCTAAGCAA 959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 915 CCGGAAAGTGTTGCTAGATGTGCTTCCTATTGTTTTGAATGATGTGACTGTGCTAAGCAA 974 Query 960 ATCAAATGCGGCGGCTAAAAGTTCTCTGCTTCGCAAGTATTTGATCAAGTTAACTCAGAG 1019 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 975 ATCAAACGCGGCGGCTAAAAGTTCTCTGCTTCGCAAGTATTTGATCAAGTTAACTCAGAG 1034 Query 1020 GATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCACCTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACTGT 1079 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1035 GATAGGGCTTGTTTGTCTTCCTCATCGCTCACCTTCCTGGCGCTATGTGGCTCAAACCGC 1094 Query 1080 CTCTCTTTCTGAGAATATGTCTACGAGTTCAGCCCAAAGATTGCCGCCTGATCATACTGT 1139 ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1095 CTCTCTTTCTGAGAATATGTCTACGAGTTCATCTCAAAGATTGGCGCCTGATCATACTGT 1154 Query 1140 GACTGCCATCTTACAACCAGAAAGTTTGGATGATCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCC 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1155 GACTGCCATCTTACAACCAGAAAGTTTGGATGATCAAGAGGATGAAGATATGGATGTTCC 1214 Query 1200 AGAAATCTTAGAAGAGATTATTGAAATGCTACTCGCGGGTTTGAGGGACACGGACACCGT 1259 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1215 AGAAATCTTAGAAGAGATTATTGAAATGCTACTATCTGGTTTGAGGGACACGGACACCGT 1274 Query 1260 GGTCCGTTGGTCTGCTGCGAAGGGTATAGGTCGTGTAACTTCACGTCTAACATCTGTTCT 1319 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1275 GGTTCGTTGGTCTGCTGCAAAGGGTATAGGTCGTGTTACTTCACGTCTAACATCTGTTCT 1334 Query 1320 GTCTGAAGAGGTGTTGTCATCTGTATTGGAGCTGTTTTCACCAGGAGAGGGAGATGGCTC 1379 |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1335 GTCTGATGAGGTGTTGTCATCTGTATTGGAGCTTTTTTCACCAGGAGAGGGAGATGGTTC 1394 Query 1380 ATGGCATGGGGGTTGTTTGGCCTTAGCTGAACTGGCTCGTAGAGGGGTACTTTTGCCTAG 1439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1395 ATGGCATGGGGGTTGTTTGGCCTTAGCTGAACTGGCTCGTAGAGGGTTACTTTTGCCTAG 1454 Query 1440 AAGTTTTCCACCAGTCGTTCCAGTTATTGTGAAGGCACTCCATTATGATGTTCGCCGTGG 1499 ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1455 AAGTTTTCCACTAGTCGTCCCAGTTATTGTGAAGGCACTCCATTATGATGTTCGCCGAGG 1514 Query 1500 TCCACACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTATGTTTGTTGGGCATTTGG 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1515 TCCACACAGTGTTGGATCTCATGTGCGTGATGCAGCTGCCTATGTTTGTTGGGCATTTGG 1574 Query 1560 ACGTGCCTATTCCCACAAAGATATGAAAAACGTGCTGGATCAGCTTGCTCCAGATTTATT 1619 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1575 GCGCGCCTATTCCCACAAAGATATGAAAAACGTGCTGGATCAGCTTGCTCCAGATTTATT 1634 Query 1620 GATAGTAGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTGCCGCTGCTTTCCA 1679 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1635 GATAGTGGGTTCCTTTGATAGAGAGGTGAACTGTAGAAGGGCTGCTGCCGCTGCTTTCCA 1694 Query 1680 AGAGAATGTTGGAAGACAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAGTGAACATAGCTGA 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1695 AGAGAATGTTGGAAGACAAGGAAATTACCCTCATGGGATTGACATAGTGAGCATAGCTGA 1754 Query 1740 TTATTTTTCCCTTTCTTCTCGGGTGAACTCTTACCTTCAGGTTGCTGTTTCCATTGCTCA 1799 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1755 TTATTTTTCCCTATCTTCTCGGGTGAACTCTTACCTTCAGGTTGCTGTTTCCATTGCTCA 1814 Query 1800 ATATGAAGGGTATCTACATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACAAGATCTGCCACTG 1859 ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1815 ATATGAAGGATATCTATATCCTTTTGTGGATGAATTGCTATACAACAAGATCTGCCACTG 1874 Query 1860 GGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCTGCAGAAGCTCTTGCTGCTCTTGTTAAGTACGAGCC 1919 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1875 GGATAAAAGCTTGAGAGAACTTGCTGCAGAAGCTCTTGCTCCTCTTGTTAAGTACGAGCC 1934 Query 1920 TAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAATTCCTTGTACCCTTTCAACTGATTT 1979 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1935 TAAGCACTTTGCCAACTATGTGCTGGAGAAACTAATTCCTTGTACCCTTTCAACTGATTT 1994 Query 1980 GTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAGCTCTGCACCAGTG 2039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1995 GTGCATGCGCCATGGTGCAACATTGGCAGCTGGAGAGGTTGTGTTAGCTCTGCACCAGTG 2054 Query 2040 TGGCTATGTCCTTTCTGCTGATAGCCAAAAGAGTATGGCTGGGATTGTTCCATCCATTGA 2099 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 2055 TGGCTATGTCCTTTCTGCTGATAGCCAAAAGCGTATGGCTGGTATTGTTCCTTCCATTGA 2114 Query 2100 GAAAGCACGCCTTTACCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGGCTGTCTCACGGTT 2159 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2115 GAAAGCACGCCTTTACCGTGGAAAAGGTGGAGAAATAATGCGACTGGCTGTCTCACGATT 2174 Query 2160 TATCGAGTGTATCTCGCTATCTCATGTGACATTAGCTGAAAGAACAGAACGGATCTTGCT 2219 |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2175 TATCGAGTGTATTTCGTTATCGCATGTGACTTTAGCTGAAAGAACAGAACGGATCTTGCT 2234 Query 2220 TGATACTCTCACTGAGAATTTAAGACATCCCAATTCTCAAATACAGAATGCTGCTGTCAG 2279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2235 TGATACTCTCACTGAGAATTTAAGACATCCCAATTCTCAAATACAGAATGCAGCTGTCAG 2294 Query 2280 TGCTGTTAAACAGCTTGTGCAATCCTATCTCGTTGGCAATGATAAGAAATCTGTTGATTT 2339 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2295 TGCTGTTAAACAGCTTGTGCAATCTTATCTCGTTGGCAATGATAAGAAATCTGTTGATTT 2354 Query 2340 AATATCAAAACACCTAAAACATCTAACGGACCCAAATGTAGCTGTCCGAAGAGGTTCTGC 2399 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2355 AATATTAAAACACCTAAAACATCTAACGGACCCAAATGTAGCTGTCCGAAGAGGTTCTGC 2414 Query 2400 ACTTGCACTAGGTGTCTTGCCATATGAACTATTGACTGCAAAATGGAAGGATATAGTTTT 2459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2415 ACTTGCACTAGGTGTCTTGCCATATGAACTATTGACTGCAAAATGGAAGGATATAGTTTT 2474 Query 2460 GAAGCTCTGCAGTGCGTGTAAGATAGAGGTGAACCCTGAAGACAGAGATGCAGAGGCACG 2519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2475 GAAGCTCTGCAGTGCGTGTAAGATAGAGGTGAACCCTGAAGACAGAGATGCAGAGGCACG 2534 Query 2520 TGTGAATGCTGTAAAAGGACTCACATCCGTGTGTGAGACTCTTACTCAGAAAAGGGCTAG 2579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2535 TGTGAATGCTGTAAAAGGACTCACATCCGTGTGTGAGACTCTTACTCAGAAAAGGGCTAG 2594 Query 2580 TGATCCTGAAAACGATGACCTGTCTCTTTTTCTTCTTATCAAGACTGAAGTGATGGATAC 2639 ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2595 CGATCCTGGAAATGATGACCTGTCTCTTTTTCTTCTTATCAAGACTGAAGTGATGGATAC 2654 Query 2640 TTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACCGAGGTGATGTAGGTTCTTGGGT 2699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2655 TTTACTGAAAGCTCTTGATGACTATTCAGTTGATAACCGAGGTGATGTAGGTTCTTGGGT 2714 Query 2700 TCGTGAAGCTGCAGTCCATGGCCTTGAGAAGTGTACATATATCCTCTGTAAGAAAATCGG 2759 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2715 TCGTGAAGCTGCAGTCCATGGTCTTGAGAAGTGTACATATATCCTCTGTAAGAAAAT-GG 2773 Query 2760 AA-CAAATTCAGAGGGTGATCATAACAATGATACGTCCTCACTTTTCGATTCAAATCTTG 2818 || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2774 AAACATATTCAGAGGGTGATTATAACGATGATACGTCCTCACTTTTCGATTCGAATCTTG 2833 Query 2819 CGACCCGTCTAATTGGAGGTATTG-TGAAGCAAGGAGTGGAGAAAATGGATAAACTAAGA 2877 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2834 CGACCCGTCTAATTGGAGGTAT-GCTGAAGCAAGGAGTGGAGAAAATGGATAAATTAAGA 2892 Query 2878 GAAACAGCTGCGAAGGTTCTTCAACGGATTTTGTATCACAAATCTGTTTCCGTCCCTCAT 2937 ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2893 GAAACAGCTGCAAAGGTTCTTCAAAGGATTTTGTATCACAAATCTGTTTCCGTCCCTCAT 2952 Query 2938 ATACCTCATAGAGAAAAACTGGAAGAAATTCTTCCCAACAAGGCAAGCTTACAGTGGGCG 2997 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 2953 GTACCTTATAGAGAAAAACTGGAAGAAATTCTTCCCAACAAGGCAAACTTACAATGGGCG 3012 Query 2998 GTTCCGGCTTTCTCTTTCCCACGTTTTGTGCAGCTATTAAAACTCCGTTGCTACAGCAAA 3057 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct 3013 GTTCCGGCTTTCTCTTTCCCACGGTTTGTGCAGCTTTTGAAACTCCGTTGTTACAGCAAA 3072 Query 3058 GAGGTGATGTCTGGATTAGTAATTTCTATTGGAGGATTACAAGATTCACTTAGAAAGGCT 3117 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3073 GAGGTGATGTCTGGATTAGTAATTTCAATTGGAGGATTACAAGATTCACTTAGAAAGGCT 3132 Query 3118 TCTCTCGTTGCATTGTTGGAGTATATGAGGGAAGGTGAAGCTAAAGACCCTAAAGAACAA 3177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3133 TCTCTCGTTGCATTGTTGGAGTATATGAGGGAAGGTGAAGCTAAAGACCCTAAAGAACAA 3192 Query 3178 CAATCCAGAGAGTCTGCACTGGGAGATGACATTCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAA 3237 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3193 CAATCCAGAGAGTCTGCCCTGGGAGATGACATTCTCTGGATACTTCAAGAGTACAAGAAA 3252 Query 3238 TGTGACAGAGTTATGGTACCCTGTCTACAGACAATTGAGATCCTCTTCAGCAGCAAGATC 3297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3253 TGTGACAGAGTTATGGTACCCTGTCTACAGACAATTGAGATCCTCTTCAGCAGCAAGATC 3312 Query 3298 TTTCTGAATCTAGAGTCTTATACGTTGAGTTTCTACGCGGGTGCCATGGATTCTCTAGCC 3357 |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3313 TTTCTGAATCAAGAGTCGTATACGTTTAGTTTCTACGCGGGTGTCATGGATTCTCTAGCC 3372 Query 3358 ATCGAACTAAGAGCTTCTAAGGATTTCACAAAGTTAAAAGCAGGCCTTGCAATACTTGGA 3417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3373 ATCGAACTAAGAGCTTCTAAGGATTTCACAAAGTTAAAAGCAGGCCTTGCAATACTTGGA 3432 Query 3418 TATATCGCTTCAGTCTCACATC-CAATCAGCACAAAAGCATTCTCTCAGCTTCTATCATT 3476 ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3433 TATATTGCTTCAGTCTCGCATTTCA-TCAGCACAAAAGCATTCTCTCAACTTCTATCATT 3491 Query 3477 CCTTGGCCACCGATACCCAATGATCCGAAAGGCGGCAGCTGAACAAGTCTATCTTGCGCT 3536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3492 CCTTGGCCACCGATACCCAATGATCCGAAAGGCGGCAGCGGAACAAGTCTATCTTGCGCT 3551 Query 3537 ACTTCAAAACGGAATCTTAGTGACAGAGGAGAAGATGGAGAAAGTTATAGAGATAATTTC 3596 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3552 ACTTCAAAACGGAATCTTAGTGACAGAGGAGAAGATGGAGAAAGTGATAGAGATAATTTC 3611 Query 3597 AGAATCTTGTTGGGAAGCAGACATGGAAACGACTAAGAGTCAGAGGTTAGAATTGTGCGA 3656 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3612 AGAATCTTGTTGGGAAGCAGACATGGAAACGACTAAGACTCAGAGGTTAGAATTGTGCGA 3671 Query 3657 ATTGGCTGGTTTAGACCATGAAGTAGTGTTCAAGACAAGAAACAGATTGGCGACTAGGGA 3716 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| Sbjct 3672 GTTGGCTGGTTTAGACCATGAAGTAGTGTTCAAGACCAGAAACAGATTGGTGATTAAGGA 3731 Query 3717 TATAGCCGGGAATGAAA-CGACTGCGTCTGACGAGAACGCGTCTTACTCTTCCTTGGTCG 3775 ||||||||| ||| ||| || |||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||| Sbjct 3732 TATAGCCGGAAAT-AAATCGGCTGC-T--GACGAAAATGCGTCTTACTCTTCATTGGTCG 3787 Query 3776 ATTCCTCTGGCTTTTGATTTCACGCTTTGTCCT 3808 | ||||||||||| |||||| |||| ||||||| Sbjct 3788 ACTCCTCTGGCTTCTGATTTTACGCATTGTCCT 3820 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 189932046198 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5