BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg940129
Length=2429
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G06850.1 | Symbols: | C2 calcium/lipid-binding plant phosph... 3949 0.0
> AT5G06850.1 | Symbols: | C2 calcium/lipid-binding plant phosphoribosyltransferase
family protein | chr5:2126975-2130443
REVERSE LENGTH=3081
Length=3081
Score = 3949 bits (2138), Expect = 0.0
Identities = 2333/2430 (96%), Gaps = 2/2430 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTGGTTCAAGTAATCTATAACCATGGCAGCCAAAGATGGAGCTAAGAGCCAAGAAGAC 60
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 TTTTGGTTCAAGTAATCTAAAACCATGGCAGCCAAAGATGGAGCTAAGAGCCAAGAAGAC 507
Query 61 TATAAGCTTAAAGACATGAAACCGGAGCTTGGAGAGAGATGGCCACATGGAGGACAGCGT 120
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 TATAAGCTTAAAGACATGAAACCAGAGCTTGGAGAGAGATGGCCACATGGAGGACAGCGT 567
Query 121 GGAGGAACCGGATGGATTGGCAGTGAACGAGCTGCAAGCACATACGACCTTGTTGAGCAA 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 568 GGAGGAACCGGATGGATTGGCAGTGAACGAGCTGCAAGCACATATGACCTTGTTGAGCAA 627
Query 181 ATGTTTTATCTCTACGTTCGGGTCGTCAAAGCCAAGGATCTTCCTCCAAACCCGGTCACA 240
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 628 ATGTTTTATCTCTATGTTCGGGTCGTCAAAGCCAAGGATCTTCCTCCAAACCCTGTCACC 687
Query 241 AGCAATTGCGATCCTTATGTGGAAGTGAAAATTGGAAACTACAAAGGAAAGACTAAACAT 300
||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 688 AGCAACTGTGATCCTTATGTGGAAGTGAAAATAGGAAACTACAAAGGAAAGACTAAACAC 747
Query 301 TTCGAGAAAAGAACCAACCCGGAGTGGAATCAAGTTTTCGCCTTTTCAAAAGACAAGGTC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 748 TTCGAGAAAAGAACCAACCCGGAGTGGAATCAAGTTTTCGCATTTTCAAAAGACAAGGTC 807
Query 361 CAATCCTCTACAGTCGAAGTATTTGTGCGCGATAAGGAGATGGTTACAAGAGATGAATAC 420
||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CAATCCTCTACTGTTGAAGTCTTTGTGCGCGATAAGGAGATGGTTACAAGAGATGAATAC 867
Query 421 ATCGGGAAGGTTGTGTTTGATATGCGTGAGGTTCCCACAAGAGTTCCTCCTGATAGTCCA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 ATCGGGAAGGTTGTGTTTGATATGCGTGAGGTTCCTACAAGAGTTCCTCCTGATAGTCCA 927
Query 481 CTTGCACCACAGTGGTACAGATTAGAAGATCGGCGAGGTGAGAGTAAGAAGAGAGGAGAG 540
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 928 CTTGCACCTCAGTGGTACAGATTAGAAGATCGGCGAGGTGAGAGTAAGAAAAGAGGAGAG 987
Query 541 GTTATGGTAGCGGTTTGGCTTGGGACGCAAGCTGATGAAGCGTTTCCTGATGCTTGGCAT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 988 GTTATGGTAGCGGTTTGGCTTGGGACGCAAGCCGATGAAGCATTTCCTGATGCTTGGCAT 1047
Query 601 TCGGATGCTTCCTCTGTTCAAGGAGAAGGTGTCCAAAGTGTGAGGTCTAAAGTCTATGTA 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 TCGGATGCTTCCTCTGTTCAAGGAGAAGGTGTCCAAAGCGTGAGGTCTAAAGTCTATGTA 1107
Query 661 TCTCCCAAACTGTGGTATTTACGGGTTAATGTCATCGAGGCGCAAGATGTTGAGCCTAGT 720
||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 TCTCCCAAATTGTGGTATCTGCGGGTTAATGTCATCGAGGCGCAAGATGTTGAGCCTAGT 1167
Query 721 GACAGGAGCCAACCGCCTCAAGCTTTCGTTAAGGTTCAGGTTGGGAATCAGATTCTGAAA 780
|||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 GACAGGAGCCAACCACCTCAAGCTTTCGTTAAAGTACAAGTTGGGAATCAGATTCTGAAA 1227
Query 781 ACAAAGTTATGTCCTAACAAGACAACAAATCCGATGTGGAACGAAGATCTTGTTTTTGTA 840
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228 ACAAAGTTATGTCCTAACAAGACGACGAATCCGATGTGGAACGAAGATCTTGTTTTTGTA 1287
Query 841 GCTGCAGAGCCATTTGAAGAACAGTTCTTCTTGACGGTAGAAAACAAGGTGACACCAGCT 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 GCTGCAGAGCCATTTGAAGAACAGTTCTTCTTGACGGTCGAAAACAAGGTGACACCAGCT 1347
Query 901 AAAGATGAAGTCATGGGGAGGCTGATCTCACCTTTGAACGTCTTTGAGAAAAGATTAGAC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1348 AAAGATGAAGTCATGGGGAGGCTGATCTCACCTTTGAGCGTATTTGAGAAAAGGTTAGAT 1407
Query 961 CACAGAGCTGTTCATTCCAAATGGTACAACCTCGAAAAGTTTGGGTTTGGGGCACTGGAA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1408 CACAGAGCTGTTCATTCCAAATGGTACAACCTCGAAAAGTTTGGGTTTGGGGCTCTGGAA 1467
Query 1021 GGAGATAAGAGGCACGAGCTCAAGTTCTCCAGCCGAATCCACCTACGAGTTTGCCTTGAA 1080
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 GGAGACAAGAGACACGAGCTCAAGTTCTCCAGCCGAATCCACCTACGAGTTTGCCTTGAA 1527
Query 1081 GGCGGTTATCATGTAATGGACGAATCAACTCTATACATCAGTGACGTGAAACCTACGGCA 1140
|| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528 GGAGGTTACCATGTAATGGACGAGTCAACTCTGTACATCAGTGACGTGAAACCTACGGCA 1587
Query 1141 AGGCAACTGTGGAAG-CAACCTATTGGCATCCTTGAAGTAGGAATCTTGAGTGCTCAAGG 1199
|||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 AGGCAACTATGGAAGTC-TCCTATTGGCATCCTTGAAGTAGGAATCTTGAGTGCTCAAGG 1646
Query 1200 GCTTTCGCCGATGAAAACAAAAGACGGTAAAGCGACAACAGATCCATATTGTGTTGCCAA 1259
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1647 GCTATCGCCTATGAAAACAAAAGACGGTAAAGCGACAACAGATCCGTATTGTGTTGCCAA 1706
Query 1260 GTATGGACAAAAATGGGTGAGAACAAGAACCATCATTGAGAGCTATAACCCTAAATGGAA 1319
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||
Sbjct 1707 GTACGGTCAAAAATGGGTGAGAACAAGAACCATCATTGACAGCTCTAGCCCTAAATGGAA 1766
Query 1320 TGAGCAATACACATGGGAAGTGTATGATCCTTGTACAGTTATCACACTGGGAGTTTTCGA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767 TGAGCAATACACATGGGAAGTGTATGATCCTTGTACAGTTATCACACTGGGAGTTTTCGA 1826
Query 1380 TAACTGTCACCTTGGCGGGAGTGAGAAATCGAACAGTGGAGCCAAAGTGGATTCGAGAAT 1439
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827 TAACTGTCACCTTGGCGGAAGTGAGAAATCGAACAGTGGAGCCAAAGTGGATTCGAGAAT 1886
Query 1440 CGGGAAGGTAAGGATCCGATTATCGACTCTAGAGGCTGATAGAATCTACACTCACTCCTA 1499
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1887 CGGGAAGGTAAGGATCCGGTTGTCGACTCTAGAGGCTGATAGAATCTACACTCACTCCTA 1946
Query 1500 CCCTCTTCTTGTTCTGCAAACAAAAGGGTTAAAGAAAATGGGAGAAGTCCAATTAGCTGT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1947 CCCTCTTCTTGTTCTGCAAACAAAAGGGTTAAAGAAAATGGGAGAAGTCCAATTAGCTGT 2006
Query 1560 GAGATTCACTTGTCTATCTTTGGCTCACATGATCTATCTTTATGGCCATCCTCTGCTTCC 1619
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007 GAGATTCACTTGTCTATCCTTGGCTCACATGATCTATCTTTATGGCCATCCTCTGCTTCC 2066
Query 1620 AAAGATGCATTATCTCCATCCATTCACTGTGAACCAATTAGACAGTCTTAGATACCAAGC 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2067 AAAGATGCATTATCTCCATCCATTCACTGTGAACCAATTAGACAGTCTAAGATACCAAGC 2126
Query 1680 AATGAGCATTGTTTCAGCGCGGTTAGCCCGAGCAGAGCCTCCTTTAAGGAAAGAGATCGT 1739
|||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2127 AATGAGCATTGTCGCAGCACGGTTATCTCGAGCAGAGCCTCCTTTAAGGAAAGAGAACGT 2186
Query 1740 AGAGTACATGCTCGATGTTGATTCACACATGTGGAGCATGAGGAGGAGCAAAGCTAACTT 1799
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2187 AGAGTACATGCTTGATGTTGATTCACACATGTGGAGCATGAGAAGGAGCAAAGCTAACTT 2246
Query 1800 CTTCAGGATAGTCTCTGTGTTTTCAGGCTTGATTGCTATGAGCAAATGGCTTGGTGACGT 1859
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||
Sbjct 2247 CTTCAGGATAGTGTCTGTGTTTGCAGGCTTGATTGCTATGAGTAAATGGCTCGGAGACGT 2306
Query 1860 CTGCTACTGGAAGAATCCATTGACGTCGATATTGTTCCACGTTCTCTTCTTTATACTGAT 1919
|||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2307 CTGCTACTGGAAGAATCCGTTGACGACGATATTATTCCACGTTCTCTTCTTTATATTGAT 2366
Query 1920 CTGTTATCCGGAGCTGATACTGCCAACCACATTCCTCTACATGTTCTTGATAGGTCTCTG 1979
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2367 TTGTTATCCGGAGCTGATACTCCCAACCACATTCCTCTACATGTTCTTGATAGGGCTTTG 2426
Query 1980 GAATTTCAGGTTCAGGACACGCCATCCTGCTCATATGGACATAAAGCTCTCATGGGCTGA 2039
||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||
Sbjct 2427 GAATTTCCGGTTCAGGCCGCGTCATCCTGCTCATATGGACACAAAGGTATCTTGGGCTGA 2486
Query 2040 AGCGGCTAGCCCCGATGAGCTAGATGAGGAATTCGATACTTTCCCAACTTCAAAGGGACA 2099
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2487 AGCGGCTAGCCCTGATGAGCTAGATGAGGAATTTGATACTTTCCCAACTTCAAAGGGACA 2546
Query 2100 AGATGTTGTGAAGATGAGGTATGATAGGTTAAGAAGCGTAGCGGGTCGGATCCAGATGGT 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2547 AGATGTTGTGAAGATGAGGTATGATAGGTTAAGAAGCGTTGCGGGTCGGATCCAGATGGT 2606
Query 2160 TGTTGGAGACATTGCAACGCAAGGAGAGAGGTTTCAAGCTCTGTTGAGTTGGAGAGATCC 2219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2607 TGTTGGAGACATTGCAACGCAAGGAGAGAGGTTTCAGGCTTTGTTGAGTTGGAGAGATCC 2666
Query 2220 GCGTGCGACTTGCTTGTTTGTGATTTTTTGTCTTGTTGCTGCGATGATATTGTACGTGAC 2279
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2667 GCGTGCGACTTGCTTGTTTGTGATTTTTTGTCTTGTTGCTGCGATGATTTTGTACGTGAC 2726
Query 2280 GCCTTTCAAGATCATAGCTCTTGCGGCTGGGATGTTCTGGATGAGGCATCCTAAGTTCAG 2339
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727 GCCTTTCAAGATCATAGCTCTTGCGGGTGGGATGTTCTGGATGAGGCATCCTAAGTTCAG 2786
Query 2340 AAGCAAGATGCCTTCTGCTCCAAGTAACTTCTTCAGGAAATTACCTTCAAAAGCAGATTG 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2787 AAGCAAGATGCCTTCTGCTCCAAGTAACTTCTTCAGGAAATTACCTTCAAAAGCAGATTG 2846
Query 2400 TATGCTTTGAATGGTACAAGTTCTTTGTGG 2429
|||||||||||| ||| || ||||||||||
Sbjct 2847 TATGCTTTGAATTGTAAAACTTCTTTGTGG 2876
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 120631909635
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5