BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg940649
Length=4325
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G11700.2 | Symbols: | BEST Arabidopsis thaliana protein mat... 6244 0.0
> AT5G11700.2 | Symbols: | BEST Arabidopsis thaliana protein match
is: glycine-rich protein (TAIR:AT4G32920.3); Has 8203 Blast
hits to 3102 proteins in 389 species: Archae - 3; Bacteria
- 5624; Metazoa - 852; Fungi - 139; Plants - 704; Viruses
- 77; Other Eukaryotes - 804 (source: NCBI BLink). | chr5:3762462-3771416
REVERSE LENGTH=5223
Length=5223
Score = 6244 bits (3381), Expect = 0.0
Identities = 3591/3691 (97%), Gaps = 19/3691 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTGATGACTCTTGATACTAGTGGATGGCTCGATTTCAATTTTGCTGCGTCTTCATCGTG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 270 TGTGATGACTCTTGATACTAGTGGATGGCTCGATTTCAATTTTGCTGCGTCTTCGTCTTG 329
Query 61 GTCGCTCTTGCGGTTTTGGCCGTAAACCCTAGTTCAAGCTATCGATTTACCATTGTGGAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 GTCGCTCTTGCGGTTTTGGCCGTAAACCCTAGTTCAAGCTATCGATTTACCATTGTGGAA 389
Query 121 CCGAATTCGGGTTTTGATTCGGATTTGGACTCAGATTCAGAGTCGTTACTTTTCCATCAG 180
||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 CCGAAATCGGGTTCTGATTCCGATTTGGACTCAGATTCAGAGTCGTTACTTTTCCATCAG 449
Query 181 GATTACTCTCCGCCTGCTCCGCCACCGCCACCACCGCATGGACCGTCGGTATCTTGTAGC 240
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450 GACTACTCTCCGCCTGCTCCGCCACCGCCACCACCGCATGGACCGTCGGTATCTTGTAGC 509
Query 241 GAGGATCTCGGTGGCGTTGGGTTTTTGGATACTACTTGTAAGATTGTCGCCGATTTGAAT 300
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 GAGGATCTCGGCGGCGTTGGGTTTTTGGATACTACTTGTAAGATTGTCGCCGATTTGAAC 569
Query 301 CTTACGCATGATGTGTATATAGCTGGGAAGGGGAATTTTATCATCCTGCCTGGTGTTAGG 360
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 CTTACGCACGATGTGTATATAGCTGGGAAGGGGAATTTTATCATCCTGCCTGGTGTTAGG 629
Query 361 TTTCACTGCCCGATCCCTGGTTGCTCTATAGCTATCAATGTTTCTGGAAACTTCTCTTTG 420
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 630 TTTCACTGCCCGATCCCTGGTTGTTCTATAGCTATCAATGTTTCTGGAAACTTCTCTTTG 689
Query 421 GGAGCGGAATCTACAATTGTCGCTGGGACATTGGAGCTTTCAGCTGGTAATGCTAGTTTT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 690 GGAGCGGAATCTACAATTGTCGCTGGGACATTGGAGCTTACAGCTGGTAATGCTAGCTTT 749
Query 481 GCCAATGGGTCGGCGGTGAACACGACGGGATTAGCTGGGAATCCTCCGCCACAGACCAGT 540
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 750 GCTAATGGGTCGGCGGTGAACACGACGGGGTTAGCTGGGAGCCCTCCGCCACAGACCAGT 809
Query 541 GGGACACCGCAGGGGATTGATGGTGCTGGTGGTGGACATGGTGGTAGAGGCGCTTGCTGT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 810 GGGACACCGCAGGGGATTGATGGTGCTGGTGGTGGACATGGTGGTAGAGGCGCTTGTTGT 869
Query 601 TTGACTGACACTAGGAAGCTTCCTGAAGATGTGTGGGGAGGTGATGCATACTCGTGGTCG 660
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 870 TTGACTGACACTAAGAAGCTACCTGAAGATGTGTGGGGAGGTGATGCATACTCTTGGTCG 929
Query 661 ACTCTGCAGAGGCCGTGGAGCTATGGTAGTAAAGGAGGGTCAACGAGTAGAGAGATTGAT 720
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 930 ACTCTGCAGAAGCCGTGGAGCTATGGTAGTAAAGGAGGGTCAACTAGTAGAGAGATTGAT 989
Query 721 TATGGAGGAGGAGGAGGTGGCAAAGTGAAAATGGATATTCTGCAGCTTCTGGATGTTAAT 780
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 TATGGAGGAGGAGGAGGTGGGAAAGTGAAGATGGATATTCTGCAGCTTCTGGATGTTAAC 1049
Query 781 GGAAGCCTTTTGGCAAACGGAGG-TAATGGAGGAGCCAAAGGTGGTGGTGGCGCTGGTGG 839
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1050 GGAAGCCTTTTGGCAAACGGAGGCT-ATGGAGGAGCCAAAGGCGGTGGTGGATCTGGTGG 1108
Query 840 CAGCATCTACATCAAAGCATACAAGATGACTGGAATTGGAAAGATCAGTGCATgtggtgg 899
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 CAGCATCTACATCAAGGCATACAAGATGACTGGAATTGGAAAGATCAGTGCATGTGGTGG 1168
Query 900 gagtggttatggtggtgggggtggtggAAGAGTATCTGTCGATATTTTTAGTAGGCATGA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 GAGTGGTTATGGTGGTGGGGGTGGTGGAAGAGTATCTGTCGATATTTTTAGTAGGCATGA 1228
Query 960 TGACCCGAAGATTTTTGTGCATGGCGGATACAGTATCGGATGTCCAGACAACTCAGGTGC 1019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1229 TGACCCGAAGATTTTTGTGCATGGCGGATACAGTATCGGATGTCCAGATAACTCGGGTGC 1288
Query 1020 TGCTGGGACACTCTATGATGCTGTTCCCCGAAGCCTTTTCGTTAGCAACTACAAT-ATGA 1078
|||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1289 TGCTGGAACTCTATATGATGCTGTTCCCCGAAGCCTTTTCGTTAGCAACTACAATCA-GA 1347
Query 1079 CGACAGACACGTATACACTTCTCTTAGAATTTCCCTTCCAGCCACTTTGGACCAATGTTT 1138
| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348 CAACAGACACGTATACGCTTCTCTTAGAATTTCCATTCCAGCCACTTTGGACCAATGTTT 1407
Query 1139 ATATTCAGGATAAAGCGCGAGCAACTTGTCCTCTGTTATGGAGTCGTGTCCAGGTTCAAG 1198
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408 ATATTCAGGATAAAGCACGCGCAACTTGTCCTCTGTTATGGAGTCGTGTCCAGGTTCAAG 1467
Query 1199 GACAAATTAGTTTGTTGTGCGGTGGTGTTTTGAGCTTTGGATTAGCTCATTTTGGCACAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1468 GACAAATTAGTTTGTTGTGCGGTGGTGTTTTGAGCTTCGGATTAGCTCATTATGGTACAT 1527
Query 1259 CAGTATTTGAGTTGTTTGCAGAAGAACTCTTAATGAGTGATTCTACTATCAAGGTTTATG 1318
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1528 CAGTATTTGAGTTGTTGGCAGAAGAACTCTTAATGAGTGATTCTACCATCAAGGTTTACG 1587
Query 1319 GGGCATTACGCATGACTGTCAAAATGTTCTTGATGTGGAATTCAGAATTGCATATAGATG 1378
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1588 GGGCATTACGCATGACTGTCAAGATGTTCTTGATGTGGAACTCAGAATTGCATTTAGATG 1647
Query 1379 GAGGAGGAGGAGATACAACTGTTTCAACTTCCATGCTTGAGGCTAGCAATTTATTCGTTC 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648 GAGGAGGAGGAGATACAACTGTTTCAACTTCCATGCTTGAGGCTAGCAATTTATTCGTTC 1707
Query 1439 TTAGGGGATCATCTGTCATTCGGTCAAATGCAAATCTTGGAGTCCATGGACAAGGTTTCT 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1708 TTAGGGGATCATCTGTCATTCGGTCAAATGCAAATCTTGGAGTCCATGGACAAGGTTTCT 1767
Query 1499 TGAATCTAACTGGACCAGGGGATTCGATTGAAGCACAACGGCTTGTTTTGTCACTATTTT 1558
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1768 TGAATCTAACTGGACCAGGGGATTCAATTGAAGCACAACGGCTTGTTTTGTCACTGTTTT 1827
Query 1559 ACCGGATTTATGTTGGGCCTGGGTCTCTTTTGCGTGCTCCTCTACTGAATGCGTCCAGAG 1618
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1828 ACCGGATTTATGTTGGGCCTGGGTCTATCTTGCGTGCTCCTCTACTGAATGCGTCCAGAG 1887
Query 1619 ATGCTGTTACACCAAAGCTCTATTGTGAACGGCAAGATTGCCCTTATGAACTACTGAATC 1678
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888 ATGCTGTTACACCAAAGCTCTATTGTGAACGACAAGATTGCCCTTATGAACTACTGAATC 1947
Query 1679 CTCCAGAGGATTGCAATGTCAATTCATCTCTGTCCTTTAC-C--C---TA---C------ 1723
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | || |
Sbjct 1948 CTCCAGAGGATTGCAATGTGAATGCATCTCTGTCCTTTACTCTACAGATATGCCGAGTTG 2007
Query 1724 AGGATATTCTCGTCGAAGGTTTCATTAAAGGATCAGTAGTTCATTTCCACCGAGCAAAAA 1783
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2008 AGGATATTCTCGTCGAAGGTTTCATTAAAGGATCAGTAGTTCATTTCCACCGGGCAAAAA 2067
Query 1784 CTGTAACCCTTGAACCCTCTGGAGAGATTAGTGCCAGTGGAATGGGTTGTAGAGGTGGCG 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2068 CTGTAACCCTTGAACCCTCTGGAGAGATTAGTGCCAGTGGAATGGGTTGTAGAGGTGGCG 2127
Query 1844 TAGGTGAAGGTAAATTGCTTGGAAATGGCTTTGGCAGTGGTGGTGGACATGGTGGTAAAG 1903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128 TAGGTGAAGGTAAATTGCTTGGAAATGGCTTTGGCAGTGGTGGTGGACATGGTGGTAAAG 2187
Query 1904 GGGGGCGTGTATGTTACAATAACAGCTGTGTTGAAGGTGGAATTACATATGGAAATGCAA 1963
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2188 GGGGGCGTGTTTGTTACAATAACAGCTGTGTTGAAGGTGGAATTACATATGGAAATGCAA 2247
Query 1964 ATCTCCCTTGTGAGCTTGGCAGTGGAAGTGGCGATTTTAGCCCTGGTTATTCATCTGCTG 2023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2248 ATCTCCCTTGTGAGCTTGGCAGTGGAAGTGGCGATTTTAGCCCTGGTTATTCATCTGCTG 2307
Query 2024 GTGGTGGTATTGTAGTGATTGGTTCAATGGAGCAGCCTCTATCTGGTTTATCACTTGAAG 2083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2308 GTGGTGGTATTGTAGTGATTGGTTCAATGGAGCAGCCTCTATCTGGTTTATCGCTTGAAG 2367
Query 2084 GCTCAATTAGGGTTGATGGAGAAAGTGTCAAACGTTTGAGTAGAGATGAAAATGGTTCTA 2143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2368 GCTCAATTAGGGTTGATGGAGAAAGTGTCAAACGTTTGAGTAGAGATGAAAACGGTTCTA 2427
Query 2144 TTGTAGCTCCTGGGGGTGGTTCTGGGGGAACAGTCCTTTTGTTCCTGCGTTATCTTATTT 2203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 TTGTAGCTCCTGGGGGTGGTTCTGGGGGAACAGTCCTTTTGTTCCTGCGTTATCTTATTT 2487
Query 2204 TAGGAGAGTCGTCCCTTCTCTCAAgtggtggtgggtctggcagtcctggtggtggtggtg 2263
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2488 TAGGAGAGTCATCTCTTCTCTCAAGTGGTGGTGGGTCTGGCAGTCCTGGTGGTGGTGGTG 2547
Query 2264 gtggcggaggtggGAGGATTCATTTTCATTGGTCAAACATTCCGACTGGGGACATATACC 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2548 GTGGCGGAGGTGGGAGGATTCATTTTCATTGGTCAAACATTCCTACTGGGGACATATACC 2607
Query 2324 AGCCCATTGCTAGTGTAAAAGGAATAATTCATGCACGAGGGGGAGCAGCAGCGGATGATG 2383
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2608 AGCCAATTGCTAGTGTAAAAGGAATAATTCATGCACGAGGGGGAGCAGCAGCGGATGATG 2667
Query 2384 GTTTTTATGGCAAAAATGGTACAATAACTGGGACGGCTTGTCCGAAGGGACTCCACGGTA 2443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2668 GTTTTTATGGCAAAAATGGTACAATAACTGGGACGGCTTGTCCGAAGGGACTCCACGGTA 2727
Query 2444 TATTTTGCAAGGAATGTCCATCTGGTACATTCAAGAATGTTACTGGATCCGACCCTTCTC 2503
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2728 TATTTTGCAAGGAATGCCCATCTGGTACATTCAAGAATGTTACTGGATCCGACCCTTCTC 2787
Query 2504 TTTGTCGCCCTTGTCCCGTTGATGAGCTTCCAACTCGTGCTGTCTATGTCACAGTTCGAG 2563
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2788 TTTGTCGTCCTTGTCCGGTTGATGAGCTTCCAACTCGTGCTGTCTATGTCACAGTTCGAG 2847
Query 2564 GTGGCGTTTCTGAGACACCATGTCCATATCGATGCATATCGGAAAGGTATCACATGCCAC 2623
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2848 GTGGTGTTTCTGAGACACCATGTCCATATCGATGCATATCGGAAAGGTATCACATGCCAC 2907
Query 2624 ACTGTTACACCGCACTCGAGGAGTTAATTTACACATTTGGTGGGCCTTGGTTGTTTGGTC 2683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2908 ACTGTTACACCGCACTCGAGGAGTTAATTTACACATTTGGTGGGCCTTGGTTGTTTGGTC 2967
Query 2684 TTCTTCTGATGGGTCTCCTCATCCTCTTAGCACTTGTACTTAGTGTTGCACGAATGAAAT 2743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2968 TTCTTCTGATGGGTCTCCTCATCCTCTTAGCACTTGTACTTAGTGTTGCACGAATGAAAT 3027
Query 2744 TTGTTGGAGTTGATGATTTGCCTGGCCCAGCTCCCACACAGCATGGCTCTCAAATAGATC 2803
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 TTGTTGGAGTTGATGATTTACCTGGCCCAGCTCCCACACAGCATGGCTCTCAAATAGATC 3087
Query 2804 ATTCCTTCCCTTTCCTGGAATCACTTAATGAGGTGTTGGAAACAAATAGAGCTGAGCAAT 2863
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3088 ATTCGTTCCCTTTCCTGGAATCACTTAATGAGGTGTTGGAAACAAATAGAGCTGAGCAAT 3147
Query 2864 CTCAGAGTCATGTGCATAGAATGTATTTTATGGGTCCTAATACATTCAGTGAGCCGTGGC 2923
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3148 CTCAGAGTCATGTGCATAGAATGTATTTTATGGGTCCTAATACATTCAGTGAACCGTGGC 3207
Query 2924 ATCTCTCACACATTCCCCCGGAGGAGATTAAAGAGATAGTATATGAGGCTGCATTTAACA 2983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3208 ATCTCTCACACATTCCCCCGGAGGAGATTAAAGAGATAGTATATGAGGCTGCATTTAACA 3267
Query 2984 CATTTGTCGACGAAATCAACTCTATAGCTGCATATCAATGGTGGGAAGGTGCCATATATA 3043
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3268 CATTTGTCGACGAAATCAACTCTATAGCTGCATATCAATGGTGGGAAGGTGCTATATATA 3327
Query 3044 GTATTCTTTCAGTAGTTGCATATCCGCTCGCATGGTCATGGCAGCAATGGCGGCGGAAGA 3103
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3328 GTATTCTTTCAGTAGTTGCGTATCCGCTCGCATGGTCATGGCAGCAATGGCGGCGGAAGA 3387
Query 3104 TGAAGTTGCAAAAACTGCGTGAGTTTGTACGTTCAGAATATGATCACTCCTGTTTACGCT 3163
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3388 TGAAGTTGCAAAAATTGCGTGAGTTTGTACGTTCAGAATATGATCACTCCTGTTTACGCT 3447
Query 3164 CCTGTCGCTCCCGAGCTTTATACGAGGGTCTGAAGGTCGCTGCAACCTCCGATTTGATGC 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3448 CCTGTCGCTCCCGAGCTTTATACGAGGGTCTGAAGGTCGCTGCAACCTCCGATTTGATGC 3507
Query 3224 TTGCATATCTGGATTTCTTCCTTGGTGGTGATGAAAAAAGGACAGACCTTCCACCTCGAC 3283
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3508 TTGCGTATCTGGATTTCTTCCTTGGTGGGGATGAAAAAAGGACAGACCTTCCACCTCGAC 3567
Query 3284 TTCACCAAAGGTTACCAATGCCCATATTGTTTGGTGGTGATGGCAGTTACATGGCTCCTT 3343
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3568 TTCACCAAAGGTTTCCAATGCCCATATTGTTTGGTGGTGATGGCAGTTACATGGCTCCTT 3627
Query 3344 TCTCACTTCAAAATGACAACATTCTTACCAGTCTGATGAGTCAGCTTGGTTCGCCTACTA 3403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3628 TCTCACTTCAAAATGACAACATTCTTACCAGTCTGATGAGTCAGCTTGGTTCGCCTACTA 3687
Query 3404 CTTGGTACAGACTGGTGGCTGGTGTTAATGCTCAATTACGTCTTGTTCGCCGTGGGCGTC 3463
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3688 CTTGGTATAGACTGGTGGCTGGTGTAAATGCTCAATTACGTCTTGTTCGCCGTGGGCGTC 3747
Query 3464 TGAGATCAACATTTCATTCTGTTCTGAAATGGTTAGAAACTCATGCTAATCCCGCTCTGG 3523
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3748 TGAGATCAACATTTCATTCTGTTCTGAGATGGTTAGAAACTCATGCTAATCCCGCTCTGG 3807
Query 3524 AAACACATGGCATACGGGTTGATCTGGCCTGGTTCCAGACTACAGCTTGTGGTTACTGCC 3583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3808 AAACACATGGCATACGGGTTGATCTGGCCTGGTTCCAGACTACAGCTTGTGGTTACTGCC 3867
Query 3584 AATATGGTCTCTTGATTCATACTGTTGAGGATTGTGAACCAACATCACCTCAGTGTGTCA 3643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3868 AATATGGTCTCTTGATTCATACTGTTGAGGATTGTGAACCAACATCACCTCAGTGTGTCA 3927
Query 3644 ATGAAACAGCATGGACTGAAATCCAGCCACG 3674
||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3928 GTGAAACAACATGGACTGAAATCCAGCCACG 3958
Score = 1160 bits (628), Expect = 0.0
Identities = 644/652 (99%), Gaps = 0/652 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3674 GAAAGAACTATGGAGGGATAATCGACCTTGACAGCTTACCGAGTCTGAAAGAGAAGAGAG 3733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4129 GAAAGAACTATGGAGGGATAATCGACCTTGACAGCTTACCGAGTCTGAAAGAGAAGAGAG 4188
Query 3734 ATATGTTTTTCCTTCTCTCTTTCTTAGTTCACAACACAAAACCTGTGGGCCACCAGGATA 3793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4189 ATATGTTTTTCCTTCTCTCTTTCTTAGTTCACAACACAAAACCTGTGGGCCACCAGGATA 4248
Query 3794 TGGTTGGCTTAGTTATCTCGATGTTACTTTTAGGAGATTTTAGTCTAGTCTTGCTCACAC 3853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4249 TGGTTGGCTTAGTTATCTCGATGTTACTTTTAGGAGATTTTAGTCTAGTCTTGCTCACAC 4308
Query 3854 TGCTCCAGCTGTATTCAATTTCTTTGCTGGATGTACTTTTGGCTTTGTTCATATTACCTC 3913
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4309 TCCTCCAGCTGTATTCGATTTCTTTGCTGGATGTACTTTTGGCTTTGTTTATATTACCTC 4368
Query 3914 TCGGCTTGCTTCTGCCATTCCCCGCCGGGATTAATGCCTTATTCAGTCATGGACCCAGAC 3973
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4369 TCGGCTTGCTTCTGCCATTCCCCGCTGGGATTAATGCCTTATTCAGTCATGGACCCAGAC 4428
Query 3974 GCTCTGCTGGCTTAGCACGTGTTTACGCATTGTGGAACTTCATGTCCTTAGTCAATGTGT 4033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4429 GCTCTGCTGGCTTAGCACGTGTTTACGCATTGTGGAACTTCATGTCCTTAGTCAATGTGT 4488
Query 4034 TTGTTGCTTTTCTCTGCGGATATGTTCATTATCACAGTGAATCATCAGCTAGCAAGAAAA 4093
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4489 TTGTGGCTTTTCTCTGCGGATATGTTCATTATCATAGTGAATCATCAGCTAGCAAGAAAA 4548
Query 4094 TCCCATTTCAGCCGTGGAATATAAACATGGGTGAAAGTGAATGGTGGATATTCCCAGCAG 4153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4549 TCCCATTTCAGCCGTGGAATATAAACATGGGTGAAAGTGAATGGTGGATATTCCCAGCAG 4608
Query 4154 GATTGGTCGTGTGTAAGATAATGCAATCGCAGCTCATAAATCGACATGTAGCAAACCTGG 4213
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4609 GACTGGTCGTGTGTAAGATAATGCAATCGCAGCTCATAAATCGACATGTAGCAAACCTGG 4668
Query 4214 AGATACAAGACCGCTCGTTGTATAGTAAGGATTATGAGCTGTTTTGGCAGTCGTGACAAA 4273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4669 AGATACAAGACCGCTCGTTGTATAGTAAGGATTATGAGCTGTTTTGGCAGTCGTGACAAA 4728
Query 4274 GTCTTGTCAGGTAATTTTTCTCAGAACAACTAAAAACAGTCCCGCCCCAAGT 4325
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4729 GTCTTGTCAGGTAATTTTTCTCAGAACAACTAAAAACAGTCCTGCCCCAAGT 4780
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 215617521014
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5