BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg940758
Length=2637
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G12950.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknow... 4161 0.0
AT5G12960.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknow... 3903 0.0
> AT5G12950.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknown
function (DUF1680) | chr5:4092953-4096975 FORWARD LENGTH=2919
Length=2919
Score = 4161 bits (2253), Expect = 0.0
Identities = 2497/2615 (95%), Gaps = 15/2615 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 AGATACGATGAAGTCTGGTCTCATTATAACCATTGCTTTATTATTATACAC-A--AGCTT 72
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| | |||||
Sbjct 158 AGATACGATGAAGTCTGGTCTCATCATAACCATTGCTCTGTTACTATACACAAGCAGCTT 217
Query 73 TGTTCTTGTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTACGAACACTCCTACGCAGCTCTCATCGCATAC 132
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 218 TGTTCTTGTTTCTGTAGCGAAAGAGTGTACCAACACTCCTACGCAGCTCTCATCCCATAC 277
Query 133 TTTCCGCAACGAGCTTCTTCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCA 192
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 TTTCCGCAGCGAGCTTCTGCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCA 337
Query 193 TTACCATTTAACACCAACTGATGACGCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTT 252
|||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 338 TTACCATTTAACTCCAGCTGATGACTCTGCTTGGTCTAGTTTATTGCCAAGGAAGATGTT 397
Query 253 GAAAGAAGAGGCTGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGACGTTCAAGGACTCTAA 312
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 398 GAAAGAAGAGGCAGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAA 457
Query 313 TTCCTCTGGTAACTTTCTTAAAGAAGTCTCTTTGCACCACGTTAGGCTGGATCCAAACTC 372
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||
Sbjct 458 TTCCTCTGGTAACTTTCTTAAAGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGACCCAGACTC 517
Query 373 CATTCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGG 432
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CTTTCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGG 577
Query 433 TTTGGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAGATCACTATGGAGG 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 578 TTTGGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCACCTGGAGATTACTATGGAGG 637
Query 493 ATGGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAAC 552
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638 ATGGGAGAGACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAAC 697
Query 553 AGCTTATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGT 612
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698 AGCTTATATGTGGGCTAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGT 757
Query 613 CTCAGCTCTATCGGAATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTC 672
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 CTCAGCTCTATCGGAATGCCAACAGAAGTCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTC 817
Query 673 CAGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCA 732
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 CAGTTTTTTCGACCGCTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCA 877
Query 733 CAAGATTATAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTACA 792
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 878 CAAGATTTTAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTAAA 937
Query 793 GATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTCTATGGCCTTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTA 852
||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 GATGGCAACCGGGATGGCTGATTATTTCTATGGCCGTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTA 997
Query 853 CAGCGTTGAAAGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 912
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CAGTGTTGAACGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 1057
Query 913 CTATCAGCTATACAGCATCACTGGAGACTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGA 972
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 TTATCAGCTATACAGCATCACTGGAGATTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGA 1117
Query 973 CAAGCCTTGCTTTCTTGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATAAGTGGATTCCACTC 1032
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1118 CAAGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGC 1177
Query 1033 TAACACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCC 1092
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 TAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCT 1237
Query 1093 ACTCCATAAGGAAATCTCGATTTTCTTTATGGACATCGTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1152
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 ACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATTTTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1297
Query 1153 AACTGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAAATCCAAAGAGAATGGCGACTACGCT 1212
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||
Sbjct 1298 AACAGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAGATCCCAAGAGAATGGCGACTGCACT 1357
Query 1213 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1417
Query 1273 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGTGCTTTGACCAACGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1418 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCCTTGACCAACGG 1477
Query 1333 TGTGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCCAACCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGG 1392
||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 CGTGTTGGGAATTCAAAGAGGAACCCAGCCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGG 1537
Query 1393 TAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTG 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538 TAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTG 1597
Query 1453 GTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCTTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATTTATTTTCA 1512
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1598 GTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCA 1657
Query 1513 AGAAGATGATGTATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTG 1572
|||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658 AGAAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTG 1717
Query 1573 GAAATCTGCTGGTCTTTCGCTATCTCAGAAAGTTAATCCCGTTGTATCGTGGGATCCGTA 1632
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1718 GAAATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTA 1777
Query 1633 CATGCGTGTGACATTCTCT-TTCTCTTCTTCCAAAGGGGGAATGGCAAAGGAGTCGACTT 1691
|||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1778 CATGCGTGTGACATTCACTCTT-TCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTT 1836
Query 1692 TGAATCTAAGAATTCCAGTTTGGACAAACTCTGTAGGTGCCAAAATATCTTTGAATGGGC 1751
|||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1837 TGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGC 1896
Query 1752 AATCCTTAAAAGTACCAAACTTCAGAACCCGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAACTGGA 1811
| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1897 GACCCTTAAACGTACC-AACTTCAG-----GTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGA 1950
Query 1812 AATCTGGCGATCAAGTAACCATGGAGTTACCATTGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAG 1871
||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 AATCTGGTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAG 2010
Query 1872 ATGATCGG-CAGGAGTACTCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCC 1930
|||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 ATGATCGGCCA-GAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCC 2069
Query 1931 GGACACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAAATGGATAACC 1990
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2070 GGACACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAACCTGGAAAATGGATAACC 2129
Query 1991 CCTATACCTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATA 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2130 CCTATACCTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACGTA 2189
Query 2051 TCTTACGTGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGG 2110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2190 TCTTACGTGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGG 2249
Query 2111 ACACAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATA 2170
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 ACACAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATT 2309
Query 2171 TCGGGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTGGTCAAGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCCGGC 2230
||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2310 TCGGGTCCAGAAGGACTAATTGGAAGGCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGC 2369
Query 2231 ATGATTGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGAC 2290
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2370 ATGATTGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACAGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGAC 2429
Query 2291 AAAGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCG 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2430 AAAGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCTAGGAAGCGTTTCG 2489
Query 2351 TTAAGACTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGG 2410
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2490 TTAAGACTAGAGAGCAAAAAAGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACCCTAAAGCAAGGG 2549
Query 2411 ACGAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCA 2470
|| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2550 ACAAAACTAAGGCTAGAATGTGGTTCGGATGCGACTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCA 2609
Query 2471 AGCTTTAAG-TTAAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGG 2529
|||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2610 AGCTTT-AGTTTAAAGACAGGAATGCATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGG 2668
Query 2530 AACACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGT 2589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2669 AACACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGT 2728
Query 2590 GTACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCT 2624
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729 GTACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCT 2763
> AT5G12960.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknown
function (DUF1680) | chr5:4097701-4101668 FORWARD LENGTH=2835
Length=2835
Score = 3903 bits (2113), Expect = 0.0
Identities = 2459/2627 (94%), Gaps = 19/2627 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 18 ATACGATGAAGTCTGGTCTCATTATAACCATTGCTTTATTATTATACACAAGCTTTGTTC 77
||||||||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||
Sbjct 98 ATACGATGAAGTCTGGTGTGATCATAACCATTGCTCTGTTATTATACACAAGCTTTCTTC 157
Query 78 TTGTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTACGA-ACACTCCTACGCAGCTCTCATCGCATACTTTC 136
|||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 158 TTGTTTGTCTGGCGAAAGAGTGTAC-AGACATTCCTACGAAGCTCTCATCGCATACTCTC 216
Query 137 CGCAACGAGCTTCTTCAATCAAAGAACG-AAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTA 195
|||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 217 CGCAGCGAGCTTCTGCAATCACAGAACGCAAA-TTTGAAGTCAGAGGAGTTCTCTCATTA 275
Query 196 CCATTTAACACCAACTGATGACGCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAA 255
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 CCATTTAACTCCAACTGATGACTCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAA 335
Query 256 AGAAGAGGCTGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGACGTTCAAGGACTCTAATTC 315
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 336 AGAAGAGACTGATGATTTTGCTTGGACTATGTTGTATAGAAAGTTCAAGGACTCTAATTC 395
Query 316 CTCTGGTAACTTTCTTAAAGAAGTCTCTTTGCACCACGTTAGGCTGGATCCAAACTCCAT 375
||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| || | || | |
Sbjct 396 CTCTGGTAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTGGACCCGAGCT-CTT 454
Query 376 T-CATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTT 434
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 TCCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTT 514
Query 435 TGGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAGATCACTATGGAGGAT 494
|||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 515 TGGCCTATAACTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTAATGCTCCTGGAGTTCCCTATGGAGGAT 574
Query 495 GGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 575 GGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 634
Query 555 CTTATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGTCT 614
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 635 CTTATATGTGGGCAAGTACTCATAACGAAACTCTCAAGGCGAAAATGACAGCTCTTGTCT 694
Query 615 CAGCTCTATCGGAATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCA 674
|||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 695 CAGCTCTAGCGGAATGCCAGCAGAAATATGGCACAGGATATCTCTCAGCTTTCCCTTCCA 754
Query 675 GTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACA 734
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 755 GTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTATACCATTCACA 814
Query 735 AGATTATAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTACAGA 794
||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||
Sbjct 815 AGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAGA 874
Query 795 TGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTCTATGGCCTTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTACA 854
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 875 TGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAAGAAGTACA 934
Query 855 GCGTTGAAAGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTCT 914
| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 935 GTGTTGAACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTT 994
Query 915 ATCAGCTATACAGCATCACTGGAGACTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGACA 974
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 995 ATCAGCTATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACA 1054
Query 975 AGCCTTGCTTTCTTGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATAAGTGGATTCCACTCTA 1034
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1055 AGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTA 1114
Query 1035 ACACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCCAC 1094
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1115 ATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTAC 1174
Query 1095 TCCATAAGGAAATCTCGATTTTCTTTATGGACATCGTTAATGCTTCTCACAGCTATGCAA 1154
|||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1175 TCCATAAGGAAATCCCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCACACAGCTATGCAA 1234
Query 1155 CTGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAAATCCAAAGAGAATGGCGACTACGCTGC 1214
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1235 CTGGAGGAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACGTTGC 1294
Query 1215 AAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGT 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 AAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGT 1354
Query 1275 TCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGTGCTTTGACCAACGGTG 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1355 TCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTG 1414
Query 1335 TGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCCAACCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTA 1394
||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1415 TGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCGATCCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTGGGTA 1474
Query 1395 AAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGT 1454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1475 AAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTTTGGT 1534
Query 1455 GTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCTTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATTTATTTTCAAG 1514
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1535 GTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAG 1594
Query 1515 AAGATGATGTATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGA 1574
|||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 AAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGA 1654
Query 1575 AATCTGCTGGTCTTTCGCTATCTCAGAAAGTTAATCCCGTTGTATCGTGGGATCCGTACA 1634
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1655 AATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACA 1714
Query 1635 TGCGTGTGACATTCTCT-TTCTCTTCTTCCAAAGGGGGAATGGCAAAGGAGTCGACTTTG 1693
|||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 1715 TGCGTGTGACATTCACTCTT-TCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTTTG 1773
Query 1694 AATCTAAGAATTCCAGTTTGGACAAACTCTGTAGGTGCCAAAATATCTTTGAATGGGCAA 1753
|||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1774 AATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGCGA 1833
Query 1754 TCCTTAAAAGTACCAAACTTCAGAACCCGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAACTGGAAA 1813
||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1834 CCCTTAAACGTACCAA-CTTCAG-----GTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAA 1887
Query 1814 TCTGGCGATCAAGTAACCATGGAGTTACCATTGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGAT 1873
||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888 TCTGGTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGAT 1947
Query 1874 GATCGGCAGGAGTACTCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGA 1933
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1948 GATCGGCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCTTACTTGTTAGCCGGA 2007
Query 1934 CACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAAATGGATAACCCCT 1993
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2008 CACACGAGCATGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAACTGGATAACCCCT 2067
Query 1994 ATACCTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCT 2053
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2068 ATACCTGAAACTCTTAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCT 2127
Query 2054 TACGTGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGGACA 2113
|||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128 TACGTGTTGTCAAACAGCAACCAAACCATCATAATGAAAGTATCACCCGAGCCAGGGACA 2187
Query 2114 CAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCA-CGGATATC 2172
||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||
Sbjct 2188 CAAGACGCTGTTTCGGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATGATTCTAAAC-ATCCGATTTC 2246
Query 2173 GGGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTGGTCAAGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCCGGCAT 2232
| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2247 GAGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTTGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCAT 2306
Query 2233 GATTGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAA 2292
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2307 GATCGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAA 2366
Query 2293 AGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTT 2352
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 AGGATCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTT 2426
Query 2353 AAGACTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGAC 2412
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 2427 AAGCCTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACATTAAAGCAAGGGAC 2486
Query 2413 GAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAG 2472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2487 GAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAG 2546
Query 2473 CTTTAAGTT-AAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAA 2531
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2547 CTTTA-GTTTAAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAA 2605
Query 2532 CACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGT 2591
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606 CACAGAGGAACTTTGTGCTATCGCCATTGTTTAGCCTAAGAGATGAAACATACAATGTGT 2665
Query 2592 ACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCTCTTAAAATTC-TTT 2637
|||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||
Sbjct 2666 ACTTCAGTGTGCAAGCTTGAAGAAATAAACCCTTTTAAAACTCCTTT 2712
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 130935721230
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5