BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg940828
Length=4310
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G13630.1 | Symbols: GUN5, CCH, CHLH, CCH1, ABAR | magnesium-... 7075 0.0
> AT5G13630.1 | Symbols: GUN5, CCH, CHLH, CCH1, ABAR | magnesium-chelatase
subunit chlH, chloroplast, putative / Mg-protoporphyrin
IX chelatase, putative (CHLH) | chr5:4387334-4392227
REVERSE LENGTH=4524
Length=4524
Score = 7075 bits (3831), Expect = 0.0
Identities = 4155/4313 (96%), Gaps = 16/4313 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 CAGCCGCGAAAATGGCTTCGCTTGTGTATTCTCCATTCACTCTATCCACTTCTAAAGCAG 69
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 CAGCCGC-AAAATGGCTTCGCTTGTGTATTCTCCATTCACTCTATCCACTTCTAAAGCAG 194
Query 70 AGCATCTCTCTTCGCTCTCTAACAGTACCAAACATTCTTTCCTCCGGAAGAAACACAGAT 129
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 AGCATCTCTCTTCGCTCACTAACAGTACCAAACATTCTTTCCTCCGGAAGAAACACAGAT 254
Query 130 CGTCAAAACCAGCTC-TATCCTTCTTCAAGGTGAAATCTGCGGTATCTGGAAACGGCCTC 188
| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 255 CAACCAAACCAGC-CAAATCTTTCTTCAAGGTGAAATCTGCTGTATCTGGAAACGGCCTC 313
Query 189 TTCACACAGACGAACCCGGAGGTCCGGCGTATAGTTCCGATCAAGAGAGACAACGTTCCG 248
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 TTCACACAGACGAACCCGGAGGTCCGTCGTATAGTTCCGATCAAGAGAGACAACGTTCCG 373
Query 249 ACGGTGAAAATCGTCTACGTTGTCCTTGAGGCTCAGTACCAGTCTTCTCTCACTGAGGCC 308
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 374 ACGGTGAAAATCGTCTACGTCGTCCTCGAGGCTCAGTACCAGTCTTCTCTCAGTGAAGCC 433
Query 309 GTGCAATCTCTCAACAAGACTTCGAGATTCGCATCCTACGAAGTGGTTGGATACTTGGTA 368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 GTGCAATCTCTCAACAAGACTTCGAGATTCGCATCCTACGAAGTGGTTGGATACTTGGTC 493
Query 369 GAGGAGCTTCGAGACAAGAACACGTACAACAACTTCTGCGAAGACCTTAAAGACGCCAAC 428
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 GAGGAGCTTAGAGACAAGAACACTTACAACAACTTCTGCGAAGACCTTAAAGACGCCAAC 553
Query 429 ATCTTCATTGGTTCTCTGATCTTCGTCGAGGAATTGGCGATCAAAGTTAAAGATGCGGTG 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 554 ATCTTCATTGGTTCTCTGATCTTCGTCGAGGAATTGGCGATTAAAGTTAAGGATGCGGTG 613
Query 489 GAGAAGGAGAGAGACAGGATGGACGCAGTTCTTGTCTTCCCTTCAATGCCTGAGGTAATG 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 GAGAAGGAGAGAGACAGGATGGACGCAGTTCTTGTCTTCCCTTCAATGCCTGAGGTAATG 673
Query 549 AGACTTAACAAACTCGGATCTTTCAGTATGTCTCAATTGGGTCAGTCAAAGTCTCCGTTT 608
||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674 AGACTGAACAAGCTTGGATCTTTTAGTATGTCTCAATTGGGTCAGTCAAAGTCTCCGTTT 733
Query 609 TTCCAACTCTTCAAGAGGAAGAAACAAGGCTCTGCTGGTTTTGCCGATAGTATGTTGAAG 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 TTCCAACTCTTCAAGAGGAAGAAACAAGGCTCTGCTGGTTTTGCCGATAGTATGTTGAAG 793
Query 669 CTTGTTAGGACATTGCCTAAGGTTTTGAAGTACTTACCTAGTGACAAGGCTCAAGATGCT 728
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 CTTGTTAGGACTTTGCCTAAGGTTTTGAAGTACTTACCTAGTGACAAGGCTCAAGATGCT 853
Query 729 CGTCTCTACATCTTGAGTTTACAGTTTTGGCTTGGAGGGTCTCCTGATAATCTCCAGAAT 788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 854 CGTCTCTACATCTTGAGTTTACAGTTTTGGCTTGGAGGCTCTCCTGATAATCTTCAGAAT 913
Query 789 TTCGTTAAGATGATTTCCGGATCTTATGTTCCGGCGTTGAAAGGTGTCAAAATCGAGTAT 848
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 TTTGTTAAGATGATTTCTGGATCTTATGTTCCGGCTTTGAAAGGTGTCAAAATCGAGTAT 973
Query 849 TCGGATCCGGTTTTGTTCTTGGACACTGGAATTTGGCATCCACTTGCTCCCACCATGTAC 908
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 974 TCGGATCCGGTTTTGTTCTTGGATACTGGAATTTGGCATCCACTTGCTCCAACCATGTAC 1033
Query 909 GATGATGTGAAGGAATACTGGAACTGGTATGACACGAGAAGGGACACCAATGACTCACTC 968
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 GATGATGTGAAGGAGTACTGGAACTGGTATGACACTAGAAGGGACACCAATGACTCACTC 1093
Query 969 AAGAGGAAAGATGCAACGGTTGTTGGTTTGGTCTTGCAGAGGAGTCACATTGTGACTGGT 1028
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 AAGAGGAAAGATGCAACGGTTGTCGGTTTAGTCTTGCAGAGGAGTCACATTGTGACTGGT 1153
Query 1029 GATGATAGTCACTATGTGGCTGTTATCATGGAGCTTGAGGCTAGAGGCGCTAAGGTTGTT 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1154 GATGATAGTCACTATGTGGCTGTTATCATGGAGCTTGAGGCTAGAGGTGCTAAGGTCGTT 1213
Query 1089 CCTATATTCGCAGGAGGATTGGATTTCTCTGGTCCAGTTGAGAAATATTTCGTAGATCCG 1148
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1214 CCTATATTCGCAGGAGGGTTGGATTTCTCTGGTCCAGTAGAGAAATATTTCGTAGACCCG 1273
Query 1149 GTGTCCAAACAGCCCATCATAAACTCTGCTGTCTCCTTGACCGGCTTTGCTCTAGTTGGT 1208
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 1274 GTGTCGAAACAGCCCATCGTAAACTCTGCTGTCTCCTTGACTGGTTTTGCTCTTGTTGGT 1333
Query 1209 GGACCTGCAAGGCAGGATCATCCGAGGGCTATCGAAGCCCTGAAGAAGCTCGATGTTCCT 1268
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1334 GGACCTGCAAGGCAGGATCATCCCAGGGCTATCGAAGCCCTGAAAAAGCTCGATGTTCCT 1393
Query 1269 TACCTTGTGGCAGTACCACTGGTGTTCCAGACGACAGAGGAATGGCTAAACAGCACACTT 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 TACCTTGTGGCAGTACCACTGGTGTTCCAGACGACAGAGGAATGGCTAAACAGCACACTT 1453
Query 1329 GGTCTGCATCCCATCCAGGTGGCTCTGCAGGTTGCCCTCCCTGAGCTTGATGGAGCCATG 1388
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1454 GGTCTGCATCCCATCCAGGTGGCTCTGCAGGTTGCCCTCCCTGAGCTTGATGGAGCGATG 1513
Query 1389 GAGCCAATCGTTTTCGCTGGTCGTGACCCTAGAACAGGGAAGTCACATGCTCTCCACAAA 1448
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 GAGCCAATCGTTTTCGCTGGTCGTGACCCTAGAACAGGGAAGTCACATGCTCTCCACAAG 1573
Query 1449 AGAGTTGAGCAACTCTGCATCAGGGCGATTCGATGGGGTGAGCTCAAAAGAAAAACTAAG 1508
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 AGAGTGGAGCAACTCTGCATCAGAGCGATTCGATGGGGTGAGCTCAAAAGAAAAACTAAG 1633
Query 1509 GCAGAGAAGAAGCTGGCAATCACTGTTTTCAGTTTCCCACCTGATAAAGGTAATGTAGGG 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 GCAGAGAAGAAGCTGGCAATCACTGTTTTCAGTTTCCCACCTGATAAAGGTAATGTAGGG 1693
Query 1569 ACTGCAGCTTACCTCAACGTGTTTGCTTCCATCTTCTCGGTCCTAAAAGACCTCAAGAGA 1628
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1694 ACTGCAGCTTACCTCAATGTGTTTGCTTCCATCTTCTCGGTGTTAAGAGACCTCAAGAGA 1753
Query 1629 GATGGCTACAATGTTGAGGGCCTTCCTGAGAATGCAGAGACTCTTATTGAAGAAATCATT 1688
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754 GATGGCTACAATGTTGAAGGCCTTCCTGAGAATGCAGAGACTCTTATTGAAGAAATCATT 1813
Query 1689 CATGACAAGGAGGCTCAGTTCAGCAGTCCTAATCTCAATGTAGCTTACAAAATGGGAGTC 1748
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 CATGACAAGGAGGCTCAGTTCAGCAGCCCTAACCTCAATGTAGCTTACAAAATGGGAGTC 1873
Query 1749 CGCGAGTACCAAGACCTCACTCCTTATGCAAATGCCCTGGAAGAAAACTGGGGAAAACCT 1808
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1874 CGTGAGTACCAAGACCTCACTCCTTATGCAAATGCCCTGGAAGAAAACTGGGGGAAACCT 1933
Query 1809 CCGGGGAACCTTAACTCAGATGGAGAGAATCTTCTTGTCTATGGAAAAGAGTACGGTAAT 1868
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1934 CCGGGGAACCTTAACTCAGATGGAGAGAACCTTCTTGTCTATGGAAAAGCGTACGGTAAT 1993
Query 1869 GTTTTCATCGGAGTCCAACCGACATTTGGGTATGAAGGTGATCCCATGAGGCTGCTTTTC 1928
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 GTTTTCATCGGAGTGCAACCAACATTTGGGTATGAAGGTGATCCCATGAGGCTGCTTTTC 2053
Query 1929 TCCAAGTCAGCAAGTCCTCATCACGGTTTTGCTGCTTACTACTCTTACGTAGAAAAGATC 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2054 TCCAAGTCAGCAAGTCCTCATCACGGTTTTGCTGCTTACTACTCTTATGTAGAAAAGATC 2113
Query 1989 TTCAAAGCTGATGCTGTCCTTCATTTTGGAACACATGGTTCACTCGAGTTTATGCCAGGG 2048
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 2114 TTCAAAGCTGATGCTGTTCTTCATTTTGGAACACATGGTTCTCTCGAGTTTATGCCCGGG 2173
Query 2049 AAGCAAGTGGGAATGAGCGACGCTTGCTTTCCAGACAGTCTTATCGGTAACATTCCCAAT 2108
||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2174 AAGCAAGTGGGAATGAGTGATGCTTGTTTTCCCGACAGTCTTATCGGGAACATTCCCAAT 2233
Query 2109 GTGTACTACTACGCAGCTAACAATCCCTCTGAAGCTACCATCGCAAAGAGGAGAAGTTAC 2168
|| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2234 GTCTACTATTATGCAGCTAACAATCCCTCTGAAGCTACCATTGCAAAGAGGAGAAGTTAT 2293
Query 2169 GCCAACACCATCAGTTATTTGACTCCTCCAGCTGAGAATGCTGGTCTATACAAAGGGCTG 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 GCCAACACCATCAGTTATTTGACTCCTCCAGCTGAGAATGCTGGTCTATACAAAGGGCTG 2353
Query 2229 AAGCAGTTGAGCGAGCTGATATCGTCGTACCAGTCTCTGAAGGACACGGGGAGAGGTCCA 2288
||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 AAGCAGTTGAGTGAGCTGATATCGTCCTATCAGTCTCTGAAGGACACGGGGAGAGGTCCA 2413
Query 2289 CAGATTGTCAGTTCCATCATCAGCACAGCTAAGCAATGTAATCTTGATAAGGATGTGGAC 2348
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 CAGATCGTCAGTTCCATCATCAGCACAGCTAAGCAATGTAATCTTGATAAGGATGTGGAT 2473
Query 2349 CTTCCAGATGAAGGGGCGGAGTTGTCACCTAATGACAGGGATTCTGTGGTTGGAAAAGTG 2408
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2474 CTTCCAGATGAAGGCTTGGAGTTGTCACCTAAAGACAGAGATTCTGTGGTTGGGAAAGTT 2533
Query 2409 TATTCCAAGATTATGGAGATTGAATCAAGGCTTTTGCCGTGCGGGCTTCACGTCATTGGA 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2534 TATTCCAAGATTATGGAGATTGAATCAAGGCTTTTGCCGTGCGGGCTTCACGTCATTGGA 2593
Query 2469 GAGCCTCCATCCGCCATGGAAGCTGTAGCCACACTGGTCAACATTGCTGCTCTAGATCGC 2528
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2594 GAGCCTCCATCCGCCATGGAAGCTGTGGCCACACTGGTCAACATTGCTGCTCTAGATCGT 2653
Query 2529 CCGGAGGATGAGATTTCAGCTCTTCCTTCTATATTAGCTGAGTGTGTTGGAAGGGAGATA 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654 CCGGAGGATGAGATTTCAGCTCTTCCTTCTATATTAGCTGAGTGTGTTGGAAGGGAGATA 2713
Query 2589 GAGGATGTTTACAGAGGAAGTGACAAGGGTATCTTGAGCGATGTAGAGCTTCTCAAAGAG 2648
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2714 GAGGATGTTTACAGAGGAAGCGACAAGGGTATCTTGAGCGATGTAGAGCTTCTCAAAGAG 2773
Query 2649 ATCACTGATGCCTCGCGTGGCGCGGTTTCCGCCTTTGTGGAAAAAACAACAAATAGCAAA 2708
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2774 ATCACTGATGCCTCACGTGGCGCTGTTTCCGCCTTTGTGGAAAAAACAACAAATAGCAAA 2833
Query 2709 GGACAGGTGGTGGATGTGTCTGACAAGCTTACCTCGCTTCTCGGGTTTGGAATCAATGAG 2768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2834 GGACAGGTGGTGGATGTGTCTGACAAGCTTACCTCGCTTCTTGGGTTTGGAATCAATGAG 2893
Query 2769 CCATGGGTTGAGTATTTGTCCAACACCAAGTTTTACCGGGCGAACAGAGATAAGCTCAGA 2828
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2894 CCATGGGTTGAGTATTTGTCCAACACCAAGTTCTACAGGGCGAACAGAGATAAGCTCAGA 2953
Query 2829 ACAGTGTTTGGTTTCCTTGGAGAGTGCCTGAAGTTGGTGGTCATGGACAACGAACTAGGG 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 ACAGTGTTTGGTTTCCTTGGAGAGTGCCTGAAGTTGGTGGTCATGGACAACGAACTAGGG 3013
Query 2889 AGTCTAATGCAAGCTTTGGAAGGGAAGTACGTTGAGCCAGGACCCGGAGGTGATCCCATC 2948
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 3014 AGTCTAATGCAAGCTTTGGAAGGCAAGTACGTCGAGCCTGGCCCCGGAGGTGATCCCATC 3073
Query 2949 AGAAACCCCAAGGTCTTACCAACCGGTAAAAACATTCATGCCTTAGATCCTCAGGCTATT 3008
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3074 AGAAACCCAAAGGTCTTACCAACCGGTAAAAACATCCATGCCTTAGATCCTCAGGCTATT 3133
Query 3009 CCCACAACAGCAGCAATGGCTAGTGCCAAGATTGTGGTCGAGAGGTTGGTAGAGAGACAG 3068
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3134 CCCACAACAGCAGCAATGGCAAGTGCCAAGATTGTGGTTGAGAGGTTGGTAGAGAGACAG 3193
Query 3069 AAGCTCGAAAACGAAGGGAAATATCCCGAGACAATCGCCCTTGTTCTCTGGGGAACTGAC 3128
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3194 AAGCTCGAAAACGAAGGGAAATATCCCGAGACAATCGCGCTTGTTCTTTGGGGAACTGAC 3253
Query 3129 AACATCAAGACATATGGGGAGTCTCTTGGGCAGGTTCTTTGGATGATTGGTGTGAGACCA 3188
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3254 AACATCAAAACATATGGGGAGTCTCTTGGGCAGGTTCTTTGGATGATTGGTGTGAGACCA 3313
Query 3189 ATTGCTGATACTTTTGGAAGAGTGAACCGTGTCGAGCCTGTGAGCTTAGAAGAACTAGGA 3248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3314 ATTGCTGATACTTTTGGAAGAGTGAACCGTGTCGAGCCTGTGAGCTTAGAAGAACTAGGA 3373
Query 3249 AGGCCAAGGATCGATGTAGTTGTTAACTGCTCAGGGGTGTTCCGTGATCTCTTTATCAAT 3308
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3374 AGGCCGAGGATCGATGTAGTTGTTAACTGCTCAGGGGTCTTCCGTGATCTCTTTATCAAC 3433
Query 3309 CAGATGAACCTTCTTGACCGAGCTATCAAGATGGTGGCTGAGCTAGATGAGCCTGTAGAG 3368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3434 CAGATGAACCTTCTTGACCGAGCTATCAAGATGGTGGCGGAGCTAGATGAGCCTGTAGAG 3493
Query 3369 CAAAACTTTGTGAGAAAACACGCGTTGGAACAAGCAGAGGCGCTTGGCATTGATATTAGA 3428
||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3494 CAAAATTTTGTAAGGAAACACGCGTTGGAACAAGCAGAGGCGCTTGGCATTGATATTAGA 3553
Query 3429 GAGGCAGCGACAAGAGTTTTCTCAAACGCTTCAGGGTCATACTCAGCAAACATCAGTCTT 3488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3554 GAGGCAGCGACAAGAGTTTTCTCAAACGCTTCAGGGTCATACTCAGCCAACATCAGTCTT 3613
Query 3489 GCTGTTGAAAACTCTTCATGGAACGATGAGAAACAGCTTCAGGACATGTACTTGAGCCGC 3548
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3614 GCTGTTGAAAACTCGTCATGGAACGATGAGAAACAGCTTCAGGACATGTACTTGAGCCGC 3673
Query 3549 AAATCGTTTGCGTTTGATAGTGATGCTCCTGGAGCAGGAATGGCTGAGAAGAAGCAGGTC 3608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3674 AAATCGTTTGCGTTTGATAGTGATGCTCCTGGAGCAGGAATGGCTGAGAAGAAGCAGGTC 3733
Query 3609 TTTGAGATGGCTCTTAGCACTGCAGAAGTCACCTTCCAGAACCTAGATTCTTCAGAGATT 3668
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3734 TTTGAGATGGCTCTTAGCACTGCAGAAGTCACCTTCCAGAACCTGGATTCTTCAGAGATT 3793
Query 3669 TCCTTGACTGATGTGAGCCACTACTTCGACTCTGACCCGACAAATCTAGTTCAGAGTTTG 3728
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3794 TCTTTGACTGATGTGAGCCACTACTTCGATTCTGACCCTACAAATCTAGTTCAGAGTTTG 3853
Query 3729 AGGAAGGATAAGAAGAAACCGAGCTCTTACATTGCTGATACAACAACTGCAAACGCACAG 3788
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 3854 AGGAAGGATAAGAAGAAACCAAGCTCTTACATTGCTGACACTACAACTGCAAACGCGCAG 3913
Query 3789 GTGAGGACTCTATCTGAGACAGTGAGGCTGGACGCAAGAACGAAGCTGCTGAATCCAAAG 3848
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3914 GTGAGGACACTATCTGAGACAGTGAGGCTGGACGCAAGAACAAAGCTGCTGAATCCAAAG 3973
Query 3849 TGGTACGAAGGAATGATGTCAAGTGGATATGAAGGAGTTCGTGAGATAGAGAAGAGACTG 3908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3974 TGGTACGAAGGAATGATGTCAAGTGGATATGAAGGAGTTCGTGAGATAGAGAAGAGACTG 4033
Query 3909 TCAAACACTGTGGGATGGAGTGCAACGTCCGGTCAAGTAGACAATTGGGTGTACGAGGAG 3968
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4034 TCCAACACTGTGGGATGGAGTGCAACGTCAGGTCAAGTAGACAATTGGGTCTACGAGGAG 4093
Query 3969 GCCAACTCAACTTTCATCCAAGATGAGGAGATGCTTAACCGTCTCATGAACACCAATCCC 4028
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4094 GCCAACTCAACTTTCATCCAAGACGAGGAGATGCTGAACCGTCTCATGAACACCAATCCC 4153
Query 4029 AACTCCTTCAGGAAAATGCTTCAGACTTTCTTGGAGGCCAATGGTCGCGGCTACTGGGAT 4088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4154 AACTCCTTCAGGAAAATGCTTCAGACTTTCTTGGAGGCCAATGGTCGTGGCTACTGGGAC 4213
Query 4089 ACTTCCGCTGAAAACATCGAGAAGCTCAAGGAATTGTACTCGCAGGTGGAAGACAAGATC 4148
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4214 ACTTCCGCTGAAAACATAGAGAAGCTCAAGGAATTGTACTCGCAGGTGGAAGACAAGATC 4273
Query 4149 GAAGGGATTGATAGATAAAC--T---A-A---GCCTATCTTCTTGTAAATGAACTCAAA- 4198
|||||||| ||| ||||||| | | | |||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 4274 GAAGGGATCGATCGATAAACAATGGGATATAAGCCTTTCTTCTTGTAAATGAACTTAAAA 4333
Query 4199 CTTTAtttttttGTGTATTACAGTATCCTACCAA-CGACATTATCTCTCTGTGAATAAGA 4257
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4334 CTTTATTTTT--GTGTATTACAGTATTCTACCAAACGACATCATCTCTCTGTGAATAAGA 4391
Query 4258 GAATGTTTTGGCTGACATTTTCTGACTTTATATGAATGTTGTGGCGTTTCTTC 4310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 4392 GAATGTTTTGGCTGACATTTTCTGACTTTATATGAATGTTGTGGAGCTTCTTC 4444
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 214865016869
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5