BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg940959 Length=2860 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G14770.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 4499 0.0 > AT5G14770.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr5:4772881-4775697 REVERSE LENGTH=2817 Length=2817 Score = 4499 bits (2436), Expect = 0.0 Identities = 2696/2823 (96%), Gaps = 12/2823 (0%) Strand=Plus/Plus Query 24 ATGATAAGGATTTGGAATAACTATAAGGGAAAATACAGATTCTTTCTCTCAAATTGCCGC 83 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1 ATGATAAGGATTTGGAATAACTATAAGGGTAAATACAGATTCTTCCTCTCAAATTGCCGC 60 Query 84 TCTTTCTCGTCAATCAAACGACCCCAAGTCCCAGAAAGCGAAGAGACTAGCCTCTCGATT 143 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCTTTCTCGTCAATCAAACGACCCCAAATCCCAGAAAGCGAAGAGACTAGCCTCTCGATC 120 Query 144 TCAAAACGAATCTTTC-ACCCAGATTTAGCT-CTCAACAAGACTCGGGTTTACGTCTCTC 201 || |||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||| Sbjct 121 ACACAACGAA-GATTCGACCCAGATTTAGCTCCT-ATCAAGACTAGAGTTTACGTCTCTC 178 Query 202 TCTTCCACACTCTCTTTCGGCTCTATTTAAGCTGTGGGAGACTCTACGGAGCAGCAAGGA 261 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 179 TCTTCCATACTCTCTTTCGGCTCTATTTAAGCTGTGAGAGACTCTACGGAGCAGCAAGGA 238 Query 262 CGCTCTCTGCGATGTGCACTTTCGGGGTTGTTCCGGATTTGTGTCTATGGAACAGTCTGA 321 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 239 CGCTCTCTGCGATGTGCACTTTCGGGGTTGTTCCGGATTCGCGTCTATGGAACAGTCTGA 298 Query 322 TTCATCAATTCAATGTCAATGGTTTGGTACACGATCAGGTATCGTTGGTTTATAGCAAGA 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| Sbjct 299 TTCATCAATTCAATGTCAATGGTTTGGTACACGATCAGGTATCGCTGATTTACAGCAAGA 358 Query 382 TGATAGCTTGTGGAGTTTCTCCCGATGTTTTTGCTCTCAATGTGTTGATTCATTCTTTGT 441 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 359 TGATAGCTTGTGGAGTGTCTCCCGATGTTTTTGCTCTCAATGTATTGATTCATTCTTTTT 418 Query 442 GCAAAGTGGGTCAATTGAGTTTTGCGATTAGTTTACTTAGAAATAGAGTAATCAGCGTCG 501 |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 419 GCAAAGTGGGTCGTTTGAGTTTTGCAATTAGTTTACTTAGAAATAGAGTAATCAGCATCG 478 Query 502 ATACTGTTACTTATAACACTGTGATTTCGGGTTTATGTGAACATGGTTTAGCTGATGAGG 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 ATACTGTTACTTATAACACTGTGATTTCGGGTTTATGTGAACATGGTTTAGCTGATGAGG 538 Query 562 CTTATCAGTTTCTCTCTGAGATGGTGAAGATAGGTATATTGCCTGATACGGTTAGCTACA 621 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 CTTATCAGTTTCTATCTGAGATGGTGAAGATGGGTATATTGCCTGATACGGTTAGCTACA 598 Query 622 ATACTCTGATTGATGGGTTTTGTAAAGTTGGAAACTTTGCTAGAGCTAAGGCTTTAGTTG 681 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 599 ATACTCTGATTGATGGGTTTTGTAAAGTTGGAAACTTTGTTAGAGCTAAGGCTTTAGTTG 658 Query 682 ACGAAATCTCGGAACTAAACCTTATCACTCATACTATACTCATAAGCTCCTACTACAACC 741 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 659 ACGAAATCTCGGAACTAAACCTTATCACTCATACTATACTCTTAAGCTCCTACTACAATC 718 Query 742 TCCATGCTATTGAAGAAGCATACAGGGATATGGTTATGAGTGGGTTTGATCCGGATGTTG 801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 TCCATGCTATTGAAGAAGCATACAGGGATATGGTTATGAGTGGGTTTGATCCGGATGTTG 778 Query 802 TTACTTTTAGTTCGATTATTAACCGATTGTGCAAAGATGGAAAAGTGATGGAAGGGGGAT 861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| Sbjct 779 TTACTTTTAGTTCGATTATTAACCGATTGTGCAAAGGTGGAAAAGTGCTGGAAGGGGGAT 838 Query 862 TGTTACTGAGGGAAATGGAAGAGATGGA-TGTATATCCGAACCATGTTACTTATACTACT 920 |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 839 TGTTACTGCGGGAAATGGAGGAGAT-GAGTGTATATCCGAACCATGTAACTTATACTACT 897 Query 921 CTTGTTGATTCGTTATTTAAAGCAAAAGA-TTACCGCCATGCTTTGGCTCTTTACAGTCA 979 ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 CTTGTTGATTCGTTATTTAAAGC-AAATATTTACCGCCATGCTTTGGCTCTTTACAGTCA 956 Query 980 GATGGTTGTGCGTGGCATACCTGTGGATTTAGTTGTATATACTGTTTTGATGGATGGTCT 1039 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 957 GATGGTTGTGCGTGGGATACCTGTAGATTTAGTTGTATATACTGTTTTGATGGATGGTCT 1016 Query 1040 GTTTAAGGCTGGGGACCTTAGGGAGGCTGGGAAAACGTTTAAGATGCTTTTGGAAGATAA 1099 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 GTTTAAGGCTGGGGACCTTAGGGAGGCTGAGAAAACATTTAAGATGCTTTTGGAAGATAA 1076 Query 1100 CCAAGTTCCAAATGTGGTTACATATACGGCTTTGGTAGATGGGTTGTGCAAAGCGAGGGA 1159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 1077 CCAAGTTCCAAATGTGGTTACATATACGGCTTTGGTTGATGGGTTGTGCAAAGCGGGGGA 1136 Query 1160 TTTAAGCAGTGCAGAATTTATCATTACGCAGATGTTGGAGAAAAGTGTTTTTCCGAATGT 1219 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct 1137 TTTAAGCAGTGCAGAATTTATCATAACGCAGATGTTAGAGAAAAGTGTTATTCCGAATGT 1196 Query 1220 TGTAACCTACTCTAGTATGATAAACGGCTATGTGAAGAAAGGGATGCTCGAAGAAGCTGT 1279 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 TGTAACATACTCTAGTATGATAAACGGCTATGTGAAGAAAGGGATGCTCGAAGAAGCTGT 1256 Query 1280 TAGTCTTATGAGAAAAATGGAGGACCAAAATGTTGTGCCGAATGGTTTTACTTATGGTAC 1339 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 TAGTCTTTTGAGAAAAATGGAGGACCAAAATGTTGTGCCGAATGGTTTTACTTATGGTAC 1316 Query 1340 AGTAATTGATGGCTTGTTTAAGGCAGGGAAACAAGAAGTGGC-TTCTGAAATGAGTAAGG 1398 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||| Sbjct 1317 AGTAATTGATGGCTTGTTTAAGGCAGGGAAAGAAGAAATGGCAAT-TGAACTGAGTAAGG 1375 Query 1399 AGATGAGGTTGATTGGGGTGGAGGAAAACAACTACATACTTGATGCTCTGGTGAACCACT 1458 | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1376 AAATGAGGCTGATTGGGGTGGAGGAAAACAACTACATACTTGATGCTCTGGTGAACCACT 1435 Query 1459 TGAAGAGAATTGGTAGGATTAAGGAAGTTAAAGGATTAGTCAAAGACATGGTATCTAAAG 1518 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1436 TGAAGAGAATTGGTAGGATTAAGGAAGTTAAGGGATTAGTCAAAGACATGGTATCTAAAG 1495 Query 1519 GAGTGACGCTGGATCATATTAACTACACTTCTTTAATTGATGTGTTCTTCAAAGGAGGAG 1578 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1496 GAGTGACGCTGGATCAGATTAACTACACATCTTTAATTGATGTATTCTTCAAAGGAGGAG 1555 Query 1579 ACGAAGAAGCTGCTCTTGCTTGGGCTGAAGAAATGCAAGAGAAAGAGATGCCCTGGGATG 1638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| Sbjct 1556 ACGAAGAAGCTGCTCTTGCTTGGGCTGAAGAAATGCAAGAGAGAGGGATGCCGTGGGATG 1615 Query 1639 TTGTTTCATATAATGTCTTAATTAGTGGGCTGTTAAAGTTTGGCAAAGTCGGAGCAGACT 1698 ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1616 TTGTTTCTTATAATGTCTTAATCAGTGGGATGTTAAAGTTTGGCAAAGTCGGAGCAGACT 1675 Query 1699 GGGCCTACAGAGGAATGAGAGAGAAGGGTATAGAACCAGATATCGCTACATTTAACATAA 1758 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1676 GGGCCTACAAAGGAATGAGAGAGAAGGGTATAGAACCAGATATTGCTACATTTAACATAA 1735 Query 1759 TGATGAATTCACAACGAAAACAAGGGGATTTC-GAAGGTATCCTTAAGCTTTGGGATAAG 1817 |||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1736 TGATGAATTCACAAAGAAAGCAAGGGGA-TTCGGAAGGTATCCTTAAGCTTTGGGATAAG 1794 Query 1818 ATGAAGAGTTGTGGAATCAAACCGAGTCTGATGATTTGCAATATTGTGGTTGGAATGCTA 1877 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1795 ATGAAGAGTTGTGGAATAAAACCGAGTCTGATGAGTTGCAATATTGTGGTTGGAATGCTA 1854 Query 1878 TGCGAAAAGGGTAAAATGAAGGAAGCTATTGACATATTGGATCAAATGATGTTTATGGAG 1937 |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1855 TGCGAAAACGGTAAAATGGAGGAAGCAATTCACATATTGAATCAAATGATGCTTATGGAG 1914 Query 1938 ATCCATCCTAACTTAATGACCTACCGAATTTTTCTCGACACGTCTTCAAAGCATAAAAGA 1997 |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1915 ATCCATCCTAACTTAACGACATACCGGATTTTTCTTGACACGTCTTCGAAGCATAAAAGA 1974 Query 1998 GCTGATGCTATATTCAAAACACATGAGACACTATTGAGTTATGGGATTAAACTCAGTAGG 2057 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1975 GCTGATGCTATATTCAAAACGCATGAGACGCTATTGAGTTATGGGATTAAACTCAGTCGG 2034 Query 2058 CAAGTTTATAACACTCTTATTGCAACTCTGTGCAAACTAGGTATGACGAGAAAGGCAGCT 2117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2035 CAAGTTTATAACACTCTTATTGCAACTCTGTGCAAACTAGGTATGACGAAAAAGGCAGCT 2094 Query 2118 ATGGTTATGGAGGATATGGAAGCGAGAGGCTTTGTTCCTGATACTGTGACGTTCAATGCC 2177 |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2095 ATGGTTATGGGGGATATGGAAGCGAGAGGCTTTATTCCTGATACTGTGACGTTCAATTCC 2154 Query 2178 CTTATGCACGGGTACTTCGTGGGCAGTCATGTAGGAAAAGCTCTTTCGACATATTCCATG 2237 ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct 2155 CTTATGCACGGGTACTTTGTAGGCAGTCATGTAAGAAAAGCTCTTTCGACATATTCTGTG 2214 Query 2238 ATGATGGAAGCAGGAATATCTCCAAATGTTGCAACCTATAATACTATAATAAGAGGTCTT 2297 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2215 ATGATGGAAGCAGGAATATCCCCAAATGTTGCAACCTATAATACTATAATAAGAGGTCTT 2274 Query 2298 TCTGATGCGGGGCTAATAAAAGAAGTGGAAAAATGGCTGAGTGAGATGAAGAATAGAGGT 2357 |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2275 TCTGATGCTGGGCTAATAAAGGAAGTGGACAAATGGCTGAGTGAGATGAAGAGTAGAGGT 2334 Query 2358 ATGCGTCCTGACGATTTTACATACAATGCTTTAATTTCTGGTCAAGCGAAGATAGGGAAT 2417 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2335 ATGCGCCCTGACGATTTTACATACAATGCTTTAATCTCTGGTCAAGCTAAGATAGGGAAT 2394 Query 2418 AAGAAAGAAAGTATGACGATATATTGTGAGATGATTGCGGATGGGTTGGTACCGAAAACC 2477 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2395 ATGAAAGGAAGTATGACGATATATTGTGAGATGATTGCGGATGGGTTGGTACCGAAAACC 2454 Query 2478 AGCACTTATAATGTGCTTATCAGTGAATTTGCTAAAGTTGGGAAGATGCTTCAGGCGAGA 2537 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2455 AGCACTTATAATGTGCTTATTAGTGAATTTGCTAACGTTGGGAAGATGCTTCAGGCGAGA 2514 Query 2538 GAGCTAATGAAGGAGATGGGTAAGAGAAGAGTGAGCCCCAATACTTCGACTTATTGTACT 2597 |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2515 GAGCTATTGAAAGAGATGGGTAAGAGAGGAGTGAGCCCCAATACTTCGACTTATTGTACC 2574 Query 2598 ATGATATCTGGTCTGTGCAAACTTTGCACTCATCCGGAAGTTGAGTGGAATAAAAAAGCA 2657 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 2575 ATGATATCTGGTTTGTGCAAACTTTGCACTCATCCAGACGTTGAGTGGAATAAAAAAGCA 2634 Query 2658 ATGTACTTGGCAGAGGCAAAAGGGTTGCTAAAAGAGATGATTGAAGAGAAGGGATATATT 2717 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 2635 ATGTACTTAGCAGAGGCAAAAGGGTTGCTAAAAGAGATGGTTGAAGAAAAGGGATATATT 2694 Query 2718 CCGTATAATCAAACTATTTACTGGATAAGTGCTGCCTTTTCTAAACCTGGAATGAAGGTT 2777 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2695 CCGTGTAATCAAACTATTTACTGGATAAGTGCTGCCTTTTCTAAACCTGGAATGAAGGTT 2754 Query 2778 GATGCTGAAAGATTCTTAAAGGAGTGTTACAAGAAAAAGAATGCTCGTTCCTCAAATTCG 2837 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2755 GATGCTGAAAGATTCTTAAAGGAGTGTTACAAGAAAAAGAATGCTCGTTCCTCAAATTCG 2814 Query 2838 TGA 2840 ||| Sbjct 2815 TGA 2817 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 142122949519 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5