BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg941041
Length=5584
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G15540.1 | Symbols: EMB2773, ATSCC2, SCC2 | PHD finger famil... 9304 0.0
> AT5G15540.1 | Symbols: EMB2773, ATSCC2, SCC2 | PHD finger family
protein | chr5:5047887-5057411 REVERSE LENGTH=5541
Length=5541
Score = 9304 bits (5038), Expect = 0.0
Identities = 5384/5552 (97%), Gaps = 19/5552 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGAGCAATCCAAGCAGTTCCGGCTGGGGTTCAAGTTCGA-GTTTGACTCAGTTCGGGAT 79
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGAGCAATCCAAGCAGTTCCGGCTTGGGTTCAAGTTC-AGGTTTGACTCATTTCGGGAT 59
Query 80 CGGTTTGGCTAATACTGTGCAGTCGGAGGTTGCTCCTTACTTGCCGCTACCGTCGTTACC 139
|||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CGGTTTGGCTAATACTGTTCAGTCGGAAGTTACTCCTTACTTGCCGCTACCGTCGTTACC 119
Query 140 TATATTCTGTGGTGCGGCGGAACCTGGAGAGTTCAAGCTGTTCGATGAGGTTGGCGAAGG 199
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 120 TATATTCTGCGGTGCGGCCGAACCTGGAGAGTTCAAGTTGTTCGATGAGGTTGGCCAAGG 179
Query 200 TAGTAGCTACAGGTCGTTGGATCGCAGTGAGATTCTAGCGCAATCTAGTAGAATCGCAAA 259
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TAGTGGCTACAGGTCGTTGGATCGCAGTGAGATTCTCGCGCAATCTAGTAGAATCGCAAA 239
Query 260 CATGCTTCAAGAGACTGACGTTTCTTACCTGGATCTTAGAAACGTGGCTAGGGCGCCCGA 319
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 240 TATGCTTCATGAGACTGACGTTTCTTACCTGGATCTTAGAAACGAGGCTAGGGCGCCCGA 299
Query 320 TTGTAATTCTGGGGAGCATTTTCAGTTATATGACCAAGTTCTACGATGCAATCCTGGAGC 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TTGTAATTCTGGGGAGCATTTTCAGTTATATGACCTAGTTCTACGATGCAATCCTGGAGC 359
Query 380 ATTTGAGTATGTTACCCCTGGTCCGACCTGCGATCCAGTCTTTACCAATGAAGTGCCTCA 439
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 360 ATTTGAGTATGTTACCCCCGGTCCGACCTGCGATCCACTCTTTACCAATGAAGGGCCTCA 419
Query 440 AAAGATAATTTCTGAGCCAAGTGTTCCTGTCAAGATGCATCGACAGACGGATAATCATTT 499
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 420 AAAGATAATTTCTGAACCAAGTGTTCCTGTCAAGATGCAGCGACAGACGGATACTCATTT 479
Query 500 AGCTAGGAGTATCGAACCTGAACCTGTGAAAAGGGTATTACGATCAAATCATGTTGAAGA 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 480 AGCTAGGAGTATCGAACCTGAACCTGTGAAAAGGGTATTACGACCAAATCATGTT---GA 536
Query 560 AGATCATAGTTGGCAGCACGAAACTCTGACAAACCAGTCACCGAATGATGGTACTGCATA 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
Sbjct 537 AGATCATAGTTGGCAGCACGAAACTCTGACAAACCAGTCACCGAAAGATGTTACTGC--A 594
Query 620 TCATGACTCTCGGCCTGAAACGATCACCATGAATGAAATTTCTGCTTCCAAAAAGCCAAA 679
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 T-ATGACTCTCGGCCTGAAACGATCACCATGAATGAACTTTCTGCTTCCAAAAAGCCAAA 653
Query 680 GGGAAAGAAGAAACGTAAAGATGACTTGTCTTCAGTTCAACCAGATCCATCTGTGCTGCA 739
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 GGGAAAGAAGAAACGTAAAGATGACTTGTCATCAGTTCAACCAGATCCATCTGTGCTGCA 713
Query 740 AGAGTCCATCGTA-AATAGCTTTTGTGAGATGTTGGAGGACTTCTGTGGCAGAGCTGAAG 798
||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 AGAGTCCATCGTACAA-AACTTTTGTGAGATGTTGGAGGACTTCTGTGGCAGAGCTGAAG 772
Query 799 TCCCTGGTGATGATAGGGATGAAACAGAGTGGTCATCAGTTCCTGTTGATGAAGTTCGTG 858
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 773 TCCCTGGTGATGATAGGGATGAAGCAGAGTGGTCATCAGTGCCCGTTGATGAAGTTCGTG 832
Query 859 TTCTTGTAAATGAATTGATGACTATACGGTCAAAAATGCTTCTGCATATGGTACCTGTTG 918
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 TTCTTATAAATGAATTGATGACTATACGGTCAAAAATGCTTCTGCATATGGTACCTGTTG 892
Query 919 ATATTCTATCGAGGTTATTGCGCACTCTGGATCATCAGATACACAGGGCAGAAGGCTTGT 978
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 ATATTCTATCAAGGTTACTGCGCACTCTGGATCATCAGATACACAGGGCAGAAGGCTTGT 952
Query 979 CCATTTATAGTGAACATTCAGATTCAGATTCAGTTTTGTTGGTTCTTGGTGCCCTTGAGT 1038
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 CCATTTATAGTGAACATTCAGATTCAGATTCAGTGTTGTTGGTTCTTGGTGCCCTTGAGT 1012
Query 1039 CAATTCATGCATCGCTAGCAGTGATGGCCAACAGTGATTTGCCAAAGCAGCTCTACAAGG 1098
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 CAATCCATGCATCGCTAGCAGTGATGGCCAACAGTGATATGCCAAAGCAGCTCTACAAGG 1072
Query 1099 AGGAGATAATTGAGAGAATTCTGGAGTTTTCTAGGCACCAAATGATGGCTGTTATGTCTG 1158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 AGGAGATAATTGAGAGAATTCTGGAGTTTTCTAGGCACCAAATGATGGCTGTTATGTCTG 1132
Query 1159 CTTATGATCCATCATACCGCACTGGAAGTAAACCGGCAGAAAATGTGGCATTTGAAGGTG 1218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1133 CTTATGATCCATCATACCGCACTGGAAGTAAACCGGCAGAAAATTTGGCATTTGAAGGTG 1192
Query 1219 ATGATGATGATG---ATCCTGATCATGACATGGGCTCAGCCAGCAAAAGGCGGCGCATAG 1275
|||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 ATGATGATGATGATAATCCAGATCATGACATGGGGTCAGCCAGCAAAAGGCGGCGCATAG 1252
Query 1276 GAAAAAGCGGCAAAGTAAAGAAGTCGTCAGTGAACAGGATCTCTGGAGCAGTGAATACTG 1335
||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1253 TAAAAAACAGCAAAGTAAAGAAGGCGTCAGTAAACAGGATCTCTGGAGCAGTAAATACTG 1312
Query 1336 CACTACAGAAACTTTGCACAATTCTTGGCTTACTCAAGGACCTGTTGTTGGTAGAAAGGT 1395
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 CACTACAGAAACTTTGCACTATTCTTGGCTTACTCAAGGACCTGTTGTTGGTAGAAAGGT 1372
Query 1396 TGTCTGACAGTTGCATTTTACAACTGCTGAAGACAAGTATTACAACATTTCTGGTGGAAA 1455
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1373 TGTCTGACAGTTGCATTTTACAACTGTTGAAGACAAGTATTACAACATTTCTAGTGGAAA 1432
Query 1456 ATATCCAACTTCTGCAACTTAAAGCAATTAGCTTAATCGGTGGTATTTATAATTCATATT 1515
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 ATATCCAAATTCTGCAACTTAAAGCAATTAGCTTAATCGGTGGTATTTATAATTCATATT 1492
Query 1516 CTCAACACCGAACATATGTGATAGATGAAATATCTCAATTGCTCTGGAAGTTACCTTCCT 1575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 CTCAACACCGAACATATGTGATAGATGAAATATCTCAATTGCTCTGGAAGTTACCTTCCT 1552
Query 1576 CGAAACGAGCATTGAGAGCGTATCTTCTCCCTGATGAAGAACAGAGGCAGATTCAAATGG 1635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CGAAACGAGCATTGAGAGCGTATCTTCTCCCTGATGAAGAACAGAGGCAGATTCAAATGG 1612
Query 1636 TCACTGCTTTGCTCATTCAGTTGGTTCACAACAGCACAAACCTTCCTGAAACCTCAAGAC 1695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1613 TCACTGCTTTGCTCATTCAGTTGGTTCACAACAGCACAAGCCTTCCTGAAACCTCGAGAC 1672
Query 1696 AGGCTTCCAGTGGAAACTCTATACTGGAGACCCCAGTTGATGTTGGCTACCTTACTAAGT 1755
||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 AGGCTGCCAGTGGAAACTCTATACTAGAGACCTCAGTTGATGTTGGCTACCTTACTAAGT 1732
Query 1756 GTCATGAAGCTGCTACAGAAACATGTTGCCTCTTCTGGACTCGTGTCCTTGAACGATTTA 1815
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 GTCATGAAGCGGCTACAGAAACATGTTGCCTCTTCTGGACTCGTGTCCTTGAACGATTTA 1792
Query 1816 CCAGTTTTAAGGGTCAGGATGCTTCTGAGATAAAATTGATTATTGAGAATCTTGTTATGG 1875
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 CCAGTTTTAAGGGTCAGGACGCTTCTGAGATAAAATTGATTATTGAGAATCTTGTTATGG 1852
Query 1876 ACTTACTGACAGCATTAAATCTTCCTGAATATCCGTCTGTGTCTCCTATTCTTGAGGTTC 1935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 ACTTACTGACAGCATTAAATCTTCCTGAATATCCGTCTGTGTCTCCTATTCTTGAGGTTC 1912
Query 1936 TCTGTGTCATACTGCTACATAATGCAGGGTTGAAATCAAAAGATGTCTCTGCTCGAATAA 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 TCTGTGTCATACTGCTACATAATGCAGGGTTGAAATCAAAAGATGTCTCTGCTCGAATAA 1972
Query 1996 TGGCCATTGACTTGCTAGGTACAATAGCTGCAAGGTTGAAACGTGATGCTGTCCTCTGCA 2055
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 TGGCCATTGAGTTGCTAGGTACAATAGCTGCAAGGTTGAAACGTGATGCTGTCCTCTGCA 2032
Query 2056 GTAAAGACAGATTCTGGACGTTACTAGAGTCAGATAGTGAAATTAACGTTGATCAAGTTT 2115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2033 GTAAAGACAGATTCTGGACGTTACTAGAGTCAGATAGTGAAATTAGCGTTGATCAAGTTT 2092
Query 2116 GCACAAAAGATTGCACTATTT-GTTTAGGTAAAAGGGCTGGGAACTTATTGGTCTGTCAA 2174
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 GCACAAAAGATTGCAC-ATTTTGTTTAGGTAAAAGGGCTGGGAACTTATTGGTCTGTCAA 2151
Query 2175 ATTTGTCAAAGGCGGTTTCATGGTGACTGTTTGGGTTTAAAGGAACTAGACATTCCAAGT 2234
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2152 ATTTGTCAAAGGCGGTTTCATGGTGACTGTTTGGGTTTAAAGGAACTAGACATTTCAAGT 2211
Query 2235 CGGAATTGGCACTGTCCGTTTTGTGTATGCAAGAGGAAACTTCTTGTACTACAGTCTTAC 2294
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 CGAAATTGGCACTGTCCGCTTTGTGTATGCAAGAGGCAACTTCTTGTACTACAGTCTTAT 2271
Query 2295 TGCAAGACGGACACCAAGGGTACTGGTAAGTTGGAATCAGAAGAAAGCATCGAAAATCCA 2354
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 TGCAAGACTGACACCAAGGGTACTGGTAAGTTGGAATCAGAAGAAAGCATCGAAAATCCA 2331
Query 2355 AGTATGATTACAAAGACCGAAGTTGTGCAACAGATGCTCTTGAATTACCTTCAGGATGCA 2414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2332 AGTATGATTACAAAGACCGAAGTTGTGCAACAGATGCTCTTGAATTACCTTCAGGATGTA 2391
Query 2415 GGATCTA-CTGATGATGTGCATACTTTCATTTGCTGGTTTTATCTGTGCCTTTGGTATAA 2473
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 GGATC-AGCTGATGATGTGCATACTTTCATTTGCTGGTTTTATCTGTGCCTTTGGTATAA 2450
Query 2474 AGATGTCCCAAAATCTCAGGATAAATTCAAATATTACATTGCCAGACTGAAAGCAAAGTC 2533
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451 AGATGTCCCAAAATCTCAGAATAAATTCAAATATTACATTGCCAGACTGAAAGCAAAGTC 2510
Query 2534 AATAATCCGTAACTCTGGAGCAACTACTTCGTTCTTGACAAGAGATGCTATCAAGAAGAT 2593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2511 AATAATCCGTAACTCTGGAGCAACTACTTCGTTCTTGACAAGAGATGCTATCAAGCAGAT 2570
Query 2594 TACTTTAGCCCTTGGAATGAATAGTTCCTTTTCCAGAGGATTTGATAAGATTCTAAACAT 2653
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2571 TACTTTAGCCCTTGGAATGAATAGTTCCTTTTCCAGAGGATTTGATAAGATTCTGAACAT 2630
Query 2654 GCTCCTGGCTAGTTTAAGAGAGAACGCTCCCAACATTAGGGCCAAAGCTTTGCGAGCAGT 2713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2631 GCTCCTGGCTAGTTTAAGAGAGAACGCTCCCAACATTAGGGCTAAAGCTTTGCGAGCAGT 2690
Query 2714 TAGTATAATTGTTGAAGCTGATCCAGAGGTACTGTGTGATAAACGTGTTCAGTTGGCTGT 2773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2691 TAGTATAATTGTTGAAGCTGATCCAGAGGTACTGTGTGATAAGCGTGTTCAGTTGGCTGT 2750
Query 2774 TGAGGGAAGGTTTTGTGATTCTGCAATATCTGTTAGAGAAGCAGCACTGGAACTTGTTGG 2833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2751 TGAGGGAAGGTTTTGTGATTCTGCAATATCTGTTAGAGAAGCAGCACTGGAACTTGTTGG 2810
Query 2834 TAGGCATATTGCATCACATCCTGATGTTGGTATAAAGTATTTTGAGAAGGTCGCTGAGAG 2893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 TAGGCATATTGCATCACATCCTGATGTTGGTATAAAGTACTTTGAGAAGGTCGCTGAGAG 2870
Query 2894 GATTAAGGATACTGGAGTGAGTGTTCGAAAACGAGCCATCAAGATAATACGTGACATGTG 2953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871 GATTAAGGATACTGGAGTGAGTGTTCGAAAACGAGCCATCAAGATAATACGTGACATGTG 2930
Query 2954 TACTTCCAATCCCAACTTCTCTGAATTCACAAGTGCGTGCGCTGAGATATTATCTCGTAT 3013
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2931 TACTTCAAATCCCAACTTCTCTGAATTTACAAGTGCGTGCGCTGAGATATTATCTCGTAT 2990
Query 3014 CAGTGATGATGAGTCTAGCGTTCAGGATCTTGTGTGCAAAACTTTCTATGAATTTTGGTT 3073
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2991 CAGTGATGATGAGTCTAGTGTTCAGGATCTTGTGTGCAAAACTTTCTATGAATTTTGGTT 3050
Query 3074 TGAGGAACCTCCAGGGCATCATACTCAGTTTGCTAGTGACGCTAGCTCCATTCCACTGGA 3133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 TGAGGAACCTCCAGGGCATCATACTCAGTTTGCTAGTGATGCTAGCTCCATTCCACTGGA 3110
Query 3134 ACTGGAAAAGAAAACCAAGCAAATGGTTGGGTTGTTAAGCAGGACCTCAAATCAACAGCT 3193
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3111 ACTGGAGAAGAAAACCAAGCAAATGGTAGGGTTGTTAAGCAGGACCCCAAATCAACAGCT 3170
Query 3194 TCTTGTAACAATTATTAAGCGTGCCCTGGCCCTGGAtttttttCCTCAAGCAGCTAAAGC 3253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3171 GCTTGTAACAATTATTAAGCGTGCCCTGGCCCTGGATTTTTTTCCTCAAGCAGCTAAAGC 3230
Query 3254 TGCTGGTATTAACCCAGTTGCTCTTGCATCAGTACGCAGGCGCTGCGAGCTGATGTGCAA 3313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3231 TGCTGGTATTAACCCAGTTGCTCTTGCATCAGTACGCAGGCGCTGCGAGCTGATGTGCAA 3290
Query 3314 GTGCTTACTGGAAAAAATATTACAGGTAGAAGAAATGAGCCGTGAAGAAGGAGAGTTGCA 3373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3291 GTGCTTACTGGAAAAAATATTACAGGTAGAAGAAATGAGCCGTGAAGAAGGAGAGGTGCA 3350
Query 3374 AGTACTTCCTTATGTACTTGTTTTACATGCTTTCTGTCTGGTGGATCCTGGGCTGTGTAC 3433
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3351 AGTACTTCCTTATGTACTTGTTTTGCATGCTTTCTGTCTGGTGGATCCTGGGCTGTGTAC 3410
Query 3434 ACCGGCTTCAGACCCTACTAAATTTGTCATCACCTTACAGCCATATCTGAAGAGTCAGGC 3493
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 ACCGGCTTCAGACCCTACTAAGTTTGTCATCACCCTACAGCCATATCTGAAGAGTCAGGC 3470
Query 3494 TGATAGTAGAACAGGAGCACAGTTACTAGAGAGTATTATTTTCATTATCGATTCTGTCCT 3553
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3471 TGATAGTAGAACAGGAGCACAGTTACTGGAGAGTATTATTTTCATTATCGATTCTGTCCT 3530
Query 3554 ACCATTGATCCGGAAGCTGCCTCTAAGTGTCACAGAAGATCTGGAACAAGATCTAAAGCA 3613
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3531 ACCCTTGATCCGCAAGCTGCCTCTAAGTGTCACAGAAGATCTGGAACAGGATCTAAAGCA 3590
Query 3614 TATGATTGTTCGGCATTCATTTCTAACTGTTGTTCATGCTTGCGTTAGGTGTCTTTGTTC 3673
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3591 TATGATTGTTCGGCATTCGTTTCTAACTGTTGTGCATGCTTGCGTTAGGTGTCTTTGTTC 3650
Query 3674 TGTGAGTAAATTGGCGGGGAAAGGTGTTAGCATAGTTGAGCATCTTCTTCAGTTCTTTTT 3733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3651 TGTGAGTAAATTGGCGGGGAAAGGTGTTAGCATAGTTGAGCATCTTCTTCAGTTCTTTTT 3710
Query 3734 TAAGCGGCTGGAGGCCCAAGGTTCCGATAACACACAGATTGCTGGGCGGTCCCTTTTTTG 3793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3711 TAAGCGGCTGGAGGCCCAAGGTTCCGATAACACACAGATTGCTGGGCGGTCCCTTTTTTG 3770
Query 3794 TCTTGGCTTGCTTATTCGCCATGGAAATTCTCTTATTAGCACCTCAGGTGGCAAGAATTT 3853
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3771 TCTTGGCTTGCTTATTCGCCATGGAAACTCTCTTATTAGTACCTCAGGTGGCAAGAATTT 3830
Query 3854 CAATCTCTCTGGCTGTCTCAATTTGTTTAAACGACATCTCCGAACGGAAGATATTGCTTT 3913
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3831 CAATCTCTCTGGCTGTCTTAATTTGTTTAAACGACATCTCCGAACGGAAGATATTGCTTT 3890
Query 3914 GAAAGTCAGGTCGCTGCAGGCTTTAGGATTCATCCTAATTGCACGACCTGAGTACATGTT 3973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3891 GAAAGTCAGGTCGCTGCAGGCTTTAGGATTCATCCTAATTGCACGACCTGAGTACATGTT 3950
Query 3974 GGAAGAAGACATTGGAAAGATAATCGAGACTACATTAGCAGATGAAGCAAATGGGCGTAT 4033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3951 GGAAGAAGACATTGGAAAGATAATCGAGACTACATTAGCAGATGAAGCAAATGGGCGTAT 4010
Query 4034 GAAGATGCAAGCATTACAAAACATCTATGAATACCTTCTTGATGCGGAAAAACAATTGGG 4093
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4011 GAAGATGCAAGCATTACAAAACATGTATGAATACCTTCTTGATGCGGAAAAACAATTGGG 4070
Query 4094 ATCCGAGAAAGCCAGTGATAACGTGGTTAACCCAATTGAGCAAGGTGGCCATACTGTACC 4153
||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 4071 ATCAGAGAAAGCCAGTGATAACACGGTTAACTCAGTTGAACAAGGTGGCCATAATGTACC 4130
Query 4154 TGTGGCCGCTGGTGCAGGTGACACCAACATTTGCGGAGGCATTGTGCAGTTGTATTGGGA 4213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4131 TGTGGCCGCTGGTGCAGGTGACACCAACATTTGCGGAGGCATTGTGCAGTTGTTTTGGGA 4190
Query 4214 TAAGATATTAGGTAGATGCTTAGACTTCGATGATCAAATTCGCCAGAC-TGCTCTCAAGA 4272
||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 4191 TAAAATATTAGGTAGATGCTTGGACTTTGATGATCAAATTCGCCAGACCT-CTCTCAAGA 4249
Query 4273 TAGTGGAAGTTGTACTACGTCAAGGCCTAGTTCATCCTATTACGTGTGTCCCTTATTTGA 4332
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4250 TAGTGGAAGTTGTACTACGTCAAGGCCTAGTGCATCCTATTACGTGTGTTCCTTATTTGA 4309
Query 4333 TTGCCCTCGAGACGGATCCTCAAGAGGCCAACCAAAAGCTGGCCCATCATTTACTAATGA 4392
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 TTGCCCTCGAGACAGATCCTCAAGAGGCCAACCAAAAGCTGGCCCATCATTTACTAATGA 4369
Query 4393 ATATGCATGAGAAATATCCGGCtttttttGAGAGCCGTCTCGGTGACGGACTTCAAATGT 4452
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4370 ATATGCATGAGAAGTATCCGGCTTTTTTTGAGAGCCGTCTTGGTGACGGACTTCAAATGT 4429
Query 4453 CGTTTATCTTCATGCAATCCATCAGCCAGGTCACTTCAGAACCAAATCAAAGTCTTCAGC 4512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 CGTTTATCTTCATGCAATCCATCAGCCAGGTCACTTCAGAACCAAATCAAAGTCTTCAGC 4489
Query 4513 AAAAGGGTTCAACAAACATGTCGGGCAAAAATGATCATACTAGTAGTACTCTCACACAAG 4572
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 4490 AAAAGGGTTCAACAAACATGTTGGGCAAAAATGATCATGCTAGTAGTACTCTCACCCAAG 4549
Query 4573 CTAGACTTGGAGTCTCTAGGATCTACAAGCTTATCCGTGGAAACAGGGTTTCTCGAAACA 4632
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4550 CTAGACTTGGAGTCTCTAGGATCTACAAGCTTATCCGTGGAAACCGGGTTTCTCGAAACA 4609
Query 4633 AATTTATGACTTCAATTGTTCGCAAGTTTGATAATCCAACCTGGAGTGGCTCAGTAATAT 4692
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4610 AATTTATGACTTCGATTGTTCGCAAGTTTGATAATCCAACCTGGAATGGCTCAGTAATAT 4669
Query 4693 CCTTTCTGAAGTATTGCACTGAAACCCTTGCTTTACTTCCATTCACATCACCTGATGAGC 4752
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4670 CGTTTCTGAAGTATTGCACTGAAACCCTTGCTTTACTTCCATTCACATCACCTGATGAAC 4729
Query 4753 CACTCTATCTTGTATATTCCATAAACCGAGTTATGCAAATTCGGGCTGGTGCAGTTGAGT 4812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4730 CACTCTATCTTGTATATTCCATAAACCGAGTTATGCAGATTCGGGCTGGAGCAGTTGAGT 4789
Query 4813 CAAATTTGAAGGCTTTGTTACATAAAGAGTCCGCAAAGACTCAGCATGGAAATGGAACGT 4872
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4790 CAAATTTGAAGGCTTTGTTACATAAAGATTCCGCAAAGACTCAGCATGGAAATGGAGCAT 4849
Query 4873 ACCAACAAGGTCCGATTCCCGGACATATGCACATGATGGATCTAAACACAAGAATCCAAG 4932
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4850 ACCAACAAGATCCGATTCCCGGACATATGAACATGATGGATCTAAACACAAGAATCCAAG 4909
Query 4933 AAGAACCAACACATTGGAATTCCTATGCCCATCCAACTCCAATTGACCTCAATGGAGCAG 4992
||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 4910 AAGAACCAAGACATTGGAATTCCTATGGCCATGCAACTCTAATTGACCTCAATGGATCAG 4969
Query 4993 TATACCAAGATTCAAGGGATCAGTTCACTTCATATCAAGTCCATAATGGGAAAGCAGATG 5052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4970 TATACCAAGATTCAAGGGATCAGTTCACTTCATATCAAGTCCATAATGGGAAAGCAGATG 5029
Query 5053 TTCACAAAATGACCTCATCTGATCCTCCTGAATTATCTACCGATGATCTGCAGAAAATTA 5112
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 5030 TGCACAAGATGACCTCATCTGATCCTCCTGAATTATCCACTGATGATCTGCAGAAAATTC 5089
Query 5113 AGGTTGATTGCGCAGCAGCTATAGCTATACAACTTCTTTTGAAGCTCAAGAGATACTTAA 5172
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5090 AGGTTGATTGCTTAGCAGCTATAGCTATACAACTTCTTTTGAAGCTCAAGAGATACCTAA 5149
Query 5173 AAGTCACATATAGCTTAAATGATGACCGGTGCCAAGCCTATTCTCCAACGGAACCATTGA 5232
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5150 AAGTCACGTACAGCTTAAATGATGACCGGTGCCAAGCCTATTCTCCAACGGAACCATTGA 5209
Query 5233 AGCCAGGAGATCCTCTGTCCAGACAAAGTGTTGCCTTTGACCTCAGTGAAACTCGCACTG 5292
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5210 AGCCAGGAGATCCTCTCTCCAGACAAAGCGTTGCCTTTGACCTCAGCGAAACTCGCACTG 5269
Query 5293 ACTTACCTTCAACATATCCAGACTTAGTTCAGAGATATCAGGAGTTTAAGAACGCAATGA 5352
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5270 ACTTACCTTCAACATATCAAGACTTAGTTCAGAGATATCAGGAGTTTAAGAACGCAATGA 5329
Query 5353 GAGAAGATACGGTTGACTTCACCATCTATTCATCAAACGTCAAGAGAAAACGCCCAACGC 5412
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5330 GAGAAGATACGGTTGACTTCACCATCTATTCAACAAACGTCAAGAGAAAACGCCCAACGC 5389
Query 5413 CAAGAAAAACTTCAAGATCAGCTAAAAAACCAGTGGCCTACAACGAAgatgatgatgatg 5472
|||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5390 CAAGGAAAACTTCAAGATCTGCTAAAAAAACAGTGGCCTACAACGAAGATGATGATGATG 5449
Query 5473 acgacgatgatgaCAGAGGATGGCATGGAGGAGGAGGAAGAGGAGCTGCTCGGAGACTGA 5532
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5450 ACGACAATGATGACAGAGGATGGCATGGAGGAGGAGGAAGAGGAGCTGCTCGGAGACTAA 5509
Query 5533 ATTACAGCACCAGAAGTAGCAACAGAAGGTAA 5564
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5510 ATTACAGCACCAGAAGTAGCAACAGAAGGTAA 5541
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 278777702251
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5