BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg941174
Length=2680
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G16750.1 | Symbols: TOZ | Transducin family protein / WD-40 ... 4327 0.0
> AT5G16750.1 | Symbols: TOZ | Transducin family protein / WD-40
repeat family protein | chr5:5504346-5509343 REVERSE LENGTH=2903
Length=2903
Score = 4327 bits (2343), Expect = 0.0
Identities = 2572/2682 (96%), Gaps = 18/2682 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 AGAGATTTCGCTGTTGTGATGGCTCCTCAGTCGTTAAAGAAGAACTACAGGTGCTCACGA 64
||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 AGAGAGTTCGCCGTCGTGATGGCTCCTCATTCGTTAAAGAAGAACTACAGGTGCTCACGA 119
Query 65 TCTCTAAAGCAGTTCTATGGCGGTGGTCCTTTCATTGTTTCATCTGATGGTTCTTTCATC 124
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TCTCTAAAGCAGTTCTACGGCGGTGGTCCTTTCATTGTTTCATCTGATGGTTCTTTCATC 179
Query 125 GCCTGCGCCTGTGGTGACGCCATTAACATCGTTGATTCTACTGATTCATCAGTGAAATCC 184
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 180 GCCTGCGCCTGTGGTGACGTCATTAACATCGTTGATTCTACGGATTCATCAGTGAAATCC 239
Query 185 ACGATTGAAGGCGAGTCGGATACGCTCACTGCTTTGGCTCTTAGTCCTGACGATAAGCTC 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 240 ACGATTGAAGGCGAGTCGGATACGCTCACTGCTTTAGCTCTTAGTCCTGATGATAAGCTC 299
Query 245 CTTTTCTCTGCTGGACATAGTAGACAAATTCGAGTTTGGGATTTGGAAACCTTGAAATGC 304
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTTTTCTCTGCTGGACATAGTAGACAAATCCGAGTTTGGGATTTGGAAACCTTGAAATGC 359
Query 305 ATTCGCTCTTGGAAGGGACACGAAGGACCTGTAATGGGAATGGCTTGCCACGCATCTGGA 364
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 ATTCGCTCTTGGAAGGGACACGAAGGACCTGTGATGGGAATGGCTTGCCACGCATCTGGA 419
Query 365 GGATTGCTAGCTACTGCCGGAGCTGATAGGAAAGTTCTTGTTTGGGATGTTGATGGTGGT 424
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GGATTGCTAGCTACTGCTGGAGCTGATAGGAAAGTTCTTGTTTGGGATGTTGATGGTGGT 479
Query 425 TTCTGCACTCATTATTTCAAAGGCCATAAAGGAGTTGTGTCAAGTATCTTGTTCCATCCT 484
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 480 TTCTGCACTCATTATTTCAGAGGCCATAAAGGGGTTGTGTCAAGTATCCTCTTCCATCCT 539
Query 485 GATACAAACAAAAATATCCTTTTTTCGGGAAGTGATGATGCAACCGTTCGTGTCTGGGAT 544
||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 GATTCAAACAAAAACATTCTTATCTCGGGAAGTGATGATGCAACCGTTCGTGTCTGGGAT 599
Query 545 CTT-TTGGCAAAGAATACTGAGAAGAAATGTCTTGCCATTTTGGAGAAGCACTTTTCAGC 603
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 600 CTTAAT-GCAAAGAATACTGAGAAGAAATGTCTTGCCATTATGGAGAAGCACTTTTCAGC 658
Query 604 TGTGACTTCAATTGCTCTATCAGAGGATGGATGGAATTTATTCAGTGCTGGAAGAGATAA 663
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TGTGACTTCAATTGCTCTATCAGAGGATGGATTGACTTTATTCAGTGCTGGAAGAGATAA 718
Query 664 AGTTGTGAACTTGTGGGACCTTCATGATTATAGCTGCAAGACTACAATTGCAACGTATGA 723
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 719 AGTTGTGAACTTGTGGGACCTTCATGATTATAGCTGCAAGGCTACAGTTGCAACGTATGA 778
Query 724 GGTACTAGAAGCTGTGACAGCAGTGTCTTCTGGGACGCCTTTCGCTTCATTTGTAGCTTC 783
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GGTACTAGAAGCTGTGACAACAGTTTCTTCTGGGACGCCTTTCGCTTCATTTGTAGCTTC 838
Query 784 TTTGGATCAGAAGAAGAGTAAGAAGAAGGAATCTGATTCTCAAGGAACATATTTTATTAC 843
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 839 TTTGGATCAGAAGAAGAGTAAGAAGAAGGAATCTGATTCTCAAGCAACATATTTTATTAC 898
Query 844 TGTTGGTGAACGTGGTGTTGTGCGCATCTGGAAGTCTGAAGGTTCAATTTGCCTCTATGA 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TGTTGGTGAACGTGGTGTTGTGCGCATCTGGAAGTCTGAAGGTTCAATTTGCCTCTATGA 958
Query 904 GCAAAAGTCGTCGGATATTACTGTCAGCTCAGATGACGAGGAATCTAAAAGAGGATTCAC 963
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GCAAAAGTCGTCGGATATTACTGTCAGCTCGGATGATGAGGAATCTAAAAGAGGATTCAC 1018
Query 964 TGCAGCTGCTATGCTGCCTTCTGATCGCGGACTGCTTTGTGTGACTGCTGATCAGCAGTT 1023
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TGCAGCTGCTATGCTGCCTTCTGATCACGGACTGCTTTGTGTGACTGCTGATCAGCAGTT 1078
Query 1024 CTTTTTCTACTCCGTTGTGGAAAATGTAGAAGTATCAGAGTTAGTGCTAAGCAAGAGGCT 1083
||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CTTTTTCTACTCCGTTGTGGAAAATGTGGAAGAAACAGAGTTAGTGCTAAGCAAGAGGCT 1138
Query 1084 TGTTGGATATAATGAAGAAATAGCAGATATGAAGTTCCTAGGTGATGAAGAACAGTTTCT 1143
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 GGTTGGATATAATGAAGAAATAGCTGATATGAAGTTCCTAGGTGATGAAGAACAGTTTCT 1198
Query 1144 CGCAGTAGCTACAAATCTCGAGGAGGTTCGTGTTTATGATGTTGCAACAATGTCATGTTC 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 CGCAGTAGCTACAAATCTCGAGGAGGTTCGTGTATATGATGTTGCAACAATGTCATGTTC 1258
Query 1204 CTACGTGTTAGCTGGCCATAAGGAAGTTATTCTGTCCCTTGACACTTGCGTATCTAGTTC 1263
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTACGTGTTAGCTGGCCATAAGGAAGTTGTTCTGTCCCTCGACACTTGCGTATCTAGTTC 1318
Query 1264 TGGGAATGTTCTAATGGTAACTGGAAGTAAAGACAAAACTGTAAGGCTATGGAACGCAAC 1323
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TGGGAATGTTCTAATCGTAACTGGAAGTAAAGACAAAACTGTAAGGCTATGGAACGCAAC 1378
Query 1324 AAGCAAATCTTGCATCGGAGTTGGTACAGGCCATAATGGTGATATCTTAGCGGTTGCTTT 1383
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 AAGCAAATCTTGTATCGGAGTTGGTACTGGCCATAATGGCGATATCTTAGCGGTTGCTTT 1438
Query 1384 TGCGAAGAAGTCCTTCAGTTTCTTTGTCAGTGGAAGTGGTGATCGTACACTGAAGGTCTG 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TGCGAAGAAGTCCTTCAGTTTCTTTGTCAGTGGAAGTGGTGATCGTACACTGAAGGTCTG 1498
Query 1444 GAGCCTTGATGGTATTTCAGAGGACTCAGAGGATCCCGTTAATCTGAAAACTAGAAGTGT 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GAGCCTTGATGGTATTTCAGAGGACTCAGAGGAGCCCATTAATCTGAAAACTAGAAGTGT 1558
Query 1504 TGTCGCTGCCCATGATAAAGACATCAATTCTGTGGCTGTTGCTCGTAACGATAGCTTAGT 1563
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 TGTCGCTGCCCATGATAAAGACATCAATTCCGTGGCTGTTGCTCGTAACGATAGCTTAGT 1618
Query 1564 TTGCACTGGTTCTGAGGATCGTACAGCTAGCATATGGAGACTACCAGACTTGGTGCATGT 1623
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1619 TTGCACTGGTTCTGAGGATCGTACAGCTAGCATATGGAGACTACCAGACTTGGTACATGT 1678
Query 1624 TGTTACACTTAAGGGACATAAGAGGCGGATTTTTTCTGTTGAGTTCTCAACTGTTGATCA 1683
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 TGTTACACTTAAAGGACACAAGAGGCGGATTTTTTCTGTTGAGTTCTCAACTGTTGATCA 1738
Query 1684 GTGCGTCATGACAGCTTCAGGCGATAAGACAGTAAAGATATGGGCTATATCCGATGGTTC 1743
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1739 GTGCGTAATGACAGCTTCAGGAGATAAGACAGTAAAGATATGGGCTATATCTGATGGTTC 1798
Query 1744 ATGCCTCAAAACATTTGAAGGTCATACCTCAAGTGTACTTAGGGCCTCATTCATAACTGA 1803
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1799 CTGCCTCAAAACATTTGAAGGTCATACCTCAAGTGTACTTAGGGCCTCATTTATAACTGA 1858
Query 1804 GGGAACTCAATTTGTCTCATGTGGTGCCGATGGTTTGTTGAAACTTTGGAATGTGAACAC 1863
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 TGGAACCCAATTTGTCTCATGTGGTGCCGATGGTTTGTTGAAACTTTGGAATGTGAACAC 1918
Query 1864 TAGCGAATGCATTGCCACATATGACCAGCACGAGGACAAGGTATGGGCTTTAGCTGTCGG 1923
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1919 TAGCGAGTGCATTGCCACATATGACCAGCACGAGGACAAGGTATGGGCTTTAGCTGTTGG 1978
Query 1924 AAAGAAAACAGAAATGATTGCAACTGGTGGAGGCGATGCAGTTATTAATTTATGGCATGA 1983
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 AAAGAAGACAGAAATGATTGCAACTGGTGGAGGTGATGCAGTTATTAATTTATGGCATGA 2038
Query 1984 TTCAACCGCTTCCGATAAAGAAGACGAATTCCGGAAAGAGGAAGAAGCAATCTTGAGAGG 2043
|||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TTCAACCGCTTCAGATAAAGAAGACGATTTCCGAAAAGAGGAAGAAGCAATCTTGAGAGG 2098
Query 2044 TCAAGAGCTGGAAAACGCAGTGTTAGATGCTGAATACACTAAAGCTATAAGATTAGCATT 2103
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 TCAAGAGCTGGAAAACGCAGTGTTAGATGCGGAATACACTAAAGCTATAAGATTAGCATT 2158
Query 2104 TGAGCTTCGTAGGCCTCACAAAGTTTTTGAACTCTTT-GCTGGTCTCTGCAGGAAAAGAG 2162
||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 TGAGCTTTGTAGGCCTCACAAAGTTTTTGAGCTCTTCAG-TGGTCTCTGCAGGAAAAGAG 2217
Query 2163 AATCAGACGAACAGATTGTGAAAGCTCTTCAAGGACTTGAACAGGAAGAGTTCCGTCTAC 2222
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2218 ATTCAGACGAACAGATAGTGAAAGCTCTTCAAGGACTTGAAAAAGAAGAGTTCCGTCTAC 2277
Query 2223 TTTTTGAATATGTCAGAGAATGGAACACAAAACCAAAGCTATGCCACATTGCTCAGTTTG 2282
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 TTTTTGAATATGTCCGAGAATGGAACACAAAACCAAAGCTATGCCACATTGCTCAGTTTG 2337
Query 2283 TTCTTTACCAAACCTTCAACATACTTCCTCCCACAGAAATTGTTCAGGTAAAAGGAATTG 2342
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 TTCTTTACAAAACCTTCAACATACTTCCTCCCACAGAAATTGTTCAGGTAAAAGGAATTG 2397
Query 2343 GGGAACTCCTGGAAGGTTTAATCCCATATTCTCAGAGACATTTCAACAGAATCGACAGAT 2402
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2398 GGGAACTCCTGGAAGGGTTAATCCCATATAGTCAGAGACATTTCAGTAGAATTGACAGAT 2457
Query 2403 TTGTAAGAAGCAGTTTCTTGTTAGACTACACACTTGGTGAGATGTCTGTGATCGATCCAG 2462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 TTGTAAGAAGCAGTTTCTTGTTAGACTACACACTTGGTGAGATGTCTGTGATCGATCCAG 2517
Query 2463 AGACTG---AGACAGAGTATCCTAAGGACAAGAAGAAGAAAGAAAAAGAGGTAATTGCTG 2519
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||
Sbjct 2518 AGACTGTTGAGACAGAGTATCCTAAGGACGAGAAGAAAAAAGAAAAAGATGTCATTGCTG 2577
Query 2520 CTGTTTCCGCAATGGAACAAGACACAGAAGAGCTAAA-CAAAGAGACTCCTTCGAGGAAA 2578
| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2578 C---------AATGGAACAAGACACAGACGAGCTAAAGCAG-GAGACTCCTTCGAGGAAA 2627
Query 2579 CGAAAGTCTCAGAAATCCAAAGATAAATCGAATAAGAAGAGACTCATTGCCGAAGCACAG 2638
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 CGAAAGTCTCAGAAATCCAAAGGTAAATCGAATAAGAAGAGACTCATTGCCGAAGCACAG 2687
Query 2639 GGAAGCGTAATCGCAGTTTGAATCTTGAAATGCTACATCAAT 2680
||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||
Sbjct 2688 GGAAGCGTAATTGCAGTTTGAGTCTTGAAATACTTCATCAAT 2729
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 133092899779
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5