BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg941202
Length=3278
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G17020.1 | Symbols: XPO1A, ATCRM1, ATXPO1, XPO1, HIT2 | expo... 5498 0.0
AT3G03110.1 | Symbols: XPO1B, CRM1B | exportin 1B | chr3:708936... 3254 0.0
> AT5G17020.1 | Symbols: XPO1A, ATCRM1, ATXPO1, XPO1, HIT2 | exportin
1A | chr5:5594736-5602955 FORWARD LENGTH=3884
Length=3884
Score = 5498 bits (2977), Expect = 0.0
Identities = 3170/3265 (97%), Gaps = 5/3265 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 15 TCTCTCTCTGCCATGGCGGCTGAGAAGTTAAGGGACTTGAGCCAGCCGATTGACGTCGGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 TCTCTCTCTGCCATGGCGGCTGAGAAGTTAAGGGACTTGAGCCAGCCGATTGACGTCGGT 216
Query 75 GTGCTCGATGCCACTGTTGCGGCCTTCTTTGTTACCGGATCTAAAGAAGAGAGAGCTGCT 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 GTGCTCGATGCCACTGTTGCGGCCTTCTTTGTTACCGGATCTAAAGAAGAGAGAGCTGCT 276
Query 135 GCGGACCAGATTTTGCGGGATTTGCAGGCTAATCCAGATATGTGGCTTCAAGTTGTCCAC 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 GCGGACCAGATTTTGCGGGATTTGCAGGCTAATCCAGATATGTGGCTTCAAGTTGTCCAC 336
Query 195 ATTCTACAAAACACAAAGAGCATGGATACCAAGTTCTTTGCTCTTCAGGTTCTAGAAGGT 254
||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 337 ATTCTACAAAATACAAACAGCTTGGATACCAAGTTCTTTGCTCTGCAGGTTCTAGAAGGT 396
Query 255 GTTATAAAGTATAGATGGAATGCACTGCCTGTTGAACAACGAGATGGAATGAAAAATTAC 314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 GTTATAAAGTATAGATGGAATGCACTGCCTGTTGAACAACGAGATGGAATGAAAAATTAC 456
Query 315 ATCTCAGAGGTCATTGTACAGCTCTCGAGTAATGAAGCATCTTTCAGATCAGAAAGGCTC 374
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 ATCTCAGAGGTTATTGTACAGCTCTCGAGTAATGAAGCATCTTTCAGATCAGAAAGGCTC 516
Query 375 TATGTCAACAAGCTAAATGTCATTTTGGTCCAGATAGTGAAACATGATTGGCCGGCAAAG 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 TATGTCAACAAGCTAAATGTCATTTTGGTCCAGATCGTGAAACATGATTGGCCGGCAAAG 576
Query 435 TGGACAAGCTTCATTCCTGATCTAGTTGCGGCTGCTAAAACTAGCGAAACTATCTGCGAA 494
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 TGGACAAGCTTCATTCCTGATCTAGTTGCAGCTGCTAAAACTAGCGAAACTATCTGCGAA 636
Query 495 AATTGCATGGCCATTTTGAAACTCCTAAGCGAAGAGGTTTTTGATTTCTCAAGAGGAGAA 554
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 AATTGCATGGCCATTTTGAAACTCCTAAGTGAAGAGGTTTTTGATTTCTCAAGAGGAGAA 696
Query 555 ATGACTCTGCAGAAGATTAAAGAGCTGAAACAATCTCTAAACAGCGAGTTTAAACTCATT 614
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 697 ATGACTCAGCAGAAGATTAAAGAGCTGAAACAATCTCTAAACAGTGAGTTTAAACTCATT 756
Query 615 CATGAGTTATGCCTATATGTCCTCTCAGCTTCTCAAAGACAGGATCTTATACGTGCAACA 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 CATGAGTTATGCCTATATGTCCTCTCAGCTTCTCAAAGACAGGATCTTATACGTGCAACA 816
Query 675 CTGTCTGCGTTGCATGCCTATCTTTCCTGGATTCCATTGGGTTATATTTTTGAGTCTCCT 734
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 817 CTGTCTGCATTGCATGCCTATCTTTCCTGGATTCCATTGGGTTACATTTTTGAGTCTACT 876
Query 735 TTGCTTGAGACCCTCCTTAAATTCTTCCCTGTGCCAGCATATAGGAACCTCACTCTTCAA 794
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 877 TTGCTTGAGACCCTCCTTAAATTTTTTCCTGTGCCAGCATATAGGAACCTCACTATTCAA 936
Query 795 TGTCTGACCGAGGTTGCAGCTCTTAATTTCGGGGACTTCTACAATGTCCAATATGTCAAC 854
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 937 TGTCTGACCGAGGTCGCAGCTCTTAATTTCGGGGACTTCTACAATGTTCAATATGTCAAA 996
Query 855 ATGTACACCATATTTATAGGGCAGCTGCGGGCAATTCTCCCACCGAGTACAAATATCCCT 914
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 997 ATGTATACCATATTTATAGGGCAGCTGCGGATAATTCTCCCACCGAGTACAAAGATCCCT 1056
Query 915 GAGGCATATTCAAGTGGAAGTGGTGAAGAACAAGCATTTATCCAGAACCTGGCACTGTTT 974
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1057 GAGGCATATTCCAGTGGAAGTGGTGAAGAACAAGCATTTATCCAGAACCTGGCACTATTT 1116
Query 975 TTCACTTCCTTTTTCAAGTTTCATATTCGAGTCCTAGAATCAGCGCCAGAAGTTGT-TGC 1033
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
Sbjct 1117 TTCACTTCCTTTTTCAAGTTTCATATTCGAGTCCTAGAATCAACGCCAGAAGTTGTCT-C 1175
Query 1034 TTTGTTACTTGCTGGTCTCGAATATCTCATTAATATATCATATGTTGATGACACTGAAGT 1093
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1176 TTTGTTACTCGCTGGTCTAGAATATCTCATTAATATATCTTATGTTGACGACACTGAAGT 1235
Query 1094 ATTTAAGGTTTGTTTGGATTATTGGAACTCGTTGGTTTTGGAGCTGTTTGATGCACATCA 1153
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1236 ATTTAAGGTTTGTTTGGACTATTGGAACTCGTTGGTGTTGGAGCTATTTGATGCGCATCA 1295
Query 1154 TAATTCTGATAACCCTGCAGTAAGTGCAAGCCTGATGGGATTGCAGATGCCTTTCCTTCC 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1296 TAATTCTGATAACCCTGCAGTAAGTGCAAGCCTGATGGGTTTGCAG---CCTTTCCTTCC 1352
Query 1214 TGGTATGGTTGATGGCCTTGGTTCTCAAGTCATGCAGCGGCGTCAACTTTATTCTAACCC 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1353 TGGTATGGTTGATGGCCTTGGTTCTCAAGTCATGCAGCGGCGTCAACTTTATTCTCACCC 1412
Query 1274 AATGTCCAAATTAAGAGGGTTAATGATTAACCGCATGGCGAAGCCTGAAGAAGTGCTTAT 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413 AATGTCCAAATTAAGAGGGTTAATGATTAACCGCATGGCGAAGCCTGAAGAAGTGCTTAT 1472
Query 1334 TGTTGAAGATGAAAATGGGAACATCGTCCGTGAAACCATGAAGGACAATGATGTTCTTGT 1393
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 TGTTGAAGATGAAAATGGGAACATCGTTCGTGAAACCATGAAGGACAATGATGTTCTTGT 1532
Query 1394 CCAGTATAAGATTATGCGGGAGACATTAATCTACCTCTCACACCTTGACCATGATGATAC 1453
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533 CCAATATAAGATAATGCGGGAGACATTAATCTACCTCTCACACCTTGACCATGATGATAC 1592
Query 1454 CGAGAAGCAGATGTTGAGGAAGCTAAACAAACAATTAAGTGGGGAGGAATGGGCATGGAA 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 CGAGAAGCAGATGTTGAGGAAGCTAAACAAACAATTAAGTGGGGAGGAATGGGCATGGAA 1652
Query 1514 CAACTTGAACACTTTGTGCTGGGCTATTGGATCTATTTCTGGATCTATGGCAGAAGATCA 1573
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1653 CAATTTGAACACTTTGTGCTGGGCTATTGGGTCTATTTCCGGATCTATGGCAGAAGATCA 1712
Query 1574 GGAAAACAGGTTTTTGGTGATGGTCATTCGTGATTTGTTGAATTTATGTGAAATTACTAA 1633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1713 GGAAAACAGGTTTTTGGTGATGGTCATTCGTGATTTGTTGAATTTATGTGAAATTACCAA 1772
Query 1634 GGGAAAAGACAATAAAGCCGTTATTGCGAGCAACATCATGTATGTCGTTGGCCAGTACCC 1693
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1773 GGGAAAAGACAATAAAGCCGTTATTGCAAGCAACATCATGTATGTCGTTGGCCAGTATCC 1832
Query 1694 GAGATTCTTAAGGGCCCATTGGAAGTTTTTGAAGACAGTTGTGAACAAGTTGTTTGAATT 1753
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833 AAGATTCTTAAGGGCCCATTGGAAGTTTTTGAAGACAGTTGTGAACAAGTTGTTTGAATT 1892
Query 1754 CATGCATGAGACACATCCTGGTGTTCAGGACATGGCATGTGACACATTCTTGAAAATAGT 1813
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1893 CATGCATGAAACACATCCTGGTGTTCAGGACATGGCCTGTGATACATTCTTGAAAATAGT 1952
Query 1814 TCAAAAGTGCAAGCGAAAATTTGTTATTGTACAGGTTGGAGAGAATGAACCATTTGTATC 1873
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1953 TCAAAAGTGCAAGCGAAAATTCGTTATTGTACAGGTTGGAGAGAATGAACCATTTGTATC 2012
Query 1874 TGAACTTCTATCAGGCCTTGCAACAACTGTTCAAGATCTTGAGCCTCATCAAATACACTC 1933
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013 TGAACTTCTAACAGGCCTTGCAACAACTGTTCAAGATCTTGAGCCTCATCAAATACACTC 2072
Query 1934 ATTTTATGAATCAGTTGGTAATATGATCCAAGCAGAACCAGATCCTCAGAAGCGAGATGA 1993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2073 ATTTTATGAATCAGTTGGTAATATGATCCAAGCAGAATCAGATCCTCAGAAGAGAGATGA 2132
Query 1994 ATATCTCCAGAGGTTGATGGCACTCCCCAACCAGAAATGGGCAGAAATCATAGGACAGGC 2053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2133 ATATCTCCAGAGGTTGATGGCACTCCCCAACCAGAAATGGGCAGAAATCATAGGACAGGC 2192
Query 2054 ACGCCAAAGTGTAGAATTCCTCAAGGATCCAGGTGTGATACGAACAGTGCTTAACATCCT 2113
|||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2193 ACGCCACAGTGTAGAATTCCTCAAGGATCAAGTTGTGATACGTACAGTGCTAAACATCCT 2252
Query 2114 ACAGACTAATACTAGTGCTGCTACTTCACTGGGAACCTACTTCTTATCCCAAATTTCCTT 2173
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 ACAGACTAATACTAGTGCTGCTACTTCACTGGGAACATACTTCTTATCCCAAATTTCCTT 2312
Query 2174 GATCTTCTTGGATATGCTGAATGTATACAGAATGTACAGTGAGCTTGTGTCAACCAACAT 2233
||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2313 GATTTTCTTGGATATGTTGAATGTATACAGAATGTACAGTGAGCTTGTGTCAACCAACAT 2372
Query 2234 TACTGAGGGAGGACCATATGCTTCCAAGACATCTTTTGTAAAACTCTTAAGATCTGTTAA 2293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2373 TACTGAGGGAGGACCATATGCTTCCAAGACATCTTTTGTAAAACTCTTAAGATCGGTTAA 2432
Query 2294 GAGGGAAACCCTTAAGCTGATAGAAACCTTCTTAGACAAAGCTGAGGACCAACCACACAT 2353
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2433 GAGGGAAACACTTAAGCTGATAGAAACCTTTTTAGACAAAGCTGAAGACCAGCCACACAT 2492
Query 2354 AGGGAAACAATTTGTGCCGCCAATGATGGAATCAGTACTTGGTGACTATGCGAGGAATGT 2413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2493 AGGGAAACAATTTGTGCCGCCAATGATGGAATCAGTACTTGGTGACTATGCGAGGAATGT 2552
Query 2414 GCCTGATGCTAGGGAATCCGAAGTTCTTTCACTCTTTGCAACGATTATAAACAAGTACAA 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2553 GCCTGATGCTAGGGAATCCGAAGTTCTTTCACTCTTTGCAACGATTATAAACAAGTACAA 2612
Query 2474 GGCGACAATGTTAGAAGACGTGCCTCACATATTTGAAGCTGTATTCCAGTGTACATTGGA 2533
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2613 GGCAACAATGTTAGACGACGTGCCTCACATATTTGAAGCTGTATTCCAGTGTACATTGGA 2672
Query 2534 GATGATAACTAAGAACTTTGAAGATTATCCAGAACACCGCCTCAAGTTTTTCTCATTACT 2593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2673 GATGATAACTAAGAACTTTGAAGATTATCCAGAACACCGCCTCAAGTTTTTCTCATTACT 2732
Query 2594 CCGTGCTATTGCTACATTTTGTTTCCCTGCCTTGATAAAGTTATCAAGTCCGCAACTGAA 2653
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2733 CCGTGCTATTGCTACGTTTTGTTTCCCTGCCTTGATAAAGTTATCAAGTCCGCAACTGAA 2792
Query 2654 GCTAGTGATGGATTCAATTATCTGGGCATTTAGACATACTGAGAGAAATATCGCTGAAAC 2713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2793 GCTAGTGATGGATTCAATTATCTGGGCATTTAGACATACTGAGAGAAATATTGCTGAAAC 2852
Query 2714 CGGGCTTAATCTTTTGCTTGAGATGCTGAAAAACTTTCAGCAATCTGAGTTTTGTAATCA 2773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2853 CGGGCTTAATCTTTTGCTTGAGATGCTGAAAAACTTTCAGCAATCTGAATTTTGTAATCA 2912
Query 2774 ATTCTACCAGACATACTTTATGCAAATCGAGCAAGAAATATTTGCCGTTTTGACTGATAC 2833
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2913 ATTCTACCGGTCATACTTTATGCAAATCGAGCAAGAAATATTTGCCGTTTTGACCGATAC 2972
Query 2834 CTTCCATAAGCCTGGCTTCAAGCTGCATGTGTTGGTGCTGCAGCATCTGTTTTGTCTGCC 2893
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2973 CTTCCATAAGCCTGGCTTCAAGCTACATGTGTTGGTGCTGCAGCAACTGTTTTGCCTGCC 3032
Query 2894 TGAGAGCGGTGCTTTGACAGAACCTTTGTGGGATGCCACAACTGTTCCTTACCCGTATCC 2953
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3033 TGAGAGCGGTGCTTTGACAGAACCCTTGTGGGATGCTACAACCGTTCCTTACCCGTATCC 3092
Query 2954 GAACAATGCTGCATTTGTTCGTGAATACACCATTAAGCTACTGAGCTCTTCATTCCCCAA 3013
| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3093 GGACAACGTTGCATTTGTTCGCGAATACACCATTAAGCTACTGAGCTCTTCATTCCCAAA 3152
Query 3014 CATGACTGCAGCAGAGGTCACACAATTTGTGGATGGACTTTACGAGTCTAGAAATGACCC 3073
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3153 CATGACTGCAGCAGAGGTCACACAATTTGTGAATGGACTATACGAGTCTAGAAATGACCC 3212
Query 3074 GTCTGGATTTAAGAATAACATTCGTGACTTCCTTGTACAGTCTAAGGAGTTTTCCGCTCA 3133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3213 GTCTGGATTTAAGAATAACATTCGTGACTTCCTTGTACAGTCTAAGGAGTTTTCCGCTCA 3272
Query 3134 GGATAACAAAGATCTCTATGCTGAGGAAGCAGCTGCACagagagagagagagCGTCAAAG 3193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3273 GGATAACAAAGATCTCTATGCTGAGGAAGCAGCTGCACAGAGAGAGAGAGAACGTCAAAG 3332
Query 3194 AATGCTTTCGATTCCTGGGCTTATTGCTCCTAATGAGATTCAAGACGAGATGGTGGACTC 3253
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3333 AATGCTTTCAATTCCTGGGCTTATTGCTCCTAATGAGATTCAAGACGAGATGGTGGACTC 3392
Query 3254 ATAAAATTAAGAAGGCTGCAACAAG 3278
||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3393 ATAAAATTAAGAAGGGTGCAACAAG 3417
> AT3G03110.1 | Symbols: XPO1B, CRM1B | exportin 1B | chr3:708936-717093
FORWARD LENGTH=3475
Length=3475
Score = 3254 bits (1762), Expect = 0.0
Identities = 2774/3263 (85%), Gaps = 68/3263 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 18 CTCTCTGCCATGGCGGCTGAGAAGTTAAGGGACTTGAGCCAGCCGATTGACGTCGGTGTG 77
||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |
Sbjct 22 CTCTCCGCCATGGCTGCCGAGAAGTTAAGAGACTTGAGTCAGCCGATTGACGTCGTTTTA 81
Query 78 CTCGATGCCACTGTTGCGGCCTTCTTTGT-TACCGGATCTAAAGAAGAGAGAGCTGCTGC 136
|||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||| |||||| ||||
Sbjct 82 CTCGATGCCACTGTTGAGGCCTT-TTACTCTACCGGATCTAAGGAAGAAAGAGCTTCTGC 140
Query 137 GGACCAGATTTTGCGGGATTTGCAGGCTAATCCAGATA-TGTGGCTTCAAGTTGTCCACA 195
||| | || |||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||
Sbjct 141 GGATAATATCTTGCGGGATTTGAAAGCTAATCCTGATACT-TGGCTTCAAGTTGTTCACA 199
Query 196 TTCTACAAAACACAAAG-AGCATGGATACCAAGTTCTTTGCTCTTCAGGTTCTAGAAGGT 254
||||||| ||||| || || | | ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 200 TTCTACAGAACAC-CAGTAGTACGCATACCAAATTTTTTGCCCTTCAGGTGCTGGAAGGT 258
Query 255 GTTATAAAGTATAGATGGAATGCACTGCCTGTTGAACAACGAGATGGAATGAAAAATTAC 314
|||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 259 GTTATAAAATATAGGTGGAATGCATTACCCGTTGAACAACGTGATGGAATGAAAAATTAC 318
Query 315 ATCTCAGAGGTCATTGTACAGCTCTCGAGTAATGAAGCATCTTTCAGATCAGAAAGGCTC 374
||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 319 ATCTCTGATGTCATTGTGCAGCTGTCAAGGGATGAAGCATCTTTCAGAACGGAAAGGCTT 378
Query 375 TATGTCAACAAGCTAAATGTCATTTTGGTCCAGATAGTGAAACATGATTGGCCGGCAAAG 434
|||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||
Sbjct 379 TATGTCAACAAGTTAAATATCATCCTGGTTCAGATCGTGAAACAGGAGTGGCCGGCAAAG 438
Query 435 TGGACAAGCTTCATTCCTGATCTAGTTGCGGCTGCTAAAACTAGCGAAACTATCTGCGAA 494
|||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 439 TGGAAAAGCTTTATTCCTGATTTAGTTATAGCTGCTAAGACTAGTGAAACTATCTGTGAG 498
Query 495 AATTGCATGGCCATTTTGAAACTCCTAAGCGAAGAGGTTTTTGATTTCTCAAGAGGAGAA 554
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 499 AATTGCATGGCTATTTTGAAACTCCTAAGTGAAGAGGTCTTTGATTTCTCAAAAGGAGAG 558
Query 555 ATGACTCTGCAGAAGATTAAAGAGCTGAAACAATCTCTAAACAGCGAGTTTAAACTCATT 614
||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 559 ATGACTCAGCAAAAGATAAAAGAACTGAAACAGTCTCTAAACAGCGAGTTTCAACTCATT 618
Query 615 CATGAGTTATGCCTATATGTCCTCTCAGCTTCTCAAAGACAGGATCTTATACGTGCAACA 674
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 619 CACGAGTTATGCCTATATGTCCTCTCAGCTTCCCAAAGACAAGAGCTTATACGTGCTACA 678
Query 675 CTGTCTGCGTTGCATGCCTATCTTTCCTGGATTCCATTGGGTTATATTTTTGAGTCTCCT 734
|| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||
Sbjct 679 CTCTCTGCATTGCATGCCTATCTTTCTTGGATTCCGTTGGGATACATATTTGAGTCCCCT 738
Query 735 TTGCTTGAGACCCTCCTTAAATTCTTCCCTGTGCCAGCATATAGGAACCTCACTCTTCAA 794
||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 739 TTGCTGGAGATCCTACTTAAATTCTTCCCTGTTCCAGCATATAGGAATCTCACACTTCAA 798
Query 795 TGTCTGACCGAGGTTGCAGCTCTTAATTTCGGGGACTTCTACAATGTCCAATATGTCAAC 854
||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||
Sbjct 799 TGTTTGTCAGAGGTTGCATCTCTTAATTTTGGGGACTTCTACGATATGCAATATGTCAAG 858
Query 855 ATGTACACCATATTT-ATAG-GGCAGCTGCGGGCAATTCTCCCACCGAGTACAAATATCC 912
||||||| ||| ||| || | ||| ||| |||||||||||| | | ||||||||
Sbjct 859 ATGTACAGCAT-TTTCAT-GAATCAGTTGCAGGCAATTCTCCCTTTAAATTTAAATATCC 916
Query 913 CTGAGGCATATTCAAGTGGAAGTGGTGAAGAACAAGCATTTATCCAGAACCTGGCACTGT 972
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||
Sbjct 917 CTGAGGCATATTCAACTGGAAGTAGTGAAGAACAGGCTTTTATCCAGAACTTGGCACTGT 976
Query 973 TTTTCACTTCCTTTTTCAAGTTTCATATTCGAGTCCTAGAATCAGCGCCAGAAGTTGTTG 1032
|||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| || || ||| | ||
Sbjct 977 TTTTCACTTCGTTTTTCAAGTTACATATAAAAATCCTAGAATCTGCACCCGAAAATATTT 1036
Query 1033 CTTTGTTACTTGCTGGTCTCGAATATCTCATTAATATATCATATGTTGATGACACTGAAG 1092
|| | |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCTATTACTTGCGGGTCTGGGATATCTCATTAGCATATCGTATGTTGATGACACTGAAG 1096
Query 1093 TATTTAAGGTTTGTTTGGATTATTGGAACTCGTTGGTTTTGGAGCTGTTT--GATGCACA 1150
|||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||| ||||| || || |
Sbjct 1097 TATTCAAGGTTTGTTTGGACTATTGGAATTCATTAGTGTTGGAGTTGTTTGGGACGC-GA 1155
Query 1151 TCATAATTC-TGATAACCCTGCAGTAAGTGCAAGCCTGATGGGATTGCAGATGCCTTTCC 1209
||| || | || | |||||||| ||| | |||| ||| | |||||||| ||| ||||||
Sbjct 1156 -CATCATGCGTG-TCACCCTGCACTAACTCCAAGTCTGTTTGGATTGCAAATGGCTTTCC 1213
Query 1210 TTCCTGGTATGGTTGATGGCCTTGGTTCTCAAGTCA-TGCAGCGGCGTCAACTTTATTCT 1268
||||| ||| |||||||| || ||| |||||| || |||||| ||||||||||
Sbjct 1214 TTCCTAGTACAGTTGATGGTGTTAAATCTGAAGTCACTG-AGCGGCAAAAACTTTATTC- 1271
Query 1269 A-ACCCAATGTCCAAATTAAGAGGG-TTAATGATTAACCGCATGGCGAAGCCTGAAGAAG 1326
| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1272 AGATCCAATGTCAAAATTAAG-GGGACTCATGATTAGTCGCACGGCTAAGCCTGAAGAAG 1330
Query 1327 TGCTT-ATTGTTGAAGATGAAAATGGGAACATCGTCCGTGAAACCATGAAGGACAATGAT 1385
|| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1331 TG-TTAATTGTTGAGGACGAAAATGGGAACATTGTTCGTGAAACTATGAAGGATAATGAT 1389
Query 1386 GTTCTTGTCCAGTATAAGATTATGCGGGAGACATTAATCTACCTCTCACACCTTGACCAT 1445
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1390 GTTCTTGTCCAGTATAAGATAATGCGGGAGACATTAATCTACCTCTCACACCTTGATCAT 1449
Query 1446 GATGATACCGAGAAGCAGATGTTGAGGAAGCTAAACAAACAATTAAGTGGGGAGGAATGG 1505
|| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1450 GAAGATACCGAAAAACAGATGTTGAGTAAGCTAAGCAAACAGTTGAGCGGGGAGGAATGG 1509
Query 1506 GCATGGAACAA-CTTGAACACTTTGTGCTGGGCTATTGGATCTATTTCTGGATCTATGGC 1564
||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||
Sbjct 1510 GCATGGAACAATCTA-AACACTTTATGCTGGGCTATTGGGTCTATTTCTGGGTCCATGGT 1568
Query 1565 AGAAGATCAGGAAAACAGGTTTTTGGTGATGGTCATTCGTGATTTGTTGAA-TTTATGTG 1623
|| ||| ||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1569 AGTAGAACAGGAAAACAGATTTCTCGTGATGGTTATCCGTGATTTGTT-AAGTTTATGTG 1627
Query 1624 AAAT--TACTAAGGGAAAAGACAATAAAGCCGTTATTGCGAGCAACATCATGTATGTCGT 1681
|| | | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1628 AAGTCGT-C-AAGGGAAAAGACAATAAAGCTGTTATTGCGAGCAACATCATGTACGTTGT 1685
Query 1682 TGGCCAGTACCCGAGATTCTTAAGGGCCCATTGGAAGTTTTTGAAGACAGTTGTGAACAA 1741
||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1686 TGGACAATATTCAAGATTCTTAAGAGCCCATTGGAAGTTTTTGAAGACAGTTGTCCATAA 1745
Query 1742 GTTGTTTGAATTCATGCATGAGACACATCCTGGTGTTCAGGACATGGCATGTGACACATT 1801
| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1746 GCTGTTTGAATTTATGCATGAGACGCATCCTGGTGTTCAGGACATGGCTTGCGACACATT 1805
Query 1802 CTTGAAAATAGTTCAAAAGTGCAAGCGAAAATTTGTTATTGTACAGGTTGGAGAGAA-TG 1860
||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 1806 CTTAAAAATTGTTCAGAAGTGTAAGCGAAAATTTGTTATTGTTCAGGTTGGAGA-AAGTG 1864
Query 1861 AACCATTTGTATCTGAACTTCTATCAGGCCTTGCAACAA-CTGTTCA-AGATCTTGAGCC 1918
| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||| | ||
Sbjct 1865 AGCCATTTGTGTCTGAACTTCTATCAGGCCTTGCTACAATC-GT-CGGAGATCTTCAACC 1922
Query 1919 TCATCAAATACACT-CATTTTATGAATCAGTTGGTAATATGATCCAAGCAGAACCAGATC 1977
|||||| || || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 1923 TCATCAGATTCA-TACATTTTATGAATCTGTTGGTAGTATGATCCAGGCAGAATCAGATC 1981
Query 1978 CTCAGAAGCGAGATGAATATCTCCAGAGGTTGATGGCACTCCCCAACCAGAAATGGGCAG 2037
|||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1982 CTCAGAAGAGGGGGGAATACCTCCAGAGGTTGATGGCTCTCCCGAATCAGAAATGGGCAG 2041
Query 2038 AAATCATAGGACAGGCACGCCAAAGTGTAGA-ATTCCTCAAGGATCCAGGTGTGATACGA 2096
|||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 2042 AAATTATAGGACAAGCACGTCAAAGTGCAGATAT-CCTCAAGGAACCAGATGTGATACGT 2100
Query 2097 ACAGTGCTTAACATCCTACAGACTAATACTAGTGCTGCTACTTCACTGGGAACCTACTTC 2156
|| |||||||| ||||| ||||| ||||| | | ||| |||||||| ||||| | ||||
Sbjct 2101 ACTGTGCTTAATATCCTCCAGACAAATACGCGCGTTGCAACTTCACTAGGAACATTCTTC 2160
Query 2157 TTATCCCAAATTTCCTTGATCTTCTTGGATATGCTGAATGTATACAGAATGTACAGTGAG 2216
| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2161 CTGTCTCAAATTTCGTTGATCTTCTTGGATATGCTGAATGTTTACAGAATGTATAGTGAA 2220
Query 2217 CTTGTGTCAACCAACATTACTGAGGGAGGACCATATGCTTCCAAGA-CATCTTTTGTAAA 2275
|| || |||| || |||| || | || || ||||| ||||| | || ||||| |||| ||
Sbjct 2221 CTCGTTTCAAGCAGCATTGCTAATGGTGGCCCATACGCTTCGA-GAACATCTCTTGTTAA 2279
Query 2276 ACTCTTAAGATCTGTTAAGAGGGAAACCCTTAAGCTGATAGAAACCTTCTTAGACAAAGC 2335
||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||
Sbjct 2280 ACTTTTAAGGTCTGTTAAGAGGGAAATTCTTAAGCTGATAGAGACGTTTTTAGATAAAGC 2339
Query 2336 TGAGGACCAACCACACATAGGGAAACAATTTGTGCCGCCAATGATGGAATCA-GTACTTG 2394
||| |||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 2340 TGAAAACCAGCCACACATTGGAAAACAGTTTGTTCCACCAATGATGGA-TCAAGTACTTG 2398
Query 2395 GTGACTATGCGAGGAATGTGCCTGATGCTAGGGAATCCGAAGTTCTT-TCACTCTTTGCA 2453
| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2399 GCGACTATGCAAGAAATGTTCCTGATGCAAGAGAATCAGAAGT-CTTGTCACTCTTTGCG 2457
Query 2454 ACGATTATAAACAAGTACAAGGC-GACAATGTTAGAAGACGTGCCTCACATATTTGAAGC 2512
|| || || ||||| ||||||| | |||| ||| || || || | ||||||||||||
Sbjct 2458 ACAATAATCAACAAATACAAGGTTGT-AATGCGAGATGAAGTTCCCCTCATATTTGAAGC 2516
Query 2513 TGTATTCCAGTGTACATTGGAGATGATAACTAAGAACTTTGAAGATTATCCAGAACACCG 2572
||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2517 TGTTTTCCAGTGCACATTGGAGATGATTACTAAGAATTTTGAAGATTACCCAGAGCACCG 2576
Query 2573 CCTCAAGTTTTTCTCATTACTCCGTGCTATTGCTACATTTTGTTTCCCTGCCTTGATAAA 2632
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
Sbjct 2577 TCTCAAGTTTTTCTCGTTACTTCGTGCTATTGCTACATTTTGTTTCCGTGCGTTGATACA 2636
Query 2633 GTTATCAAGTCCGCAACTGAAGCTAGTGATGGATTCAATTATCTGGGCATTTAGACATAC 2692
||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 2637 GTTGTCAAGTGAGCAACTGAAGCTAGTGATGGATTCAGTTATCTGGGCATTTAGGCATAC 2696
Query 2693 TGAGAGAAATATCGCTGAAACCGGGCTTAATCTTTTGCTTGAGATGCTGAAAAACTTTCA 2752
||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2697 TGAAAGAAATATCGCTGAAACTGGGCTCAATCTCTTGCTCGAGATGCTGAAAAACTTTCA 2756
Query 2753 GCAATCTGAGTTTTGTAATCAA-TTCTACCAGACATACTTTATGCAAATCGAGCAAGAAA 2811
| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 2757 GAAATCTGACTTTTGTAA-CAAATTCTACCAAACATACTTTCTGCAAATTGAGCAAGAAG 2815
Query 2812 TATTTGCCGTTTTGACTGATACCTTCCATAAGCCTGGCTTCAAGCTGCATGTGTTGGTGC 2871
||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 2816 TATTTGCTGTCTTGACCGATACCTTCCACAAGCCTGGGTTCAAGTTGCATGTGTTGGTGT 2875
Query 2872 TGCAGCATCTGT-TTT-GTCTGCCTGAGAGCGG-TGCTTTGACAGAACCTTTGTGGGATG 2928
||||||| || | ||| | ||| ||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 2876 TGCAGCA-CT-TATTTAGCCTGGTTGAGAGCGGAT-CATTGGCAGAACCATTGTGGGATG 2932
Query 2929 CCACAACTGTTCCTTACCCGTATCCGAACAATG-CTGCATTTGTTCGTGAATACACCATT 2987
| |||| || || | || ||| | || |||| | || ||||| | ||| |||||||
Sbjct 2933 CTGCAACGGTACCGCATCCTTATTCAAATAATGTC-GCCTTTGTGCTTGAGTACACCACC 2991
Query 2988 AAGCTACTGAGCTCTTCATTCCCCAACATGACTGCAGCAGAGGTCACACAATTTGTGGAT 3047
||||| || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||
Sbjct 2992 AAGCTTCTAAGCTCATCATTCCCCAACATGACTACAACAGAGGTGACACAGTTTGTGAAT 3051
Query 3048 GGACTTTACGAGTCTAGAAATGACCCGTCTGG-A--TTTAAGAATAACATTCGTGACTTC 3104
|||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||| ||||||| || ||||||
Sbjct 3052 GGACTTTACGAGTCGAGAAACGAT--GT-TGGCAGATTTAAGGATAACATACGCGACTTC 3108
Query 3105 CTTGTACAGTCTAAGGAGTTTTCCGCTCAGGATAACAAAGATCTCTATGCTGAGGAAGCA 3164
||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3109 CTTATACAGTCCAAGGAATTTTCTGCTCAGGATAACAAAGATTTATATGCTGAGGAAGCT 3168
Query 3165 GCTGCACaga-gagagagagagCGTCAAAGAATGCTTTCGATTCCTGGGCTTATTGCTCC 3223
||||| || | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3169 GCTGCCCAAATG-GAGAGAGAGAGACAAAGAATGCTTTCGATTCCTGGACTTATAGCTCC 3227
Query 3224 TAATGAGATTCAAGACGAGATGG 3246
| || ||||||||||| ||||
Sbjct 3228 CAGCGAAATTCAAGACGACATGG 3250
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 163092731693
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5