BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg941983
Length=7180
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G24350.2 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unkn... 8654 0.0
> AT5G24350.2 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unknown;
INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN:
cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures;
EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Secretory pathway Sec39 (InterPro:IPR013244). | chr5:8301105-8310895
FORWARD LENGTH=7577
Length=7577
Score = 8654 bits (4686), Expect = 0.0
Identities = 5204/5458 (95%), Gaps = 20/5458 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1730 GGATTACAGAAAATTTCGGAGTATTCCTATCAATCAGGCTGCTATTTCACTTGCCGAGAG 1789
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1998 GGATTACAGAAAATTTCGGAGTAATCCTATCAATCAGGCTGCTATTTCACTTGCTGAGAG 2057
Query 1790 CGGGAGAATAGGAGCCTTAAACCTGCTATTTAAGCGGCATCCTTATTCACTTGCTTCGTT 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2058 CGGGAGAATAGGAGCCTTAAACCTGCTATTTAAGCGGCATCCTTATTCACTTGTTTCGTT 2117
Query 1850 CATGCTGAAAATTTTGGCAGCTATTCCTGAAACAGTCCCCGTTGAAACGTATGCACATCT 1909
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2118 TATGCTGCAAATTTTGGCAGCTATTCCTGAAACAGTCCCTGTTGAAACGTATGCACATCT 2177
Query 1910 TCTTCCTGGAAAATCTCCTCCAACGAGTATGGCAGTGAGAGAAGAAGACTGGGTTGAATG 1969
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2178 TCTTCCGGGAAAATCTCCTCCAACCAGTATGGCAGTGAGAGAAGAAGATTGGGTTGAATG 2237
Query 1970 TGAGAAGATGGTT-AGATTTATTAGTAACTTGCCGGAGAATGGCAAGAATGATTCTCTGA 2028
||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2238 TGAGAAGATGGTTAAG-TTTATTAATAACTTGCCGGAGAATGGCAAGAATGATTCTCTGA 2296
Query 2029 TTCAAACTGAGCCAATTGTCAGAAGGTGTTTGGGGTATAATTGGCCATCATCACAAGAAC 2088
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2297 TTCAAACTGAGCCAATTGTTAGAAGGTGTTTGGGGTATAATTGGCCATCATCAGAAGAAC 2356
Query 2089 TTGCTGCATGGTACAAAAGTAGAGCTAGAGATATTGATTCGTCCACTGGGCTGTTAGACA 2148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2357 TTGCTGCATGGTACAAAAGTAGAGCTAGAGATATTGATTCGACCACTGGGCTGTTAGACA 2416
Query 2149 ACTGCATTTGCTTGATTGATATTGCATGTCGAAAAGGCATATCTGAGTTGGAACAGTTCC 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 ACTGCATTTGCTTGATTGATATTGCATGTCGAAAAGGCATATCTGAGTTGGAACAGTTCC 2476
Query 2209 ATGAGGATCTATCATACTTGCACCAGATAATTTATTCTGACGAAATTGGAGGTGAAATCT 2268
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2477 ATGAGGATCTATCATACTTGCACCAGATAATTTATTCTGACGAAATTGGAGGCGAAATCT 2536
Query 2269 GCTTCAGCTTAAGCCTTGTTGGGTGGGAGCATTTATCTGATTATGAGAAATTTAAAATAA 2328
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2537 GCTTCAGCTTAAGCCTTGCTGGGTGGGAGCATTTATCTGATTATGAGAAATTTAAAATAA 2596
Query 2329 TGCTTGAAGGGGTCAAAGCTGATACTGTGGTTAGAAGATTGCATGACAAGGCAATTCCAT 2388
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2597 TGCTTGAAGGGGTTAAAGCTGATACTGTGGTTAGAAGATTGCATGAGAAGGCAATTCCAT 2656
Query 2389 TTATGCAGAAAAGGTTTTTGGGGACAAACAACC-GTAATGTGGAGTCCTTTCTAGTTAAA 2447
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2657 TTATGCAGAAAAGGTTTTTGGGGACAAACAACCAG-AATGTGGAGTCCTTTCTAGTTAAA 2715
Query 2448 TGGCTGAAGGAGATGGCAGCAAAAAATGATATGGAATTATGCTCACAAGTTATAGAGGAA 2507
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||
Sbjct 2716 TGGCTGAAGGAGATGGCAGCAAAAAGTGATATGGATTTATGCTCAAAAGTTATTGATGAA 2775
Query 2508 GGGTGCATGGATTTACATACTGTTTGtttttttAAGGATGA-GTTTGAAGTTGTTGATTG 2566
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||
Sbjct 2776 GGGTGCATTGATTTATATACTGTTTGTTTTTTTAAGGATGATGTT-GAAGCTGTTGATTG 2834
Query 2567 TGCTCTGCAATGTCTGTATCTGTGCAAAGTTACAGATAAGTGGAATGTCATGGCAACAAT 2626
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2835 TGCTCTGCAATGTTTGTATCTGTGCAAAGTTACGGATAAGTGGAATGTCATGGCAACAAT 2894
Query 2627 GTTATCAAAGCTACCGAAGATAAATGATAATGCTGGTGAAGACATTCAGAAAAGACTCAA 2686
| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2895 GCTATCAAAGCTACCAAAGATAAATGATAAAGCTGGTGAAGACATTCAGAGAAGACTCAA 2954
Query 2687 ACGGGCGGAAGGTCATATAGAAGCAGGGAGGCTTTTGGAGTTTTATCAGGTCCCCAAACC 2746
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2955 ACGGGCAGAAGGTCATATTGAAGCAGGGAGGCTTTTGGAGTTTTATCAGGTCCCCAAACC 3014
Query 2747 AATTAATTATTTTCTTGAGGTTCATTTGGATGAAAAAGGTGTAAAGCAGATTCTTCGACT 2806
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3015 AATTAACTATTTTCTTGAGGTTCATTTGGATGAAAAAGGTGTAAAGCAGATTCTTCGACT 3074
Query 2807 CATGCTTTCGAAATTTGTCCGTCGTCAACCTGGGCGATCTGATAATGACTGGGCATGCAT 2866
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3075 CATGCTTTCGAAATTTGTTCGTCGTCAACCTGGACGATCTGATAATGACTGGGCATGCAT 3134
Query 2867 GTGGCGTGATCTGAGACAGTTGCAAGAGAAAGCCTTTTATTTCCTTGATCTTGAGTTTGT 2926
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3135 GTGGCGTGATCTGCGACAGTTGCAAGAGAAAGCCTTTTATTTCCTTGATCTTGAGTTTGT 3194
Query 2927 GCTCACAGAGTTCTGTAGAGGACTTCTAAAGGCTGGGAAGTTTTCTCTGGCTAGAAATTA 2986
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3195 GCTAACAGAATTCTGTAGAGGACTTCTAAAGGCTGGGAAGTTTTCTCTGGCTAGAAATTA 3254
Query 2987 TCTCAAGGGTACAGGCTCAGTTGCTCTGCCATCAGAGAAGGCAGAGAGTCTTGTTATTAA 3046
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3255 TCTCAAGGGTACAGGTTCAGTTGCTCTGCCATCAGAGAAGGCAGAGAGTCTGGTTATTAA 3314
Query 3047 TGCGGCAAAGGAATACTTCTTCTCTGCTCCGAGCCTTGATTCTGAAGAAATATGGAAAGC 3106
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3315 TGCGGCAAAGGAATACTTCTTCTCTGCTCCGAGCCTTGCTTCTGAAGAAATATGGAAAGC 3374
Query 3107 AAGGGAGTGCCTGAATATATTTTCTAGTAGCCGGACTGTTAAAGCCGAGGCCGATATCAT 3166
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3375 AAGGGAGTGCCTGAATATATTTTCTAGTAGCCGGACTGTTAAAGCCGAGGACGATATCAT 3434
Query 3167 TGACGCAGTTACTATTAGGCTTCCAAATCTTGGGGTTCGTCTCTTACCAGTGCAGTTCAA 3226
||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3435 TGATGCAGTTACCGTTAGGCTTCCAAAGCTTGGGGTTAGTCTCTTACCAGTGCAGTTCAA 3494
Query 3227 ACAAGTAAAAGACCCAATGGAGATTATTAAGATGGCAATCACGGG-GCATCCTGGGGCTT 3285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||
Sbjct 3495 ACAAGTAAAAGACCCAATGGAGATTATTAAGATGGCAATCACGGGCG-ATCCTGAGGCTT 3553
Query 3286 ATCTACATGTTGAAGAACTTATTGAGGTTGCTAAACTTCTTGGGTTGAATTCTTCAGAAG 3345
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3554 ATCTACATGGTGAAGAGCTTATTGAGGTTGCTAAACTTCTTGGGTTGAATTCTTCAGAAG 3613
Query 3346 ATAGATCACCTGTTGAA-GAAGCTATTGCTAGAGAAGCTGCAGTTGCAGGGGATCTGCAT 3404
||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3614 ATATATCATCTGT-GAAAGAAGCTATTGCTAGAGAAGCTGCAATTGCAGGGGATATGCAG 3672
Query 3405 CTGGCTTCTGATTTATGCCTTGTTCTAACCAAAAAGGGGCATGGTCCCATTTGGGATTTG 3464
||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3673 CTGGCTTTTGATCTATGCCTTGTTCTAACCAAAGAGGGGCATGGTCCCATTTGGGATTTA 3732
Query 3465 GGTGCTGCAATAGCAAGAGGTCCTGCACTTGAGCACATGGATATAAGTTCTAGAAAGCAG 3524
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3733 GGTGCTGCAATAGCAAGAAGTCCTGCACTTGAACACATGGATATAAGTTCTAGAAAGCAG 3792
Query 3525 TTGCTTGGCTTTGCTTTGGGTCACTGTGATGATGAATCGATCAGTGAGTTATTGCACTCA 3584
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 3793 TTGCTTGGTTTTGCTTTGGGTCACTGTGATGATGAATCGATTAGTGAGTTATTGCACGCA 3852
Query 3585 TGGAAAGATCTTGACCTGCAAGGCCAATGTGAGACTCTGGGAATGTTATCTGAGTCGGAT 3644
||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3853 TGGAAAGATTTTGACCTGCAAGGCCAGTGCGAGACTCTGGGAATGTTATCTGAGTCGAAT 3912
Query 3645 TCTCCTGA-TATTCACAAGATGGACGGTGTTTCTTGTCTTAGAGAATTCCCTCAGATGCT 3703
|||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 3913 TCTCCTGAGT-TTCAAAAGATGGACGGTGTTTCTTGTCTTACTGATTTCCCTCAAATGCT 3971
Query 3704 TGATGGGCTATGCAGTGATCAACAACTAGATTTGGATAGAGTCAAAGATTCACTTTCTTG 3763
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 3972 TGATGGACTAAGCAGTGATCAACAACTAGATTTGGATAGAGCCAAAGATTCAATTTCTTG 4031
Query 3764 TATTGCTAAGGACT-TACCGGTTGATAATAGAGTGGACTTGGAATCTCTTCTAAAGGAAA 3822
| |||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4032 TGTTGCTAAGGA-TATGCCGGTTGATGATAGCGTGGACTTGGAATCTCTGCTAAAGGAAA 4090
Query 3823 ATGGGAAGCTTCTCTCATTTGCTGCTTCACATCTTCCTTGGTTGCTTAAGCTGGGTAGAA 3882
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4091 ATGGGAAGCTTTTCTCATTTGCTGCTTCACATCTTCCTTGGTTGCTTAAGCTGGGAAGAA 4150
Query 3883 ATAGGAAACTGGATAAAAGTCTAGTGCTTGATTCAATTCCTGGAAAGCAGTTTGTCAGCA 3942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4151 ATAGGAAACTGGATAAAAGTCTAGTGCTTGATTCAATTCCTGGAAAGCAGTTTGTCAGCA 4210
Query 3943 TAAAAGCAACTGCTCTTGTTACCATTCTTTCCTGGCTGGCAAAGAATGGTTTTGCGCCGA 4002
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4211 TAAAAGCAACTGCTCTAATTACCATTCTTTCCTGGCTGGCAAAGAATGGTTTTGCGCCAA 4270
Query 4003 AAGATGAGCTGATAGTTATGATTACAGACTCAATCATCGAACAACCGGTAACAAAAGAGG 4062
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4271 AAGATGAGCTGATAGCCATGATTACAGACTCCATCATCGAACATCCGGTAACAAAAGAGG 4330
Query 4063 AAGACATTATAGGATGCTCCTTTCTGTTGAATCTGGTAGATGCATCTAATGCAGTAGAAG 4122
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4331 AAGACGTCATAGGATGCTCCTTTCTGTTGAATCTGGTAGATGCATCTAATGCAGTAGAAG 4390
Query 4123 TTATTGAGAAGCAGTTGAGAATAAGGGGGAACTACCAAGAAATTCGAAGTATCATGAGTC 4182
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4391 TTATAGAGAAGCAGTTGAGAATAAGGGGGAACTACCAAGAAATTCGAAGTATCATGAGTC 4450
Query 4183 TAGGGATGATATATAGTTTGCTACATGACTCTGGAGTAGAGTGCACAGCTCCCATCCAGA 4242
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4451 TAGGGATGATATACAGTTTGCTACATGACTCTGGGGTAGAGTGCACAGCTCCCATCCAGA 4510
Query 4243 GGAGAGAACTGCTACGGAAGAACTTTGAGAGAAAGCAAACAGAAAGTCTCTCTGATGATA 4302
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4511 GGAGAGAACTGCTACAGAAGAACTTTGAGAGAAAGCAAACAGAAAGTCTCGCTGATGATA 4570
Query 4303 TGAGCAGGATCGACAAACTTCAATCAACTTTTTGGAAGGAATGGAAACATAAATTAGAGG 4362
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4571 TGAGCAAGATCGACAAACTTCAATCAACTTTTTGGAAGGAATGGAAGCATAAATTAGAGG 4630
Query 4363 AAAAAATGCATGATGCTGACCGTTCTAGAATGCTGGAGAGAATTATTCCTGGGGTTGAGA 4422
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4631 AAAAAATGCATGATGCTGACCGTTCTAGGATGCTGGAGAGAATCATTCCTGGGGTTGAGA 4690
Query 4423 CTGAAAGGTTTTTGTCACTTGATATGGAATATATTAAGGTTGCTGTTTTCTCTCTGGTTG 4482
|||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4691 CTGAAAGGTTTTTGTCTCATGATATTGAATACATTAAGGTTGCTGTTTTCTCTCTCATTG 4750
Query 4483 AATCTGTGAAATCCGAGAAGAAGCTGATTTTGAAGGATGTACTAAAATTGGCTGATACAT 4542
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4751 AATCTGTGAAATCAGAGAAGAAGCTGATTTTGAAGGATGTACTAAAATTAGCTGATACAT 4810
Query 4543 ATGGCTTGAAGCAATCAGAGGTGATATTACGGTATTTAAGCTCTATCCTTTGCTCTGAAA 4602
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4811 ATGGCTTGAAGCAATCAGAGGTGATATTAAGGTATTTAAGCTCTATCCTTTGCTCTGAGA 4870
Query 4603 TTTGGACAAATGAGGACATCACGGCTGAAATTTTACAAGTCAAGGACGAAATACTTTCCC 4662
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 4871 TTTGGACAAATGAGGACATCACGGCTGAAATTTTACAAGTCAAGGAAGAAATACTCACCT 4930
Query 4663 TTGCTTCAGACACCATACAAACCATAAGCACAATCGTGTACCCAGCAGTTAGTGGTCTTA 4722
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4931 TTGCTTCAGACACCATAGAAACCATAAGCACAATCGTGTACCCAGCAGCTAGTGGTCTTA 4990
Query 4723 ACAAACAACGCCTTGCTTACATATATAGCCTCCTTTCTGAATGCTATTGCCATTTGGTAG 4782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 4991 ACAAACAACGCCTTGCTTACATATATAGCCTCCTTTCTGAATGCTATTGTCATTTGGCAG 5050
Query 4783 AAAGCAAGGAAGCATCATTGTTGGTTGAACCGCATGGTTCCTTTGCTGGGTTATCAAATT 4842
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5051 AAAGCAAGGAAGCATCATTGTTGGTTCAACCGAATTCTTCCTTTGCTGGGTTATCAAATT 5110
Query 4843 TGTGTAACGTCCTTAAGCAAGAGTGCAGTAGAGTGTCATTTATCAAAGATTTGGATTTCA 4902
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5111 GGTATAACGTCCTTAAGCAAGAGTGCAGTAGAGTGTCATTTATCAAAGATTTGGATTTCA 5170
Query 4903 AAAATATTGCGGAGTTGGGAGGTTTGAACTTTGACAGCTTCAACAATGAAGTCCATGCGC 4962
|||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5171 AAAATATTTCAGAATTGGGAGGTTTGAATTTTGACAGCTTCAACAATGAAGTCCATGCGC 5230
Query 4963 ACATCAATGAGATGAACTTGGAAGCTTTGGCCAAAATGGTAGAAACTCTCACTGGCTTAT 5022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 5231 ACATCAATGAGATGAACTTGGAAGCTTTGGCCAAAATGGTAGAAACTCTAAGTGGCTTAT 5290
Query 5023 TCATTGAAAATTCCTCCATGGGTCTCATTTCCTGGCAAGATGTCTACAAGCAATATATTA 5082
||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5291 CCATGGAAAATTCGTCCAAGGGTCTCATTTCCTGTCAAGATGTCTACAAACAATATATTA 5350
Query 5083 TGAATTTGTTAGATACATTGGAGAGTAGAAGAGATCTTGATTTTGGAAGTGCAGAGAGTT 5142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5351 TGAATTTGTTAGATACATTGGAGAGTAGAAGAGATCTTGATTTTGGAAGTGCAGAGAGTT 5410
Query 5143 TCCAAGGCTTCCTCGGTCAACTTGAGCAGACATATGACCACTGCAGAGTATATGTCAGGA 5202
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 5411 TCCAGGGCTTCCTCGGTCAACTTGAGAAGACATATGACCACTGTAGAGTATATGTCAGAA 5470
Query 5203 TCTTGGAACCTTTGCAGGCTGTGGAAATCCTGAAACGGAATTTCACCTTAGTTCTACCAC 5262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
Sbjct 5471 TCTTGGAACCTTTGCAGGCTGTGGAAATCCTGAAACGGCATTTCACGTTAGTTCTACCGC 5530
Query 5263 CAAATGGTTCTTACATGCACATCCCTGATAGTTCTAAATGGCAAGAATGTCTTATCTTAC 5322
|||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5531 CAAATGGTTCCTATATGCACATCCCTGATAGTTCTACATGGCAAGAATGTCTTATCTTAC 5590
Query 5323 TGATTAACTTTTGGATAAGATTAGCTGATGAGATGCAGGAAGTAAAATCATCTAGTCCAA 5382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||
Sbjct 5591 TGATTAACTTTTGGATAAGATTAGCTGATGAGATGCAAGAGGTAAAATCATCTAATCCAA 5650
Query 5383 GTTTGGTGGCGAATCTCATCTTAAGCCCTGAATGCATTAGCAGCTGTCTTACTGTTCTTA 5442
||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |
Sbjct 5651 GTTTGGTGGAGAATCTTACCTTGAGCCCTGAATGCATTAGCAGCTGTTTTACTCTACTCA 5710
Query 5443 TAAAACTAGTAATGGATGATAGTCTGTACCCAAGTCAGGCTTGGGCTGCAATACTTATCT 5502
||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5711 TAAAACTTGTAATGTATGACAGTCTGTCCCCAAGTCAGGCTTGGGCTGCAATACTTGTCT 5770
Query 5503 ACGTTAGATCTGGCTTGGTTGGTGATTGTGCCACTGAAATCTTCAATTTCTGCAGAGCCA 5562
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5771 ACCTTAGATCTGGCTTGGTTGGTGATTGTGCCACTGAAATCTTCAATTTCTGCAGAGCCA 5830
Query 5563 TGGTCTTCTCTGGTTGTGGATTCGGGCCCATTTCTGATGTCTTCTCAGATTTGTCCTCTC 5622
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5831 TGGTCTTCTCTGGTTGTGGATTCGGGCCCATTTCTGATGTCTTCTCAGATATGTCCTCTC 5890
Query 5623 GGTATCCAACAGCTTTGCAGGATCTTCCACATCTTTATTTGAGTGTACTTGAACCTATTT 5682
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5891 GGTATCCAACAGCTTTGCAGGATCTTCCACACCTGTATTTGAGTGTCCTTGAACCTATTT 5950
Query 5683 TACAAGATTTGGTATCTGGGGCTCAC-GAAACACAGAATCTTTACCGGTTGCTCTCTTCT 5741
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5951 TACAAGATTTGGTATCTGGGGCTC-CTGAAACACAAAATCTTTACCGGCTGCTCTCTTCT 6009
Query 5742 CTTAGTAACTTAGAAGGCAACCTAGAAGAACTGAAGCGTGTTAGGCTTGTAGTCTGGGAA 5801
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 6010 CTTAGTAACTTGGAAGGCAACCTGGAAGAACTGAAACGTGTCAGGCTTGTAGTCTGGAAA 6069
Query 5802 CAACTCGTAATATTTTCTGAGAACCTGGAGTTGCCAAGTCAAGTTCGCGTCTACTCTTTA 5861
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6070 CAACTCGTAATATTTTCTGAGAACCTGGAGTTGCCAAGTCAAGTTCGCGTCTACTCCTTA 6129
Query 5862 GAGCTTATGCAGTTCATCTCGGGTAAGAATATCAAGGGCTCATCGTCTGAGCTACAATCA 5921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6130 GAGCTTATGCAGTTCATCTCGGGTAAGAATATCAAGGGCTCATCGTCTGAGCTACAATCA 6189
Query 5922 AACGTTTTGCCATGGGACGGTTCAGCTGAGTTACTATCTTCTATGCAGAAGACTGAAGCC 5981
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6190 AACGTTATGCCATGGGACGGTTCGGCTGAGTTACTATCATCTATGCAGAAGACTGAAGCC 6249
Query 5982 ACACTTAACCAAGCGTTGCCTGACCAGGCTGATGGCTCTAGCAGGCTCACAAACACTCTG 6041
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6250 GCGCTTAACCAAGCGTTGCCTGACCAGGCTGATGGCTCTAGCAGGCTCACAAACACTCTG 6309
Query 6042 GTCGCACTTAAATCATCTCAGATCGCTGTTGCTGCCATCTCTCCAGGCCTAGAGATCTCA 6101
|| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6310 GTTGCACTTAAATCATCTCAGGTCGCTGTAGCAGCCATCTCTCCAGGCCTAGAGATCTCC 6369
Query 6102 CCGGAGGATTTATCTACTGTTGAGACATCTGTTTCCTGCTTCTCTAAACTCTCTGCTGCT 6161
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6370 CCGGAGGATTTATCTACTGTTGAGACATCTGTTTCTTGCTTCTCTAAACTCTCTGCTGCT 6429
Query 6162 GTTACTACAGCTTCACAAGCTGAAGCTCTTCTGGCTATTTTAGAAGGATGGGAAGAGCTG 6221
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6430 GTTACTACAGCTTCACAAGCTGAAGCTCTTTTGGCTATTTTGGAAGGATGGGAAGAGCTG 6489
Query 6222 TTTGAAGCTAAGAAAGCCGAACTATTGCCGTCTAATGACGCAACCGACCGAGGAAACGAC 6281
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 6490 TTTGAAGCTAAGAACGCCGAACTATTGCCATCTAATGAGGCAACCGACCAAGGAAACGAC 6549
Query 6282 TGGGGTGATGATGATTGGAATGATGGATGGGAAACACTCCAGGAATCAGAACCCGTGGAG 6341
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6550 TGGGGTGATGATGATTGGAATGATGGATGGGAAACACTGCAGGAATCAGAACCCGTGGAG 6609
Query 6342 AAAGTGAAAAAGGAATGCATAGTGTCAGCTCATCCTTTACATTCATGCTGGCTGGATATT 6401
||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6610 AAAGTAAAAAAAGAATGCGTAGTCTCAGCTCATCCTTTACATTCTTGCTGGCTGGATATT 6669
Query 6402 TTCAGAAAGTACATTGCATTGTCCATGCCCGAAAATGTTCTACGACTAATAGATGGATCG 6461
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||
Sbjct 6670 TTCAGAAAGTACATTGCATTGTCCATGCCCGAAAATGTACTACAACTAATAGATGGTTCT 6729
Query 6462 CTTCAAAAGCCCGAAGAGGTCATAATTGAAGAAAATGAAGCAGAAAGCCTGACCGGGATC 6521
||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6730 CTTCAGAAGCCTGAAGAGGTGATAATTGAAGAAACTGAAGCAGAAAGCCTGACCGGGATC 6789
Query 6522 TTAGCCAGGACCGACCCATTTCTCGCACTAAAGATTTCTCTTTTGTTACCCTACGAACAG 6581
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6790 TTAGCCAGGACCGACCCATTTCTCGCACTAAAGATTTCTCTTTTGTTACCCTACAAACAG 6849
Query 6582 ATCAGATCTCAGTGTCTCAGTGTTGTGGAAGAACAATTGAAGCAAGAAGGCATTCCGGAG 6641
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6850 ATCAGATCTCAGTGTCTCAGTGTTGTTGAAGAACAATTGAAGCAAGAAGGCATTCCGGAG 6909
Query 6642 TTATCGAGTCAGAGCCATCATGAAGTTCTTCTCCTGGTTATATATTCTGGGACTCTCTCA 6701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6910 TTATCGAGTCAGAGCCATCATGAAGTTCTTCTCCTGGTTATATATTCTGGGACTCTCTCA 6969
Query 6702 ACAATCATCTCCAATTCTTGCTACGGCTCAGTCTTCTCCTTCCTCTGTTATCTGATTGGA 6761
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6970 ACGATCATCTCCAATGCTTGCTACGGCTCAGTCTTCTCCTTCCTCTGTTATCTGATTGGA 7029
Query 6762 AAGCTATCTCGAGAGTTCCAAGAAGAGCGGATAACACAAGCTGACAACAGAGAATCAAAT 6821
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 7030 AAGCTATCTCGAGAATTCCAAGAAGAGCGGATAACACAAGCTGACAACAGAGAATCGAAT 7089
Query 6822 GCAAGTTCGGAGAGTCGGTTTATCTCATGTTTTGGGCAACTCATGTTCCCGTGTTTTGTC 6881
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 7090 GCAAGTTCCGAGAGTCGGTTTATATCATGTTTTGGGCAACTCATGTTCCCCTGTTTTGTC 7149
Query 6882 GCGGGGCTTGTTAAGGCGGATCAGCAGATATTAGCCGGGTTTCTGGTGACCAAGTTCATG 6941
| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 7150 TCAGGGCTTGTTAAGGCAGATCAGCAGATATTAGCGGGGTTTTTGGTGACCAAGTTCATG 7209
Query 6942 CACAGTAACCCATCTCTTAGTCTGATTAATGTTGCAGAGGCAAGTCTGAGGAGATACTTG 7001
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 7210 CACAGTAACCCATCTCTTAGTCTGATTAATGTTGCAGAGGCAAGTCTGCGGAGATACTTG 7269
Query 7002 GAGAAGCAGCTCGAGTCTTTGGAGCATTTGGAGGATTCGTTTGCCGAGAGCTCAGAACTT 7061
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 7270 GATAAGCAGCTCGAATCTTTGGAGCATTTGGAGGATTCGTTTGCCGAGAGCTCAGA-CTT 7328
Query 7062 -GAAACGCTGAAGAATACAGTCTCAAGCTTAAAAGGCAATTCAAAGGAAGTTATACGATC 7120
||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 7329 TGAAACACTGAAGAATACAGTCTCAAGCCTAAGAGGCACTTCAAAGGAAGTTATACGATC 7388
Query 7121 TGCGTTAGCGTCTCTTTCTACTTGTACAAACAGCAGATGATATGGA-AATGGAGGCTT 7177
||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||
Sbjct 7389 TGCGTTAGCTTCTCTCTCTAATTGTACAAACAGCAGATGATTTG-ACAATGGAGGCTT 7445
Score = 2710 bits (1467), Expect = 0.0
Identities = 1632/1711 (95%), Gaps = 13/1711 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 12 CGATTGATCATGGAAACTCCTGGAAGAAAAGTTTTGTATGAGATACGTCATCATGCTTCA 71
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 CGATTGATCATGGAAAGTCCTGGAAGAAAAGTTTTGTATGAGATACGTCATCATGCTTCA 288
Query 72 TTGCCTTTTGTTCCTAGATATCCTCCTCTTCCTCAGGCAGATGGAGCTGATTCGAAAGGA 131
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 289 TTGCCTTATGTTCCTAGATATCCTCCTCTTCCTCAGGCAGATGGAACTAATTCGAAAGGA 348
Query 132 GGGCTTCGGTCTCTTGTCTCCATTAGAGGTTTTAGTCAACTCAAGGAAAAGTGGAGTGGA 191
|| |||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 349 GGACTTCGGTCACTTGTTTCCATCAAAGGTGTTAGTCAACTCAAGGAAAAGTGGAGTGAA 408
Query 192 TATTGGAATCCGAGAAAGACTAATAAACCGGTGTCGTTATTTATTTCACCAAGAGGAGAA 251
|| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 TACTGGAATCCGAAAAAAACTAATAAGCCGGTGTCGTTATTTATTTCACCAAGAGGAGAA 468
Query 252 CTTGTGGCTGTCACTTCCGCAAATCATGTTACTATCTTACGAAAGGATGATGATTACAGG 311
||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 469 CTTGTGGCTGTCACTTCTGGAAATCACGTTACTATCTTGCGAAAGGATGATGATTACAGG 528
Query 312 AAACCTTGTGGCAATTTTACATCCAACATATCAGGATCATTTACTTCTGGAGTGTGGTCC 371
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 529 AAACCTTGTGGCAATTTTACATCCAGCATATCAGGTTCATTTACTTCTGGAGTATGGTCC 588
Query 372 GAAAAACATGATGTTCTTGGTCTTGTGGATGATAGTGAGACCCTCTTTTTCATCAGAGCT 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 GAAAAACATGATGTTCTTGGTCTTGTGGATGATAGTGAGACCCTCTTTTTCATCAGAGCT 648
Query 432 AATGGTGAAGAAATAAGTCAAGTCACAAAAAGAAACTTGAAGGTTTCTGCATCAGTATTA 491
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 649 AATGGCGAAGAAATAAGTCAGGTCACAAAAAGAAACTTGAAGGTTTCTGCACCAGTATTA 708
Query 492 GGATTAATAGAGGACGACTGTGATTTGCAACCATCATGTTTGTGTTCATTCAGTGTACTT 551
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||
Sbjct 709 GGATTAATGGAGGACGACTCTGATTTGCAACCATCATGCTTGTGTTCGTTCAGTATACTT 768
Query 552 ACATCAGATGGACTTATTCATCATGTCGAGATCAGTAGGGAGCCAAGCGCTTCTTCCTTT 611
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 769 ACGTCAGATGGACGTATTCATCATGTCGAGATCAGTAGGGAGCCAAGTGCTTCTGCCTTT 828
Query 612 TCCAAACATGCTTCAAATAGTGTCTCAGCTTTGAGAAAGCAATTCCCCAACCACGTTTTT 671
||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 TCCAAGCATGCTTCAAATAGTGTCT---C------AAAGCAATTCCCCAACCACGTTTTC 879
Query 672 TGCTTTGATTACCATCCAAATCTTTCTTTTCTTCTTC-TTGTTGGTAGTGCTGCAGGCAT 730
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||
Sbjct 880 TGCTTTGATTACCATCCAGATCTTTCTTTTCTTC-TCATTGTTGGTAGTGTTGCAGGCAT 938
Query 731 ATCATCGACAGGGAGTTCTGGTTCATCATGTATCTCACTTTGGCGTAAGTGTCAGAATTT 790
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 939 ATCATCGTCAGGGAGTTCTGGTTCATCGTGTATCTCGCTTTGGCGTAAGTGTCAGAATTT 998
Query 791 AGGTCTGGAACTGTTGTCCACCACAAAGTTTGAAGGCGAGTATTGTGAGAACAAAGATGA 850
|||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 999 AGGTCTGGAATTGTTGTCCACCACAAAGTTTGATGGCGTGTATTGTGAGAACAAAGATGA 1058
Query 851 TCAGTTGGCATATCCAAAGACTTTAATCTCACCTCAAGGGTCACATGTTGCAAGTCTTGA 910
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059 TCAGTTGGCATATCCAAAGACTTTAATCTCCCCTCAAGGGTCACATGTTGCAAGTCTTGA 1118
Query 911 TAGCAATGGGTGCGTGCATCTTTTCCAGTTAGATAAAGCAAGATTGACACTTTCGTGCTG 970
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 TAGCAATGGGTGCGTGCATATTTTCCAGTTAGATAAAGCAAGATTGACACTTTCGTGCTG 1178
Query 971 TCCTTCTGAAGACAGTTCTGATTCACTGAAGCCAGATAAGTCACTAAAAAATTGGAAAGA 1030
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||
Sbjct 1179 TCCTTCTGAAGACAGTTCTGATTCACTGAAGCCAGATAAGTCGCTACAAAGTTGGAAAGA 1238
Query 1031 AAGTTTAAGAAATGTCGTAGATTTTACTTGGTGGTCTGATCACGCCCTTACAATTTTGAA 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1239 AAGTTTAAGAAATGTCGTAGATTTTACTTGGTGGTCTGATCACGCCCTTGCAATTTTGAA 1298
Query 1091 AAGGAGCGGTAACATTAGTATATTTGACATCAATAGGTGTGTTATAGTTCAAGAGGATGC 1150
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299 AAGGAGCGGTAACATTAGTATATTTGACATCAGTAGGTGTGTTATAGTTCAAGAGGATGC 1358
Query 1151 TACCATTTATTCTATGCCTGTCGTGGAAAGAGTTCAGAGATATGAGGGACACATTTTTCT 1210
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1359 TACCATTTATTCTATGCCTGTCGTGGAAAGAGTTCAGAAATATGAAGGACACATTTTTCT 1418
Query 1211 TTTAGAAAGTTCAACACAGGAAGCAAAATCAGCCCTGGCCAAGGTTGACAAGGACCCAAG 1270
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||
Sbjct 1419 TTTAGAAAGTTCAACACAGGAAGCAAAATCAGCTCTGGCCAATGTTGACAGGGACGCAAG 1478
Query 1271 TGAATTGCATCATACTAGTGAGCATAGTATGTTATGGAGGCTAATATCTTTTACTGAGAA 1330
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1479 TGAATTTCATCATACTAGTGAGCATAGTATGTTATGGAGGCTAATATCATTTACTGAGAA 1538
Query 1331 AACAATTCCTGAAATGTATAAAATCTTAGTTGAGAAATGCCACTATCAAGAAGCGTTGGA 1390
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1539 AACAATTCCTGAAATGTATAAAATCTTAGTTGAGAAATGCCAATATCAAGAAGCGTTAGA 1598
Query 1391 TTT-TGCTGATAGTCATGGCTTGGACAGAGATGAAGTTTTCAAGTCAAGATGGTTGAACT 1449
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1599 TTTCT-CTGATAGTCATGGCTTGGACAGAGATGAAGTTTTCAAGTCAAGATGGTTGAAGT 1657
Query 1450 CAGGAAAAGGAGTCAGTGATGTGAGCACGATTCTATCAAAGATAAAAGATAAAGCTTTTG 1509
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658 CAGAAAAAGGAGTCAGTGATGTGAGCACGATTCTATCAAAGATAAAAGATAAAGCTTTTG 1717
Query 1510 TGCTCTCCGAATGCTTAGATAGAATTGGGCCAACAGAAGATTCCATGAAGGCCTTACTTG 1569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718 TGCTCTCCGAATGCTTAGATAGAATTGGGCCAACAGAAGATTCCATGAAGGCCTTACTTG 1777
Query 1570 CGCATGGACTTTATCTAACTAATCACTATGTATTTGCTAAATCTGAAGATCAAGAATCCC 1629
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778 CGCATGGACTTTATCTAACCAATCACTATGTATTTGCTAAATCTGAAGATCAAGAATCCC 1837
Query 1630 AACAACTTTGGGAATTTCGTTTGGCTAGGCTTCGTCTATTACAGTTTAGTGAAAGGCTCG 1689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1838 AACAACTTTGGGAATTTCGTTTGGCTAGGCTTCGTCTATTACAGTTTAGTGAAAGGCTTG 1897
Query 1690 ACACATATTTGGGGATAAGCATGGGCAGATA 1720
|||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898 ACACCTATTTGGGGATAAGCATGGGCAGATA 1928
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 358553654832
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5