BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg941983 Length=7180 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G24350.2 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unkn... 8654 0.0 > AT5G24350.2 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Secretory pathway Sec39 (InterPro:IPR013244). | chr5:8301105-8310895 FORWARD LENGTH=7577 Length=7577 Score = 8654 bits (4686), Expect = 0.0 Identities = 5204/5458 (95%), Gaps = 20/5458 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1730 GGATTACAGAAAATTTCGGAGTATTCCTATCAATCAGGCTGCTATTTCACTTGCCGAGAG 1789 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1998 GGATTACAGAAAATTTCGGAGTAATCCTATCAATCAGGCTGCTATTTCACTTGCTGAGAG 2057 Query 1790 CGGGAGAATAGGAGCCTTAAACCTGCTATTTAAGCGGCATCCTTATTCACTTGCTTCGTT 1849 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2058 CGGGAGAATAGGAGCCTTAAACCTGCTATTTAAGCGGCATCCTTATTCACTTGTTTCGTT 2117 Query 1850 CATGCTGAAAATTTTGGCAGCTATTCCTGAAACAGTCCCCGTTGAAACGTATGCACATCT 1909 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2118 TATGCTGCAAATTTTGGCAGCTATTCCTGAAACAGTCCCTGTTGAAACGTATGCACATCT 2177 Query 1910 TCTTCCTGGAAAATCTCCTCCAACGAGTATGGCAGTGAGAGAAGAAGACTGGGTTGAATG 1969 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2178 TCTTCCGGGAAAATCTCCTCCAACCAGTATGGCAGTGAGAGAAGAAGATTGGGTTGAATG 2237 Query 1970 TGAGAAGATGGTT-AGATTTATTAGTAACTTGCCGGAGAATGGCAAGAATGATTCTCTGA 2028 ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2238 TGAGAAGATGGTTAAG-TTTATTAATAACTTGCCGGAGAATGGCAAGAATGATTCTCTGA 2296 Query 2029 TTCAAACTGAGCCAATTGTCAGAAGGTGTTTGGGGTATAATTGGCCATCATCACAAGAAC 2088 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2297 TTCAAACTGAGCCAATTGTTAGAAGGTGTTTGGGGTATAATTGGCCATCATCAGAAGAAC 2356 Query 2089 TTGCTGCATGGTACAAAAGTAGAGCTAGAGATATTGATTCGTCCACTGGGCTGTTAGACA 2148 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2357 TTGCTGCATGGTACAAAAGTAGAGCTAGAGATATTGATTCGACCACTGGGCTGTTAGACA 2416 Query 2149 ACTGCATTTGCTTGATTGATATTGCATGTCGAAAAGGCATATCTGAGTTGGAACAGTTCC 2208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2417 ACTGCATTTGCTTGATTGATATTGCATGTCGAAAAGGCATATCTGAGTTGGAACAGTTCC 2476 Query 2209 ATGAGGATCTATCATACTTGCACCAGATAATTTATTCTGACGAAATTGGAGGTGAAATCT 2268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2477 ATGAGGATCTATCATACTTGCACCAGATAATTTATTCTGACGAAATTGGAGGCGAAATCT 2536 Query 2269 GCTTCAGCTTAAGCCTTGTTGGGTGGGAGCATTTATCTGATTATGAGAAATTTAAAATAA 2328 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2537 GCTTCAGCTTAAGCCTTGCTGGGTGGGAGCATTTATCTGATTATGAGAAATTTAAAATAA 2596 Query 2329 TGCTTGAAGGGGTCAAAGCTGATACTGTGGTTAGAAGATTGCATGACAAGGCAATTCCAT 2388 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2597 TGCTTGAAGGGGTTAAAGCTGATACTGTGGTTAGAAGATTGCATGAGAAGGCAATTCCAT 2656 Query 2389 TTATGCAGAAAAGGTTTTTGGGGACAAACAACC-GTAATGTGGAGTCCTTTCTAGTTAAA 2447 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2657 TTATGCAGAAAAGGTTTTTGGGGACAAACAACCAG-AATGTGGAGTCCTTTCTAGTTAAA 2715 Query 2448 TGGCTGAAGGAGATGGCAGCAAAAAATGATATGGAATTATGCTCACAAGTTATAGAGGAA 2507 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| Sbjct 2716 TGGCTGAAGGAGATGGCAGCAAAAAGTGATATGGATTTATGCTCAAAAGTTATTGATGAA 2775 Query 2508 GGGTGCATGGATTTACATACTGTTTGtttttttAAGGATGA-GTTTGAAGTTGTTGATTG 2566 |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| Sbjct 2776 GGGTGCATTGATTTATATACTGTTTGTTTTTTTAAGGATGATGTT-GAAGCTGTTGATTG 2834 Query 2567 TGCTCTGCAATGTCTGTATCTGTGCAAAGTTACAGATAAGTGGAATGTCATGGCAACAAT 2626 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2835 TGCTCTGCAATGTTTGTATCTGTGCAAAGTTACGGATAAGTGGAATGTCATGGCAACAAT 2894 Query 2627 GTTATCAAAGCTACCGAAGATAAATGATAATGCTGGTGAAGACATTCAGAAAAGACTCAA 2686 | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2895 GCTATCAAAGCTACCAAAGATAAATGATAAAGCTGGTGAAGACATTCAGAGAAGACTCAA 2954 Query 2687 ACGGGCGGAAGGTCATATAGAAGCAGGGAGGCTTTTGGAGTTTTATCAGGTCCCCAAACC 2746 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2955 ACGGGCAGAAGGTCATATTGAAGCAGGGAGGCTTTTGGAGTTTTATCAGGTCCCCAAACC 3014 Query 2747 AATTAATTATTTTCTTGAGGTTCATTTGGATGAAAAAGGTGTAAAGCAGATTCTTCGACT 2806 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3015 AATTAACTATTTTCTTGAGGTTCATTTGGATGAAAAAGGTGTAAAGCAGATTCTTCGACT 3074 Query 2807 CATGCTTTCGAAATTTGTCCGTCGTCAACCTGGGCGATCTGATAATGACTGGGCATGCAT 2866 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3075 CATGCTTTCGAAATTTGTTCGTCGTCAACCTGGACGATCTGATAATGACTGGGCATGCAT 3134 Query 2867 GTGGCGTGATCTGAGACAGTTGCAAGAGAAAGCCTTTTATTTCCTTGATCTTGAGTTTGT 2926 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3135 GTGGCGTGATCTGCGACAGTTGCAAGAGAAAGCCTTTTATTTCCTTGATCTTGAGTTTGT 3194 Query 2927 GCTCACAGAGTTCTGTAGAGGACTTCTAAAGGCTGGGAAGTTTTCTCTGGCTAGAAATTA 2986 ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3195 GCTAACAGAATTCTGTAGAGGACTTCTAAAGGCTGGGAAGTTTTCTCTGGCTAGAAATTA 3254 Query 2987 TCTCAAGGGTACAGGCTCAGTTGCTCTGCCATCAGAGAAGGCAGAGAGTCTTGTTATTAA 3046 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3255 TCTCAAGGGTACAGGTTCAGTTGCTCTGCCATCAGAGAAGGCAGAGAGTCTGGTTATTAA 3314 Query 3047 TGCGGCAAAGGAATACTTCTTCTCTGCTCCGAGCCTTGATTCTGAAGAAATATGGAAAGC 3106 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3315 TGCGGCAAAGGAATACTTCTTCTCTGCTCCGAGCCTTGCTTCTGAAGAAATATGGAAAGC 3374 Query 3107 AAGGGAGTGCCTGAATATATTTTCTAGTAGCCGGACTGTTAAAGCCGAGGCCGATATCAT 3166 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3375 AAGGGAGTGCCTGAATATATTTTCTAGTAGCCGGACTGTTAAAGCCGAGGACGATATCAT 3434 Query 3167 TGACGCAGTTACTATTAGGCTTCCAAATCTTGGGGTTCGTCTCTTACCAGTGCAGTTCAA 3226 ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3435 TGATGCAGTTACCGTTAGGCTTCCAAAGCTTGGGGTTAGTCTCTTACCAGTGCAGTTCAA 3494 Query 3227 ACAAGTAAAAGACCCAATGGAGATTATTAAGATGGCAATCACGGG-GCATCCTGGGGCTT 3285 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| Sbjct 3495 ACAAGTAAAAGACCCAATGGAGATTATTAAGATGGCAATCACGGGCG-ATCCTGAGGCTT 3553 Query 3286 ATCTACATGTTGAAGAACTTATTGAGGTTGCTAAACTTCTTGGGTTGAATTCTTCAGAAG 3345 ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3554 ATCTACATGGTGAAGAGCTTATTGAGGTTGCTAAACTTCTTGGGTTGAATTCTTCAGAAG 3613 Query 3346 ATAGATCACCTGTTGAA-GAAGCTATTGCTAGAGAAGCTGCAGTTGCAGGGGATCTGCAT 3404 ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 3614 ATATATCATCTGT-GAAAGAAGCTATTGCTAGAGAAGCTGCAATTGCAGGGGATATGCAG 3672 Query 3405 CTGGCTTCTGATTTATGCCTTGTTCTAACCAAAAAGGGGCATGGTCCCATTTGGGATTTG 3464 ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3673 CTGGCTTTTGATCTATGCCTTGTTCTAACCAAAGAGGGGCATGGTCCCATTTGGGATTTA 3732 Query 3465 GGTGCTGCAATAGCAAGAGGTCCTGCACTTGAGCACATGGATATAAGTTCTAGAAAGCAG 3524 |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3733 GGTGCTGCAATAGCAAGAAGTCCTGCACTTGAACACATGGATATAAGTTCTAGAAAGCAG 3792 Query 3525 TTGCTTGGCTTTGCTTTGGGTCACTGTGATGATGAATCGATCAGTGAGTTATTGCACTCA 3584 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 3793 TTGCTTGGTTTTGCTTTGGGTCACTGTGATGATGAATCGATTAGTGAGTTATTGCACGCA 3852 Query 3585 TGGAAAGATCTTGACCTGCAAGGCCAATGTGAGACTCTGGGAATGTTATCTGAGTCGGAT 3644 ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3853 TGGAAAGATTTTGACCTGCAAGGCCAGTGCGAGACTCTGGGAATGTTATCTGAGTCGAAT 3912 Query 3645 TCTCCTGA-TATTCACAAGATGGACGGTGTTTCTTGTCTTAGAGAATTCCCTCAGATGCT 3703 |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| Sbjct 3913 TCTCCTGAGT-TTCAAAAGATGGACGGTGTTTCTTGTCTTACTGATTTCCCTCAAATGCT 3971 Query 3704 TGATGGGCTATGCAGTGATCAACAACTAGATTTGGATAGAGTCAAAGATTCACTTTCTTG 3763 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 3972 TGATGGACTAAGCAGTGATCAACAACTAGATTTGGATAGAGCCAAAGATTCAATTTCTTG 4031 Query 3764 TATTGCTAAGGACT-TACCGGTTGATAATAGAGTGGACTTGGAATCTCTTCTAAAGGAAA 3822 | |||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4032 TGTTGCTAAGGA-TATGCCGGTTGATGATAGCGTGGACTTGGAATCTCTGCTAAAGGAAA 4090 Query 3823 ATGGGAAGCTTCTCTCATTTGCTGCTTCACATCTTCCTTGGTTGCTTAAGCTGGGTAGAA 3882 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4091 ATGGGAAGCTTTTCTCATTTGCTGCTTCACATCTTCCTTGGTTGCTTAAGCTGGGAAGAA 4150 Query 3883 ATAGGAAACTGGATAAAAGTCTAGTGCTTGATTCAATTCCTGGAAAGCAGTTTGTCAGCA 3942 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4151 ATAGGAAACTGGATAAAAGTCTAGTGCTTGATTCAATTCCTGGAAAGCAGTTTGTCAGCA 4210 Query 3943 TAAAAGCAACTGCTCTTGTTACCATTCTTTCCTGGCTGGCAAAGAATGGTTTTGCGCCGA 4002 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4211 TAAAAGCAACTGCTCTAATTACCATTCTTTCCTGGCTGGCAAAGAATGGTTTTGCGCCAA 4270 Query 4003 AAGATGAGCTGATAGTTATGATTACAGACTCAATCATCGAACAACCGGTAACAAAAGAGG 4062 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4271 AAGATGAGCTGATAGCCATGATTACAGACTCCATCATCGAACATCCGGTAACAAAAGAGG 4330 Query 4063 AAGACATTATAGGATGCTCCTTTCTGTTGAATCTGGTAGATGCATCTAATGCAGTAGAAG 4122 ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4331 AAGACGTCATAGGATGCTCCTTTCTGTTGAATCTGGTAGATGCATCTAATGCAGTAGAAG 4390 Query 4123 TTATTGAGAAGCAGTTGAGAATAAGGGGGAACTACCAAGAAATTCGAAGTATCATGAGTC 4182 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4391 TTATAGAGAAGCAGTTGAGAATAAGGGGGAACTACCAAGAAATTCGAAGTATCATGAGTC 4450 Query 4183 TAGGGATGATATATAGTTTGCTACATGACTCTGGAGTAGAGTGCACAGCTCCCATCCAGA 4242 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4451 TAGGGATGATATACAGTTTGCTACATGACTCTGGGGTAGAGTGCACAGCTCCCATCCAGA 4510 Query 4243 GGAGAGAACTGCTACGGAAGAACTTTGAGAGAAAGCAAACAGAAAGTCTCTCTGATGATA 4302 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4511 GGAGAGAACTGCTACAGAAGAACTTTGAGAGAAAGCAAACAGAAAGTCTCGCTGATGATA 4570 Query 4303 TGAGCAGGATCGACAAACTTCAATCAACTTTTTGGAAGGAATGGAAACATAAATTAGAGG 4362 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4571 TGAGCAAGATCGACAAACTTCAATCAACTTTTTGGAAGGAATGGAAGCATAAATTAGAGG 4630 Query 4363 AAAAAATGCATGATGCTGACCGTTCTAGAATGCTGGAGAGAATTATTCCTGGGGTTGAGA 4422 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4631 AAAAAATGCATGATGCTGACCGTTCTAGGATGCTGGAGAGAATCATTCCTGGGGTTGAGA 4690 Query 4423 CTGAAAGGTTTTTGTCACTTGATATGGAATATATTAAGGTTGCTGTTTTCTCTCTGGTTG 4482 |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4691 CTGAAAGGTTTTTGTCTCATGATATTGAATACATTAAGGTTGCTGTTTTCTCTCTCATTG 4750 Query 4483 AATCTGTGAAATCCGAGAAGAAGCTGATTTTGAAGGATGTACTAAAATTGGCTGATACAT 4542 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4751 AATCTGTGAAATCAGAGAAGAAGCTGATTTTGAAGGATGTACTAAAATTAGCTGATACAT 4810 Query 4543 ATGGCTTGAAGCAATCAGAGGTGATATTACGGTATTTAAGCTCTATCCTTTGCTCTGAAA 4602 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4811 ATGGCTTGAAGCAATCAGAGGTGATATTAAGGTATTTAAGCTCTATCCTTTGCTCTGAGA 4870 Query 4603 TTTGGACAAATGAGGACATCACGGCTGAAATTTTACAAGTCAAGGACGAAATACTTTCCC 4662 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 4871 TTTGGACAAATGAGGACATCACGGCTGAAATTTTACAAGTCAAGGAAGAAATACTCACCT 4930 Query 4663 TTGCTTCAGACACCATACAAACCATAAGCACAATCGTGTACCCAGCAGTTAGTGGTCTTA 4722 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4931 TTGCTTCAGACACCATAGAAACCATAAGCACAATCGTGTACCCAGCAGCTAGTGGTCTTA 4990 Query 4723 ACAAACAACGCCTTGCTTACATATATAGCCTCCTTTCTGAATGCTATTGCCATTTGGTAG 4782 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct 4991 ACAAACAACGCCTTGCTTACATATATAGCCTCCTTTCTGAATGCTATTGTCATTTGGCAG 5050 Query 4783 AAAGCAAGGAAGCATCATTGTTGGTTGAACCGCATGGTTCCTTTGCTGGGTTATCAAATT 4842 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 5051 AAAGCAAGGAAGCATCATTGTTGGTTCAACCGAATTCTTCCTTTGCTGGGTTATCAAATT 5110 Query 4843 TGTGTAACGTCCTTAAGCAAGAGTGCAGTAGAGTGTCATTTATCAAAGATTTGGATTTCA 4902 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5111 GGTATAACGTCCTTAAGCAAGAGTGCAGTAGAGTGTCATTTATCAAAGATTTGGATTTCA 5170 Query 4903 AAAATATTGCGGAGTTGGGAGGTTTGAACTTTGACAGCTTCAACAATGAAGTCCATGCGC 4962 |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5171 AAAATATTTCAGAATTGGGAGGTTTGAATTTTGACAGCTTCAACAATGAAGTCCATGCGC 5230 Query 4963 ACATCAATGAGATGAACTTGGAAGCTTTGGCCAAAATGGTAGAAACTCTCACTGGCTTAT 5022 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 5231 ACATCAATGAGATGAACTTGGAAGCTTTGGCCAAAATGGTAGAAACTCTAAGTGGCTTAT 5290 Query 5023 TCATTGAAAATTCCTCCATGGGTCTCATTTCCTGGCAAGATGTCTACAAGCAATATATTA 5082 ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 5291 CCATGGAAAATTCGTCCAAGGGTCTCATTTCCTGTCAAGATGTCTACAAACAATATATTA 5350 Query 5083 TGAATTTGTTAGATACATTGGAGAGTAGAAGAGATCTTGATTTTGGAAGTGCAGAGAGTT 5142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5351 TGAATTTGTTAGATACATTGGAGAGTAGAAGAGATCTTGATTTTGGAAGTGCAGAGAGTT 5410 Query 5143 TCCAAGGCTTCCTCGGTCAACTTGAGCAGACATATGACCACTGCAGAGTATATGTCAGGA 5202 |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 5411 TCCAGGGCTTCCTCGGTCAACTTGAGAAGACATATGACCACTGTAGAGTATATGTCAGAA 5470 Query 5203 TCTTGGAACCTTTGCAGGCTGTGGAAATCCTGAAACGGAATTTCACCTTAGTTCTACCAC 5262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | Sbjct 5471 TCTTGGAACCTTTGCAGGCTGTGGAAATCCTGAAACGGCATTTCACGTTAGTTCTACCGC 5530 Query 5263 CAAATGGTTCTTACATGCACATCCCTGATAGTTCTAAATGGCAAGAATGTCTTATCTTAC 5322 |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 5531 CAAATGGTTCCTATATGCACATCCCTGATAGTTCTACATGGCAAGAATGTCTTATCTTAC 5590 Query 5323 TGATTAACTTTTGGATAAGATTAGCTGATGAGATGCAGGAAGTAAAATCATCTAGTCCAA 5382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| Sbjct 5591 TGATTAACTTTTGGATAAGATTAGCTGATGAGATGCAAGAGGTAAAATCATCTAATCCAA 5650 Query 5383 GTTTGGTGGCGAATCTCATCTTAAGCCCTGAATGCATTAGCAGCTGTCTTACTGTTCTTA 5442 ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || | Sbjct 5651 GTTTGGTGGAGAATCTTACCTTGAGCCCTGAATGCATTAGCAGCTGTTTTACTCTACTCA 5710 Query 5443 TAAAACTAGTAATGGATGATAGTCTGTACCCAAGTCAGGCTTGGGCTGCAATACTTATCT 5502 ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 5711 TAAAACTTGTAATGTATGACAGTCTGTCCCCAAGTCAGGCTTGGGCTGCAATACTTGTCT 5770 Query 5503 ACGTTAGATCTGGCTTGGTTGGTGATTGTGCCACTGAAATCTTCAATTTCTGCAGAGCCA 5562 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5771 ACCTTAGATCTGGCTTGGTTGGTGATTGTGCCACTGAAATCTTCAATTTCTGCAGAGCCA 5830 Query 5563 TGGTCTTCTCTGGTTGTGGATTCGGGCCCATTTCTGATGTCTTCTCAGATTTGTCCTCTC 5622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 5831 TGGTCTTCTCTGGTTGTGGATTCGGGCCCATTTCTGATGTCTTCTCAGATATGTCCTCTC 5890 Query 5623 GGTATCCAACAGCTTTGCAGGATCTTCCACATCTTTATTTGAGTGTACTTGAACCTATTT 5682 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5891 GGTATCCAACAGCTTTGCAGGATCTTCCACACCTGTATTTGAGTGTCCTTGAACCTATTT 5950 Query 5683 TACAAGATTTGGTATCTGGGGCTCAC-GAAACACAGAATCTTTACCGGTTGCTCTCTTCT 5741 |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5951 TACAAGATTTGGTATCTGGGGCTC-CTGAAACACAAAATCTTTACCGGCTGCTCTCTTCT 6009 Query 5742 CTTAGTAACTTAGAAGGCAACCTAGAAGAACTGAAGCGTGTTAGGCTTGTAGTCTGGGAA 5801 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || Sbjct 6010 CTTAGTAACTTGGAAGGCAACCTGGAAGAACTGAAACGTGTCAGGCTTGTAGTCTGGAAA 6069 Query 5802 CAACTCGTAATATTTTCTGAGAACCTGGAGTTGCCAAGTCAAGTTCGCGTCTACTCTTTA 5861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 6070 CAACTCGTAATATTTTCTGAGAACCTGGAGTTGCCAAGTCAAGTTCGCGTCTACTCCTTA 6129 Query 5862 GAGCTTATGCAGTTCATCTCGGGTAAGAATATCAAGGGCTCATCGTCTGAGCTACAATCA 5921 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6130 GAGCTTATGCAGTTCATCTCGGGTAAGAATATCAAGGGCTCATCGTCTGAGCTACAATCA 6189 Query 5922 AACGTTTTGCCATGGGACGGTTCAGCTGAGTTACTATCTTCTATGCAGAAGACTGAAGCC 5981 |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 6190 AACGTTATGCCATGGGACGGTTCGGCTGAGTTACTATCATCTATGCAGAAGACTGAAGCC 6249 Query 5982 ACACTTAACCAAGCGTTGCCTGACCAGGCTGATGGCTCTAGCAGGCTCACAAACACTCTG 6041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6250 GCGCTTAACCAAGCGTTGCCTGACCAGGCTGATGGCTCTAGCAGGCTCACAAACACTCTG 6309 Query 6042 GTCGCACTTAAATCATCTCAGATCGCTGTTGCTGCCATCTCTCCAGGCCTAGAGATCTCA 6101 || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6310 GTTGCACTTAAATCATCTCAGGTCGCTGTAGCAGCCATCTCTCCAGGCCTAGAGATCTCC 6369 Query 6102 CCGGAGGATTTATCTACTGTTGAGACATCTGTTTCCTGCTTCTCTAAACTCTCTGCTGCT 6161 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 6370 CCGGAGGATTTATCTACTGTTGAGACATCTGTTTCTTGCTTCTCTAAACTCTCTGCTGCT 6429 Query 6162 GTTACTACAGCTTCACAAGCTGAAGCTCTTCTGGCTATTTTAGAAGGATGGGAAGAGCTG 6221 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 6430 GTTACTACAGCTTCACAAGCTGAAGCTCTTTTGGCTATTTTGGAAGGATGGGAAGAGCTG 6489 Query 6222 TTTGAAGCTAAGAAAGCCGAACTATTGCCGTCTAATGACGCAACCGACCGAGGAAACGAC 6281 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 6490 TTTGAAGCTAAGAACGCCGAACTATTGCCATCTAATGAGGCAACCGACCAAGGAAACGAC 6549 Query 6282 TGGGGTGATGATGATTGGAATGATGGATGGGAAACACTCCAGGAATCAGAACCCGTGGAG 6341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 6550 TGGGGTGATGATGATTGGAATGATGGATGGGAAACACTGCAGGAATCAGAACCCGTGGAG 6609 Query 6342 AAAGTGAAAAAGGAATGCATAGTGTCAGCTCATCCTTTACATTCATGCTGGCTGGATATT 6401 ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 6610 AAAGTAAAAAAAGAATGCGTAGTCTCAGCTCATCCTTTACATTCTTGCTGGCTGGATATT 6669 Query 6402 TTCAGAAAGTACATTGCATTGTCCATGCCCGAAAATGTTCTACGACTAATAGATGGATCG 6461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || Sbjct 6670 TTCAGAAAGTACATTGCATTGTCCATGCCCGAAAATGTACTACAACTAATAGATGGTTCT 6729 Query 6462 CTTCAAAAGCCCGAAGAGGTCATAATTGAAGAAAATGAAGCAGAAAGCCTGACCGGGATC 6521 ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6730 CTTCAGAAGCCTGAAGAGGTGATAATTGAAGAAACTGAAGCAGAAAGCCTGACCGGGATC 6789 Query 6522 TTAGCCAGGACCGACCCATTTCTCGCACTAAAGATTTCTCTTTTGTTACCCTACGAACAG 6581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 6790 TTAGCCAGGACCGACCCATTTCTCGCACTAAAGATTTCTCTTTTGTTACCCTACAAACAG 6849 Query 6582 ATCAGATCTCAGTGTCTCAGTGTTGTGGAAGAACAATTGAAGCAAGAAGGCATTCCGGAG 6641 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6850 ATCAGATCTCAGTGTCTCAGTGTTGTTGAAGAACAATTGAAGCAAGAAGGCATTCCGGAG 6909 Query 6642 TTATCGAGTCAGAGCCATCATGAAGTTCTTCTCCTGGTTATATATTCTGGGACTCTCTCA 6701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6910 TTATCGAGTCAGAGCCATCATGAAGTTCTTCTCCTGGTTATATATTCTGGGACTCTCTCA 6969 Query 6702 ACAATCATCTCCAATTCTTGCTACGGCTCAGTCTTCTCCTTCCTCTGTTATCTGATTGGA 6761 || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6970 ACGATCATCTCCAATGCTTGCTACGGCTCAGTCTTCTCCTTCCTCTGTTATCTGATTGGA 7029 Query 6762 AAGCTATCTCGAGAGTTCCAAGAAGAGCGGATAACACAAGCTGACAACAGAGAATCAAAT 6821 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 7030 AAGCTATCTCGAGAATTCCAAGAAGAGCGGATAACACAAGCTGACAACAGAGAATCGAAT 7089 Query 6822 GCAAGTTCGGAGAGTCGGTTTATCTCATGTTTTGGGCAACTCATGTTCCCGTGTTTTGTC 6881 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 7090 GCAAGTTCCGAGAGTCGGTTTATATCATGTTTTGGGCAACTCATGTTCCCCTGTTTTGTC 7149 Query 6882 GCGGGGCTTGTTAAGGCGGATCAGCAGATATTAGCCGGGTTTCTGGTGACCAAGTTCATG 6941 | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct 7150 TCAGGGCTTGTTAAGGCAGATCAGCAGATATTAGCGGGGTTTTTGGTGACCAAGTTCATG 7209 Query 6942 CACAGTAACCCATCTCTTAGTCTGATTAATGTTGCAGAGGCAAGTCTGAGGAGATACTTG 7001 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 7210 CACAGTAACCCATCTCTTAGTCTGATTAATGTTGCAGAGGCAAGTCTGCGGAGATACTTG 7269 Query 7002 GAGAAGCAGCTCGAGTCTTTGGAGCATTTGGAGGATTCGTTTGCCGAGAGCTCAGAACTT 7061 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 7270 GATAAGCAGCTCGAATCTTTGGAGCATTTGGAGGATTCGTTTGCCGAGAGCTCAGA-CTT 7328 Query 7062 -GAAACGCTGAAGAATACAGTCTCAAGCTTAAAAGGCAATTCAAAGGAAGTTATACGATC 7120 ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 7329 TGAAACACTGAAGAATACAGTCTCAAGCCTAAGAGGCACTTCAAAGGAAGTTATACGATC 7388 Query 7121 TGCGTTAGCGTCTCTTTCTACTTGTACAAACAGCAGATGATATGGA-AATGGAGGCTT 7177 ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| Sbjct 7389 TGCGTTAGCTTCTCTCTCTAATTGTACAAACAGCAGATGATTTG-ACAATGGAGGCTT 7445 Score = 2710 bits (1467), Expect = 0.0 Identities = 1632/1711 (95%), Gaps = 13/1711 (1%) Strand=Plus/Plus Query 12 CGATTGATCATGGAAACTCCTGGAAGAAAAGTTTTGTATGAGATACGTCATCATGCTTCA 71 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 229 CGATTGATCATGGAAAGTCCTGGAAGAAAAGTTTTGTATGAGATACGTCATCATGCTTCA 288 Query 72 TTGCCTTTTGTTCCTAGATATCCTCCTCTTCCTCAGGCAGATGGAGCTGATTCGAAAGGA 131 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 289 TTGCCTTATGTTCCTAGATATCCTCCTCTTCCTCAGGCAGATGGAACTAATTCGAAAGGA 348 Query 132 GGGCTTCGGTCTCTTGTCTCCATTAGAGGTTTTAGTCAACTCAAGGAAAAGTGGAGTGGA 191 || |||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 349 GGACTTCGGTCACTTGTTTCCATCAAAGGTGTTAGTCAACTCAAGGAAAAGTGGAGTGAA 408 Query 192 TATTGGAATCCGAGAAAGACTAATAAACCGGTGTCGTTATTTATTTCACCAAGAGGAGAA 251 || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 409 TACTGGAATCCGAAAAAAACTAATAAGCCGGTGTCGTTATTTATTTCACCAAGAGGAGAA 468 Query 252 CTTGTGGCTGTCACTTCCGCAAATCATGTTACTATCTTACGAAAGGATGATGATTACAGG 311 ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 469 CTTGTGGCTGTCACTTCTGGAAATCACGTTACTATCTTGCGAAAGGATGATGATTACAGG 528 Query 312 AAACCTTGTGGCAATTTTACATCCAACATATCAGGATCATTTACTTCTGGAGTGTGGTCC 371 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 529 AAACCTTGTGGCAATTTTACATCCAGCATATCAGGTTCATTTACTTCTGGAGTATGGTCC 588 Query 372 GAAAAACATGATGTTCTTGGTCTTGTGGATGATAGTGAGACCCTCTTTTTCATCAGAGCT 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 589 GAAAAACATGATGTTCTTGGTCTTGTGGATGATAGTGAGACCCTCTTTTTCATCAGAGCT 648 Query 432 AATGGTGAAGAAATAAGTCAAGTCACAAAAAGAAACTTGAAGGTTTCTGCATCAGTATTA 491 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 649 AATGGCGAAGAAATAAGTCAGGTCACAAAAAGAAACTTGAAGGTTTCTGCACCAGTATTA 708 Query 492 GGATTAATAGAGGACGACTGTGATTTGCAACCATCATGTTTGTGTTCATTCAGTGTACTT 551 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| Sbjct 709 GGATTAATGGAGGACGACTCTGATTTGCAACCATCATGCTTGTGTTCGTTCAGTATACTT 768 Query 552 ACATCAGATGGACTTATTCATCATGTCGAGATCAGTAGGGAGCCAAGCGCTTCTTCCTTT 611 || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct 769 ACGTCAGATGGACGTATTCATCATGTCGAGATCAGTAGGGAGCCAAGTGCTTCTGCCTTT 828 Query 612 TCCAAACATGCTTCAAATAGTGTCTCAGCTTTGAGAAAGCAATTCCCCAACCACGTTTTT 671 ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 829 TCCAAGCATGCTTCAAATAGTGTCT---C------AAAGCAATTCCCCAACCACGTTTTC 879 Query 672 TGCTTTGATTACCATCCAAATCTTTCTTTTCTTCTTC-TTGTTGGTAGTGCTGCAGGCAT 730 |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct 880 TGCTTTGATTACCATCCAGATCTTTCTTTTCTTC-TCATTGTTGGTAGTGTTGCAGGCAT 938 Query 731 ATCATCGACAGGGAGTTCTGGTTCATCATGTATCTCACTTTGGCGTAAGTGTCAGAATTT 790 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 939 ATCATCGTCAGGGAGTTCTGGTTCATCGTGTATCTCGCTTTGGCGTAAGTGTCAGAATTT 998 Query 791 AGGTCTGGAACTGTTGTCCACCACAAAGTTTGAAGGCGAGTATTGTGAGAACAAAGATGA 850 |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 999 AGGTCTGGAATTGTTGTCCACCACAAAGTTTGATGGCGTGTATTGTGAGAACAAAGATGA 1058 Query 851 TCAGTTGGCATATCCAAAGACTTTAATCTCACCTCAAGGGTCACATGTTGCAAGTCTTGA 910 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1059 TCAGTTGGCATATCCAAAGACTTTAATCTCCCCTCAAGGGTCACATGTTGCAAGTCTTGA 1118 Query 911 TAGCAATGGGTGCGTGCATCTTTTCCAGTTAGATAAAGCAAGATTGACACTTTCGTGCTG 970 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1119 TAGCAATGGGTGCGTGCATATTTTCCAGTTAGATAAAGCAAGATTGACACTTTCGTGCTG 1178 Query 971 TCCTTCTGAAGACAGTTCTGATTCACTGAAGCCAGATAAGTCACTAAAAAATTGGAAAGA 1030 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| Sbjct 1179 TCCTTCTGAAGACAGTTCTGATTCACTGAAGCCAGATAAGTCGCTACAAAGTTGGAAAGA 1238 Query 1031 AAGTTTAAGAAATGTCGTAGATTTTACTTGGTGGTCTGATCACGCCCTTACAATTTTGAA 1090 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1239 AAGTTTAAGAAATGTCGTAGATTTTACTTGGTGGTCTGATCACGCCCTTGCAATTTTGAA 1298 Query 1091 AAGGAGCGGTAACATTAGTATATTTGACATCAATAGGTGTGTTATAGTTCAAGAGGATGC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1299 AAGGAGCGGTAACATTAGTATATTTGACATCAGTAGGTGTGTTATAGTTCAAGAGGATGC 1358 Query 1151 TACCATTTATTCTATGCCTGTCGTGGAAAGAGTTCAGAGATATGAGGGACACATTTTTCT 1210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct 1359 TACCATTTATTCTATGCCTGTCGTGGAAAGAGTTCAGAAATATGAAGGACACATTTTTCT 1418 Query 1211 TTTAGAAAGTTCAACACAGGAAGCAAAATCAGCCCTGGCCAAGGTTGACAAGGACCCAAG 1270 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| Sbjct 1419 TTTAGAAAGTTCAACACAGGAAGCAAAATCAGCTCTGGCCAATGTTGACAGGGACGCAAG 1478 Query 1271 TGAATTGCATCATACTAGTGAGCATAGTATGTTATGGAGGCTAATATCTTTTACTGAGAA 1330 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1479 TGAATTTCATCATACTAGTGAGCATAGTATGTTATGGAGGCTAATATCATTTACTGAGAA 1538 Query 1331 AACAATTCCTGAAATGTATAAAATCTTAGTTGAGAAATGCCACTATCAAGAAGCGTTGGA 1390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 1539 AACAATTCCTGAAATGTATAAAATCTTAGTTGAGAAATGCCAATATCAAGAAGCGTTAGA 1598 Query 1391 TTT-TGCTGATAGTCATGGCTTGGACAGAGATGAAGTTTTCAAGTCAAGATGGTTGAACT 1449 ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1599 TTTCT-CTGATAGTCATGGCTTGGACAGAGATGAAGTTTTCAAGTCAAGATGGTTGAAGT 1657 Query 1450 CAGGAAAAGGAGTCAGTGATGTGAGCACGATTCTATCAAAGATAAAAGATAAAGCTTTTG 1509 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1658 CAGAAAAAGGAGTCAGTGATGTGAGCACGATTCTATCAAAGATAAAAGATAAAGCTTTTG 1717 Query 1510 TGCTCTCCGAATGCTTAGATAGAATTGGGCCAACAGAAGATTCCATGAAGGCCTTACTTG 1569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1718 TGCTCTCCGAATGCTTAGATAGAATTGGGCCAACAGAAGATTCCATGAAGGCCTTACTTG 1777 Query 1570 CGCATGGACTTTATCTAACTAATCACTATGTATTTGCTAAATCTGAAGATCAAGAATCCC 1629 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1778 CGCATGGACTTTATCTAACCAATCACTATGTATTTGCTAAATCTGAAGATCAAGAATCCC 1837 Query 1630 AACAACTTTGGGAATTTCGTTTGGCTAGGCTTCGTCTATTACAGTTTAGTGAAAGGCTCG 1689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1838 AACAACTTTGGGAATTTCGTTTGGCTAGGCTTCGTCTATTACAGTTTAGTGAAAGGCTTG 1897 Query 1690 ACACATATTTGGGGATAAGCATGGGCAGATA 1720 |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1898 ACACCTATTTGGGGATAAGCATGGGCAGATA 1928 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 358553654832 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5