BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg943318
Length=3313
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G05420.1 | Symbols: DDB1A | damaged DNA binding protein 1A |... 5709 0.0
AT4G21100.1 | Symbols: DDB1B | damaged DNA binding protein 1B |... 3845 0.0
> AT4G05420.1 | Symbols: DDB1A | damaged DNA binding protein 1A
| chr4:2746121-2752943 FORWARD LENGTH=3714
Length=3714
Score = 5709 bits (3091), Expect = 0.0
Identities = 3232/3302 (98%), Gaps = 1/3302 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCTCGGGGACAAAGAAGAGGAAGATGAGCTCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAAC 62
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 CCT-GGAGACAAAGAAGAGGAAGATGAGCTCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAAC 204
Query 63 CGACCAGTGTCACTCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCA 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 CGACCAGTGTCACTCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCA 264
Query 123 TTGTTGCGAAATGTACCCGAATTGAGATCCATTTGCTTACCCCGCAGGGACTTCAGCCTA 182
|||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 265 TTGTCGCGAAATGTACTCGAATCGAGATCCATTTGCTTACCCCACAAGGACTTCAGCCTA 324
Query 183 TGCTGGATGTTCCTATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGGCCCCATGGCG 242
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 325 TGTTGGACGTTCCTATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGACCCCATGGCG 384
Query 243 AAGCACAAGACTTTTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAGTGGG 302
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 385 AAGCGCAAGACTTTTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAATGGG 444
Query 303 ATCCTGAGTCCTCTGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCC 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCCTGAGTCCTCTGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCC 504
Query 363 GACCAACAGACAATGGTCAGATTGGCATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCC 422
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505 GGCCAACAGACAATGGTCAGATTGGTATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCC 564
Query 423 ATCTGTATGACGGCTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAAGAAG 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 565 ATCTGTATGACGGCTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAGGAAG 624
Query 483 CTTTTAATATCAGGCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTG 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 CTTTTAATATCAGGCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTG 684
Query 543 CAAAGCCCACTATTGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACAT 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 CAAAGCCCACTATTGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACAT 744
Query 603 ATGAAGTCTCTCTAAAAGATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCACAGAATAATCTCG 662
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||
Sbjct 745 ATGAAGTCTCTCTTAAAGATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCTCAGAACAGTCTCG 804
Query 663 ACAATGGTGCTGACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTG 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 ACAATGGTGCTGACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTG 864
Query 723 GTGAAGAAACAATTGTCTATTGCAGTGCTAATGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTT 782
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 GTGAAGAAACAATTGTCTATTGCAGTGCTAGTGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTT 924
Query 783 CCATCACTAAAGCATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGGTATCTTCTTGGTGACC 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 925 CCATCACTAAAGCATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGATATCTTCTTGGTGACC 984
Query 843 ATGCTGGACTGATTCATCTTCTTGTTATAACGCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAA 902
|||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 ATGCTGGAATGATTCATCTGCTTGTTATAACGCACGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAA 1044
Query 903 AAATTGAGCTTTTGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 AAATTGAGCTTTTGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCG 1104
Query 963 TTGTCTTTGTCGGCTCAAGCTATGGCGATTCACAGCTAGTAAAGCTGAATCTACACCCTG 1022
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 TTGTCTTTGTCGGCTCAAGCTATGGTGATTCACAGCTAGTAAAGCTGAATCTACACCCTG 1164
Query 1023 ATGCAAAAGGCTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCG 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 ATGCAAAAGGCTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCG 1224
Query 1083 ACTTTTGTGTAGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAG 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225 ACTTTTGTGTAGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAG 1284
Query 1143 CATTTAAGGATGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGT 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 CATTTAAGGATGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGT 1344
Query 1203 CTGTGGAACTTCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCT 1262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 CTGTGGAACTTCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCT 1404
Query 1263 TCGATACATTCCTCGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGTATATTAGCCATGAATCTTG 1322
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1405 TCGATACATTTCTTGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGCATATTAGCCATGAATCTTG 1464
Query 1323 AGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTT 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 AGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTT 1524
Query 1383 GCCATGATGCTGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCA 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 GCCATGATGCTGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCA 1584
Query 1443 GTTCTACAACTAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCGGCTGGATTCACTGTTAATG 1502
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1585 GTTCTACAACTAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCAGCTGGATTCACTGTTAATG 1644
Query 1503 TTGCAACTGCAAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTGTATC 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1645 TTGCAACTGCAAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTTTATC 1704
Query 1563 TAGAAATTGGAGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAACATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTT 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 TAGAAATTGGAGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAACATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTT 1764
Query 1623 CTTGTCTTGATATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTTCGGTTG 1682
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1765 CCTGTCTTGATATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCGGTTG 1824
Query 1683 GGATGTGGACAGATATAAGTGTGAGGATCTTTTCGCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAA 1742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825 GGATGTGGACAGATATAAGTGTGAGGATCTTTTCGCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAA 1884
Query 1743 AAGAGCAACTCGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGA 1802
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1885 AAGAGCAACTTGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGA 1944
Query 1803 TATCTTACTTGCTCTGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGTTGGATACAA 1862
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1945 TATCTTACTTGCTATGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGATGGATACAA 2004
Query 1863 CTACCGGGCAGTTGAAAGACAGGAAAAAAGTATCACTAGGGACTCAGCCTATAACTCTGC 1922
||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 CTACCGGACAATTAAAAGACAGGAAAAAAGTATCACTCGGGACTCAGCCTATAACTCTGC 2064
Query 1923 GTACTTTTTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGA 1982
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 GTACATTTTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGA 2124
Query 1983 TCTATAGCAGCAACAAGAAACTGTTATACAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATA 2042
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 TCTATAGCAGCAACAAGAAGCTGTTATATAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATA 2184
Query 2043 TGTGCCCTTTCAACTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAAC 2102
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2185 TGTGCCCTTTCAATTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAAC 2244
Query 2103 TTACGATTGGTACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGCACTATTCCTCTTGGAG 2162
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2245 TTACGATTGGAACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGTACTATTCCTCTTGGAG 2304
Query 2163 AGCATGCTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGG 2222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2305 AGCATGCTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGG 2364
Query 2223 GAAACCAGTCAAATGCCGAAGAATCTGAAATGCACTTTGTCCGTCTTTTAGACGACCAGA 2282
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2365 GAAACCAGTCAAATTCCGAAGAATCTGAAATGCACTTTGTCCGTCTTTTGGACGACCAGA 2424
Query 2283 CTTTCGAGTTTATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATACGGTTGCTCCATTCTGA 2342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||
Sbjct 2425 CTTTCGAGTTTATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATATGGTTGTTCAATTCTGA 2484
Query 2343 GCTGCTCATTCACCGACGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTAC 2402
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485 GCTGCTCATTCACCGAAGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTAC 2544
Query 2403 CGGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATATTAGTATTTATAGTTGAAGATGGGAGGT 2462
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2545 CGGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATATTAGTATTTATAGTCGAAGATGGGAGGT 2604
Query 2463 TGCAGTTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAATG 2522
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2605 TGCAGCTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAATG 2664
Query 2523 GAAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGCGGGATG 2582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2665 GAAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGAGGGATG 2724
Query 2583 ATGGCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTATG 2642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2725 ATGGCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTATG 2784
Query 2643 TACAGACCCGTGGAGACTTTATCGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTGT 2702
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2785 TGCAGACCCGTGGAGACTTTATAGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTGC 2844
Query 2703 TATACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCGAATTGGA 2762
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2845 TATACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCAAATTGGA 2904
Query 2763 TGTCAGCGGTTGAGATACTAGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAATC 2822
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2905 TGTCAGCGGTTGAGATACTCGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAATC 2964
Query 2823 TGTTAACAGTGAAAAAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGACGGTTGGAGG 2882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2965 TGTTAACAGTGAAAAAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGACGGTTAGAGG 3024
Query 2883 TAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCTAGTAA 2942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3025 TAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCTAGTAA 3084
Query 2943 TGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACCGTCAATG 3002
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3085 TGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACAGTCAATG 3144
Query 3003 GAGTGATAGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAGTATACTTTCTTGGAGAAGTTGC 3062
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3145 GAGTGATTGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAATATACTTTCTTGGAGAAGTTGC 3204
Query 3063 AGTCGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGCGGATTAAGCCACGAGCAATGGAGGT 3122
|||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3205 AGTCAAGTTTGAGAAAAGTGATTAAAGGAGTCGGCGGATTAAGCCACGAGCAATGGAGGT 3264
Query 3123 CGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCAGAAGCGAGGAATTTCTTGGATGGTGACTTAATCG 3182
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3265 CGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCGGAAGCGAGGAATTTCTTGGATGGTGACTTAATCG 3324
Query 3183 AATCGTTTCTGGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATCCATGAATGTTC 3242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3325 AATCGTTTCTGGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATCCATGAATGTTC 3384
Query 3243 AAGTGGAAGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTGAATCAAATCAA 3302
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3385 AAGTGGAGGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTGAGTCAAATCAA 3444
Query 3303 TC 3304
||
Sbjct 3445 TC 3446
> AT4G21100.1 | Symbols: DDB1B | damaged DNA binding protein 1B
| chr4:11258761-11265463 REVERSE LENGTH=3576
Length=3576
Score = 3845 bits (2082), Expect = 0.0
Identities = 2908/3309 (88%), Gaps = 48/3309 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 GAAGAGGAAGATGAGC-TCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAACCGACCAGTGTCA 74
||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 145 GAAGAAGAAGATGAGCGT-ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAGAAACCGACCTGTGTCA 203
Query 75 CTCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCATTGTTGCGAAAT 134
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CTCACTCTTGCGTCGGGAACTTCACAAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAAT 263
Query 135 GTACCCGAATTGAGATCCATTTGCTTACCCCGCAGGGACTTCAGCCTATGCTGGATGTTC 194
|| ||||| ||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 264 CCACTCGAATCGAGATCCATCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTC 323
Query 195 CTATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGGCCCCATGGCGAAGCACAAGACT 254
|| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 324 CTCTATATGGGAGAATCGCAACTATGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGACT 383
Query 255 TTTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAGTGGGATCCTGAGTCCT 314
||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 384 TTTTGTTTGTTGCAACTGAAAGATATAAATTCTGTGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCT 443
Query 315 CTGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCAACAGACA 374
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 444 CTGAGCTTATTACAAGGGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACAGACA 503
Query 375 ATGGTCAGATTGGCATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCCATCTGTATGACG 434
||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||
Sbjct 504 ATGGTCAGATTGGTATAATTGATCCTGATTGCAGAGTAATTGGTCTGCATCTGTATGACG 563
Query 435 GCTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAAGAAGCTTTTAATATCA 494
||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |
Sbjct 564 GCTTGTTTAAGGTCATTCCATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCCTTTAACATAA 623
Query 495 GGCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTGC-AAAGCCCACT 553
|||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||| || ||
Sbjct 624 GGCTGGAGGAGTTGCAGGTCCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAA-CCAACA 682
Query 554 ATTGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTCTCT 613
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 683 ATTGCAGTACTTTATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCT 742
Query 614 CTAAAAGATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCACAGAATAATCTCGACAATGGTGCT 673
||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 743 CTAAAGGATAAGAACTTTGTCGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGACAATGGTGCT 802
Query 674 GACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTGGTGAAGAAACA 733
||||| |||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 803 GACTTATTGATCCCTGTACCTTCACCTCTATGTGGCGTCCTCATCATTGGGGAAGAAACA 862
Query 734 ATTGTCTATTGCAGTGCTAATGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACTAAA 793
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 863 ATTGTCTATTGTAGTGCCAATGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACAAAA 922
Query 794 GCATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATGCTGGACTG 853
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 923 GCATATGGAAGAGTTGATCTTGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATGCCGGACTG 982
Query 854 ATTCATCTTCTTGTTATAACGCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAAAAATTGAGCTT 913
||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 983 ATTCACCTGCTTGTTATAACCCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTT 1042
Query 914 TTGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCGTTGTCTTTGTC 973
||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||||
Sbjct 1043 TTGGGTGAAACCTCTATTGCATCTTCCATCTCGTATCTGGACAATGCTGTCGTCTTTGTC 1102
Query 974 GGCTCAAGCTATGGCGATTCACAGCT-AGTAAAGCTGAATCTACACCCTGATGCAAAAGG 1032
|| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || || || || |||||||||||
Sbjct 1103 GGTTCAAGCTATGGAGATTCACAGCTTATTAA-GCTAAACCTGCAACCGGATGCAAAAGG 1161
Query 1033 CTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCGACTTTTGTGT 1092
|||||||||||| | || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1162 GTCATATGTAGAAATTTTAGAAAAGTATGTCAACTTGGGGCCTATTGTCGATTTTTGTGT 1221
Query 1093 AGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAGCATTTAAGGA 1152
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 1222 AGTTGACCTTGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGA 1281
Query 1153 TGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGTCTGTGGAACT 1212
|||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1282 TGGTTCTCTTCGCATAGTTCGCAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACT 1341
Query 1213 TCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCTTCGATACATT 1272
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1342 TCAAGGCATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATT 1401
Query 1273 CCTCGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGTATATTAGCCATGAATCTTGAGGATGAACT 1332
||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1402 CCTTGTAGTTAGTTTTATCAGTGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACT 1461
Query 1333 GGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTTGCCATGATGC 1392
||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1462 GGAAGAAACAGAGATTGAGGGTTTTTTGTCTGAAGTTCAGACTTTATTTTGCCATGATGC 1521
Query 1393 TGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCAGTTCTACAAC 1452
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1522 TGTCTACAACCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAAC 1581
Query 1453 TAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCGGCTGGATTCACTGTTAATGTTGCAACTGC 1512
|||||| |||||| | | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1582 TAGAGAGTTGCGGAATAAATGGGATGCCCCAGCTGGATTCTCTGTTAATGTTGCAACTGC 1641
Query 1513 AAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTGTATCTAGAAATTGG 1572
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1642 AAATGCGAGCCAGGTTCTTTTGGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGG 1701
Query 1573 AGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAACATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTTCTTGTCTTGA 1632
||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 GGATGGGACATTGACGGAAGTGAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCTTGTCTTGA 1761
Query 1633 TATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTTCGGTTGGGATGTGGAC 1692
|||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct 1762 CATAAACCCCATTGGTGATAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCCGTCGGGATGTGGAC 1821
Query 1693 AGATATAAGTGTGAGGATCTTT-TCGCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAAAAGAGCAAC 1751
||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||
Sbjct 1822 TGATATAAGTGTGAGGATTTTTGT-GCTACCAGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGGAAC 1880
Query 1752 TCGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGATATCTTACT 1811
| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1881 TAGGAGGAGAGATCATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTACT 1940
Query 1812 TGCTCTGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGTTGGATACAACTACCGGGC 1871
||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1941 TGCTCTGTGCTCTTGGAGACGGTCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTTGCGGGA 2000
Query 1872 AGTTGAA-AGA-CAGGAAAAAAGTATCACTAGGGACTC-AGCCTATAACTCTGCGTACTT 1928
| || || ||| | |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2001 AATT-AAGAGATC-GGAAAAAAGTATCACTGGGGACTCGA-CCTATAACTCTGCGTACTT 2057
Query 1929 TTTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGATCTATA 1988
||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||
Sbjct 2058 TTTCATCTAAAAGTGCAACGCATGTCTTCGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATA 2117
Query 1989 GCAGCAACAAGAAACTGTTATACAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATATGTG-C 2047
||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2118 GCAACAACAAGAAGCTATTATACAGCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTC 2177
Query 2048 CCTTTCAACTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAACTTACG 2107
|||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 2178 CCTT-CAACTCTGCTGCTTTTCCAGACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAGGGCGAACTTACA 2236
Query 2108 ATTGGTACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGCACTATTCCTC-TTGGAGAGCA 2166
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||
Sbjct 2237 ATTGGTACCATCGATGACATTCAGAAGCTTCACATACGCACCATTCC-CATTGGAGAGCA 2295
Query 2167 TGCTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGGGAAA 2226
||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||
Sbjct 2296 TGCTCGTCGGATATGTCATCAGGAACAAACACGAACATTTGCTATCTCCTGTTTGAGAAA 2355
Query 2227 CCAGTCAAATGCCGAAGAATCTGAAAT-GCACTTTGTCCGTCTTTTAGACGACCAGACTT 2285
| | ||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| | || | ||| | ||
Sbjct 2356 CGAACCAAGTGCAGAAGAATCTGAA-TCGCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTT 2414
Query 2286 TCGAGTT-TATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATACGGTTGCTCCAT-TCTGAG 2343
||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||
Sbjct 2415 TCGAGTTCT-TGTCAAGTTACCCTTTGGATGCCTTTGAATGTGGTTGCTCCATAT-TGAG 2472
Query 2344 CTGCTCATTCACCGACGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTACC 2403
|||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 2473 CTGCTCGTTTACAGACGACAAAAATGTCTATTATTGTGTTGGTACAGCATATGTTTTGCC 2532
Query 2404 GGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATA-TTAGTATTTATAGTTGAAGATGGGAGGT 2462
|||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |
Sbjct 2533 CGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATACTT-GTGTTTATAGTTGAAGAAGGAAGAT 2591
Query 2463 TGCAG-TTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAAT 2521
||||| ||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2592 TGCAGCTTA-TCACAGAGAAGGAAACCAAGGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAAT 2650
Query 2522 GGAAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGCGGGAT 2581
|| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2651 GGCAAACTTCTTGCTTCTATTAATCAAAAGATTCAGTTGTATAAGTGGATGCTGCGGGAT 2710
Query 2582 GATGGCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTAT 2641
||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 2711 GATGGCACTCGCGAGCTGCAATCTGAATGTGGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTAC 2770
Query 2642 GTACAGACCCGTGGAGACTTTATCGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTG 2701
|| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2771 GTGCAGACCCGTGGAGACTTCATCGCTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCTTTATTG 2830
Query 2702 TTATACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCGAATTGG 2761
| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| || ||||| || |||
Sbjct 2831 ATCTACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGAGGAGAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGG 2890
Query 2762 ATGTCAGCGGTTGAGATACT-AGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAA 2820
||| | || ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||| || |||||
Sbjct 2891 ATGACGGCAGTTGAGATACTCA-ATGATGACATCTACCTCGGTACTGATAATTGCTTCAA 2949
Query 2821 TC-TGTTAACAGTGAAA-AAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGACGGT-T 2877
| | || || || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || | |
Sbjct 2950 -CATATTCACCGT-AAAGAAGAACAACGAAGGTGCTACAGATGAAGAACGTGCTCG-TAT 3006
Query 2878 GGAGGTAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCT 2937
|||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 3007 GGAGGTGGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATTTGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCT 3066
Query 2938 AGTAATGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACCGT 2997
|| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||
Sbjct 3067 TGTCATGAAGCTGCCTGATTCAGATATTGGTCAGATACCGACAGTCATATTTGGCACTGT 3126
Query 2998 CAATGG-AGTGATAGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAGTATAC-TTTCTTGGAG 3055
|| ||| | |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| | ||
Sbjct 3127 CAGTGGGA-TGATTGGAGTGATAGCGTCTCTGCCTCAAGAACAGTATGCGTTTCTAG-AG 3184
Query 3056 AAGTTGCAGTCGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGCGGAT-TAAGCCACGAGCA 3114
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||
Sbjct 3185 AAACTGCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGTGG-TCTAAGCCACGAGCA 3243
Query 3115 ATGGAGGTCGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCAGAAGCGA-GGAATTTCTTGGATGGTG 3173
||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | || || ||||||||| |
Sbjct 3244 GTGGAGATCGTTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGAAGCAAAGGG-TTACTTGGATGGAG 3302
Query 3174 AC-TTAATCGAATCGTTTCT-GGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATC 3231
|| ||| | |||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||| || || |||
Sbjct 3303 ACCTTATT-GAATCGTT-CTTGGATTTGAGCAGAGGTAAGATGGAGGAGATCTCCAAAGG 3360
Query 3232 CATGAATGTTCAAGTGGAAGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTG 3291
||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 TATGGATGTTCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTG 3420
Query 3292 AATCAAATC 3300
|| ||||||
Sbjct 3421 AAGCAAATC 3429
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 164848574698
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5